种子纯度鉴定汇总
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2、生化鉴定法
1)同工酶电泳 2)蛋白质电泳法 3)高效液相色谱法
生化标记概念
• 生化标记:建立在生化遗传学基础上的特异性同 功酶或蛋白质。其编码基因的位置及其与其它基 因位点的连锁关系也是明确的。
• 蛋白质是由基因编码的,特定的基因型决定了蛋 白质的特定组成,因此蛋白质组成能够反映出其 特征或特性
④许多类型的分子标记表现位共显性,能够鉴别出 纯合基因型和杂合基因型,提供完整的遗传信息
⑤表现为中性,即不影响目标性状的表达,与不良 性状无必然的连锁关系
⑥可对控制任何目标性状的基因进行标记
(2)常用分子标记技术简介
1)限制性片段长度多态性(Restriction
Fragment Length Polymorphism,RFLP)
• 原理:生物体在长期的自然选择和进化过程 中,由于个别碱基的突变以及序列的缺失、 插入或重排,会造成DNA在核苷酸序列上 出现差异,从而导致限制性内切酶识别位点 的不同,当用限制性内切酶来消化不同材料 的DNA时,会产生数目和大小不同的DNA 片段,电泳后经转膜和与探针杂交,就可以 得到DNA限制性片段长度多态性。
基因组DNA的不同位点,再经凝胶电泳分开, 得到一系列多态性DNA片段。
RAPD中多态性产生的基础 片段数量、大小和有无 ①核苷酸置换造成引物与结合位点无
法匹配 ②某个引物结合位点缺失 ③两引物结合位点间的间距过大,因
片段太长致使扩增中断(<3kb) ④插入或缺失改变了扩增产物的大小
RAPD
中 多 态 性 产 生 的 基 础
① 具有共显性特点,可以区别基因型纯合与杂合, 能提供单个位点上较完整的资料;
② 标记无表型效应,不受环境和发育条件影响;
③在非等位RFLP标记之间不存在上位效应,因而互 不干扰;
④ 标记源于基因组DNA的自然变异,数量上几乎不 受限制
•缺陷:RFLP标记对DNA需要量较大,操作繁琐,
花费昂贵
•其应用受到一定程度的限制;主要用于遗传连锁 图的绘制和目标基因的标记
2) 随机扩增多态性DNA(Random Amplified Polymorphism DNA,RAPD;RP-PCR ;AP-PCR )
• 1990 年Williams 和Welsh • 原理:以一个人工合成的随随机的寡核苷
酸序Fra Baidu bibliotek(通常为10 个碱基) 作引物,以基因 组总DNA 为模板,利用PCR技术随机扩增
L-f1,l-f2 ln(4);Lo,lo;l-w1,l-w2;l-b1,l-b2; A V1;y3;y4;… y20 Pa1,pa1;Pa2,pa2;P1,p1(2);P2,p2(4); Pb,pb(14);Pc,pc;Pd1,pd2;Ps,ps
f(11) S,s Lps,lps df2(6);df3;df4;df5(1)
第三章 作物品种纯度鉴定
主要内容
一、研究意义 二、鉴定依据 三、鉴定方法
一、研究意义
1、品种纯度是种子的主要质量指标,影 响作物的产量和产品品质。
2、由于纯度低而导致的减产就完全有可 能抵消一个新品种的增产潜力,因而纯度 低而造成很大的损失。
二、鉴定依据
遗传特性的差异,即调控性状发生发育的 基因的差异。
三、主要鉴定方法
1、常规鉴定法 2、生化鉴定法 3、分子标记技术
1、常规鉴定法
1)田间种植鉴定 2)籽粒和幼苗形态鉴定 3)物理化学鉴定法
1、常规鉴定法
1)田间种植鉴定 依据:形态特征和生物学特性 优点:鉴定结果是比较准确、可靠的 缺点:时间长、费用高,用地较多。
大豆部分形态标记性状及标记基因
标记性状 色素 花色 茸毛色 荚色 种皮 种脐 双色 子叶色 叶 小叶数目 叶形 落叶性 叶绿素缺失 茸毛类型
茎 扁化茎 节间长度 短叶柄 矮杆
标记基因(括号内数字表示所在连锁群)
W1,w1(8) T,t(1) L1,l1(5);L2,l2 G,g(3) R,r-m(2);I,i-i,I-k,i(7) K1;K2;K3 D1(3);D2;Cyt-G,Y3
• 主要利用种子蛋白:数量丰富、稳定、易于提取
3、分子标记技术
(1)分子标记的特点 (2)常用的分子标记
• (1)分子标记的特点 ①直接对DNA进行标记,在植物体的各种组织、器
官,不同发育时期均可检测到,不受环境、季节 的限制,不存在表达与否的问题
②类型丰富,数量多,遍及整个基因组
③多态性高,自然存在着许多等位变异,不需要创 造特殊的材料
1、常规鉴定法
2)籽粒和幼苗形态鉴定 种子粒形、类型、颜色,大小、果柄颜色 等 幼苗叶鞘颜色、叶片颜色、叶片形状等特 征
•对形态鉴定的评价
优点: •简单 •直观
缺点: •数量少、多态性差 •易受环境条件因素影响 •显隐关系要通过自交或杂交来检出
1、常规鉴定法
3)物理化学鉴定法 特殊物质或对化学试剂有特殊的生化反应。
RAPD标记的优、缺点
• 无需知道有关模板DNA的结构信息; • 引物没有种属特异性 • 模板DNA用量少,纯度要求不高 • 操作简便快速,可实现自动化操作 • RAPD标记是显性标记,不能区分纯合型
和杂合型 • 扩增产物易受反应条件影响,实验结果
重复性较差。
3)扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length
• 1980年Botstein等首次提出
对DNA进行酶切
单拷贝或低拷贝DNA
电泳分离
标记探针
将DNA片段转到膜上 杂交
观察多态性
RFLP技术流程
RFLP产生的原因——多态性基础 A)点突变
RFLP产生的原因——多态性基础 B)缺失
RFLP产生的原因——多态性基础 C)插入
RFLP图例
•RFLP标记的优点
AFLP Polymorphism,
) http://www.pcrlinks.com/variants/aflp.htm
• Zabean等于1992年发明的一项专利技术
原理:基因组DNA经2个限制性内切酶酶切后,与
特定接头相连接,根据接头的核苷酸序列和酶 切位点设计引物,进行特异性PCR扩增,经聚丙 烯酰胺凝胶电泳分离检测扩增片段的多态性。 由于不同材料的DNA片段存在差异,因而便产生 了扩增产物的多态性。实际上它是RFLP与PCR结 合的一种中间产物。