基因组学总结

合集下载

基因组学知识点总结

基因组学知识点总结

基因组学知识点总结基因组学是研究生物体的基因组结构、功能以及其与遗传性状的关系的学科。

下面将对基因组学的相关知识进行总结,包括基因组、基因、DNA测序技术等内容。

一、基因组和基因基因组指的是一个生物体所有基因和非编码DNA序列的总和。

基因是基因组中的一个特定区域,能够编码特定的功能性产物,如RNA和蛋白质。

基因组学研究着基因组中存在的各种基因的类型、数量以及它们在生物体中的分布和功能。

二、DNA测序技术DNA测序技术是基因组学中的重要工具,通过测序技术可以获取到DNA序列的信息,从而研究基因组结构和功能。

在过去的几十年里,DNA测序技术经历了多次技术革新,从传统的Sanger测序到现代的高通量测序技术,如二代测序和三代测序技术。

三、基因组测序项目基因组测序项目是基因组学研究的重要组成部分。

其中,人类基因组计划是最为著名的基因组测序项目之一,对人类基因组进行了全面的测序和分析,为后续的基因组学研究提供了重要的基础数据。

四、功能基因组学功能基因组学研究基因组中的各种功能元件,如调控区域、非编码RNA等,以及它们在基因调控网络中的作用和相互关系。

通过功能基因组学的研究,我们可以更好地理解基因组中各个功能区域的作用机制和生物学意义。

五、比较基因组学比较基因组学研究不同物种之间基因组的异同,以及这些差异对生物体特性的影响。

通过比较基因组学的研究,我们可以了解不同物种间的进化关系、基因家族的起源和演化等重要问题。

六、基因组编辑技术基因组编辑技术是基因组学中的一项重要技术,主要用于修饰和改变生物体的基因组。

目前,CRISPR-Cas9系统是最为常用的基因组编辑技术,能够实现高效、精确的基因组编辑,对基因组学研究和生物技术应用具有重要意义。

七、应用领域基因组学在许多领域都有广泛的应用,包括生物医学研究、农业与畜牧业、环境保护等。

通过基因组学的研究,我们可以揭示疾病的遗传基础、改良作物和畜牧动物的品质特性、了解生物多样性等重要问题。

《基因组学》课程总结(精选五篇)

《基因组学》课程总结(精选五篇)

《基因组学》课程总结(精选五篇)第一篇:《基因组学》课程总结《基因组学》这门课程主要包含基因组和基因组研究两大部分。

基因组部分主要介绍基因组的基础知识,基因组研究重点介绍基因组研究的方法和进展,重点介绍结构基因组、功能基因组和比较基因组的内容。

1 基因组基因组指一种生物所拥有的整套遗传物质,它包含该生物的全部遗传信息。

绝大多数生物都以脱氧核糖核酸(DNA)为遗传物质,仅有一些病毒以核糖核酸(RNA)为遗传物质。

DNA是由4种脱氧核苷酸残基按一定顺序彼此用3′,5′-磷酸二酯键相连构成的长链。

大多数DNA是由两条多聚脱氧核苷酸链以极性相反,反向平行的方式,由氢键连接而成的双螺旋结构。

也有的DNA为单链,如大肠杆菌噬菌体φX174等。

有的DNA为环形,有的DNA为线形。

RNA一般是单链线形分子,构成RNA的核苷中的核糖为2′位非脱氧的OH基,其碱基中没有胸腺嘧啶,只有尿嘧啶。

生物进化从低等到高等,从简单到复杂,遗传信息量不断增加,因而基因组也相应不断增大。

然而在高等生物进化阶段上述规律不成立,这表明高等生物基因组中存在大量的无用序列。

原核生物基因组通常为一个环状DNA分子,原核生物基因组很小,因而其组织结构十分经济有效,很少含有无用的多余序列。

真核生物基因组由多个DNA分子组成,每个皆为双链线形分子。

真核生物的每个DNA分子皆与蛋白质结合,构成染色体,染色体上有着丝粒结构,可以进行有丝分裂。

真核生物基因组通常比较大,含有内含子序列,有大量重复序列,其表达调控机制较复杂。

真核生物的一个基因在基因组上通常由编码序列外显子和非编码序列内含子组成。

DNA转录为RNA后,内含子序列必须切除。

外显子通常都较短,内含子的长度可以从很短到非常长。

内含子的插入和缺失可造成基因的进化。

随着物种进化程度的提高,不仅间断基因的比例增加,而且每个间断基因所包含的外显子(或内含子)数目也增加。

真核生物基因组中存在基因家族与基因簇。

基因与基因组知识点资料整理总结

基因与基因组知识点资料整理总结

第一章基因与基因组1.基因的概念:基因是指合成有功能的蛋白质多肽链或RNA所必需的全部核酸序列(通常指DNA)。

2.基因的结构:①真核生物的结构基因不是连续编码的,而是由编码序列和非编码序列两部分构成,二者相互间隔排列,因此这种基因又称作割裂基因(split gene).②人类编码基因主要由外显子、内含子和侧翼序列组成.③能转录、并存在于成熟RNA中的序列称为外显子(exon)④能转录、但不存在于成熟RNA中的序列称为内含子(intron)(注:GT-AG法则:每个内含子的5’端开始的两个核苷酸都是GT,3’端末尾的两个核苷酸都是AG。

)⑤不同数目的外显子和内含子组成的各个基因大小各不相同;无内含子的基因一般较小,有较大内含子的基因一般较大。

⑥每个结构基因的第一个外显子和最后一个外显子外侧,即基因的5′端和3′端都有一段不被转录的DNA序列,对基因的转录表达及表达水平具有重要的调控作用。

包括:启动子、增强子和终止子,属顺式调控因子,称为调控序列。

(启动子 (Promoter),通常位于基因转录起点上游的100bp范围内,是RNA聚合酶的结合部位,促进转录过程,包括TATA框、Hogness框(TATA box, Hogness box)、CAAT框(CAAT box)和GC框(GC box)。

终止子 (Terminator),一段回文序列以及特定的序列,例如:5’-AATAAA-3’是RNA停止工作的信号。

增强子(Enhancer),启动子上游或下游的一段DNA序列,无明显方向性,但具有组织特异性,可增强启动子转录的效率)3.基因家族、基因簇和假基因①基因家族 (gene family):基因组中来源相同、结构相似、功能相关且常成簇存在的一组基因。

②基因簇:家族成员成簇排列在同一条染色体上,形成一个基因簇;不同成员成簇地分布在几条不同的染色体上,形成几个基因簇。

基因簇成员可能同时表达,也可能在不同发育阶段或不同部位表达。

基因组学教学方法总结基因组与基因调控的教学策略与方法

基因组学教学方法总结基因组与基因调控的教学策略与方法

基因组学教学方法总结基因组与基因调控的教学策略与方法基因组学是生物学领域中的重要学科,研究生物体的基因组结构、基因功能以及基因之间的相互作用关系。

在面对如此复杂的学科内容时,教学方法的选择显得尤为重要。

本文旨在总结基因组学的教学策略与方法,帮助教师更好地进行教学。

1. 引发学生兴趣引发学生对基因组学的兴趣是成功的第一步。

教师可以通过展示基因组学的发展和应用前景,讲解相关基因组学研究的经典案例以及与各领域的联系等方式,激发学生的学习兴趣。

此外,为学生提供参观实验室、参加学术讲座等机会,让他们亲身感受基因组学的魅力。

2. 建立基础知识在教学过程中,建立基础知识是至关重要的。

教师可以从基因组的组成、基因的表达调控、基因组测序技术等方面对基本概念进行讲解。

通过教授相关的生物化学原理、细胞生物学知识,帮助学生理解基因组学的基础知识,并将其与实际案例相结合,提高学生对知识点的理解和记忆。

3. 使用案例分析案例分析是一种有效的教学方法,能够帮助学生将所学知识应用于实际情境中。

教师可以选取一些基因组学的研究案例,结合相关的基因组学知识进行分析和讨论。

例如,基因突变导致的疾病、基因组变异与个体差异等。

通过引导学生分析这些案例,让他们在实际问题中运用所学知识,提高解决问题的能力。

4. 进行实验操作基因组学的教学也需要结合实验操作,让学生亲身参与其中。

教学实验可以选择一些简单的基因组学实验,例如PCR反应、凝胶电泳等,培养学生的实验技能和科学思维。

同时,教师应引导学生进行实验结果的分析和解读,帮助他们理解实验原理并将实验结果与理论知识进行关联。

5. 培养团队合作意识基因组学的研究常常需要团队合作,因此培养学生的团队合作意识也是教学的重要目标之一。

教师可以组织学生进行小组合作,设计解决基因组学问题的方案,并进行讨论和交流。

通过这样的合作学习,学生可以学会倾听他人的观点,协调不同意见,培养团队合作和沟通能力。

6. 教学资源的合理利用在教学中,充分利用教学资源能够提升教学效果。

基因组学与生物信息学知识点总结

基因组学与生物信息学知识点总结

基因组学与生物信息学知识点总结基因组学与生物信息学是现代生物科学的重要分支,通过研究基因组和生物信息的相关知识,可以揭示生物的遗传信息和进化机制,为生物学、医学和农业领域的研究提供了重要的理论和技术支持。

本文将对基因组学与生物信息学的主要知识点进行总结。

一、基因组学的概念基因组学是研究生物的全基因组结构、组成、功能及其相互关系的学科。

基因组是生物体内一切遗传信息的总和,它包括基因和非编码DNA等。

基因组学的研究主要包括基因组测序、基因功能注释、基因组进化以及基因表达调控等方面。

1. 基因组测序基因组测序是从某一生物体中获取其全部基因组的顺序信息。

常见的基因组测序方法有Sanger测序、测序和高通量测序等。

通过基因组测序可以获得生物个体的全基因组序列,进而对基因组结构和功能进行分析。

2. 基因功能注释基因功能注释是指对基因组中的基因进行功能分析与注释。

通过比对已知的基因数据库,可以鉴定生物体中的基因,并推断其可能的功能。

基因功能注释是理解基因组功能的重要手段,可以帮助科学家发现与特定疾病相关的基因。

3. 基因组进化基因组进化是研究基因组在进化过程中的变化和演化规律。

通过比较不同物种的基因组序列,可以揭示物种之间的亲缘关系和进化历史。

基因组进化研究对于理解物种的起源、进化和适应性具有重要意义。

4. 基因表达调控基因表达调控是研究基因在不同细胞类型和组织阶段中的表达模式和调控机制。

通过研究基因表达调控,可以深入了解基因功能、细胞发育和组织分化等生物过程。

二、生物信息学的概念生物信息学是应用数学、计算机科学和统计学等技术手段研究生物学问题的学科。

生物信息学的主要任务是处理和分析大规模生物数据,从中挖掘生物学的规律和信息。

1. 生物序列分析生物序列分析是生物信息学的基础和核心内容之一,主要包括对DNA、RNA和蛋白质序列的比对、序列结构预测和功能注释等。

生物序列分析可以帮助科学家理解基因和蛋白质的结构和功能,从而推断出它们在生物体中的作用。

基因组总结终极版

基因组总结终极版

1、什么是基因组学?基因组学有哪些特点?答:基因组学即基因组生物学,是研究生命遗传物质和其生物学规律的学问。

基因组学的研究对象是基因组结构特征、变演规律和生物学意义。

特点:(1)Genome sciences are sequence-based(2)Genome sciences are data-guided (not so hypothesis-driven)(3)Genome sciences is a systematic approach2、什么是模式生物?答:生物学家通过对选定的生物物种进行科学研究,用于揭示某种具有普遍规律的生命现象,这种被选定的生物物种为模式生物。

在人类基因组计划中,包括对五种生物基因组的研究:大肠杆菌、酵母、线虫、果蝇和小鼠,称之为人类的五种“模式生物”。

3、人类基因组计划是哪一年完成的?在科学上有什么意义?答:2000年完成了人类基因组“工作框架图”。

2001年公布了人类基因组图谱及初步分析结果。

意义:人类基因组计划与曼哈顿原子弹计划和阿波罗计划并称为三大科学计划。

对生命科学的研究和生物产业的发展具有非常重要的意义,它为人类社会带来的巨大影响是不可估量的。

首先,获得人类全部基因序列将有助于人类认识许多遗传疾病以及癌症等疾病的致病机理,为分子诊断、基因治疗等新方法提供理论依据。

第二,破译生命密码的人类基因组计划有助于人们对基因的表达调控有更深入的了解。

4、基因组学的发展方向是什么?答:近年来比较基因组学和动态基因组学的不断发展,使得基因组学的应用越来越广泛,向其他学科、领域逐渐渗透的趋势日趋明显,涵盖了现代农业、生态环境、结构、进化、药物、法医、营养、人类健康等各个方面。

随着各种技术水平的进步,基因组学的发展前景必将更加广阔。

5、三大公共DNA数据库是什么?答:GenBank,DDBJ,EMBL6、什么是一级数据库和二级数据库?答:一级数据库的数据直接来源于实验获得的原始数据,只经过简单的归类整理和注释,其内容由提交者提供、控制。

基因组学在生物研究中的应用方法知识点总结

基因组学在生物研究中的应用方法知识点总结

基因组学在生物研究中的应用方法知识点总结基因组学是研究生物体全部基因组的结构、功能及其相互关系的学科。

它利用高通量测序技术和生物信息学分析方法,从整体上揭示了生物体基因组的信息。

通过对基因组的研究,我们能够了解到生物体的遗传信息、基因调控、进化过程等。

本文将总结基因组学在生物研究中的应用方法知识点,以期帮助读者更好地理解和应用基因组学。

一、基因组测序基因组测序是基因组学研究的基础和核心技术。

它可以将生物体全部基因组的序列信息解读出来。

目前常用的基因组测序方法主要包括Sanger测序、二代测序和三代测序等。

其中,Sanger测序是一种经典的测序方法,基于身体的组成单元嵌在我们的DNA链中的一种特定的化学物质,所以嵌在这种意义上的物质。

它以DNA链延伸和终止法为基础,在反应体系中加入了二碱基链终止剂,通过测量不同位置的DNA链延伸的长度来确定DNA序列。

而二代测序技术相比于Sanger测序更快速、更高通量。

常用的二代测序技术包括454测序、Illumina测序等,它们通过将DNA片段连接成文库,并利用荧光信号记录DNA合成过程中释放的碱基信息,从而实现对基因组序列的高通量测序。

另外,三代测序技术则是最新的测序技术。

它主要包括单分子实时测序技术和纳米孔测序技术等。

这些技术的出现进一步提高了测序速度和质量,为基因组学研究提供了更多的机会。

二、基因组注释基因组注释是基因组学研究中的一个重要环节。

通过将基因组序列与已知基因和功能进行比对,可以确定基因组中具有功能的区域和基因。

基因组注释的方法有多种,包括基于比对的注释、基于比较基因组学的注释和基于转录组学的注释等。

其中,基于比对的注释是最常用的方法,它通过将基因组序列与已知基因进行比对,从而确定基因的起始位点、终止位点和外显子、内含子等结构特征。

另外,基于比较基因组学的注释则通过将不同物种间的基因组序列进行比对,寻找保守区域,从而推断出功能上的共有基因和进化上的关系。

基因组学-总结

基因组学-总结

1.1.DNA顺序复杂性:不同顺序的DNA总长称为复杂性。

复杂性代表了一个物种基因组的基本特征,可通过DNA复性动力学来表示。

1.2.基因的定义:不同的DNA片段共同组成一个完整的表达单位,有一个特定的表达产物,可以是RNA分子,也可以是多肽分子1.3.反义基因:是指与细胞内DNA或RNA序列相互补形成杂交体而阻断或减弱其转录和翻译过程的DNA或RNA片段.反义基因通常包括反义寡核苷酸(ASON)、反义RNA及核酶1.4.假基因:与有功能的基因在核苷酸顺序的组成上非常相似,却不具正常功能的基因。

假基因是相应的正常基因在染色体的不同位置上的复制品,由于突变积累的结果而丧失活性。

假基因都是在真核生物的基因组中发现的,在原核生物中未见报道2.1.DNA标记的类型:限制性片段长度多态性(RFLP);简单序列长度多态性(SSLP)(小卫星序列和微卫星序列);SNP.2.2.RFLP(限制性片段长度多态性)的特点: 限制酶识别的碱基具有位点专一性,用不同的限制酶处理同一样品时,可以产生与之对应的不同限制性片段,提供大量位点多态性信息。

2.3. 部分连锁与遗传作图:交换是随机的,两个相近的基因发生交换的概率要比两个相远发生交换的概率要大,因此通过重组率的确定可以相对确定两个基因的位置。

由此可以进行基因的遗传作图。

3.1.分子信标的结构:环含识别序列,一般15 --33个核苷酸;茎在两末端各接上5到8个核苷酸的互补序列,富含GC;荧光素及猝灭剂3.2.猝灭剂:荧光染料发射的光能,可被邻近的染料或非染料分子所吸收转成热能而不再发射荧光,也可以发射能量较低的荧光3.3.PRET(激光共振能量转移):受激发荧光素的能量转移到邻近的另一荧光素,并不发射荧光而使激发荧光素回复基态时的现象。

3.4.原位杂交:靶子为完整的染色体,由杂交信号提供作图信号,DNA变性时不破坏染色体自然形态,原位杂交是指将特定标记的已知顺序核酸为探针与细胞或组织切片中核酸进行杂交,从而对特定核酸顺序进行精确定量定位的过程。

基因组学总结

基因组学总结

Roche 454(GS FLX Titanium System)超高通量测序技术原理2005年底,454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System,被《Nature》杂志以里程碑事件报道,开创了边合成边测序的先河。

2007年又推出了性能更优的第二代基因组测序系统——Genome Sequencer FLX System。

2008年10月,454推出了全新的GS FLX Titanium系列试剂和软件,让GS FLX的通量一下子提高了5倍,准确性和读长也进一步提升。

GS FLX 测序原理:GS FLX系统的测序原理和GS 20一样,也是一种依靠生物发光进行DNA序列分析的新技术;在DNA 聚合酶,ATP硫酸化酶,荧光素酶和双磷酸酶的协同作用下,将引物上每一个dNTP的聚合与一次荧光信号释放偶联起来(图1)。

通过检测荧光信号释放的有无和强度,就可以达到实时测定DNA序列的目的。

此技术不需要荧光标记的引物或核酸探针,也不需要进行电泳;具有分析结果快速、准确、灵敏度高和自动化的特点。

Roche GS FLX System是一种基于焦磷酸测序原理而建立起来的高通量基因组测序系统。

在测序时,使用了一种叫做“Pico TiterPlate”(PTP)的平板,它含有160多万个由光纤组成的孔,孔中载有化学发光反应所需的各种酶和底物。

测序开始时,放置在四个单独的试剂瓶里的四种碱基,依照T、A、C、G的顺序依次循环进入PTP板,每次只进入一个碱基。

如果发生碱基配对,就会释放一个焦磷酸。

这个焦磷酸在各种酶的作用下,经过一个合成反应和一个化学发光反应,最终将荧光素氧化成氧化荧光素,同时释放出光信号。

此反应释放出的光信号实时被仪器配置的高灵敏度CCD捕获到。

有一个碱基和测序模板进行配对,就会捕获到一分子的光信号;由此一一对应,就可以准确、快速地确定待测模板的碱基序列。

基因组学实习总结

基因组学实习总结

基因组学实习总结在过去的一段时间里,我有幸在_____实验室进行了基因组学的实习。

这段实习经历不仅让我对基因组学这一前沿领域有了更深入的了解,也极大地提升了我的实践能力和科研思维。

实习伊始,我对基因组学的认识还停留在书本上的理论知识。

然而,随着实习的推进,我逐渐接触到了实际的实验操作和数据分析,这让我对这门学科有了全新的认识。

实验室的工作环境严谨而有序。

在导师和师兄师姐的悉心指导下,我首先学习了各种实验设备的使用方法,如 PCR 仪、测序仪等。

这些设备在基因组学研究中起着至关重要的作用,熟练掌握它们的操作是进行实验的基础。

在实验操作方面,我参与了 DNA 提取和纯化的工作。

这看似简单的步骤,实则需要极大的耐心和细致。

每一个操作环节都可能影响到最终的实验结果,比如在提取过程中要避免 DNA 的降解和污染。

通过多次实践,我逐渐掌握了要领,能够稳定地获取高质量的 DNA 样本。

除了实验操作,数据分析也是基因组学研究的重要环节。

我学习了使用相关软件对测序数据进行处理和分析。

这包括数据的质控、比对、变异检测等。

通过对大量数据的分析,我逐渐学会了如何从复杂的数据中筛选出有价值的信息,并解读这些信息背后的生物学意义。

在实习过程中,我也遇到了不少困难和挑战。

例如,在一次实验中,由于操作失误,导致样本受到了污染,实验结果出现了偏差。

这让我深刻认识到严谨的实验态度的重要性。

还有在数据分析时,遇到一些复杂的算法和模型,理解和应用起来颇为困难。

但通过查阅文献、向同事请教以及不断地尝试,我最终克服了这些难题。

通过这次实习,我收获颇丰。

首先,我的实验技能得到了显著提升。

从最初的手忙脚乱到后来能够独立完成复杂的实验操作,这是一个质的飞跃。

其次,我学会了如何在团队中合作。

在实验室里,每个项目都需要不同人员的协作,有效的沟通和良好的团队协作精神是项目顺利进行的关键。

再者,我培养了自己解决问题的能力。

面对实验中的各种突发情况和数据分析中的难题,我不再畏惧,而是积极寻找解决办法。

基因组学-Genomics-知识考点汇总

基因组学-Genomics-知识考点汇总

基因组学-Genomics-知识考点汇总•基因组(Genome:Gene+chromosome)细胞或生物体中一套完整的单倍体遗传物质•基因组学(Genomics)最早Thomas Roderick在1986年提出,包括基因组作图、测序和分析。

可分为结构基因组学和功能基因组学。

一、结构基因组学1.遗传图(Genetic Mapping Genomes) : Based on the calculation of recombination frequencyby linkage analysis .通过亲本的杂交,分析后代的基因间重组率,并用重组率来表示两个基因之间距离的线形连锁图谱每条染色体组成一个连锁群,所有染色体的连锁群组成的图谱即构成基因组遗传图。

重组率代表基因位点之间的相对距离。

在遗传作图中,人们把一个作图单位定义为1厘摩(cM),1cM等于1%的重组率。

提高遗传作图的分辨率:选用不同的杂交群体;增加杂交群体的数目;增加分子标记的数目;扩大分子标记的来源分子标记:绘制基因组遗传图需要的坐标点。

分子标记的主要来源是染色体上存在的大量等位基因。

在DNA水平上,两个基因间一个碱基的差异就足以形成等位基因。

2.物理图(physical map):指DNA序列上两点的实际距离,它是以DNA的限制酶片段或克隆的大片段的基因组DNA分子为基本单位,以连续的重叠群为基本框架,通过遗传标记将重叠群或基因组DNA分子有序排列于染色体上。

物理图的绘制: Based on molecular hybridization analysis and PCR techniques杂交法;指纹法;荧光原位杂交技术。

3.基因组序列测定: Sequencing methods: the chain termination procedure;Map-based clone by clone strategy;Whole genome shotgun (WGS) strategy;Sequence assembly;•传统基因组测序的方法:克隆步移法(BAC-by-BAC Strategy)和全基因组鸟抢法(Whole Genome Shotgun Strategy)。

专业进展——药物基因组学知识点归纳

专业进展——药物基因组学知识点归纳

专业进展——药物基因组学知识点归纳PART 01 药物基因组学一、药物基因组学药物基因组学:是研究人类基因变异和药物反应的关系,利用基因组学信息解答不同个体对同一药物反应存在差异的原因。

基因组(genome):是指生物体单倍细胞中一套完整的遗传物质,包括所有的基因和基因间区域(即编码区和非编码区)。

人类基因组计划是由序列(结构)基因组学向功能基因组学的转移。

开启了人类的“后基因组时代”。

后基因组时代研究的重要方向:功能基因组学比较基因组学结构基因组学蛋白质组学药物基因组学……PART 02 基因多态性二、基因多态性基因多态性是指在一个生物群体中,呈不连续多峰曲线分布的一个或多个等位基因发生突变而产生的遗传变异。

CYP450酶超大家族共涉及1000种药物的代谢(拓展)12种亚型:CYP1、CYP2、CYP3……15个亚家族:A~Q如:CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6、CYP3A5等药物转运蛋白-MDR1(多药耐药基因)(拓展)调控许多药物吸收、分布和排泄过程与胆红素、抗癌化疗药物、强心苷、免疫抑制剂、糖皮质激素、HIVⅠ型蛋白抑制剂有关药物靶蛋白-ADRB2编码人β2肾上腺受体人类白血球抗原-HLA-BHLA-B变异,将引起某些药物的严重皮肤反应内容:1.药物代谢酶的多态性同一基因位点上具有多个等位基因引起,其多态性决定表型多态性和药物代谢酶的活性,造成不同个体间药物代谢反应的差异。

是产生药物毒副作用、降低或丧失药效的主要原因之一。

细胞色素P450酶(CYP)是药物代谢的主要酶系。

在细胞色素P450的亚群中,CYP2D6、CYP2C9和CYP2C19对许多药物的效应非常重要。

(拓展)例:奥美拉唑、兰索拉唑和泮托拉唑等质子泵抑制剂由P450酶代谢,主要由CYP2C19,部分由CYP3A4代谢。

因此,CYP2C19的基因多态性会影响质子泵抑制剂的药动学,从而影响后者治疗相关疾病的临床效果。

艾司奥美拉唑仅经CYP3A4代谢。

博士计算生物学基因组学知识点归纳总结

博士计算生物学基因组学知识点归纳总结

博士计算生物学基因组学知识点归纳总结基因组学是生物科学领域中研究物种基因组结构、组成、功能和演化的学科。

计算生物学是应用计算机科学和技术研究生物学问题的学科。

博士计算生物学基因组学是一个专注于基因组学领域,应用计算方法和工具研究和解析基因组数据的学术领域。

在博士计算生物学基因组学的学习和研究过程中,我们需要了解和掌握一些重要的知识点。

本文将对博士计算生物学基因组学的关键知识点进行归纳总结,并提供相应的示例和应用。

一、基因组学基础知识1. 从DNA到基因组:了解DNA的结构和功能,掌握基因组的定义和组成,包括核糖核酸(RNA)等。

示例:DNA双螺旋结构、RNA转录和翻译。

2. 基因组测序技术:介绍常用的基因组测序技术,如Sanger测序、下一代测序(NGS)等。

示例:Illumina测序平台、PacBio长读长测序。

二、基因组比对和组装1. 基因组比对:掌握基因组比对的方法和软件,如BLAST、Bowtie、BWA等。

示例:DNA/蛋白质序列比对、多序列比对。

2. 基因组组装:了解基因组组装的原理和流程,掌握常用的组装软件,如SOAPdenovo、SPAdes等。

示例:基于Illumina数据的基因组组装流程。

三、基因组注释和功能预测1. 基因组注释:了解基因组注释的方法和数据库资源,如NCBI、Ensembl等。

示例:基因结构注释、功能注释。

2. 功能预测:熟悉常用的功能预测方法和工具,如GO注释、KEGG通路分析等。

示例:基于基因表达量的通路富集分析。

四、基因组变异分析1. 变异检测:掌握基因组变异检测的方法和软件,如SNP calling、INDEL calling等。

示例:单核苷酸多态性(SNP)、插入/缺失变异(INDEL)检测。

2. 变异注释:了解基因组变异注释的方法和数据库资源,如dbSNP、ClinVar等。

示例:功能影响预测、路径ogenicity预测。

五、转录组学和可变剪接分析1. RNA测序:熟悉RNA测序技术和数据分析方法,如RNA-Seq、scRNA-Seq等。

基因组学知识点

基因组学知识点

基因组学知识点基因组学是研究生物个体遗传物质的组成、结构、功能和变异等的一门科学。

下面将介绍基因组学的几个重要知识点。

一、基因组的概念和组成基因组指一个个体或者一个物种所拥有的所有基因的集合。

基因组由DNA分子构成,DNA是生物体内存储遗传信息的分子。

人类的基因组由大约30亿个碱基对组成,这些碱基对编码着我们的遗传信息。

基因组还包括非编码DNA序列,这些序列虽然不直接编码蛋白质,但在基因调控和遗传变异中起着重要作用。

二、基因组测序技术基因组测序是基因组学研究的重要手段。

体外测序技术的出现使我们能够更加高效、准确地测定基因组的序列。

目前常用的基因组测序技术有Sanger测序、Illumina测序和第三代测序技术等。

这些技术的不断发展使得我们能够深入研究基因组中基因的分布、变异以及功能。

三、基因组水平的生物信息学分析基因组水平的生物信息学分析能够帮助我们理解基因组的结构和功能。

其中基因预测是基因组水平的重要任务之一,通过计算机算法,预测基因组DNA序列中的基因位置、结构和功能。

基因注释是对已预测的基因信息进行进一步分析和解释,包括基因的功能、进化关系和调控信息等。

四、基因组变异和人类疾病基因组变异是指个体之间基因组DNA序列的差异。

人类基因组的变异包括单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失变异和结构变异等。

这些变异在人类的个体差异、种群进化以及人类疾病的发生和发展中起着重要作用。

基因组学的研究使我们能够深入了解基因组变异与疾病之间的关联。

五、基因组学在个性化医学中的应用基因组学的发展对个性化医学产生了重大影响。

通过对个体基因组的分析,医生可以更好地为病患提供个体化的诊断和治疗方案。

例如,基因组学研究对癌症靶向治疗的发展做出了重要贡献。

此外,基因组学的研究还有助于预测个体对药物的反应和药物剂量的调整,提高了药物治疗的效果和安全性。

六、基因组学在植物和动物研究中的应用基因组学的研究不仅局限于人类,还广泛应用于植物和动物研究中。

高中生物基因组学知识点总结

高中生物基因组学知识点总结

高中生物基因组学知识点总结在生物学领域中,基因组学是研究生物体基因组的科学。

基因组是一个生物体内的所有DNA分子的集合,它承载着生物体所有的遗传信息。

基因组学的研究可以帮助我们更好地理解生物的遗传特征以及遗传疾病的发生机制。

本文将对高中生物基因组学的关键知识点进行总结。

一、DNA的结构和功能DNA是生物遗传信息的携带者,其结构和功能对于理解基因组学至关重要。

1. DNA的结构DNA是由磷酸、脱氧核糖和四种碱基(腺嘌呤、胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶)组成的双链螺旋结构。

两条链通过氢键相互连接,形成了DNA的双螺旋结构。

2. DNA的功能DNA通过编码蛋白质的遗传信息,控制生物体的发育和功能。

同时,DNA还能进行DNA复制、转录和翻译等过程,以完成基因的表达和遗传信息的传递。

二、基因组的组成与特点1. 基因基因是指能够编码蛋白质或功能RNA的DNA序列。

基因组中的基因数量和组织方式因物种而异,不同基因在基因组中的排列方式也不同。

2. 基因组的组成基因组由染色体组成,染色体是一条线型的DNA分子。

人类基因组中有23对染色体,其中一对性染色体决定了个体的性别。

3. 基因组的特点基因组具有巨大的信息量和高度的可变性。

基因组中的基因序列可以通过突变和重组等变化,导致物种的进化和遗传多样性。

三、基因组学的研究方法1. 基因组测序基因组测序是研究基因组的重要方法。

通过测序技术,可以确定一个生物体整个基因组的序列,从而对基因组的结构和功能进行更深入的研究。

2. 基因表达分析基因表达分析可以帮助我们了解基因在不同组织、不同发育阶段以及不同环境条件下的表达情况。

这对于揭示基因功能以及研究疾病发生机制具有重要意义。

3. 基因组编辑技术CRISPR-Cas9是一种常用的基因组编辑技术。

通过设计特定的引导RNA,可以利用Cas9蛋白切割基因组中的特定片段,实现基因的添加、删除或修改,从而改变生物体的遗传特征。

四、基因组学的应用1. 遗传疾病的研究和诊断基因组学可以帮助人们了解遗传疾病的发生机制,并且提供基因诊断的方法。

基因组学重要知识点

基因组学重要知识点

基因组学重要知识点什么是基因组学?基因组学是研究生物体完整基因组的科学分支。

基因组是生物体内包含所有遗传信息的DNA的总和。

通过研究基因组,我们可以深入了解生物的遗传特征、进化历史以及与各种疾病的关联。

人类基因组计划人类基因组计划是20世纪末至21世纪初的一项重要科学研究项目,旨在解析人类的基因组序列。

该项目于2003年完成,成功地确定了人类基因组中约300亿个碱基对的顺序。

基因组的结构一个生物体的基因组通常由DNA分子组成。

DNA是一种双螺旋结构,由四种碱基(腺嘌呤、胸腺嘧啶、鸟嘌呤和胞嘧啶)构成。

这些碱基的不同排列顺序决定了生物体内不同基因的编码方式。

基因组的功能基因组承载了生物体的遗传信息,决定了其形态特征、生理功能和行为特性等。

基因是基因组中的一个单位,由DNA编码。

通过基因组研究,我们可以了解到特定基因与特定性状之间的关系,为疾病的预防和治疗提供重要依据。

基因组的重要应用1. 进化研究通过比较不同物种的基因组,可以了解到它们之间的进化关系。

基因组研究揭示了生物种群的遗传多样性、物种起源和演化等重要问题。

2. 疾病研究基因组研究在疾病的起因和发展机制方面起着重要作用。

通过对疾病相关基因的研究,可以了解到疾病的遗传风险、致病机理以及潜在的治疗方法。

3. 药物研发基因组研究为药物研发提供了重要的依据。

通过研究基因组中的特定基因,可以了解到药物对不同个体的疗效差异,从而实现个体化的药物治疗。

4. 农业改良基因组研究对农业领域也有着重要意义。

通过研究作物和家畜的基因组,可以培育出更具产量、抗病性和适应性的新品种,提高农作物的产量和质量。

基因组学的挑战和前景尽管基因组学取得了巨大的进展,但仍面临一些挑战。

首先,基因组的解读仍存在困难,因为我们对许多基因的功能和相互作用了解有限。

其次,随着技术的进步,大规模基因组数据的处理和分析也面临着巨大的挑战。

然而,基因组学在未来的发展前景依然广阔,将为医学、农业、生态学等领域带来更多的突破。

基因组学总结

基因组学总结

一、前言继20世纪50年代Watson和Crick揭示了遗传信息携带者DNA的双螺旋结构后,近50年来分子生物学的发展势如破竹。

60年代中期遗传信息传递的中心法则的初步确定;70年代基因重组理论和技术的崛起;以及近二三十年来基因的表达和调控及相关的发育分子生物学的进展;蛋白质翻译后加工、折叠、组装、转运,生物大分子相互识别、信号转导的深入研究等;一个个里程碑工作接踵而来。

人类基因组计划业已完成,不久完整的人类基因组序列将呈现在人们面前.一个崭新的时代——后基因组时代已经来临。

基因即DNA分子上有遗传效应的特定核苷酸序列的总称,基因组即细胞或生物组的全部遗传物质,遗传物质即基因的编码序列,大量的非编码序列同样含有遗传物质。

1985年美国科学家率先提出了人类基因组计划(HGP:Human Genome Plan),1990年正式启动。

这是一项规模宏大的跨国跨学科的科学探索工程,其宗旨在于测定人类染色体中所包含的30亿个碱基对组成的核苷酸序列,从而绘制人类基因组图谱,并且辨认其载有的基因及其序列,从而达到破译人类遗传信息的目的。

该项计划是继曼哈顿计划和阿波罗登月计划之后人类历史上的一个伟大工程。

2001年人类基因组工作草图的发表被认为是人类基因组计划成功的里程碑,2005年人类基因组计划的测序工作已经基本完成,同时制作出了遗传图谱、物理图谱、序列图谱和基因图谱四张图谱。

二、人类基因组计划的成功完成对人类的意义1、对人类各个领域的贡献a 对人类疾病基因研究的贡献:人类疾病相关的基因是人类基因组中结构和功能完整性至关重要的信息。

对于单基因病,采用“定位克隆”和“定位候选克隆”的全新思路,导致了亨廷顿氏舞蹈症、遗传性结肠癌和乳腺癌等一大批单基因遗传病致病基因的发现,为这些疾病的基因诊断和基因治疗奠定了基础。

对于心血管疾病、肿瘤、糖尿病、神经精神类疾病(老年性痴呆、精神分裂症)、自身免疫性疾病等多基因疾病是目前疾病基因研究的重点.健康相关研究是HGP的重要组成部分,1997年相继提出:“肿瘤基因组解剖计划”“环境基因组学计划”。

基因组学知识点整理

基因组学知识点整理

AC/DS转座Ac/Ds系统是玉米转座子系统之一。

Ac是自主控制因子(autonomous element),或称激活因子,长4563bp,含有一个转座酶基因和一段与转座酶的近末端重复区域邻接的、短的不完整的反向重复序列。

Ac缺失后能形成不同形式的Ds。

Ds-a和Ac相似,只缺失了部分转座酶基因。

这点可解释Ds自身不能发生转座的原因。

Ds-b的缺失片段较长,仅保留了转座酶基因的一个小片段。

Ds-c仅剩有Ac因子中反向重复序列和与转座酶结合的近末端重复区域。

这些区域和片段都是Ds-c在Ac指导下转座所必须的靶位点。

Ac能自主转座,并形成不稳定的基因突变,但不使染色体断裂,它能使Ds因子活化、转座,并通过Ds控制结构基因的表达,有剂量效应,当Ac剂量增加时,相关的遗传效应延迟发生。

Ds是非自主因子(nonautonomous element),又称解离因子,是与Ac属于同一家族的控制因子,Ds是由Ac因子中间序列的缺失而形成的,从而失去转座酶功能。

当Ac因子存在时,能活化Ds,使其在基因组内转座或插入结构基因之内,导致基因失活或改变结构基因的表达水平,也可使染色体特定部位断裂,引起缺失或重组。

玉米Ds的存在能抑制邻近基因的表达。

Ac-Ds的转座通过非复制型机制发生,且总是转移到邻近的位置,当插入新靶位点后,原来位置上即失去Ds因子,结果可造成染色体断裂或重排,由此可引起显性基因丢失,隐性基因表达。

(小结)Ac是自主控制因子,Ds是非自主因子,Ac因子能自主转座并形成不稳定的基因突变,但不使染色体断裂,它能使Ds因子活化、转座,并通过Ds因子控制结构基因表达。

Ac因子中间缺失后能形成不同形式的Ds因子,无转座酶功能。

Ac因子能活化Ds因子,使其在基因组内转座或插入结构基因内导致基因失活或改变基因的表达水平,也可使染色体特定部位断裂,引起缺失或重组。

Ds因子必须由Ac提供转座酶才能转座,Ds因子或多或少缺失Ac因子中的部分片段。

基因组学综述

基因组学综述

基因组学综述随着科技的不断进步,基因组学的研究越来越受到关注。

基因组学是研究生物体内特定的基因和它们的功能,以及整个基因组的构成和演化的学科。

在这一领域的研究对于了解生命的起源、进化和疾病发生机制都有重大的意义。

基因组的构成基因组是生物体所有基因的总和,它是由DNA组成的。

DNA是一个具有双螺旋结构的分子,由四种碱基A、T、C、G组成。

DNA通过三联体密码的方式编码蛋白质,在这个过程中,相邻的三个碱基(称为密码子)编码一个氨基酸。

人类基因组中大约有2000万个基对,约占整个DNA分子的1%。

研究基因组的方法研究基因组的方法主要包括:全基因组测序、基因组重测序、转录组测序和蛋白质组学等。

其中,全基因组测序是当前最常用的方法之一,它可以对一个生物体的所有基因进行测序和分析。

基因组的演化基因组的演化是生物发展史上的重要一环,它涉及到种群,个体和个体内部遗传信息的演化。

基因组的演化可以通过比较不同物种的基因组来研究,这被称为比较基因组学。

比较基因组学可以揭示生物进化的历史和关系,并帮助科学家理解物种之间的相似性和差异性。

基因组的应用基因组学有着广泛的应用领域,其中包括医学、农业和环境等。

在医学领域,基因组学可以用来研究疾病基因的发现、个体化医学诊断和治疗,以及药物的开发。

在农业领域,基因组学可以用来改进作物的品质和产量,并提高养殖业的效率。

在环境领域,基因组学可以用来研究生态系统和物种的保护。

总之,基因组学是一个涉及到生命科学、医学和农业等多个领域的重要学科。

它的发展将促进我们对于生命的认知,推动人类的医学、农业和环境保护事业发展。

  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

一、前言继20世纪50年代Watson和Crick揭示了遗传信息携带者DNA的双螺旋结构后,近50年来分子生物学的发展势如破竹。

60年代中期遗传信息传递的中心法则的初步确定;70年代基因重组理论和技术的崛起;以及近二三十年来基因的表达和调控及相关的发育分子生物学的进展;蛋白质翻译后加工、折叠、组装、转运,生物大分子相互识别、信号转导的深入研究等;一个个里程碑工作接踵而来。

人类基因组计划业已完成,不久完整的人类基因组序列将呈现在人们面前。

一个崭新的时代——后基因组时代已经来临。

基因即DNA分子上有遗传效应的特定核苷酸序列的总称,基因组即细胞或生物组的全部遗传物质,遗传物质即基因的编码序列,大量的非编码序列同样含有遗传物质。

1985年美国科学家率先提出了人类基因组计划(HGP:Human Genome Plan),1990年正式启动。

这是一项规模宏大的跨国跨学科的科学探索工程,其宗旨在于测定人类染色体中所包含的30亿个碱基对组成的核苷酸序列,从而绘制人类基因组图谱,并且辨认其载有的基因及其序列,从而达到破译人类遗传信息的目的。

该项计划是继曼哈顿计划和阿波罗登月计划之后人类历史上的一个伟大工程。

2001年人类基因组工作草图的发表被认为是人类基因组计划成功的里程碑,2005年人类基因组计划的测序工作已经基本完成,同时制作出了遗传图谱、物理图谱、序列图谱和基因图谱四张图谱。

二、人类基因组计划的成功完成对人类的意义1、对人类各个领域的贡献a 对人类疾病基因研究的贡献:人类疾病相关的基因是人类基因组中结构和功能完整性至关重要的信息。

对于单基因病,采用“定位克隆”和“定位候选克隆”的全新思路,导致了亨廷顿氏舞蹈症、遗传性结肠癌和乳腺癌等一大批单基因遗传病致病基因的发现,为这些疾病的基因诊断和基因治疗奠定了基础。

对于心血管疾病、肿瘤、糖尿病、神经精神类疾病(老年性痴呆、精神分裂症)、自身免疫性疾病等多基因疾病是目前疾病基因研究的重点。

健康相关研究是HGP的重要组成部分,1997年相继提出:“肿瘤基因组解剖计划”“环境基因组学计划”。

b 对医学的贡献:基因诊断、基因治疗和基于基因组知识的治疗、基于基因组信息的疾病预防、疾病易感基因的识别、风险人群生活方式、环境因子的干预。

c 对生物技术的贡献:对研发基因工程药物和诊断研究试剂产业有巨大推动。

d 对细胞、胚胎、组织工程的贡献:胚胎和成年期干细胞、克隆技术、器官再造。

f 人类基因组计划的完成,在社会经济、生物进化等方面都有重要影响。

2、基因检测在个体化医学方面的应用人类基因组计划和一系列的实验完成之后积累的大量的数据资料,科学家们面临的挑战就是如何利用这些数据的巨大潜力去改善人类的健康状况并使人类更好的生存,探索出一条造福人类健康的崭新途径。

大部分表型都是由遗传因素(基因及其产物)和非遗传因素(环境因素)交互作用,HGP的研究成果以及基因组学的研究,有助于我们了解遗传因素在人类健康和疾病中的角色,精确确定非遗传因素,并迅速将新发现用于疾病的预防、诊断和治疗。

例如鉴定基因及其路径在健康和疾病中的角色,测定它们与环境因素之间的关系,预测药物反应,疾病的早期诊断,疾病在分子水平上的精确分类等。

因此基因组学的进展将推动人们发展相应基因组研究方法,对人类基因组可遗传变异进行更为深入细致全面描述和分析。

目前科学家们建立起一套人类基因常见差异的细目,包括核苷酸多态性(SNPs),小的缺失和插入,以及其它结构上的不同,并致力于寻找不同表型与DNA序列变异之间的关联。

HapMap和SNPs 将会揭示基因差异与疾病的关系,架起连结人类健康与疾病差异的桥梁,也将极大程度推动对一般疾病的遗传机制和药物基因组学的研究。

3、复杂疾病与遗传分析复杂疾病的发生是由多种遗传因素和多种内外界环境因素的共同作用,对复杂疾病进行遗传分析的主要目标之一就是找出其易感基因。

复杂疾病在遗传学上具有某些独特的复杂特点,致使各种遗传分析的效力不够高,还需要一定深度的研究。

三、基因命名的方法2、基因的命名人类基因的命名一半由基因符号和基因名称组成,如CTP2C9 “cytochrome P450, family 2,subfamily C,polypeptide 9”。

基因命名时一般要遵循简明、独特和能够表达基因的特征或功能三个基本原则,基因名称一般使用美式英语拼写,且为小写,不能在名称中对组织特异性、分子量等信息进行详细描述。

当使用到人名时首字母要大写,对基因名称进行限定时,限定词放在名称后面并用“,”隔开。

使用替代名称作为基因名称的一部分时,替代名称放在括号内,与其它种属同源的基因,应使用已获得批准的基因名称和符号,在名称后面加注“homolog”并在括号内标明种属。

基因符号的命名要遵循简短独特、不含任何标点符号、仅含拉丁字母和阿拉伯数字三个基本原则。

3、基因变异位点的命名基因突变的类型主要有点突变,移码突变,缺失突变和插入突变。

所有变异发生的最终都是DNA水平的变异引起相应RNA或蛋白质水平的变化。

DNA变异涉及的四种碱基AGCT需大写,RNA中则小写,蛋白质水平氨基酸的变异使用前三个字母的缩写。

变异序列的类型:g代表基因组序列,c代表编码DNA,P代表蛋白序列。

突变表示方法:置换突变(“>”):如241T>G代表序列的第241位核苷酸T被G 替换。

缺失突变(“del”):如692-694del代表692,693,694位三个核苷酸连续缺失。

插入突变(“ins”):如451-452insT,代表451位与452位核苷酸之间插入了一个胸腺嘧啶脱氧核苷酸。

内含子突变(“IVS”):当全基因组序列未知时,供体位置GT的G位用+1表示,受体位置AG的G位开始用-1表示。

如IVS4+1G>T 代表在第四个内含子的+1核苷酸处G突变为T;IVS4-2A>C代表在第四个内含子的-2核苷酸处A突变为C。

cDNA核苷酸的编号可以用来指示内含子附近的突变位点。

如c.1997+1G>T,cDNA第1997位核苷酸下游+1处G替换为T。

重复突变(“dup”):如序列ACTTTGTGCC突变为ACTTTGTGGCC不能描述为18_19insG,而应描述为18dupG。

倒位(“inv”):如76_83inv表示第76到83位氨基酸之间的片段发生倒位。

四、生物信息学的重要性1、生物信息学及相关生物信息的查询随着生物实验技术及检测手段的发展、人类基因组计划的完成、及基因组学的发展,产生了成千上万的数据,这些数据也覆盖了生命科学的各个领域。

基因组数据库、(核酸、蛋白质)序列数据库、生物大分子(主要是Pr)结构数据库、及文献数据库应运而生。

而对于这些信息的查询和使用则依赖于一系列相关的数据库。

NCBI, 是一个综合数据库,包括GeneBank 数据库、Pupmed 文献数据库、人类孟德尔遗传数据库OMIM、3D蛋白结构分子模型数据库、分类学浏览器等。

搜索检索:Entrez系统,可检索(DNA、RNA、蛋白质)序列、(蛋白质)结构及参考文献。

2、基因测序技术及原理基因测序主要是通过某种方法检测出一条DNA链中核苷酸的排列顺序。

目前用于基因测序的方法主要有Sanger双脱氧链末端终止法和Maxam-Gilbert化学降解法,其中Sanger双脱氧链末端终止法应用的更为广泛。

原理:(1)Sanger双脱氧链末端终止法:由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH 基团,该方法利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物,直到掺入一种链终止核苷酸为止,每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止,终止点由反应中相应的双脱氧而定。

结果通过高分辨率变性凝胶电泳分离并用X- 光胶片放射自显影或非同位素标记进行检测。

(2)Maxam-Gilbert化学降解法:将一个DNA片段的5'端磷酸基作放射性标记,再分别采用不同的化学方法修饰和裂解特定碱基,从而产生一系列长度不一而5'端被标记的DNA片段,这些以特定碱基结尾的片段群通过凝胶电泳分离,再经放射线自显影,确定各片段末端碱基,从而得出目的DNA的碱基序列。

3、复杂疾病易感基因测序可以通过外显子组测序,针对全基因外显子区域的DNA筛查复杂疾病的易感基因。

4、SNP检测技术基因检测的方法主要有SNP检测,甲基化检测和基因表达检测。

SNP具有密度高、代表性强、高度稳定和易自动化的特点,理想的SNP检测方法应该能够检测出常见SNP、稀有SNP和突变位点。

高通量时代SNP的检测方法有DNA测序法、基因芯片法、变性高效液相色谱法(DHPLC)、TagMan探针法、MassARRAY法等。

SNP检测方法:(1)对未知SNP进行检测时,方法主要有:温度梯度凝胶电泳(TGGE)、变梯性度凝胶电泳(DGGE)、单链构象多态性(SSCP)、变性高效液相色谱检测(DHPLC)、限制性片段长度多态性(RFLP)、随机扩增多态性DNA(RAPD)等。

(2)对已知SNP进行检测时,主要方法有:等位基因特异寡核苷酸片段分析(ASO)、突变错配扩增检验(MAMA)、基因芯片技术(gene chips)等。

五、后基因组计划1、国际人类基因组计划单体型图计划人类基因组计划的结果表明,人类的基因99%都是相同的,只有1%不同,而仅仅这1%的不同,就足以引起人类日常生活中对药物敏感性、免疫能力等各方面极大的不同,比如同一种药物对部分人有很好的疗效,而对部分人却效果甚微:相同的职业、相仿的年龄,有的人却比别人更容易生病等。

这一系列不同的原因,就再于那1%的差异,多核苷酸多态性(SNP)是造成每个人对药物的敏感性不同、血型不同、身高差异等的原因,此外,SNP也和癌症、心血管疾病、自体免疫等疾病有关。

位于一条染色体上或某一区域的一组相关联的SNP位点称为单体型,实际上大多数染色体区域只有少数几个常见的单体型(P>5%),代表了一个群体中人与人之间的大部分多态性,且不同民族、群体单体型类别和频率都不同。

由于发现了这些个体差异的原因,2002年10月27日至29日,“国际人类基因组单体型图计划(HAPMAP计划)”正式揭幕,该项计划是人类基因组计划的自然延伸,目的是构建人类DNA序列中多态位点的常见模式,即单体型图(HapMap),运用单倍体分型的方法来找出约50万个标签SNP来代表整个人类基因图谱之中的SNP集合,这些标签SNP与表现型间的关联也更容易显现出来。

国际HapMap 计划通过提供充分资源,使研究人员用于发现与疾病及个体治疗反应相关的遗传多态位点,从而对人类健康做出贡献。

相关文档
最新文档