转座子

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转座子概述

转座子概述

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NGCTNAGCN
有热点 未知ຫໍສະໝຸດ 2、复合转座子(composite transposon) 复合转座子是一类带有某些抗药性基因(或其他宿主基因) 的转座子,其两翼往往是两个相同或高度同源的IS序列。
The arms may be in either the same or (more commonly) inverted orientation.
3、复杂转座子:TnA家族
——携带转座和耐药等基因的独立体家族。
TnA家族带有3个基因,其中一个编码β-内酰胺酶(AmpR),另两个则是转座作用 所必需的。所有TnA类转座子两翼都带有38bp的倒置重复序列。
转座子TnA的结构示意图
转座过程
转座酶(transposase)催化IS的转座,它由IS编码。 首先转座酶交错切开宿主靶位点,然后IS插入,与宿主的 单链末端相连接,余下的缺口由DNA聚合酶和连接酶加以填 补,最终插入的IS两端形成了DR(Direct repeat)或靶重复。
p型父本贡献的paternalcontributing带有全长和缺失型的p因子m型母本贡献的maternalcontributing不含全长p因子或只含缺失的p因子后代可育杂种不育是不对称的它是由p品系的雄果蝇和m品系的雌果蝇杂交产生的但m品系的雄果蝇和p品系的雌果蝇不会产生杂种不育
转座子概述
主讲内容
the arms that are direct repeats
the arms are inverted repeats
复合转座子的中心区携带有标记(如抗药性),两侧有IS 序列。每个IS 具有短的末端重复。
部分复合转座子的结构和功能

可移动的遗传因子(转座子)

可移动的遗传因子(转座子)

特点:

重组DNA之间不需要任何序列同源性!

转座以很低的频率发生,而且转座子的插入是随机的,没有 转座的特异位点!
一、转座子的分类和结构特征
转座子分类-转座机制 DNA-DNA方式转座的转座子:
通过DNA复制或直接剪切两种方式获得可移动片段,整 合入基因组DNA中。又分为复制型,非复制型,保守型。
聚合酶 (polymerase) :
依赖DNA的DNA聚合酶(DDDP),简写为 DNA-pol ;
如何获得单链DNA模板??

多种蛋白质参与(以大肠杆菌为例)
解链酶(helicase);
单链结合蛋白(single-strand DNA binding prote
SSB);
DNA拓扑异构酶( DNA topoisomerase )
发生在同源序列之间,涉及大片段同源序列的
交换。 最基本的DNA重组方式,通过链的断裂和再连接,
在两个DNA分子同源序列间进行单链或双链片段的交 换。 同源重组需要一些重组蛋白和酶,如Rec A、B、
C、D及DNA连接酶等-无碱基序列特异性。
同源重组机制 (P90)
Holliday模型 (单链断裂重组模型)
变序列)
DNA聚合酶(DNA dependent DNA polymerase,DDDP)
5 至 3 的聚合活性
(dNMP) n
+ dNTP (dNMP) n+1 + ppi
5'
3'
A T G C A A T T G C
| | | | T G dTTP 3'
5
T A C
ppiBiblioteka 合反应的特点:非LTR逆转录转座子,能编码逆转录酶等蛋白,可自主转座。 非病毒超家族(nonviral superfamily): 自身没有转座酶或整合酶的编码能力,而在细胞内已有的酶系

转座子的名词解释

转座子的名词解释

转座子的名词解释转座子是一个常用于交通运输领域的名词,指的是一种用于将货物、乘客或货车从一种交通工具转移到另一种交通工具的设备。

它在物流行业、旅游业和城市交通中具有广泛的应用。

转座子通常由一个平台和配备了轮子的底盘组成。

平台上通常有一个或多个可伸缩的桥梁,以便方便乘客或车辆上下。

为了确保安全,转座子还配备了紧急制动系统和固定装置,以确保在运输过程中车辆不会滑动或倾斜。

在物流行业中,转座子被广泛应用于货物的中转,尤其是涉及到不同交通方式的中转。

以货运航空公司为例,它们经常使用转座子将航空货物从货机转移到地面运输工具。

这种操作可以提高效率,减少运输时间,同时还能减少物品损坏的风险。

在旅游业中,转座子可用于提供景区内的交通服务。

对于那些难以步行或需要长时间行走的游客来说,转座子是一种理想的解决方案。

通过将游客从一个景点转移到另一个景点,他们可以更好地欣赏风景,并减轻疲劳。

此外,转座子还可以为残障人士提供更便利的旅行选择,增加社会包容性。

在城市交通领域,转座子也扮演着重要的角色。

在一些繁忙的城市中,人们经常需要在不同的公共交通工具之间进行换乘。

转座子为乘客提供了更加方便快捷的换乘方式,尤其是对于老年人和行动不便的人来说。

例如,在地铁站和火车站之间设置转座子,并通过无缝衔接服务,乘客可以轻松地从一个交通工具转移到另一个交通工具,从而减少了时间和困扰。

除了上述用途,转座子还有其他一些特殊的应用,如舞台装置中的转座子。

在演出中,为了实现不同场景和道具的快速调度,转座子被广泛应用于剧院和演艺场所。

它可以帮助舞台工作人员迅速而准确地调整舞台布局,使演出更加顺畅。

尽管转座子在不同领域中有着广泛的应用,但也面临一些挑战。

首先,转座子的设计和制造需要遵循严格的安全标准,以确保使用过程中不会发生意外。

其次,转座子需要适应不同的交通工具和环境,这对设计和技术水平提出了要求。

此外,维护和保养转座子也需要投入一定的人力和物力。

转座子类型

转座子类型
作为一个整体进行转座。
复合转座子
由两个重复序列夹着一个或多个结构
基因如某些抗药性基因和其它基因组成,
其两端的组件由IS和类IS组成。
转座因子 Tn903 Tn9 Tn10
长度(bp) 3100 2500 9300
遗传标记 KanR CamR TetR
末端组件 IS903 IS 1 IS 10R
方向 反向 正向
复合转座子的转座特点
• 可以作为一个整体进行转座; • 含有的一个或两个IS元件也可进行单独转座。
类插入序列
指IS10R,IR50R和IS903,它们的结 构和IS相似,但不独立存在。而是作为复 合转座子(compositetransposons)两臂的 组件。
TnA家族
长约5kb左右,两端具有IR,而不是 IS,中部的编码区不仅编码抗性标记, 还编码转座酶和解离酶的DNA序列。
4、转座子的转座机制
所有转座子的共同机制: 在靶DNA上造成交错切口,转座子与突出的末端
相连,填补缺口。 据转座子的移动机制,可分为: ◆复制型转座(replicative transposition) ◆非复制型转座(nonreplicative transposition) ◆保守型转座(conservative transposition)
BACK
3、转座子的类型
3.1 简单转座子(插入序列)Simple transposon ( insertion sequence)
结构特征和转座特点
3.2 复合转座子 (Composite transposon)
结构特征和转座特点
3.3 类插入序列 (IS-like elements) 3.4 TnA家族
BACK

转座子结构特征

转座子结构特征

转座子结构特征
转座子(Transposon)是一个基因组中可移动的DNA序列。

转座
子通过“剪切并复制”的机制活动,即从一个位置切断并携带自己的DNA序列,然后在目的地插入该序列。

转座子结构特征从其功能、组成和分类三个方面进行了描述。

功能方面,转座子通过自身编码的转座酶来切断、复制和插入目
标DNA。

这种特殊功能使转座子成为基因组进化和变异的重要驱动力。

组成方面,转座子包含两个反向重复序列和一个中央区域。

反向
重复序列是指转座子两端相似、但互补的DNA序列,它有助于转座子
在进化过程中扩复制。

中央区域是转座子的功能中心,它包括了转座
酶编码信息、调节序列以及其他功能相关的序列。

分类方面,转座子可以分为类别I、类别II和类别III三类。


别I转座子通过逆转录过程活动,可被分为线性和环形的两类;类别
II转座子主要通过剪切转座活动,是大多数真核生物中最多的转座子
类型;类别III转座子较少见,是通过入侵基因组DNA和产生单链嵌
合体来活动的。

总之,转座子的特点决定了其在基因组变异和进化中的重要作用。

对于目前基因组学和生态学的研究,深入了解转座子结构和特征将有
利于更好地理解生命进化的奥秘。

转座子概述

转座子概述
大部分自主因子AC中含5个外显子的单个基因,其产物是转座 酶,
末端11bp的IR和8bp的DR,DR是由靶位点重复而成。
Ds:
各种Ds因子的长度和序列都不相同,但和Ac相关。其末端同样 有11bp的IR。
Ds比Ac短,其缺失的长度不同,一个极端的例子是Ds9因子仅 缺失194bp,另一个例子是Ds6因子长仅有2.5kb,相当于Ac两端 各1kb。
转座产生的染色体畸变
当复制性转座发生在宿主DNA原有位点附近时,往往导 致转座子两个拷贝之间的同源重组,引起DNA缺失或倒位。 若同源重组发生在两个正向重复转座区之间,就导致宿主染 色体DNA缺失;若重组发生在两个反向重复转座区之间,则 引起染色体DNA倒位。
正向重复之间的互 惠 (Reciprocal) 重 组 会将它们之间的序 列切除,中间区域 会以环状DNA 的形 式被切除(从细胞中 消失);染色体仍保 留正向重复的一个 拷贝。
转座子概述
主讲内容
一、转座子的概念 二、转座子的分类 三、转座发生的机制 四、真核生物的转座因子
一、概念ห้องสมุดไป่ตู้
转座子(transposon,简称Tn), 又称易位子,是指存在 于 染 色 体 DNA 上 可 以 自 主 复 制 和 移 位 的 一 段 DNA 序 列 。
转座子可以在不同复制子之间转移,以非正常重组方式 从一个位点插入到另外一个位点,对新位点基因的结构与表 达产生多种遗传效应。
dSpm(defective Spm): 非自主性因子,所有dSpm都是功能性Spm的缺失突变体; Spm-dSpm系统在功能上与Ac-Ds系统相似,也可以引入基因的
插入突变,影响结构基因表达,还能导致染色体断裂。
Spm/En有两个基因,tnpA 有11 个外显子,经转录拼接产生2500bp 的 mRNA,tnpB 的6000bpmRNA中包含ORF1和ORF2。

分子遗传学中的转座子和质粒

分子遗传学中的转座子和质粒

分子遗传学中的转座子和质粒在分子遗传学中,转座子和质粒是两个非常重要的概念。

它们都是基因组中的一部分,但是它们的性质和作用却不一样。

本文将对这两个概念进行详细的解释和探讨。

一、转座子转座子是存在于基因组中的一段DNA序列,它可以在不同的基因间移动,并且可以改变基因的表达。

转座子的存在意味着基因组是可变的,也就是说基因组中的基因不是静止不动的,而是可以发生变化的。

转座子的发现对基因组学的发展有非常大的贡献。

转座子早在20世纪50年代就被发现,但是当时并没有受到足够的重视。

直到1960年代,美国研究者Barbara McClintock对玉米的转座子进行了深入的研究,才引起了广泛关注。

McClintock因此获得了1983年诺贝尔生理学或医学奖。

转座子的存在可以引起基因的突变和重组。

它还可以影响基因表达,从而导致个体形态和生理学性状的变化。

由于转座子的高度可变性和整合性,它还可以用作遗传标记和进化研究的材料。

二、质粒质粒是细胞内的一种环状DNA分子,它并不是主要的基因组成分,但是可以在细菌、酵母等单细胞生物中存在并进行复制。

质粒中可以携带一些有用的基因,如抗生素抗性基因等。

因此,质粒可以被广泛应用于分子生物学研究、生物工程和基因技术中。

质粒与转座子的不同在于,质粒并不会在不同的基因间移动,它只能在同一细胞中进行复制。

在生物工程和基因技术中,人们经常使用质粒携带目标基因,将其导入细胞中进行表达。

在这个过程中,质粒的作用类似于一个载体,它可以将目标基因传递到宿主细胞内,从而实现目的。

三、转座子与质粒的联系虽然转座子和质粒存在一些不同之处,但它们之间也有一些联系。

事实上,一些质粒中也可以存在转座子,这些转座子可以影响质粒的表达和复制。

此外,转座子也可以被用作构建质粒的工具。

例如,研究者可以将转座子序列嵌入到质粒中,从而构建一个具有一定可变性的质粒。

这些可变质粒可用于研究基因表达、创造新的酶(enzyme)、并用于制作对基因临床检测进行测试的标准。

转座子建库流程及原理-概述说明以及解释

转座子建库流程及原理-概述说明以及解释

转座子建库流程及原理-概述说明以及解释1.引言1.1 概述转座子建库是一种重要的分子生物学技术,广泛应用于基因组学研究、进化生物学和遗传工程等领域。

通过转座子建库可以快速准确地获取目标DNA序列,并在进一步的研究中发挥重要作用。

转座子是一类能够在基因组中移动和复制的DNA序列,在生物进化过程中起到了重要的作用。

由于转座子的广泛存在和多样性,利用转座子进行建库研究能够有效地捕获和分析基因组中的各种变异和多样性。

转座子建库主要分为两个步骤:设计引物和提取目标DNA。

设计引物是为了选择特定的转座子元件,以便将目标DNA序列与转座子连接起来。

提取目标DNA是为了获取感兴趣的DNA序列,通常采用PCR等技术进行扩增。

转座子建库的原理是基于转座子的特性和作用机制。

转座子能够通过酶的作用在基因组中移动和复制,从而改变基因组结构和功能。

转座子的结构和特点对其移动和复制的方式产生了重要影响,这也是利用转座子进行建库研究的基础。

总结而言,转座子建库是一种重要的技术手段,能够帮助我们深入了解基因组的组成和功能。

通过设计合适的引物和提取目标DNA,我们可以获取到感兴趣的DNA序列,并通过分析转座子的移动和复制机制,揭示转座子在基因组中的作用和影响。

未来的研究方向包括进一步完善转座子建库技术和深入探究转座子的作用机制,以更好地应用于基因组学研究和生物技术开发中。

1.2文章结构文章结构部分的内容可以是以下内容:文章结构部分:本文将围绕转座子建库流程及原理展开讨论,主要分为以下几个部分:引言、正文和结论。

引言部分将对文章的主题进行一个概述,简要介绍转座子建库的相关背景和意义。

接着,将介绍文章的整体结构,明确各个章节的内容和目标。

最后,阐明本文的目的,即期望通过对转座子建库流程和原理的研究,推动相关领域的发展。

正文部分是本文的核心,将重点详细介绍转座子建库流程和原理。

首先,将详解转座子建库流程的各个步骤,包括设计引物和提取目标DNA。

转座子的名词解释

转座子的名词解释

“转座子”的名词解释
“转座子”的名词解释:转座子(Transposable element)是生物界的一大类序列,可以在基因组中移动,从而改变基因组的排列和结构。

它们被归类为“可移动基因”,并在分子遗传学中有广泛的应用。

转座子的发现要追溯到20世纪初,但真正的转座子概念的形成要归功于20世纪50年代的科学家们。

当时,他们发现了一些DNA 序列可以在基因组中复制和移动,从而改变了基因组的排列和结构。

这些序列被命名为“转座子”。

转座子的作用机理涉及到一些复杂的的过程。

首先,转座子在基因组中复制自己,然后在DNA链上打开一个缺口,将自己插入到新的位置。

这个过程会改变基因组的排列和结构,从而导致一些表型的变化。

按照序列的来源和结构,转座子可以分成多种类型。

其中最常见的类型是DNA转座子,它们可以在基因组中复制和移动。

另外还有一些RNA转座子和DNA-RNA转座子,它们的作用机理有所不同。

转座子的广泛应用在分子遗传学、基因工程和进化生物学等领域。

例如,科学家们可以利用转座子来研究基因组的结构和功能,或者用来改良作物的和动物的性状。

转座子名词解释

转座子名词解释

转座子名词解释转座子,又称旋转椅、转椅或旋座,是一种设备,用于支持并使人或物体能够旋转或转动。

它通常由一个平面座椅或平台和一个旋转的轴组成。

转座子主要用于医疗、办公、家庭、娱乐等场合,为用户提供便利和舒适,同时也在工业生产过程中起到重要的作用。

转座子在医疗领域中常见于诊断、康复和护理过程。

医生和护士可以利用转座子来快速移动患者,进行全面的检查和治疗。

转座子还可以帮助行动不便的患者翻身、倒立或躺下,减轻他们长时间卧床或坐着的不适感。

它还可以用于运送患者从一个位置到另一个位置,如从床上转移到轮椅上。

此外,在手术室中,转座子可以在手术台上移动,以适应医生和护士的工作需求。

在办公环境中,转座子通常是一种旋转椅,用于提供员工舒适的坐姿,使他们可以在办公桌前自由旋转和移动。

这种设备通常配有可调节的高度,以适应不同身高的人。

转座子还经常用于会议室,使参与会议的人可以方便地转动或移动,以与其他与会人员进行交流和合作。

在家庭中,转座子常用于懒人沙发、电视沙发和办公椅上。

使用转座子可以让人们更轻松地改变自己的坐姿,找到最舒适的角度。

转座子还可以在家庭劳动中发挥作用,如拖地、擦窗等。

它能让人们轻松地旋转身体,移动到需要的位置,从而减轻劳动强度。

在娱乐领域,转座子通常用于游乐园、主题公园和儿童乐园等场所。

一些旋转木马、云霄飞车和过山车等游乐设施都利用了转座子的原理。

乘客坐在转座子上,随着设施的旋转或转动,体验到刺激和快乐。

在工业生产中,转座子被广泛应用于装配线和生产线。

它可以提高工作效率,减少工人的劳动强度。

工人可以坐在转座子上,以便他们可以自由旋转和移动到需要处理的物体所在的位置。

综上所述,转座子是一种旋转装置,用于支持并使人或物体能够旋转或转动。

它在医疗、办公、家庭、娱乐和工业生产等方面提供了便利和舒适,为人们的工作和生活带来了很大的改善。

转座子

转座子

Replicative transposition
Nonreplicative transposition
Conservative transposition
6 转座引起的遗传学效应
(1)引起插入突变 (2)产生新的基因 (3)引起生物进化 (4)引起染色体畸变
注:转座引起DNA重排(Rearrangement)
8 果蝇中的 P 因子
◆ 黑腹果蝇的两个杂种败育(hybrid dysgenesis)系统: I / R ( inducer / reactive) 型和 P / M ( paternal contributing / maternal contributing )型 ;
◆ P 因子(P element)是黑腹果蝇P品系而不是M品 系所携带的转座子;
第十三章 转座子
Chapter 13 Transposon
主要内容
1. 转座子的定义 2. 转座子的转座特点 3. 转座子的分类 4. 转座机制 5. 转座类型 6. 转座引起的遗传学效应 7. 玉米中的控制元件 8. 果蝇中的 P 元件 9. 反转录病毒和反转录转座子
1 转座子的定义
能将自身插入基因组新 位置的DNA序列。
the arms that are direct repeats
the arms are inverted repeats
A composite transposon has a central region carrying markers flanked by IS modules.
复合转座子的转座特点
2 转座子的转座特点
(1) 基因组内移动; (2) 不依赖于供体与受体间的序列关系; (3) 一般仅移动转座子序列本身。

转座子 例子

转座子 例子

转座子例子
【最新版】
目录
1.转座子的定义和特点
2.转座子的分类和功能
3.转座子的例子及其应用
正文
转座子(Transposable elements,简称 TEs)是一类可以在基因组中自主移动的 DNA 序列,它们在生物体基因组中占据很大比例,尤其在植物基因组中更为明显。

转座子具有自主复制和插入的功能,可以在基因组中不断跳跃,从而改变基因组的结构和功能。

根据转座子的功能和特点,可以将其分为两大类:一类是可转座元件(Transposable elements),另一类是假基因(Pseudogenes)。

可转座元件具有自主复制和插入功能,可以在基因组中不断跳跃。

而假基因则是失去功能的可转座元件,它们在基因组中占据一定比例,但已失去跳跃功能。

转座子在生物体中具有多种功能,例如:1)基因组结构的调整;2)基因表达的调控;3)基因组的进化等。

其中,基因组结构的调整是转座子的主要功能之一,通过转座子的不断跳跃和插入,可以改变基因组的结构和功能,从而为生物体的适应性进化提供原材料。

在实际应用中,转座子也可作为基因编辑工具使用。

例如,
CRISPR-Cas9 系统就是一种基于转座子的基因编辑技术,通过将 Cas9 蛋白引导至特定位点,实现对目标基因的敲除或插入。

这一技术已在生物医学研究和遗传病治疗等领域取得显著成果。

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转座子名词解释生物化学

转座子名词解释生物化学

转座子名词解释生物化学
嘿,你知道啥是转座子不?转座子啊,就像是生物界里的小调皮鬼!比如说吧,就好像一个小孩子在一个大房间里跑来跑去,一会儿在这
个角落捣乱一下,一会儿又跑到那个角落折腾一番。

转座子就是这样,它们能在基因组里跳来跳去。

想象一下,整个基
因组就像是一个超级大的拼图,而转座子就是那些可以在拼图里随意
移动的小块。

转座子可神奇了呢!它们可以改变基因的位置和功能。

哎呀呀,这
可不得了!就好像本来一个东西放在这儿好好的,突然被挪到了别的
地方,那可就会产生一系列的变化呀!这影响可大可小呢。

咱来举个例子啊,好比一个乐团正在演奏一首美妙的乐曲,突然其
中一个乐器的位置变了,那整首曲子的感觉可能就完全不一样了,对吧?转座子就有这样的魔力。

科学家们对转座子那是又爱又恨呐!爱的是它们能给研究带来很多
有趣的发现和突破,恨的是它们有时候也会搞出一些麻烦事儿。

“哎呀,这个转座子怎么又捣乱啦!”科学家们可能会这么抱怨。

转座子还分为不同的类型呢,什么插入序列啦,复合型转座子啦等等。

它们各自有着独特的特点和行为方式。

在生物的进化过程中,转座子也扮演着重要的角色呢!它们可以带来新的基因组合,推动着生物的不断变化和发展。

总之啊,转座子就是生物化学里超级有趣又超级重要的一个概念!它们就像一群小精灵,在基因组里蹦蹦跳跳,给生物世界带来了无数的可能和惊喜!我觉得转座子真的是太神奇啦,它们的存在让生物世界变得更加丰富多彩,难道不是吗?。

转座子的概念

转座子的概念

转座子的概念
转座子(Transposon),也称为转座因子或跳跃基因,是存在于染色体DNA上可以自主复制和移位的基本单位。

它们可以反复插入到基因组中的许多位点,并从一个位置跳到另一个位置,这可能会影响它们所在位置的基因表达。

转座子可以分为两种类型:简单转座子和复合式转座子。

简单转座子只包含转座酶识别的末端,而复合式转座子则包含更复杂的结构,例如与逆转录酶相关的结构。

转座子的作用机制可以概括为剪切和复制。

首先,转座酶识别转座子,并在其中产生一个切口。

然后,转座子被复制并在同一位置插入新的DNA链。

这个过程可以重复多次,导致转座子在基因组中不断移动。

转座子的存在和活动可能会对生物体的遗传信息产生重要影响。

它们可能导致基因突变、基因重复或缺失,甚至可能影响基因表达和调控。

因此,对转座子的研究对于理解基因组稳定性和遗传变异具有重要意义。

转座子概述

转座子概述
——不含全长P因子或只含缺失的P因子 ❖ P(♂)×M(♀) 后代不育 ❖ M(♂)×P(♀) 后代可育
杂种不育:
当P品系雄果蝇和
M品系雌果蝇交配
时,可能由于雄果
蝇 DNA 的 进 入 而
突然生成了转座酶,
结果使很多的P因
子发生转座,造成
插入突变。这样杂
交生下的子代出现
染色体畸变和生育
力下降。
杂种不育是不对称的,它是由P品系的雄果蝇和M品系的雌果蝇杂 交产生的,但M品系的雄果蝇和P 品系的雌果蝇不会产生杂种不育。
IS1 IS2 IS4 IS5 IS10R IS50R IS903
IS序列的结构特征比较
长度(bp)
768 1327 1428 1195 1329 1531 1057
两段倒置重 靶位点正向 复区(bp) 重复区(bp)
靶位点
23
9
随机
41
5
有热点
18
11或12
AAAN20TT
16
4
有热点
22
9
NGCTNAGCN
Ac-Ds转座元件
❖ 1951年McClintock-麦克林托克提出转座(Transposition) 和跳跃基因(jumping gene)的新概念;
❖ 1967年Shapiro才在E.coli中发现了转座因子(transposable element)。
Barbara McClintock(1902-1992) Nobel Prize for Physiology or Medicine 1983
二、转座子的分类
1、插入序列(insertional sequence IS)
特征: ❖两端都有短的4-15bp的正向重复序列(direct repeats, DR) (靶序列); ❖末端有略长的15-25bp的反向重复序列(inverted repeats, IR); ❖1kb左右的编码区,它仅编码和转座有关的转座酶。

转座子的类型和基本结构

转座子的类型和基本结构

转座子的类型和基本结构转座子,这个词听起来是不是很复杂?其实它们就像基因组里的小调皮捣蛋鬼,爱到处跑。

这些小家伙能在DNA中移动,真的是让科学家们又爱又恨。

简单来说,转座子分为两种类型:一种叫做“自主转座子”,另一种叫“非自主转座子”。

前者可以独立移动,后者则依赖于其它基因组的帮助。

想象一下,自主转座子就像那种爱自由的小鸟,而非自主转座子就像依赖别人的小猫咪,看到没,完全是两种不同的风格。

说到结构,转座子可真有趣。

这些小家伙的基本结构通常包括转座酶基因和一些重复序列。

转座酶就像一把钥匙,帮助转座子在基因组中打开一扇扇门。

哎呀,这个比喻真不错,对吧?而这些重复序列则像是转座子的小“身份证”,让它们在基因组中能被认出来。

不过,虽然这些转座子有时候能搞得基因组一团乱,但它们的存在也带来了很多进化上的好处,真是复杂的关系呀。

有些人可能会觉得转座子真是麻烦,干嘛要它们呢?它们在生物体的进化中扮演了超级重要的角色。

就像是变色龙,能帮助生物适应环境变化。

这些小家伙可以在基因组里引入新的基因变异,创造新的特性。

就拿某些植物来说,转座子让它们能在恶劣环境中生存,简直是太给力了!所以说,转座子就像一把双刃剑,既有好的一面,也有坏的一面,真是让人捉摸不透。

转座子的活跃程度也各有不同,有些可以说是超级活跃,每隔一段时间就跃动一次;而有些则比较安静,躲在角落里。

不少研究显示,转座子的活跃性跟环境因素、遗传背景都有关系。

简单来说,环境越糟,转座子越活跃,反之亦然。

这就像人类,压力大了就会变得更为敏感,反之则相对平静。

这种调皮捣蛋的特性,使得转座子在研究遗传疾病时成为了一个重要的目标。

转座子在医学研究中也有不少潜力。

科学家们发现,某些转座子的移动跟癌症、遗传病等有着密切的关系。

想象一下,转座子在基因组中胡乱移动,有可能引发突变,从而导致细胞不正常地生长,真的是让人心头一紧。

不过,正是因为有了转座子的研究,科学家们才能更好地理解这些复杂的疾病,为患者找到更有效的治疗方案。

第十二章转座子ppt课件

第十二章转座子ppt课件

▪ 控制因子利用其特定的靶子位点重复(target site duplication,TSD)DNA与受体基因相连接,插入基因座位。 在它们离开插入位点时,TSD与转座因子一起消失。但在植物中, 转座因子离开之后,TSD常常被遗留下来形成印迹(footprint), 不过这种遗留下来的TSD,有时与原来的TSD有所不同,个别碱 基可能被替代或丢失(图12-18,图12-19)。如果转座因子的 插入和跳出,发生在内含子或基因前导序列(leader sequence),其后果很难觉察得到。如果发生在外显子,在遗 留的TSD碱基不是3的倍数时,有可能产生移码突变 (frameshift mutation),是3的倍数时,TSD碱基有可能增加 少数氨基酸,使回复突变的蛋白质与原始类型有所不同。
没有活性的a1和a1-m,在dt存在时,表现是稳定的,但在Dt存在时, 都能发生特定频率的回复突变,出现不同活性水平的A1。回复突变可以 发生在个体发育的任何时期。在能够产生花青素的组织,引起叶片、花 药、籽粒等产生大小不同的有色斑点(图12-1)。
图12-1 Dt-rDt系统对花药和叶片色素的影响
与Ac类似,Spm的活性也受甲基化影响,甲基化抑制其转座能力。但具体的调 控方式还不完全清楚。Fedoroff(1995)认为,Spm 5’端至转录起始点的上游 控制区域(UCR)甲基化与其失活有关。Spm编码产生的两个蛋白TNPA和 TNPD是转座所必需的,两个蛋白通过与Spm端部结合,促使Spm与DNA的紧 密结合。TNPA结合于Spm靠近端部的重复区域,可以使Spm启动子脱甲基化。 同时,通过影响转录和转座实现Spm的调控。图12-17为Spm的分子调控模 式。
三、SPm系统
自主因子----SPm 非自主因子----I 自主因子作用特点------SPm分为两个部分 ---抑制基因SP:通过控制因子对结构基因的表达起到完全抑制作用 ---增变基因m:能够引起控制因子的转座和状态变化,控制整个SPm因
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三、Ty因子的转座机制
反转座子:DNA RNA
四、Ty因子的转座机制 1.插入失活 2.增强效应 3.DNA重排
DNA
第五节 转座因子及其遗传学效应
一、转座因子的遗传效应 1、插入突变 2、DNA重排 3、极性效应 二、转座子的应用 1、随机诱变 2、定位诱变
第四节 酵母中的转座子(Ty)
一、Ty因子的分子结构和转录
1.Ty因子的分子结构
Ty1 LTR
TyA(gag)
PR
TyB(pol)
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RT
RH LTR
Ty2 LTR
TyA
Ty3 LTR
四、转座噬菌体
1、可插入到宿主染色体的任何一个位点上 2、不是细菌基因组的正常组分,易于识别 3、可诱导产生 4、不含反向重复序列,含寄主DNA片段
五、转座子的插入机制和转座模型
1.插入机制
2.转座模型 (1)剪-贴型转座
(2)保守性转座
(3)复制型转座
共整合体
第二节 细菌转座因子的遗传效应和应用
特异位点间发生的整合。 例如:噬菌体的整合酶识别噬菌体
DNA 和宿主染色体的特异靶位点,而 后发生的选择性整合。
(二)同源重组 发生在同源序列间的重组。同源
重组不依赖特异DNA序列,而依赖 同源性。
同源重组需要一些重组蛋白和酶。 如Rec A、B、C、D及DNA连接酶等。
Holliday 中间体
列保持不变; • 在靶序列上造成同向重复序列; • 产生新的变异,有利于进化。
返回
返回
五、基因重组 在转化、转导或转座过程中,整段
DNA在细胞内、细胞间或不同物种间 进行转移,并发生DNA分子间的共价 连接,简称重组(recombination)。
(一)位点特异的重组 由整合酶催化,在两个DNA序列的
B. 连接:供体和受体结合形成不完整共联体,留下缺口。
C. 复制:DNA聚合酶补齐缺口,再连接形成完整的共联 体,具有重复序列。
D. 重组:在特定位点进行重组,共联体分离:留下原来 的转座子;并在靶序列上插入转座子,两端有同向 重复序列。
2. 转座子的遗传学效应
• 可引起基因突变——插入或切离; • 改变染色质的结构(缺失、倒位等); • 可以插入新基因(ampR、terR等); • 在靶序列上引入新的转座子序列,原来序
一、转座因子(转座元)
• 转座因子:能够在染色质或质粒上转移 座位的 DNA功能单位(transposable element)。
• 特点: 1.自身携带有转座酶基因,末端有反向重复序 列; 2.转座过程中出现共联体; 3.转座以后,原来的转座子依然保持在原位,而 在靶序列上复制了一个转座子; 4.转座完成以后可以在靶序列上造成同向重复序 列.
携带有tnpA、tnpB基因,末端有E.coli DNA, 近邻类似IS序列,具有高频的转座作用。
三 真核生物转座因子:
1. 酵母、果蝇、玉米中的转座子(略)
四、 转座机制和遗传学效应
1. 转座的机制:
(197以9年细S菌ha中rpi转ro座提子出T) n:3为例,说明转座的一般过程
A. 切开: 转座酶识别受体的靶序列,在两条单链上均 切开,形成粘性末端;识别自身的反向重复序列, 在3‘端切开。
2. 转座子(Tn, transposon):
携带有转座酶基因及抗性基因或其它基因, 两端有相同的序列(IS)。 eg.酵母(Yeast)中的Tn1、 Tn2 ……Tn9等 Tn3:携带有tnpA、ampR、tnpR等基因,两端分别 有36bp的IR; Tn9:末端是两个IS1
3. 转座噬菌体( mutator phage)
第十章 微生物中的转座因子
转座(transposition) 转座因子:细胞中能改变自身座位的一段 DNA序列,可以从复制子的一个座位跳跃 到另一个座位,包括插入序列和转座子。 转座:由插入序列和转座子介导的基因移 位或重排的过程称为转座。
转座因子的共同特征
1.插入寄主DNA后,导致基因失活; 2.插入时在靶DNA位点产生一个短的正向
正向重复序列:3~9bp,位于反向重复序列 外侧,为插入序列所特有
二、转座子(transposons,Tn) 1、复杂转座子
反向重复序列 组成 转座酶基因
特殊基因:如抗生素抗性基因等
转座酶基因
特殊基因
2、复合转座子
IS 组成
抗药性基因
IS
抗药性基因
IS(IS’)
三、接合型转座子
1、不具有反向重复序列 2、转座时不引起靶DNA上正向重复序列产生 3、通过“切除-插入”机制转座
重复序列。
转座因子的分类
1.DNA转座子; 2.反转录转座子。
第一节 细菌转座因子的 类型和结构
一、插入序列(IS) 二、转座子 三、接合型转座子 四、转座噬菌体
一、插入序列 插入序列(IS):750 ~ 2500bp 组成: 反向重复序列:10~40bp,位于两侧 转座酶编码基因:产物引起转座,位于中间
二、原核生物转座因子:
原核生物转座因子的类型: 插入序列;转座子;转座噬菌体
1. 插入序列(IS,inserted sequence):
简单的转座因子,携带有转座酶基因,两端有反向重复 序列. eg. E.coli中的IS1……IS11等。 发现:E.coli中一种突变体:
A. 不能通过核酸置换回复——非点突变; B. 可自然回复——不是缺失; C. 突变比野生型密度梯度大——增加一段DNA; D. 变性单链电镜下出现颈环结构——反向重复序列。
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