分子生物学:第三章染色体和基因组

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兼性异染色质:指在一定的细胞类型或一定的发育阶 段呈现凝集状态的异染色质。
Molecular Biology 2015, ZJNU
核小体(nucleosome): 是染色质的基本结构 单位,由~200 bp DNA和组蛋白八聚体组成。
组蛋白八聚体:各2分子H2A、H2B、H3、H4。 H1在核小体的外面 ,位于DNA进入和离开核小体
的位置。 146bp DNA+组蛋白八聚体——>核心颗粒(core
particle)+H1——>染色小体(chromatosome 166bp)+连接DNA(linker DNA)——>核小体 (200bp)
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基因是可以移动的:
是一些可以在染色体基因组上从一个位置转移到另一 个位置,甚至在不同染色体之间跃迁的DNA成分。有 人将之形象地称为跳跃基因(jumping genes)。
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基因组(genome):
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噬菌体φX174基因组特 点:
DNA为单链环状,含 5386个碱基。
有11个基因,分别从基因 A、B、D开始转录最后。
噬菌体DNA可以以环状分 子(带切刻),和线形分 子(具有两个粘性末端) 两种形式存在。
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虽然DNA的含量大致上反映了物种间的差异,但是对 DNA含量与物种进化的对应性,大部分还不能作出满 意的解释。尤其在真核生物中DNA的含量并不与生物 的复杂性相协调,即在某些情况下,进化程度低的生 物其DNA含量反而比进化程度高的生物高许多倍,这 种现象称为C值佯谬或称为C值矛盾、C值悖理。
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基因分类:按其产物的功能可分为结构基因、调 控基因和RNA基因。
结构基因:可被转录形成mRNA,并进而翻译成多肽, 构成各种蛋白质,催化各种生化反应的酶和激素等;
调控基因:指某些可调节控制结构基因表达的基因。 RNA基因:是一些只转录不翻译的基因,包括核糖体
RNA基因,专门转录rRNA;以及tRNA基因,专门转 录tRNA。
第三章 染色体和基因组
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第一节 染色质与核小体
常染色质(euchromatin):包装密度较低,有 转录活性。
异染色质(heterochromatin):包装密度较高, 一般没有转录活性。
组成型异染色质:在整个细胞周期中都处于凝集状态。 多位于着丝粒、端粒和次缢痕处。
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Байду номын сангаас
基因是重叠的:
不同基因的核苷酸序列有时是可以共用的,即这些基 因的核苷酸序列是彼此重叠的,这样的基因称为重叠 基因(overlapping genes)或嵌套基因(nested genes)。目前已在病毒、噬菌体和少数真核基因中发 现了重叠基因。
是指一个细胞中遗传物质的总量。对于原核细胞,基 因组就是细胞内构成染色体的一个DNA分子;对于真 核生物,基因组是指单倍体细胞内整套染色体所含的 DNA分子。
C值(C value):
基因组中DNA的总量。单位是碱基对(base pair, bp) 或道尔顿。
C值矛盾( C value paradox )
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基因含有内含子和外显子:
基因的编码序列(exon)被 一个或多个不编码的序列 (intron)所隔开,这种基因 叫断裂基因(split gene)。 绝大部分真核生物基因是断裂 基因。
假基因(pseudogene):
是一些核苷酸序列与其相应的 正常功能基因基本相同、但却 不能合成出功能蛋白质的失活 基因,通常积累了较多的突变。 现已在大多数真核生物中发现 了假基因的存在。假基因数量 一般较少。
爪蟾的基因组大小和 人类相似;
两栖类最小的基因组 和最大的基因组之间 相差约100倍
C值矛盾在进化中的 原因和机制尚不清楚
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第三节 原核生物染色体及基因组
大肠杆菌( E.coli )染色体:
E.coli的染色体DNA是一个由4.2X106 bp,双链环状 分子。多种DNA结合蛋白和RNA可使染色体压缩成一 个脚手架(scaffold)结构,分成大约100个小区 (domain)。
原核生物基因组特点:
细菌的染色体基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组 成,形成类核。
除编码rRNA的基因是多拷贝外,在大多数情况下,结 构基因在细菌染色体基因组中都是单拷贝。
不编码的DNA部份所占比例比真核细胞基因组少得多。 除了真核细胞病毒外,基因是连续的,即不含内含子序
列。 病毒基因组具有基因重叠现象。 原核生物基因组具有单个复制起点,为单复制子
核小体中的组蛋白
有H1、H2A、H2B、H3及H4五种。 富含赖氨酸和精氨酸的碱性蛋白,生理pH时带正电。 进化上极具保守性 存在较普遍的修饰作用如乙酰化,甲基化等,影响基
因活性。
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第二节 基因与基因组
基因:目前对基因的认识是,基因是能够表达和 产生基因产物(蛋白质或RNA)的核苷酸序列。 其内容可扩展至包括两侧对基因表达的起始和终 止所必需的调控序列。
类核(nucleoid):染色体DNA聚集在一起,形成较 为致密区域,中间为RNA和蛋白,外围是DNA超螺旋。
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E.coli基因组特点:
多数基因的相对位置是随机分布的。 操纵子(operon):大肠杆菌某些功能上相关的几个
结构基因前后相连,由一个共同的调节基因和一组共 同的控制位点,即启动子(promoter )和操作子 (operator)对其表达过程实行协同调节控制。细菌 基因表达调控的这样一个完整的单元,称为操纵子。
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