反转录pcr原理
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反转录pcr原理
反转录聚合酶链式反应(reverse transcriptase PCR, RT-PCR)
是一种广泛应用于分子生物学和遗传学领域中的实验技术。
反转录PCR是通过利用酶的催化作用将RNA转录成为cDNA,再对其进行PCR扩增,得到想要检测的基因或mRNA的技术。
PCR扩增过程中需要模板,而RNA不是PCR的良好模板,因此转录成cDNA可以克服RNA的不足。同时,cDNA的合成
是由反转录酶引导完成的,反转录酶还可以分解RNA的二级
结构,从而使RNA模板更容易转录成cDNA,同时反转录酶
还可以进行链延伸,从而形成单链cDNA,便于进一步的
PCR扩增。
反转录PCR的优势
1. 可以利用非常少量的RNA样本来检测目标基因或mRNA,
异常表达的RNA,例如,在肿瘤细胞或某些医学检测中,只
需要一些组织样本或血液检测样本即可。
2. 反转录过程中可以对RNA进行过滤,去除其中的DNA,而且可以对花粉孢子,原虫和肠道微生物的RNA进行转录。
3. cDNA是双链结构,可以使用两个引物同时扩增目标基因,PCR效率高,容易检测出关键的目标信息。
4. cDNA对PCR的稳定性更高,可以稳定地保存很长时间,
从而方便后续实验操作。
反转录PCR的基本步骤
1. 反转录:需要选用适当的反转录酶、引物和反转录缓冲液将RNA反转录为cDNA。
2. PCR扩增:根据目标基因的特点和反转录产物的质量,设计合适的引物,进行PCR扩增,通常采用热启动PCR反应,提高反应的特异性和积极性。
3. 产品检测:用凝胶电泳或者Real-time PCR等技术来鉴定扩增产物的数量、大小、纯度和特异性等。
可见反转录PCR技术不仅可以来检测细胞内RNA的表达,而且还可以检测病毒、细胞质RNA的表达状况,因此是目前用于发现和检测RNA的最好方法之一。
然而,反转录PCR虽然在分子生物学和遗传学研究中被广泛应用,但其有一定的不适应性,需要注意以下几个问题:
1. 只能从RNA模板转录到cDNA,不能转录其他类型的RNA 或DNA。
2. 如果遇到RNA样本太少或RNA片段太短的情况,则容易出现假阴性结果。
3. 反转录操作时间过长,可能导致RNA的分解或者降解,而
且会对反转录产物的质量产生负面影响。
4. 在PCR扩增过程中,输入量和扩增条件是否合适,以及引
物和其他试剂成分的影响,都会直接或间接地影响PCR结果。
总之,反转录PCR是一种非常重要的分子生物学技术,可以
检测RNA表达水平,尤其在病毒学、癌症诊断和 RNA统计
分析方面发挥着无以伦比的作用。然而,正如其他实验技术一样,反转录PCR技术也有其自身的局限性和缺点,需要实验
人员根据具体情况选择和应用。