第四章次级代谢

代谢调控学者认为抗生素的生源学是：次级代谢物 的作用不在于产物而在于产物生产的过程 。
1.4 初级与次级途径的相互关系

初级代谢为次级代谢提供前体化合物 初级代谢中间体修饰为次级代谢终产物的方式
生物氧化与还原（醇与羰基的氧化、双键的引入或还原） 生物甲基化（甲硫氨酸为供体，常出现在合成最后一步） 生物卤化（对于分子上含有卤素的次级代谢物很重要）
3.5 次级代谢物合成酶的专一性
① 次级代谢物合成酶往往只具有簇的专一性，即对基质分 子的某一部分有要求，对分子的其他部分无绝对要求。
如：产黄青霉的青霉素酰基转移酶能催化青霉素N的a-氨基己二酰侧链，
使转化为疏水性的酰基侧链。此反应专一性较高，因它不能酰化7-氨基 头孢霉烷酸(7-ACA)，但接受广泛的内源与外源酰基CoA衍生物。
② 参与初级代谢物和次级代谢物生物合成的基本差别之一在 于引物和延长单位的异质性。
如：如由于缺少高度专一性，乙酰CoA、丙二酰CoA和丙二酰胺CoA可在
四环类抗生素合成中作引物。同样，杀假丝菌素合成中几种芳香酰基 CoA衍生物也可作引物。
③ 然而，不是所有参与次级代谢物合成的酶都缺乏基质专一 性。有些具有高度专一性。
C 聚多酮途径：大多数真菌产生的芳香代谢物是
由乙酸通过聚多酮途径合成的。
（5）经修饰的糖与氨基酸
糖的碳架以整体的方式结合到抗生素，但是在结合前需要
经过差向异构化、异构化、氧化、去羟基、重排等环节。
（6）环己醇与氨基环己醇
链霉素、庆大霉素、新霉素和卡那霉素
（7）脒基和甲基
甲基的来源
抗生素生物合成中的所有甲基化作用均以Met作为甲基供体，
次级代谢物的种类
抗生素 色素 根据产物的作用分 生物碱 毒素 维生素
1 引论
1.1 微生物次级代谢物的特征
（1）次级代谢产物一般不在产生菌的生长期产生，而 是在随后的生产期形成。
避免生长受其自身产物的抑制 培养液中缺乏某种营养物质
或者前体物质的积累起到诱导作用
或编码次级代谢产物的基因从分解代谢物阻遏中解脱出来所致。
中间体
是指养分或者基质进入一途径后，被转化为一种或者 多种不同的物质，均被进一步代谢，最后获得该途径 的终产物
如何区分基质、中间体、前体 ？
前体与中间体的区别： 前体的结构往往略需改变后才进入到代谢 途径中去；有时指同一物质。
可作为次级代谢物前体的物质
Betina认为，次级代谢 物的前体大多数源自初级 代谢的中间体： 糖类 莽草酸/或芳香氨基酸 非芳香氨基酸 C1化合物 脂肪酸 柠檬酸循环中间体 嘌呤和嘧啶 Martin等将可作为次级 代谢物前体的初级代谢的 中间体分为： 短链脂肪酸 异戊二烯单位 氨基酸 糖与氨基糖 环乙醇与氨基环己醇 脒基 嘌呤与嘧啶碱 芳香中间体与芳香氨基酸 甲基
次级代谢专用的关键酶通常受次级代谢物的控制：
例1：麦角生物碱生物合成的第一个酶受Trp或其类似物的诱导作用。
从生长期到生产期的过渡期间较高的Trp库存量导致DMAT合成酶 的浓度增加。 例2：苯恶嗪酮合成酶是放线菌素生物合成的关键酶，受葡萄糖分 解代谢物阻遏。 例3：磷酸阻遏灰色链霉菌的对氨基苯甲酸合成酶的形成。
2.3 前体的作用
（1）抗生素建筑材料
例如：丙酮酸可用于Ala、Val、Leu等的合成，是几种肽类抗生素（头 孢菌素簇或青霉素簇）合成的重要中间体。
次级代谢物通常由初级中间体产生，将初级中间体转
化为次级终产物有三个生化过程：
①生物氧化和还原；
②生物甲基化；
③生物卤化。
许多次级代谢物是用不同的中间体作为建筑单位合成的。
含有正常的核苷的抗生素，例如（狭霉素C以 及蛹虫草菌素）,或者核糖部分或嘌呤或嘧啶部分 被修饰。
2.2.2 外源前体的来源

青霉素G前体：苯乙酸、苯乙胺、苯乙酰胺、苯乙酰苷氨酸
头孢菌素前体－－－与青霉素基本相似 红霉素簇前体－－－丙酸


螺旋霉素前体－－－乙酸、丙酸、丁酸
麦迪霉素前体－－－丙酰CoA 环孢菌素前体－－－氨基酸 氨基糖苷类抗生素前体－－－N－乙酰葡糖胺、 N－乙酰胞壁酸
（1）前体合成的分子调节机制
* 如初级代谢和次级代谢均需要同一种必需的前体， 则低浓度的前体需先满足生长的需要。 * 高浓度的前体是抗生素合成所必需的，除去前体 生物合成的反馈调节机制有可能使抗生素增产。
（2）前体导向抗生素的合成
次级代谢物的前体源自初级代谢，前体叉向次级代谢物 合成途径的第一个酶往往是关键。 因为：它决定前体流向抗生素合成的数量、代谢流的分 布和抗生素的产量。途径中可能存在其他限制性酶。 这些酶往往受到反馈、碳、氮或磷的调节。另一些酶可 能受到高浓度前体的诱导。 引向初级和次级代谢物的支路途径的生理调节随不同的 M及其代谢途径而有所不同。
（3）添加前体的策略
研究前体添加策略对有些抗生素高产稳产有重要意义。 高产菌株对前体的利用率(可>90％)比低产菌株高许多。
添加前体时宜少量多次或流加，控制发酵液中前体的
残留浓度在适当范围。 例如：苯乙胺浓度在0.05％～0.08％。
3 次级代谢物生物合成原理
3.1合成原理
前体存在，在适当条件下它们便流向次级 代谢物生物合成的专用途径。 在某些情况下单体结构单位被聚合，形成 聚合物，如聚酮化物、寡肽和聚醚类抗生 素等。 这些特有的生物合成中间产物需作后几步 的结构修饰，修饰的深度取决于产生菌的 生理条件。 最后，有些复杂抗生素是由几个来自不同 生物合成途径组成的。
通过甲基转移酶进行。而Met的甲基源自N5-四氢叶酸。 转甲基时Met先活化，即在Mg2+和ATP存在下生成高能甲基 供体：S-腺苷酰甲硫氨酸(SAM)。以SAM进行甲基化后自己变成 S-腺苷酰高半胱氨酸(SAH)，后者可被水解为腺苷和高半胱氨酸。
（8）经修饰的嘌呤和嘧啶碱
核糖部分或嘌呤或嘧啶部分被修饰。
如：红霉素合成酶形成红霉内酯糖苷配基时只接受甲基丙二酰CoA作为
延长单位，而不用丙二酰CoA单位。杀假丝菌素合成酶总是按既定的顺 序聚合适当的前体单位。
4 抗生素的生物合成
合成次级代谢物是作为储藏物； 作为正常代谢的无用的副产物； 大分子消化后残留的碎片； 解除体内有害代谢物的毒性； 支路代谢物； 竞争需要，用于抑制其他微生物，争夺有限的养分； 进化遗留所致； 在自然界具有生态上功能； 调节功能，至少与形态学的分化方面有关； 代谢维持产物，其作用主要是代谢过程而不是产物本身。
糖类
聚酯酰类
核酸碱基类似物
细交链孢菌酮酸 灵菌红素
糖肽
糖脂类化合物
1.4 抗生素的生源学

生源学: 又称生物发生学，是研究一些天然物质(包括有生
命的物质)发生、存在的原因，以及它对宿主、环境的作
用的科学。

抗生素生源学: 研究一些微生物会产生这类对其他微生
物、甚至对其自身有害物质的原因及这类物质的功能。
（2）诱导抗生素生物合成 在细胞中的特殊合成酶的活性已被激活的情 况下，细胞可利用的前体浓度具有调节抗生素生
产的作用。例如：缬氨酸是头孢菌素A的前体物
质和诱导物质。
前体与诱导物的区别
诱导作用在次级代谢物的合成控制上起
重要作用。有时难于区分这种促进作用是真 的诱导物的作用还是前体的作用。
① 诱导物与前体的作用时期不同 ② 诱导物应能被非前体的结构类似物取代。
第四章
本章主要内容

引论
微生物次级代谢的特征
次级代谢产物的类型 抗生素的生源学


次级代谢物生物合成的前体
次级代谢物的生物合成原理


抗生素的生物合成
微生物次级代谢作用的调控
概念：
次级代谢是指微生物在一定的生长时期(一般是稳定生长
期)，以初级代谢产物为前体，合成一些对微生物的生命 活动没有明确功能的物质的过程。这一过程的产物即为次 级代谢产物。






2.2.1 内源前体的来源
(1) 短链脂肪酸----大环内酯类抗生素
目前，沿用的大环内酯类有
乙酸 CoA 丙酸 CoA 丁酸 CoA
红霉素、麦迪霉素、螺旋霉素、 乙酰螺旋霉素、交沙霉素、柱晶
白霉素。
（2）异戊二烯单位
异戊二烯单位可参与萜和一些抗生素的合 成，如真菌代谢物、动植物和真菌的甾类化合物 和萜的形成。
3.2 前体聚合作用过程
通过前体单体聚合的次级代谢物有：
四环类、大环内酯类、安莎霉素类、真菌芳香化合
物的聚多酮类和肽类抗生素，以及聚醚和聚异戊二烯类
抗生素。这些聚合过程所涉及的生物合成机制对上述次
级代谢物均适用。这说明这类合成酶具有共同的进化渊
源。
聚合反应是由高相对分子质量的合成酶催化的：
例如：肽类抗生素合成酶 聚多酮合成酶
2 次级代谢物生物合成的前体
2.1 研究次级代谢的意义
2.2 前体的概况
2.3 前体的作用
2.4 前体的限制性
2.1 研究微生物次级代谢的意义：
a) 获得与次级代谢有关的基础理论知识，并用于设 计更为有效的途径来合成这类复杂的化合物或改 造它们，以获得所需的生物性质；
b) 有助于优化次级代谢产物的工业生产。 c) 借助于生物合成途径的知识，利用基因工程技术 可以帮助构建在遗传学上能产生新化合物的突变 株。
（8） 微生物的次级代谢产物的合成过程是一类由多基因 控制的代谢过程
这些基因不仅在微生 物染色体上，而且也 位于质粒上。
1.2 次级代谢物的合成
微生物次级代谢产物的合成过程可以概括为如下模式：
三 个 步 骤
前体聚合
结构修饰
组分装配
1.3 次级代谢物的类型
根据次级代谢产物中主要组分与初级代谢的关系
前体常常是次级代谢物生物合成的限制因素。
例1：在发酵过程中加适量苯乙酸可强烈促进苄青霉素的生产； 例2：丙酸或丙醇促进大环内酯抗生素的生物合成。
例3：肽类抗生素的形成中非蛋白的AA成分通常是限制因素。
例4：缺少Ac-CoA会限制四环素的生产。 例5：金色链霉菌低产菌株的特征是Ac-CoA倾向于走TCA循环而被氧 化；高产菌株没有这一倾向。 例6：诺尔斯链霉菌合成制霉菌素的能力的提高与其前体，丙二酸和甲 基 丙二酸合成的增加有关。
③ 诱导物的另一个特征是其诱导系数特别高。
思考： 当添加前体物质却不一定能 促进次级代谢产物的合成。

前体物质不能被吸收或者不能到达合成次级 代谢的部位 添加的物质可能对细胞本身的合成产生反馈 抑制作用，或者不是所需要的前体物质
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添加的前体物质不是起限制作用的物质
其他的反馈抑制
2.4 前体的限制性
次级代谢物生 物合成步骤：
① 养分摄入；
② 通过中枢代谢途径养分转化为中间体；
③ 次级代谢物前体的生物合成；
④ 如有必要，改变其中的一些中间体；
⑤ 前体进入次级代谢物生物合成专有途径；
⑥ 次级代谢的主要骨架形成后作最后的修饰，
成为产物。
2.2 前体的概况
前体(precursor)：是初级代谢的中间体或由培养基提供的， 能被代谢形成某种终产物的物质。 自身的结构无多大变化，有些还具有促进产物合成的作用。
3.3 次级代谢物结构的后几步修饰 聚合后许多次级代谢物的化学结构通过多
步酶反应修饰完成。
3.4 复合抗生素中不同部分的装配
某些次级代谢物是由单一类前体衍生的，（例如同型 肽）。许多次级代谢物由几类不同的前体合成的。（例如，
杂肽类抗生素是由氨基酸和脂肪酸组装成的）。
如：①链霉素：由N-甲基-L-葡萄糖胺、链霉糖和链霉胍三部分组成。 ②新生霉素：由新生霉糖、香豆素、对氨基苯甲酸和异戊烯四个部 分组成的。 ③杀假丝菌素：由对氨基苯甲酸与4个丙酸，15个乙酸和一个丁酸单 位缩合组装的，并连接上一个罕见的碳霉糖胺。 ④诺卡菌素：由L-高丝氨酸、修饰过的L-对羟苯甘氨酸、L-Ser和未经 修饰的L-对羟苯甘氨酸组成 。
（2）次级代谢物种类繁多，含有不寻常的化学键
（3）一种菌可以产生结构相近的一族抗生素
产黄青霉可产生 至少10种不同青霉素
（4）一族抗生素各组分的多少取决于遗传与环境因素。
源于次级代谢物合成所涉及的酶特异性较低
（5）一种微生物的不同菌株可以产生多种在分子结构上
完全不同的次级代谢产物。
曲霉科
（6）次级代谢物的合成对环境因素特别敏感，其合成信息 受环境因素的调节 （7）微生物由生长期向生产期过渡时，菌体形态学上会发 生一些变化
木霉素、羧链孢酸、新生霉素
（3）经修饰的氨基酸－－构筑 同型肽类抗生素
正常氨基酸和经过修饰的非蛋白氨基酸可用
于合成同型肽类抗生素。有些次级代谢物含有不
寻常的氨基酸
（4）芳香中间体－－－抗生素的芳香部分
A 莽草酸途径的中间体或终产物：形成许多次级 代谢物的芳香部分。 B 芳香氨基酸生物合成途径：负责大多数放线菌 和许多植物次生代谢物的生物合成。