dna提取的各种方法介绍
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二. 从猪脾中提取DNA
1. 操作步骤: 取鲜猪脾,去脂、血,称取10g,用预冷的1×SSC溶液洗2次,剪碎。 按睥:1×SSC=1; 5W/V 加入50ml预冷的1×SSC,用高速组织 捣碎机破碎8次,每次5秒,中间间隔30秒。 将匀浆液放在烧杯中, 于冰盐浴中冷却30分钟。4000转/分钟 离心10分钟。充掉上清。沉淀物中再加2倍体积的1×SSC搅匀,离 心,弃上清,重复2次。 将所得沉淀悬于5倍体积的PH8.0、0.15MNaCL—0.1Na2MEDTA 溶液中。边搅拌边漫漫滴加5%SDS最终浓度达1%为止。然后加入 固体氯化钠使其最终浓度达1mol/L,继续搅60分钟,以确保氯化钠 全溶。所得混合液倒入磨口塞的锥形瓶中,加入同体积氯仿—异戊 醇,激烈振荡20分钟,4000r离心20分钟,上层水相取出后倒入烧杯, 以同积氯仿—异戊醇重复去蛋白2次。 取出水相于烧杯中,逐渐加入2倍体积95%乙醇,玻棒搅动, DNA纤维绕于璃玻棒上后挤干,用70%乙醇洗DNA纤维2次,用 95%乙醇洗一次,再用乙醚洗一次,取出并挤干。
DNA的提取方法简介
为了研究DNA分子在生命代谢中的作用,常常 需要从不同的生物材料中提取DNA.由于DNA 分子在生物体内的分布及含量不同,要选择适 当的材料提取DNA。 动植物中,小牛胸腺۰动物肝脏۰鱼类精子,植 物种子的胚中都含有丰富的DNA。 微生物中,谷氨酸菌体含7%~10%,面包酵母 含4%,啤酒酵母含6%,大肠肝菌含9%~10%。
从各种材料中提取DNA方法不同,分离提取的 难易程度也不同。 对于低等生物。如从病毒中提取DNA 比较容 易,多数病毒DNA 分子量较小,提取时易保 持其结构完整性。 从细菌及高等动植物中提取DNA难度大一些。 细菌DNA 分子量较大,一般达2×10 道尔顿。 因 此 易 被 机 械 张 力 剪 断 。 细 菌 DNA, 除 核 DNA 外,还有质粒DNA 等。
wk.baidu.com 1、核酸的理化性质
RNA和核苷酸的纯品都呈白色粉末或结晶,DNA则 为白色类似石棉样的纤维状物。除肌苷酸、鸟苷酸具有 鲜味外,核酸和核苷酸大都呈酸味。 DNA、RNA和核苷酸都是极性化合物,一般都溶于 水,不溶于乙醇、氯仿等有机溶剂,它们的钠盐比游离 酸易溶于水,RNA钠盐在水中溶解度可达40g/L。DNA 在水中为10g/L,呈黏性胶体溶液。在酸性溶液中, DNA、RNA易水解,在中性或弱碱性溶液中较稳定。
天然状态的DNA 是以脱氧核糖核蛋白(DNP)形式存 在于细胞核中。要从细胞中提取DNA 时,先把DNP 抽提出来,再把P除去,再除去细胞中的糖,RNA 及无机离子等,从中分离DNA 。 DNP和RNP在盐溶液中的溶解度受盐浓度的影响而 不同。DNP在低浓度盐溶液中,几乎不溶解,如在 0.14 mol/L的氯化钠溶解度最低,仅为在水中溶解度 的1%,随着盐浓度的增加溶解度也增加,至1mol/L 氯化钠中的溶解度很大,比纯水高2倍。 RNP在盐溶液中的溶解度受盐浓度的影响较小,在 0.14mol/L氯化钠中溶解度较大。因此,在提取时, 常用此法分离这两种核蛋白。
待测液中测得的核酸μg数 待测液中制品的μg数
×100
二苯胺显色法测定DNA含量
强酸、加热条件下,可以使DNA中的嘌呤碱基与 脱氧核糖间的糖苷键断裂,而产生嘌呤碱基,脱氧 核糖与嘧啶核苷酸。其中2ˊ脱氧核糖在酸性环境中 成为 ω― 羟基 ―γ― 酮基戊醛,此物与二苯胺反应生 成蓝色化合物,在595nm处有最大吸收。DNA在40400μg范围内光密度与DNA浓度成正比。在反应液中 加入少量乙醛可提高灵敏度,而且其他化合物的干 扰也显著降低。当样品含少量 RNA 时不影响测定, 而蛋白质、多种糖及其衍生物芳香,羟基醛都能与 二苯胺形成各种有色物质,干扰测定。
1.为什么在低温下进行?
2.分别加柠檬酸钠和EDTA的作用 ?
3.加SDS的作用?
4.加NaCL的作用,为什么要加到1mol/L?
5.加入异戊醇有什么作用?
操作方法: 1. DNA标准曲线的制定: 取10支试管,分成2组,依次加入0.4、0.8、1.2、1.6 和2.0mlDNA标准溶液。添加蒸馏水,使之都成为2ml。另 取2只试管,各加2ml蒸馏水作为对照。然后各加入4ml二 苯胺试剂,混匀。于60 恒温水浴中保温1h,冷却后于 595nm处进行比色测定。取两管平均值,以DNA浓度为横 坐标,光吸收值为纵坐标,绘制标准曲线。 2. 制品的测定: 取2支试管,各加2ml待测液(内含DNA应在标准曲 线的可范围之内)和4ml二苯胺试剂,摇匀。其于操作同 标准曲线的制作。 3. 根据测得的光吸收值,从标准曲线待测上查出相应 该光吸收值DNA的含量,计算出制品中的百分含量。
3.DNA提取的几种方法 (1).浓盐法 利用RNP和DNP在电解溶液中溶解度不同,将二者分离,常 用的方法是用1M 氯 纳提取化钠抽提,得到的DNP粘液与含有少 量辛醇的 氯仿一起摇荡,使乳化,再离心除去蛋白质,此时蛋白质 凝胶停留在水相及氯仿相中间,而DNA位于上层水相中,用2倍 体积95%乙醇可将DNA 钠盐沉淀出来.
1、二苯胺试剂:使用前称取 0.8g 二苯胺(需在70% 乙醇试 剂中重结晶 2 次 ) ,溶于 180 ml 冰乙酸中,再加入 8ml 过氯酸 (60%以上),混匀待用,临用前加入0.8ml 1.6%乙醛溶液,所 配试剂应为无色。 每组需56ml 共需2800ml 2、DNA标准溶液:(须经定磷法确定其浓度)取标准DNA 以0.01N NAOH配成200微克/毫升的标准液。 每组需12ml 共需600ml 3、1.6% 乙醛:取 47% 乙醛 3.4ml,加重蒸水定容至 100ml (放于冰箱中,一周之内可以使用)。 共需70ml 4、 ( 测样品液:准确称取猪脾 DNA 或用紫外分光法中剩下 的DNA液配成10微克/毫升的溶液。 每组需4ml 共需200ml
也可用0.15 MNaCL液反复洗涤细胞破碎液除去RNP,再以 1MNaCL提取脱氧核糖蛋白,再按氯仿---异醇法除去蛋白.
两种方法比较,后种方法使核酸降解可能少一些.
以稀盐酸溶液提取DNA 时,加入适量去污剂,如SDS可有助于 蛋白质与DNA 的分离。在提取过程中为抑制组织中的DNase对 DNA 的降解作用,在氯化钠溶液中加入柠檬酸钠作为金属离子 的烙合剂.通常用.15MNaCL,0.015M柠檬钠,并称SSC溶液,提取 DNA.
( 4).水抽提法: 利用核酸溶解于水的性质,将组织细胞破碎后,用低 盐溶液除去RNA,然后将沉淀溶于水中,使DNA充 分溶解于水中,离心后收集上清液.在上清中加入固体 氯化钠调节至2.6M.加入2倍体积95%乙醇,立即用搅拌 法搅出.然后分别用66% ٠80%和95%乙醇以及丙铜洗 涤,最后在空气中干燥,既得DNA样品.此法提取的DNA 中蛋白质含量较高,故一般不用.为除蛋白可将此法加 以改良,在提取过程中加入SDS.
2. 实验材料,仪器和试剂: (1) 实验材料:新鲜猪脾: (2)仪器:量筒:1×10、3×100烧杯:2×100,2×250;磨 口锥形瓶:1×250、1×500;吸管:1×1、1×10;滴管、玻棒 离心机、电动搅拌器、台秤、剪刀、镊子。 (3) 试剂: ① 20×SSC:175.2gNaCL,88.2g柠檬酸钠•2H2O,PH=7.0加 水至1000ml; ② 1×SSC,0.1×SSC由①做相应的稀释得来; ③ NaCL-Na2EDTA液:8.77gNaCL,3.72gNa2EDTA溶于 800ml蒸馏水中,用固体NaOH调PH=8后定容至1000; ④ 5%SDS(W/V):6gSDS溶于100ml45%乙醇中; ⑤ 氯仿-异戊醇=24:1(体积比) ⑥ 其他:95%乙醇,盐冰. 数据:DNA重,产率: DNA%=
2.细胞的破碎
细菌有坚硬的细胞壁,首先要破碎经胞。方
法有三种: ①机械方法:超声波处理法、研磨法、 匀浆法; ②化学试剂法:用SDS处理细胞;
③酶解法:加入溶菌酶或蜗牛酶,都可
使细胞壁破碎。
由于高等动物DNA 主要存在于细胞核与线粒体 中,所以提取时有两个困难(高等植物与此类 似): ①破碎细胞难;从处死动物۰分离组织器宫到 破碎细胞费时长。在此时期间DNA 可能会被DN ase降解,而动物组织:特别是肌肉组织很难破碎, 即使是较易破碎的肝۰肾等组织也往往使用组织 匀浆器,易造成DNA 断裂。 ②分子量大,一般比细菌的大2—3个数量级, 比病毒的大4—5个数量。对不同生物材料,要根 据具体情况选择适当的分离提取方法。
(2).阴离子去污剂法: 用SDS或二甲苯酸钠等去污剂使蛋白质变性,可以直 接从生物材料中提取DNA .由于细胞中DNA与蛋白质之 间常借静电引力或配位键结合,因为阴离子去污剂能够 破坏这种价键,所以常用阴离子去污剂提取DNA. (3).苯酚抽提法: 苯酚作为蛋白变性剂,同时抑制了DNase的降解作用. 用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白 分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分 子溶于酚相,而DNA溶于水相。离心分层后取出水层, 多次重复操作,再合并含DNA 的水相,利用核酸不溶 于醇的性质,用乙醇沉淀DNA 。此时DNA是十分粘稠 的物质,可用玻璃漫漫绕成一团,取出。此法的特点是 使提取的DNA保持天然状态 .