适用于野生软枣猕猴桃遗传多样性分析的SSR引物筛选
猕猴桃野生居群的SSR分析初报
猕猴桃野生居群的SSR分析初报栗琪;李作洲;黄宏文【期刊名称】《植物科学学报》【年(卷),期】2004(022)002【摘要】采用SSR分子标记技术对我国猕猴桃的2个商业栽培物种--中华猕猴桃和美味猕猴桃的9个天然居群(共221个样)的遗传多样性进行了初步分析.通过对14对猕猴桃引物的筛选,8对重现性好的引物扩增结果表现出良好的多态性.在8个多态性位点上共获得222个等位基因.居群等位基因平均数A=17.3,多态位点百分率P=100,多态信息指数PIC为0.87~0.96,显示出我国的猕猴桃野生居群具有极高的遗传多样性.中华猕猴桃和美味猕猴桃野生居群拥有高比例的共同等位基因,反映出二者的亲缘关系极近.【总页数】4页(P175-178)【作者】栗琪;李作洲;黄宏文【作者单位】中国科学院武汉植物园,武汉,430074;中国科学院武汉植物园,武汉,430074;中国科学院武汉植物园,武汉,430074【正文语种】中文【中图分类】Q347;S663.4【相关文献】1.野生大麻居群遗传多样性ISSR分析的取样策略 [J], 张庆滢;郭蓉;陈璇;许艳萍;郭孟璧;郭鸿彦;杨明2.野生大麻居群遗传多样性ISSR分析的取样策略 [J], 张庆滢;郭蓉;陈璇;许艳萍;郭孟璧;郭鸿彦;杨明;3.福建中部3个野生蕉自然居群基于NTSYS和STRUCTURE软件的ISSR分析[J], 赖恭梯;赖钟雄;刘炜婳;叶炜;林玉玲;刘生财;陈裕坤;张梓浩;吴高杰4.福建东南部野生蕉7个自然居群289份样品的ISSR分析 [J], 陈红俊;赖钟雄;刘炜婳;赖恭梯;张梓浩;叶炜;刘生财;林玉玲5.天山樱桃野生居群遗传多样性SSR分析 [J], 李春侨;周龙;陆彪;董凯向;刘春燕因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A001[发明专利]
专利名称:用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A001
专利类型:发明专利
发明人:黄宏文,张琼,钟彩虹,龚俊杰,刘春燕
申请号:CN201410525014.5
申请日:20140930
公开号:CN104293942A
公开日:
20150121
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明公开了一种用于猕猴桃杂交群体雌雄性别鉴定的SSR分子标记A001,涉及分子遗传育种技术领域。
本分子标记A001在雌株中扩增得到的特异片段核苷酸序列如SEQ.IDNo1所示;所述标记的引物序列如SEQ.IDNo2和SEQ.IDNo3所示。
本分子标记A001可用于猕猴桃雌雄性别的早期鉴定检测,避免大量雄株在育种和生产中造成极大的浪费;利用高密度遗传图谱,能快速发掘性别相关的分子标记用于辅助育种,为功能标记的开发提供了重要的实践经验;本分子标记A001用于雌雄性别标记辅助选择,将大大提高育种中雌株的选择效率,缩短育种周期,具有很大的应用潜力和较高的经济价值。
申请人:中国科学院武汉植物园
地址:430074 湖北省武汉市武昌磨山
国籍:CN
代理机构:武汉宇晨专利事务所
代理人:黄瑞棠
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猕猴桃的遗传转化研究以及SSR分子标记在其遗传多样性中的应用
猕猴桃的遗传转化研究以及SSR分子标记在其遗传多样性中的应用摘要:猕猴桃栽培品种存在一定的缺陷,利用遗传转化技术对猕猴桃品质特性改良具有广泛的应用前景。
对猕猴桃目的基因的分离,猴桃遗传转化的基本方法和研究进展以影响猕猴桃转化效率的因素进行了总结,并对猕猴桃遗传转化需解决的问题进行了探讨。
综述了SSR标记技术在猕猴桃群体遗传多样性研究、基因连锁图谱的构建、种质资源鉴定以及分子标记辅助育种等方面的应用概况,并在此基础上提出了今后猕猴桃育种发展的方向。
关键词:猕猴桃;遗传转化;SSR;猕猴桃;遗传多样性猕猴(Actinidia)属猕猴桃科猕猴桃属植物,其风味独特,营养丰富,Vc含量高,有一定保健功效,因而倍受关注。
我国猕猴桃栽培面积居世界第一位,产量排第二位。
目前,猕猴桃的栽培品种往往存在某些性状缺陷,如耐贮藏性和抗逆性较差等。
通过常规育种方法改良往往周期长、工作量大、效率较低,很难满足生产发展的需要。
采用遗传转化技术培育新品种,有几个明显的优点:首先,它可以有目的、有计划地引入优良性状而不需要改变原有的其它特性;其次,它可以突破物种障碍,把许多原来植株中没有的基因引入;另外,它可以在幼苗期对转化植株进行筛选和鉴定,大大缩短了得到稳定遗传的新品种所需要的时间。
因此,遗传转化技术为猕猴桃种质改良开辟了一条新的途径,其将大大缩短猕猴桃的育种年限,扩展猕猴桃的育种范围,拓宽猕猴桃的基因资源,从而大力推动猕猴桃育种工作的进程。
一直以来,我国乃至世界上的主要栽培品种比较单一,引种区域相对狭小,此外,由于猕猴桃属中普遍存在自发的种间杂交和种内多倍化的现象,因此不同学者对该属植物种的界定及亲缘关系存在不同的看法。
分子标记技术是猕猴桃群体遗传结构分析、物种遗传多样性鉴定、遗传基因连锁图谱构建以及分子标记育种等方面的理想工具。
利用分子标记技术分析生物个体之间DNA序列差别并用于作图的研究始于1980年。
经过多年的发展,现在的DNA标记技术已有10多种,其中简单重复序列(SSR)或称微卫星DNA、简单串联重复序列(STRP)是高等真核生物基因组中种类多、分布广、具有高度的多态性和杂合度的分子标记技术,比RFLP和RAPD分子标记具有更丰富的多态性,呈孟德尔式遗传。
软枣猕猴桃性别相关的SRAP分子标记
软枣猕猴桃性别相关的SRAP分子标记作者:李旭吴松权姜明亮朴一龙来源:《江苏农业科学》2016年第08期摘要:以软枣猕猴桃成龄雌株、雄株叶片为试验材料,利用SRAP分子标记手段及SPSS 软件对统计数据进行聚类分析,结果表明,从初筛的80对引物中筛选出15对可稳定扩增出多态性条带的引物组合,19个雌、雄植株共得到77个条带,多态性条带为72个,多态率达到93.50%;雌株多态性比率为68.8%,雄株多态性比率为87.0%;me2-em1、me6-em6、me7-em5、me7-em7这4对引物的扩增结果表现出雌雄株间的多态性比率具有明显差异;供试的19个植株经聚类分析分成2组,2组中均有70%以上表现出相同的性别。
基于性别相关的SRAP 可以有效分辨出软枣猕猴桃雌株、雄株。
关键词:软枣猕猴桃;雌雄异株;性别鉴定;SRAP;分子标记中图分类号: Q943文献标志码:文章编号:1002-1302(2016)08-0069-03软枣猕猴桃[Actinidia arguta (Seib.et Zucc.)Plangch.ex Miq.]是猕猴桃科猕猴桃属中水平和垂直分布最广泛的多年生落叶藤本果树之一[1],我国南北各地、朝鲜、日本、俄罗斯均有分布,以我国东三省资源最为丰富,其中,小兴安岭和长白山山区较为多见,是珍贵的抗寒果树资源。
软枣猕猴桃果实富含维生素C、酚类物质、类胡萝卜素及多种矿质元素,具有一定的药用价值。
目前,软枣猕猴桃作为第3代猕猴桃,受到世界各国的广泛关注,其产业开发正蓬勃发展。
但是,软枣猕猴桃为雌雄异株植物,以雌株产果实,雌株的经济价值明显高于雄株,而软枣猕猕猴桃实生苗需要5~7年才能结果,童期漫长,且实生繁殖后代出现雌雄比约为1 ∶[KG-*3]4的性别分离[2],不利于生产需要。
雌雄异株和幼苗期雌雄无法辨别给软枣猕猴桃种质资源的改良和育种带来巨大困难,因此,软枣猕猴桃的性别鉴定在生产和遗传育种方面有着重要的意义。
使用SSR标记对猕猴桃品种和选择系的分子鉴定
使用SSR标记对猕猴桃品种和选择系的分子鉴定
谢国禄
【期刊名称】《作物育种信息》
【年(卷),期】2005(000)007
【摘要】为了确定遗传相似性,并评价遗传多样性和亲缘程度,本试验用9个简单序列重复(SSR)标记来调查了代表全世界90%以上猕猴桃生产的48个猕猴桃品种和选择系。
这9个SSR标记是多态的,并且检测到了总共213个等位基因,结果发现每个位点平均有23.7个等位基因,其变幅在9-38个等位基因。
【总页数】1页(P14)
【作者】谢国禄
【作者单位】无
【正文语种】中文
【中图分类】S663.4
【相关文献】
1.基于ISSR标记的猕猴桃品种r遗传多样性分析及指纹图谱构建 [J], 张安世;韩臣鹏;齐秀娟;张中海
2.SSR分子标记鉴定两系杂交水稻"荃两优2118"的种子纯度 [J], 王立广; 张翔; 黄贯刘; 汪仁举; 康圣好; 熊延军; 张奎
3.122份栽培桃品种(系)黄白肉性状的分子标记辅助鉴定 [J], 鲁振华;沈志军;牛良;潘磊;崔国朝;曾文芳;王志强
4.ISSR分子标记技术在桃品种鉴定中的应用 [J], 孙淑霞;李靖;陈栋;谢红江;涂美艳;
江国良
5.利用SCoT分子标记分析85个猕猴桃品种(系)及野生近缘种的遗传结构 [J], 王悦星;周婉莹;张文慧;吴婉婉;张晓娟;于月华
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枣品种鉴定技术规程ssr分子标记法
枣品种鉴定技术规程ssr分子标记法一、引言枣是中国传统的重要经济作物之一,具有丰富的营养价值和药用价值。
枣的品种鉴定对于枣的种质资源保护、品种选育和市场推广具有重要意义。
随着生物技术的发展,分子标记技术成为枣品种鉴定的重要手段之一。
其中,ssr分子标记法在枣品种鉴定中具有广泛应用和较高的准确性。
本文将详细介绍ssr分子标记法在枣品种鉴定中的技术规程。
二、ssr分子标记法概述ssr(Simple Sequence Repeat)又称微卫星,是DNA序列中重复出现的简单序列。
ssr分子标记法是一种基于PCR扩增的分子标记技术,通过扩增和分析ssr位点上的DNA序列差异,实现对枣品种的鉴定和遗传多样性分析。
ssr标记具有高度重复性、多态性强、稳定可靠等特点,被广泛应用于植物基因组研究和品种鉴定。
三、ssr分子标记法的实验步骤为了准确地进行枣品种鉴定,需要按照以下步骤进行实验:1. DNA提取•从枣叶片或嫩枝中提取总DNA。
•使用CTAB法、高盐法等常用的DNA提取方法。
•确保提取的DNA质量和纯度,以保证后续实验的准确性。
2. ssr引物设计和合成•根据已知的ssr序列进行引物设计。
•引物应具有良好的特异性和扩增性。
•可以通过商业合成或实验室自行合成。
3. PCR扩增•根据ssr引物序列设计PCR扩增反应体系。
•设置合适的PCR扩增程序和条件。
•使用阳性和阴性对照进行扩增反应的验证。
4. 电泳分析•将PCR扩增产物进行电泳分析。
•选择合适的琼脂糖凝胶和电泳条件。
•根据扩增产物的大小和带型特征进行品种鉴定。
四、ssr分子标记法的优势和应用ssr分子标记法在枣品种鉴定中具有以下优势和应用:1. 高度重复性ssr序列在基因组中高度重复,因此可以通过ssr分子标记法对枣品种进行高度重复性的鉴定。
2. 多态性强ssr序列具有多态性,不同品种之间的ssr位点会出现不同的DNA序列差异,因此可以通过ssr分子标记法对枣品种进行多态性鉴定。
软枣猕猴桃栽培品种DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析
软枣猕猴桃栽培品种DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析王丹丹;张彦文【期刊名称】《东北师大学报:自然科学版》【年(卷),期】2017(49)3【摘要】为了对软枣猕猴桃栽培品种进行分子鉴别及分析不同品种间的亲缘关系,采用对叶片直接进行PCR扩增的方法,利用EST-SSR分子标记技术构建了常见的42个软枣猕猴桃品种的数字指纹图谱和模式指纹图谱数据库(cluster project),并进行了遗传多样性分析.结果表明:利用21对软枣猕猴桃核心引物扩增所有品种的基因组,共检测到132个等位位点,包括122个多态性位点,多态性比率为92.4%.每对引物扩增出的等位位点数为3~8个,平均每对引物扩增6.28个基因型,扩增条带大小100~300bp,多态信息含量(polymorphism information content,CPIC)为0.721,基因流为1.454,平均杂合率为0.691.其中,7对引物,即ACAR2,ACAR13,ACAR53,ACAR75,ACAR92,ACAR112和ACAR120可作为指纹图谱构建的首选引物,利用其中的ACAR2,ACAR13,ACAR53和ACAR75以引物组合方式构建指纹图谱可区分42个品种.聚类分析表明在遗传距离0.64处42个品种被分为一类,在遗传距离0.81处分为4类.聚类结果与品种的特性及来源具有较高的一致性.【总页数】8页(P104-111)【关键词】软枣猕猴桃;EST-SSR标记;指纹图谱;遗传多样性;聚类分析【作者】王丹丹;张彦文【作者单位】辽东学院农学院;东北师范大学草地研究所【正文语种】中文【中图分类】Q663.4【相关文献】1.披碱草属牧草DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 [J], 张锐; 唐艾嘉; 解继红; 石凤翎; 赵彦2.披碱草属牧草DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 [J], 张锐; 唐艾嘉; 解继红; 石凤翎; 赵彦3.睡莲种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建 [J], 苏群; 杨亚涵; 田敏; 卜朝阳; 毛立彦; 张进忠; 潘介春; 卢家仕4.基于iPBS标记的石斛兰种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建 [J], 崔学强;唐璇;黄昌艳;邓杰玲;李秀玲;卢家仕;张自斌5.基于cpSSR标记的山药种质资源DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 [J], 张静珍;王连军;雷剑;柴沙沙;杨新笋;张文英因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
不同品种野生软枣猕猴桃最佳组培方法的研究
不同品种野生软枣猕猴桃最佳组培方法的研究刘延吉;郝桂杰;姜岩岩;田晓艳【期刊名称】《北方园艺》【年(卷),期】2012(000)017【摘要】以5个品种野生软枣猕猴桃(H1、H2、H3、H4和H5)茎段为外植体,采用6-BA和NAA的组合进行研究,筛选适宜于野软枣猕猴桃各品种快繁的最佳培养基,以期建立离体培养快繁体系.结果表明:品种和培养基对猕猴桃外植体扩繁有显著影响;H1在MS+6-BA 1.0 mg/L+NAA 0.2 mg/L的培养基中最适宜扩繁;H2在MS+6-BA 1.5 mg/L+NAA 0.2 mg/L的培养基中最适宜扩繁;H3和H4在培养基MS+6-BA 1.5 mg/L +NAA 0.3 mg/L中最适宜扩繁;H5在的培养基MS+ 6-BA 2.0mg/L+NAA 0.2mg/L中最适宜扩繁.【总页数】3页(P124-126)【作者】刘延吉;郝桂杰;姜岩岩;田晓艳【作者单位】沈阳农业大学生物科学技术学院,辽宁沈阳110866;沈阳农业大学生物科学技术学院,辽宁沈阳110866;沈阳农业大学园艺学院,辽宁沈阳110886;沈阳农业大学食品学院,辽宁沈阳110866【正文语种】中文【中图分类】S663.4【相关文献】1.扶桑组培最佳培养基配方及不同激素水平影响研究 [J], 谢晓蓉;张以顺;等2.青岛野生软枣猕猴桃与其他品种之间雄蕊及花粉特性的研究 [J], 刘猜; 辛华3.软枣猕猴桃"魁绿"品种组培微繁技术研究 [J], 胡皓; 张志东4.丹东地区不同品种软枣猕猴桃需冷量研究 [J], 常婧;张利萍;姜冬;潘丕克5.长白山野生软枣猕猴桃组培快繁技术研究 [J], 玄英实;周丽洁;周旭;李敏;张阳;朴雪梅;匙坤;金雪梅因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
8种软枣猕猴桃种质纯度鉴定
8种软枣猕猴桃种质纯度鉴定
王丹丹;杨东霞
【期刊名称】《西北农业学报》
【年(卷),期】2016(025)011
【摘要】采用SSR、EST-SSR和SRAP 3种分子标记鉴定8种软枣猕猴桃区试品种种子纯度,结果表明,EST-SSR引物多态性、稳定性好,可用于后续试验;8种软枣猕猴桃区试品种中DNA位点纯合率最高的是‘LD241’和‘LD126’,在受检的53个位点上,未检测到非纯合位点,DNA位点纯合率100%,‘宝贝星’最低(92.5%);而纯度最高的是‘LD126’和‘宝贝星’(95.8%),纯度最差的是‘绿珍珠'(70.8%),说明种子的纯度与DNA位点纯合率的相关性并不大,进一步明确种子生产纯度(去除异型株的纯度)与分子遗传纯度2个概念,为育种及减少农艺性状差异(一致性、稳定性)提供重要依据.
【总页数】7页(P1656-1662)
【作者】王丹丹;杨东霞
【作者单位】辽东学院农学院,辽宁丹东 118003;辽东学院农学院,辽宁丹东118003
【正文语种】中文
【中图分类】Q663.4
【相关文献】
1.利用基因组SSR分子标记对老芒麦品种(种质)鉴别和品种纯度鉴定 [J], 雷云霆;赵闫闫;喻凤;李媛;窦全文
2.棉花SSR标记种质资源纯度鉴定及遗传多样性分析 [J], 石建斌;周红;王宁;许庆华;乔文青;严根土
3.长白山软枣猕猴桃种质资源主要数量性状评价指标探讨 [J], 邵瞳; 刘香苏; 周嘉彬; 贾佳林; 朴一龙
4.软枣猕猴桃种质资源溃疡病抗性鉴定方法的建立与评价 [J], 温欣;秦红艳;艾军;王月;韩先焱;李昌禹
5.中韩野生软枣猕猴桃种质资源遗传多样性分析 [J], 赵成日
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枣品种鉴定技术规程ssr分子标记法
枣品种鉴定技术规程ssr分子标记法摘要:一、引言1.枣品种鉴定的重要性2.传统鉴定方法的局限性二、SSR 分子标记法简介1.SSR 分子标记法的原理2.SSR 分子标记法的优势三、枣品种鉴定技术规程1.SSR 分子标记法的实验流程2.SSR 分子标记法的数据分析四、应用案例与效果评价1.我国枣品种鉴定中的应用案例2.效果评价与展望正文:一、引言枣是我国广泛种植的一种果树,具有较高的经济价值和生态价值。
然而,由于枣品种繁多,且品种间形态特征差异较小,传统的鉴定方法往往难以准确区分。
因此,枣品种鉴定技术的研究具有重要的现实意义。
二、SSR 分子标记法简介SSR(Simple Sequence Repeat,简单序列重复)分子标记法是一种基于PCR 技术的分子生物学方法。
该方法通过检测DNA 序列中简单序列重复单元的数量差异,从而实现对不同品种的区分。
由于其具有较高的准确性和重复性,SSR 分子标记法在植物品种鉴定领域得到了广泛应用。
三、枣品种鉴定技术规程本技术规程主要采用SSR 分子标记法,对枣品种进行鉴定。
实验流程如下:1.样品收集:选取具有代表性的枣树样品,进行DNA 提取。
2.SSR 引物设计:根据枣基因组信息,设计针对不同品种的SSR 引物。
3.PCR 扩增:采用设计的SSR 引物,对样品DNA 进行PCR 扩增。
4.电泳检测:将扩增产物进行电泳分析,观察并记录分子大小差异。
5.数据分析:通过生物信息学方法对电泳结果进行处理,计算各品种间的相似性指数。
四、应用案例与效果评价近年来,我国在枣品种鉴定领域已成功运用SSR 分子标记法,为枣树的选育、繁殖、栽培及资源保护提供了有力支持。
实验证明,SSR 分子标记法具有较高的准确性和重复性,对于枣品种的鉴定具有良好的效果。
综上所述,SSR 分子标记法作为一种高效、准确的枣品种鉴定技术,在我国的枣产业中具有广泛的应用前景。
然而,本技术在实际应用中尚存在一定的局限性,如引物设计、实验操作等方面仍有待进一步优化。
软枣猕猴桃良种选育研究进展
软枣猕猴桃良种选育研究进展作者:冯健曾凡顺王嘉李程来源:《安徽农业科学》2015年第11期摘要论述了软枣猕猴桃良种选育和苗木繁育现状,提出软枣猕猴桃良种选育存在的问题及对策,旨在为软枣猕猴桃良种选育提供参考,促进软枣猕猴桃产业发展。
关键词软枣猕猴桃;良种选育;组织培养中图分类号 S663.4 文献标识码A 文章编号 0517-6611(2015)11-046-02软枣猕猴桃(Actinidia arguta),又名软枣子、藤瓜、藤枣、猕猴梨,属于猕猴桃科(Actinidiaceae)猕猴桃属(Actinidia)的多年生落叶藤本植物。
软枣猕猴桃是9种光果猕猴桃种类之一,珍贵的野生果中之王,被誉为“世界之珍果”。
软枣猕猴桃是猕猴桃属植物中在中国地域分布最广泛的野生果树之一。
软枣猕猴桃生长于海拔150~900 m 之间的阔叶林或针阔叶混交林中,分布于我国的东北、山东、华北、西北地区及长江流域各地,以我国东北三省的野生资源最为丰富,其中,小兴安岭和长白山山区较多见。
另外,朝鲜、日本、俄罗斯(远东地区)也有分布。
软枣猕猴桃营养丰富,维生素C含量高,素有“VC之王”的美誉,是一种上好的保健食品,具有较高的经济价值。
软枣猕猴桃的根、茎、叶及果实均可入药,具有一定的药用价值。
软枣猕猴桃还是一种优美的庭园观赏树,它的美观奇特远非一般花木可比,用于造园配景,可谓一绝。
另外,软枣猕猴桃花还可用来提取香料,也是丰富的蜜源植物[1]。
目前,由于资源保护、良种选育及配套丰产栽培技术等方面的原因,软枣猕猴桃产业发展进程相对迟缓,笔者通过对软枣猕猴桃良种选育现状进行论述,旨在为软枣猕猴桃良种选育及产业化提供理论指导。
1 软枣猕猴桃良种选育的现状国外对软枣猕猴桃资源的开发利用较早,并且进行了大量研究工作。
在软枣猕猴桃资源开发利用中,日本处于领先地位,有学者对日本境内分布的软枣猕猴桃资源进行了详细调查,发现日本各州县分布的软枣猕猴桃有2倍体、4倍体、6倍体、7倍体和8倍体,倍性上有很大的变异性。
基于SSR的云南野生猕猴桃种质资源亲缘关系分析
基于SSR的云南野生猕猴桃种质资源亲缘关系分析王连润;万红;陶磅;陈霞;李坤明;沙毓沧;丁仁展【期刊名称】《中国农学通报》【年(卷),期】2024(40)4【摘要】为探讨云南猕猴桃属种质资源的亲缘关系,采用SSR分子标记方法对70份云南野生猕猴桃种质资源的亲缘关系进行分析。
UPGMA聚类分析结果表明,70份猕猴桃种质资源在遗传相似系数0.17水平上可分为4个类群,类群Ⅰ共6份材料,包括滇东南麻栗坡的中越猕猴桃MLP001和MLP010、西畴的中越猕猴桃TSH-1和TSH-4,以及滇南屏边的中越猕猴桃PB001和PB005;类群Ⅱ共31份材料,主要包括滇东北的18份材料,滇西北的3份紫果猕猴桃TC-8、TC-1、TC-10,以及5份贡山猕猴桃CJ-11、CJ-13、CJ-7、CJ-3、CJ-2;类群Ⅲ共14份材料,主要包括滇东北的10份美味猕猴桃和中华猕猴桃系列材料,滇东的JZS-5、JZS-9及JZS-7,以及滇东南西畴的黄毛猕猴桃XPS-1;类群Ⅳ共19份材料,主要包括滇东北的16份材料,滇东南西畴的京梨猕猴桃XCFD-1及革叶猕猴桃XCFD-3,果实无被毛且果皮带斑点,果实较小,与其他类群具有较远的亲缘关系。
SSR分子标记反映了云南猕猴桃属70份种质资源间的遗传亲缘关系,其中一些材料按种类、资源分布地及形态学性状特征形成明显有规律的聚类关系。
【总页数】5页(P98-102)【作者】王连润;万红;陶磅;陈霞;李坤明;沙毓沧;丁仁展【作者单位】云南省农业科学院园艺作物研究所【正文语种】中文【中图分类】S666.4【相关文献】1.红阳猕猴桃与杭州地区部分野生猕猴桃种质的SSR分析2.基于SSR分子标记分析云南月季种质资源亲缘关系3.基于表型性状和SSR标记的茄子种质资源亲缘关系比对分析4.基于SSR分子标记的68份柚类种质资源亲缘关系分析5.基于SSR 标记的55份清远野生茶树种质资源遗传多样性和亲缘关系分析因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
猕猴桃属植物的cpSSR遗传多样性及其同域分布物种的杂交渐渗与同塑
生物多样性 2007, 15 (1): 1-22 doi: 10.1360/biodiv.060277 Biodiversity Science http: //猕猴桃属植物的cpSSR遗传多样性及其同域分布物种的杂交渐渗与同塑张田1, 2**李作洲1**刘亚令1, 3姜正旺1黄宏文1*1 (中国科学院武汉植物园, 武汉 430074)2 (中国科学院研究生院, 北京 100049)3(华中农业大学园艺林学学院, 武汉 430074)摘要: 同域分布的近缘物种常常发生杂交而导致种间基因渐渗, 从而对相关物种的自然居群遗传结构产生重要影响, 近缘种间的杂交渐渗已成为进化生物学和保护生物学关注的热点。
本研究采用8对cpSSR引物对我国西部高原台地向中东部丘陵平原过渡地带同域重叠分布的猕猴桃属(Actinidia)7个物种的自然居群遗传多样性、居群遗传结构和同域分布种间遗传分化进行了检测。
结果表明: (1)在6个多态性位点检测到18个等位基因形成的42个单倍型, 尽管各单倍型间显示了复杂的网状进化关系, 但还是具有明显的物种特异性; (2)各物种有丰富的cpSSR遗传多样性, 但种间存在较大差异, 绵毛猕猴桃(Actinidia fulvicoma var. lanata)的遗传多样性水平最高(P = 62.50%, h T =0.173, H T = 0.897), 美味猕猴桃(A.deliciosa)的最低(P = 37.5%, h T = 0.041, H T = 0.516); (3)尽管不同物种的居群分化程度存在较大差异, 但种内居群间存在明显分化(G ST为0.319–0.780, F ST为0.401–0.695), 居群间的基因流不足(N m为0.219–0.747<1); 其中以美味猕猴桃的居群遗传分化度最高(G ST = 0.780, F ST = 0.695); (4)遗传分化系数G ST(unordered alleles)与N ST(ordered alleles)无显著差异, 揭示本研究的大多数猕猴桃属物种不存在系统地理结构,与用Mantel检验得出的居群遗传距离和地理距离不存在显著性相关的结果一致; (5)除了中华/美味猕猴桃复合体(A. chinensis / A.deliciosa complex)的湖北五峰(HW)和广西资源(GZ)两个同域复合居群外, 同域分布的物种间遗传分化强烈(F ST为0.476–0.990), 与UPGMA聚类时多数居群按各自物种聚类的结果一致。
11个猕猴桃品种间的遗传多样性分析
11个猕猴桃品种间的遗传多样性分析邹游;丁建;申瑛;赵建;杨志荣;吴成【期刊名称】《应用与环境生物学报》【年(卷),期】2007(13)2【摘要】利用随机扩增多态性DNA标记(RAPD)技术对采自四川省猕猴桃科研基地的11个猕猴桃品种进行了遗传多样性分析.通过引物筛选,从15个RAPD引物中扩增出135条带,其中100条为多态带,占74.07%.UPGMA聚类分析结果揭示了各品种间的亲缘关系.RAPD标记说明猕猴桃品种间遗传距离与地理分布有一定关系,地理位置较近的材料能聚在一起.分子标记可用于猕猴桃种质资源的分类、鉴定及良种选育.【总页数】4页(P172-175)【关键词】猕猴桃;RAPD;遗传多样性;品种;地理分布【作者】邹游;丁建;申瑛;赵建;杨志荣;吴成【作者单位】四川大学生命科学学院;四川省自然资源研究所猕猴桃研究开发中心;四川申能科技有限责任公司【正文语种】中文【中图分类】Q949.758.2;S663.4【相关文献】1.基于ISSR标记的猕猴桃品种r遗传多样性分析及指纹图谱构建 [J], 张安世;韩臣鹏;齐秀娟;张中海2."十五"大豆创新种质和1963-1995年间育成品种的SSR遗传结构及遗传多样性分析 [J], 李英慧;刘燕;关荣霞;魏淑红;杨光宇;周新安;张孟臣;杨春燕;朱保葛;李卫东;刘学义;徐冉;孙君明;朱申龙;赵团结;刘章雄;常汝镇;邱丽娟3.软枣猕猴桃栽培品种DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析 [J], 王丹丹;张彦文4.甘啤系列啤酒大麦品种(系)与国外引进品种间遗传多样性的SSR分析 [J], 杨振华;漆燕玲;蒋玮5.中国小麦地方品种内和品种间醇溶蛋白遗传多样性分析 [J], 陶先萍;李洪杰;李秀全;杨欣明;李立会因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
枣品种鉴定技术规程ssr分子标记法
枣品种鉴定技术规程ssr分子标记法【实用版】目录1.枣品种鉴定技术规程简介2.SSR 分子标记法的原理3.SSR 分子标记法在枣品种鉴定中的应用4.SSR 分子标记法的优势与局限性正文一、枣品种鉴定技术规程简介枣品种鉴定技术规程是对枣的品种进行科学鉴定的一种方法,通过对枣的形态特征、生长习性、果实品质等方面进行分析,从而判断枣的品种。
在众多的鉴定方法中,SSR 分子标记法因其高度的准确性和便捷性,成为了枣品种鉴定的重要手段。
二、SSR 分子标记法的原理SSR,全称为简单序列重复,是一种在基因组中广泛分布的 DNA 序列重复单元。
SSR 分子标记法是基于 SSR 序列的遗传多态性,通过 PCR 技术扩增 SSR 片段,然后对扩增产物进行测序,根据测序结果的差异来判断枣的品种。
三、SSR 分子标记法在枣品种鉴定中的应用SSR 分子标记法在枣品种鉴定中的应用主要表现在以下几个方面:1.品种鉴别:通过 SSR 分子标记法,可以对枣的不同品种进行鉴别,提高品种的识别率。
2.亲缘关系分析:SSR 分子标记法可以用于分析枣的亲缘关系,为枣的遗传育种提供依据。
3.遗传多样性分析:SSR 分子标记法可以用于分析枣的遗传多样性,为枣的遗传资源保护和利用提供参考。
四、SSR 分子标记法的优势与局限性SSR 分子标记法在枣品种鉴定中具有以下优势:1.高度准确:SSR 分子标记法基于 DNA 序列的差异,具有较高的鉴定准确性。
2.高通量:SSR 分子标记法可以通过 PCR 技术大量扩增目标片段,提高鉴定效率。
3.简便快捷:SSR 分子标记法操作简便,结果直观,适合于大规模的品种鉴定。
然而,SSR 分子标记法也存在一定的局限性:1.需要特定的 SSR 序列:在鉴定前需要先了解和筛选出与品种鉴定相关的 SSR 序列。
2.鉴定成本较高:虽然 SSR 分子标记法操作简便,但其所需的仪器设备和试剂成本较高,对鉴定经费有一定要求。
3个野生毛花猕猴桃居群的SSR多样性分析
3个野生毛花猕猴桃居群的SSR多样性分析杨妙贤;潘伟明;周玲艳;刘文;叶婵娟;刘胜洪;万小荣;梁红【期刊名称】《华南师范大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2014(046)004【摘要】利用9对SSR引物对来自广东省河源市和平县上陵镇高峰和羊石、上陵镇桃源村及热水镇3个居群的野生毛花猕猴桃不同植株叶DNA进行PCR扩增,以分析野生毛花猕猴桃居群遗传多态性.结果表明,3个野生毛花猕猴桃居群的遗传多态性百分比在97.3%~98.9%之间,平均多态性信息量(polymorphism information content,简称PIC值)在0.846~0.880之间,其中,上陵镇高峰和羊石野生毛花猕猴桃居群的SSR多样性相对较高,平均PIC值为0.880;而上陵镇桃源村野生毛花猕猴桃居群的SSR多样性较低,平均PIC值为0.846;但3个野生毛花猕猴桃居群的多态性百分比差异不明显.这些结果显示,广东省和平县不同野生毛花猕猴桃居群间遗传多样性较高,保存了丰富的猕猴桃野生居群基因资源.【总页数】6页(P87-92)【作者】杨妙贤;潘伟明;周玲艳;刘文;叶婵娟;刘胜洪;万小荣;梁红【作者单位】仲恺农业工程学院生命科学学院,广州510225;仲恺农业工程学院生命科学学院,广州510225;仲恺农业工程学院生命科学学院,广州510225;仲恺农业工程学院生命科学学院,广州510225;华南农业大学农学院,广州510642;仲恺农业工程学院生命科学学院,广州510225;仲恺农业工程学院生命科学学院,广州510225;仲恺农业工程学院生命科学学院,广州510225;仲恺农业工程学院生命科学学院,广州510225【正文语种】中文【中图分类】Q311;Q145【相关文献】1.基于EST-SSR标记的贵州野生刺梨居群遗传多样性分析 [J], 张怀山;鄢秀芹;鲁敏;王道平;安华明2.猕猴桃野生居群的SSR分析初报 [J], 栗琪;李作洲;黄宏文3.江西野生毛花猕猴桃群体SSR遗传多样性研究 [J], 钟敏;陶俊杰;黄春辉;黄清;邹梁峰;廖光联;陈璐;徐小彪4.野生毛花猕猴桃雄株居群花粉形态观察 [J], 钟敏;谢敏;张文标;陶俊杰;黄春辉;朱博;徐小彪5.野生毛花猕猴桃雄花花器性状及SSR遗传多样性研究 [J], 钟敏;廖光联;李章云;邹梁峰;黄清;陈璐;黄春辉;陶俊杰;朱博;徐小彪因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
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Q i n R u i , L a i J u a n j u a n , L i Z u o z h o u , Ma n Y u p i n g , Wa n g Y a n c h a n g
t o t a l o f 1 4 1 ll a e l e we r e o b s e r v e d wi t h t h e a v e r a g e n u mb e r o f ll a e l e s f o r e a c h l o c i o f 9 . 4 a n d t h e a v e r a g e P I C o f 0 . 7 4 5 .
摘 要 为进一步研究野生软枣猕猴桃种 质资源的遗传 多样性 , 以软枣猕猴桃基 因组 D N A为模板 , 优化 了 S S R反
应体 系并确定 了反应 条件 , 筛选 出了多态性较高 的标记 . 从 来 自中华猕猴桃基因组的 6 5 对S S R引物初步筛选 出 l 5
对有较好扩增带 型、 增稳定 性好 的引物 , 其 中较好 多态性 的引物有 1 2对 . 用筛 选 的引物进一 步对 四川 天全二 郎 山 的野生软枣猕猴桃群体进行 了 S S R分析 , 在1 5个个体 中共检测 出了 1 4 1 个等位基 因 , 平均 每个位点检测 到 9 . 4个 等位基 因, 平均 P I C值 为 0 . 7 4 5 . 关键词 软枣猕猴桃 ;简单重复序列 ;引筛选 ; 等位基因
A c t i n i d i a s a mp l e s w e r e t h e n c o l l e c t e d f r o m E r l a n g s h a n o f Y a a n,S i c h u n ,a a n d a n a l y z e d u s i n g t h e a b o v e 1 5 p r i me r p a i r s .A
中图分类号 Q 9 4 3 文献标识码 A 文章编号 1 6 7 2 - 4 3 2 1 ( 2 0 1 3 ) 0 4 - 0 0 2 8 - 0 5
S S R P r i me r S c r e e n i n g f o r t h e An a l y s i s o f Ge n e t i c
( 1 S c h o o l o f L i f e S c i e n c e s , S o u t h — C e n t r a l U n i v e r s i t y f o r N a t i o n a l i t i e s ,
2 Ke y L a b o r a t o r y o f P l a n t Ge r mp l a s m E n h a n c e me n t a n d S p e c i a l t y Ag r i c u l t u r e ,W u h a n Bo t a n i c a l Ga r d e n,
V0 I . 3 2 No . 4 De c . 2 01 3
适 用 于 野 生 软 枣猕 猴 桃 遗 传 多样 性 分 析 的 S S R引物 筛 选
覃 瑞 , 赖娟娟 , 李作洲 , 满玉萍 , 王彦昌 ,
( 1 中南民族大学 生命科学学院, 武汉 4 3 0 0 7 4 ; 2中国科学院 武汉植物园, 植物种质创新与特色农业重点实验室 , 武汉 4 3 0 0 7 4 )
第3 2卷第 4期 2 0 1 3年 1 2月
中南 民族大学学报(自然科学版 ) J o u r n a l o f S o u t h - C e n t r a l U n i v e r s i t y f o r N a t i o n a l i t i e s ( Na t . S c i . E d i t i o n )
C h i n e s e A c a d e m y o f S c i e n c e s , Wu h a n 4 3 0 0 7 4 , C h i n a )
Ab s t r a c t I n o r d e r t o s t u d y t h e g e n e t i c d i v e r s i t y o f w i l d A c t i n i d i a a r g u t a g e r mp l a s m ,g e n o me DNA o f t h e w i l d s p c i e s w e r e u s e d a s t e mp l a t e or f d e c i d i n g t h e S S R r e a c t i o n c o n d i t i o n s a n d i d e n t i f y i n g t h e p o l y mo r p h i e ma r k e r s .F i f t e e n p a i s r o f p r i me s r we r e s c r e e n e d o u t f r o m s i x t y i f v e g e n o me S S R p r i me r s o f A. c h i n e n s i s ,a mo n g wh i c h t w e l v e p a i r s w e r e p o l y mo r p h i c .1 5