化学信息学-数据库ppt课件
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化学文摘数据库检索方法培训教材.ppt
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当光标滞留在某个CAS号时，点击 该标识查看其内容；
• 数据库文献内容及索引信息按月更新。 • 数据库检索软件为Windows版本，用户需进入
图书馆光盘系统才能使用。
2019-10-23
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2
光盘标识
2019-10-23
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2019-10-23
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2019-10-23 Updata
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2019-10-23
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词序及间距限定
9
Search检索事项（一）
化学文摘数据库检索方法
培训教材（八）
2002.5.8
2019-10-23
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1
CA on CD数据库介绍
• CA on CD光盘数据库由美国化学学会制作，文 摘内容对应于书本式《化学文摘》。该数据库 收录世界范围内有关生物化学、物理化学、无 机、有机化学等众多化学及化工方面的科技文 献，年文献量达773,000条，其中约123,000条专 利。文献来源种类包括科技期刊、专利、技术 报告、学位论文、会议录以及图书。
第四章 数据库和化学信息来源_PPT课件
• 8.产品资料 指厂商为推销产品而印制的各种宣传资料、技
术资料。如公司介绍、产品目录、样本、说明书 等，它反映厂家、公司及产品的有关信息，对产 品采购，仪器设备的维护、使用及新产品开发具 有重要价值。 • 9.技术档案
档案是指国家、机构和个人从事社会活动留 下的具有历史价值的文献。
• 10. 科技报纸
一、文献检索工作的意义和目的
科学的发展依赖于继承、借鉴、交流和 综合，在当代条件下，这种作用主要通 过文献检索来实现。
查阅科技文献，进行调查研究，可以使 我们减少重复劳动，避免或少走弯路， 吸取别人的经验和教训。
科技工作者为确定研究课题进行反复探索到 最后完成，用于检索文献情报所花费的时间占相 当的比重。
40年代的PB报告主要是从战败国德、日、奥、意等国搞 来的资料。
50年代开始，PB报告则是美国政府科研机构、军事科研 单位、情报部门、公司企业、高等院校以及部分国外机构 的科技报告的汇集。
PB报告的内容包括基础理论、生产技术及工艺材料等方面：
1）航空与空间技术（Aeronautics and Space Technology） 2）运输工程（Transpoetation Engineering） 3）土木建筑工程（Civil Engineering） 4）地质与采矿（Earth Science Mining） 5）机械工程（Mechanical Engineering） 6）核科学与力能学（Nuclear Science and Power Engineering） 7）电子学与电工学（Electronics and Electrical Engineering） 8）数学（Mathematics） 9）化学与化工（Chemistry and Chemical Engineering） 10）物理学（Physics）
《化学信息学》课件
药物设计
药物设计是一种通过研究分子结构和相互作用来设计新药物的方法。它的目 标是开发更安全、有效的药物，用于治疗疾病。
结语
化学信息学在化学和生命科学中的应用前景广阔。它为教学和科研提供了宝贵的贡献和价值，并将在未 来持续发展和创新。
《化学信息学》PPT课件
欢迎来到《化学信息学》PPT课件！本课程将为您介绍化学信息学的定义、 应用领域、相关技术和方法。准备好探索这个令人着迷的领域了吗？让我们 开始吧！
概述
化学信息学是研究如何有效地收集、存储、检索和分析化学信息的学科。它 的应用范围广泛，包括药物设计、分子模拟和化合物结构搜索。
化合物结构搜索
化合物结构搜索是一种通过分析数据库中的化合物结构来检索相关化合物的 方法。它使用算法和工具来帮助我们寻找特定的化学结构。
化学数据库
化学数据库是一个存储大量化学信息的资源，包括查询方法和操作技巧对于化学信息学研究至关重要。
分子模拟
分子模拟是一种利用计算机模拟分子的行为和性质的方法。它可以帮助我们 了解分子之间的相互作用，预测它们的性质和行为。
《数据库基础知识》PPT课件
编写触发器与存储过程
根据业务需求编写触发器和存储过程 ，实现复杂业务逻辑。
监控与优化性能
监控数据库性能，定期进行优化和调 整，确保数据库高效运行。
维护数据安全
定期备份数据、修复损坏数据、防范 恶意攻击等，确保数据安全可靠。
05
索引与查询优化技术
索引基本概念及作用
索引定义
索引是数据库中用于快速查找和检索数据的数据结构。
如在线购物网站、拍卖网站等，需要处理 大量的用户信息和交易数据，数据库可以 提供安全、可靠的数据存储和检索功能。
金融系统
科研领域
如银行、证券、保险等金融机构的信息系 统，需要处理大量的金融数据，数据库可 以提供高效的数据处理和分析功能。
如生物信息学、天文学等科研领域，需要处 理大量的实验数据和观测数据，数据库可以 提供灵活的数据存储和管理功能。
关系完整性约束
完整性约束概念
完整性约束是用来保证数据库中数据的正确性和一致性的规则。在关系模型中，完整性约束包括实体 完整性、参照完整性和用户自定义完整性。
完整性约束类型
实体完整性约束要求关系中的主键属性不能取空值；参照完整性约束要求关系中的外键属性取值必须 对应于另一个关系中的主键取值；用户自定义完整性约束则是根据应用需求定义的其他规则。
03
SQL语言基础
SQL语言简介
01
SQL（Structured Query Language）是一种用于管理关系数 据库管理系统的语言。
02
它包括数据插入、查询、更新和删除，数据库模式创建和修改
，以及数据访问控制。
SQL语言简单易学，是开发和管理数据库系统的标准语言。
03
数据定义语言DDL
DDL（Data Defini对象，如表、 索引、触发器等。
《化学与信息科学》课件
总结词
化学信息学是一门交叉学科，它结合了化学和信息科学的知识，利用计算机技 术处理、分析和解释化学信息。
详细描述
化学信息学是化学与信息科学相互渗透、融合而形成的一门新兴交叉学科。它 利用计算机技术，通过对化学信息进行获取、整理、分析、解析和表达，实现 对化学问题的深入研究。
化学信息学的研究内容
总结词
化学信息学的发展趋势
总结词
随着大数据时代的到来，化学信息学的发展趋势是向 着智能化、自动化和集成化的方向发展。
详细描述
随着大数据时代的来临，化学信息学面临着新的机遇和 挑战。为了更好地适应时代的发展，化学信息学的发展 趋势主要表现在以下几个方面：一是智能化，即利用人 工智能、机器学习等技术手段对化学数据进行自动化处 理和分析，提高数据处理效率；二是自动化，即通过自 动化技术手段获取和处理化学数据，提高数据获取的准 确性和效率；三是集成化，即通过集成化技术手段将各 类化学数据库、信息系统等进行整合，实现数据共享和 互通。
总结词
计算化学在能源、环境、药物设计等领域有广泛的应 用。
详细描述
计算化学在能源领域的应用主要包括燃料电池、太阳 能电池等方面的研究，旨在提高能源利用效率和降低 环境污染。在环境领域，计算化学可用于研究大气、 水体和土壤中的化学反应和污染物迁移转化等。在药 物设计领域，计算化学可用于研究药物与靶点的相互 作用和分子设计，为新药研发提供理论支持。此外， 计算化学还在材料科学、生物技术等领域有广泛的应 用。
总结词
要点二
详细描述
概述化学信息系统的发展历程、应用领域及未来发展趋势 。
化学信息系统经历了从简单的手工检索到计算机化的数据 库管理系统，再到智能化的知识管理系统的发展历程。目 前，化学信息系统已经广泛应用于化学研究、教学、生产 等领域，为化学学科的发展和进步提供了重要的技术支持 。未来，随着信息技术和人工智能的不断发展，化学信息 系统将朝着更加智能化、个性化的方向发展。
化学信息学是一门交叉学科，它结合了化学和信息科学的知识，利用计算机技 术处理、分析和解释化学信息。
详细描述
化学信息学是化学与信息科学相互渗透、融合而形成的一门新兴交叉学科。它 利用计算机技术，通过对化学信息进行获取、整理、分析、解析和表达，实现 对化学问题的深入研究。
化学信息学的研究内容
总结词
化学信息学的发展趋势
总结词
随着大数据时代的到来，化学信息学的发展趋势是向 着智能化、自动化和集成化的方向发展。
详细描述
随着大数据时代的来临，化学信息学面临着新的机遇和 挑战。为了更好地适应时代的发展，化学信息学的发展 趋势主要表现在以下几个方面：一是智能化，即利用人 工智能、机器学习等技术手段对化学数据进行自动化处 理和分析，提高数据处理效率；二是自动化，即通过自 动化技术手段获取和处理化学数据，提高数据获取的准 确性和效率；三是集成化，即通过集成化技术手段将各 类化学数据库、信息系统等进行整合，实现数据共享和 互通。
总结词
计算化学在能源、环境、药物设计等领域有广泛的应 用。
详细描述
计算化学在能源领域的应用主要包括燃料电池、太阳 能电池等方面的研究，旨在提高能源利用效率和降低 环境污染。在环境领域，计算化学可用于研究大气、 水体和土壤中的化学反应和污染物迁移转化等。在药 物设计领域，计算化学可用于研究药物与靶点的相互 作用和分子设计，为新药研发提供理论支持。此外， 计算化学还在材料科学、生物技术等领域有广泛的应 用。
总结词
要点二
详细描述
概述化学信息系统的发展历程、应用领域及未来发展趋势 。
化学信息系统经历了从简单的手工检索到计算机化的数据 库管理系统，再到智能化的知识管理系统的发展历程。目 前，化学信息系统已经广泛应用于化学研究、教学、生产 等领域，为化学学科的发展和进步提供了重要的技术支持 。未来，随着信息技术和人工智能的不断发展，化学信息 系统将朝着更加智能化、个性化的方向发展。
《化学信息学资料》课件
《化学信息学资料》PPT 课件
在这个《化学信息学资料》PPT课件中，我将分享关于化学信息学的知识。 你会了解化学信息学的定义、应用领域、重要性以及常见的工具和技术。还 将探讨化学信息学在药物设计中的应用。最后，我们将总结和得出结论。
课程介绍
在这一部分，我们将介绍《化学信息学资料》课程的内容和目标。通过学习 这门课程，您将获得关于化学信息学的全面了解，并掌握在实际应用中使用 化学信息学的技能。
化学信息学在药物设计中的应 用
在这一部分，我们将探讨化学信息学，加速新药的研发过程。
总结和结论
在这一部分，我们将对整个《化学信息学资料》PPT课件进行总结和结论。我们回顾学到的知识，并强调化学 信息学在现代科学中的重要性和应用前景。
在这一部分，我们将讨论化学信息学的重要性。化学信息学帮助我们更好地理解和预测化学反应、发现新的化 学物质，并加速科学研究的进展。
化学信息学的常见工具和技术
在这一部分，我们将介绍化学信息学中常用的工具和技术。这些工具包括分 子模拟软件、化学数据库和化学信息系统等，它们帮助我们处理和分析大量 的化学数据。
化学信息学的定义
在这一部分，我们将阐述化学信息学的定义。化学信息学是研究如何利用信息技术和计算机科学方法来处理和 分析化学数据的学科。
化学信息学的应用领域
在这一部分，我们将探讨化学信息学在不同领域的应用。这些领域包括药物研发、材料科学、环境保护等，化 学信息学在这些领域中起着至关重要的作用。
化学信息学的重要性
2019精品第五章数据库安全管理课件化学
•拒绝权限（DENY）:表示用户或角色不能执行 某项操作，也称禁止权限。
•废除权限（REVOKE）:表示废除以前用户或角 色所具有的允许权限或拒绝权限，但是当用户 继承其它角色时，用户的权限是以其它角色的 权限为准。
5.5管理权限
拒绝权限优先： 如果用户本身设置了一定权限，而它
又继承了一定的角色，当它们的权限出现 冲突时，以拒绝权限优先。
•设置用户帐号数据库操作权限（也称语句权限） 对用户账号设置语句权限是限制用户账号
对整个数据库的操作权限，是创建数据库或者 数据库中的数据对象（表、视图或存储过程等） 所涉及的权限。
5.5管理权限
5.5.2管理数据库用户帐号的权限
数据库用户帐号权限的三个层次
（1）创建数据库对象及进行数据库备份的权限（创 建表、视图、存储过程，备份日志文件等）
（2）对数据库表的操作权限及执行存储过程的权限 （ SELECT,INSERT,UPDATE,DELETE,EXECU TE）
（3）对 数 据 库 中 指 定 列 的 操 作 权 限 （ SELECT 、 UPDATE）
5.5管理权限
三种权限 •允许权限（GRANT）:表示用户或角色能够执 行某项操作。
•设置 SQL Server 登录账户
5.3管理登录账号
三、管理登录账号
5.3管理登录账号
5.3.3修改登录账号
5.3管理登录账号
5.3管理登录账号
5.3.4删除登录账号
5.3管理登录账号
5.4管理数据库用户
登录帐号(Login Name)只负责在用户连接数据库 实例时的验证，登录帐号本身不能让用户访问服务 器中的数据库。要访问数据库，用户还必须在数据 库中拥有和其登录服务器时所用的登录名相关联的 用户帐号(User Name)，也称为数据库用户。
•废除权限（REVOKE）:表示废除以前用户或角 色所具有的允许权限或拒绝权限，但是当用户 继承其它角色时，用户的权限是以其它角色的 权限为准。
5.5管理权限
拒绝权限优先： 如果用户本身设置了一定权限，而它
又继承了一定的角色，当它们的权限出现 冲突时，以拒绝权限优先。
•设置用户帐号数据库操作权限（也称语句权限） 对用户账号设置语句权限是限制用户账号
对整个数据库的操作权限，是创建数据库或者 数据库中的数据对象（表、视图或存储过程等） 所涉及的权限。
5.5管理权限
5.5.2管理数据库用户帐号的权限
数据库用户帐号权限的三个层次
（1）创建数据库对象及进行数据库备份的权限（创 建表、视图、存储过程，备份日志文件等）
（2）对数据库表的操作权限及执行存储过程的权限 （ SELECT,INSERT,UPDATE,DELETE,EXECU TE）
（3）对 数 据 库 中 指 定 列 的 操 作 权 限 （ SELECT 、 UPDATE）
5.5管理权限
三种权限 •允许权限（GRANT）:表示用户或角色能够执 行某项操作。
•设置 SQL Server 登录账户
5.3管理登录账号
三、管理登录账号
5.3管理登录账号
5.3.3修改登录账号
5.3管理登录账号
5.3管理登录账号
5.3.4删除登录账号
5.3管理登录账号
5.4管理数据库用户
登录帐号(Login Name)只负责在用户连接数据库 实例时的验证，登录帐号本身不能让用户访问服务 器中的数据库。要访问数据库，用户还必须在数据 库中拥有和其登录服务器时所用的登录名相关联的 用户帐号(User Name)，也称为数据库用户。
化学信息学课件
第一章化学信息概论一、化学信息学的产生和发展信息：实物的存在方式和运动状态的记录，它精确地描述物体或事件，并且可借助于一定的物质载体进行存储和传播。
化学学科的重要性化学信息量的快速增长化学信息学：是应用信息学方法解决化学问题的学科。
（化学信息学是信息科学与化学的交叉学科。
）（利用数学、统计学与计算机科学的理论、方法和网络技术作为手段，研究化学信息的获取、表示、管理、传播、分析、加工和应用，在此基础上进行知识创新，促进化学学科的发展。
）二、化学信息学的研究领域应用现代信息技术构建信息处理系统，处理长期积累的大量化学信息资源，帮助化学家组织、分析和理解已知的科学数据，正确地预测化学物质的性质，开发新化合物、材料和方法。
应用计算机科学方法或信息学解决化学问题，对化学信息进行有效的存储、操作和处理，使化学信息合理地提升为化学知识。
研究内容：化学、化工文献学；化学知识体系的计算机表示、管理与网络传输；化学图形学；化学信息的解析与处理；化学知识的计算机推演；化学教育与教学的现代技术与远程信息资源。
三、信息资源检索的意义与作用⏹• 启迪创新：科研工作具有继承和创新两重性，要求科研人员在探索未知进行创新之前，应该尽可能地继承和利用与之相关的信息。
⏹• 拓宽视野：21世纪信息与知识的积累日新月异，出现了大量的边缘科学和交叉科学。
面对知识频繁更新的世界，需要接受终身教育，在不断的教育中更新知识，适应环境的变化。
⏹• 培养能力：现代教育不单纯是知识的传授，更重要是要大力进行各种能力的培养，其中包括自学能力、思维能力、研究能力、表达能力、创新能力、终生教育能力、组织管理能力和收集处理信息的能力。
⏹• 提高素质：信息素质是信息社会中实现对知识的探索和发现的综合能力，它是进入信息社会赖以生存的通行证。
四、化学信息学的课程内容化学信息的产生和获取（重点）利用检索工具通过实验方法... …化学信息的表达、存储和管理化学运筹学数据整理可视化数据库管理技术... ...化学信息的加工和处理化学计量学化学软件目的是获取更多的信息化学信息的深化计算机模拟设计化学结构的可视化以图形的方式对化学信息进行描述1.2 电子信息和数据库一、电子信息指通过计算机等设备以数字信号传递的数字信息资源组成的数据库。
化学信息学
化学信息学的研究领域
化学信息的组织、管理、检索和使用； 分子结构的编码、描述、三维结构的构建； 化学信息的加工、处理及深化； 计算组合化学； 化学体系中信息的交换及传递； 分子的物理化学预测 ——北京大学徐筱杰 教授
化学信息学的研究领域
利用计算机技术和计算机网络技术对化学信息进 行表示和管理； 利用计算机网络技术对化学信息进行收集、传播 和共享； 化学体系的计算机模拟或建模； 利用计算机技术对复杂的化学信息进行解析，以 快捷方便的方式最大限度地提取和利用有用信息。 ——南开大学邵学广教授
信息资源检索的意义与作用
启迪创新：科研工作具有继承和创新两重性，要求科研人员 在探索未知进行创新之前，应该尽可能地继承和利用与之相 关的信息。 拓宽视野：21世纪信息与知识的积累日新月异，出现了大量 的边缘科学和交叉科学。面对知识频繁更新的世界，需要接 受终身教育，在不断的教育中更新知识，适应环境的变化。 培养能力：现代教育不单纯是知识的传授，更重要是要大力 进行各种能力的培养，其中包括自学能力、思维能力、研究 能力、表达能力、创新能力、终生教育能力、组织管理能力 和收集处理信息的能力。 提高素质：信息素质是信息社会中实现对知识的探索和发现 的综合能力，它是进入信息社会赖以生存的通行证。
国内化学信息学实验室网址
南开大学化学信息学实验室 / 中国科学技术大学：化学信息学实验室 / .
考核方式
平时成绩：考勤、提问、随堂作业 期中测试 期末考试（闭卷）
第二节 电子信息和数据库
互联网大众
面向整个世界的开放性 面向广大公众的廉价性 面向普通百姓的易用性 无所不在的普及性 P2P( peer-to-peer) 对等系统, 最重要的应 用 QQ,MSN,BT Web2.0 只是术语,包括RSS,网络日志,wiki
电子教案与课件：化学信息学 第八课
— 常用软件（一）
1
化学软件-概述
化学软件是当前化学工作者日常工作 的基本工具，国外的计算机信息产业 之所以发达，其中很重要的一个原因 就是软件非常规范和丰富，特别是专 业应用软件，计算机只有做到 “有用 ”，才真正体现到它的价值。
2
化学软件常用分类一
物理化学软件
分析化学软件 其他化学软件
有机化学软件 化学教育软件
6
Matlab
MATLAB (Matrix Laboratory)是一款商 业软件，主要应用于算法开发、数据 可视化、数据分析以及数值计算的高 级技术计算语言和交互式的环境 （)。
7
Matlab的特点
（1）友好的工作平台和编程环境 （2）强大的科学计算机数据处理能力 （3）出色的图形处理功能 （4）应用广泛的模块集合工具箱 （5）实用的程序接口和发布平台
无机化学软件
生物化学软件
化学软件 3
化学软件常用分类二
分子模拟软件
化学编排软件 谱图库软件
化学计算软件 画图作图软件
仪器分析软件
化学学习软件
化学软件 4
化学软件常用分类三
结构化学
LIMS 化学信息学 生物信息学
通用软件 量化计算软件 分子模拟软件
化学软件 5
语言软件和依托算法的化学计算软件
➢ Matlab ➢ R语言
22
While循环语句
20
If语句
If expression
statements
end 其中expression为设定的执行条件，当满足条件时程 序将执行statements语句。另外也可采用if…else…结 构进行多条判断：
If expression 1
1
化学软件-概述
化学软件是当前化学工作者日常工作 的基本工具，国外的计算机信息产业 之所以发达，其中很重要的一个原因 就是软件非常规范和丰富，特别是专 业应用软件，计算机只有做到 “有用 ”，才真正体现到它的价值。
2
化学软件常用分类一
物理化学软件
分析化学软件 其他化学软件
有机化学软件 化学教育软件
6
Matlab
MATLAB (Matrix Laboratory)是一款商 业软件，主要应用于算法开发、数据 可视化、数据分析以及数值计算的高 级技术计算语言和交互式的环境 （)。
7
Matlab的特点
（1）友好的工作平台和编程环境 （2）强大的科学计算机数据处理能力 （3）出色的图形处理功能 （4）应用广泛的模块集合工具箱 （5）实用的程序接口和发布平台
无机化学软件
生物化学软件
化学软件 3
化学软件常用分类二
分子模拟软件
化学编排软件 谱图库软件
化学计算软件 画图作图软件
仪器分析软件
化学学习软件
化学软件 4
化学软件常用分类三
结构化学
LIMS 化学信息学 生物信息学
通用软件 量化计算软件 分子模拟软件
化学软件 5
语言软件和依托算法的化学计算软件
➢ Matlab ➢ R语言
22
While循环语句
20
If语句
If expression
statements
end 其中expression为设定的执行条件，当满足条件时程 序将执行statements语句。另外也可采用if…else…结 构进行多条判断：
If expression 1
数据库学习ppt课件
数据库监控与调优
实时监控数据库运行状态，根 据性能指标进行调优操作，确
保数据库高效运行。
22
06
数据库应用实例
2024/1/27
23
电子商务网站数据库设计
商品信息存储
包括商品名称、描述、价格、库存等
订单处理
生成订单、支付状态、物流信息等
用户信息管理
注册信息、地址、支付方式等
数据分析
销售统计、用户行为分析等
规范化设计的优点
减少数据冗余、提高数据一致 性、增强数据完整性、优化数 据库性能等。10源自2024/1/2703
数据库设计
11
数据库设计的步骤
需求分析
收集和分析用户需求，确定数据库 需要支持的功能和性能要求。
概念设计
建立概念模型，通常使用实体-联系 模型（E-R模型）来描述数据和数据
间的关系。
2024/1/27
9
关系数据库的规范化设计
第二范式（2NF）
要求表的主键列完全函数依赖 于整个候选键，即消除部分依 赖。
BCNF范式
在3NF的基础上，要求每一个 决定因素都包含候选键，即达 到更高的规范化程度。
第一范式（1NF）
要求数据库表的每一列都是不 可分割的原子数据项。
2024/1/27
第三范式（3NF）
要求非主键列只依赖于主键列 ，即消除传递依赖。
BCNF、4NF等更高范式
消除传递依赖，确保每个属性只依赖于主 键。
在更高级别上消除冗余和异常，提高数据 库设计的质量。
2024/1/27
13
数据库设计的优化
01
索引优化
根据查询需求和数据分布特点 ，合理选择索引类型和索引列
实时监控数据库运行状态，根 据性能指标进行调优操作，确
保数据库高效运行。
22
06
数据库应用实例
2024/1/27
23
电子商务网站数据库设计
商品信息存储
包括商品名称、描述、价格、库存等
订单处理
生成订单、支付状态、物流信息等
用户信息管理
注册信息、地址、支付方式等
数据分析
销售统计、用户行为分析等
规范化设计的优点
减少数据冗余、提高数据一致 性、增强数据完整性、优化数 据库性能等。10源自2024/1/2703
数据库设计
11
数据库设计的步骤
需求分析
收集和分析用户需求，确定数据库 需要支持的功能和性能要求。
概念设计
建立概念模型，通常使用实体-联系 模型（E-R模型）来描述数据和数据
间的关系。
2024/1/27
9
关系数据库的规范化设计
第二范式（2NF）
要求表的主键列完全函数依赖 于整个候选键，即消除部分依 赖。
BCNF范式
在3NF的基础上，要求每一个 决定因素都包含候选键，即达 到更高的规范化程度。
第一范式（1NF）
要求数据库表的每一列都是不 可分割的原子数据项。
2024/1/27
第三范式（3NF）
要求非主键列只依赖于主键列 ，即消除传递依赖。
BCNF、4NF等更高范式
消除传递依赖，确保每个属性只依赖于主 键。
在更高级别上消除冗余和异常，提高数据 库设计的质量。
2024/1/27
13
数据库设计的优化
01
索引优化
根据查询需求和数据分布特点 ，合理选择索引类型和索引列
化学类相关专业数据库资源 ppt课件
4
国外的网站：
• Elsevier SDOS电子期刊 • ACS(美国化学学会)电子期刊 • Springer电子期刊 • Wiley interscience电子期刊
5
• 查询化合物性质的网站h ttp:///
• 有机化合物数据库 • 经典有机化学反应 • 有机合成
13
质谱谱图数据库
• 收录了大约12,000多个化合物，检索途径为 质荷比检索，丰度检索以及组合检索，可 获取化合物质谱谱图，物化性质等信息。
14
药物与天然产物数据库
• 覆盖来自不同数据库的药物和利以及参考 文献，另外还包括14万多个天然产物信息 和1万多条相关专利。
11
化学反应数据库
• 覆盖了国内外化学文献中报道的化学反应 200万余条，检索途径为化学反应物检索， 反应产物检索，反应溶剂、催化剂检索及 组合检索等，可获取相关反应信息及参考 文献等，对反应机理研究，合成路线设计 具有相当参考意义。
12
红外谱图数据库
• 收录了大约15万多个化合物，通过特定格 式转化的红外光谱文件以峰位检索，强峰 检索，功能团检索以及组合检索，也可以 通过化合物名称，化合物分子式检索，获 取需要的化合物，主要包括其红外光谱图， 物化性质以及CA登录号等信息。
17
中国化学文献数据库
• 收录了1990年—2006年国内化学期刊文献 共569,204篇，检索途径为关键字检索，作 者名检索，期刊名检索，发行机构名检索 以及高级组合检索。同时还可以提供其他 入口检索，比如图表信息、化合物、各项 实验数据检索。
18
化工产品数据库
• 收录了共16,000多家国内化学化工产品供应 厂商，以及共67,000多条化工产品信息。检 索途径为，供应厂商检索，产品检索以及 组合检索，可获取产品厂商，产品物化性 质，以及产品价格等信息。
国外的网站：
• Elsevier SDOS电子期刊 • ACS(美国化学学会)电子期刊 • Springer电子期刊 • Wiley interscience电子期刊
5
• 查询化合物性质的网站h ttp:///
• 有机化合物数据库 • 经典有机化学反应 • 有机合成
13
质谱谱图数据库
• 收录了大约12,000多个化合物，检索途径为 质荷比检索，丰度检索以及组合检索，可 获取化合物质谱谱图，物化性质等信息。
14
药物与天然产物数据库
• 覆盖来自不同数据库的药物和利以及参考 文献，另外还包括14万多个天然产物信息 和1万多条相关专利。
11
化学反应数据库
• 覆盖了国内外化学文献中报道的化学反应 200万余条，检索途径为化学反应物检索， 反应产物检索，反应溶剂、催化剂检索及 组合检索等，可获取相关反应信息及参考 文献等，对反应机理研究，合成路线设计 具有相当参考意义。
12
红外谱图数据库
• 收录了大约15万多个化合物，通过特定格 式转化的红外光谱文件以峰位检索，强峰 检索，功能团检索以及组合检索，也可以 通过化合物名称，化合物分子式检索，获 取需要的化合物，主要包括其红外光谱图， 物化性质以及CA登录号等信息。
17
中国化学文献数据库
• 收录了1990年—2006年国内化学期刊文献 共569,204篇，检索途径为关键字检索，作 者名检索，期刊名检索，发行机构名检索 以及高级组合检索。同时还可以提供其他 入口检索，比如图表信息、化合物、各项 实验数据检索。
18
化工产品数据库
• 收录了共16,000多家国内化学化工产品供应 厂商，以及共67,000多条化工产品信息。检 索途径为，供应厂商检索，产品检索以及 组合检索，可获取产品厂商，产品物化性 质，以及产品价格等信息。
《化学信息学资料》课件
加速新发现
通过数据挖掘和分析，化学信息学能够发现潜在的化学规律和现象 ，为新材料的开发、药物设计等领域提供支持。
解决实际问题
化学信息学在环境保护、食品安全、医疗诊断等领域有广泛的应用 ，为解决实际问题提供技术支持。
化学信息学的发展历程
起源
01
化学信息学作为一门学科，起源于20世纪80年代，随着计算机
技术的快速发展和化学数据库的建立。
发展阶段
02
进入21世纪，随着大数据和人工智能技术的兴起，化学信息学
得到了快速发展，广泛应用于各个领域。
未来展望
03
未来，化学信息学将继续融合新的技术和方法，在数据获取、
处理和分析方面取得更大的突破和应用。
02
化学信息学基础知识
分子结构与性质
分子结构
分子中的原子通过化学键相互连 接，形成特定的空间排列。
原子或分子的电子在空间 中的分布状态，决定了分 子的电子结构和化学性质 。
分子轨道理论
通过分子轨道理论可以描 述分子中电子的分布和运 动状态，解释分子的化学 键合和反应机理。
分子光谱与波函数
分子光谱
分子吸收或发射光时产生的光谱，包括红外光谱 、紫外光谱、拉曼光谱等。
波函数
描述电子在原子或分子中运动的量子力学函数， 可以用来描述分子的电子结构和化学性质。
通过化学信息学方法，可以分析环境样品中的污染物成分和浓度，预测污染物的迁移转化规律，为污染 控制和环境治理提供科学依据。
化学信息学还可以应用于生态毒理学研究中，通过分析生物体内外的化学物质及其对生物体的影响，揭 示环境污染对生态系统和人体健康的潜在危害。
材料科学与工程
材料科学与工程是化学信息学的又一应用领域。在现代材料科学研究中，化学信息 学方法被广泛应用于材料的设计、合成、表征和性能预测等方面。
通过数据挖掘和分析，化学信息学能够发现潜在的化学规律和现象 ，为新材料的开发、药物设计等领域提供支持。
解决实际问题
化学信息学在环境保护、食品安全、医疗诊断等领域有广泛的应用 ，为解决实际问题提供技术支持。
化学信息学的发展历程
起源
01
化学信息学作为一门学科，起源于20世纪80年代，随着计算机
技术的快速发展和化学数据库的建立。
发展阶段
02
进入21世纪，随着大数据和人工智能技术的兴起，化学信息学
得到了快速发展，广泛应用于各个领域。
未来展望
03
未来，化学信息学将继续融合新的技术和方法，在数据获取、
处理和分析方面取得更大的突破和应用。
02
化学信息学基础知识
分子结构与性质
分子结构
分子中的原子通过化学键相互连 接，形成特定的空间排列。
原子或分子的电子在空间 中的分布状态，决定了分 子的电子结构和化学性质 。
分子轨道理论
通过分子轨道理论可以描 述分子中电子的分布和运 动状态，解释分子的化学 键合和反应机理。
分子光谱与波函数
分子光谱
分子吸收或发射光时产生的光谱，包括红外光谱 、紫外光谱、拉曼光谱等。
波函数
描述电子在原子或分子中运动的量子力学函数， 可以用来描述分子的电子结构和化学性质。
通过化学信息学方法，可以分析环境样品中的污染物成分和浓度，预测污染物的迁移转化规律，为污染 控制和环境治理提供科学依据。
化学信息学还可以应用于生态毒理学研究中，通过分析生物体内外的化学物质及其对生物体的影响，揭 示环境污染对生态系统和人体健康的潜在危害。
材料科学与工程
材料科学与工程是化学信息学的又一应用领域。在现代材料科学研究中，化学信息 学方法被广泛应用于材料的设计、合成、表征和性能预测等方面。
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ACS数lective Ratiometric Two-Photon Fluorescent Probe for Human Cytochrome P450 1A
➢ 作者:Zi-Ru Dai†, Guang-Bo Ge†‡, Lei Feng†‡, Jing Ning†, Liang-Hai Hu⊥, Qiang Jin†, DanDan Wang†, Xia Lv†, Tong-Yi Dou†, Jing-Nan Cui*‡, and Ling Yang*†
摘要:We report a twophoton fluorescent probe (ASS) that can be excited by 780 nm femtosecond pulses and detect thiols in live cells and living tissues at a 90−180 μm depth without interference from other biologically relevant species by two-
➢ 摘要:Cytochrome P450 1A (CYP1A), one of the most important phase I drug-metabolizing enzymes in humans, plays a crucial role in the metabolic activation of procarcinogenic compounds to their ultimate carcinogens. Herein, we reported the development of a ratiometric two-photonfluorescent probe NCMN that allowed for selective and sensitive detection of CYP1A for the first time. The probe was designed on the basis of substrate preference of CYP1A and its high capacity for O-dealkylation, while 1,8-naphthalimide was selected as fluorophore because of itstwo-photon absorption properties. To achieve a highly selective probe for CYP1A, a series of 1,8-naphthalimide derivatives were synthesized and used to explore the potential structure–selectivity relationship, by using a panel of human CYP isoforms for selectivity screening. After screening and optimization, NCMN displayed the best combination of selectivity, sensitivity and ratiometric fluorescence response following CYP1A-catalyzed O-demetylation. Furthermore, theprobe can be used to real-time monitor the enzyme activity of CYP1A in complex biological systems, and it has the potential for rapid screening of CYP1A modulators using tissue preparation as enzyme sources.
photon microscopy.
.
3
TOC:
.
4
RSC数据库
第一篇
➢ 题目: Recent development of two-photon fluorescent probes for bioimaging
➢ 作者:Dokyoung Kim,a Hye Gun Ryua and Kyo Han Ahn*a
.
1
TOC:
.
2
第二篇
题目:A TwoPhoton Fluorescent Probe for Thiols in Live Cells and Tissues
作者:Jun Han Lee, Chang Su Lim, Yu Shun Tian, Ji Hee Han and Bong Rae Cho*
➢ 摘要:Fluorescent probes are essential tools for studying biological systems. The last decade has witnessed particular interest in the development of two-photon excitable probes, owing to their advantageous features in tissue imaging compared to the corresponding one-photon probes. This review summarizes various types of two-photon probes that have been applied to bioimaging, categorized by the principles in the probe design and the target analytes, which would provide a basis for the future development of novel two-photon probes for tackling important biological issues.
➢ 作者:Zi-Ru Dai†, Guang-Bo Ge†‡, Lei Feng†‡, Jing Ning†, Liang-Hai Hu⊥, Qiang Jin†, DanDan Wang†, Xia Lv†, Tong-Yi Dou†, Jing-Nan Cui*‡, and Ling Yang*†
摘要:We report a twophoton fluorescent probe (ASS) that can be excited by 780 nm femtosecond pulses and detect thiols in live cells and living tissues at a 90−180 μm depth without interference from other biologically relevant species by two-
➢ 摘要:Cytochrome P450 1A (CYP1A), one of the most important phase I drug-metabolizing enzymes in humans, plays a crucial role in the metabolic activation of procarcinogenic compounds to their ultimate carcinogens. Herein, we reported the development of a ratiometric two-photonfluorescent probe NCMN that allowed for selective and sensitive detection of CYP1A for the first time. The probe was designed on the basis of substrate preference of CYP1A and its high capacity for O-dealkylation, while 1,8-naphthalimide was selected as fluorophore because of itstwo-photon absorption properties. To achieve a highly selective probe for CYP1A, a series of 1,8-naphthalimide derivatives were synthesized and used to explore the potential structure–selectivity relationship, by using a panel of human CYP isoforms for selectivity screening. After screening and optimization, NCMN displayed the best combination of selectivity, sensitivity and ratiometric fluorescence response following CYP1A-catalyzed O-demetylation. Furthermore, theprobe can be used to real-time monitor the enzyme activity of CYP1A in complex biological systems, and it has the potential for rapid screening of CYP1A modulators using tissue preparation as enzyme sources.
photon microscopy.
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RSC数据库
第一篇
➢ 题目: Recent development of two-photon fluorescent probes for bioimaging
➢ 作者:Dokyoung Kim,a Hye Gun Ryua and Kyo Han Ahn*a
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TOC:
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第二篇
题目:A TwoPhoton Fluorescent Probe for Thiols in Live Cells and Tissues
作者:Jun Han Lee, Chang Su Lim, Yu Shun Tian, Ji Hee Han and Bong Rae Cho*
➢ 摘要:Fluorescent probes are essential tools for studying biological systems. The last decade has witnessed particular interest in the development of two-photon excitable probes, owing to their advantageous features in tissue imaging compared to the corresponding one-photon probes. This review summarizes various types of two-photon probes that have been applied to bioimaging, categorized by the principles in the probe design and the target analytes, which would provide a basis for the future development of novel two-photon probes for tackling important biological issues.