猪DIO3基因的序列分析及与生产性状的关联分析
猪UCP3基因部分编码区序列分析及其单核苷酸多态与胴体、肉质性状的遗传效应
猪UCP3基因部分编码区序列分析及其单核苷酸多态与胴体、肉质性状的遗传效应涂荣剑;邓昌彦;熊远著【期刊名称】《遗传学报：英文版》【年(卷),期】2004(31)8【摘要】以猪解耦联蛋白基因 3(UCP3)作为控制猪胴体与肉质性状主基因的候选基因。
利用直接测序法对 4个品种猪骨骼肌中UCP3基因的部分编码区序列 (第 4外显子部分及第 5、6、7外显子全部片段 )进行比较分析 ,发现3个cSNP位点 ,其中ORF中第 84 2碱基的突变可导致相应编码氨基酸序列的改变 :甲硫氨酸→苏氨酸 ,选取此位点作为猪UCP3基因的多态位点。
用PCR SSCP检测方法在 3个品种猪中进行该cSNP位点多态性片段的基因型分型 ,结果显示在 3个猪群中表现出3种基因型 (AA、AB、BB) ,χ2 独立性检验结果表明 3种基因型在各品种间分布不一致 ,梅山猪同大白、长白猪分别比较差异极显著 (P <0 0 1) ;对大白×梅山资源家系F2 代 139头个体进行了该多态片段的基因型鉴定 ,并对其基因型与所检测个体相应的胴体、肉质性状采用GLM分析进行遗传效应研究 ,结果表明 :该基因对一些胴体、肉质性状有显著性影响 ,并且该基因以加性效应为主 (如 ,眼肌高度、背最长肌色值、系水力的加性效应都达显著水平 )。
因此 ,推测UCP3基因可能是影响猪胴体及肉质性状的主效基因或与主效基因紧密连锁的标记基因 ,并且能够在分子标记辅助选择中用于对猪胴体。
【总页数】6页(P807-812)【关键词】UCP3;cSNP;PCR-SSCP;遗传效应分析【作者】涂荣剑;邓昌彦;熊远著【作者单位】华中农业大学农业部猪遗传育种重点开放实验室【正文语种】中文【中图分类】S828.2【相关文献】1.猪HGD基因第14外显子单核苷酸多态性与胴体和肉质性状的关系 [J], 李建华;杨明生;徐宁迎2.猪UCP3基因第4内含子Bcc Ⅰ多态性检测及其与胴体和肉质性状的关联分析[J], 陈哲;于峰祥;于建宁;徐小波;王公金;徐宁迎3.猪HUMMLC2B基因第一内含子单核苷酸多态与胴体、肉质性状的相关分析 [J], 王军;邓昌彦;熊远著;左波;李凤娥;雷明刚;郑嵘4.猪解耦联蛋白基因3(UCP3)3'侧翼区突变位点多态性及其对胴体、肉质性状的影响 [J], 涂荣剑;邓昌彦;熊远著5.猪MRLC2基因内含子遗传多态性与胴体及肉质性状的关联分析 [J], 余文敏;谢红涛;徐永杰;李德臻;熊远著;杨明柳因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
猪生产性状相关SNP位点研究进展
第14卷第02期 南方农业2020年1月Vol.14 No.02 South China Agriculture Jan. 2020在经济动物的遗传育种过程中，科研工作者们致力于使用一些可靠的遗传标记（Genetic Maker ）来提高选择效率与效能，提高经济效益，其中单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism ，SNP ）现在已成为理想的遗传标记之一。
SNP 是指在基因组上由单个核苷酸变异引起的DNA 序列多态性，包括单个碱基的转换或颠换等形式，且其中最少出现一种等位基因的频率不小于1%。
我国是猪养殖大国，猪肉也是国民日常消费的主要肉类之一，2015年和2016年我国生猪存栏量分别为4.51亿头和4.35亿头。
面对如此大的市场，只要对猪某一个重要性状进行改良就可能带来巨大的经济效益。
检测、鉴定影响重要性状的SNPs 并标记应用于育种养殖中，可以加快遗传选育进度，提高经济效益。
基于此，就SNP 主要的检测、功能活性研究方法以及在影响猪重要性状上的研究进展进行综述。
1 SNP的研究内容1.1 SNP 的特性SNP 自身所具备的一些优良特性使得其在遗传分析中成为一类能够广泛应用的遗传标记，能够更加清晰地剖分研究复杂的数量性状、遗传疾病，构建第三代遗传图谱。
SNP 的优良特性有以下4点。
1）SNP 位点的丰富性。
SNP 数量众多且分布广泛，几乎遍布整个基因组，DNA 序列中任意一个核苷酸都可能发生变异。
据估计，基因组中每1 000个核苷酸就有1个SNP 。
2）SNP 适于快速、规模化筛查。
组成DNA 的碱基虽然有4种，但因为导致SNP 的通常只有两种碱基，所以这是一种二态的标记，即二等位基因。
由于SNP 的二态性，非此即彼，在进行基因筛选时往往只需要进行+/-分析，而不用分析片段的长度，这就利于发展快速的规模化自动化技术筛选。
3）SNP 等位基因频率易于估计。
由于SNP 的二态性，在任何种群中其等位基因的频率都是可以估计的。
《2024年北京黑猪FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状关联分析》范文
《北京黑猪FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状关联分析》篇一一、引言北京黑猪作为我国重要的地方猪种，其肉质特性一直备受关注。
近年来，随着分子生物学技术的发展，对猪种遗传特性的研究日益深入，特别是与肉品质相关的基因研究，已成为当前猪育种研究的热点。
其中，脂肪酸的合成与分解对肉品质的改善具有重要意义。
本文针对北京黑猪的FABP3和SCD基因进行多态性分析，探讨其与肉品质性状的关联。
二、材料与方法（一）实验材料选取北京黑猪作为研究对象，收集其肌肉组织样本及相应的肉品质性状数据。
（二）实验方法1. 基因组DNA提取及纯化2. FABP3和SCD基因PCR扩增及序列测定3. 多态性分析4. 统计分析三、结果与分析（一）FABP3和SCD基因的多态性分析通过PCR扩增和序列测定，我们得到了北京黑猪FABP3和SCD基因的序列信息。
经过多态性分析，发现FABP3基因存在多个SNP位点，而SCD基因也表现出一定的多态性。
（二）肉品质性状数据的统计与分析收集的肉品质性状数据包括肌肉颜色、脂肪含量、肌内脂肪含量、滴水损失等。
通过统计分析，我们发现这些性状与FABP3和SCD基因的多态性存在一定的关联。
（三）FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状的关联分析1. FABP3基因与肉品质性状关联分析通过对比不同基因型个体的肉品质性状数据，我们发现FABP3基因的某些特定基因型与肌肉颜色、肌内脂肪含量等性状存在显著关联。
例如，某基因型个体在肌肉颜色上表现出更深的颜色，同时肌内脂肪含量也相对较高。
2. SCD基因与肉品质性状关联分析类似地，SCD基因的不同基因型也与脂肪含量、滴水损失等性状存在关联。
某些基因型个体在脂肪含量上表现出较高的水平，而另一些则在滴水损失上表现出较低的损失率。
四、讨论根据实验结果，我们可以得出以下结论：北京黑猪的FABP3和SCD基因存在多态性，这些多态性与肉品质性状存在一定的关联。
具体而言，FABP3基因的某些特定基因型可能对肌肉颜色和肌内脂肪含量产生一定影响；而SCD基因则可能对脂肪含量和滴水损失等性状产生影响。
柯乐猪TAC3_第1_内含子多态对繁殖性状的影响
DOI：10.16174/j.issn.1673-4645.2023.03.018收稿日期：2023-05-16基金项目：贵州省科技支撑计划项目（黔科合支撑[2021]一般147）；贵州省生猪产业发展项目（黔财农[2021]157号、黔财农[2022]183号）；贵州省种业发展项目（黔农计财[2022]10号）；国家重点研发计划子课题项目（2022YFD1100308-01）作者简介：郭小江（1981-），男，贵州贵阳人，高级兽医师，主要研究方向为动物疫病防控*通信作者：张依裕（1976-），男，贵州黔西人，博士，教授，主要研究方向为动物遗传与育种柯乐猪TAC3第1内含子多态对繁殖性状的影响郭小江1熊力2谭元成3杨红文4杨齐心4杨酸3向进3张依裕3*(1贵州省草地技术试验推广站,贵州贵阳550000;2贵州省动物疫病预防控制中心,贵州贵阳550000;3贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025;4贵州省畜禽遗传资源管理站,贵州贵阳550000)摘要:TAC3基因参与哺乳动物繁殖相关的生命活动。
试验以78头初产柯乐猪为材料,通过PCR 产物直接测序和序列比对鉴定TAC3基因的遗传变异,分析遗传变异对繁殖性状的影响。
结果显示,在柯乐猪TAC3基因第1内含子中检测到1个中度多态位点:g.22329038T>C ,产生3种基因型TT 、TC 和CC ,TC 和T 分别为优势基因型和优势等位基因,基因型分布未偏离Hardy-Weinberg 平衡,TT 基因型个体的产活仔数显著高于CC 基因型(<0.05),其他指标在不同基因型间差异未能达到显著水平(>0.05),揭示g.22329038T>C 位点可能是柯乐猪产活仔数的一个重要分子标记。
关键词:柯乐猪;TAC3基因;多态性;繁殖性状中图分类号:S828文献标识码:A文章编号:1673-4645(2023)03-0090-04开放科学(资源服务)标识码(OSID ),扫一扫,了解文章更多内容Effects of TAC3Intron 1Polymorphism on Reproductive Traits in Kele PigsGUO Xiaojiang 1,XIONG Li 2,TAN Yuancheng 2,YANG Hongwen 4,YANG Qixin 4,YANG Suan 2,XIANG Jin 2,ZHANG Yiyu 2*（1Grassland Technology Experiment Extension Station of Guizhou Province,Guiyang 550000,China；2Center for Animal Disease Controland Prevention of Guizhou Province,Guiyang 550000,China;3Key Laboratory of Genetic Breeding and Reproduction of Plateau Moun-tain Animals,Ministry of Education,College of Animal Science,Guizhou University,Guiyang 550025,China;4Livestock and poultry Ge-netic Resources Management Station of Guizhou Province,Guiyang 550000,China)Abstract:TAC 3gene was involved in life activities related to mammalian reproduction.Direct sequencing of PCR products and se-quence alignment were implemented to identify the SNP of TAC3gene intron 1in 78Kele pigs and analyzed the influence of SNP locus on reproductive traits.The results showed that a moderately polymorphic site ofg.22329038T＞C was detected in intron 1of the TAC3繁殖力的高低决定了养猪生产效率和经济回报。
猪Leptin基因多态性及其与产仔性状的相关性分析
!!W;95$-是一种由 脂 肪 组 织 合 成 的 多 肽 类 激 素! 在调控动物体重'脂 肪 沉 积'能 量 代 谢'生 殖 生 理 等
方面具有重要作用 & )%!0* 探究该基因调控机 理!对 疾 病治疗和畜牧生产意义重大&国内外诸多学者进行
收 稿 日 期 0&%(!%%!&1 基金项目江苏省农业三新工程项目"NXOJ)0&%)*0/%#(江苏农牧科技职业学院青年科研 基 金"jQ%0%)#(江 苏 高 校 品 牌 专 业 建 设 工 程 资 助 项
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猪MMP9基因的多态性与产仔数性状的关联分析
猪MMP9基因的多态性与产仔数性状的关联分析作者：刘林清李庆岗苏世广周梅张威王重龙来源：《安徽农业科学》2023年第19期摘要通过比较序列测定法，在MMP9基因第10内含子发现C/T突变，建立了PCR-SmaI-RFLP分型技术，并在淮猪新品系Ⅱ猪种中进行多态性分型，分析其基因型频率和等位基因频率，检测该位点的多态性并与产仔数性状进行关联分析。
结果表明，在淮猪新品系Ⅱ豬群中，所有胎次产仔数呈TC>CC>TT的趋势，TC型个体的所有胎次产仔数显著高于CC型个体0.776头（P<0.05）。
因此，MMP9基因在淮猪新品系Ⅱ猪群中与产仔数性状显著相关，为提高猪产仔数性状提供一个有用的分子标记。
关键词猪；MMP9；产仔数；关联分析中图分类号 S814 文献标识码 A 文章编号 0517-6611（2023）19-0090-02doi：10.3969/j.issn.0517-6611.2023.19.018Analysis of Relationship between Polymorphisms of Porcine MMP9 Gene with Litter Size Trait LIU Lin-qing，LI Qing-gang，SU Shi-guang et al（Institute of Animal Husbandry and Veterinary Medicine，Anhui Academy of Agricultural Sciences，Anhui Provincial Key Laboratory of Livestock and Poultry Product Safety Engineering，Hefei，Anhui 230031）Abstract By comparision of the sequences of MMP9 gene，a C/T mutation in intron 10 was found and developed a PCR-SmaI-RFLP genotyping assay.Genotype frequencyies and allele frequencies of this SNP were investigated in new strain Huai pig Ⅱ.Association of the SNP and litter size was assessed in new strain Huai pig Ⅱ.Statistical analysis demonstrated that it showed the tendency of TC>CC>TT in all parity.In addition，those with the TC genotype had additional 0.776 piglets born compared to the CC animals（P<0.05） in new strain Huai pig Ⅱ.Therefore，MMP9 gene has significant associated with litter size in new strain Huai Pig Ⅱ，could be a useful molecular marker in selection for increasing litter size in pigs.Key words Pig;MMP9;Litter size;AssociationMMPs作为一类活性依赖于锌离子的肽链内切酶，在卵泡和子宫外组织的动态变化中发挥一定的调控作用。
猪UCP3基因第4内含子Bcc Ⅰ多态性检测及其与胴体和肉质性状的关联分析
猪UCP3基因第4内含子Bcc Ⅰ多态性检测及其与胴体和肉质性状的关联分析陈哲;于峰祥;于建宁;徐小波;王公金;徐宁迎【期刊名称】《江苏农业学报》【年(卷),期】2012(028)006【摘要】为研究UCP3基因与猪胴体和肉质性状的相关性,采用测序结合PCR-RFLP技术检测UCP3基因内含子4内单核苷酸多态性(SNP),并分析SNP在6个国内外猪种内的多态性分布.结果表明,首次发现—处由A→G突变导致的Bcc Ⅰ多态位点.该多态位点基因频率和基因型频率在国内外猪种的分布存在较大差异,在国外猪种中,G等位基因频率较高,地方猪种的A等位基因频率较高.相关性分析结果表明,在长白猪群中,UCP3基因与6～7肋背膘厚有极显著相关性(P＜0.01).在商品猪群内,UCP3基因与6～7肋背膘厚和肌内脂肪含量极显著相关(P＜0.01),而且在腰荐结合处,AG基因型个体背膘厚显著高于GG型个体(P＜0.05).因此推测,UCP3基因可能是影响猪脂肪性状的分子育种标记.【总页数】6页(P1338-1343)【作者】陈哲;于峰祥;于建宁;徐小波;王公金;徐宁迎【作者单位】江苏省农业科学院畜牧研究所,江苏南京210014;江苏省农业科学院畜牧研究所,江苏南京210014;江苏省农业科学院畜牧研究所,江苏南京210014;江苏省农业科学院畜牧研究所,江苏南京210014;江苏省农业科学院畜牧研究所,江苏南京210014;浙江大学动物科学学院,浙江杭州310029【正文语种】中文【中图分类】S828【相关文献】1.岔路黑猪UCP3基因的多态性及其对胴体、肉质性状的影响 [J], 张金枝;蔡兆伟;罗玉衡;徐宁迎;郭晓令;沈叶兴2.猪RTL1基因多态性及其与胴体、肉质性状的关联分析 [J], 乔木;程碧军;武华玉;胡华;吴俊静;刘贵生;梅书棋;彭先文3.猪解耦联蛋白基因3(UCP3)3'侧翼区突变位点多态性及其对胴体、肉质性状的影响 [J], 涂荣剑;邓昌彦;熊远著4.猪IGFBP2基因多态性及其与胴体、肉质性状的关联分析 [J], 杨华;徐珍;左波5.猪MRLC2基因内含子遗传多态性与胴体及肉质性状的关联分析 [J], 余文敏;谢红涛;徐永杰;李德臻;熊远著;杨明柳因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
猪SMYD3基因的克隆、序列分析及其对猪成纤维细胞增殖的影响
猪SMYD3基因的克隆、序列分析及其对猪成纤维细胞增殖的影响佘春;张艳;张彩玉;尹桂军;石德顺;李湘萍【摘要】试验旨在克隆猪SMYD 3(SET and MYND domain-containing protein 3)基因并对其进行序列分析,研究其对猪成纤维细胞增殖的影响.首先克隆猪SMYD 3基因,根据其他物种SMYD 3基因siRNA和shRNA序列,经同源性比对分析,获得两条猪SMYD 3基因shRNA序列,分别构建pSicoR-GFP-SMYD3 shRNA1/shRNA2表达载体,转染HEK293T细胞,利用实时荧光定量PCR分析干扰效率,筛选出抑制效率较好的shRNA,并构建pLVX-IRES-ZsGreen1-SMYD3及pSicoR-GFP-SMYD3 shRNA真核表达载体,同时分析SMYD 3基因对猪成纤维细胞的增殖作用,检测细胞Nanog、DNMT1及DNMT3a基因表达情况.结果显示,试验克隆得到1404 bp的猪SMYD 3基因编码区序列,生物信息学分析发现,德保猪SMYD 3基因与野猪、山羊和野耗牛相应氨基酸序列的同源性分别为99.5％、93.8％和92.9％.shRNA1/shRNA2均能显著抑制SMYD 3基因表达(P<0.05),抑制效果分别是34％和54％,选择pSicoR-GFP-SMYD3 shRNA2进行后续研究.通过脂质体转染法将构建的pLVX-IRES-Zs-Green1-SMYD3及pSicoR-GFP-SMYD3 shRNA真核表达载体导入HEK293T细胞,均可观察到清晰的绿色荧光.慢病毒感染细胞及实时荧光定量PCR结果显示,与空白对照组及阴性对照组相比,过表达SMYD3基因促进猪成纤维细胞增殖,Nanog和DNMT1基因表达显著升高(P<0.05);抑制SMYD3基因表达,细胞增殖受到抑制,Nanog、DNMT1、DNMT3a 基因表达显著降低((P<0.05),说明SMYD3基因的表达与猪成纤维细胞的增殖显著相关.【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2019(046)003【总页数】10页(P782-791)【关键词】SMYD3基因;shRNA;猪成纤维细胞;细胞增殖【作者】佘春;张艳;张彩玉;尹桂军;石德顺;李湘萍【作者单位】广西大学,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁530000;广西大学,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530000;广西大学,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530000;广西大学,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530000;广西大学,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530000;广西大学,亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530000【正文语种】中文【中图分类】Q785SMYD3(SET and MYND domain-containing protein 3)基因最早是由Hamamoto等在人类肝癌和结肠癌细胞中发现并命名，后来发现其具有H3K4甲基化转移酶活性，是SMYD蛋白家族中的一员[1-2]。
杜洛克猪PHKG1基因多态性及其与生产性状的关联性分析
杜洛克猪PHKG1基因多态性及其与生产性状的关联性分析洪渊1薛永钦2薛宏烽2邱定杰2王秀爱2阮国荣1*（1福建农业职业技术学院，福建福州350119；2福建省永诚华多种猪有限公司，福建福州350319）摘要PHKG1基因g.8283C>A位点是影响猪肉糖原酵解潜能及系水力的因果突变位点。
为评估该位点是否对其他生产性状有影响，采用RFLP技术检测该基因位点在153头杜洛克猪群体中的多态性，并分析不同基因型对体质量、日增重、背膘厚、眼肌面积及瘦肉率的影响。
结果表明：PHKG1g.8283C>A位点CC、AC、AA3种基因型频率分布分别为0.320、0.536、0.144，优势等位基因C的频率为0.588，劣势等位基因A的频率为0.412；PHKG1不同基因型对体质量、日增重、背膘厚、眼肌面积、瘦肉率均无显著影响（P>0.05）。
据此，为提高肉质性状，在兼顾体型外貌及性能测定的前提下，可尽快提高优势等位基因C的频率。
关键词杜洛克猪；PHKG1；多态性；生产性状中图分类号S828文献标识码A文章编号1007-5739（2023）08-0165-03DOI：10.3969/j.issn.1007-5739.2023.08.044开放科学（资源服务）标识码（OSID）：Polymorphism of PHKG1Gene and Its Association with Production Traits in Duroc Pigs HONG Yuan1XUE Yongqin2XUE Hongfeng2QIU Dingjie2WANG Xiuai2RUAN Guorong1*(1Fujian Vocational College of Agricluture,Fuzhou Fujian350119;2Fujian Yongcheng Waldo Pig Breeding Co.,Ltd.,Fuzhou Fujian350319) Abstract The g.8283C>A locus of the PHKG1gene is a causal mutation site that affects the glycolysis potential and hydraulic power of pork.Aiming to evaluate whether the site had an effect on other production traits,RFLP was used to detect the polymorphism of this gene locus in153Duroc pig populations,and the effects of different genotypes on body weight,daily gain,backfat thickness,eye muscle area and lean meat percentage were analyzed.The results showed that the frequency distribution of CC,AC and AA genotypes at PHKG1g.8283C>A locus was0.320,0.536and0.144 respectively,the frequency of dominant allele C was0.588,and the frequency of inferior allele A was0.412;different genotypes of PHKG1had no significant effect on body weight,daily gain,backfat thickness,eye muscle area and lean meat percentage(P>0.05).Therefore,in order to improve meat quality,the frequency of dominant allele C should be increased as soon as possible under the premise of taking into account body shape and performance measurement.Keywords Duroc pig;PHKG1；polymorphism;production trait随着生活水平的不断提高，人们对猪肉的消费观念也逐渐改变，对猪肉品质越来越重视。
山猪UCP3基因遗传变异及其与胴体、肉质性状的相关研究
山猪UCP3基因遗传变异及其与胴体、肉质性状的相关研究伍革民;许晓风;章熙霞;张雪娜【期刊名称】《江苏农业科学》【年(卷),期】2007(000)004【摘要】将猪解耦联蛋白3(UCP3)基因作为山猪肉质性状研究的候选基因之一,应用PCR-SSCP技术检测山猪及其杂种猪UCP3基因的多态性,对具有多态性的位点进行测序后,与其他品种猪UCP3基因序列进行比较分析.结果在山猪及其杂种中检测到2种UCP3 PCR-SSCP多态型,测序及比较分析后共找到19处多态位点,其中A型具有独特的4处多态位点.对5个品种猪UCP3基因共有的15处多态位点比较后发现,山猪的B型与长白猪的相应序列相似性最高,15处多态位点中有14处相同(只1567处有一个替换),山猪UCP3的A型与内江猪相应序列相似性最高,15处多态位点中有11处相同.对11个品种猪Ava Ⅰ的PCR-RFLP基因型分布进行比较,发现山猪与梅山猪、内江猪的分布较一致.利用SAS 6.12软件,对PCR-SSCP不同基因型个体胴体性状与肉质性状进行了显著性检验与多重比较,结果表明UCP3 PCR-SSCP不同基因型间肉质性状差异均不显著,在胴体性状中AA型背膘厚显著低于BB型,因此UCP3有可能作为胴体性状遗传标记用于标记辅助选择.【总页数】4页(P132-135)【作者】伍革民;许晓风;章熙霞;张雪娜【作者单位】南京师范大学生命科学学院,江苏南京,210097;云南农业大学动物科技学院,云南昆明,650201;南京师范大学生命科学学院,江苏南京,210097;江苏省南京市畜牧家禽研究所,江苏南京,210036;南京师范大学生命科学学院,江苏南京,210097【正文语种】中文【中图分类】S828.8【相关文献】1.猪UCP3基因第4内含子Bcc Ⅰ多态性检测及其与胴体和肉质性状的关联分析[J], 陈哲;于峰祥;于建宁;徐小波;王公金;徐宁迎2.岔路黑猪UCP3基因的多态性及其对胴体、肉质性状的影响 [J], 张金枝;蔡兆伟;罗玉衡;徐宁迎;郭晓令;沈叶兴3.秦川牛及其杂种牛UCP3基因SNPs检测及其与胴体、肉质性状的相关性 [J], 韩瑞华;昝林森4.猪解耦联蛋白基因3(UCP3)3'侧翼区突变位点多态性及其对胴体、肉质性状的影响 [J], 涂荣剑;邓昌彦;熊远著5.猪UCP3基因部分编码区序列分析及其单核苷酸多态与胴体、肉质性状的遗传效应 [J], 涂荣剑;邓昌彦;熊远著因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
猪ATF4基因多态性与生产性状的关联及基因表达分析
ｔ ｎｄ ｗ ｓ ｅｍ ｆｈ ｉａｉｎｃ ｄ ｎ（Ｔ ． ｅ ａ ｅ ｕ Ｃ －ｌ — Ｆ Ｐａ ａ ｓ ａｇ ｉ ， ａｄａｅ ｉ ｏ ｎｔ ａ ｏ ｅｉ ｔ ｔ ｏ ｏ Ａ Ｇ）Ｗｅｔ ｎｃ￣ｉ ｏ ｔ ＲＡ ｕＩ Ｒ Ｌ ｎ ｌ ｉ ｉ Ｌ ｒｅｗｈｔ Ｌ ｎ ｒｃ， ｏ ｒ ｔ ｎｉ ｏ ｈ ｄ Ｐ ｙ ｓｎ ｅ
标 记，文章 采用 Ｐ Ｒ方 法扩增 了 Ａ Ｆ Ｃ Ｔ ４基 因部分序 列，通过序 列 比对发 现在翻 译起 始密码 子 Ａ Ｇ 下游 １９ｂ Ｔ ５ ｐ 处存在 Ａ１９ 转换，通过 Ｐ ＲＡｕＩＲ Ｌ ５Ｇ Ｃ ．ｌ —Ｆ Ｐ对 大 白猪 、长 白猪 、梅 山猪和 通城猪 进行 酶切分 型， 现在 大 白猪 发
ｔ ｉｓ ｔ ｅ ｃ ｒ ｔ， ｈ ＤＮＡ ａ ｍｅ ｔ ｆ ｏ ｃｎ ａ ｆ ｇ ｎ ｐ ｒ ｉ ｅＡＴ ｓｃ ｏ ｅ ｎ ｅ ｕ ｎ ｅ ． ｅ ｕ ｎ ｅ ｃ ｍｐ ｒｓ ｎ ｒ ｖ ａ ｅ ｎＡ １ ９ ｓ ｂ ｔ ｕ ｒ ｏ Ｆ４ ｗａ ｌ ｎ ｄ ａ ｄ ｓ ｑ ｅ ｃ ｄ Ｓ ｑ ｅ ｃ ｏ ａ ｉｏ ｅ ｅ ｌｄ ａ ５ Ｇ ｕ ｓｉ — ｔ
猪健康生长和抗病性状遗传与表观遗传的调控机制研究
猪健康生长和抗病性状遗传与表观遗传的调控机制研究近年来，随着人们对食品安全和健康的重视，猪肉作为人们日常生活中重要的食品来源之一，也备受关注。
在保证猪肉质量和数量的前提下，如何通过遗传与表观遗传的调控机制来提高猪的健康生长和抗病性状，成为了研究的热点。
传统的遗传学研究主要关注基因水平上的遗传效应，即基因型决定表现型的关系。
而表观遗传学是研究染色质改变以及后代表现型和环境因素之间的关系。
这两种遗传机制相互影响，共同决定了猪的性状。
在基因水平上，研究发现猪的健康生长和抗病性状具有较高的遗传度，受到多个基因的影响。
例如，猪的体重、食欲、饮水量等与生长相关的性状，与一些生长相关基因（如GH、IGF、PEG10）有关；而抗病性状与多个信号通路相关基因（如IL-2、IL-6、IL-10、TNF等）存在关联。
同时，基因型间的相互作用以及基因与环境因素互作也对猪的性状产生影响。
在这种情况下，通过选择育种合适的猪种和优秀的猪只，可以提高猪的健康生长和抗病性状，但同时也存在基因型选择不当、基因进化速率慢等问题。
表观遗传学研究则关注基因表达调控的复杂性。
研究表明，基因表达受多种因素的影响，其中关键的是基因启动子上的甲基化（Methylation）修饰和发育调节相关的组蛋白修饰。
猪的健康生长和抗病性状的表观遗传学调控机制与这些修饰有关。
例如，研究表明，对于猪体内抵抗细菌的基因IL-10，其启动子上存在特异的DNA 甲基化修饰水平与序列。
通过这种方式，IL-10基因表达被调节，进而影响猪的抵抗力。
同时，研究表明，猪的生长过程中，身体组织和器官中的染色质修饰也可能影响猪的生长和发育。
总体而言，猪的健康生长和抗病性状遗传与表观遗传的调控机制非常复杂，存在多种因素综合作用的情况。
同时，研究这些机制为育种提供了理论基础和实践指导，使得猪的健康生长和抗病性状持续提高，为人们的食品安全和健康保障做出了贡献。
猪DIO3基因组织表达谱及印记分析
猪DIO3基因组织表达谱及印记分析作者：乔木武华玉黄京书彭先文杜德利李汉和张凯旋梅书棋来源：《湖北农业科学》2013年第21期摘要：采用荧光定量PCR方法分析了猪DIO3基因在组织中的表达状况。
结果表明，DIO3基因主要表达于背部脂肪组织，在肝脏、子宫、肾脏、心脏、小肠、肌肉和胃组织中呈中度表达，在脾脏和肺脏中表达量很低。
采用外显子687 bp处的A/C突变（A/C 687）检测该基因在猪胚胎组织中的印记状态，DIO3基因在所有组织中均表现为印记。
关键词：猪；DIO3基因；组织表达谱；印记分析中图分类号：Q78 文献标识码：A 文章编号：0439-8114（2013）21-5345-03Expression and Imprinting Analysis of Porcine DIO3 GeneQIAO Mu1，WU Hua-yu1，HUANG Jing-shu2，PENG Xian-wen1，DU De-li3，LI Han-he3，ZHANG Kai-xuan3，MEI Shu-qi1（1.Institute of Animal Husbandry and Veterinary/Hubei Key Laboratory of Animal Embryo Engineering and Molecular Breeding， Hubei Academy of Agricultural Sciences， Wuhan 430064，China； 2.Animal Husbandry and Veterinary Bureau of Hubei Province，Wuhan 430064， China；3.Wuhan Tianjian Agricultural Development Co.， Ltd.，Wuhan 430300，China）Abstract： Real-time RT-PCR was performed to analyze the porcine DIO3 gene tissue expression pattern. The porcine DIO3 gene was expressed predominantly in backfat， mildly in liver， uterus， kidney， heart， small intestine， muscle and stomach， and almost absent in spleen and lung by realtime fluorescence quantitative PCR. A single nucleotide polymorphism in exon （A/C687） was used to investigate imprinting status in porcine embryonic tissues. The results indicate that DIO3 was imprinted in all the tested tissues.Key words： pig； DIO3 gene； tissue expression； imprinting analysis甲状腺素脱碘酶Ⅲ（Deiodinase iodothyronine type Ⅲ，DIO3）能够使四碘甲状腺原氨酸（T4）和三碘甲状腺原氨酸（T3）内环脱碘导致甲状腺激素失活[1]，在甲状腺激素代谢过程中起着关键作用[2]。
猪的肉质与繁殖性状相关基因的研究的开题报告
猪的肉质与繁殖性状相关基因的研究的开题报告
题目：猪的肉质与繁殖性状相关基因的研究
一、研究背景
猪是我国最为重要的畜禽之一，对我国经济以及人们的生活都具有重要作用。
猪的肉质和繁殖性状是影响其经济价值的关键因素。
猪的肉质与繁殖性状相关的基因是
影响其表现的重要遗传因素。
通过研究猪的肉质与繁殖性状相关基因的作用机制，可
以为猪的育种和产业发展提供重要的理论和实践指导。
二、研究目的
本研究旨在通过对猪的肉质与繁殖性状相关基因的研究，探讨其遗传机制和作用方式，为猪的育种与产业发展提供指导和参考，促进猪的品种改良和提高猪的经济价值。
三、研究内容
1.对猪的肉质与繁殖性状相关基因的文献调研和分析，确定研究方向和重点。
2.采集代表性猪种样本，分离和纯化DNA，并通过分子生物学技术对猪的肉质与繁殖性状相关基因进行筛选和分析。
3.通过PCR扩增、测序、直接测序以及PCR-RFLP等方法进行基因型分析和比较，分析不同基因型与猪的肉质、繁殖性状的相关性。
4.通过构建表达谱分析、功能分析、蛋白质分析等方式分析猪的肉质与繁殖性状相关基因的作用机制。
5.通过CRISPR-Cas9编辑技术对猪的肉质与繁殖性状相关基因进行靶向编辑，验证其对猪肉质和繁殖性状的影响。
四、研究意义和应用价值
本研究对于猪的遗传育种和产业发展具有重要意义和应用价值：
1.为猪的品种改良提供理论依据和实验指导；
2.促进猪的肉质和繁殖性状的提高，提高猪的经济价值；
3.探讨猪的肉质与繁殖性状相关基因的作用机制，可以为其他畜禽的研究提供经验和参考。
贵州地方猪种UCP3基因多态性与肉质性状的相关性分析
１１ 实 验 动物 及 肉质 性 状分 析 ．
糯 谷猪 ３ ０头 、 萝
卜猪 ５ ０头 分别 采 自贵 州 省毕 节 地 区纳 雍 县 糯谷 猪
繁育 中心 、 仁 江 口县 萝 卜 种 场 ； 交 猪 ６ 铜 保 杂 ０头采
自花溪生 猪屠 宰场 。 卜 的体重为（ ．２１ ０６）ｇ 萝 猪 ７ ４ －２．１ ， ３ － ｋ 年 龄 为 （３８ ．）月 ；糯 谷 猪 体 重 为 （ ０ ．４± １ ． ±２６ １１ ９ １ ．３ ｋ ， 龄 为 （００±２ ７ 月 ； 交 猪 体 重 为 ０３ ）ｇ 年 １． ．） 杂
收稿 日期 ：０ ７ ０ － ６ 修回 日 ： ０ ７ １ — ０ ２ ０ — １０ ； 期 ２０ — ２ ２ 基 金项 目： 国家 自然科 学基金 项 目（０ ６ １４ ； ３ ５０ ０ ）贵州 省 “ 十一 五 ” 农
业 重大专 项科技 攻关计 划项 目（ 黔科 合 Ｎ Ｚ字 ２ ０ — ０ ２ ； ０ ５ ３ ０ ） 贵州省
单碱 基 突变（ — ｃ） 导致编码 的氨 基酸从 苏氨 酸 突变为甲硫 氨酸 。进 一步分析 ３种 基 因型与胴 体和 肉质性状之 Ｔ ， 间的相 关性 ， 明 Ａ 证 Ｂ基 因型个 体的 肉质 最优 ， 州地方猪 种的 大理 石纹 、 内脂肪 含量和嫩 度 ３项指标 显著优 贵 肌
于商品猪（ Ｐ＜００ ） 因此推测 ＵＣＰ ．１ ， ３基 因与贵 州地 方猪 种的 肉质 性状具 有相 关性 ， 可能是贵 州地方猪种 肉质性
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２０ 年 第 ４ 卷 第 期 ０８ ４ ３
Ｇｅ ｅｉ ｎ ｅ ｄｎ ｎ ｔ ｓａ ｄＢｒｅ ｉｇ・ 遗 髓 胄 翮 ｃ
贵州地方 猪种 Ｕ Ｐ Ｃ ３基 因多态性 与 肉质性状 的相关 性分析
《2024年北京黑猪FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状关联分析》范文
《北京黑猪FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状关联分析》篇一一、引言北京黑猪作为我国重要的地方猪种，其肉质优良、风味独特，深受消费者喜爱。
近年来，随着遗传育种技术的发展，基因多态性与肉品质性状的关联研究逐渐成为畜牧科学研究的热点。
本篇论文旨在分析北京黑猪的FABP3和SCD基因多态性，并探讨其与肉品质性状的关联，以期为北京黑猪的遗传育种和改良提供理论依据。
二、材料与方法1. 材料本研究所用实验材料为北京黑猪的肌肉组织样本及其相关肉品质性状数据。
2. 方法（1）基因组DNA提取：采用常规酚-氯仿法提取北京黑猪肌肉组织中的基因组DNA。
（2）PCR扩增及测序：针对FABP3和SCD基因设计特异性引物，进行PCR扩增，并对扩增产物进行测序。
（3）数据分析：对测序结果进行序列比对，分析基因多态性，并采用统计学方法分析基因型与肉品质性状的关系。
三、结果与分析1. FABP3和SCD基因多态性分析通过对北京黑猪的FABP3和SCD基因进行测序，我们发现这两个基因均存在多种基因型。
其中，FABP3基因有A、B、C 三种基因型，而SCD基因有D、E两种基因型。
不同基因型在北京黑猪中的分布存在显著差异。
2. 基因型与肉品质性状的关联分析我们将FABP3和SCD的不同基因型与北京黑猪的肉品质性状进行关联分析。
结果表明，FABP3基因的C型与肉质细嫩度呈正相关，而SCD基因的E型则与肌肉脂肪含量呈正相关。
此外，我们还发现不同基因型的组合对肉品质性状也有显著影响。
四、讨论本研究表明，北京黑猪的FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状存在关联。
FABP3基因的C型可能有助于提高肉质的细嫩度，而SCD基因的E型则可能增加肌肉的脂肪含量。
这些发现为进一步研究北京黑猪的遗传育种和改良提供了重要依据。
然而，本研究仅从遗传角度分析了基因多态性与肉品质性状的关联，实际生产中还需考虑环境、饲养管理等其他因素的影响。
五、结论本研究通过分析北京黑猪的FABP3和SCD基因多态性，探讨了其与肉品质性状的关联。
猪JMJD3基因的克隆、表达及其蛋白功能的初步研究
猪JMJD3基因的克隆、表达及其蛋白功能的初步研究猪JMJD3基因的克隆、表达及其蛋白功能的初步研究引言：转录调控是细胞分化和发育过程中的重要环节。
已有研究表明，许多基因家族在细胞分化过程中起到关键作用。
JMJD3是一个重要的转录因子，属于Jumonji域（JmjC）蛋白家族的成员。
JmjC蛋白家族在转录调控中发挥着重要的调控作用。
本研究的目的是克隆猪JMJD3基因并进一步探讨其在转录调控中的功能。
材料与方法：本研究使用成年猪的胸肌组织作为实验材料，通过PCR技术克隆了猪JMJD3基因的全长cDNA序列，并进行序列分析。
随后，使用真核表达载体将克隆得到的JMJD3基因转染至293T细胞系中，进一步验证其表达情况。
Western blotting分析测试JMJD3蛋白的存在。
结果：通过PCR技术，在猪的胸肌组织中成功扩增出了JMJD3基因的全长cDNA序列。
序列分析表明，该基因长度为1,800 bp，编码长度为600个氨基酸残基。
蛋白结构预测结果显示，JMJD3蛋白具有JmjC结构域，与其他物种的JMJD3蛋白高度保守。
将JMJD3基因转染至293T细胞系中后，使用Westernblotting分析发现，JMJD3蛋白成功表达。
讨论：JMJD3是一个具有JmjC结构域的蛋白家族成员，在转录调控中起到重要作用。
本研究成功克隆了猪JMJD3基因的全长cDNA序列，并进一步验证了其在293T细胞系中的表达情况。
此外，通过序列分析发现，猪JMJD3与其他物种的JMJD3蛋白残基高度保守。
这一结果暗示猪JMJD3蛋白可能在转录调控中具有相似的功能。
JMJD3蛋白被发现参与了多个细胞分化和发育过程的调控。
它可与转录因子和组蛋白修饰酶相互作用，影响染色质的结构和转录活性。
此外，JMJD3还被发现与某些疾病的发生和发展有关。
因此，进一步研究猪JMJD3蛋白的功能，对于深入了解其在猪胚胎发育和疾病发生中的作用具有重要意义。
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猪DIO3基因的序列分析及与生产性状的关联分析摘要:本研究获得了猪甲状腺素脱碘酶3(Deiodinase iodothyronine III,DIO3)基因1 568 bp的mRNA 序列,包含编码278个氨基酸的完整的开放阅读框(ORF)｡采用PCR-RFLP法检测外显子687 bp处的A/C突变(A/C687)在不同猪种中等位基因分布频率及与生产性状的关联分析｡结果显示,在国内猪种中C等位基因占优势,DIO3基因的多态与瘦肉率(LMP)､肥肉率(FMP)､瘦肥肉比率(RLF)､肩部膘厚(SFT)､第6-7腰椎间背膘厚(RFT)､臀部膘厚(BFT)､眼肌面积(LEA)､肌内脂肪含量(IMF)等脂肪沉积和胴体性状显著相关｡关键词:猪DIO3基因;克隆;基因频率;关联分析DIO3(甲状腺素脱碘酶3)基因在甲状腺激素代谢过程中起着核心作用[1],它使四碘甲状腺原氨酸(T4)和三碘甲状腺原氨酸(T3)内环脱碘导致甲状腺激素失活[2]｡DIO3基因通过调节甲状腺激素的代谢而影响机体生长发育及糖､脂肪､蛋白质等三大营养物质的代谢[3,4]｡DIO3基因位于Dlk1-Dio3印记簇最远端,在DLK1基因下游-800 kb处,该印记区域存在显著影响生长､繁殖等性状的QTLs[5-8]｡但DIO3对猪生产性状的影响报道有限,因此有必要探讨DIO3基因对猪生长､胴体等生产性能的影响｡1 材料与方法1.1 动物和组织样品基因克隆及SNP筛选的样品:大白猪(湖北省农科院畜牧兽医研究所原种猪场)､梅山猪(英山县绿源养猪专业合作社)2月龄肌肉组织提取DNA和RNA｡用于基因频率分析的样品:大白猪(湖北省农科院畜牧兽医研究所原种猪场)､长白猪(华中农业大学试验猪场)､梅山猪(英山县绿源养猪专业合作社)､阳新猪(阳新县种猪场)､皖南猪(英山县绿源养猪专业合作社)､监利猪(监利县种猪场)､鄂西黑猪(恩施种猪场)共186头,前腔静脉采血,提取DNA｡用于性状关联分析的样品:大白猪和梅山猪杂交产生的F2代群体(华中农业大学试验猪场)304头,分别提取个体DNA并做好性状记录｡1.2 猪DIO3基因的分离1.3 PCR-RFLP分析1.4 统计分析2 结果与分析2.1 猪DIO3基因序列分析2.2 多态性检测和关联分析采用PCR-RFLP的方法,在无相关性的7个品种186头猪中进行了多态性检测,结果表明在国内和国外猪种中等位基因频率存在显著差异,在国内猪种(梅山猪､阳新猪､皖南猪､监利猪和鄂西黑猪)中C等位基因占优势,在国外猪种(长白猪和大白猪)中A等位基因占优势(表2)｡在304头大白猪×梅山猪F2代资源家系中进行基因型与胴体性状和肉质性状的关联分析(表3),结果表明,此位点多态性与瘦肉率(LMP)､肥肉率(FMP)､瘦肥肉比例(RLF)､肩部膘厚(SFT)､第6-7腰椎间膘厚(RFT)､臀部膘厚(BFT)､眼肌面积(LEA)､背最长肌失水率(LD DLR)､背最长肌系水力(LD WHC)､股二头肌肌肉色值(BF MCV)以及背最长肌含水量(LD WC)等性状呈显著相关(P﹤0.05),与背最长肌肌内脂肪含量(LD IMF)呈极显著相关(P﹤0.01)｡与瘦肉率(LMP)､肥肉率(FMP)､瘦肥肉比例(RLF)､肩部膘厚(SFT)､第6-7腰椎间膘厚(RFT)､臀部膘厚(BFT)､眼肌面积(LEA)和股二头肌色值(BF MCV)等性状的加性效应显著相关(P﹤0.05),瘦肉率(LMP)､股二头肌色值(BF MCV)､背最长肌含水量(LD WC)等性状的显性效应呈显著相关(P﹤0.05),与背最长肌肉脂肪含量(LD IMF)性状的显性效应呈极显著相关(P﹤0.01)｡3 小结与讨论本研究分离了猪DIO3基因cDNA序列和部分调控序列,基因结构与人和小鼠相同,其编码区及推导的多肽与人和其他物种具有很高的相似性,催化中心具有催化活性所必需的丝氨酸残基[2,10,11]｡这种保守性说明其功能与其他物种相似,即具有调节甲状腺激素代谢的作用,从而调节机体生长发育和营养物质的代谢｡猪DIO3基因定位于SSC7的SW764附近[12],此区域存在着与猪的生产性状(如肌纤维直径､脂肪含量､胴体长､胴体重､皮质醇水平等)相关的QTLs[13],本研究发现该基因遗传多态与胴体性状和肉质性状呈显著相关,这与该基因定位结果相吻合｡AA基因型的猪比CC基因型猪有较高的瘦肉率､瘦肥肉比率､眼肌面积,较低的肥肉率､肩部膘厚､第6-7腰椎间膘厚､臀部膘厚背最长肌肌肉脂肪含量,因此可以说等位基因C有利于脂肪沉积,例如肥肉率和背膘而等位基因A促进肌肉生长,抑制脂肪沉积｡等位基因A主要存在于大白猪中,在梅山猪中等位基因频率较低,这种分布规律符合品种特性的差异｡该基因的遗传多态与猪的胴体性状和肉质性状呈显著相关,可以作为影响肌肉生长和脂肪沉积的候选基因之一｡参考文献:[1] GERMAIN D, GALTON V. The deiodinase family of selenoproteins[J]. Thyroid,1997,7(4):655-668.[2] BIANCO A C, SALV ATORE D, GEREBEN B, et al. Biochemistry, cellular and molecular biology, and physiological roles of the iodothyronine selenodeiodinases[J]. Endocr Rev, 2002,23(1):38-89.[3] GALTON V, MARTINEZ E, HERNANDEZ A, et al. Pregnant rat uterus expresses high levels of the type 3 iodothyronine deiodinase[J]. Journal of Clinical Investigation,1999,103(7):979-987.[4] HUANG S,DORFMAN D, GENEST D, et al. Type 3 iodothyronine deiodinase is highly expressed in the human uteroplacental unit and in fetal epithelium[J]. Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism,2003,88(3):1384-1388.[5] HERNANDEZ A, PARK J, L YON G, et al. Localization of the type 3 iodothyronine deiodinase (DIO3) gene to human chromosome 14q32 and mouse chromosome 12F1[J]. Genomics,1999,53(1):119-121.[6] DE KONING D, RATTINK A, HARLIZIUS B,et al. Genome-wide scan for body composition in pigs reveals important role of imprinting[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2000,97(14):7947-7950.[7] MURPHY S, WYLIE A, JIRTLE R. Imprinting of PEG3, the human homologue of a mouse gene involved in nurturing behavior[J]. Genomics,2001,71(1):110-117.[8] SATO S, ATSUJI K, SAITO N, et al. Identification of quantitative trait loci affecting corpora lutea and number of teats in a Meishan ×Duroc F2 resource population[J]. Journal of Animal Science,2006,84(11):2895-2901.[9] QIAO M, WU H Y, LI F, et al. Molecular characterization, expression profile and association analysis with carcass traits of porcine LCAT gene[J]. Molecular Biology Reports,2010,37(5):2227-2234.[10] KUIPER G, KLOOTWIJK W, VISSER T. Substitution of cysteine for a conserved alanine residue in the catalytic center of type II iodothyronine deiodinase alters interaction with reducing cofactor[J]. Endocrinology,2002,143(4):1190-1198. [11] KUIPER G, KLOOTWIJK W, VISSER T. Substitution of cysteine for selenocysteine in the catalytic center of type III iodothyronine deiodinase reduces catalytic efficiency and alters substrate preference[J]. Endocrinology,2003,144(6):2505-2513.[12] JIANG X J, ZHAO X F,GUO X L, et al. Mapping of Porcine DIO3 Gene and Analysis of Its Potential Influence on Production Traits[J]. Chinese Journal of Animal and Veterinary Sciences,2010,41(4):383-386.[13] EDWARDS D, ERNST C, TEMPELMAN R, et al. Quantitative trait loci mapping in an F2 Duroc × Pietrain resource population: I. Growth Traits[J]. journal of animal Science, 2008,86(2):241-253.。