组蛋白的修饰作用ppt课件
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蛋白质的修饰和表达ppt课件
赖氨酸的ε-氨基是蛋白质分子中亲核反应 活性很高的基团,是蛋白质或多肽分子比 较容易与修饰剂发生作用的位点。
常见的修饰剂有三硝基苯磺酸、烷基化试 剂、氰酸盐以及盐酸吡哆醛等。
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8
(三)羧基的化学修饰 谷氨酸、天冬氨酸
修饰方法很有限,产物一般是脂类或酰胺 类。
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9
(四)二硫键的化学修饰
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6
5,5-二硫-2-硝基苯甲酸(DTNB)是目前
最常用的巯基修饰试剂之一,可与巯基反 应形成二硫键,使蛋白质分子上标记1个2硝基-5-硫苯甲酸(TNB),同时释放一个 有颜色的TNB阴离子,该离子在412nm有很
强的吸收,可以通过光吸收变化来检测反 应程度。
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7
(二)氨基的化学修饰
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12
3、精氨酸残基含一个胍基,精氨酸残基的 强碱性,使其很难与大多数试剂发生修饰 反应,但可以和二羰基化合物发生反应。
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13
4、色氨酸吲哚基可以发生取代反应或者被 氧化裂解。N-溴代琥珀酰亚胺(NBS)可以 使吲哚基团氧化成羟吲哚衍生物,但专一
性较差,酪氨酸残基也可与该试剂发生反 应。
第三章 蛋白质的修饰和表达
蛋白质的修饰和表达是蛋白质工程的重要 研究内容和手段。将从蛋白质修饰的化学 途径、蛋白质改造的分子生物学途径和重 组蛋白质的表达进行讲解。
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1
第一节 蛋白质修饰的化学途径
蛋白质的化学修饰:凡通过活性基团的引 入或去除,而使蛋白质的一级结构发生改 变的过程。
有些情况下,化学结构的改变并不影响蛋 白质的生物学活性,这些修饰称为非必需 部分的修饰。但多数情况下,蛋白质结构 的改变将导致生物活性的改变。
常见的修饰剂有三硝基苯磺酸、烷基化试 剂、氰酸盐以及盐酸吡哆醛等。
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8
(三)羧基的化学修饰 谷氨酸、天冬氨酸
修饰方法很有限,产物一般是脂类或酰胺 类。
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9
(四)二硫键的化学修饰
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6
5,5-二硫-2-硝基苯甲酸(DTNB)是目前
最常用的巯基修饰试剂之一,可与巯基反 应形成二硫键,使蛋白质分子上标记1个2硝基-5-硫苯甲酸(TNB),同时释放一个 有颜色的TNB阴离子,该离子在412nm有很
强的吸收,可以通过光吸收变化来检测反 应程度。
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7
(二)氨基的化学修饰
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12
3、精氨酸残基含一个胍基,精氨酸残基的 强碱性,使其很难与大多数试剂发生修饰 反应,但可以和二羰基化合物发生反应。
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13
4、色氨酸吲哚基可以发生取代反应或者被 氧化裂解。N-溴代琥珀酰亚胺(NBS)可以 使吲哚基团氧化成羟吲哚衍生物,但专一
性较差,酪氨酸残基也可与该试剂发生反 应。
第三章 蛋白质的修饰和表达
蛋白质的修饰和表达是蛋白质工程的重要 研究内容和手段。将从蛋白质修饰的化学 途径、蛋白质改造的分子生物学途径和重 组蛋白质的表达进行讲解。
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1
第一节 蛋白质修饰的化学途径
蛋白质的化学修饰:凡通过活性基团的引 入或去除,而使蛋白质的一级结构发生改 变的过程。
有些情况下,化学结构的改变并不影响蛋 白质的生物学活性,这些修饰称为非必需 部分的修饰。但多数情况下,蛋白质结构 的改变将导致生物活性的改变。
表观遗传学 第三章 组蛋白修饰
表观遗传学第三章组 蛋白修饰
,
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目录 /目录
01
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04
组蛋白修饰的 酶类
02
表观遗传学概 述
05
组蛋白修饰的 作用机制
03
组蛋白修饰的 种类
06
组蛋白修饰与 疾病的关系
01 添加章节标题
02 表观遗传学概述
表观遗传学的定义
表观遗传学是研究基因型未发生变化但基因的表达却发生了可遗传变化的科学。 表观遗传学主要关注DN甲基化、组蛋白修饰和非编码RN等对基因表达的影响。 表观遗传学在生物体发育、肿瘤发生和神经科学等领域有广泛应用。 表观遗传学可以通过研究基因表达的可遗传变化来揭示遗传信息与环境因素之间的相互作用。
sirtuins两类具 有不同的生物学 功能和底物特异
性。
研究意义:组蛋 白去乙酰化酶在 多种生物学过程 中发挥重要作用 如细胞分化、肿 瘤发生等是当前 表观遗传学研究
的热点之一。
组蛋白甲基化酶
定义:能够催化组蛋白甲基化反应的酶类
作用机制:通过甲基化组蛋白的特定位点 调控基因的表达
种 类 : 包 括H MTs 和 HM Ts e 等
研究意义:组蛋 白泛素化在表观 遗传学中具有重 要的研究意义对 于理解生物发育、 细胞分化和疾病 发生机制等方面 具有重要意义。
04 组蛋白修饰的酶类
组蛋白乙酰化酶
定义:组蛋白乙 酰化酶是一类能 将乙酰基团转移 至组蛋白特定位 点的酶
作用:调控基因 表达影响细胞分 化、发育和肿瘤 发生等过程
种 类 : 包 括 H Ts 和 K Ts 等 不 同 亚 型具有不同的底 物特异性和功能
与其他修饰的关系:组蛋白磷酸化可以与其他修饰如甲基化、乙酰化等相互影响共同参与基 因表达的精细调控。
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04
组蛋白修饰的 酶类
02
表观遗传学概 述
05
组蛋白修饰的 作用机制
03
组蛋白修饰的 种类
06
组蛋白修饰与 疾病的关系
01 添加章节标题
02 表观遗传学概述
表观遗传学的定义
表观遗传学是研究基因型未发生变化但基因的表达却发生了可遗传变化的科学。 表观遗传学主要关注DN甲基化、组蛋白修饰和非编码RN等对基因表达的影响。 表观遗传学在生物体发育、肿瘤发生和神经科学等领域有广泛应用。 表观遗传学可以通过研究基因表达的可遗传变化来揭示遗传信息与环境因素之间的相互作用。
sirtuins两类具 有不同的生物学 功能和底物特异
性。
研究意义:组蛋 白去乙酰化酶在 多种生物学过程 中发挥重要作用 如细胞分化、肿 瘤发生等是当前 表观遗传学研究
的热点之一。
组蛋白甲基化酶
定义:能够催化组蛋白甲基化反应的酶类
作用机制:通过甲基化组蛋白的特定位点 调控基因的表达
种 类 : 包 括H MTs 和 HM Ts e 等
研究意义:组蛋 白泛素化在表观 遗传学中具有重 要的研究意义对 于理解生物发育、 细胞分化和疾病 发生机制等方面 具有重要意义。
04 组蛋白修饰的酶类
组蛋白乙酰化酶
定义:组蛋白乙 酰化酶是一类能 将乙酰基团转移 至组蛋白特定位 点的酶
作用:调控基因 表达影响细胞分 化、发育和肿瘤 发生等过程
种 类 : 包 括 H Ts 和 K Ts 等 不 同 亚 型具有不同的底 物特异性和功能
与其他修饰的关系:组蛋白磷酸化可以与其他修饰如甲基化、乙酰化等相互影响共同参与基 因表达的精细调控。
组蛋白修饰与癌症-课件
从组蛋白的尾部添加或去除翻译后修饰是动态的,是由多个
不同的组蛋白修饰酶进行的。该酶参与所谓的“写作”和“擦 除”这些可逆的标志,包括组蛋白乙酰转移酶(HATS)和组蛋 白去乙酰化酶(HDAC),组蛋白甲基转移酶(HMTS),组蛋白 去甲基化酶(HDMS),组蛋白泛素化酶以及去泛素化酶,都可 以识别和改变组蛋白尾部的氨基酸残基
胃癌
• 胃癌是一种常见的侵袭性恶性肿瘤,其预后较差。 2012年GC发生在美国估计有21300例新病例,估计 10540人死亡。胃腺癌的免疫组织化学分析表明, H3K9甲基化水平(H3K9me3)与肿瘤分期,淋巴管浸 润,肿瘤复发呈正相关 。此外,基因组分析表明,高
表达的H3K9me3与低生存率呈正相关,这是转录抑制 的标志。芯片分析显示128个基因的H3K27me3水平差 异显著,有119个基因处于高水平表达(即MMP15、 UNC5B,和SHH)的标记和9个处于低水平表达• 通过文献综述表明,组蛋白翻译后修饰在肿瘤生物学中发挥 重要的作用,成为疾病亚型的显著预测因子。在肿瘤组织中, 组蛋白标记总体水平的下降,如,H3K9Ac、H3K18ac、 H3K4me1,H3K4me2,H3K9me2,H3K9me3,H4K5ac,h4k8ac, H4K16ac,H4K20me3,和H4R3Me2与许多癌症患者的不良预后 有关。文章还表示组蛋白甲基化和乙酰化水平的下降可能导致 癌细胞的转移,因为癌细胞的增值速率很快而且癌细胞内大分 子生物合成反应可能耗尽供体甲基化和乙酰化的水平,如 AcCoA
组蛋白修饰与癌症预后
肺癌
在美国,肺癌和支气管癌的死亡率比任何其他癌症都要高。 美国癌症协会估计,2012年男性和女性的肺癌和支气管肺癌死亡 人数分别占29%和26%。原发性非小细胞肺癌(NSCLC)是亚洲和 西方人群恶性肿瘤相关死亡的主要原因 。临床病理学分析结果表 明, 非小细胞肺癌组织低水平的H3K9ac, H3K9me3和H4K16ac和 肿瘤复发呈正相关。根据患者的组蛋白修饰模式发现乙酰化占主 导地位组具有较好的预后,但甲基化占主导地位组与不良预后相 关。此外,患有大细胞或鳞状细胞癌患者,其肿瘤中H3K4me2高 表达和腺癌较低水平的H3K9ac提高了的I期病人生存率。
不同的组蛋白修饰酶进行的。该酶参与所谓的“写作”和“擦 除”这些可逆的标志,包括组蛋白乙酰转移酶(HATS)和组蛋 白去乙酰化酶(HDAC),组蛋白甲基转移酶(HMTS),组蛋白 去甲基化酶(HDMS),组蛋白泛素化酶以及去泛素化酶,都可 以识别和改变组蛋白尾部的氨基酸残基
胃癌
• 胃癌是一种常见的侵袭性恶性肿瘤,其预后较差。 2012年GC发生在美国估计有21300例新病例,估计 10540人死亡。胃腺癌的免疫组织化学分析表明, H3K9甲基化水平(H3K9me3)与肿瘤分期,淋巴管浸 润,肿瘤复发呈正相关 。此外,基因组分析表明,高
表达的H3K9me3与低生存率呈正相关,这是转录抑制 的标志。芯片分析显示128个基因的H3K27me3水平差 异显著,有119个基因处于高水平表达(即MMP15、 UNC5B,和SHH)的标记和9个处于低水平表达• 通过文献综述表明,组蛋白翻译后修饰在肿瘤生物学中发挥 重要的作用,成为疾病亚型的显著预测因子。在肿瘤组织中, 组蛋白标记总体水平的下降,如,H3K9Ac、H3K18ac、 H3K4me1,H3K4me2,H3K9me2,H3K9me3,H4K5ac,h4k8ac, H4K16ac,H4K20me3,和H4R3Me2与许多癌症患者的不良预后 有关。文章还表示组蛋白甲基化和乙酰化水平的下降可能导致 癌细胞的转移,因为癌细胞的增值速率很快而且癌细胞内大分 子生物合成反应可能耗尽供体甲基化和乙酰化的水平,如 AcCoA
组蛋白修饰与癌症预后
肺癌
在美国,肺癌和支气管癌的死亡率比任何其他癌症都要高。 美国癌症协会估计,2012年男性和女性的肺癌和支气管肺癌死亡 人数分别占29%和26%。原发性非小细胞肺癌(NSCLC)是亚洲和 西方人群恶性肿瘤相关死亡的主要原因 。临床病理学分析结果表 明, 非小细胞肺癌组织低水平的H3K9ac, H3K9me3和H4K16ac和 肿瘤复发呈正相关。根据患者的组蛋白修饰模式发现乙酰化占主 导地位组具有较好的预后,但甲基化占主导地位组与不良预后相 关。此外,患有大细胞或鳞状细胞癌患者,其肿瘤中H3K4me2高 表达和腺癌较低水平的H3K9ac提高了的I期病人生存率。
蛋白质分子的化学修饰课件
磷酸酶
催化去磷酸化反应的酶,将蛋白 质上的磷酸基团去除。
蛋白质磷酸化修饰 磷酸化修饰的种类
调节蛋白质活性
磷酸化修饰可改变蛋白质 的构象或活性位点,从而 调节其功能。
参与信号转导
磷酸化修饰在细胞信号转 导过程中起着关键作用, 可影响细胞生长、分化、 代谢等过程。
蛋白质稳定性
磷酸化修饰可影响蛋白质 的稳定性,通过调节蛋白 质降解途径来影响细胞内 蛋白质水平。
2023
PART 04
蛋白质甲基化修饰
REPORTING
甲基化修饰的种类
赖氨酸甲基化
赖氨酸残基的ε-氨基上加上甲基 基团,包括单甲基化、二甲基化
和三甲基化。
蛋氨酸甲基化
蛋氨酸残基的α-氨基上加上甲基基 团,通常为N-甲基化。
精氨酸甲基化
精氨酸残基的胍基上加上甲基基团 ,包括N-甲基化和N,N-二甲基化。
2023
PART 03
蛋白质糖基化修饰
REPORTING
糖基化修饰的种类
O-糖基化
糖基磷脂化
发生在蛋白质的丝氨酸或苏氨酸的羟 基上,由糖苷酶催化。
将糖基连接到脂质分子上,形成糖脂 。
N-糖基化
发生在蛋白质的氨基上,由糖苷酶催 化。
糖基化修饰的酶类
糖基转移酶
催化糖基从供体转移到受体上。
糖苷酶
催化糖苷键的断裂,释放出糖基 。
泛素化
泛素化是指将泛素分子加到蛋 白质的特定位点上,可以调节 蛋白质的降解和功能。
甲基化
甲基化是指将甲基基团加到蛋 白质的特定位点上,可以调节 蛋白质的构象和与其他蛋白质
的相互作用。
蛋白质分子化学修饰的功能
调节蛋白质活性
调节蛋白质稳定性
催化去磷酸化反应的酶,将蛋白 质上的磷酸基团去除。
蛋白质磷酸化修饰 磷酸化修饰的种类
调节蛋白质活性
磷酸化修饰可改变蛋白质 的构象或活性位点,从而 调节其功能。
参与信号转导
磷酸化修饰在细胞信号转 导过程中起着关键作用, 可影响细胞生长、分化、 代谢等过程。
蛋白质稳定性
磷酸化修饰可影响蛋白质 的稳定性,通过调节蛋白 质降解途径来影响细胞内 蛋白质水平。
2023
PART 04
蛋白质甲基化修饰
REPORTING
甲基化修饰的种类
赖氨酸甲基化
赖氨酸残基的ε-氨基上加上甲基 基团,包括单甲基化、二甲基化
和三甲基化。
蛋氨酸甲基化
蛋氨酸残基的α-氨基上加上甲基基 团,通常为N-甲基化。
精氨酸甲基化
精氨酸残基的胍基上加上甲基基团 ,包括N-甲基化和N,N-二甲基化。
2023
PART 03
蛋白质糖基化修饰
REPORTING
糖基化修饰的种类
O-糖基化
糖基磷脂化
发生在蛋白质的丝氨酸或苏氨酸的羟 基上,由糖苷酶催化。
将糖基连接到脂质分子上,形成糖脂 。
N-糖基化
发生在蛋白质的氨基上,由糖苷酶催 化。
糖基化修饰的酶类
糖基转移酶
催化糖基从供体转移到受体上。
糖苷酶
催化糖苷键的断裂,释放出糖基 。
泛素化
泛素化是指将泛素分子加到蛋 白质的特定位点上,可以调节 蛋白质的降解和功能。
甲基化
甲基化是指将甲基基团加到蛋 白质的特定位点上,可以调节 蛋白质的构象和与其他蛋白质
的相互作用。
蛋白质分子化学修饰的功能
调节蛋白质活性
调节蛋白质稳定性
第四讲蛋白质的化学修饰(共94张PPT)
二、确定修饰程度和修饰部位
通过对被修饰蛋白质的降解和氨基酸分析后鉴定修饰部 位。
通过纯化被修饰蛋白质的氨基酸及其衍生物,测定其同位素标 记量或光谱强度或顺磁共振谱或荧光标记量等来确定反应程度 。
一般认为:测定被修饰的氨基酸,要比测定氨基酸的减少 量更准确。
三、化学修饰数据的分析
⒈化学修饰的时间进程曲线 以修饰时间对蛋白质活性作图
蛋白质构象改变会导致微区极性的局部改变,这 种改变对
Trp,Met和Cys的反应性影响最小; 对氨基和咪唑基的反应性影响较大; 而对Tyr,Hcys和COOH的反应性影响最大
。此外,极性的变化也影响到反应类型。
⑵氢键效应
氢键对维持天然蛋白质及其离子稳定性有重要影响, 氢键的变化也可能导致pK发生改变。
S er O H
O H O C C H 2 C H 2
N O 2
⑸局部环境的极性
溶剂极性可能与反应速度有关,如下表:
反应类型
降低极性对速度的影响
⒈RSR+ICH2CONH2
[R2S+CH2CONH2]I- 适当或大大降低
⒉RSR+H2O2
R2SO+H2O
没有影响
⒊RS-+ ICH2CONH2
⒈试剂选择
不同实验,对修饰的专一性要求也不同,因此选择试剂在很大程 度上要依赖修饰目的。
例如,对氨基的修饰,仅修饰氨基;仅修饰α-氨基;修饰暴露的 或反应性高的氨基。
一般通过选择试剂和反应条件来控制修饰的部位和程度
•如果希望改变蛋白质的带电状态或溶解性,应该选择能引入最大
电荷量的试剂。
•例如用顺丁烯二酸酐可将中性的巯基和酸性条件下带正电荷的氨基转变成
组蛋白的修饰ppt课件
组蛋白赖氨酸甲基化 组蛋白精氨酸甲基化
最新编辑ppt
4
组蛋白上的甲基化修饰
组蛋白赖氨酸甲基化 组蛋白精氨酸甲基化
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5
组蛋白赖氨酸甲基化修饰位点
组 蛋 白 赖 氨 酸 甲 基 化 主 要 发 生 在 组 蛋 白 H3 和H4上。目前研究较多的有6个位点, 其中 有5个存在于H3组蛋白,它们分别位于N-末端 (H3K4、H3K9、H3K27 和H3K36)和球状区域 中(H3K79),另一个位于H4组蛋白赖氨酸N 末 端的K20,还可发生在H1的N端。
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12
组蛋白精氨酸甲基化
催化组蛋白精氨酸去甲基酶主要有两个:一个是肽基精氨
酸去亚胺基酶4(peptide
arginine
deiminase
4,PADI/PAD4),它能将蛋白质内单甲基化的精氨酸脱去加
甲基和亚胺基,进而转化为瓜氨酸,因此这一过程常被称
为ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ亚胺基化(demination)或瓜氨酸化(citrullination)
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14
组蛋白 赖氨酸甲基 化似乎是基 因表达调控 较为稳定的 修饰,作用 也较复杂。
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15
组蛋白甲基化与组蛋白乙酰化 及DNA 甲基化的联系
关于组蛋白修饰与DNA甲基化之间的相互作用, 目 前 有 以 下 几 种 推 测 : 甲 基 化 的 CpG 连 接 蛋 白 (MBD)募集组蛋白去乙酰化酶复合物,使得组蛋 白尾端便于被HMTs甲基化;染色体上,组蛋白被 高度乙酰化,含有MBD的HMTs可直接结合组蛋白 并将其甲基化;甲基化的组蛋白尾端可募集 DNMTs,导致DNA甲基化,使基因长期沉默。
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4
组蛋白上的甲基化修饰
组蛋白赖氨酸甲基化 组蛋白精氨酸甲基化
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5
组蛋白赖氨酸甲基化修饰位点
组 蛋 白 赖 氨 酸 甲 基 化 主 要 发 生 在 组 蛋 白 H3 和H4上。目前研究较多的有6个位点, 其中 有5个存在于H3组蛋白,它们分别位于N-末端 (H3K4、H3K9、H3K27 和H3K36)和球状区域 中(H3K79),另一个位于H4组蛋白赖氨酸N 末 端的K20,还可发生在H1的N端。
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12
组蛋白精氨酸甲基化
催化组蛋白精氨酸去甲基酶主要有两个:一个是肽基精氨
酸去亚胺基酶4(peptide
arginine
deiminase
4,PADI/PAD4),它能将蛋白质内单甲基化的精氨酸脱去加
甲基和亚胺基,进而转化为瓜氨酸,因此这一过程常被称
为ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ亚胺基化(demination)或瓜氨酸化(citrullination)
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组蛋白 赖氨酸甲基 化似乎是基 因表达调控 较为稳定的 修饰,作用 也较复杂。
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组蛋白甲基化与组蛋白乙酰化 及DNA 甲基化的联系
关于组蛋白修饰与DNA甲基化之间的相互作用, 目 前 有 以 下 几 种 推 测 : 甲 基 化 的 CpG 连 接 蛋 白 (MBD)募集组蛋白去乙酰化酶复合物,使得组蛋 白尾端便于被HMTs甲基化;染色体上,组蛋白被 高度乙酰化,含有MBD的HMTs可直接结合组蛋白 并将其甲基化;甲基化的组蛋白尾端可募集 DNMTs,导致DNA甲基化,使基因长期沉默。
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组蛋白的修饰作用
甲基化转移酶简介
甲基化转移酶分为组蛋白赖氨酸甲基转移酶(HKMT)、组蛋 白精氨酸甲基转移酶(HRMT)2个家族;而多数蛋白甲基转移酶都 包含有SET结构域,含有SET结构域的蛋白主要功能是调节基因活 性,但具体机制还不甚明确。 核小体组蛋白在异染色体基因沉默中发挥关键作用,已有 研究表明很多含有SET结构域的蛋白,如人Suv39H1和裂殖酵母
组蛋白甲基化的功能: 1、组蛋白的甲基化有抑制或激活双重效应,这些效应是 由组蛋白甲基化的特定模式识别及结合核小体的蛋白质共同产 生的,并进一步修饰染色质或直接影响转录。 2、组蛋白的甲基化对促进DNA甲基化具有一定的作用。 DNA甲基化在转录水平可影响基因表达、参与真核生物胚胎发 育调节、参与基因组印记和X染色体失活及影响DNA与蛋白质 的相互作用。
H3K4的甲基化还可促进H3K9的乙酰化。相反,H3K9的甲基化
抑制了H3S10的磷酸化,并且抑制H3K9、H3K14的乙酰化,从 而导致基因沉默。
图3、组蛋白尾部不同修饰的交互作用类型
思考题:组蛋白的修饰及其在转录调控中的作用。(中科院03、10年考题)
Thank you very much!
组蛋白的修饰作用
一、组蛋白的定义:
组蛋白是染色体的结构蛋白,与DNA构成核小体。它分为 H1、H2A、H2B、H3和H4等5种。
二、组蛋白的特征:
1、进化上的极端保守性: 其保守程度比较:H1<H2A 、H2B<H3 、H4; 2、无组织特异性:
鸟、鱼、两栖类的红细胞染色体不含H1而含H5,精细胞
图1所示:
图1、组蛋白的乙酰化与去乙酰化过程
组蛋白乙酰化的生物学功能:
1)可改变蛋白质分子表面的电荷,影响核小体的结构,从
组蛋白修饰
的。
组蛋白乙酰化酶
(3)Hatl、Elp3、Hpa2和其他乙酰化酶
Hatl 最初被把它归为 B型组蛋白乙酰化酶,它主要涉及细 胞质组蛋白乙酰化,这些组蛋白与DNA共同参与细胞核中 染色质的形成。Hatl可以乙酷化组蛋白H4的N端第12位赖 氨酸,第12位赖氨酸也是之前发现的新合成的组蛋白乙酰 化过程中的主要位点。 Elp3是酵母A型乙酰化酶,似乎可以直接影响转录起始和 延伸,因为它是RNA聚合酶E全酶的组成部分。Elp3能够 乙酰化全部4个核心组蛋白。Elp3的作用机制可能与GenS 类似。Elp3在多种真核生物中的同源性以及进化保守性说 明它是非常重要的。
完整的中期染 色体
核小体
核小体是染色体的基本结 构单位,由 DNA 和组蛋白 (histone )构成,是染色 质(染色体)的基本结构 单位。 核小体由相对伸展的连接 DNA相连,形成串珠状 (称为一级结构)
核小体
二级结构是由一系列核小 体盘绕成螺旋并排列形成 30nm 纤维,在间期染色 质和有丝分裂染色体中都 可见到。 30nm的纤维状结构中的 |←二级结构→|← 一级结构 →| DNA 的压缩包装比约为 40 。 纤丝本身再进一步压缩后, 成为常染色质的状态时, DNA的压缩包装比约为 1000 。有丝分裂时染色质 进一步压缩为染色体,压 缩包装比高达 8400 ,即只 有伸展状态时长度的万分 之一。
组蛋白修饰
组蛋白修饰
组蛋白修饰
组蛋白修饰
组蛋白修饰种类
一. 二. 三. 四. 五.
组蛋白的乙酰化 组蛋白的甲基化 组蛋白的磷酸化 组蛋白的泛素化 组蛋白的SUMO化
一、组蛋白的乙酰化
乙酰化修饰是通过组蛋白乙酰化酶的催化作用实现 的。组蛋白乙酰化酶将乙酰CoA的乙酰基转移到组蛋 白N末端尾区内赖氨酸侧链的ԑ-氨基。
蛋白质的修饰和表达课件
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2
• 影响化学修饰的主要因素有两方面:
• 1、蛋白质功能基的活性反应,包括基团之间的氢 键和静电作用等,基团之间的的空间阻力。
• 2、修饰剂的反应活性。
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3
一、蛋白质侧链的化学修饰
• 在20种天然氨基酸的侧链中,大约有一半可以在足够温和 的条件下产生化学取代而不使肽键受损,其中氨基、巯基 和羧基特别容易产生有用的取代。
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16
• (一)亲和标记
• 亲和标记是一类位点专一性的化学修饰,试剂可 以专一性标记于酶的活性部位上,使酶不可逆的 失活,因此又称为专一性的不可逆抑制作用。
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17Βιβλιοθήκη • 这类抑制剂可分为两类:
• 一类是Ks型的不可逆抑制剂,它是根据底物的结构 设计的,它具有和底物结构相似的结合集团,同 时还具有和活性部位氨基酸残基的侧链基团反应 的活性基团。
基也可与该试剂发生反应。
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14
• 5、蛋氨酸主要是由于硫醚的硫原子的亲核性所引 起的,一些氧化剂可以使蛋氨酸氧化。
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15
二、蛋白质的位点专一性修饰
• 专一性包括两方面的含义:一是试剂对被修饰基 团的专一性;二是试剂对蛋白质分子中被修饰部 位,如膜蛋白质上的激素结合部位、酶的活性部 位等位点的专一性,一般这类试剂不仅具有对被 作用基团的专一性,而且具有对被作用部位的专 一性。这类专一性的化学修饰,称为亲和标记或 专一性的不可逆抑制作用。这类修饰试剂也被称 为位点专一性抑制剂。
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19
• (二)光亲和标记
• 这类试剂在结构上除了有一般亲和试剂的特点外, 还具有一个光反应基团。
组蛋白修饰及其功能(乙酰化,甲基化,磷酸化等)PPT演示幻灯片
分子效应:乙酰化可能通过对组蛋白电荷以及相互作用蛋 白的影响,增加组蛋白与DNA的排斥力,来调节基因转录。组 蛋白的乙酰化有利于DNA与组蛋白八聚体的解离,核小体结构 松弛,从而使各种转录因子和协同转录因子能与DNA结合位点 特异性结合,激活基因的转录。同时影响泛素与组蛋白的H2A 的结合,导致蛋白质的选择性降解。
9
10
组蛋白修饰的生物学意义
11
尤其是组蛋白乙酰化、甲基化修饰能为相关调控蛋白提供其在组蛋白上的附着位点,改变染色质结 构和活性。一般来说,组蛋白乙酰化能选择性的使某些染色质区域的结构从紧密变得松散,开放某 些基因的转录,增强其表达水平。而组蛋白甲基化既可抑制也可增强基因表达。乙酰化修饰和甲基 化修饰往往是相互排斥的。在细胞有丝分裂和凋亡过程中,磷酸化修饰能调控蛋白质复合体向染色 质集结。
组蛋白修饰及其功能
表观遗传学(epigentics)是研究不改变DNA序列而由于其外 部修饰引起的基因开放与否的学科,涉及的主要机制有DNA甲基 化、组蛋白修饰、基因印记、RNA干扰等。其中研究得最多是 DNA甲基化和组蛋白乙酰化、组蛋白甲基化,这些修饰与活化或 失活染色质的结构形成相关。
染色质是由许多核小体组成的,大部分真核生物中有5种富含 碱性氨基酸的组蛋白,即H1,H2A,H2B,H3和H4。H2A,H2B, H3和H4各2个分子构成的8聚体是核小体的核心部分,H1的作用是 与线形 DNA结合以帮助后者形成高级结构。
研究表明,组蛋白精氨酸甲基化是一种相对动态 的标记,精氨酸甲基化与基因激活相关,而H3和H4精 氨酸的甲基化丢失与基因沉默相关。相反,赖氨酸甲 基化似乎是基因表达调控中一种
1. H3-K9甲基化与异染色质的形成:人们曾针对异染色质的形成提出过一个模型:首先组蛋白 脱乙酰酶使H3中的K9、K14脱乙酰化,然后Suv39h1或Clr4对H32K9进行甲基化,H32K9的甲基 化再影响DNA的甲基化,随后甲基化的H32K9做为一个结合位点招募HP1或Swi6蛋白的定位, 最后HP1/Swi6通过它们的shadow染色质结合区域定位在C末端,进而形成异染色质的多聚体。 2. H32K9甲基化对常染色体中基因表达调控的影响: 3. 组蛋白其他位点上发生甲基化与基因表达的关系:大量实验表明H32K9甲基化的功能与基 因沉默有关,但其它位点甲基化可能存在激活转录作用。 4. 组蛋白甲基化与DNA甲基化:H32K9的甲基化可以直接或间接影响DNA 的甲基化,DNA 甲基化可能是组蛋白甲基化的间接结果
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组蛋白修饰的生物学意义
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尤其是组蛋白乙酰化、甲基化修饰能为相关调控蛋白提供其在组蛋白上的附着位点,改变染色质结 构和活性。一般来说,组蛋白乙酰化能选择性的使某些染色质区域的结构从紧密变得松散,开放某 些基因的转录,增强其表达水平。而组蛋白甲基化既可抑制也可增强基因表达。乙酰化修饰和甲基 化修饰往往是相互排斥的。在细胞有丝分裂和凋亡过程中,磷酸化修饰能调控蛋白质复合体向染色 质集结。
组蛋白修饰及其功能
表观遗传学(epigentics)是研究不改变DNA序列而由于其外 部修饰引起的基因开放与否的学科,涉及的主要机制有DNA甲基 化、组蛋白修饰、基因印记、RNA干扰等。其中研究得最多是 DNA甲基化和组蛋白乙酰化、组蛋白甲基化,这些修饰与活化或 失活染色质的结构形成相关。
染色质是由许多核小体组成的,大部分真核生物中有5种富含 碱性氨基酸的组蛋白,即H1,H2A,H2B,H3和H4。H2A,H2B, H3和H4各2个分子构成的8聚体是核小体的核心部分,H1的作用是 与线形 DNA结合以帮助后者形成高级结构。
研究表明,组蛋白精氨酸甲基化是一种相对动态 的标记,精氨酸甲基化与基因激活相关,而H3和H4精 氨酸的甲基化丢失与基因沉默相关。相反,赖氨酸甲 基化似乎是基因表达调控中一种
1. H3-K9甲基化与异染色质的形成:人们曾针对异染色质的形成提出过一个模型:首先组蛋白 脱乙酰酶使H3中的K9、K14脱乙酰化,然后Suv39h1或Clr4对H32K9进行甲基化,H32K9的甲基 化再影响DNA的甲基化,随后甲基化的H32K9做为一个结合位点招募HP1或Swi6蛋白的定位, 最后HP1/Swi6通过它们的shadow染色质结合区域定位在C末端,进而形成异染色质的多聚体。 2. H32K9甲基化对常染色体中基因表达调控的影响: 3. 组蛋白其他位点上发生甲基化与基因表达的关系:大量实验表明H32K9甲基化的功能与基 因沉默有关,但其它位点甲基化可能存在激活转录作用。 4. 组蛋白甲基化与DNA甲基化:H32K9的甲基化可以直接或间接影响DNA 的甲基化,DNA 甲基化可能是组蛋白甲基化的间接结果
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组蛋白的修饰作用
1
一、组蛋白的定义:
组蛋白是染色体的结构蛋白,与DNA构成核小体。它分为 H1、H2A、H2B、H3和H4等5种。
2
二、组蛋白的特征:
1、进化上的极端保守性: 其保守程度比较:H1<H2A 、H2B<H3 、H4;
2、无组织特异性: 鸟、鱼、两栖类的红细胞染色体不含H1而含H5,精细胞
DNA复制和重组过程发挥着直接的作用。组蛋白H1被细胞周期 蛋白依赖的激酶磷酸化是其主要的修饰作用。组蛋白H1的磷酸 化能够影响DNA二级结构的改变和染色体凝集状态的改变。另 外,组蛋白H1的磷酸化需要DNA复制,并且激活DNA复制的蛋 白激酶也促进组蛋白H1的磷酸化。因此,组蛋白H1的磷酸化与 DNA复制存在一个协同发生的机制。
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直到1996年,James Brownell 和David Allis 成功的纯化和鉴定 了一种组蛋白乙酰转移酶(Histone acetyltransferase HAT ),该 酶是从供体乙酰辅酶A上将乙酰基团转移到核心组蛋白上。
进一步研究得出HAT的两种作用机制: 1)使组蛋白H1、H2A、H4的氨基末端乙酰化,形成α-乙酰丝氨 酸;通常组蛋白在细胞质内合成后输入细胞核之前发生这一修 饰作用。 2)在组蛋白H2A、H2B、H3 和 H4 的氨基末端区域的某些专一位 置形成N6-乙酰赖氨酸。通常发生在蛋白质的赖氨酸(K)上。如下 图1所示:
由组蛋白甲基化的特定模式识别及结合核小体的蛋白质共同产 生的,并进一步修饰染色质或直接影响转录。
2、组蛋白的甲基化对促进DNA甲基化具有一定的作用。 DNA甲基化在转录水平可影响基因表达、参与真核生物胚胎发 育调节、参与基因组印记和X染色体失活及影响DNA与蛋白质 的相互作用。
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(二)组蛋白的乙酰化:
染色体的组蛋白是鱼精蛋白; 3、肽链上氨基酸分布的不对称性:
碱性氨基酸集中分布在N端的半条链上,而大部分疏水基 团都分布在C末端; 4、 组蛋白的修饰作;用 5、富含Lys的组蛋白H5;
3
三、组蛋白修饰作用:
组蛋白富含带正电荷的精氨酸和赖氨酸,可以与带有负 电荷的DNA分子紧密结合。每个核心组蛋白由一个球形结构 域和暴露在核小体表面的N端尾区组成,其 N 端氨基末端会 发生多种共价修饰,主要包括甲基化、乙酰化、泛素化、磷 酸化、ADP-核糖化和SUMO等。如图1所示:
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16
(三)组蛋白的泛素化: 1)定义:组蛋白的赖氨酸(k)残基位点与泛素分子的羧基端
相互结合的过程。 2)蛋白质泛素化过程:
17
3)泛素化组蛋白的转录调控作用:
18
4)组蛋白泛素化的生物学功能: 泛素化的组蛋白能够募集核小体到染色体、参与X染色体的
失活、影响组蛋白的甲基化和基因的转录。 例如,组蛋白H2–K120(酵母中为K123)的泛素化修饰是调
在蛋白激酶作用下与带负电荷的磷酸基团共价结合的修饰过程。 2)蛋白质的磷酸化过程:
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3)磷酸化组蛋白的分子效应:
A. 直接形成致密的 异染色质; B. 招募HP1,形成异 染色质; C. 促使组蛋白异构 体的替换。
21
4)组蛋白磷酸化的生物学功能: 组蛋白的磷酸化在有丝分裂、细胞死亡、DNA损伤修复、
7
组蛋白的甲基化过程:
8ห้องสมุดไป่ตู้
组蛋白的去甲基化过程:
组蛋白去甲基化酶可以催化组蛋白中赖氨酸和精氨酸单、双甲基化的 去甲基化,而三甲基化似乎不能被去甲基化。 组蛋白去甲基化酶的发现使 组蛋白甲基化过程更具动态性,也大大丰富了组蛋白修饰的复杂性。
9
组蛋白甲基化的功能: 1、组蛋白的甲基化有抑制或激活双重效应,这些效应是
22
(五)组蛋白各修饰的交互作用: 组蛋白的甲基化、乙酰化、泛素化和磷酸化会同时发生
在特定的核小体上。原则上说,每种特定的修饰组合能给细 胞传递不同的转录抑制或激活的信息。一定的组蛋白修饰对 其他邻近的修饰方式也产生影响。
例如:组蛋白H3S10的磷酸化促进H3K9与H3K14的乙酰化, 抑制H3K9的甲基化。H3K14的乙酰化与H3K4的甲基化均可进 一步抑制H3K9的甲基化,从而导致基因呈活化状态。同时, H3K4的甲基化还可促进H3K9的乙酰化。相反,H3K9的甲基化 抑制了H3S10的磷酸化,并且抑制H3K9、H3K14的乙酰化,从 而导致基因沉默。
甲基化转移酶分为组蛋白赖氨酸甲基转移酶(HKMT)、组蛋 白精氨酸甲基转移酶(HRMT)2个家族;而多数蛋白甲基转移酶都 包含有SET结构域,含有SET结构域的蛋白主要功能是调节基因活 性,但具体机制还不甚明确。
核小体组蛋白在异染色体基因沉默中发挥关键作用,已有 研究表明很多含有SET结构域的蛋白,如人Suv39H1和裂殖酵母 Clr4,都具有组蛋白甲基转移酶活性,并在组蛋白甲基化导致基 因沉默担当重要角色。
节组蛋白H3甲基化修饰及基因转录的开关。如果组蛋白H2– K120被泛素化修饰,则促进H3–K4甲基化修饰,有利于基因转 录的起始;然后H2–K120被去泛素化,促进H3–K36甲基化修饰, 有利于基因转录的延伸。
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(四)组蛋白的磷酸化: 1)定义:指组蛋白的丝氨酸(S)或苏氨酸(T)的残基位点
1964年,Vincent Allfrey 发现了组蛋白的乙酰化和乙酰 化两种形式。乙酰化发生在Lys侧链的氨基基团,并证明了 组蛋白的乙酰化与基因的活性有关,即非乙酰化组蛋白抑 制转录,而乙酰化组蛋白却是弱转录的抑制因子。这些结 果说明细胞核中的某些酶可使组蛋白发生乙酰化和去乙酰 化,从而影响基因的活性,但这个假说未得到证实。
4
图1、组蛋白的主要修饰方式
5
(一)组蛋白的甲基化: 定义:组蛋白甲基化是表观遗传修饰方式中的一种,参与基因转 录调控,通常发生在H3和H4组蛋白N端精氨酸或者赖氨酸残基上的 甲基化,由 组蛋白甲基转移酶 (histone methyltransferases,HMT) 介导催化。
6
甲基化转移酶简介
13
图1、组蛋白的乙酰化与去乙酰化过程
14
组蛋白乙酰化的生物学功能: 1)可改变蛋白质分子表面的电荷,影响核小体的结构,从
而调节基因的活性。乙酰化修饰调节基因活性的典型实例是雌 性哺乳动物个体的X染色体失活。
2)能导致组蛋白正电荷减少,消弱了它与DNA结合的能力, 引起核小体解聚,从而使转录因子和RNA聚合酶顺利结合到 DNA上。乙酰化作用还参与细胞周期的调控,而组蛋白的去乙 酰化作用可使基因沉默。
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一、组蛋白的定义:
组蛋白是染色体的结构蛋白,与DNA构成核小体。它分为 H1、H2A、H2B、H3和H4等5种。
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二、组蛋白的特征:
1、进化上的极端保守性: 其保守程度比较:H1<H2A 、H2B<H3 、H4;
2、无组织特异性: 鸟、鱼、两栖类的红细胞染色体不含H1而含H5,精细胞
DNA复制和重组过程发挥着直接的作用。组蛋白H1被细胞周期 蛋白依赖的激酶磷酸化是其主要的修饰作用。组蛋白H1的磷酸 化能够影响DNA二级结构的改变和染色体凝集状态的改变。另 外,组蛋白H1的磷酸化需要DNA复制,并且激活DNA复制的蛋 白激酶也促进组蛋白H1的磷酸化。因此,组蛋白H1的磷酸化与 DNA复制存在一个协同发生的机制。
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直到1996年,James Brownell 和David Allis 成功的纯化和鉴定 了一种组蛋白乙酰转移酶(Histone acetyltransferase HAT ),该 酶是从供体乙酰辅酶A上将乙酰基团转移到核心组蛋白上。
进一步研究得出HAT的两种作用机制: 1)使组蛋白H1、H2A、H4的氨基末端乙酰化,形成α-乙酰丝氨 酸;通常组蛋白在细胞质内合成后输入细胞核之前发生这一修 饰作用。 2)在组蛋白H2A、H2B、H3 和 H4 的氨基末端区域的某些专一位 置形成N6-乙酰赖氨酸。通常发生在蛋白质的赖氨酸(K)上。如下 图1所示:
由组蛋白甲基化的特定模式识别及结合核小体的蛋白质共同产 生的,并进一步修饰染色质或直接影响转录。
2、组蛋白的甲基化对促进DNA甲基化具有一定的作用。 DNA甲基化在转录水平可影响基因表达、参与真核生物胚胎发 育调节、参与基因组印记和X染色体失活及影响DNA与蛋白质 的相互作用。
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(二)组蛋白的乙酰化:
染色体的组蛋白是鱼精蛋白; 3、肽链上氨基酸分布的不对称性:
碱性氨基酸集中分布在N端的半条链上,而大部分疏水基 团都分布在C末端; 4、 组蛋白的修饰作;用 5、富含Lys的组蛋白H5;
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三、组蛋白修饰作用:
组蛋白富含带正电荷的精氨酸和赖氨酸,可以与带有负 电荷的DNA分子紧密结合。每个核心组蛋白由一个球形结构 域和暴露在核小体表面的N端尾区组成,其 N 端氨基末端会 发生多种共价修饰,主要包括甲基化、乙酰化、泛素化、磷 酸化、ADP-核糖化和SUMO等。如图1所示:
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(三)组蛋白的泛素化: 1)定义:组蛋白的赖氨酸(k)残基位点与泛素分子的羧基端
相互结合的过程。 2)蛋白质泛素化过程:
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3)泛素化组蛋白的转录调控作用:
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4)组蛋白泛素化的生物学功能: 泛素化的组蛋白能够募集核小体到染色体、参与X染色体的
失活、影响组蛋白的甲基化和基因的转录。 例如,组蛋白H2–K120(酵母中为K123)的泛素化修饰是调
在蛋白激酶作用下与带负电荷的磷酸基团共价结合的修饰过程。 2)蛋白质的磷酸化过程:
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3)磷酸化组蛋白的分子效应:
A. 直接形成致密的 异染色质; B. 招募HP1,形成异 染色质; C. 促使组蛋白异构 体的替换。
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4)组蛋白磷酸化的生物学功能: 组蛋白的磷酸化在有丝分裂、细胞死亡、DNA损伤修复、
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组蛋白的甲基化过程:
8ห้องสมุดไป่ตู้
组蛋白的去甲基化过程:
组蛋白去甲基化酶可以催化组蛋白中赖氨酸和精氨酸单、双甲基化的 去甲基化,而三甲基化似乎不能被去甲基化。 组蛋白去甲基化酶的发现使 组蛋白甲基化过程更具动态性,也大大丰富了组蛋白修饰的复杂性。
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组蛋白甲基化的功能: 1、组蛋白的甲基化有抑制或激活双重效应,这些效应是
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(五)组蛋白各修饰的交互作用: 组蛋白的甲基化、乙酰化、泛素化和磷酸化会同时发生
在特定的核小体上。原则上说,每种特定的修饰组合能给细 胞传递不同的转录抑制或激活的信息。一定的组蛋白修饰对 其他邻近的修饰方式也产生影响。
例如:组蛋白H3S10的磷酸化促进H3K9与H3K14的乙酰化, 抑制H3K9的甲基化。H3K14的乙酰化与H3K4的甲基化均可进 一步抑制H3K9的甲基化,从而导致基因呈活化状态。同时, H3K4的甲基化还可促进H3K9的乙酰化。相反,H3K9的甲基化 抑制了H3S10的磷酸化,并且抑制H3K9、H3K14的乙酰化,从 而导致基因沉默。
甲基化转移酶分为组蛋白赖氨酸甲基转移酶(HKMT)、组蛋 白精氨酸甲基转移酶(HRMT)2个家族;而多数蛋白甲基转移酶都 包含有SET结构域,含有SET结构域的蛋白主要功能是调节基因活 性,但具体机制还不甚明确。
核小体组蛋白在异染色体基因沉默中发挥关键作用,已有 研究表明很多含有SET结构域的蛋白,如人Suv39H1和裂殖酵母 Clr4,都具有组蛋白甲基转移酶活性,并在组蛋白甲基化导致基 因沉默担当重要角色。
节组蛋白H3甲基化修饰及基因转录的开关。如果组蛋白H2– K120被泛素化修饰,则促进H3–K4甲基化修饰,有利于基因转 录的起始;然后H2–K120被去泛素化,促进H3–K36甲基化修饰, 有利于基因转录的延伸。
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(四)组蛋白的磷酸化: 1)定义:指组蛋白的丝氨酸(S)或苏氨酸(T)的残基位点
1964年,Vincent Allfrey 发现了组蛋白的乙酰化和乙酰 化两种形式。乙酰化发生在Lys侧链的氨基基团,并证明了 组蛋白的乙酰化与基因的活性有关,即非乙酰化组蛋白抑 制转录,而乙酰化组蛋白却是弱转录的抑制因子。这些结 果说明细胞核中的某些酶可使组蛋白发生乙酰化和去乙酰 化,从而影响基因的活性,但这个假说未得到证实。
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图1、组蛋白的主要修饰方式
5
(一)组蛋白的甲基化: 定义:组蛋白甲基化是表观遗传修饰方式中的一种,参与基因转 录调控,通常发生在H3和H4组蛋白N端精氨酸或者赖氨酸残基上的 甲基化,由 组蛋白甲基转移酶 (histone methyltransferases,HMT) 介导催化。
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甲基化转移酶简介
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图1、组蛋白的乙酰化与去乙酰化过程
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组蛋白乙酰化的生物学功能: 1)可改变蛋白质分子表面的电荷,影响核小体的结构,从
而调节基因的活性。乙酰化修饰调节基因活性的典型实例是雌 性哺乳动物个体的X染色体失活。
2)能导致组蛋白正电荷减少,消弱了它与DNA结合的能力, 引起核小体解聚,从而使转录因子和RNA聚合酶顺利结合到 DNA上。乙酰化作用还参与细胞周期的调控,而组蛋白的去乙 酰化作用可使基因沉默。