转座子
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正向重复序列:3~9bp,位于反向重复序列 外侧,为插入序列所特有
二、转座子(transposons,Tn) 1、复杂转座子
反向重复序列 组成 转座酶基因
特殊基因:如抗生素抗性基因等
转座酶基因
特殊基因
2、复合转座子
IS 组成
抗药性基因
IS
抗药性基因
IS(IS’)
三、接合型转座子
1、不具有反向重复序列 2、转座时不引起靶DNA上正向重复序列产生 3、通过“切除-插入”机制转座
列保持不变; • 在靶序列上造成同向重复序列; • 产生新的变异,有利于进化。
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五、基因重组 在转化、转导或转座过程中,整段
DNA在细胞内、细胞间或不同物种间 进行转移,并发生DNA分子间的共价 连接,简称重组(recombination)。
(一)位点特异的重组 由整合酶催化,在两个DNA序列的
二、原核生物转座因子:
原核生物转座因子的类型: 插入序列;转座子;转座噬菌体
1. 插入序列(IS,inserted sequence):
简单的转座因子,携带有转座酶基因,两端有反向重复 序列. eg. E.coli中的IS1……IS11等。 发现:E.coli中一种突变体:
A. 不能通过核酸置换回复——非点突变; B. 可自然回复——不是缺失; C. 突变比野生型密度梯度大——增加一段DNA; D. 变性单链电镜下出现颈环结构——反向重复序列。
携带有tnpA、tnpB基因,末端有E.coli DNA, 近邻类似IS序列,具有高频的转座作用。
三 真核生物转座因子:
1. 酵母、果蝇、玉米中的转座子(略)
四、 转座机制和遗传学效应
1. 转座的机制:
(197以9年细S菌ha中rpi转ro座提子出T) n:3为例,说明转座的一般过程
A. 切开: 转座酶识别受体的靶序列,在两条单链上均 切开,形成粘性末端;识别自身的反向重复序列, 在3‘端切开。
B. 连接:供体和受体结合形成不完整共联体,留下缺口。
C. 复制:DNA聚合酶补齐缺口,再连接形成完整的共联 体,具有重复序列。
D. 重组:在特定位点进行重组,共联体分离:留下原来 的转座子;并在靶序列上插入转座子,两端有同向 重复序列。
2. 转座子的遗传学效应
• 可引起基因突变——插入或切离; • 改变染色质的结构(缺失、倒位等); • 可以插入新基因(ampR、terR等); • 在靶序列上引入新的转座子序列,原来序
一、转座因子的遗传效应 1、插入突变 2、DNA重排 3、极性效应 二、转座子的应用 1、随机诱变 2、定位诱变
第四节 酵母中的转座子(Ty)
一、Ty因子的分子结构和转录
1.Ty因子的分子结构
Ty1 LTR
TyA(gag)
PR
TyB(pol)
IN
RT
RH LTR
Ty2 LTR
TyA
Ty3 LTR
四、转座噬菌体
1、可插入到宿主染色体的任何一个位点上 2、不是细菌基因组的正常组分,易于识别 3、可诱导产生 4、不含反向重复序列,含寄主DNA片段
五、转座Baidu Nhomakorabea的插入机制和转座模型
1.插入机制
2.转座模型 (1)剪-贴型转座
(2)保守性转座
(3)复制型转座
共整合体
第二节 细菌转座因子的遗传效应和应用
第十章 微生物中的转座因子
转座(transposition) 转座因子:细胞中能改变自身座位的一段 DNA序列,可以从复制子的一个座位跳跃 到另一个座位,包括插入序列和转座子。 转座:由插入序列和转座子介导的基因移 位或重排的过程称为转座。
转座因子的共同特征
1.插入寄主DNA后,导致基因失活; 2.插入时在靶DNA位点产生一个短的正向
一、转座因子(转座元)
• 转座因子:能够在染色质或质粒上转移 座位的 DNA功能单位(transposable element)。
• 特点: 1.自身携带有转座酶基因,末端有反向重复序 列; 2.转座过程中出现共联体; 3.转座以后,原来的转座子依然保持在原位,而 在靶序列上复制了一个转座子; 4.转座完成以后可以在靶序列上造成同向重复序 列.
特异位点间发生的整合。 例如:噬菌体的整合酶识别噬菌体
DNA 和宿主染色体的特异靶位点,而 后发生的选择性整合。
(二)同源重组 发生在同源序列间的重组。同源
重组不依赖特异DNA序列,而依赖 同源性。
同源重组需要一些重组蛋白和酶。 如Rec A、B、C、D及DNA连接酶等。
Holliday 中间体
重复序列。
转座因子的分类
1.DNA转座子; 2.反转录转座子。
第一节 细菌转座因子的 类型和结构
一、插入序列(IS) 二、转座子 三、接合型转座子 四、转座噬菌体
一、插入序列 插入序列(IS):750 ~ 2500bp 组成: 反向重复序列:10~40bp,位于两侧 转座酶编码基因:产物引起转座,位于中间
2. 转座子(Tn, transposon):
携带有转座酶基因及抗性基因或其它基因, 两端有相同的序列(IS)。 eg.酵母(Yeast)中的Tn1、 Tn2 ……Tn9等 Tn3:携带有tnpA、ampR、tnpR等基因,两端分别 有36bp的IR; Tn9:末端是两个IS1
3. 转座噬菌体( mutator phage)
TyA
NA
TyB
PR
IN
RT
TyB
RH LTR
PR
RT
RH
IN
LTR
Ty4 LTR
TyA
NA
TyB
PR
IN
RT
RH
LTR
TyA-TyB
Ty5 LTR
NA PR
IN
RT
RH
LTR
三、Ty因子的转座机制
反转座子:DNA RNA
四、Ty因子的转座机制 1.插入失活 2.增强效应 3.DNA重排
DNA
第五节 转座因子及其遗传学效应
二、转座子(transposons,Tn) 1、复杂转座子
反向重复序列 组成 转座酶基因
特殊基因:如抗生素抗性基因等
转座酶基因
特殊基因
2、复合转座子
IS 组成
抗药性基因
IS
抗药性基因
IS(IS’)
三、接合型转座子
1、不具有反向重复序列 2、转座时不引起靶DNA上正向重复序列产生 3、通过“切除-插入”机制转座
列保持不变; • 在靶序列上造成同向重复序列; • 产生新的变异,有利于进化。
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五、基因重组 在转化、转导或转座过程中,整段
DNA在细胞内、细胞间或不同物种间 进行转移,并发生DNA分子间的共价 连接,简称重组(recombination)。
(一)位点特异的重组 由整合酶催化,在两个DNA序列的
二、原核生物转座因子:
原核生物转座因子的类型: 插入序列;转座子;转座噬菌体
1. 插入序列(IS,inserted sequence):
简单的转座因子,携带有转座酶基因,两端有反向重复 序列. eg. E.coli中的IS1……IS11等。 发现:E.coli中一种突变体:
A. 不能通过核酸置换回复——非点突变; B. 可自然回复——不是缺失; C. 突变比野生型密度梯度大——增加一段DNA; D. 变性单链电镜下出现颈环结构——反向重复序列。
携带有tnpA、tnpB基因,末端有E.coli DNA, 近邻类似IS序列,具有高频的转座作用。
三 真核生物转座因子:
1. 酵母、果蝇、玉米中的转座子(略)
四、 转座机制和遗传学效应
1. 转座的机制:
(197以9年细S菌ha中rpi转ro座提子出T) n:3为例,说明转座的一般过程
A. 切开: 转座酶识别受体的靶序列,在两条单链上均 切开,形成粘性末端;识别自身的反向重复序列, 在3‘端切开。
B. 连接:供体和受体结合形成不完整共联体,留下缺口。
C. 复制:DNA聚合酶补齐缺口,再连接形成完整的共联 体,具有重复序列。
D. 重组:在特定位点进行重组,共联体分离:留下原来 的转座子;并在靶序列上插入转座子,两端有同向 重复序列。
2. 转座子的遗传学效应
• 可引起基因突变——插入或切离; • 改变染色质的结构(缺失、倒位等); • 可以插入新基因(ampR、terR等); • 在靶序列上引入新的转座子序列,原来序
一、转座因子的遗传效应 1、插入突变 2、DNA重排 3、极性效应 二、转座子的应用 1、随机诱变 2、定位诱变
第四节 酵母中的转座子(Ty)
一、Ty因子的分子结构和转录
1.Ty因子的分子结构
Ty1 LTR
TyA(gag)
PR
TyB(pol)
IN
RT
RH LTR
Ty2 LTR
TyA
Ty3 LTR
四、转座噬菌体
1、可插入到宿主染色体的任何一个位点上 2、不是细菌基因组的正常组分,易于识别 3、可诱导产生 4、不含反向重复序列,含寄主DNA片段
五、转座Baidu Nhomakorabea的插入机制和转座模型
1.插入机制
2.转座模型 (1)剪-贴型转座
(2)保守性转座
(3)复制型转座
共整合体
第二节 细菌转座因子的遗传效应和应用
第十章 微生物中的转座因子
转座(transposition) 转座因子:细胞中能改变自身座位的一段 DNA序列,可以从复制子的一个座位跳跃 到另一个座位,包括插入序列和转座子。 转座:由插入序列和转座子介导的基因移 位或重排的过程称为转座。
转座因子的共同特征
1.插入寄主DNA后,导致基因失活; 2.插入时在靶DNA位点产生一个短的正向
一、转座因子(转座元)
• 转座因子:能够在染色质或质粒上转移 座位的 DNA功能单位(transposable element)。
• 特点: 1.自身携带有转座酶基因,末端有反向重复序 列; 2.转座过程中出现共联体; 3.转座以后,原来的转座子依然保持在原位,而 在靶序列上复制了一个转座子; 4.转座完成以后可以在靶序列上造成同向重复序 列.
特异位点间发生的整合。 例如:噬菌体的整合酶识别噬菌体
DNA 和宿主染色体的特异靶位点,而 后发生的选择性整合。
(二)同源重组 发生在同源序列间的重组。同源
重组不依赖特异DNA序列,而依赖 同源性。
同源重组需要一些重组蛋白和酶。 如Rec A、B、C、D及DNA连接酶等。
Holliday 中间体
重复序列。
转座因子的分类
1.DNA转座子; 2.反转录转座子。
第一节 细菌转座因子的 类型和结构
一、插入序列(IS) 二、转座子 三、接合型转座子 四、转座噬菌体
一、插入序列 插入序列(IS):750 ~ 2500bp 组成: 反向重复序列:10~40bp,位于两侧 转座酶编码基因:产物引起转座,位于中间
2. 转座子(Tn, transposon):
携带有转座酶基因及抗性基因或其它基因, 两端有相同的序列(IS)。 eg.酵母(Yeast)中的Tn1、 Tn2 ……Tn9等 Tn3:携带有tnpA、ampR、tnpR等基因,两端分别 有36bp的IR; Tn9:末端是两个IS1
3. 转座噬菌体( mutator phage)
TyA
NA
TyB
PR
IN
RT
TyB
RH LTR
PR
RT
RH
IN
LTR
Ty4 LTR
TyA
NA
TyB
PR
IN
RT
RH
LTR
TyA-TyB
Ty5 LTR
NA PR
IN
RT
RH
LTR
三、Ty因子的转座机制
反转座子:DNA RNA
四、Ty因子的转座机制 1.插入失活 2.增强效应 3.DNA重排
DNA
第五节 转座因子及其遗传学效应