人类基因组计划和生物信息学

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生物的基因组学与生物信息学

生物的基因组学与生物信息学

生物的基因组学与生物信息学基因组学和生物信息学是现代生物学领域两个重要的分支。

基因组学研究基因组的组成、结构和功能,而生物信息学则利用计算机、数学和统计学等工具来处理和分析大规模的生物学数据。

1. 基因组学的概念与发展基因组学是研究生物体遗传信息的总和,包括DNA的组成、基因的组织和调控以及基因与基因之间的相互作用。

人类基因组计划的启动标志着基因组学的发展进入了一个新的阶段。

通过对不同生物基因组的研究,基因组学科学家们揭示了生命起源、进化以及生物体的复杂性。

2. 生物信息学的概念与应用生物信息学是一门研究如何存储、检索、分析和应用生物学数据的学科。

随着DNA测序技术的迅速发展,生物学领域产生了大量的数据,如基因序列、蛋白质序列等。

生物信息学通过运用计算机科学和统计学的方法,帮助科学家们更好地理解生物学现象,预测基因的功能和蛋白质的结构,以及挖掘新的生物学知识。

3. 基因组学与生物信息学的关系基因组学和生物信息学密切相关,相互促进,共同推动了生物学领域的发展。

基因组学提供了大量的数据资源,为生物信息学的研究和应用提供了基础。

而生物信息学则通过开发算法和软件工具,对基因组学数据进行处理、分析和解读,从而揭示基因组的结构、功能和演化等重要信息。

4. 基因组学与生物信息学在研究中的应用基因组学和生物信息学在许多领域都有广泛的应用。

例如,通过基因组学和生物信息学的研究,科学家们可以识别与疾病相关的基因,为疾病的早期诊断和治疗提供基础。

同时,基因组学和生物信息学的技术也被应用于农业、畜牧业和环境保护等方面,为提高农作物产量、改良畜禽品种以及保护生物多样性提供了新的途径。

5. 基因组学与生物信息学的挑战与未来发展尽管基因组学和生物信息学在生物学领域的应用取得了巨大的进展,但仍面临许多挑战。

其中包括如何处理和分析大规模的生物学数据、如何挖掘数据中隐藏的信息以及如何整合不同的数据源等。

未来,基因组学和生物信息学的发展方向将更加注重技术的改进和算法的优化,以应对日益增长的数据量和研究需求。

生物信息学期末复习资料(小字)

生物信息学期末复习资料(小字)

生物信息学期末复习资料(小字)名词解释或辨析。

1.生物信息学:生物信息学是包含生物信息的获取、处理、贮存、分发、分析和解释的所有方面的一门学科,它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具进行研究,目的在于了解大量的生物学意义。

2.基因芯片:固定有寡核苷酸、基因组DNA或互补DNA 等的生物芯片。

利用这类芯片与标记的生物样品进行杂交,可对样品的基因表达谱生物信息进行快速定性和定量分析。

3.人类基因组计划:HGP,是一项规模宏大,跨国跨学科的科学探索工程。

其宗旨在于测定组成人类染色体(指单倍体)中所包含的30亿个碱基对组成的核苷酸序列,从而描绘人类基因组图谱,并且辨识其载有的基因及其序列,达到破译人类遗传信息的最终目的。

4.中心法则:分子生物学的基本法则,是1958年由克里克(Crick)提出的遗传信息传递的规律,包括由DNA到DNA的复制,由DNA到RNA的转录和由RNA 到蛋白质的翻译等过程。

20世纪70年代逆转录酶的发现,表明还有由RNA逆转录形成DNA的机制,是对中心法则的补充和丰富。

5.相似性和同源性:相似性(similarity)和同源性(homology)是两个完全不同的概念。

同源序列是指从某一共同祖先经过趋异进化而形成的不同序列。

相似性是指序列比对过程中检测序列和目标序列之间相同碱基或氨基酸残基序列所占比例的大小。

当两条序列同源时,他们的氨基酸或核苷酸序列通常有显著的一致性(identity)。

如果两条系列有一个共同进化的祖先,那么他们是同源的。

这里不存在同源性的程度问题,两条序列要么是同源的要么是不同源的。

1.生物信息学:综合计算机科学、信息技术和数学的理论和方法来研究生物信息的交叉学科。

包括生物学数据的研究、存档、显示、处理和模拟,基因组遗传和物理图谱的处理,核苷酸和氨基酸序列分析,新基因的发现和蛋白质结构的预测等。

2.蛋白质组:指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。

生物信息学与基因组学

生物信息学与基因组学

HGP的意义
诞生了新学科、新领域

生物信息学 比较基因组学(comparative genomics) 以跨物种、跨群体的DNA序列比较为基础,利用模式 生物与人类基因组之间便码顺序和组成、结构上的同 源性,研究物种起源、进化、基因功能演化、差异表 达和定位、克隆人类疾病基因


人类基因组研究方向
基因组学(genomics)作为一门专门学科。它涵盖以下 几个方面: 结构基因组学,主要研究核酸或蛋白质的结构、定位、 功能及其相互作用;与蛋白质组学内容密切相关。 功能基因组学,主要研究基因的表达、调控、功能及 基因间的相互作用; 比较基因组学, 包括对不同进化阶段生物基因组的比 较研究,也包括不同人种、族群和群体基因组的比较研 究。 药物基因组学、疾病基因组学等分支学科也不断发展 起来。
2. 概念:从整体上研究一个物种的所有基因结构和功能的新科 学。
人类基因组计划(HGP)

人类基因组计划的主要目标是测定人类基因组全序列。人 类基因组DNA由四种核苷酸(A、T、C、G)按一定的顺 序排列而成,基因组所含核苷酸总数为30亿对。
4月末 我国科学家按照国际人类基因组计划的部署, 完成 了1%人类基因组的工作框架图。 5月 国际人类基因组计划完成时间再度提前,预计 从原定 的2003年6月提前至2001年6月。 5月8日 由德国和日本等国科学家组成的国际科研 小组宣 布,他们已经基本完成了人体第21对染色体的测 序工作。 6月26日 各国科学家公布了人类基因组工作草图。 2001年 2月15日 公布了人类基因组全序列及其分析结果, 宣告人类有30,000 - 40,000条编码蛋白质的基因, 仅占人类基因 组序列的1%~5%,成人各种组织中又只有约10%的基因表达 为蛋白质。。

人类基因组计划名词解释生物信息学

人类基因组计划名词解释生物信息学

人类基因组计划名词解释生物信息学英文回答:Bioinformatics.Bioinformatics is a field that combines biology, computer science, and information technology. It involves the development and use of computational tools and techniques to manage, analyze, and interpret biological data. Bioinformatics is used in a wide range of research areas, including genomics, proteomics, drug discovery, and disease diagnosis.Key concepts in bioinformatics.Genomics: The study of the structure and function of genomes.Proteomics: The study of the structure and function of proteins.Transcriptomics: The study of the structure and function of transcripts.Metabolomics: The study of the structure and function of metabolites.Bioinformatics databases: Databases that store and manage biological data.Bioinformatics tools: Software tools that are used to analyze and interpret biological data.Applications of bioinformatics.Drug discovery: Bioinformatics is used to identify new drug targets and to design new drugs.Disease diagnosis: Bioinformatics is used to develop new diagnostic tests for diseases.Personalized medicine: Bioinformatics is used todevelop personalized treatment plans for patients.Evolutionary biology: Bioinformatics is used to study the evolution of species.Challenges in bioinformatics.Data explosion: The amount of biological data is growing rapidly, making it difficult to manage and analyze.Data integration: Biological data is often stored in different formats and in different databases, making it difficult to integrate and analyze.Algorithm development: New algorithms are needed to analyze and interpret complex biological data.Despite these challenges, bioinformatics is a rapidly growing field with the potential to revolutionize the way we understand and treat diseases.中文回答:生物信息学。

人类基因组计划的目的

人类基因组计划的目的

人类基因组计划的目的工作目标1. 精确绘制人类基因组的完整图谱人类基因组计划的核心目标是完成对人类基因组的精确绘制,这包括确定人类DNA序列中的约30亿个碱基对,以及识别和解析约20000个基因。

此工作不仅需要高精度的测序技术,还需要生物信息学领域的专家对所获得的大量数据进行整理、分析和解释。

此外,还需要关注基因间的相互作用和调控机制,以揭示人类生物学的奥秘,并为医学研究和疾病治疗提供基础。

2. 探索基因与疾病的关系人类基因组计划的一个重要目标是识别和研究基因与疾病之间的关系。

通过对人类基因组的深入研究,我们可以发现与各种疾病相关的基因变异,从而揭示疾病的发病机制,并为疾病的诊断、治疗和预防提供科学依据。

这有望极大地提高人类的健康水平和生活质量。

3. 促进生物科技的发展人类基因组计划还将促进生物科技的发展。

基因组研究为生物制药、基因治疗、个性化医疗等领域提供了广阔的应用前景。

通过人类基因组计划,我们可以深入了解基因的功能和调控机制,为开发新的药物和治疗方法提供科学依据,推动生物科技的进步。

工作任务1. 基因测序基因测序是实现人类基因组计划的关键步骤。

我们需要开发和应用高精度的基因测序技术,对人类基因组进行全面的测序。

这包括确定DNA序列中的碱基对,以及识别基因的起始和终止位置。

此外,还需要对基因进行表达和调控的分析和研究,以揭示基因的功能和生物过程。

2. 生物信息学分析人类基因组计划产生了大量的数据,需要生物信息学领域的专家进行分析和解释。

这包括对基因序列进行比对和注释,以确定基因的功能和调控机制。

同时,还需要开发和应用统计学方法,对基因表达数据进行分析和挖掘,以揭示基因与疾病的关系,并为医学研究提供指导。

3. 医学研究与应用人类基因组计划的研究成果将在医学领域产生广泛的应用。

我们可以利用基因组信息,开发新的疾病诊断和治疗方法。

例如,通过识别与疾病相关的基因变异,我们可以提前预测个体的疾病风险,从而进行早期干预和治疗。

人类基因组计划与意义

人类基因组计划与意义

人类基因组计划与意义人类基因组计划(Human Genome Project)是人类史上最宏大的科学计划之一,旨在通过对人类基因组的解读,更好地探索人类的生命机制,促进全球健康事业的发展,为人类健康和福祉做出贡献。

一、人类基因组计划的意义人类基因组计划不仅是科学界的一次重大突破,更是人类文明的一次伟大飞跃。

其意义主要可以从以下几个方面来阐述。

1. 探索人类生命机制人类基因组计划是人类了解自身生命机制的一项重要工作。

通过解读人类基因组,人们可以深入了解人类的遗传规律、基因突变和基因信息的传递等方面。

这不仅有助于医学领域的发展,也有助于人们更好地了解自身的特点和潜质。

2. 促进医学发展人类基因组计划的完成,为医学研究提供了重要的基础数据。

例如,人们可以基于人类基因组计划的数据,更精确地了解疾病的遗传性,为疾病的早期诊断和治疗提供科学依据。

同时,人们也可以利用人类基因组的研究成果,研发更为精确和有效的医疗技术和药物,以促进全球健康事业的发展。

3. 探索人类智能机制人类的智能一直是科学家们关注的热点问题之一。

通过人类基因组计划,人们可以更深入地了解人类大脑的结构和功能机制,这有助于人们更好地认识智能和思考的本质,推进人工智能等领域的发展。

4. 推动生物技术的发展基因工程是生物技术中最为重要的领域之一,也是人类基因组计划的重要分支之一。

通过对人类基因组的了解,人们可以发掘出更多的基因序列和特征信息,从而实现对生物体进行改良和优化的目的。

这不仅有助于提高农业、畜牧业的生产效率和质量,也有助于推进医学研究等领域的发展。

二、人类基因组计划的研究方法人类基因组计划是一项长期而复杂的研究工程,其研究方法主要分为以下几个阶段。

1. 基因测序基因测序是对基因组中包含的DNA信息进行解码的过程。

对于人类基因组计划来说,这是一个耗时且复杂的过程,需要运用到许多不同的技术和方法。

2. 基因标记基因标记是指对基因组进行标记以便进一步研究的过程。

生物信息学的新技术与应用

生物信息学的新技术与应用

生物信息学的新技术与应用随着科技的不断进步,生物学领域一直都是科技创新的热点之一。

特别是随着生物信息学的不断发展,生物领域的研究也进入了一个崭新的阶段。

在这篇文章中,我们将就生物信息学的新技术与应用进行深入的探讨。

一、生物信息学的概述生物信息学主要是针对生物学数据的分析和解释,通过利用计算机和其它技术手段,对生物数据进行处理和分析,然后从中获取有用的信息,从而使人们更好地理解和掌握生命科学研究的相关知识。

二、生物信息学的新技术1. 基因编辑技术基因编辑技术是近年来生物信息学领域最为炙手可热的技术。

基因编辑技术的出现,使我们可以对生物的基因DNA进行精度极高的修改,从而能够实现对细胞或生物体的精确操纵。

基因编辑技术除了能够用于治疗人类遗传性与获得性疾病,还可以利用这种技术开发新的药物、保护农作物、巩固环境保护等等。

2. 测序技术测序技术的发展越来越快,导致这个领域研究成果的数量极大地增长了,这对于学术研究以及药物研究的发展带来很大的促进作用。

测序技术主要是指对基因组的测序,从而解析出基因组的组成结构及其功能。

常见的测序技术有Sanger测序、Illumina测序、Ion Torrent测序等等。

3. 蛋白质质谱技术蛋白质质谱技术主要是用来研究蛋白质的功能和特性的。

这种技术通常被用于药物研制方面,以便更好地理解蛋白质与药物之间的相互作用。

蛋白质质谱技术能够将蛋白质分离出来,然后将其与质谱仪一起使用,通过分析蛋白质谱图像,来确定蛋白质的个体差异和化学性质。

三、生物信息学的应用1. 人类基因组计划人类基因组计划是生物信息学最具有代表性的一个应用,该计划启动于1990年,旨在解析出人类基因组的完整质量。

人类基因组计划一方面推动了生物信息学乃至整个医药行业的发展;另一方面,还为生物信息学的后续研究奠定了良好的基础。

2. 肿瘤诊疗除了人类基因组计划外,生物信息学还广泛地应用于医疗行业的肿瘤诊疗中。

通过生物信息学技术与肿瘤学的交叉研究,医生们可以更准确地对肿瘤类型、发病原因和治疗方法进行判断,从而提高肿瘤治疗的效果。

人类基因组计划中的技术进展和成果

人类基因组计划中的技术进展和成果

人类基因组计划中的技术进展和成果21世纪初的基因科学研究迈开了一个重要的里程碑。

在1990年代,美国国家卫生研究院(NIH)和英国人类基因组计划在全球范围内展开了一项名为人类基因组计划(Human Genome Project,HGP)的大规模基因测序计划。

至今,这个计划依旧在持续推进,同时积累越来越多的数据。

在这个过程中,科学家们不断研究并改进着基因组学和生物信息学技术,为癌症、遗传疾病、人类演化等领域带来了前所未有的革命性突破。

一、基因组学和生物信息学的技术进展作为人类基因组计划的核心技术之一,基因组学发展迅速,从最初的手工测序到现在的自动化测序,大大提高了测序速度和准确度。

比如,高通量测序技术可以在极短时间内测序成千上万个DNA片段,使得人们可以更容易地分析基因序列的含义和作用。

而随着技术发展,如今的基因测序能够覆盖整个人类基因组,且数据量越来越大,甚至可以进行全身疾病的基因组学分析。

而生物信息学的技术进展则是在数据分析和挖掘方面发力。

这其中包括了一些基因组数据的分析、处理、可视化、存储和传输等。

这个领域的目标便是发现数据中的模式和相互关系,寻找并全面利用生物大数据的更多价值。

近年来,随着深度学习、人工智能、云计算等技术的发展,生物信息学的研究也拓展到了更加广泛的应用领域。

二、基因组计划带来的革命性成果随着高峰每格测序技术和生物信息学技术的不断发展,基因组计划也在各个领域带来了许多革命性成果。

以下是一些典型的例子:1.阐明了人类基因组的组成和结构。

通过人类基因组计划,科学家们成功地测序了整个人类基因组,并将它分成约30万个部分。

这项工作使得科学家们对基因的功能和组成有了更加清晰的认识。

此外,人类基因组计划还发现了很多嵌合基因(一种包含两个或多个基因的DNA序列),更深入地揭示了人类基因组的基本结构和演化过程。

2.揭示了许多遗传病的病因。

人类基因组计划是揭示遗传病的病因和机制的一个重要途径。

生物信息学的应用及其在科学研究中的贡献

生物信息学的应用及其在科学研究中的贡献

生物信息学的应用及其在科学研究中的贡献生物信息学是生物科学与信息科学交叉融合的产物,它把计算机与生物学结合起来,通过数据分析、信息挖掘等手段,从海量生物数据中探索生物规律和生命现象,为生物医学领域提供了巨大的帮助。

1.基因组学在基因组学领域中,生物信息学的应用尤为广泛。

以人类基因组计划为例,人类基因组计划是人类谱系起源计划的一个重要分支,它的目标是确定人类的基因组序列。

在这个计划中,生物信息学扮演了至关重要的角色。

通过计算机技术,将大量生物数据进行处理和分析,找出基因序列中所含的基因和物种分化的规律,使我们能够更好地理解人类基因组。

同时,通过生物信息学手段可以较为精确地分析基因测序的结果,帮助科学家发现基因变异等信息,更好地了解遗传病的发生机制。

2.药物研发生物信息学在药物研发过程中的应用也越来越受到重视。

利用生物信息学手段,我们可以更加准确地预测药物在人体内的作用机制及药效,加速药物研发过程。

生物信息学的应用使得公司能够大大减少新药开发周期,节省研发费用,这对新药研发企业无疑是一大优势。

3.癌症研究生物信息学在癌症研究中的应用也越来越受到重视。

癌症研究是生物信息学在医学领域应用最为广泛、最具影响力的研究领域之一。

生物信息学技术通过对癌症基因组学和转录组学分析,可以为癌症基础研究和个性化治疗提供重要的信息。

例如,利用生物信息学工具挖掘肿瘤组织中癌基因、肿瘤抑制基因的变异情况以及癌症特异性信号通路等,分析癌细胞的代谢途径,预测化疗药物敏感性等,从而帮助科学家更深入地了解癌症。

此外,通过肿瘤组织中的基因测序和分析,可以为癌症临床治疗提供个性化药物治疗方案,为临床癌症治疗提供更为精细的指导。

4.生物多样性研究生物信息学在生物多样性领域中也有广泛的应用,它可以通过DNA测序,并配合相应的数据分析软件,深入研究种群的构成和遗传变异模型。

同时,生物信息学也可以用来分析物种数量、分布范围、物种在地球上的分布规律等重要信息,为生物多样性研究提供信息和数据。

人类基因组计划中的关键技术

人类基因组计划中的关键技术

人类基因组计划中的关键技术人类基因组计划是一个国际性的科学合作项目,旨在测定和分析人类基因组中所有的DNA序列,以进一步了解人类的遗传信息和基因相关疾病的发病机制。

该计划的启动标志着生命科学和计算机科学领域的一次革命性进步,也为更好地预防和治疗疾病提供了有力的科学依据。

在人类基因组计划中,关键的技术手段主要包括DNA测序、基因分型、生物信息学等方面。

下面我们将从这些角度来分析人类基因组计划中的关键技术。

DNA测序技术DNA测序技术是人类基因组计划中最重要的技术之一。

DNA 测序是指将DNA序列写出来的过程,它在人类基因组计划中的作用是揭示DNA的精确结构,进而找出存在于人类基因中的显性或隐性基因,从而得知人类遗传信息和基因相关疾病的发生机制。

DNA测序技术之所以能够得到广泛的运用,是因为它具备高度可靠和快速测序的优势。

DNA测序技术的发展,从最初的手工测序逐渐发展到高通量测序技术的应用。

手工测序需要手动处理和分析每一条碱基对的试图,可分析的DNA序列长度较短,仅局限于小片段的DNA分析。

而高通量测序技术则不同,它采用机器自动处理DNA序列,有效的提高了测序速度和数据质量,序列长度可大大提高。

目前市场上高通量测序技术主要有Illumina、PacBio、Ion Torrent等。

基因分型技术基因分型是人类基因组计划中的另一个重要技术手段。

基因分型是指对百余种基因突变体进行检测和鉴定的技术,其目的是寻找出恶性肿瘤、遗传性疾病的表达标志物、分子靶点等。

基因分型技术对了解生殖健康、肿瘤、心血管等疾病的发生有着重要的作用。

基因分型技术的监测方式也有所不同,常见的有聚合酶链反应技术、基因检测技术等。

聚合酶链反应技术是一种常用的DNA扩增技术,通过反复进行核酸链扩增,将微量核酸样品扩增至足够多的数量,以便进行检测和分析。

基因检测技术则是一种利用特异性引物和荧光探针进行PCR扩增和检测、分析目标基因的技术。

评估遗传因素对药物反应的影响、增强药物副作用的预测能力等都是基因分型技术在临床医学中重要的应用。

人类基因组计划名词解释生物信息学

人类基因组计划名词解释生物信息学

英文回答:Bioinformatics, an interdisciplinary field that integrates biology andputer science, is dedicated to the interpretation and analysis ofplex biological data, specifically those associated with DNA, RNA, and protein sequences. This area of study employsputational techniques to effectively store, organize, and analyze extensive sets of biological data, such as genomic sequences, in order to extract meaningful insights and valuable information. Bioinformatics plays a crucial role in various domains of biological research, including genomic analysis, evolutionary biology, drug discovery, and personalized medicine. With the rapid advancement of high-throughput sequencing technologies, which generate copious amounts of biological data necessitating sophisticatedputational tools for analysis and interpretation, the importance of bioinformaticshas greatly escalated.生物信息学是一个跨学科领域,融合了生物学和截肢科学,致力于解释和分析复杂生物数据,特别是与DNA,RNA,蛋白质序列相关的数据。

人类遗传资源的研究及其生物信息学分析

人类遗传资源的研究及其生物信息学分析

人类遗传资源的研究及其生物信息学分析随着人类基因组计划的完成以及DNA测序技术的发展,人类遗传资源的研究已经进入了一个新的时代。

人类遗传资源是指人类体内所包含的遗传信息,包括DNA序列、基因、基因表达调控等。

人类遗传资源的研究对于人类健康、遗传病的诊断、治疗、基因编辑等方面有着重要的应用价值。

一、人类基因组计划及其进展人类基因组计划(Human Genome Project,HGP)是一个国际性的科学计划,旨在解析人类基因组的所有基因。

该计划于1990年启动,历时13年,于2003年6月完工。

该计划的完成标志着人类基因组的所有基因序列都已被解析出来,这对于生物医学研究和保健有着重要的意义。

人类基因组计划不仅是现代科学的杰作,更是一个伟大的无私奉献精神的象征。

人类基因组计划的进展为遗传资源研究和生物医学研究提供了一个基础。

它已经使得科学家们能够更深入地了解人类的基因组结构和功能。

同时,这个项目的完成以及与它相关的技术已经推动了高通量测序和生物信息学的发展,为基因组学和生物信息学提供了更广阔的前景。

二、人类遗传资源的研究方法现代科学技术的发展,使得我们能够更好的研究人类的遗传学信息,从而为预防和治疗遗传疾病提供更多的信息。

(一) DNA测序技术随着DNA测序技术的发展,拥有大规模的DNA测序数据也成为了研究人类遗传资源一个重要的来源。

(一定程度上揭示了人类疾病的发生机制)。

(二)人类遗传资源库人类遗传资源库是一个综合性的数据库,收录了人类各种遗传信息,包括单基因遗传病、复杂遗传疾病、常见遗传变异、个体基因表达等,并且对这些数据进行了分类和统计。

(三)生物信息学技术生物信息学技术则是基于计算机科学和信息学技术的新兴科学技术领域,最近的发展已经大大改善了人们对人类遗传资源的理解。

三、基因组数据分析和功能研究利用大量的基因组数据,结合生物信息学的工具,生物学家们可以研究不同基因的互动、基因与表型之间的关联情况以及基因突变和表达的机制。

人类基因组计划主要研究内容

人类基因组计划主要研究内容

人类基因组计划主要研究内容人类基因组计划(Human Genome Project,HGP)是一个国际性的研究项目,旨在解析人类的基因组结构和功能,从而深入了解人类的遗传信息,推动遗传学和生物医学的发展。

该计划自1990年启动以来,经历了15年的时间,于2003年完成了基本任务。

人类基因组计划的主要研究内容包括以下几个方面。

1. 基因组测序:人类基因组计划的最主要任务是对人类的基因组进行测序,即确定所有基因的顺序和位置。

这个过程中,研究人员采用了高通量测序技术,通过大规模的测序实验,将人类基因组分为许多小片段,并逐一确定其序列。

最终,通过将这些小片段按照顺序组装在一起,得到了人类基因组的完整序列。

2. 基因功能研究:除了测序,人类基因组计划还致力于研究基因的功能。

通过对人类基因组的测序结果进行分析和比对,研究人员可以确定每个基因的编码蛋白质的序列,进而了解这些蛋白质在细胞和生物体内的功能。

此外,还可以通过研究基因的表达模式和调控机制,深入了解基因的功能和调控网络。

3. 基因与疾病关联研究:人类基因组计划还着重研究了基因与疾病之间的关联。

通过比对大量的基因组数据和临床数据,研究人员可以发现一些与疾病相关的基因变异和突变,从而揭示疾病的遗传基础。

这对于疾病的早期诊断、治疗和预防具有重要的意义,为个性化医学的发展提供了基础。

4. 生物信息学研究:人类基因组计划的成功离不开生物信息学的支持。

生物信息学是一门研究生物数据处理和分析的学科,它通过开发各种算法和软件工具,帮助研究人员处理和解释大规模基因组数据。

在人类基因组计划中,生物信息学发挥了重要的作用,对基因组测序数据进行分析和解读,为研究提供了重要的支持。

5. 伦理与社会问题研究:人类基因组计划的开展不仅涉及科学技术层面,还涉及到伦理和社会问题。

在研究过程中,人类基因组计划关注基因测序和基因信息的使用、保护和隐私等问题,致力于制定相关的伦理准则和法律法规,保障研究的合法性和道德性。

人类基因组计划与生物信息学

人类基因组计划与生物信息学

人类基因组计划与生物信息学生物信息学是研究生物信息的一门学科,它是生物学、计算机科学、数学、统计学和物理学等一系列学科的交叉领域。

生物信息学的出现,对人类了解生命的本质和基本规律具有重要的意义。

而人类基因组计划是推动生物信息学发展的一项划时代的计划,本文将探讨它们之间的关系以及它们所给人类带来的重大意义。

一、人类基因组计划的概述人类基因组计划(HGP)是人类历史上规模最大、最具里程碑意义的科学计划之一,它的目标是揭示人类基因组的完整信息,包括基因的种类、数量以及基因在DNA序列上的位置等。

这项计划的启动始于1990年,历时13年,耗资27亿美元,于2003年6月正式完成了对人类基因组的测序,标志着人类在基因研究领域迈出了重要的步伐。

在揭示了人类基因组的完整序列后,HGP在人类的基因研究领域起到了导航和引领的作用,成为人类基因研究的重要基础。

二、生物信息学的发展历程生物信息学的发展始于20世纪70年代,当时的关键是以计算机为基础构建基于数据库的生物信息库,这些信息库主要用来存储和共享科学家们收集的海量生物信息数据,从而便于精准地进行生物信息学的研究和运用。

到了80年代,生物信息学逐渐发展成为一个多学科交叉的研究领域。

1990年,生物信息学正式成为一门学科,标志着它成为了独立的研究领域。

随着基因测序技术的不断发展,生物信息学的研究方向也不断拓展和深入,从基因的序列分析、基因表达和蛋白质结构预测等方面发展到分子进化、生物网络分析、系统生物学和生物信息学的核心数据库等多个领域。

生物信息学在研究生物学领域中的复杂问题、解决生物资源开发与利用问题等方面具有深远意义。

三、人类基因组计划与生物信息学的关系人类基因组计划涉及的是人类基因的序列信息,生物信息学是将生物学中的大量数据转化为数字信息并进行处理的学科。

这两者之间存在着紧密的联系和互动,相互作用,人类基因组计划的成功不仅需要基因测序的技术进步,还需要生物信息学中数据库的完善、高效的信息处理和数学算法等技术的支持。

生物信息学与基因组学的联系与区别

生物信息学与基因组学的联系与区别

生物信息学与基因组学的联系与区别随着科技的不断进步,生物学已经变得愈发复杂。

而人类的基因组则是研究生物学的主要领域之一。

生物信息学和基因组学的出现,使我们更好地研究和理解基因组数据。

尽管他们之间存在很多相似点,但也有很多的不同。

本文将探讨这两个领域的联系和区别。

生物信息学和基因组学的定义生物信息学这个术语最早出现在1993年,它是一门交叉学科,包括计算机科学、数学和统计学,并应用在生物学领域。

其基本目标是帮助人们更深入地理解生物学数据,并在现代技术中积极应用这些数据。

基因组学是一种生物学分支学科,是一个研究某个组织或单个生物体在某种程度上的遗传信息的科学。

基因组学通常涉及到DNA序列和RNA序列的研究,以及其在细胞中的表达和调控。

联系两者的联系可以从不同的角度来看。

1.数据分析方法和技术优秀的生物信息学技术是进行基因组研究的重要组成部分。

这些技术通常包括DNA测序、分析、元基因组学分析、氨基酸序列分析和分子建模、数据集成和整合技术,以及图像处理和模式识别等。

这些基础技术完成后,研究人员就可以使用不同的算法和软件来研究数据。

生物信息学中的数据分析方法对实验结果的正确性和有效性至关重要。

2.数据交流生物信息学提供了基因组数据的共享和交流平台。

公共数据库在这方面起着重要的作用。

例如,NCBI数据库将计算机中的生物数据存储在一个中央位置,供研究人员和医学专业人员访问和使用。

这种数据的共享和传播也更利于基因组学研究发现。

3.挖掘生物信息在基因组研究过程中积累了庞大的数据量,处于这些数据中寻找新的知识成为一个重要的研究方向。

生物信息学技术可以发现的新领域包括基因寻找,基因表达、组装和注释,并提供一种方法来分析相关表型。

区别两者之间存在差异。

主要有以下几点。

1.研究对象的不同生物信息学侧重于研究数据分析和构建算法,旨在促进对生命现象的理解。

同时,基因组学主要基于生命科学,研究疾病的遗传根源和基因序列的组成,以及表达和调控。

基因组学和生物信息学的联系

基因组学和生物信息学的联系

基因组学和生物信息学的联系随着科技的不断发展,人类对于生命科学的探究也越来越深入。

基因组学和生物信息学是生命科学中的两个重要分支,它们之间有着紧密的联系。

基因组学是一门研究基因组结构、特征、功能及其相互作用的学科。

基因组是指生物体内所有基因的集合,是遗传信息的载体。

而生物信息学是一门研究生物学信息的获取、存储、处理和分析的学科。

生物信息学主要涉及到DNA序列、蛋白质序列、基因表达等方面的信息。

基因组学和生物信息学之间的联系主要体现在以下几个方面:一、基因组学数据处理和分析在基因组学的研究中,大量的数据需要进行处理和分析。

这些数据涉及到序列分析、基因功能分析、基因表达等方面。

因此,生物信息学成为了基因组学研究的重要支撑,生物信息学的技术也被广泛地应用于基因组学领域。

比如,序列对齐、蛋白质预测、基因注释等生物信息学的分析工具,已成为基因组学研究不可或缺的组成部分。

同时,在大规模基因组学数据中,也需要通过生物信息学的分析方法来完成数据挖掘和提炼,从而发现新的基因、基因表达特征和基因调节网络。

二、基因组学研究的进一步深化通过基因组学技术的发展,可以对生物基因组进行大规模测序。

以人类基因组计划为例,这个计划将大规模的人类基因组序列进行测序、注释和分析。

但是,单纯的基因组测序并不能完全解读基因信息,需要依赖于生物信息学技术的支持来对这些基因进行解码和分析。

生物信息学的技术应用,可以帮助研究人员更好地解析基因组信息。

通过对基因组数据进行深度分析,研究人员可以发现基因之间的相互关系,并确定不同基因的功能和作用。

同时,生物信息学的支持也使得研究人员能够对基因的DNA序列、蛋白质结构、基因功能等进行更加深入的理解。

三、基因组学与生物信息学的联合应用生物信息学和基因组学之间的联系不仅限于数据分析和信息解读,同时它们更多地是相互依存和互补的关系。

基因组数据的产生、获取和处理需要大量生物信息学技术的支持,而生物信息学的关键方法和技术性知识贡献的结果对基因组研究的推进也至关重要。

人类基因组计划与分子生物学的发展

人类基因组计划与分子生物学的发展

人类基因组计划与分子生物学的发展人类基因组计划(Human Genome Project,HGP)是一个旨在阐明人类基因组的国际科学研究计划。

自从计划的启动以来,人类基因组计划对于分子生物学领域的发展产生了深远的影响。

本文将探讨人类基因组计划对分子生物学的影响,并介绍一些与计划相关的重要成果和突破。

1. 人类基因组计划的背景人类基因组计划的启动可以追溯到上世纪80年代。

为了更好地了解人类基因组的结构、功能和相互作用,国际科学界达成了一致,决定对人类基因组进行全面测序。

这一计划的目标是建立一个完整的人类基因组图谱,以促进对基因的研究和相关疾病的诊断、预防和治疗。

2. 人类基因组计划的意义人类基因组计划对分子生物学领域的发展具有深远的意义。

首先,该计划的开展使得研究者们可以全面了解人类基因组的组成和结构。

这对于研究基因如何编码信息、如何参与细胞过程以及如何影响健康与疾病具有重要意义。

其次,人类基因组计划的推进推动了基因组学技术的快速发展。

高通量测序技术的引入使得全基因组测序的成本大大降低,加速了基因的鉴定和研究速度。

这对于基因与疾病的关联研究以及个体化医学的发展起到了关键作用。

此外,人类基因组计划也促进了大数据时代的到来。

人类基因组的测序产生了海量的数据,对数据存储和管理提出了巨大的挑战。

这催生了生物信息学的发展,为基因组学研究提供了强大的数据分析和挖掘工具。

3. 人类基因组计划的重要成果和突破人类基因组计划的推进取得了一系列的重大成果和突破。

最重要的是,2001年,人类基因组计划成功完成了对人类基因组的测序,确定了人类基因组中大约30,000个基因的位置和功能。

此外,人类基因组计划还推动了一系列基因相关疾病的研究。

通过对基因组的研究,科学家们发现了多个与疾病相关的基因和突变。

这为疾病的早期诊断、治疗和风险评估提供了重要的依据。

此外,人类基因组计划还促进了分子生物学技术的发展。

例如,高通量测序技术的广泛应用使得个体基因组的测序成为可能,为个体化医学的发展奠定了基础。

人类基因组计划的意义和主要成果

人类基因组计划的意义和主要成果

人类基因组计划的意义和主要成果人类基因组计划(HGP)是一项历史性的科学工程,旨在对人类基因组进行测序和解析,并结合生物信息学和其他相关技术,探究人类遗传密码的奥秘。

该计划在20世纪90年代初期启动,历时15年之久,耗资数十亿美元。

该计划的完成标志着人类基因组学的飞跃发展,对人类健康、医学、生命科学、环境保护等领域带来了革命性的影响。

一、人类基因组计划的意义人类基因组是指人体内全部的基因,即人类遗传信息的总和。

人类基因组计划的完成,使得科学家们可以对全部或大部分人类基因进行测序和分析。

这对于人类健康有着巨大的意义。

首先,基因组测序可以促进人类疾病的预防和治疗。

通过对基因组的研究,科学家们可以了解人类基因与疾病之间的关系。

例如,基因组测序可以让科学家们了解某些基因和遗传疾病之间的关系,从而找出引起疾病的基因,有助于疾病的早期预测和预防。

在治疗方面,基因组测序也可以帮助科学家们开发出更为精准的药物,例如利用基因组测序开发个性化医疗,在选用药物上更具针对性,从而减轻患者的痛苦和降低医疗成本。

其次,人类基因组计划的完成,对人类进化和人类历史的研究也有着重要的意义。

人类基因组可以刻画人类的起源和发展,了解远古人类和现代人类之间的基因关系,给人类历史研究提供新的手段和视角。

二、人类基因组计划的主要成果人类基因组计划的主要成果包括两个方面,即人类基因组的测序和生物信息学的发展。

一方面,人类基因组测序是人类基因组计划最核心的成就之一。

HGP完成了99%以上的人类基因序列测序,发现人类基因组中大约含有2.9亿个碱基对,约包含2万-2.5万个基因,其中包括编码基因和非编码基因。

此外,人类基因组计划不仅测序了人类基因组,还测序了一些其他生物的基因组,例如小鼠、果蝇、酵母等。

另一方面,人类基因组计划也推动了生物信息学的发展。

该计划使得生物信息学成为了与基因研究同等重要的领域,为生物学、医学、生物技术等领域的研究提供了强有力的工具和方法。

人类基因组计划与生物信息学的发展

人类基因组计划与生物信息学的发展

人类基因组计划与生物信息学的发展2003年,人类基因组计划宣告完成,这标志着我们对基因的了解和掌握进入了一个新的时代。

在这场计划的背后,是近四十年来世界各地的科学家们不断前行的努力,其中生物信息学的发展功不可没。

一、人类基因组计划人类基因组计划于1985年正式启动,其目标是解码人类基因组,即确定人类DNA中的每一个碱基的位置和序列。

这个目标的意义在于,基因组的解码使得我们可以深入了解基因的构成和功能,为人类健康和疾病治疗提供更深入的科学基础。

人类基因组计划的实施需要庞大的研究团队和超级计算机的支持,时间跨度长达18年,耗费了数十亿美元。

在计划的最后阶段,研究团队成功解决了整个人类基因组的序列,这项成就被誉为20世纪科学史上最重要的突破之一。

值得注意的是,这个计划也启发了对其他动植物基因组的研究,为加深我们对生命的认知提供了基础。

二、生物信息学人类基因组计划的成功实施,离不开生物信息学在其中的贡献。

生物信息学是一个涉及计算机、统计学和生物学等多个领域的综合性学科,其研究目标是利用计算机和相关技术处理、分析和应用生物学数据。

在人类基因组计划中,生物信息学广泛应用于基因组序列的分析、比对和注释等领域。

研究团队通过对基因组序列的处理和分析,揭示了人类基因组中的基因数量、组成结构以及各个基因的位置和功能等。

这种重要的生信技术,不仅在人类基因组计划中得到了广泛的应用,而且十分受到生物学家的关注。

而珂学(Omics)技术的发展,让生物信息学的应用领域又有了新的扩展。

比如蛋白质组学、转录组学、代谢组学等,这些技术让我们能够更全面深入地探究生命的奥秘。

三、基因组计划与生物信息学的未来人类基因组计划和生物信息学的成功,推动了人们对基因和生命科学的探究和发展。

随着时间的推移和科学技术的进步,基因组计划和生物信息学的未来也将更加广阔。

一方面,基因组计划和生物信息学的成功逐渐推动人们开展更广泛深入的生命科学研究。

不仅是基因组水平的研究,而且还涉及到分子水平、细胞水平、组织学水平等多个层面,从而更好地揭示生命本质。

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人类基因组计划和生物信息学徐新来 安道昌 王 芷3 李 青 付红波(中国生物工程中心 北京100081)(3中国科技信息研究所 北京100038)提要:介绍人类基因组计划和生物信息学,阐述了两者的关系,提出了在人类基因组计划中发展生物信息学的策略。

一、引 言人类基因组计划(H um an Genom e P ro 2ject ,H GP )是美国在1990年提出实施的一项大科学计划,在世界各国引起了很大反响。

计划的提出旨在对人类基因组3×109个脱氧核苷酸对进行作图和测序,进而解读和破译生老病死以及语言、记忆和疾病发生的遗传信息。

而生物信息学是集生物学、数学、信息学、计算机科学一体化的一门新的学科。

早在H GP 提出时就预示到生物信息学的重要性,当时就成立了有42位著名专家组成的生物信息学任务组。

随着人类基因组计划的进展,基因组的数据和信息大量,迅速地增加,信息的收集、储存、分发、分析的管理越来越显得紧迫和重要。

利用数学模式和计算机处理数据的功能来处理和分析大量增加的人类基因组信息的结果,使人类基因组计划和生物信息学紧紧地结合起来了,而且随着两者的紧密结合和互相渗透,人类基因组计划的前进步伐会大大加快,从而提前完成计划,为人类造福。

二、从人类基因组计划看生物信息学 美国在1990年率先提出H GP ,计划用15年时间,投入30亿美元,完成人类全部24条染色体的3×109脱氧核苷酸对(bp )的序列测定,主要任务包括作图(遗传图谱、物理图谱的建立)、测序和基因识别。

其中还包括模式生物(如大肠杆菌、酵母、线虫、小鼠等)基因组的作图和测序,以及信息系统的建立。

遗传图谱、物理图谱的建立是测序的必要条件;遗传图谱是根据遗传连锁标志之间的重组频率来确定它们的距离,遗传图谱的建立为基因识别和完成基因定位创造了条件。

物理图谱是以核苷酸的长度为单位绘制而成,详细描述染色体上界标间的距离,主要是编码蛋白质的外显子和排序DNA 克隆库组成,这些DNA 分子克隆库相互交错、重叠。

人类基因组全部DNA 序列的测定是H GP 的核心部分;随着遗传和物理图谱的完成和即将完成,测序就成为今后重中之重的工作。

而大规模测序技术的改进及分析大片段DNA 序列的生物信息技术的进步,对完成人类基因组全部核苷酸顺序测定起着决定性作用。

测序的完成依赖物理图谱上的排序的DNA 片段分子克隆,这些分子图谱通常是在较短的时间由一个研究组从单一分离群体中获得的,为了充分利用所有资料信息,要对其全部标记的同时进行分析,这种分析涉及十分庞杂和巨大的计算,手工无法完成。

基因识别是H GP 的重要内容之一;目的是要识别全部人类的基因,即基因组在生命活动中发生转录表达的DNA 片段,并对其结构进行研究。

目前常采用的有二种方法:一是从基因组顺序中识别那些转录表达的DNA 片段;二是从c D 2NA 文库中挑取并克隆。

两种方法都必须依靠生物信息学的帮助即信息系统的建立;前者需要对基因组进行分析,后者要对基因文库进行分析,甚至还要进行分类分型,建立二级库,才能有效地挑取到所需要的DNA 分子克隆。

模式生物基因组在H GP 中占有重要的位置;模—06—高技术通讯 1998181式生物基因组结构相对比较简单、单位DNA 片段上基因的密度高,易于基因的识别。

从进化角度讲,动物的许多基因有很大的同源性,对模式生物基因的分析有助于人类基因的结构与功能的阐明。

在这种背景下生物信息学的重要性便在基因组计划提出后真正显示出来了。

H GP的提出和实施,实验的数据和信息急剧大量的增加,信息的管理和分析成为一项重要的研究内容。

生物信息学以基因组信息学为核心,主要任务是收集、储存、分发基因组的数据和信息,管理和分析、处理基因组及相关的蛋白质、m RNA 的信息,根据基因组数据和信息的比较分析,发现新的基因,并对基因结构和功能进行研究。

信息的收集、储存、分发、分析是基因组计划最初提出时确定的任务,计划实施后,每天都有上万的数据,数据的取舍非常重要,数据的标准化和检验成为信息处理的第一步工作。

同时,数据必须能提供给广大的科研工作者使用,计算机管理要提供一个工作界面,才能有效地利用信息。

另外,这些数据还应可视化,方便用户使用。

生物信息学的研究更重要的作用是将原始的信息库进行分析、分类,按照需要建立具有特殊功能的二级数据库。

二级数据库是进一步研究开发基因组的重要手段,通常是封闭的,不对外开放,仅供内部使用。

随着基因组研究的发展,向功能基因组研究转化,解读生物的遗传密码成为生物信息学的又一项重要的任务。

生物信息学另一项重要任务是分析工具的研究开发,如序列相似性比较的软件。

分析软件是有效利用基因组信息的有利工具,同时分析软件也是构建二级、三级数据库的条件和手段。

分析软件还可将不同性质的数据库结合一起,如将基因组序列数据和蛋白质数据结合计算,可以推断结构和功能的关系,从而成为一种发现新基因的较为快捷的方法,有利解读全部生物遗传密码。

生物信息学发展很快,各种数据库不断涌现,数据库各有不同的特色。

美国、日本、欧盟、加拿大等国都有基因组数据库,有的是国际性的,有的是本国的,有的公开,有的不公开。

其中比较有代表性的数据库有:美国的GenB ank,欧盟的E M BL,日本的DDBJ和美国的N CB I等。

数据库的内容十分丰富,有表达序列标记数据库(dbEST),有序列标记位点数据库(dbST S),有蛋白质序列数据库、蛋白质序列功能位点数据库、还有基因图谱数据库、结构数据库等等。

各数据库的容量也在不断扩大,根据GenB ank1997年11月统计,该库已有100多万条人类核酸序列记录,近5万条蛋白质记录。

三、生物信息学发展现状 随着信息学大环境的改善,如信息高速公路、国际互联网的发展,生物信息学发展迅速。

美国、日本及欧洲各国的生物信息学已相继在In ternet上建立了各自的网络节点,进行管理大型数据库,为研究人员提供研究数据的分析、处理、采集、交换的服务。

国际互联网所到之处,都有各种研究机构的联网、数据库的建立,开展生物信息学研究。

各种数据库各具特色: GenB ank、E M BL、DDBJ是三大核苷酸 蛋白质数据库;GDB数据库主要收集遗传学制图的资料;CEPH的数据库收集YA C con tig; Genethon、CHL C储存遗传学标记系列; W h iethead研究所的数据库可了解全部18000个ST S及联系作图的信息;另外还有突变序列的数据库在建立之中。

在各类数据库建立的同时,数据库设计中出现了集成化趋势,集成化包括:各类数据的集成、数据库与数据分析软件的整合。

各种数据库分析、测序应用软件包也被开发出来。

除了数据库、数据分析软件的发展,生物信息学中比较基因组学的发展也较为突出。

其中河豚、鼠、猪、牛和马的基因组与人基因组的比较研究,秀丽隐杆线虫与人基因组的比较研究、酵母与人基因组的比较研究,支原体与嗜血流感杆菌基因组的比较研究,都取得了成果,从比较中分离到一些人类遗传病的候选基—16—高技术通讯 1998181因,鉴定了一些新克隆的基因,为人类基因组的分析提供了有益的数据。

随着计算机技术的发展和渗透,生物信息学在人类基因组中大规模测序的自动化控制、测序结果分析处理、序列数据的计算机管理、各类遗传图谱、物理图谱的绘制、研究数据的网络获取、分析和交换,以数据分析的结果辅助基因组研究等都发挥着不可替代的功能,显示出越来越重要的作用。

四、我们的策略 人类基因组计划和生物信息学是当今生命科学重要的课题,为全世界所关注。

由于其重大的科学意义和潜在的经济价值,积极开展有关的研究势在必行。

人类基因组计划启动时,生物信息学技术就已成为发展的重点之一,目前有关基因序列、图谱的数据信息的大量积累,使生物信息学研究在人类基因组研究中的重要性越来越突出,在今后的人类基因研究中,生物信息学是一个信息库,一种高层次研究的工具。

如果生物信息学研究发展滞后,将意味着失去信息,失去高层次、高水平研究的基础。

中国1993年开始参与H GP 研究,但由于资金技术等各种原因,其研究水平与国际同行尚有较大差距。

我国虽然早在1993年中国人类基因组计划中列入了生物信息学的内容,但真正起步可能是在1995—1996年,基础比较弱,尚处于引进国外已有数据库,为国内研究人员提供服务的阶段。

中国的人类基因组研究和生物信息学都处于一个不容乐观的现状。

如何在现有的资金、技术条件下,找到1个或2个突破口,改变落后现状,在国际同类研究领域争得一席之地,我们认为应该在策略上作些调整。

11在人类基因组研究上,找功能基因。

利用我国丰富的遗传资源和广泛的疾病谱系,从“c DNA ”入手,尽快地克隆一批新基因。

“c DNA ”又称互补DNA ,只占整个基因组DNA 很小的一部分,是编码蛋白质的,即功能基因,结合大家系和疾病谱系,才可以完成,我国在这方面具有利条件。

基因组测序是一件知识劳动密集性工作,只要我们引进技术和设备,培训一支高水平的技术队伍,利用我们的优势,就能够抢到一部分新基因。

21在引进国外数据库的同时,建立中国人基因资源数据库。

生物信息学对推进基因组的工作十分重要,充分利用国际基因信息库的信息,建立国际合作关系,在基因组研究工作的基础上,组建自己的生物信息网络,建设基因资源、基因结构的数据库。

同时,进行分析软件的开发研究,构建特殊需要的二级、三级数据库,从已知的c DNA 文库中,进行测序和功能推测研究,发现新基因,才有可能在国际人类基因组计划中占有一席之地。

31人才培养。

当务之急是对现有从事基因研究的科技人员进行生物信息学的培训。

只有有了中国自己的一支专门从事生物信息学研究的科研队伍,才能在中国人类基因组研究中做出国际领先水平的工作。

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