蛋白质的一级结构
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
化学法:可获得较大的肽段 溴化氰
(Cyanogen bromide)水解法,它能选择性地 切割由Met的羧基所形成的肽键。 多 肽 链 的 选 择 性 降 解
CH3 S: CH2 CH2 O NH CH C CH3 S
+
R
O + Br C
+
Br N
-
NH CH C
C
N R O CH2 CH2 O NH CH C O
O NH CH C R1 R2
O NH CH C R3
O NH CH C R4
O NH CH C
水解位点
肽链
嗜 热 菌 蛋 白 酶
thermolysin:R2=Phe, Trp, Tyr; Leu,Ile, Met以及其它疏水性强的 氨基酸水解速度较快。 R2=Pro或Gly 水解受抑。 R1或R3=Pro 水解受抑。
(2)测定步骤
E.多肽链断裂成多个肽段,可采用两种或多种不同 的断裂方法将多肽样品断裂成两套或多套肽段或 肽碎片,并将其分离开来。p169
多 肽 链 的 选 择 性 降 解
酶解法: 胰蛋白酶,糜蛋白酶,胃蛋白酶,嗜热 菌蛋白酶,羧肽酶和氨肽酶
O NH CH C R1 R2
O NH CH C R3
+
CH2 CH2 O NH CH C H2O CH3 S C NH NH CH C
CH2 N CH2 O CH C R
R
+
O
NH CH C O
H3N
+
CH C
高丝氨酸内酯
多 肽 链 的 选 择 性 各种蛋白中-Asn-Gly-出现的概率很低。 降 解
化学法:可获得较大的肽段 羟胺(NH2OH):专一性断裂-Asn-Gly-之 间的肽键。也能部分裂解-Asn-Leu-之 间的肽键以及-Asn-Ala-之间的肽键。
三、 蛋白质的一级结构与生物功能
1. 同源蛋白质的种属差异与生物进化 同源蛋白质(homologous protein)是指在 不同的有机体中实现同一功能的蛋白质。 例如血红蛋白在不同的脊锥动物中行使 相同的输氧功能。 不同种属来源的同源蛋白质一般具有相同 长 度或接近相同长度的多肽链。
同源蛋白质
O NH CH C R3
O NH CH C R4
O NH CH C
水解位点
肽链
胃 蛋 白 酶
Pepsin:R1和R2=Phe, Trp, Tyr; Leu 以及其它疏水性氨基酸水解速度较快。 R1=Pro 水解受抑。 酶的最适pH2。二硫键在酸性条件下稳 定。确定二硫键的位置时常用胃蛋白酶。
Pro
O NH CH C R1 R2
O NH CH C R3
O NH CH C R4
O NH CH C
水解位点
肽链
糜 蛋 白 酶
或胰凝乳蛋白酶 (Chymotrypsin): R1=Phe, Trp,Tyr时水解快; R1= Leu,Met和His水解稍 慢。 R2=Pro 水解受抑。
O NH CH C R1 R2
N-端氨基酸分析法-氨肽酶(amino
peptidases)法
氨肽酶是一种肽链外切酶,它能从多肽链 的N-端逐个的向里水解。 根据不同的反应时间测出酶水解所释放出 的氨基酸种类和数量,按反应时间和氨基 酸残基释放量作动力学曲线,从而知道蛋 白质的N-末端残基顺序。 最常用的氨肽酶是亮氨酸氨肽酶,水解以 亮氨酸残基为N-末端的肽键速度最大。
(一)肽键与肽链
1.肽键:一个氨基酸的α-COOH 和相邻的另一个氨基酸的
α-NH2脱水形成共价键。如下图:
肽键和肽的结构
2. 氨基酸借肽键连接起来叫肽,肽是一大类物质,即:
1) 2) 3) 4) 两个氨基酸组成的肽叫二肽; 三个氨基酸组成的肽叫三肽; 多个氨基酸组成的肽叫多肽; 氨基酸借肽键连成长链,称为肽链,肽链两端有自由-NH2 和-COOH,自由-NH2端称为N-末端(氨基末端),自由COOH端称为C-末端(羧基末端); 5) 构成肽链的氨基酸已残缺不全,称为氨基酸残基; 6) 肽链中的氨基酸的排列顺序,一般-NH2端开始,由N指 向C,即多肽链有方向性,N端为头,C端为尾。
蛋白质的一级结构
蛋白质的二级结构
蛋白质的三级结构
蛋白质的四级结构
蛋白质的结构具有多种结构层次,包括一级结构和空间结 构,空间结构又称为构象。空间结构包括二级结构、三级结 构和四级结构。在二级与三级之间还存在超二级结构和结构 域这两个结构层次。
一、蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构
蛋白质的一级结构(Primary structure)又称为共价结 构或化学结构。它是指蛋白质中的氨基酸按照特定的排列 顺序通过肽键连接起来的多肽链结构。
氨酸),可促进甲状腺素的释放。 3.短杆菌素S:环十肽,含有D-苯丙氨酸、鸟氨酸, 对革兰氏阴性细菌有破坏作用,主要作用于细胞膜。
4.青霉素:含有D—半胱氨酸和D—缬氨酸的二肽衍生
物 。主要破坏细菌的细胞壁粘肽的合成引起溶菌。
5.牛催产素与加压素:均为九肽,分子中含有一对二硫键, 两者结构类似。前者第九位为Gly或Lys或Phe,后者为Arg。 前者可刺激子宫的收缩,促进分娩。后者可促进小动脉收缩, 使血压升高,也有抗利尿作用,参与水、盐代谢的调节。
顺序同源的生物学意义
在不同种属来源的细胞色素c中,可以变换的 氯基酸残基数目与这些种属在系统发生上的位 置有密切关系,即在进化位置上相距愈远,则 氨基酸顺序之间的差别愈大; 反之,亲缘关系 越近,其顺序同源性越大。 细胞色素c的氨基酸顺序分析资料己被用来核 对各个物种之间的分类学关系,以及绘制系统 发生树-进化树。 根据进化树不仅可以研究从单细胞有机体到多 细胞有机体的生物进化过程,而且可以粗略估 计现存的各类种属生物在进化中的分歧时间。
根据细胞色素c的顺序种属差异建立的进化树
2 一级结构的局部断裂与蛋白质的激活
在动物体内的某些生物化学过程中,蛋白质分 子的部分肽链必须先按特定的方式断裂,然后 才呈现生物活性。 血液凝固时血纤维蛋白原(fibrinogen)和凝血酶 原(thrombinogen)的复杂变化; 消化液中一系列蛋白水解酶原的激活 (activation) 许多多肽或蛋白质激素前体转变为活性的激素 形式等都属于这种情况。
肽的颜色反应
多肽可与多种化合物作用,产生不同的颜色反应。这 些显色反应,可用于多肽的定性或定量鉴定。 如黄色反应,是由硝酸与氨基酸的苯基(酪氨酸和苯 丙氨酸)反应生成二硝基苯衍生物而显黄色。
多肽的双缩脲反应是多肽特有的颜色反应;双缩脲是两 分子的尿素经加热失去一分子NH3而得到的产物。 双缩脲能够与碱性硫酸铜作用,产生兰色的铜-双缩脲 络合物,称为双缩脲反应。含有两个以上肽键的多肽, 具有与双缩脲相似的结构特点,也能发生双缩脲反应, 生成紫红色或蓝紫色络合物。这是多肽定量测定的重 要反应.
H H N CH C NHNH2 +H2N CH C OH NH2NH2 2 C -端 氨 基 酸 氨基酸酰肼
R
C-端氨基酸分析法--羧肽酶 (carboxypeptidase)法
Baidu Nhomakorabea
羧肽酶是一种肽链外切酶,它能从多肽链的C-端逐个的 水解AA。根据不同的反应时间测出酶水解所释放出的氨 基酸种类和数量,从而知道蛋白质的C-末端残基顺序。 目前常用的羧肽酶有四种:A,B,C和Y;A和B来自胰脏; C来自柑桔叶;Y来自面包酵母。 羧肽酶A能水解除Pro,Arg和Lys以外的所有C-末端氨基酸 残基;B只能水解Arg和Lys为C-末端残基的肽键。
O
O NH CH C R2 R3
O NH CH C R4
O NH CH C
谷 氨 酸 蛋 白 酶 和 精 氨 酸 蛋 白 酶
NH CH C R1
水解位点
肽链
谷氨酸蛋白酶: R1=Glu、Asp(磷酸 缓冲液); R1=Glu (磷酸缓冲液或醋 酸缓冲液) 精氨酸蛋白酶: R1=Arg
木瓜蛋白酶、菠萝蛋白酶
6.舒缓激肽:促进血管舒张,促进水、钠离子的排出。
7.脑啡肽:为五肽,具有镇痛作用。
在正常人的脑内存在内源性脑啡肽和脑啡肽受体。在正常情况下,内 源性脑啡肽作用于脑啡肽受体,调节着人的情绪和行为。人在吸食海洛因 后,抑制了内源性脑啡肽的生成,逐渐形成在海洛因作用下的平衡状态, 一旦停用就会出现不安、焦虑、忽冷忽热、起鸡皮疙瘩、流泪、流涕、出 汗、恶心、呕吐、腹痛、腹 泻等。冰毒和摇头丸在药理作用上属中枢兴 奋药,毁坏人的神经中枢。
不变残基(invariable residue):同源蛋白质的 氨基酸顺序中有许多位置的氨基酸对所有的种 属来说都是相同的; •可变残基(variable residue):其它位置的氨基 酸对不同种属有相当大的变化。 •顺序同源(sequence homology)现象:同源蛋 白质的氨基酸顺序中所具有的相似性。 •顺序同源现象表明从中分离同源蛋白质的这 些生物在进化上有着共同的祖先。
C-端氨基酸分析法--肼解法
此法是多肽链C-端氨基酸分析法。多肽与肼在无水 条件下加热,C-端氨基酸即从肽链上解离出来,其 余的氨基酸则变成肼化物。肼化物能够与苯甲醛缩 合成不溶于水的物质而与C-端氨基酸分离。
R
O
R n-1O
Rn O
H2N CH C N- 端 氨 基 酸
+
HN CH C HN CH C OH C -端 氨 基 酸 O Rn O
(二)天然活性肽 自然界中有自由存在的活性肽,主要有: 1. 谷胱甘肽(GSH):三肽(Glu-Cys-Gly),广泛存在于 生物细胞中,含有自由的-SH,具有很强的还原性,可作为 体内重要的还原剂,保护某些蛋白质或酶分子中的巯基免 遭氧化,使其处于活性状态。
2.促甲状腺素释放激素:三肽(焦谷氨酰组氨酰脯
蛋白质的一级结构
3.蛋白质一级结构举例 (1)胰岛素(Insulin)英国Sanger
S S S S
A链
S S
胰岛素 A链21个aa残基
B链
B链30个aa残基
一个链内二硫键和两个链间 二硫键,分子量5700
(2)牛胰核糖核酸酶(RNase) 一条多肽链,124AA残基组成,四 个链内二硫键,分子量12600.它是测出一 级结构的第一个酶分子。
蛋白质的结构
蛋白质是由一条或多条多肽 (polypeptide)链以特殊方式结合而成 的生物大分子。 蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是 将分子量在6000道尔顿以上的多肽称为 蛋白质。 蛋白质分子量变化范围很大, 从大约 6000到1000000道尔顿甚至更大。
示例
虾红素
木瓜蛋白酶
O NH CH C R4
O NH CH C
水解位点
肽链
胰 蛋 白 酶
Trypsinase :R1=Lys和 Arg侧链(专一性较强,水 解速度快)。R2=Pro 水解 受抑。 马来酸酐保护Lys,只水解 Arg 1,2-环己二酮保护Arg,只 水解Lys p173
-HN-CH-CO-NH-CH-COR1 R2
组织蛋白酶
一、蛋白质的一级结构
1. 定义—— 1969年,国际 纯化学与应用化学委员会 (IUPAC) 规定:蛋白 质的一级结构指蛋白质多 肽连中AA的排列顺序,包 括二硫键的位置。其中
最重要的是多肽链的氨 基酸顺序,它是蛋白质 生物功能的基础。
2.蛋白质一级结构的测定
蛋白质氨基酸顺序的测定是蛋白质化学 研究的基础。自从1953年F.Sanger测定 了胰岛素的一级结构以来,现在已经有 上千种不同蛋白质的一级结构被测定。
荔枝病:荔枝为“南国第一佳果”。但过量进食后易患“低血糖症”, 俗称“荔枝病”。荔枝内含有丰富的果糖,过食后大量果糖来不及经 肝脏转化酶转化成葡萄糖,而积聚在体内,使血液中葡萄糖含量严重 不足。 芒果皮炎:芒果有“热带果王”之称,滋味独特。芒果汁内的特异性 蛋白和蛋白酶引起的即发型接触性皮肤反应。。 波萝过敏症:菠萝有“宴会水果”之称,内含菠萝蛋白酶的作用。这 是一种蛋白水解酶,可使胃肠粘膜通透性增大,使胃肠中异性大分子 蛋白渗透进血液中,而引起胃肠道乃至全身过敏反应。菠萝所含的生 物碱及蛋白酶,能使血凝块消散与抑制血液凝块的形成。对冠状动脉 和脑动脉血管栓塞所引起之病有缓解作用。 柿结石症:含大量柿胶酚、单宁和果胶质。空腹服少量,就会致胃脘 疼痛,消化不良等症,原因为果胶与胃酸凝结成不溶性物质 —— 胃柿 结石。正常人也宜饱餐后食,且忌与螃蟹、山芋和菱角等同食。 樱桃:含过量铁和氢氰甙,故过食后可引起铁中毒,甚至氰化物中毒 而死亡。李时珍在《本草纲目》中有关于过食樱桃致死的记载,以告 诫后人。