本地blast查找目的基因
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将目标RNA-seq数据载入到本地blast中
NCBI寻找同源物种目标基因
一、寻找同源序列
二、将同源序列作为种子序列并保存
以近缘物种的基因为种子序列,筛选RNA-seq中的目的基因
打开所查找的目的基因序号
根据序号查找Unigene序列
本地blast的方法寻找RNA-seq数据中的目的基因
Fra Baidu bibliotek
基本步骤
下载本地Blast软件并进行安装
将目标RNA-seq数据载入到本地blast中
用NCBI筛选近缘物种的目的基因
以近缘物种的基因为种子序列,筛选RNA-seq中的目的基因
下载本地Blast软件并进行安装
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast