文献汇报1

膜、GJD2和ACTC1中，对可能影响这些基因转录的调节 因素进行调控后的数据表明15q14的变异影响屈光不正
研究内容分析
• 对5328个个体的屈光误差进行了全基因组关联研究（主要荷兰）在四个独立的队列中进行复制(共 10280个)。在15q14号染色体上发现了一个重要的关联。 • 轻度近视与远视的比值比后发现 等位基因(小等位基因频率= 0.47)为个体杂合子的1.41 (95% CI 1.16-1.70)。 等位基因和对于等位基因的纯合子的1.83(95% CI 1.42-2.36)。 • 眼轴伸长导致近视(近视)，，而短轴则导致远视(远视)。屈光不正经常引起，眼睛解剖结构的改变，增 加了临床眼病的风险。 近视可导致青光眼、视网膜等眼部疾病。高度近视会导致后葡萄膜炎和黄斑变性。 近视的治疗方法有限，是视力受损的第五大常见原因和第七大常见的致盲原因。 屈光不正和近视的病因是复杂的，目前的观点是眼球生长是由视觉诱发的信号级联引起 （从视网膜开始，穿过脉络膜，随后进行巩膜重塑。 近视的危险因素是教育、阅读、户外曝晒和家族遗传。 通过隔离分析：近视患者的复发风险估计的兄弟姐妹(λs)不同，近视的遗传度估计(h2)范围从0.60到0.90 (ref. 15)。（建议多基因参与，而不是单个主要基因的影响
研究背景总体概述
• 对5328个个体的屈光误差进行了全基因组关联研究（主要荷兰）在四个独立的队列中进行复制(共 10280个)。在15q14号染色体上发现了一个重要的关联。 • 轻度近视与远视的比值比后发现 等位基因(小等位基因频率= 0.47)为个体杂合子的1.41 (95% CI 1.16-1.70)。 等位基因和对于等位基因的纯合子的1.83(95% CI 1.42-2.36)。 • 眼轴伸长导致近视(近视)，，而短轴则导致远视(远视)。屈光不正经常引起，眼睛解剖结构的改变，增 加了临床眼病的风险。 近视可导致青光眼、视网膜等眼部疾病。高度近视会导致后葡萄膜炎和黄斑变性。 近视的治疗方法有限，是视力受损的第五大常见原因和第七大常见的致盲原因。 屈光不正和近视的病因是复杂的，目前的观点是眼球生长是由视觉诱发的信号级联引起 （从视网膜开始，穿过脉络膜，随后进行巩膜重塑。 近视的危险因素是教育、阅读、户外曝晒和家族遗传。 通过隔离分析：近视患者的复发风险估计的兄弟姐妹(λs)不同，近视的遗传度估计(h2)范围从0.60到0.90 (ref. 15)。（建议多基因参与，而不是单个主要基因的影响
3.22 文献汇报
wk.baidu.com
全基因组关联研究确定了 15q14 为屈光不正和近视的敏感位点
汇报人：2014级本科生张静颖
目录
02
研究内容
04
研究结果
01
研究背景
03
研究方法
背景与摘要
屈光不正是全世界最常见的眼部疾病，可能导致失明且这
一性状高度遗传
01
屈光不正是目前人类视力损害最常见的原因---由眼部生 物特征成分的异常协调效应引起 分析轻度近视与远视的比值比后发现，相关位点位于视网
参与者
1991年至1993年期间进行了研究，包括6 775接受了双侧白内障手术，激光屈光手术的 有5328人可获得屈光不正和全基因组的SNPs，其中99%的人是欧洲血统。 复制组——前三个复制研究起源于荷兰。 第一个队列是RS-II，包括2157个参与者。（自2000年起，55岁以上的老人 2000年至2002年期间进行了随访。 第二个复制队列是RS-III, a。（2082名年龄在45岁及以上，在2006年和2009年之间 第三个复制研究是Erasmus Rucphen家族。 (ERF)研究，一个以家庭为基础的研究，在一个基因隔离的人口的西南部。 荷兰。包括了年龄在18岁的Erasmus Rucphen的2032个活着的后代。 人眼组织中的基因表达数据 人类基因表达的数据 在视网膜色素上皮，脉络膜（从6个供者眼睛获得 从三个供体的眼中获得光感受器（使用液态氮快速冷冻技术） 捐献者年龄在63岁至78岁之间，没有任何已知的眼部病史。 冷冻切片从黄斑切开，用组织学知识和外观辨认视网膜色素上皮、光感受器和脉络膜细胞。用激光显微解 剖系统从黄斑区分离RNA 分离和mRNA成分并进行程序和表达微阵列分析。 根据迈阿密的指导方针。作为表达水平的度量，对所有的表达式进行排序。 在44K微阵列上的基因增加了它们的表达，计算对应的百分比(补充表3)
研究方法
GWAS分析
01
对比观察期望分布
logistic回归分析
绘制势能函数
研究方法
GWAS分析（genome-wide association studies）即染色体组或基因组分析 我们选取了31个snp分布。 四个位点的染色体，(补充表2)为进一步调查四个独立的复制群组: SNP（单核苷酸多样性：在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列，绝大多数核苷酸序列顺序 一致而只有一个碱基不同的现象） 此方法可以确定基因多态性和近视的关系 复制组的分析显示了显著的变化。即15q14(最重要的)的折射误差与轨迹之间的联系。 在rs634990结合P = 2.21×10−14;表1)。该区域的风险等位基因的频率与整个研究相似。P值 在RS-II、RS-III和TwinsUK的14个顶端SNPs中，显著变化(P < 0.05) logistic回归分析 为了确定这个位点对临床相关结果风险的影响 在logistic回归分析中，将近视患者与远视者进行比较。证据表明，rs634990的C等位基因导致的近视风 险高于。T等位基因(图2)。低至中度或高度近视与低的比值比(或)。 中度或高度远视的异型受精卵为1.41 (95% CI 1.16-1.70)， 1.83(95%)。 为该置信区间1.42 - -2.36)。
研究方法
评估在基因间区域内的相关变异 对于SNPs的表达。相关的15q14位点在淋巴母细胞细胞系中。至少有两个以上的相关SNPs。、 15q14基因变异的影响是相对均匀的，提高调查结果的可信度 RASGRF1。这个基因在功能上与眼睛发育有关，类似于GJD2，参与光感受器的突触传递 15q25支持这些基因位点与屈光不正和近视的关联。来揭示近视的机理。 随后应该包括全面。对整个相关区域和侧翼基因进行重新测序，验证群组。
研究方法
在 GOLGA8B(180 kb rs634990的5′端)。研究了一个势能函数。 这些基因通过检测视网膜上的基因表达水平来促进眼睛生长发育。 在死后人类的眼睛(补充表3)并观察到中度至高表达。 GJD2和ACTC1的表达和GOLGA8B的低表达。 ACTC1对42-kDa平滑肌进行编码。 ACTC1在眼睛中的功能作用目前不清楚,但类似的如α-SMA,已被证明是在近视中增加 α-SMA影响巩膜中收缩纤维的数量并有助于细胞外基质的重塑 GJD2编码36-kDa蛋白Connexin36(也称为CX36和缝隙连接)。 蛋白质2)，是属于多基因家族的一种神经特异蛋白。 存在于光感受器，和双极细胞，在视网膜电的传输过程中起着至关重要的作用。 GJD2的所有外显子和内含子外边界的测序也有47个个体。 高度近视，高远视或远视中有频率差异
课题研究内容
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02
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THANKS
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研究方法
测量屈光不正 从1998年到2002年，参与者接受了眼科和屈光不正检查，得出最佳矫正视力和角膜测量数据。计算公式 为: 等效球镜量=球镜量+(柱镜量/2) 并对折射率进行测量， 得出临床分型。近视分为低(球形相当于从1.5−−3 度),中等(球形相当于从3−−6度)和高(球形相当于−6度或更低)。