笛鲷鱼类的线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析

ｓｑ ｅ ｃ ，Ｅ ｅ ｕ ｎ ｅ ＴＡＳ 、 央 保 守 区 （ ｅ ｔａ ｃ ｎ ｅｖ ｄ ）中 ｃｎｒ ｌ ｏ ｓｒｅ
ｄ ｒ ｉ ， Ｄ） 保 守 序 列 区 （ ｏ ｓｒｅ ｅ ｕ ｎ ｅ ｏｍａｎ Ｃ 和 ｃｎ ｅｖ ｄ ｓｑ ｅ ｃ ｂｏ ｋ Ｃ Ｂ 。 由于控 制 区不 同 区段 的进 化 速度 不 ｌｃ ， Ｓ ） 同， 故可 适用 于不 同级 别 的系统 发育 分析 研究 ， 是探 讨近 缘种 间 和种 内遗传 变异 的 良好 指 标［ 。 ４ ］ 笛鲷 属 （ ｕｊ ｎ ｓ 隶 属 鲈 形 目 （ ｅｃ ｏｍｅ） Ｌ ｔａ ｕ ） Ｐ ｒｉ ｒ ｓ 、 ｆ 笛鲷科 （ ｕｊｎｄ ｅ ， Ｌ ｔ ｉａ ） 是一 类广 泛分 布 于热带 和亚 热 ａ 带 的岩 礁 鱼类 ， 为重 要 的 海 洋 经 济鱼 类 ， 《 国鱼 据 中 类 系统 检索 》６ 载 ， 国笛 鲷属 鱼类 有 １ Ｌ记 我 ９种 ， 产 多
从 Ｇｅ Ｂ ｎ ｎ ａ ｋ中下载 的 ６种笛 鲷鱼 类 的相应 序列进 行 结构 分析 ， 以将笛 鲷 鱼类 的控 制 区分 为终 止 可
序列 区、 中央保 守 区和保 守序 列 区 三个 区域 ， 到 了终 止 相关 的序 列 Ｅ Ａｓ以及 一 系列 保 守序 列 找 Ｔ （ Ｓ — Ｃ Ｂ Ｅ， Ｓ － Ｃ Ｂ Ｆ， Ｓ — Ｃ Ｂ Ｄ和 Ｃ Ｂ １ Ｃ Ｂ ２ Ｃ Ｂ ３ ， 给 出 了它们 的一般 形 式。 以黄谐 鱼 为外 群 ， Ｓ 一， Ｓ ＿， Ｓ －）并 采 用Ｎ Ｊ法和 ＭＥ法构 建笛 鲷 鱼类 的分 子 系统树 。分 子 系统发 育分析 表 明 ， 线粒体 Ｄ ＮＡ 控 制 区序 列 适 合于 笛鲷 鱼类 的 系统发 育分 析 ， 而且 支持 Ａｌ ｎ关 于笛 鲷属 的系统形 态分 类学 观 点。 ｌ ｅ 关键 词 ： 笛鲷 ； 粒体 Ｄ 线 ＮＡ； 制 区； 控 系统发 育
第 ３ 卷 ２
第 １ 期
海
洋
学
报
Ｖｏ１３２． Ｎｏ．１ ．
２ ０年 １月 ０１
ＡＣＴＡ （ＣＥＡＮｏＩ（ＧＩ ） ） ＣＡ ＮＩ ＳＩ ＣＡ
Ｊ ｎ ａｙ ２ １ ａ ｕ ｒ ０ ０
笛鲷鱼类的线粒体 Ｄ Ａ控 制区结构及 其系统发 育分析 Ｎ
谭 围 郭 昱 嵩 王 １ ］ ＮＡ 中的控 制 区 即 Ｄ ｌｏ －ｏ ｐ区
为非 编码 区 ， 编码 蛋 白质受 到选 择压 力较 小 ， 不 因此
积 累了较 多 的突变 ， 如碱 基 替 换 、 入 、 插 缺失 以及 众 多 的串联 重复 序列 等 。控制 区较 复 杂 ， 为 ３个 区 分 段 ， 止 序 列 区 （ ｘｅ ｄ ｄ ｔｒ ｎ ｔ ｎ ａｓｃａｅ 终 ｅ ｔｎ ｅ ｅｍｉａｉ ｓｏ ｉ ｄ ｏ ｔ
于 南海 。 目前对 笛鲷 属部分 鱼类 的分子 系统学 研究
已经展 开 ， 发 林 等 Ｌ 对 ６种 笛 鲷 属 鱼 类 Ｃ ｔｂ 周 ７ ］ ｙ
和 １ Ｓｒ ６ ＲＮＡ 基 因片段序 列进 行 了 比较 研究 。张 俊
彬 等［ 以在 南 沙 群 岛采 获 的 １ 笛鲷 属 的后 期 仔 ｇ ］ １种
中图分类号 ： ５ Ｑ７ 文献标志码 ： Ａ 文 章 编 号 ： ２ ３ ４ ９ （ Ｏ Ｏ Ｏ 一 １ ９０ ０ ５ — １ ３ ２ ｌ ） ｌ０ ３ —７
１ 引 言
鱼类线粒体 Ｄ ＮＡ（ ｔｃ ｏ ｄ ｉ ｍｉ ｈ ｎ ｒ ｌ ｏ ａ ＤＮＡ，ｍｔ — Ｄ
ＮＡ） 作为 一 种 分 子 标 记 目前 已 被 广 泛 应 用 于 系统
基 金 项 目 ： 家 科 技 支撑 计 划项 目（０ ７ ＡＤ２ Ｂ ０ ； 国 ２０Ｂ ９ ０ ） 国家 自然 科 学 基 金 项 目 （０ ７ ６ ０ 。 ３ ６ １ １） 作 者 简 介 ： 围 （９ ２ ）男 ， 南 省 涟 源 市 人 ， 工 作 于 海 南 省 水 产 研 究 所 ， 要 从 事 水 产 经 济 动 物 繁 殖 生 物 学 研 究 。 Ｅ ｍａ ： ａ ｗｅ ５ ９ 谭 １８ 一 ， 湖 现 主 — ｉ ｔｎ ｉ ９ ＠ ｌ ２
鱼 为材料 ， 过 ＡＦ Ｐ电泳 图谱 的 比较 构 建 系统 进 通 Ｌ 化树 ， 同时采用 ＡＦ Ｐ标 记 及 １ Ｓ ｒ ＮＡ 基 因片 段 Ｌ ６ Ｒ 序列 对 １ ０种 笛 鲷 科 鱼 类 进 行 了 系统 发 育分 析 ［ １ 。 朱世 华等 口 通过 对 笛 鲷 属 １ ］ ９种 鱼 类 Ｃ ｔｂ基 因序 ｙ 列 的 比较 分析 ， 讨 了笛鲷 属 的分 子系 统发生 关 系 。 探 Ｇｕ ｏ等［ １ 定并 分析 了笛 鲷 属 １ 妇测 ２个 种 的 ｍｔ ＤＮＡ 中Ｃ ｔ ｙ ｂ与 Ｃ ＯⅡ基 因全序 列 ， 对南 海 笛鲷进 行 了 并 系 统学 研 究 。谭 围等 Ｌ 用 Ｃ 工 ＯⅡ和 Ｃ ｔｂ １利 。 Ｏ ，Ｃ ｙ
收 稿 日期 ：０ ９０ —８ 修 订 日期 ：０ ９０ —６ ２ ０—６０ ； ２ ０—９１ 。
基 因 的组 合 序列对 １ ４种笛 鲷 属 鱼 类 进 行 了 系统 进
化分 析 。Ｍｉ ｅ 等 ［ Ｃ ｔ ｌ ｒ １从 ｙ 列 和 １ Ｓｒ ＮＡ 序 ｌ 。 ｂ序 ６ Ｒ 列探讨 了印度 洋 一太 平 洋 地 区 的 ２ ７种 笛鲷 的分 子 系统发 生关 系 ， 利 用 线 粒 体 Ｄ 而 ＮＡ 控 制 区 全序 列 对 笛鲷 鱼类 进行 分 子系统 学研 究鲜 见报 道 。 本 研究 测定 了 １ １种笛 鲷鱼 类控 制 区全序 列 ， 并
（． １ 广东 海 洋 大 学 水 产 学 院 广 东 省 高 等 学 校 南 海 水 产 经 济 动 物增 养 殖 重 点 实 验 室 ， 东 湛 江 ５ ４ ２ ） 广 ２ Ｏ ５
摘 要 ：采用 Ｐ Ｒ扩 增直 接测 序 的方 法获得 了 １ Ｃ １种 笛 鲷 鱼 类 的线 粒体 ＤＮＡ 控 制 区全 序 列 。结 合