第三章蛋白质化学
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第三章蛋白质化学
一、重点难点概述:学习要求:掌握蛋白质的概念和化学组成;掌握蛋白质的组成单位——氨基酸的结构和理化性质;掌握肽的概念和性质;掌握蛋白质的结构(包括初级结构和空间结构)及结构与功能的关系,掌握蛋白质和氨基酸的理化性质;了解蛋白质分析、分离和纯化的一般方法。
重点及难点:氨基酸的结构和性质;蛋白质的结构与功能的关系;蛋白质的分离纯化。
主要内容:
一、蛋白质的化学组成与分类
蛋白质:蛋白质(protein)是生命的物质基础,是有机大分子,是构成细胞的基本有机物,是生命活动的主要承担者。没有蛋白质就没有生命。氨基酸是蛋白质的基本组成单位。它是与生命及与各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质。机体中的每一个细胞和所有重要组成部分都有蛋白质参与。蛋白质占人体重量的16%~20%,即一个60kg重的成年人其体内约有蛋白质9.6~12kg。人体内蛋白质的种类很多,性质、功能各异,但都是由20多种氨基酸(Amino acid)按不同比例组合而成的,并在体内不断进行代谢与更新。
(一)蛋白质的元素组成(二)蛋白质的基本单位——氨基酸(三)蛋白质的分类
二、蛋白质的大小与分子量
三、蛋白质的构象
四、蛋白质结构层次
五、蛋白质分子多样性
第二节蛋白质基本单位---氨基酸
一、蛋白质的水解
二、氨基酸的结构与分类
(一)基本氨基酸(20种)(二)修饰氨基酸(三)非蛋白质组分氨基酸
三、氨基酸的构型、旋光性和光吸收
(一) 氨基酸的构型(二)氨基酸的旋光性(三)氨基酸的光吸收性
四、氨基酸的酸碱性质
(一)氨基酸是两性电解质(二)氨基酸有特征滴定曲线(三)不同氨基酸的酸碱性质不同(四)氨基酸的甲醛滴定
五、氨基酸的化学反应
六、氨基酸的分离分析
(一)分配层析法分离氨基酸(二)分配柱层析(三)氨基酸的纸层析(四)氨基酸的薄层层析(五)氨基酸纸电泳(六)离子交换层析分离氨基酸
第三节蛋白质的共价结构
一、肽和键的结构
(一)肽键(二)肽键作为蛋白质主键的证据(三)肽键的特点(四)肽概念
二、肽的理化性质
(一)肽的物理性质:晶体的熔点很高(二)肽的解离(三)小肽的滴定及等电点确定
三、天然存在的活性肽
四、蛋白质一级结构举例
(一)胰岛素(二)核糖核酸酶的一级结构
五、蛋白质的氨基酸序列与生物功能
(一)同源蛋白质的种属差异与生物进化(二)同源蛋白质具有共同的进化起源
(三)血液凝固与氨基酸序列的局部断裂
六、肽链人工合成
第四节蛋白质的三维结构
一、研究蛋白质构象的方法
(一)X-射线晶体衍射技术:(二)核磁共振
二.蛋白质分子中的共价键与次级键
三、多肽折叠的空间限制
(一)肽单位平面结构——肽单元(二)二面角(三)拉氏构象图
四、蛋白质的二级结构
(一)螺旋结构概述(二)a-螺旋(三)b-折叠(四)转角(五)无规卷曲(六)蛋白质的结构转换
第五节蛋白质的三级结构和四级结构
一、三级结构和四级结构的概念
(一)三级结构(二)四级结构(三)纤维蛋白与球蛋白结构和功能的差异
二、纤维蛋白适应其支架功能
(一)纤维状蛋白质的类型(二)纤维蛋白的特性(三)a-角蛋白(四)胶原蛋白(五)丝心蛋白
三、结构多样性反应了球蛋白功能的多样性
四、肌红蛋白提供了关于球状蛋白结构复杂性的最早线索
(一)肌红蛋白的结构(二)由肌红蛋白的结构得出了许多重要结论(三)肌红蛋白的构象保证了血红素与氧的结合
五、球状蛋白有各种三级结构
(一)细胞色素C(二)溶菌酶(三)核糖核酸酶
六、对许多球蛋白质研究中发现共同的结构形式——超二级结构和结构域
(一)超二级结构(基序motif或折fold叠)(二)结构域
七、球状蛋白质的三级结构的特征要点:
八.蛋白质大小的限制
九、球状蛋白质的聚集体——四级结构
(二)亚基间的结合力:
(一)有关四级结构的一些概念
(三)四级结构的对称性
(四)球蛋白聚合成四级结构的优越性
第六节蛋白质的变性和折叠
一、蛋白质的变性
(一)变性概念(二)变性因素(三)各种变性因素对蛋白质构象的影响(四)变性现象(五)可逆变性和不可逆变性(六)蛋白质变性过程(七)蛋白质的复性(八)变性的预防和利用
二、多肽链折叠(一)氨基酸顺序决定蛋白质的三极结构(二)氨基酸顺序决定三级结构的证据(三)肽链按步骤折叠(四)折叠过程的能量变化(五)某些蛋白质折叠在其他蛋白质的辅助下进行
第七节蛋白质的功能
一、肌红蛋白的结构(一)结构与功能(二)肌红蛋白氧合曲线
二、血红蛋白的结构与功能
(一)血红蛋白的主要地位(二)血红蛋白的结构(三)血红蛋白对氧的结合
四、免疫球蛋白的结构与功能
(一) 免疫系统(二)抗原与抗体的一般概念(三)免疫球蛋白的分类(四)免疫球蛋白的结构(五)IgG的作用(六)抗体技术
五、肌球蛋白和肌动蛋白
(一)分布:(二)肌球蛋白(三)肌动蛋白
六、蛋白质的结构与功能的进化
(一)蛋白质进化的一般规律(二)同源蛋白质进化趋势
七、蛋白质构象的特点
八、寡聚蛋白与别构效应
蛋白质的重要性质、两性解离性质及等电点、蛋白质胶体性质、蛋白质的沉淀、蛋白质的变性与复性、蛋白质的紫外吸收、蛋白质呈色反应
蛋白质的分离纯化与鉴定一、细胞破碎二、提取三、分离盐析有机溶剂沉淀等电点沉淀四、纯化离子交换层析凝胶过滤五、蛋白质分子量的测定与纯度鉴定
1.蛋白质元素组成和氨基酸组成的特点。
2.蛋白质中常见氨基酸的结构特点、分类方法, 熟记20种氨基酸的结构特点,三字母符号和单字母符号。
3.氨基酸α-氨基参加的各种反应及用途;α-羧基参加的各种反应及其用途;α-氨基和α-羧基共同参加的反应及其用途;熟悉R基参加的一些重要反应及其用途。
4.掌握用纸层析、离子交换层析、高效液相色谱(HPLC)分离和分析氨基酸的基本原理。5.肽链一级、二级、三级、四级结构;蛋白质一、二、三、四级结构的含义,四级结构的主要特点,及四级缔合在结构和功能方面的优越性。利用沉淀法、凝胶过滤法、离子交换层析法、亲和层析法、快速液相层析法、PAGE法、IES法、IES-PAGE双向电泳法等方法分离分析蛋白蛋的基本原理和基本步骤,测定蛋白质含量的常用方法。
二、五个问题:
1.甘氨酸的pK-COOH =
2.34,pK-NH2=9.6,它的pI为
A.11.94
B.7.26
C.5.97
D.3.63
E.2.34
[答案] C
[评析] 氨基酸含有碱性的氨基和酸性的羧基,具有两性解离的特性。在某种pH环境中,氨基酸的酸性基团和碱性基团解离度相等,成为兼性离子。此时,氨基酸所处环境的pH值称为该氨基酸的等电点。甘氨酸的R基无解离基团,其pI的计算方法为:
pI=1/2(pK-COOH+ pK-NH2)=1/2(2.34+9.6)=5.97。
2.测定小肽氨基酸序列的最好方法是
A.2,4-二硝基氟苯法(FDNB法)
B.二甲氨基萘磺酰氯法(DNS-CL法)
C.氨肽酶法
D.苯异硫氰酸法(PITC法)
E.羧肽酶法
[答案] D
[评析] 测定小肽氨基酸序列最好的方法是苯异硫氰酸法。此法的最大优点是苯异硫氰酸和肽链N端的氨基反应后形成苯硫氨甲酰肽(PTC-肽),然后在酸性条件下,N端的苯硫氨甲酰氨基酸(PTC-氨基酸)环化形成苯硫乙内酰脲衍生物(PTH-氨基酸)并从肽链上脱落下来,而肽链的其余部分保持完整,又可重复上述的反应。蛋白质顺序仪就是根据这一原理设计制造的。
3.下列关于蛋白质结构的叙述哪些是正确的?
A.二硫键对稳定蛋白质的构象起重要作用
B.球状蛋白质在水溶液中,带电荷的氨基酸侧链趋向于排列在分子的外面
C.蛋白质的一级结构决定高级结构
D.氨基酸的疏水侧链很少埋在蛋白质分子的内部