微生物代谢网络的向心板块

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酒石酸、乳酸、氨基酸 (Ala,Gly,Cys,Ser,Thr) 乙酸,醋酸,脂肪酸,类脂,烃, 油脂,氨基酸(Ile,Leu,Trp) AcAcCoA CTA ICA α-KG PHB, 氨基 酸 (Leu, Lys, Phe,T yr) 氨基酸 (Glu,Gln,His,Pro,Arg)
OAA
MLA FMA 氨基酸 (Tyr,Phe,Asp) 芳香族化合物,氨基酸 (Ile,Met,Thr,Val) GOA SCA ScCoA
CoA,然后甲基丙二酸单酰 CoA分子重排,
形成ScCoA而进入TCA环。
可作为营养的多聚物包括:淀粉、纤 维素、果胶类物质(果胶酸、果胶、原果 胶质 )、 几丁质( 甲壳质 )、半纤维素 (hemi cellulose)、木质素(1ignin)、蛋白质 和多肽、核酸等等种类。 化能异养型微生物能分泌一系列胞外 酶将外源性多聚有机化合物降解。还有些 有机化合物虽然不是多聚物,也需要首先 被微生物的胞外酶水解以后才能被微生物 吸收。例如许多微生物能分泌脂肪酶,它 能将甘油三脂水解成脂肪酸和甘油。
化能异养型微生物细胞借助于 微生物的向心途径将有机化合物降 解或转化成中心途径上对应的的化 合物,从而使这两种途径衔接起来。 微生物的向心途径一般依次包括三 个部分: (1)胞外降解途径(胞外酶催化) (2)跨膜系统(有载体蛋白参与) (3)胞内向心途径
原料化合物经向心途径注入中心途径, 向心途径与中心途径的接合点(接口)原则 上可以是中心途径上的任意化合物,实际上 主要是12个代谢前体物。如果进入细胞的营 养物质已经是中心代谢途径的起始物或中间 产物,则胞内向心途径就缩成一个 “ 点 ” , 这个点也就是向心途径与中心途径的接口 。 代谢网络的向心途径往往是分解代谢途 径,但它们是以中心大平台,或者更精确地 说是以中心途径上对应的化合物为终点的。
向心途径在细胞机器工作模式中的位置
向心途径
中心代谢途径
离心途径
3.2.2 微生物的合成代谢途径和
代谢网络中的向心途径
化能异养型微生物可以广泛 地利用各种各样的有机物进行生 长和繁殖。在发酵工业上发酵生 产的原料大多是农副产品。微生 物必须能合成并分泌能分解这些 原料的酶,把原料转化成可以进 入细胞的有机营养物质。
3.2.2.1 胞外降解途径:胞外酶催化多 聚物的水解 3.2.2.2 有载体蛋白参与的跨膜系统 3.2.2.3 化能异养型微生物对各种有机 化合物的利用 3.2.2.4 细胞内源化合物的氧化降解 3.2.2.5 关于质粒编码的降解代谢活性
3.2.2.1 胞外降解途径:胞外酶对多聚物 的水解 微生物可以分泌胞外酶,大多数情 况下是水解酶,把多聚物水解成可以进 入细胞的分子。这些胞外酶游离于微生 物细胞外,有些仍与细胞相联。细胞还 会分泌一些附着物,使某些疏水化合物 结合到细胞表面,以便于降解。多聚物 水解不会产生可被生物利用的能量,但 多聚物水解是向心途径的第一步。
3-P-GA GOA (甘油酸途径) PEP (PK) (PEPS) (PyPiDK) PYR 酒石酸、乳酸、氨基酸 (Ala,Gly,Cys,Ser,Thr) (PD) (PFL) (PS) AcCoA
Gly、羟基乙 酸、草酸
待 续
接 上 页
氨基酸 (Asp, Asn)
羟基乙酸,草酸,Gly PEP PYR AcCoA
⑷甘露(糖)醇的降解 在不同的微生物中,可 能经不同的途径将甘露醇转 化为 EMP 途径的中间产物
F-6-P。
⑸丙酸的降解 在需氧条件下, 大肠杆菌的丙酸降解 至今未有明确的结论, 其丙酸代谢的第一 步是生成丙酰 CoA,后者与乙醛酸缩合成 α-羟基戊二酸,然后又裂解成乳酸和乙酸。 乙酸经AcCoA进入TCA环或(和)DCA环。 而乳酸经乳酰 CoA、丙酮酰 CoA,转化成 羟基丙酮醛, 此化合物的进一步代谢情况 尚待研究, 但已知当丙酸浓度较高时, 丙 酸主要经乙酸代谢。
这种方式的裂解比起第一种方式 更为经济,由这种方式产生磷酸葡萄 糖即可以糖的磷酸酯的形式进入中心 代谢途径,而且,此过程不消耗ATP, 而游离的单糖大多需经激活(消耗高
能键而被磷酸化)后才能进入葡萄糖
的降解途径。
⑵己糖和戊糖的降解 作为化能异养型微生物的碳源与 能源,果糖像葡萄糖一样,受己糖激 酶催化而被 ATP 激活,生成 F-6-P; 或者借助由PEP参加的磷酸转移酶系 统进入细胞,生成 F-1-P。 然后又在 1-磷酸果糖激酶(该酶受果糖诱导) 的催化下形成 F-1,6-2P。 F-6-P和 F1,6-2P 均为 EMP 途径中间产物,可 按EMP途径进一步降解。
木质纤维水解物中有40%是木 糖,木糖可以经木糖醇而转化为木 酮糖,也可以在木糖异构酶催化下 直接生成木酮糖,木酮糖经激酶催 化生成 Xu-5-P,即可进入 HMP或 PK途径。
⑶己糖醛酸的降解 果胶类物质在胞外酶作用下降解 成半乳糖醛酸。半乳糖醛酸经进一步 代谢即可转化成 ED 途径的中间产物 KDPG,即可进入 ED 途径。 这样的 作用在假单胞菌、气单胞菌和土壤杆 菌中比较明显。
二糖、 糖原、 多糖、 (含细 胞壁多 糖)等
其他己 糖、糖 醇
半乳糖醛酸(果胶物质) KDPG(ED途径) (PTS) (HK) (G6PE) G-6-P R-5-P F-6-P (PFK) (FDPE) F-1,6-2P DHAP GA-3-P 甘油 Glc 戊糖 R-1-P MNs
RNA
油脂
乳糖水解生成的葡萄糖被磷 酸化而进入酵解途径;水解生成 的半乳糖又在细胞中诱导出参与 半乳糖进一步代谢的 3 种酶,在 这 3 种酶的协同作用下,使半乳 糖转化成 G-6-P, 即可注入酵解 途径。
二糖的降解一般在细胞内发生,有如下 两种降解方式:一种是被相应的二糖水解酶 水解成单糖,如蔗糖酶将蔗糖水解成葡萄糖 和果糖,乳糖酶( β- 半乳糖苷酶 )将乳糖 水解成葡萄糖和半乳糖,麦芽糖酶将麦芽糖 水解成两份葡萄糖。另一种分解方式是在相 应的磷酸化酶的作用下,使二糖经磷酸化裂 解(phosphorylytic cleavage),得到 1分子 单糖和1分子磷酸葡萄糖。
乳糖透性酶实际上是乳糖的载体蛋 白,用于乳糖的主动输送,将乳糖送入 细胞; β- 半乳糖苷酶将乳糖水解成葡 萄糖和半乳糖; β- 半乳糖苷乙酰基转 移酶的作用是催化AcCoA将乳糖及其它 半乳糖苷乙酰化的反应,它可将未能代 谢的乳糖及与乳糖结构类似的分子乙酰 化,并将其排出细胞,因此,这个酶的 生物学功能可能是起解毒作用。
⑼草酸的降解 草酸先被转化成乙醛酸,然后经甘油 酸途径生成3-P-GA进入EMP途径。 ⑽乙醇酸(羟基乙酸)和乙醛酸的降解 乙醇酸先被氧化成乙醛酸,后者直接 与AcCoA反应,生成苹果酸进入TCA环、 DCA环;或者乙醛酸经甘油酸途径,生成 3-P-GA而进入EMP途径。
⑾乙醇和乙酸的降解 乙醇经乙醛氧化成乙酸,乙酸 在乙酰硫激酶的催化下,与CoA、 ATP作用,生成AcCoA而进入TCA 环。
3.2.2.2 有载体蛋白参与的跨膜系统(第
二章 2.2.2 已有叙述。)
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
3.2.2.3 化能异养型微生物对各种有机化 合物的利用 微生物通过一定的机制从培养基中 吸收有机化合物,进入细胞的有机化合 物再经过一段代谢途径的代谢作用,将 碳架物质注入中心代谢途径。这些有机 化合物可以是碳水化合物、烃类化合物、 含氮有机化合物或其他有机化合物。
绝大多数细菌对脂肪酸的分解 能力很弱,然而一经诱导,它们的 脂肪酸氧化活性就会增强。如大肠 杆菌就有一个可被诱导合成的,用 来降解脂肪酸的酶系,并且,C6~ C16脂肪酸靠酰基CoA合成酶参与的 基团转移机制进入细胞。
脂肪酸的β-氧化是在原核细胞的细胞 质和真核细胞的线粒体内进行的。 若脂肪 酸分子的碳原子数为偶数,最终得AcCoA, 若脂肪酸分子的碳原子数为奇数, 则同时 也得到丙酰CoA。AcCoA直接进入TCA 环 降解,丙酰 CoA 则可以经甲基丙二酸单酰
甘露糖在甘露糖激酶的催化下,
生成 6-磷酸甘露糖,再由 6- 磷酸甘
露糖异构酶催化,生成F-6-P,进入
EMP 途径。也有例外,如果没有甘
露糖激酶, 也可以以另外的方式实 现甘露糖的磷酸化。
半乳糖诱导 3 种酶的合成:半乳糖激 酶、葡萄糖∶1- 磷酸半乳糖尿苷酰转移酶 和 UDP-Glc差向异构酶。半乳糖在这些酶 的顺序催化下,先生成 1-磷酸半乳糖,然 后再生成 G-1-P。G-1-P 经G-6-P磷酸葡萄 糖变位酶作用生成 G-6-P, 即可进入酵解 途径。在嗜糖假单胞菌中,半乳糖可被直 接氧化成半乳糖酸内酯,然后进入与 ED 途径类似的途径,最终产物与 ED 途径相 同。
各种有机营养物质(包括经水 解酶降解形成的有机营养物质)大 多以主动输送的方式进入原核生物 的细胞,以促进扩散和主动输送的 方式进入真核微生物的细胞,这几 种输送方式均需借助于细胞的蛋白 质(载体蛋白或酶)。
进入细胞的营养物质若是中心 代谢途径的起始物或中间产物,即 可纳入中心代谢途径进行代谢;进 入细胞的营养物质若不是中心代谢 途径的起始物或中间产物,则需经 向心途径的胞内部分,转化成中心 代谢途径的起始物或中间产物,才 可纳入中心代谢途径进行代谢。
⑿脂肪酸的降解 脂肪和脂肪酸也可以作为微生物的碳源 和能源,但脂肪不能进入细胞,细胞内贮藏 的脂肪也不可直接进入糖的降解途径,因此 要在有关酶的作用下先行水解。 脂肪在微生物细胞合成的脂肪酶(胞外 酶对胞外的脂肪,胞内酶对胞内脂肪)的作 用下,水解成甘油和脂肪酸。 甘油经3-磷酸甘油或经二羟基丙酮转化 成磷酸二羟丙酮(DHAP)进入EMP途径。
⑹葡萄糖酸的降解 某些微生物能利用葡萄糖酸作为唯 一碳源,葡萄糖酸可经 6-磷酸葡萄糖酸 脱羧,生成 5- 磷酸核酮糖而进入 HMP 途径;也可以经 2,5 -二酮葡萄糖酸,继 续代谢生成α-KG而进入TCA环。在假 单胞菌中,葡萄糖酸经 6-磷酸葡萄糖酸 进入ED途径。
⑺山梨(糖)醇的降解 山梨(糖)醇先被转化成果糖,然后 生成F-6-P而进入EMP途径。 ⑻苹果酸的降解 在需氧情况下,苹果酸按TCA环氧化 方向生成OAA,然后OAA脱羧生成PYR, 然后按需氧途径降解。在弱氧化醋酸杆菌 中,苹果酸经草酰苹果酸生成α-KG而进入 TCA环,以便用于氨基酸合成。
戊糖,如核糖、木糖和阿拉伯糖,虽 然可以被不少微生物利用,但常有适应现 象。即它们或以自己独立的途径降解,或 经转化后进入葡萄糖降解途径。 如核糖 在激酶催化下生成R-5-P,即可进入HMP 和PK途径。 阿拉伯糖在异构酶的催化下 生成核酮糖,然后再磷酸化生成 Ru-5-P, 即可进入HMP或PK途径。
微生物通过一定的机制从培养基 中吸收有机化合物,进入细胞的有机 化合物再经过一段代谢途径的代谢作 用,将碳架物质注入中心代谢途径。 这些有机化合物可以是碳水化合物、 烃类化合物、含氮有机化合物或其他 有机化合物。
⑴二糖的吸收和降解 关于二糖的吸收和降解,研究得 最清楚的要数乳糖。大肠杆菌若要在 以乳糖为碳源的培养基中生长,首先 要诱导出 3 种酶:乳糖透性酶、β半乳糖苷酶和 β- 半乳糖苷乙酰基转 移酶。
碳架物质从向心板块注入中心板块 (前述中心代谢途径上的12个前体代谢 物的大平台)时所流经的代谢途径统称 向心途径。与整个代谢网络一样,向心 途径的变化也取决于遗传与环境条件, 本课程讨论的内容建立在微生物细胞相 对稳定的代谢基础上。 在工业发酵的细胞机器工作模式中, 向心途径首当其冲,是工业发酵载流路 径的一部分。
微生物代谢网络 的向心板块
代谢网络中,胞外碳架 物质跨膜并注入中心板块所 流经的途径统称向心途径, 向心途径群组成代谢网络的 向心板块。
3.2.1 向心途径在代谢网络及其在细胞
机器工作模式中的位置
3.2.2 微生物的分解代谢途径和代谢网
络的向心途径
3.2.1 向心途径在代谢网络和细胞
机器工作模式中的位置
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