PUBMED 搜索种类中英文对照
PUBMED 搜索种类中英文对照

PUBMED 搜索种类中英文对照Addresses 演说(对什么演说)Autobiography 自传Bibliography 参考书目;文献目录Biography 档案,个人简历Books and Documents 图书馆文献Case Reports 病例报导Classical Article 经典论文Clinical Conference 临床讨论会;病例讨论会Clinical Trial 临床试验Clinical Trial, Phase IClinical Trial, Phase IIClinical Trial, Phase IIIClinical Trial, Phase IVComment 评论类Comparative Study 比较研究,对比研究。
Congresses 高级会议Consensus Development ConferenceConsensus Development Conference, NIHControlled Clinical Trial 临床研究对照Corrected and Republished Article 校正的和再版的论文Dataset 资料组Dictionary 字典Directory 目录Duplicate Publication 重复发表Editorial 出版;出版物Electronic Supplementary Materials 子文件English Abstract 英文摘要Evaluation Studies 评价研究Festschrift 纪念文集Government Publications 政府出版物Guideline 指导方针Historical Article 历史文献Interactive Tutorial 交互式教程Interview 采访;面谈Introductory Journal Article 介绍性的期刊文章。
pubmed检索

NCBI PubMed简介与检索指南黄庆第三军医大学西南医院检验科(重庆市 400038)注:在本文中的叙述中,所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来,如以基因治疗为主题词检索,在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。
一. PubMed简介PubMed是由隶属于美国国家卫生部(NIH, National Institues of Health)的国家医学图书馆(NLM, Nationa Library of Medicine)下属的国家生物技术信息中心(NCBI, National Center for Biotechnology Information)提供,可通过NCBI网站的Entrez检索系统(Entrez retrieval system)进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。
此外,PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务,与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据,提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统,可检索NCBI网站的主要数据库,如PubMed,核酸与蛋白序列,基因组序列,蛋白结构,OMIM 等等。
PubMed是一类提供生物医学引文资料检索的数据库,此外,它还针对网上资源,提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源,如核酸蛋白序列、OMIM入口等,以及其它生命科学数据库。
其引文内容的提供方式,由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。
如果该出版商有网站,则NCBI会提供相应的网络出口。
MEDLINE及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。
4MedLinePUBMED数据库检索共26页文档

PubMed可自动更正作者、期刊名等出现的错误。 PubMed设有自动转换功能,对于要检索的单词或短
语,PubMed逐一对照下列索引:MeSH转换表 (MeSH Translation Table)、期刊刊名转换表 (Journal Translation Table)、短语表(Phrase list)、作者索引(Author Index),自动转换成其中 相应的词或短语。如果在索引中找不到该短语, PubMed将把短语分开,以单词为单位,重复以上过 程,检索词之间是逻辑“与”关系。 个性化服务。
PubMed简介
PUBMED应用Entrez系统实现MEDLINE的检索。Entrez系统 是基于文本的检索系统,NCBI的多个重要数据库都使用了这个 平台,如:PubMed, Nucleotide(核酸),Protein Sequences (蛋白质序列), Protein Structures(蛋白结构), Complete Genomes(全基因组), Taxonomy等。
MEDLINE数据库检索
MEDLINE概述
MEDLINE是由美国国立医学图书馆(NLM)下属的 美国生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)研制的数据库,是 美国国立图书馆MEDLARS系统规模最大、权威性最 高的著名医学文献数据库。
MeSH SuT作erm者s([M姓H在] 前,名在后)进行检索,通常姓用全称,名用缩写。
4. 字段限定P检ub索lic:atio一n般Da格te式[D为P]“检索词[字段名或缩写]”,如cirrhosis[ti]表示在题
PubMed检索方法[优质内容]
![PubMed检索方法[优质内容]](https://img.taocdn.com/s3/m/90862b146bec0975f565e243.png)
高级培训
111
高级培训
112
主题词检索:
Stroke/drug therapy[mh] AND aspirin/tu[mh] AND randomized controlled trial[pt] 81篇
自由词检索:
cerebrovascular accident AND aspirin AND randomized controlled trial
高级培训
5
[PubMed-indexed for MEDLINE]
[PubMed-as supplied by publisher] [PubMed-in process]
高级培训
6
一、PubMed概述
3.PubMed 特点
(1)收录文献范围广、内容齐全、回溯年限长 (2)免费提供题录、文摘及部分全文 (3)检索功能完善,使用简单方便 (4)提供检索词自动转换匹配功能、MeSH主题词检索
高级培训
45
例5:通过主题词途径检索有关肾衰诊断方面的文献。要求:主题词加权检索
高级培训
46
高级培训
47
只对主题词进行加权检索
高级培训
48
高级培训
49
高级培训
50
高级培训
51
高级培训
52
高级培训
53
题录检索、期刊检索
高级培训
54
题录检索
高级培训
55
期刊检索
高级培训
56
高级培训
PubMed提供部分免费全文,包括① NLM开发的免费 生物医学数字化期刊全文数据库PubMed Central(PMC); ②开放获取(Open Access, OA)期刊的文献; ③部分出版 商提供的免费期刊文献。
【医学PPT课件】PubMed检索指南

限 定 检 索 窗 口 全 貌
添加作者检索
添加期刊检索
限定记录有全文、免费全文或 摘要
文献发表时间限定
记录添加到PubMed时间限定
限定记录有全文、免费全文或 摘要
人类与动物限定 性别限定
文献语种限定
文献子集限定
Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等 字段
Title/Abstract [TIAB]
四、PubMed检索功能
检索
1、自由词智能检索
在检索框中键入一到多个单词,如键入: vitamin c AND common cold hepatitis b AND (diagnosis OR therapy)
SubHeadings 副主题词
对一个主题词的多个方面进行修饰限定 的词,又称限定词。
特征栏功能介绍-Clipboard
(四) Clipboard功能介绍
将每次满意的检索结果暂时保存至此 最后集中处理(下载存盘或发E-mail) 最多500条记录,断开连接后保存8小时
(五) Details功能介绍
Details:显示计算机响应的本次检索式。
点击“URL”
/entrez/query.fcgi?cmd=Pu reSearch&db=pubmed&details_term=effect%5BAll%2 0Fields%5D%20AND%20%28%28%22magnetic%20r esonance%20imaging%22%5BTIAB%5D%20NOT%2 0Medline%5BSB%5D%29%20OR%20%22magnetic% 20resonance%20imaging%22%5BMeSH%20Terms% 5D%20OR%20MRI%5BText%20Word%5D%29%20A ND%20Review%5Bptyp%5D%20AND%20%222005/0 2/13%2000.01%22%5BEDAT%5D%20%3A%20%222
PUBMED检索分析

PUBMED检索分析主题词(Mesh Heading),又称叙词Descriptor,从信息内容中抽取出来的、能表达信息实质内容的规范化专业名词或术语?款目词,又称入口词,entry word,主题词的同义词或近义词?副主题词(Subheading), 又称为限定词(Qualifiers), 对主题词进一步限定的规范化用词缩小检索范围,获取最专指的文献举例:茶碱治疗哮喘哮喘asthma(指"asthma"[MeSH Terms] OR asthma[Text Word])99696 asthma[mesh](指"asthma"[MeSH Terms] )81824 哮喘的药物治疗asthma/drug therapy19695茶碱(theophylline)治疗哮喘(2352)theophylline/TU7366Medline:是PubMed的主体部分。
[PubMed--Indexed for MEDLINE]。
OldMedline:含1950-1965年期间发表的200万篇生物医学文献。
OldMedline的记录中没有MeSH字段和摘要字段,记录的标记是[PubMed - OLDMEDLINE for Pre1966]。
PreMedline:是Medline的前期数据库,收录的是那些正在等待标引的文献,其作用在于缩短文献报道时差。
[PubMed--in Process] Publisher-Supplied Citations:出版商提供的电子期刊中有一些属于选择性收录期刊。
[PubMed - as supplied by publisher]PubMed主页上提供与NCBI的7个数据库建立了超链接Nucleotide:DNA序列数据库Protein:氨基酸(蛋白质)序列数据库Genome:基因组序列数据库Structure:分子结构模型数据库Popset:种群、种系发生或突变序列数据库Taxonomy:生物分类数据库OMIM:人类孟德尔遗传学在线数据库Books:相关图书注:在检索提问框内输入的检索词若不用字段限定,系统依次到下列3个表中进行词语的核对、转换和检索:①MeSH转换表(MeSH Translation Table)、②刊名转换表(Journals Translation T able)、③著者索引(Author Index)。
PubMed检索

大分子模式(MMDB)等其他生物信息数据库检 索。 • PubMed等文献数据。
二、PubMed数据范围
PubMed收录的文献包括4个数据库: (1).Medline (2).In Process Citations (3).Publisher-Supplied Citations (4).OldMedline
通Байду номын сангаас如下方式强制将其作为一个词组进行检索:
1.加双引号:“single cell” 2.加标段标识[tw]: single cell[tw] 3.使用短横线“-”将两词连接起来:single-cell 4.使用截词符*:single cell*
基本检索
例1:检索2010年至2015年有关肾衰(renal failure)诊断 (diagnosis)方面的文献。要求:英文、综述
主题词检索
它以主题词为检索标识,是一种特性检索。 主题词(subject,subject headings),又称叙词(discriptor),
指经过规范化处理的检索词或词组。
如:艾滋病 主题词:获得性免疫缺陷综合征
• 主题词来源于美国国家医学图书馆编制的《医学主题词表》 又称MeSH表。
美国国家医学图书馆(National Library of Medicine,NLM) 研制的用于标引、编目和检索生物医学文献的英文受控词表 。它是对生物医学文献进行主题标引以及检索生物医学文献 数据库的指导性工具,对提高查全率及查准率具有十分重要 的意义。
PubMed
天津医科大学图书馆 孟艳丽
2015.9.21.
一.PubMed数据库简介 二.PubMed数据范围 三.PubMed特点 四.检索途径与使用方法 基本检索、高级检索、主题词检索 期刊检索、题录检索、定题检索 基本检索规则
PubMed中文使用手册 (PDF)

PubMed中文使用手册Jeffrey Wu(一)PubMed简介:PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。
PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
(二)页面介绍:(更新很快,但其内容变化一般不大)在你的浏览器中的URL地址框中健入/pubmed/并单击回车键后,你将进入Pubmed的主页面。
如图:1. 主页面左侧框的介绍(注:Cubby和tutorial为最新加入的)MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
Old PubMed (使用以前的PubMed查询方式)关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。
Related ResourcesOrder Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。
Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。
PubMed使用指南

⑤. PubMed------Clinical Queries
为帮助临床医生更有效地获取PubMed数据库中一般疾 病的病因学、预后、诊断、治疗及预防等方面的信息, PubMed设置了Clinical Queries功能 。该功能具备特殊的过 滤器装置能将上述主题文献集中提供检索。
为j的作者的文献.
ge jian glaucoma
案例2 文献时间与类型限定
利用PubMed检索近十年来干扰素β治疗多发性硬 化症的综述文献 干扰素β——interferon beta 多发性硬化症——multiple sclerosis 限定:last 10 years
Review
案例3 全文获取限定
①检索结果显示
②检索结果输出、保存
剪贴板:Clipboard(临时保存)
注意:
Clipboard(剪贴板)最多只能保存500条 最多可以保存8小时 长期保存,应存到myNCBI的collection中
③全文链接----LinkOut
4、 PubMed------MyNCBI
案例2(截词检索)
请利用PubMed检索有关肝移植患者术后生活 质量的相关文献。
检索词: 肝移植---------liver transplant* 生活质量-------quality of life
liver transplant* quality of life
案例3(精确检索)
利用PubMed检索有关胎儿染色体异常的产前 诊断研究。
- Publisher-Supplied [PubMed-as supplied by publisher/PubMed]:由出版商提供但因其 学科不在MEDLINE收录学科范围内,而最终未进入MEDLINE但保留在PubMed中 的文献数据。
Pubmed检索介绍

National Library of Medicine, NLM(美国国立医学图书馆)
10
Pubmed简介
Entrez
Entrez是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)主持的一个 数据库检索系统,它包括PubMed, Nucleotide and Protein Sequences, Protein Structures, Complete Genomes, Taxonomy 等等数据库。
8
Pubmed简介
PUBMED
由美国国立医学图书馆(NLM)所属国家生物技术信息中 心(NCBI) 建立。
PUBMED是NCBI‘s Entrez retrieval system众多数据库之一。 PUBMED目前收录的文献记录超过1900多万篇。 PUBMED提供全文链接。
9
Pubmed简介
13
Pubmed简介
PUBMED收录范围(2)
In Process Citations:没有完成MeSH标引、加入到MEDLINE之前 的数据,是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新 数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其文献条目在标引和 加工后向MEDLINE移交。 记录标注为:[PubMed - in process]
18
Pubmed简介
PUBMED Record Processing
19
Pubmed检索
新手入门
以下网页供自主学习:
Pubmed Help: https:///bsd/disted/pubmed.html Pubmed Online Training: /books/NBK3827/#pubmedhe lp.A_basic_search
pubmed检索方法ppt课件

14
文摘 第一著者单位地址 出版商提供文献识别号 著者群 版权说明 参考评论文献 合著者 文献参考评论 定稿版 校样版 输入日期 输入完成日期 电子出版日期
15 15
电子出版日期 文献出版日期 数据加入PubMed日期 文献勘误 参考文献勘误 全部著者姓名 全部调研者姓名 作为文章主题的著者全称 文献相关注释 基金编号
• 无论词表或索引中是否找到相匹配的词组,PubMed还会 将短语劈开,再重复以上顺序单独分别查找,找到相匹配 的词,之后用AND连接起来。
• 宁滥勿缺
23
如:pressure point ("pressure"[MeSH Terms] OR "pressure"[All Fields]) AND point[All Fields]
24
(一)基本检索
检索规则:
4、短语限定符:“ ” 严格按输入形式匹配,不再自动转换匹配和扩展检索,
常用于词组和专有名词检索。 对比: Stem cell transplantation “Stem cell transplantation”
25
(“stem cell transplantation”[MeSH Terms] OR “stem cell transplantation”[All Fields]) OR ("stem"[All Fields] AND "cell"[All Fields] AND "transplantation"[All Fields])
18 18
(一)基本检索
检索规则:
著者检索(authors): - 姓全称在前,名首字母在后 - 以AU作为限定字段 如:Cooper SL[au] wen ym[au]
PubMed使用详解

3/7/2021Dept. of Medical Information
2021/3/7
5
PubMed主页
3/7/2021Dept. of Medical Information
2021/3/7
6
1. Pubmed简介
2021/3/7
7
1. Pubmed简介
摘要型(Abstract)的数据库, 提供文献的线索; 部分文献(约5%)提供免费全文(链接网上免费资 源或者自己的图书馆已经购买的电子期刊全文数据 库中的全文。
3/7/2021Dept. of Medical Information
2021/3/7
8
1. Pubmed简介
“liver cancer”
43
自动匹配检索功能关闭
3/7/2021Dept. of Medical Information
2021/3/7
44
4. PubMed检索结果处理
Display(显示) Send to(输出)
3/7/2021Dept. of Medical Information
2021/3/7
26
3.2 PubMed主题词检索(MeSH)
3/7/2021Dept. of Medical Information
2021/3/7
27
什么是主题词(MeSH词)?
主题词是经人工规范化处理的最能表达文章主题概 念的语词。所谓规范化处理,就是在文献存储时, 对文献中的同义词、近义词、多义词等加以严格的 控制和规范,使得同一主题概念的文献相对集中在 一个主题词下。
标引人员根据文章的内容,给出多个MeSH 词,以确切描述一篇文章内容的重点。 检索人员根据检索需求,选择相关MeSH词 进行检索。
PubMed简介及使用说明

PubMed简介及使用说明壹、简介PubMed为美国国家医学图书馆的美国国家生技资讯中心(NCBI)所制作之生物医学相关文献的书目索引摘要型资料库,目前收录1950年以来约1400多万笔生物医学相关书目资料,并提供部分免费及付费全文连结服务,需要收费的全文,读者可自行与出版社接洽。
较之于MEDLINE资料以生物医学、生命科学、生化学、行为科学为主,PubMed 资料库范围更涵盖了如下内容:1. 对于超出学科范围(如:资讯科学、航太科学) 的特定生命科学、医学、化学相关之期刊文章都会收录于本资料库中;2. 收录即将出版的医学论文;3. 已由NLM审核通过并已由PubMed Central典藏的全文文献亦收录之。
美国国家生技资讯中心(NCBI)制作了一系列的生物医学资料库如下:1.PubMed:生物医学文献书目索引摘要资料库。
2.Nucleotide:包含GenBank、RefSeq、PDB资料库中的人类基因序列资料。
3.Protein:整合了SwissProt、PIR、PRF、PDB、GenBank及RefSeq资料库中的资料,并可参照Taxonomy资料库,了解特定种类的蛋白质的在资料库中分类状况的相关说明。
4.Structure:分子构造资料库。
5.Genome:基因组合序列资料库。
6.PopSet:可查询某族群的基因序列,了解该族群演进之相关资料。
7.OMIM:遗传学资料库。
8.Taxonomy:在NCBI基因资料库中提及的微生物的核酸或蛋白质序列的分类状况之相关说明。
9.Books:收录C. elegans II.、Introduction to Genetic Analysis. 7th ed.、ModernGenetic Analysis.、Molecular Biology of the Cell. 3rd ed.、Molecular Cell Biology. 4th ed.、Retroviruses.等六本书。
pubmed(12)

Journal of leukocyte biology、J leukoc biol、0741-5400
基本检索
检索结果 文献聚类
进行如下各种限定:选择 字段、只检带文摘的记录、 全文记录、文献类型(选 择review)、语种、子集、 年龄组、人类或动物实验、 性别。
检索结果 文献分类
Protein:蛋白质序列数据库
Taxonomy:微生物类别数据库
• MeSH Database -主题词数据库
• Journals in NCBI Databases -期刊数据库 • Clinical Trials-对公众提供临床科研的当前信息 • LinkOut- 在线链接 •Single Citation Matcher-在表格输入刊物的引文 信息来定位特定文章(单篇引文匹配器) 。 •Batch Citation Matcher-多篇引文匹配器 •Clinical Queries-与临床相关的治疗,诊断,病 因,预后 • Topic-Special Queries –主题相关查询
PubMed系统 三、PubMed的检索原理
PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。当 未加任何限定修饰的检索词被输入到检索提问 框时,它是按照一定的顺序被核对、转换、匹 配和检索的。 Mesh转换表:包括Mesh词、参见词、副主题 词等 期刊转换表:包括刊名、缩写、ISSN号等 短语表 作者索引 要查验检索词的转换情况,可用“details”
最近的 检索活动
高级检索
检索步骤: 点击面上方的Advanced Search 按钮,进入高级 检界面。 选择检索字段[MeSH Terms],在检索输入框中输 入检索词alzheimer disease,点击Index按钮可 查看索引,系统显示相应字段的索引词列表,选 中一个索引词,被选中的索引词会自动粘贴在提 问框中。 选择第二个检索字段“[MeSH Subheading],在其 右侧输入框中输入检索词 therapy,点击[Index] 可查看索引。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
PUBMED 搜索种类中英文对照
Addresses 演说(对什么演说)
Autobiography 自传
Bibliography 参考书目;文献目录
Biography 档案,个人简历
Books and Documents 图书馆文献
Case Reports 病例报导
Classical Article 经典论文
Clinical Conference 临床讨论会;病例讨论会
Clinical Trial 临床试验
Clinical Trial, Phase I
Clinical Trial, Phase II
Clinical Trial, Phase III
Clinical Trial, Phase IV
Comment 评论类
Comparative Study 比较研究,对比研究。
Congresses 高级会议
Consensus Development Conference
Consensus Development Conference, NIH
Controlled Clinical Trial 临床研究对照
Corrected and Republished Article 校正的和再版的论文
Dataset 资料组
Dictionary 字典
Directory 目录
Duplicate Publication 重复发表
Editorial 出版;出版物
Electronic Supplementary Materials 子文件English Abstract 英文摘要
Evaluation Studies 评价研究
Festschrift 纪念文集
Government Publications 政府出版物Guideline 指导方针
Historical Article 历史文献
Interactive Tutorial 交互式教程
Interview 采访;面谈
Introductory Journal Article 介绍性的期刊文章。
Journal Article 期刊论文
Lectures 演讲
Legal Cases 法律案件
Legislation 法规
Letter 信
Meta-Analysis 荟萃分析
Multicenter Study 多中心研究
News 新闻
Newspaper Article 报纸文章
Observational Study 观察研究
Overall 总结类
Patient Education Handout 病人教育印刷品
Periodical Index 期刊索引
Personal Narratives 个人简历
Portraits 肖像
Practice Guideline 实践指南
Pragmatic Clinical Trial 临床试验
Published Erratum 出版更正
Randomized Controlled Trial 随机对照试验
Research Support, American Recovery and Reinvestment Act
Research Support, N.I.H., Extramural
Research Support, N.I.H., Intramural
Research Support, Non-U.S. Gov't
Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
Research Support, U.S. Gov't, P.H.S.
Research Support, U.S. Government
Retracted Publication 已撤销出版物
Retraction of Publication 出版撤销
Review 综述
Scientific Integrity Review Systematic Reviews 系统评价Technical Report 技术报告Twin Study 双生子研究Validation Studies 有校性研究Video-Audio Media 视听媒体Webcasts 网络广播。