质粒提取的原理、操作步骤、各溶液的作用教学总结
质粒dna提取原理

质粒dna提取原理
质粒DNA提取原理是通过破坏细菌细胞壁和细胞膜结构,释
放质粒DNA,并利用化学方法提取纯化质粒DNA。
质粒DNA提取的步骤如下:
1. 细胞裂解:将细菌培养物经过离心,得到菌体沉淀,然后加入裂解缓冲液,破坏细菌细胞壁和细胞膜,释放质粒DNA。
2. 质粒DNA纯化:加入一定量的碱性溶液,使细菌染色体DNA变性沉淀,而质粒DNA仍溶于溶液中。
然后通过离心,将质粒DNA沉淀下来。
3. 质粒DNA沉淀:将溶液中的质粒DNA与乙醇混合,使质
粒DNA沉淀成片状。
通过离心,得到质粒DNA沉淀。
4. 质粒DNA溶解:将质粒DNA沉淀洗涤去除杂质,并用适
当的缓冲液将质粒DNA溶解,得到高浓度的质粒DNA。
质粒DNA提取的关键在于破坏细菌细胞结构,释放质粒DNA,然后利用沉淀和溶解等步骤进行纯化。
通过以上步骤,可以提取到纯化后的质粒DNA,用于后续实验或分析。
质粒提取总结

碱裂解法抽提质粒原理溶液I,50 mM葡萄糖 /25 mM Tris-Cl / 10 mM EDTA,pH ;(溶菌酶:使细胞壁裂解;RNase:将裂解完的RNA去除,防止RNA污染)溶液II, N NaOH / 1% SDS;溶液III,3M醋酸钾 / 2 M醋酸。
溶液I的作用:①任何生物化学反应,首先要控制好溶液的pH,因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液。
②50mM葡萄糖:加了葡萄糖后最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。
因此,如果溶液I中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言,几乎没有任何影响。
所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。
③EDTA:EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂,配在分子生物学试剂中的主要作用是:抑制DNase的活性和抑制微生物生长。
在溶液I中加入高达10 mM的EDTA,无非就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。
如果不加EDTA,其实也没什么大不了的,只要是在不太长的时间里完成质粒抽提,就不用怕DNA会迅速被降解,因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。
如果哪天你手上正好缺了溶液I,可不可以抽提质粒呢只要用等体积的水,或LB培养基来悬浮菌体就可以了。
有一点不能忘的是,菌体一定要悬浮均匀,不能有结块。
溶液II:这是用新鲜的 N的NaOH和2%的SDS等体积混合后使用的。
要新从浓NaOH稀释制备的NaOH,是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。
其实破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以才叫碱法抽提。
事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂,不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞,碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解,这是由于细胞膜发生了从bilayer(双层膜)结构向micelle(微囊)结构的相变化所导致。
用了不新鲜的 N NaOH,即便是有SDS也无法有效溶解大肠杆菌,自然就难高效率抽提得到质粒。
如果只用SDS当然也能抽提得到少量质粒,因为SDS也是碱性的,只是弱了点而已。
质粒dna的提取实验报告

质粒dna的提取实验报告质粒DNA的提取实验报告引言:DNA提取是分子生物学研究中的基础实验之一,通过提取DNA可以进一步进行PCR扩增、基因克隆等实验。
本实验旨在提取质粒DNA,质粒DNA是存在于细菌细胞质中的环状DNA分子,具有重要的研究价值。
本文将详细介绍实验的步骤、原理以及结果分析。
材料与方法:1. 细菌培养液:选择含有目标质粒的细菌进行培养,如大肠杆菌。
2. 细菌培养基:选择适宜的培养基,如LB培养基。
3. 细菌培养器具:如培养皿、离心管等。
4. DNA提取试剂盒:选择适合的DNA提取试剂盒,如酚/氯仿法或硅胶柱法。
5. 离心机:用于离心细菌培养液以获取细菌沉淀。
6. 紫外可见分光光度计:用于检测DNA的纯度和浓度。
实验步骤:1. 细菌培养:将含有目标质粒的细菌接种于LB培养基中,培养过夜,使细菌充分繁殖。
2. 收集细菌:将培养液离心,以12000转/分钟离心10分钟,将细菌沉淀收集。
3. 细胞裂解:加入适量的细胞裂解缓冲液,使细菌细胞裂解,释放DNA。
4. 蛋白质沉淀:加入酚/氯仿混合液,离心分离上层的DNA溶液和下层的蛋白质。
5. DNA沉淀:将DNA溶液转移至新的离心管中,加入等体积的冷乙醇,轻轻倒置离心管,使DNA沉淀出来。
6. DNA洗涤:用70%的乙醇洗涤DNA沉淀,去除残余的盐和杂质。
7. DNA溶解:用适量的去离子水溶解DNA沉淀,得到纯净的DNA溶液。
8. DNA浓度检测:用紫外可见分光光度计检测DNA的浓度和纯度。
结果与分析:通过实验,成功提取了质粒DNA,并进行了浓度检测。
根据实验结果,我们可以得到DNA的浓度和纯度信息,这对于后续的实验设计和操作非常重要。
此外,实验中还可以通过凝胶电泳等方法对提取的DNA进行进一步的分析,如确定DNA的大小和完整性。
结论:本实验成功提取了质粒DNA,并获得了纯净的DNA溶液。
通过浓度检测和进一步的分析,我们可以进一步了解DNA的特性和应用。
质粒抽提试剂盒基本原理

质粒抽提试剂盒基本原理碱裂解法从大肠杆菌中制备质粒,是每个分子生物学实验室都要用到的常规技术,但是大家对碱法抽提质粒的原理知之甚少。
一、碱法抽提质粒用到的三种溶液及硅酸纤维膜(超滤柱)溶液I:50mM葡萄糖/25mMTri-Cl/10mMEDTA,pH8.0;溶液II:0.2NNaOH/1%SDS;溶液III:3M醋酸钾/2M醋酸/75%酒精。
二、溶液I中各成分的作用葡萄糖是使悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部,因此有些试剂厂商的溶液I没有葡萄糖成分;EDTA是Ca和Mg 等二价金属离子的螯合剂,其主要目的是为了螯合二价金属离子从而达到抑制DNae的活性。
2+2+三、溶液II中各成分的作用NaOH主要是为了溶解细胞,释放DNA,因为在强碱性的情况下,细胞膜发生了从bilayer(双层膜)结构向micelle(微囊)结构的变化;但NaOH易和空气中的CO2发生反应,形成碳酸钠,降低了NaOH的碱性,所以必须用新鲜的NaOH。
SDS与NaOH联用,其目的是为了增强NaOH的强碱性,同时SDS能很好地结合蛋白,产生沉淀。
这一步要记住两点:第一,时间不能过长,因为在这样的碱性条件下基因组DNA片断会慢慢断裂;第二,必须温柔混合,不然基因组DNA会断裂。
四、溶液III中各成分的作用溶液III中的醋酸钾是为了使钾离子置换SDS中的纳离子而形成了PDS,因为十二烷基硫酸钠(odiumdodecylulfate)遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾(potaiumdodecylulfate,PDS),而PDS是不溶水的,同时一个SDS分子平均结合两个氨基酸,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质沉淀了。
2M的醋酸是为了中和NaOH,因为长时间的碱性条件会打断DNA,所以要中和。
基因组DNA一旦发生断裂,只要是50-100kb大小的片断,就没有办法再被PDS共沉淀了,所以碱处理的时间要短,而且不得激烈振荡,不然最后得到的质粒上总会有大量的基因组DNA混入,琼脂糖电泳可以观察到一条浓浓的总DNA 条带。
质粒提取的原理及步骤
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碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH 和 SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状,离心时可沉淀下来。
一、试剂准备1. 溶液Ⅰ: 50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0)。
1M Tris-HCl[t1] (pH 8.0)12.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml。
在10 lbf/in2高压灭菌15min ,贮存于4℃。
溶液Ⅰ50mM 葡萄糖/ 10mM EDTA / 25mM Tris-HCl,pH=8.0葡萄糖增稠,使悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部;EDTA 抑制DNase的活性。
这一步溶液中还可以加入RNase,不受EDTA影响,并且可以在后续步骤中被除去2. 溶液Ⅱ:0.2N NaOH,1% SDS。
2N NaOH 1ml,10%SDS 1ml,加ddH2O至10ml。
使用前临时配置[t2]。
这是用新鲜的0.4 N的NaOH和2%的SDS等体积混合后使用的。
要新从浓NaOH稀释制备0.4N的NaOH,无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。
很多人不知道其实破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以才叫碱法抽提。
事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂,不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞,碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解,这是由于细胞膜发生了从bilayer(双层膜)结构向 micelle(微囊)结构的相变化所导致。
用了不新鲜的0.4 N NaOH,即便是有SDS也无法有效溶解大肠杆菌(不妨可以自己试一下),自然就难高效率抽提得到质粒。
如果只用SDS当然也能抽提得到少量质粒,因为 SDS也是碱性的,只是弱了点而已。
很多人对NaOH的作用误以为是为了让基因组DNA变性,以便沉淀,这是由于没有正确理解一些书上的有关DNA变性复性的描述所导致。
质粒提纯的原理

质粒提纯的原理质粒是一种由DNA分子组成的环状双链结构,常见于细菌细胞中。
质粒提纯是指从细菌细胞中分离纯净的质粒DNA,并去除其他细菌细胞成分和杂质的过程。
质粒提纯的原理主要包括质粒提取、细胞裂解、DNA溶解、去除杂质、DNA沉淀、洗涤和干燥等步骤。
1. 质粒提取:质粒提取是通过裂解细菌细胞壁和细胞膜,释放质粒DNA。
常见的方法有碱裂解法、酶裂解法和热裂解法。
其中,碱裂解法是最常用的一种方法。
在碱裂解法中,首先将含有质粒的细菌培养物经离心分离得到菌体沉淀,然后用碱溶解菌体,使细胞壁和细胞膜破裂,释放质粒DNA。
2. 细胞裂解:细胞裂解是指将细菌细胞壁和细胞膜破裂,释放细胞内的质粒DNA。
细胞裂解的方法包括机械破碎、超声波裂解和酶裂解等。
机械破碎法是将经离心得到的菌体沉淀在低温下用椎管等器械进行破碎,使菌体破裂,释放DNA。
超声波裂解法则是利用超声波的高频振动实现细胞破碎,释放DNA。
酶裂解法则通过添加蛋白酶、脱氧核酸酶等酶,使细胞壁和细胞膜被酶降解,释放DNA。
3. DNA溶解:DNA溶解是指将裂解的细胞中的DNA从其他细胞成分中分离出来。
一般来说,DNA可以通过溶于乙醇或异丙醇的方式沉淀下来,然后经过离心分离得到。
此步骤的目的是将DNA和其他细菌细胞成分如蛋白质、RNA等分离。
4. 去除杂质:在DNA溶解的过程中会有一些杂质如蛋白质、RNA等混入溶液中。
为了获得纯净的质粒DNA,需要去除这些杂质。
一般可以通过加入酶解剂如RNase A或蛋白酶K进行酶解,使RNA或蛋白质被降解。
然后通过盐酸/乙醚等混合液体沉淀蛋白质,或者通过乙醇沉淀RNA等方式去除杂质。
5. DNA沉淀:通过加入适量的盐和乙醇,使DNA与DNA溶液中碱性pH值条件下的盐结合形成DNA盐沉淀,同时DNA与乙醇结合形成DNA乙醇沉淀。
此过程中DNA成为不溶性盐和DNA乙醇复合物,通过离心分离沉淀下来。
沉淀条件可以根据实验需要进行调整,如调节盐和乙醇的浓度、温度等。
质粒提取总结(原理、小提、中提、浓度测定)

如此看来,溶液III加入后的沉淀实际上是钾离子置换了SDS中的纳离子形成了不溶性的PDS,而高浓度的盐,使得沉淀更完全。SDS专门喜欢和蛋白质结合,平均两个氨基酸上结合一个SDS分子,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质沉淀了,让人高兴的是大肠杆菌的基因组DNA也一起被共沉淀了。这个过程不难想象,因为基因组DNA太长了,长长的DNA自然容易被PDS给共沉淀了,尽管SDS并不与DNA分子结合。
质粒小提
质粒小提(这里试剂盒没有柱平衡步骤):
1、大离心管4000rpm离心5min,吸除上清;
2、每5ml菌液、加入250μlP2,上下颠倒6-8次,温和,<5min;
4、加入350μlP3,上下颠倒6-8次,温和;12000rpm离心10min;
5、取上清,加到柱子里,12000rpm离心2min,弃废液;
6、加入去蛋白液HB 500μl,12000rpm离心1min,弃废液;
7、加入75%乙醇700μl,12000rpm离心1min,弃废液;
8、重复上一步;
9、空离一次,12000rpm离心2min,弃收集管;
10、晾干;
11、加ddH2O溶解,放2min,12000rpm离心2min。
注意:如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。
3、向离心管中加入250μl溶液P1(先检查是否加入RNase A),使用移液器或涡旋振荡器彻底悬浮细菌沉淀;
质-粒-提-取-原理及步骤
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质-粒-提-取-原理及步骤概述质粒提取,又称DNA提取,是一种分离和提取所需DNA的过程。
质粒提取在许多实验中都是非常重要的步骤,例如基因工程、分子生物学、遗传学和其他DNA相关实验。
本文将介绍质粒提取的原理及步骤。
原理DNA提取的过程通常包括细胞破碎、DNA纯化、DNA溶解和复性等步骤。
对于质粒提取,主要步骤通常包括以下内容:1.细菌培养:在质粒提取之前,需要将细菌培养在含有适当抗生素的培养基中,用于扩增质粒数量。
2.细胞破碎:使细胞破裂以释放出含有质粒的细胞内物质,此步骤需要进行严格的抗污染措施,以避免污染质粒样本。
3.除去污染物:除去细胞壁、蛋白质、核酸和其他污染物。
4.离心分离:将上述步骤中提取出的样本进行离心分离,使DNA沉淀,以便进一步纯化。
5.溶解:通过加入一定的缓冲液或去离子水,使DNA重新溶解。
步骤以下是一种常见的质粒提取步骤:1.处理样本:将含有所需质粒的细胞收集,并进行初始处理,包括细胞壁破裂、核酸纤维溶解等。
2.傅里叶纯化:通过傅里叶变换纯化,将细胞内杂质和有机污染物清除。
3.离心分离:将细胞样本离心,使DNA沉淀到底部,并且将上层样本移除。
4.乙醇沉淀:加入乙醇沉淀,将DNA纯化到上清液。
5.重振溶解:最后使用适当缓冲液重振重振溶解DNA,也可以使用去离子水重振。
以上就是质粒提取的原理和步骤,这是一个非常重要的操作,在DNA研究和实验中有着广泛的应用。
我们需要注意的是,在操作过程中需要进行高标准的质量控制,以确保实验结果的准确性。
质粒提取原理和方法
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质粒提取原理和方法质粒提取是从细菌基因组中提取出质粒DNA的一种方法。
它是分子生物学和遗传工程中常用的技术,可用于质粒的纯化和制备。
质粒提取的原理主要基于以下几个步骤:1.细菌培养:首先,我们需要将含有目标质粒的细菌培养在适当的培养基上,通过高速离心将细菌收集起来。
2.细菌溶解:将培养物进行离心,分离菌落。
然后采用一定的细胞破碎方法,如超声波震荡、冻融等,将细菌细胞壁破坏,使质粒DNA释放到溶液中。
3.质粒分离:通过离心将细菌碎片、蛋白质等杂质与质粒DNA分离。
一般是通过两次离心来完成,第一次较低速离心用于去除细菌碎片和细胞蛋白质,第二次较高速离心用于沉淀质粒DNA。
4.DNA纯化:将质粒DNA从上一步得到的沉淀物中提取出来。
可以使用酚/氯仿法、硅胶柱法、商用试剂盒等方法进行纯化。
其中酚/氯仿法是较为常用的方法,它可以将DNA溶于水相,而蛋白质和其他的污染物则溶于有机相。
5.DNA沉淀:将纯化得到的DNA溶液加入适量的酒精沉淀剂(如乙醇或异丙醇),再次进行高速离心,使DNA沉淀到离心管底部。
6.DNA洗涤:将离心管底部形成的DNA沉淀用70%乙醇洗涤,去除酒精沉淀剂和其他杂质。
然后用空气吹干,最后用一定体积的纯水或缓冲液溶解。
质粒提取的方法根据实验需求不同和实验室条件的不同可以有所差异,常用的方法有以下几种:1.酚/氯仿法:这是一种经典的DNA提取方法,它将质粒DNA溶于三氯甲烷和酚的混合物中,蛋白质和其他污染物则溶于酚相。
离心去除酚相,再用异丙醇沉淀DNA,最后用70%乙醇洗涤。
2.硅胶柱法:这是一种基于硅胶柱的离心柱技术,可用于高通量的质粒提取。
DNA样品在硅胶柱中被结合,杂质被洗掉,最后用纯水或缓冲液洗提质粒DNA。
3.磁珠法:这是一种基于磁性珠子的质粒提取方法,通过在磁性珠子表面修饰DNA结合物,使质粒DNA与磁性珠子结合。
通过外加磁场将磁性珠子与DNA一起沉淀,然后去除上清液,最后用纯水洗提DNA。
三种提取质粒的方法及原理

三种提取质粒的方法及原理《三种提取质粒的方法及原理》一、离心法离心法是最常用的一种提取质粒的方法,它通过离心力的作用,使细胞或质粒(例如DNA、RNA等)从悬浮液中分离出来,从而得到提取的质粒。
分离过程如下:1.从对象(例如细胞)上提取纯化的质粒,使其形成悬浮液。
2.将所得悬浮液置于微量离心机中,加入适当的离心剂,并配置合适的离心条件(如离心速度,离心时间)。
3.根据离心力,细胞及其他悬浮液的组分会在离心机的内壁及底部形成层,质粒则聚集在中心处,形成离心质粒。
4.把离心质粒从中心处取出,即可得到纯化的质粒。
二、丙酮离心法丙酮离心法是一种以丙酮、乙醇和水作为分离剂的提取质粒方法,它可用于提取活性质粒,如抗体、RNA和DNA等,这是因为丙酮和乙醇可以良好地维持质粒的活性,并可以使悬浮液以柱状分离,有利于质粒的提取。
丙酮离心法的分离过程如下:1.将所要提取的对象加入适当的提取液(如200 ml丙酮),形成悬浮液。
2.将悬浮液置于微量离心机中,并配置合适的离心条件。
3.由于丙酮和乙醇的作用,悬浮液以柱状分离,并形成梁状质粒在柱峰中。
4.把梁状质粒从柱峰中取出,即可得到纯化的质粒。
三、超滤法超滤法是一种用于提取质粒的物理分离方法,它通过扩散作用及滤膜孔径的大小,可以有效地将非蛋白质物质等从悬浮液中分离出来,而不改变其本身的结构和性质。
超滤法的分离过程如下:1.将所要提取的对象加入适当的提取液(如水),形成悬浮液。
2.将所得悬浮液置于微量超滤器中,并配置合适的超滤条件(如超滤压力、超滤温度)。
3.根据超滤的原理,液体及其他悬浮物质会被超滤滤膜过滤,而质粒则不会被过滤,从而被滤过的液体中提取出质粒。
4.把质粒从超滤液中取出,即可得到纯化的质粒。
质粒提取原理

质粒提取原理质粒提取是分子生物学实验中常见的操作,其原理主要是利用离心、溶解、沉淀等方法将目标质粒从细菌中提取出来,为后续的实验操作提供必要的材料基础。
下面将详细介绍质粒提取的原理及相关操作步骤。
一、离心法。
离心法是质粒提取的基础步骤之一,其原理是通过高速离心使得细菌细胞和质粒分离。
首先,将含有目标质粒的培养基液体培养物进行离心,使得细菌细胞被沉淀到离心管底部,上清液中则含有目标质粒。
接着,将上清液转移至新的离心管中,再次进行离心操作,将残余的细菌细胞去除,得到含有目标质粒的上清液。
二、溶解法。
溶解法是质粒提取的另一关键步骤,其原理是通过特定的溶解液将目标质粒从细菌细胞中释放出来。
一般情况下,利用含有EDTA和蛋白酶K的溶解液对细菌细胞进行裂解,使得细菌细胞壁和膜被破坏,质粒得以释放。
此时,目标质粒已经被释放到溶解液中,为后续的纯化操作做好准备。
三、沉淀法。
沉淀法是质粒提取的最后一步,其原理是通过加入盐类或醇类使得目标质粒沉淀到溶液底部,从而实现质粒的分离和纯化。
一般情况下,将加入盐类或醇类的溶液与目标质粒混合后,通过离心将质粒沉淀到离心管底部,上清液中则含有杂质和其他不需要的物质。
最后,将上清液倒掉,得到沉淀的质粒,即可用于后续的实验操作。
综上所述,质粒提取的原理主要包括离心、溶解和沉淀三个步骤。
通过这些操作,可以有效地将目标质粒从细菌中提取出来,并得到相对纯净的质粒样品,为分子生物学实验提供了重要的基础材料。
在实际操作中,需要严格按照操作步骤进行操作,并注意操作中的细节,以确保提取到高质量的质粒样品。
希望本文介绍的质粒提取原理能够对相关实验工作有所帮助。
细菌质粒提取实验报告(3篇)

第1篇一、实验目的1. 掌握碱裂解法提取细菌质粒的原理和操作步骤。
2. 了解质粒DNA在分子生物学研究中的应用。
3. 学习琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法和技术。
二、实验原理质粒是细菌细胞内的一种小型、环状、双链DNA分子,独立于细菌染色体之外。
质粒携带的基因可以赋予细菌额外的生理代谢能力,如抗生素耐药性等。
碱裂解法是提取质粒DNA的常用方法,其原理如下:1. 在碱性条件下,蛋白质与DNA发生变性,质粒DNA与染色体DNA分开。
2. 加入盐溶液使pH值恢复至中性,质粒DNA迅速复性,而染色体DNA不易复性,形成网状结构。
3. 通过离心,将质粒DNA与蛋白质、染色体DNA等杂质分离。
三、实验材料与仪器1. 仪器:恒温摇床、台式离心机、微量移液器、紫外灯、凝胶成像系统、电泳仪、凝胶制备装置等。
2. 试剂:LB液体培养基、LB固体培养基、NaOH溶液、SDS溶液、KAc溶液、酚/氯仿/异戊醇溶液、无水乙醇、TE缓冲液、琼脂糖、DNA Marker、染色剂等。
3. 菌种:含质粒的大肠杆菌菌株。
四、实验步骤1. 菌液的制备:将含质粒的大肠杆菌菌株接种于LB液体培养基中,37℃振荡培养过夜。
2. 收集菌体:取适量培养液,4000r/min离心2min,收集菌体。
3. 菌体裂解:向菌体中加入NaOH和SDS溶液,65℃水浴10min,使蛋白质与DNA变性。
4. 质粒DNA的纯化:向裂解液中加入KAc溶液,混匀后4℃静置10min,使质粒DNA沉淀。
5. 离心:4000r/min离心10min,收集沉淀。
6. 洗涤:向沉淀中加入70%乙醇,混匀后4℃静置10min,再次离心,收集沉淀。
7. 干燥:将沉淀干燥至完全无水。
8. 溶解:向沉淀中加入适量TE缓冲液,溶解质粒DNA。
9. 琼脂糖凝胶电泳检测:取适量质粒DNA溶液,加入上样缓冲液,进行琼脂糖凝胶电泳检测。
五、实验结果与分析1. 琼脂糖凝胶电泳结果显示,质粒DNA在凝胶上呈现清晰的单一条带,表明质粒DNA已成功提取。
质粒抽提原理与详细操作步骤

质粒抽提原理与详细操作步骤质粒抽提,实验室必备技能之一质粒质粒存在于许多细菌以及酵母菌等生物中,是细胞染色体外能够自主复制的很小的环状DNA 分子。
质粒抽提从细菌中分离质粒DNA的方法包括3个基本步骤:培养细菌使质粒扩增;收集和裂解细菌;分离和纯化质粒DNA。
采用强碱液、加热或溶菌酶(主要针对革兰氏阳性细菌)可以破坏菌体细胞壁,十二烷基磺酸钠(SDS)和 TritonX-100(一般很少使用)可使细胞膜裂解。
经溶菌酶和SDS或 Triton X-100处理后,细菌染色体DNA会缠绕附着在细胞碎片上,同时由于细菌染色体DNA比质粒大得多,易受机械力和核酸酶等的作用而被切断成不同大小的线性片段。
当用强热或酸、碱处理时,细菌的线性染色体DNA变性,而共价闭合环状DNA(Covalently closed circular DNA,简称cccDNA)的两条链不会相互分开。
当外界条件恢复正常时,线状染色体DNA片段难以复性,而是与变性的蛋白质和细胞碎片缠绕在一起,而质粒DNA双链又恢复原状,重新形成天然的超螺旋分子,并以溶解状态存在于液相中。
质粒抽提最常用的方法是碱裂解法,它具有得率高、适用面广、快速和纯度高等特点。
当然,碱裂解法也有缺陷:容易导致不可逆的变性。
要降低不可逆的变性,就要控制好碱裂解的时间。
碱裂解法抽提质粒需要用到以下三种溶液溶液Ⅰ50 mmol/L 葡萄糖,25 mmol/L Tris-Cl(pH 8.0),10 mmol/L EDTA(pH 8.0),在15 psi 压力下蒸汽灭菌15 min,4℃保存。
溶液Ⅱ0.2 mmol/L NaOH(从10 mmol/L 贮存液中现用现稀释),10 g/L SDS(室温保存)。
溶液Ⅲ5 mol/L乙酸钾 60.0 mL,冰乙酸 11.5 mL,无菌水28.5 mL,4℃保存,使用时置于冰浴中。
下面介绍一下碱裂解法小提质粒的具体操作:01柱平衡:向吸附柱中加入500 μl平衡Buffer,12000 rpm离心30-60 s,倒掉收集管中的废液;注意:吸附柱平衡后可最大限度激活硅基质膜,提高质粒的得率;吸附柱平衡后应立即使用,长时间放置会影响其吸附效果。
质粒提取的原理、操作步骤、各溶液的作用
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细菌质粒是一类双链、闭环的DNA,大小范围从1kb至200kb以上不等。
各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份,通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态,但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上,随着染色体的复制而复制,并通过细胞分裂传递到后代。
质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子,重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA 分子。
目前已有许多方法可用于质粒DNA的提取,本实验采用碱裂解法提取质粒DNA。
碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH 和 SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状,离心时可沉淀下来。
纯化质粒DNA的方法通常是利用了质粒DNA相对较小及共价闭环两个性质。
例如,氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心、离子交换层析、凝胶过滤层析、聚乙二醇分级沉淀等方法,但这些方法相对昂贵或费时。
对于小量制备的质粒DNA,经过苯酚、氯仿抽提,RNA酶消化和乙醇沉淀等简单步骤去除残余蛋白质和RNA,所得纯化的质粒DNA已可满足细菌转化、DNA片段的分离和酶切、常规亚克隆及探针标记等要求,故在分子生物学实验室中常用。
一、试剂准备1. 溶液Ⅰ: 50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0)。
1M Tris-HCl[t1] (pH 8.0)12.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml。
在10 lbf/in2高压灭菌15min ,贮存于4℃。
任何生物化学反应,首先要控制好溶液的pH,因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液。
50 mM葡萄糖最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。
因此,如果溶液I中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言,几乎没有任何影响。
提取质粒实验报告
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一、实验目的1. 掌握碱裂解法提取质粒DNA的原理和步骤。
2. 熟悉质粒DNA提取过程中所用试剂和仪器的使用方法。
3. 学习通过琼脂糖凝胶电泳检测质粒DNA的方法。
二、实验原理质粒DNA是一种双链闭环的DNA分子,存在于细菌细胞质中,独立于细胞染色体之外。
碱裂解法是提取质粒DNA的一种常用方法,其原理是利用DNA在不同pH值下的变性和复性差异,将质粒DNA从细菌细胞中分离出来。
三、实验材料与仪器1. 实验材料:- 大肠杆菌(含有质粒DNA)- LB液体培养基- 无菌水- 10% SDS溶液- 5M NaCl溶液- 1M Tris-HCl(pH 8.0)溶液- 0.5M EDTA(pH 8.0)溶液- 70% 乙醇- 琼脂糖- DNA标准分子量Marker- 电泳缓冲液- 紫外线灯2. 实验仪器:- 恒温摇床- 台式离心机- 热水浴- 琼脂糖凝胶电泳仪- 移液器- 移液管- 微量离心管四、实验步骤1. 将含有质粒DNA的大肠杆菌接种于LB液体培养基中,37℃培养过夜。
2. 取适量培养物,离心(4000r/min,2min)收集菌体。
3. 将菌体悬浮于5M NaCl溶液中,涡旋混匀。
4. 加入10% SDS溶液,涡旋混匀。
5. 加入1M Tris-HCl(pH 8.0)溶液和0.5M EDTA(pH 8.0)溶液,涡旋混匀。
6. 将混合液放入65℃热水浴中,保温15min,使DNA变性。
7. 将变性后的混合液冷却至室温,加入等体积的70% 乙醇,混匀。
8. 离心(12,000r/min,5min)收集沉淀。
9. 将沉淀用70% 乙醇洗涤,离心(12,000r/min,5min)收集沉淀。
10. 将沉淀溶于适量TE缓冲液中,即为提取的质粒DNA。
11. 使用琼脂糖凝胶电泳检测质粒DNA。
五、实验结果与分析1. 琼脂糖凝胶电泳结果显示,提取的质粒DNA在紫外灯下呈现出明亮的目的条带,与DNA标准分子量Marker对应。
细菌质粒提取原理及步骤(精)
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质粒提取原理及步骤一、导论已经提出过许多方法用于从细菌中提纯质粒DNA ,这些方法都含有以下3个步骤:1. 细菌培养物的生长。
2. 细菌的收获和裂解3. 质粒DNA 的纯化。
(一)细菌培养物的生长从琼脂平板上挑取一个单菌落,接种到培养物中(有含有行当抗生素的液体培养基中生长,然后从中纯化质粒,质粒的提纯几乎总是如此。
现在使用的许多质粒载体(如pUC 系列)都能复制到很高的拷贝数,惟致只要将培养物放在标准LB 培养基中生长到对数晚期,就可以大量提纯质粒。
此时,不必造反性地扩增质粒DNA 。
然而,较长一代的载体(如pB R322 由于不能如此自由地复制,所以需要在得到部分生长的细菌培养物中加入氯霉素继续培养若干小时,以便对质粒进行性扩增。
氯霉素可抑制宿主的蛋白质合成,结果阻止了细菌染色体的复制,然而,松弛型质粒仍可继续复制,在若干小时内,其拷贝数持续递增。
这样,像pBR 322-类的质粒,从经氯霉素处理和未经处理的培养物中提取质粒的产量迥然不同,前者大为增高。
多年来,加入足以完全抑制蛋白质合成的氯霉素μg/ml已成为标准的操作、用该方法提取的质粒DNA 量,对于分子克隆中几乎所有想象到的工作任务。
(二)细菌的收获和裂解细菌的收获可通过离心来进行,而细菌的裂解则可以采用多种方法中的任意一种,这些方法包括用非离子型或离子型去污剂、有机溶剂或碱进行处理及用加热处理等。
选择哪一种方法取决于3个因素:质粒的大小、小肠杆菌菌株及裂解后用于纯化质粒DNA 的技术。
尽管针对质粒和宿主的每一种组合分别提出精确的裂解条件不切实际,但仍可据下述一般准则来选择适当方法,以取得满意的结果。
1 大质粒(大于15kb 容易受损,故应采用漫和裂解法从细胞中释放出来。
将细菌悬于蔗糖等渗溶液中,然后用溶菌酶和EDTA 进生处理,破坏细胞壁和细胞外膜,再加入SDS 一类去污剂溶解球形体。
这种方法最大限度地减小了从具有正压的细菌内部把质粒释放出来所需要的作用力。
质粒DNA提取溶液及注意
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1、实验安排:碱变性法抽提质粒DNA DNA,除了菌体培养、质粒扩增金额和收集菌体外,其提,除了菌体培养、质粒扩增金额和收集菌体外,其提取过程大致可分为三个步骤:从染色体DNA 中分离质粒DNA DNA,这是提取过程中最关键的操作,这是提取过程中最关键的操作步骤步骤;;去除质粒DNA 中的RNA;RNA;进一步纯化质粒进一步纯化质粒DNA DNA,去除蛋白质等杂质。
,去除蛋白质等杂质。
,去除蛋白质等杂质。
2、一些试剂的生化作用原理、一些试剂的生化作用原理(1)溶液Ⅰ)溶液Ⅰ溶霉菌:水解菌体细胞壁的主要化学成分肽聚糖中的β-1,4糖苷键,因而具有溶菌作用。
糖苷键,因而具有溶菌作用。
葡萄糖:增加溶液的粘度,防止DNA 受机械剪切力作用而降解。
受机械剪切力作用而降解。
EDTA EDTA::金属离子螯合剂,金属离子螯合剂,螯合螯合Mg2+Mg2+,,Ca2+Ca2+等金属离子,等金属离子,等金属离子,抑制脱氧核糖核酸酶抑制脱氧核糖核酸酶抑制脱氧核糖核酸酶((DNase DNase))对DNA 的降解作用(DNase 作用时需要一定的金属离子强度作辅基),同时EDTA 的存在,的存在,有利于溶有利于溶霉菌的作用。
因为溶霉菌的反应要求有较低的离子强度环境。
霉菌的作用。
因为溶霉菌的反应要求有较低的离子强度环境。
(2)溶液Ⅱ)溶液Ⅱ-NaOH-SDS -NaOH-SDS 液NaOH NaOH:核酸在:核酸在pH 值为5~9的溶液中是最稳定的,但pH 大于12或小于3时,就会引起双键之间氢键的解离而变性。
在溶液Ⅱ中的NaOH 浓度为0.2N 0.2N,加入提取液时,该系统的,加入提取液时,该系统的pH 就会高达12.612.6,因而促使染色体,因而促使染色体DNA 与质粒DNA 的变性。
的变性。
SDS SDS:为阴离子表面活性剂,主要功能有:溶解细胞膜上的脂肪与蛋白,从而破坏细胞膜;:为阴离子表面活性剂,主要功能有:溶解细胞膜上的脂肪与蛋白,从而破坏细胞膜;解聚细胞中的核蛋白SDS 蛋白质结合为复合物,使蛋白变性沉淀下来,但SDS 能抑制核糖核酸没的作用,酸没的作用,所以在以后的提取过程中,所以在以后的提取过程中,所以在以后的提取过程中,必须把它去除干净,必须把它去除干净,必须把它去除干净,以防用以防用RNase 去除RNA 时受到干扰。
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质粒提取的原理、操作步骤、各溶液的作用细菌质粒是一类双链、闭环的DNA,大小范围从1kb至200kb以上不等。
各种质粒都是存在于细胞质中、独立于细胞染色体之外的自主复制的遗传成份,通常情况下可持续稳定地处于染色体外的游离状态,但在一定条件下也会可逆地整合到寄主染色体上,随着染色体的复制而复制,并通过细胞分裂传递到后代。
质粒已成为目前最常用的基因克隆的载体分子,重要的条件是可获得大量纯化的质粒DNA分子。
目前已有许多方法可用于质粒DNA的提取,本实验采用碱裂解法提取质粒DNA。
碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH和 SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状,离心时可沉淀下来。
纯化质粒DNA的方法通常是利用了质粒DNA相对较小及共价闭环两个性质。
例如,氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心、离子交换层析、凝胶过滤层析、聚乙二醇分级沉淀等方法,但这些方法相对昂贵或费时。
对于小量制备的质粒DNA,经过苯酚、氯仿抽提,RNA酶消化和乙醇沉淀等简单步骤去除残余蛋白质和RNA,所得纯化的质粒DNA已可满足细菌转化、DNA片段的分离和酶切、常规亚克隆及探针标记等要求,故在分子生物学实验室中常用。
一、试剂准备1. 溶液Ⅰ: 50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0)。
1M Tris-HCl[t1] (pH 8.0)12.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml。
在10 lbf/in2高压灭菌15min ,贮存于4℃。
任何生物化学反应,首先要控制好溶液的pH,因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液。
50 mM葡萄糖最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。
因此,如果溶液I中缺了葡萄糖其实对质粒的抽提本身而言,几乎没有任何影响。
所以说溶液I中葡萄糖是可缺的。
EDTA呢?大家知道EDTA是Ca2+和Mg2+等二价金属离子的螯合剂,配在分子生物学试剂中的主要作用是:抑制DNase的活性,和抑制微生物生长。
在溶液I中加入高达 10 mM 的EDTA,无非就是要把大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子都螯合掉。
如果不加EDTA,其实也没什么大不了的,只要不磨洋工,只要是在不太长的时间里完成质粒抽提,就不用怕DNA会迅速被降解,因为最终溶解质粒的TE 缓冲液中有EDTA。
如果哪天你手上正好缺了溶液I,可不可以抽提质粒呢?实话告诉你,只要用等体积的水,或LB培养基来悬浮菌体就可以了。
NaOH也使DNA变性,但只是个副产物,在溶液3加入后其中的醋酸和NaOH 中和,质粒DNA恢复活性2. 溶液Ⅱ:0.2N NaOH,1% SDS。
2N NaOH 1ml,10%SDS 1ml,加ddH2O至10ml。
使用前临时配置[t2]。
这是用新鲜的0.4 N的NaOH和2%的SDS等体积混合后使用的。
要新从浓NaOH稀释制备0.4N的NaOH,无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。
很多人不知道其实破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以才叫碱法抽提。
事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂,不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞,碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解,这是由于细胞膜发生了从bilayer (双层膜)结构向 micelle(微囊)结构的相变化所导致。
用了不新鲜的0.4 N NaOH,即便是有SDS也无法有效溶解大肠杆菌(不妨可以自己试一下),自然就难高效率抽提得到质粒。
如果只用SDS当然也能抽提得到少量质粒,因为 SDS也是碱性的,只是弱了点而已。
很多人对NaOH的作用误以为是为了让基因组DNA变性,以便沉淀,这是由于没有正确理解一些书上的有关DNA变性复性的描述所导致。
有人不禁要问,既然是NaOH溶解的细胞,那为什么要加SDS呢?那是为下一步操作做的铺垫。
这一步要记住两点:第一,时间不能过长,千万不要这时候去接电话,因为在这样的碱性条件下基因组DNA片断会慢慢断裂;第二,必须温柔混合(象对待女孩子一样),不然基因组DNA 也会断裂。
基因组 DNA的断裂会带来麻烦。
3. 溶液Ⅲ:醋酸钾(KAc)缓冲液,pH4.8。
5M KAc 300ml,冰醋酸 57.5ml,加ddH2O至500ml。
4℃保存备用。
溶液III加入后就会有大量的沉淀,但大部分人却不明白这沉淀的本质。
最容易产生的误解是,当SDS碰到酸性后发生的沉淀。
如果你这样怀疑,往1%的 SDS溶液中加如2M的醋酸溶液看看就知道不是这么回事了。
大量沉淀的出现,显然与SDS的加入有关系。
如果在溶液II中不加SDS会怎样呢,也会有少量的沉淀,但量上要少得多,显然是盐析和酸变性沉淀出来的蛋白质。
既然SDS不是遇酸发生的沉淀,那会不会是遇盐发生的沉淀呢?在1%的SDS溶液中慢慢加入5 N的NaCl,你会发现SDS在高盐浓度下是会产生沉淀的。
因此高浓度的盐导致了SDS的沉淀。
但如果你加入的不是NaCl而是KCl,你会发现沉淀的量要多的多。
这其实是十二烷基硫酸钠(sodium dodecylsulfate)遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾(potassium dodecylsulfate, PDS),而PDS是水不溶的,因此发生了沉淀。
如此看来,溶液III加入后的沉淀实际上是钾离子置换了SDS中的钠离子形成了不溶性的PDS,而高浓度的盐,使得沉淀更完全。
大家知道SDS专门喜欢和蛋白质结合,平均两个氨基酸上结合一个SDS分子,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质沉淀了,让[t3]人高兴的是大肠杆菌的基因组DNA也一起被共沉淀了。
这个过程不难想象,因为基因组DNA太长了,长长的DNA自然容易被PDS给共沉淀了,尽管SDS并不与DNA分子结合。
那么2 M的醋酸又是为什么而加的呢?是为了中和NaOH,因为长时间的碱性条件会打断DNA,所以要中和之。
基因组DNA一旦发生断裂,只要是50-100 kb大小的片断,就没有办法再被PDS共沉淀了。
所以碱处理的时间要短,而且不得激烈振荡,不然最后得到的质粒上总会有大量的基因组DNA混入,琼脂糖电泳可以观察到一条浓浓的总DNA条带。
很多人误认为是溶液III加入后基因组DNA无法快速复性就被沉淀了,这是天大的误会,因为变性的也好复性的也好,DNA分子在中性溶液中都是溶解的。
NaOH本来是为了溶解细胞而用的,DNA分子的变性其实是个副产物,与它是不是沉淀下来其实没有关系。
溶液 III加入并混合均匀后在冰上放置,目的是为了PDS沉淀更充分一点。
4. TE:10mM Tris-HCl(pH 8.0),1mM EDTA(pH 8.0)。
1M Tris-HCl(pH 8.0)1ml,0.5M EDTA(pH 8.0)0.2ml,加ddH2O至100ml。
15 lbf/in2高压湿热灭菌20min,4℃保存备用。
5.苯酚/氯仿 /异戊醇(25:24:1)不要以为PDS沉淀的形成就能将所有的蛋白质沉淀了,其实还有很多蛋白质不能被沉淀,因此要用酚/氯仿/异戊醇进行抽提,然后进行酒精沉淀才能得到质量稳定的质粒DNA,不然时间一长就会因为混入的DNase而发生降解。
这里用25/24/1的酚/氯仿/异戊醇是有很多道理的,这里做个全面的介绍。
酚(Phenol)对蛋白质的变性作用远大于氯仿,按道理应该用酚来最大程度将蛋白质抽提掉,但是水饱和酚的比重略比水重,碰到高浓度的盐溶液(比如4M的异硫氰酸胍),离心后酚相会跑到上层,不利于含质粒的水相的回收;但加入氯仿后可以增加比重,使得酚/氯仿始终在下层,方便水相的回收;还有一点,酚与水有很大的互溶性,如果单独用酚抽提后会有大量的酚溶解到水相中,而酚会抑制很多酶反应(比如限制性酶切反应),因此如果单独用酚抽提后一定要用氯仿抽提一次将水相中的酚去除,而用酚/氯仿的混合液进行抽提,跑到水相中的酚则少得多,微量的酚在乙醇沉淀时就会被除干净而不必担心酶切等反应不能正常进行。
至于异戊醇的添加,其作用主要是为了让离心后上下层的界面更加清晰,也方便了水相的回收。
6.乙醇(无水乙醇、70%乙醇)回收后的水相含有足够多的盐,因此只要加入2倍体积的乙醇,在室温放置几分钟后离心就可以将质粒DNA沉淀出来。
这时候如果放到-20℃,时间一长反而会导致大量盐的沉淀,这点不同于普通的DNA酒精沉淀回收,所以不要过分小心了。
高浓度的盐会水合大量的水分子,因此DNA分子之间就容易形成氢键而发生沉淀。
如果感觉发生了盐的沉淀,就用70%的乙醇多洗几次,每次在室温放置一个小时以上,并用tip将沉淀打碎,就能得到好的样品。
得到的质粒样品一般用含 RNase(50 ug/ml)的TE缓冲液进行溶解,不然大量未降解的RNA会干扰电泳结果的.7. 5×TBE:Tris 碱54g,硼酸27.5g,EDTA-Na2·2H2O 4.65g,加ddH2O 至1000ml。
15 lbf/in2高压湿热灭菌20min,4℃保存备用。
8.溴化乙锭(EB):10mg/ml9.RNase A(RNA酶A):不含DNA酶(DNase-free) RNase A的10mg/ml,TE 配制,沸水加热15min,分装后贮存于-20℃。
10. 6×loading buffer(上样缓冲液):0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青FF,40%(W/V)蔗糖水溶液。
11. 1% 琼脂糖凝胶:称取1g琼脂糖于三角烧瓶中,加100ml 0.5×TBE,微波炉加热至完全溶化,冷却至60℃左右,加EB母液(10mg/ml)至终浓度0.5μg/ml (注意:EB为强诱变剂,操作时带手套),轻轻摇匀。
缓缓倒入架有梳子的电泳胶板中,勿使有气泡,静置冷却30min以上,轻轻拔出梳子,放入电泳槽中(电泳缓冲液0.5×TBE),即可上样。
二、操作步骤1. 挑取LB固体培养基上生长的单菌落,接种于2.0ml LB(含相应抗生素)液体培养基中,37℃、250g振荡培养过夜(约12-14hr)。
2.取1.5ml培养物入微量离心管中,室温离心 8000g×1min,弃上清,将离心管倒置,使液体尽可能流尽。
3.将细菌沉淀重悬于100μl预冷的溶液Ⅰ(50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0))中,剧烈振荡,使菌体分散混匀,(且不至于沉淀)。
4. 加200μl新鲜配制的溶液Ⅱ,颠倒数次混匀(不要剧烈振荡),并将离心管放置于冰上2-3min,使细胞膜裂解(溶液Ⅱ为裂解液,故离心管中菌液逐渐变清)。