凡纳滨对虾选育系间杂交的生长性状及遗传多样性分析
SPF凡纳滨对虾F1、F2及杂交代生长和存活比较研究
SPF凡纳滨对虾F1、F2及杂交代生长和存活比较研究姚雪梅;黄勃;张继涛;王志勇【期刊名称】《中国水产科学》【年(卷),期】2007(014)002【摘要】以引进美国夏威夷海洋研究所SPF凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)群体建立自交系F1和F2,并与海南经过若干代养殖后选育的健康凡纳滨对虾建立杂交系(SPF♀×海南种♂),获得杂交代 .通过大规模养殖发现,F1生长最快,杂交代居中,F2最慢.但F1存活率显著低于F2和杂交代.主要是因为F1适应力差,甚至不断有发病个体出现.从虾苗下塘至100日龄,杂交代、F2和F1整个养殖周期存活率分别为60%、54.8%和14.6%,说明杂交代和F2适应力均好于F1.杂交代与F1 100日龄生长相近,方差分析表明两者差异并不显著(P＞0.05).在养殖后期杂交代生长和存活率优势明显,不但保持了引进种较好的生长性状,而且表现出海南选育的凡纳滨对虾存活率高的优良性状,杂交优势显著.【总页数】5页(P326-330)【作者】姚雪梅;黄勃;张继涛;王志勇【作者单位】海南大学,海洋学院,海南,海口,570228;海南大学,海洋学院,海南,海口,570228;海南陵水海富实业有限公司,海南,陵水,572400;海南陵水海富实业有限公司,海南,陵水,572400【正文语种】中文【中图分类】S9【相关文献】1.SPF凡纳滨对虾F1代、F2代养殖性状比较研究 [J], 姚雪梅;黄勃;张继涛2.挪威红牛与荷斯坦杂交代(F1代)出生体重和生长增重的研究 [J], 欧四海;冯建丽;何开兵;吴洁;付云宝;王建涛;吴海山;陈爱江;陈雄柏3.本地西杂牛与德系西门塔尔牛杂交的F1代、F2代公牛生长规律研究 [J], 李春芳;和利民;侯秀贤;张艳舫;马亚宾;倪俊卿4.德系西门塔尔牛与河北西杂牛杂交F1、F2代公牛生长比较的研究 [J], 张艳舫;段晓红;李英超;李建明;杨帆;侯秀贤;倪俊卿5.通用引物SPF1/GP6++与SPF1/GP6+聚合酶链式反应检测多型别人乳头瘤病毒敏感度的比较 [J], 安国;李勇;刘彤;郭榕因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
凡纳滨对虾线粒体控制区群体遗传学分析 【15页】
凡纳滨对虾线粒体控制区群体遗传学分析目录摘要 (3)ABSTRACT (3)1绪论 (4)2 材料与方法 (4)2.1研究样品来源及总DNA的提取 (4)2.2 mtDNA控制区基因序列的扩增及测序 (4)2.3 线粒体控制区序列的整理与分析 (5)3 结果 (5)3.1凡纳滨对虾线粒体DNA测序结果 (5)3.2凡纳滨对虾单倍型及单倍型多样性 (5)3.3凡纳滨对虾群体间的遗传分化与遗传距离 (7)3.4 基于mtDNA控制区序列的凡纳滨对虾分子系统树 (9)4 讨论 (10)4.1凡纳滨对虾种群遗传多样性 (10)4.2凡纳滨对虾的遗传距离和遗传分化 (10)4.3 线粒体DNA标记鉴别不同凡纳滨对虾养殖群体的可行性 ................10.5.结论 (11)参考文献 (11)凡纳滨对虾的线粒体控制区群体遗传学分析摘要：本研究通过对4个凡纳滨对虾群体即G1、G2、S1、S2的线粒体DNA(mtDNA)控制区部分基因序列的测定，系统的分析了其遗传多样性，对比他们之间系统进化关系。
在4个凡纳滨对虾群体共40个样本的线粒体控制区序列中共检测到17种单倍型，其中群体G1和G2单倍型数量最多，分别为8个和6个。
S2群体单倍型数最少，仅有1个，S1和S2群体的单倍型个数均为1个。
4个群体单倍型多样性（H1）在0.416±0.090~0.973±0.022，其中遗传多样性最高的为G1群体。
AMOVE分析结果显示，来自群体间的遗传差异（57.03%）略高于群体内的变异（42.97%）。
各群体的遗传分化Fst值均为正值，其中GD组与其他群体之间差异最大。
用MEGA5.0基于遗传距离构建系统进化树，结果表明5个凡纳滨对虾群体中，S1和S2遗传距离最近（D=0.017），聚为一支，G2群体聚为一支，G1群体单独聚为一支，4个凡纳滨对虾群体中，4个群体共享单倍型H1，此外，S1和S2共享单倍型H2，G1和G2共享单倍型H11，可能是由于其在选育过程中亲本的遗传背景存在交叉，而G2群体与其他群体遗传距离较远，可能与选择群体样本的地理位置差异相关。
凡纳滨对虾群体的ISSR分析及抗病力指标的比较的开题报告
凡纳滨对虾群体的ISSR分析及抗病力指标的比较的开题报告一、研究背景及意义凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）是一种重要的养殖经济动物，其产值已成为全球水产业的支柱之一。
然而，由于对虾养殖密度大、生长速度快、环境异质性强等因素，导致对虾养殖易发生疾病，且抗病力不同。
因此，建立诊断和防治途径、选育抗病性强的对虾品系，对于提高对虾养殖产业发展的质量和效益至关重要。
分子标记技术是一种研究遗传多样性及其遗传机制的有效手段，ISSR为其中的一种常用的分子标记技术，其具有快捷、经济、高效等优点，已被广泛用于对虾的遗传多样性及其育种研究。
因此，本研究旨在利用ISSR分析凡纳滨对虾群体的遗传多样性，探讨其抗病力的分子标记指标，并为对虾的育种研究提供一定的理论基础。
二、研究内容及方法研究内容：1. 对凡纳滨对虾不同群体进行ISSR分析，评估其遗传多样性；2. 利用不同对虾品系进行比较研究，探究其抗病力指标；3. 建立对虾品系的ISSR指纹图谱。
研究方法：1. 样本采集与处理：选取4个地区的凡纳滨对虾进行采集，并进行分离提纯。
DNA提取后，利用ISSR引物扩增，通过PCR扩增产物进行比对分析。
2. ISSR分析：选取合适的ISSR引物，进行PCR扩增、电泳分析、结果分析。
3. 杀菌实验：分别利用不同抗病性品系的对虾，进行细菌感染实验，以评估其抗病力。
4. 数据分析：统计数据并进行分析，建立样本的ISSR指纹图谱。
三、预期结果与意义预期结果：1. 对凡纳滨对虾进行的ISSR分析可获取其遗传多样性信息；2. 可较为准确地判断不同对虾品系的抗病性；3. 可建立凡纳滨对虾ISSR指纹图谱；4. 为对虾的育种研究提供一定的理论基础。
意义：1. 为对虾的遗传多样性研究和抗病性育种提供科学依据；2. 对提高凡纳滨对虾养殖产业发展的质量和效益具有重要推动作用。
凡纳滨对虾抗WSSV选育家系的抗病与生长特性
凡纳滨对虾抗WSSV选育家系的抗病与生长特性黄永春;艾华水;殷志新;黄仙德;李色东;翁少萍;何建国【期刊名称】《应用海洋学学报》【年(卷),期】2011(030)003【摘要】从引进的无特定病原(SPF)凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)亲虾生产的子代中挑选出生长快、体格健壮等性状良好的个体作为亲本建立16个第一代选育家系,并经223d饲养和感染实验从中挑选出抗病力强、生长快的家系建立21个第二代家系.抗WSSV实验的结果表明:第一代选育各家系经感染WSSV(投喂)后的成活率在0～61.5％之间,平均成活率为30.0％±16.5％；第二代选育家系成活率在14.5％～70.0％之间,平均成活率为37.3％±15.2％,比第一代提高24.3％.21个第二代选育家系经28 d的生长实验显示:21个选育家系体长特定生长率在0.001 5～0.0142之间,体重特定生长率在0.005 3～0.0279之间；两代选育家系抗病与生长的结果表明:抗病较强的家系生长快,抗病差的家系生长慢,但抗病最强或生长最快的家系,其对应的生长或抗病性能则不理想.%Sixteen fast-growing and robust pairs of imported specific pathogen-free Litopenaeus vannamei were selected as first-generation breeding families. After 223 days of breeding and infection tests, 21 fast-growing pairs with strong disease resistance were selected as second-generation breeding families. White spot syndrome virus ( WSSV) challenge tests showed that the survival rates after the oral infection of the first-generation breeding families were 0 ~ 61. 5% ( mean; 30. 0% ± 16. 5% ) and those of the second-generation breeding families were 14. 5% -70.0% ( mean; 37. 3% ± 15. 2% ), 24. 3%higher than those of the first-generation breeding families. After rearing for 28 days, the body length specific growth rates of the 21 selected second-generation breeding families were 0.001 5 -0.0142, and the specific body weight increases were 0.005 3-0.027 9. The regression of the survival rate (Y) and the body length specific growth rate (X1) was established as Y = -23.484 X1 +0.485 9 ( r = 0.558) , and the regression of the survival rate ( Y) and the body weight specific growth rate ( X2) was established as Y = -13.921 X2 +0. 541 2(r =0. 557). The resistance to WSSV and the growth of two generations of breeding families indicated that the growth rates of more resistant families were much faster than more susceptible families with a slower growth rate. However, the most resistant or fastest growing families performed poorly in growth rates or disease resistance.【总页数】7页(P412-418)【作者】黄永春;艾华水;殷志新;黄仙德;李色东;翁少萍;何建国【作者单位】中山大学生命科学学院,广东广州510275;集美大学水产学院,福建厦门361021;中山大学生命科学学院,广东广州510275;中山大学生命科学学院,广东广州510275;中山大学生命科学学院,广东广州510275;广东湛江恒兴集团有限公司,广东广州524033;中山大学生命科学学院,广东广州510275;中山大学生命科学学院,广东广州510275【正文语种】中文【中图分类】P735【相关文献】1.凡纳滨对虾抗逆F1家系的生长、抗逆和抗WSSV的比较 [J], 王成桂;吕灿祥;杨世平;黄海立;梁华芳;陈兆明;孙成波2.5个凡纳滨对虾抗WSSV家系遗传性状的比较 [J], 王成桂;杨世平;蔡志方;黄海立;梁华芳;陈兆明;孙成波3.凡纳滨对虾抗WSSV选育家系的建立及其抗病特性 [J], 黄永春;艾华水;潘忠诚;陈锚;翁少萍;何建国;李色东4.第四代凡纳滨对虾抗WSSV选育家系的抗病及免疫特性研究 [J], 黄永春;艾华水;殷志新;黄仙德;李色东;翁少萍;何建国5.牙鲆抗淋巴囊肿病家系选育及生长和抗病性能分析 [J], 侯吉伦;刘海金;王玉芬;王桂兴;张晓彦;宋立民;孙朝徽;赵雅贤;任建功;姜秀凤;司飞因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
基于AFLP技术的凡纳滨对虾遗传多样性研究
基于AFLP技术的凡纳滨对虾遗传多样性研究薛姝雯;刘小林;李喜莲;张琼;黄皓;相建海【摘要】[目的]对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)人工繁育养殖群体进行遗传多样性评价,获得家系间和家系内的差异,为凡纳滨对虾遗传育种工作提供技术支持.[方法]采用AFLP分子标记技术,对抽查的凡纳滨对虾35个家系共计350个样品进行遗传多样性分析,统计多态性条带,应用Popgene Version 1.31、Arlequin Version3.1、Mega 3.1软件,计算各家系的Shannon指数、遗传分化系数Fst及基因流Nm等遗传参数,采用UPGMA法,根据Nei's遗传距离绘制家系间的聚类分析图.[结果]筛选的10对选择性引物共扩增出312个可用于分析的位点,其中多态性位点162个,占总标记数的51.92%;凡纳滨对虾各个家系的多态位点百分率和Shannon指数分别为12.50%～32.69%和0.068 3～0.181 7.所有家系中,有36.38%的变异存在于家系间,有63.62%的变异为家系内的遗传变异,遗传分化系数Fst为0.363 8,基因流Nm为0.937 2.[结论]凡纳滨对虾群体遗传多样性较为丰富,具备一定的选择潜力,在传代过程中已经形成了各自相对独立的遗传体系,可以根据亲缘关系,选择利用其中的个体作为育种材料.【期刊名称】《西北农林科技大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2010(038)011【总页数】6页(P43-48)【关键词】凡纳滨对虾;AFLP;遗传多样性【作者】薛姝雯;刘小林;李喜莲;张琼;黄皓;相建海【作者单位】西北农林科技大学,动物科技学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西,杨凌712100;西北农林科技大学,动物科技学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西,杨凌712100;西北农林科技大学,动物科技学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西,杨凌712100;西北农林科技大学,动物科技学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西,杨凌712100;海南南疆生物技术有限公司,海南,三亚572000;中国科学院海洋研究所,实验海洋生物学开放实验室,山东,青岛266071【正文语种】中文【中图分类】S966.12+9.6凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)又称南美白对虾，自然分布于中、南美太平洋沿岸水域。
凡纳滨对虾生长性状的双列杂交分析
凡纳滨对虾生长性状的双列杂交分析林红军;沈琪;张吕平;胡超群;梁立清【期刊名称】《热带海洋学报》【年(卷),期】2010(29)6【摘要】以来源于两个不同遗传背景群体的凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei 为亲本,设置PP(P♀×P♂)、PH(P♀×H♂)、HP(H♀×P♂)、HH(H♀×H♂) 4个实验组(P代表进口群体,H代表选育群体),进行进口个体(P♂和P♀)与选育个体(H♂和H♀)间的双列杂交实验,分析比较其子一代的生长与存活情况.结果发现,对虾存活由高到低顺序为HH>HP>PH>PP,PH实验组表现出明显的存活杂种优势,其育苗期间的杂种优势平均值为(27.72±11.88)%,下塘90d后成活率的杂种优势为30.50%.在生长前期(30日龄以前)对虾平均体长和体重的顺序是HP>PH>HH>PP,而在生长后期则为PP>HP>PH>HH.HP实验组在整个养成期(10、30、60和90d)均表现出体长和体重上的杂种优势,杂种优势值分别为24.00%、13.71%、2.55%、2.79%和112.46%、54.06%、8.16%、12.48%.结果表明,选育群体为母本、进口群体为父本的对虾杂交后代的生长和存活性状明显提高.【总页数】6页(P51-56)【作者】林红军;沈琪;张吕平;胡超群;梁立清【作者单位】中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室,广东省应用海洋生物重点实验室,广东,广州,510301;衡水学院生命科学学院,河北,衡水,053000;中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室,广东省应用海洋生物重点实验室,广东,广州,510301;中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室,广东省应用海洋生物重点实验室,广东,广州,510301;中国科学院南海海洋研究所中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室,广东省应用海洋生物重点实验室,广东,广州,510301;湛江市东方实业有限公司,广东,湛江524008【正文语种】中文【中图分类】P735.2【相关文献】1.油茶5×5全双列杂交子代幼林生长性状的配合力分析 [J], 林萍;姚小华;滕建华;王开良;任华东;叶峰2.长牡蛎(Crassostrea gigas)三个选育群体完全双列杂交后代生长性状分析 [J], 王卫军;李琪;杨建敏;李彬;张荣良3.杉木两水平双列杂交子代生长性状配合力分析 [J], 方扬辉4.虹鳟完全双列杂交试验生长性状遗传分析 [J], 李艳红;李宁;蒋丽;谷伟;张晓慧;杨润清;王炳谦5.白桦5×5双列杂交子代生长性状的遗传效应分析 [J], 王成;滕文华;李开隆;张含国;夏德安;姜静因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
凡纳滨对虾EST-SSR标记的筛选及遗传多态性检测
第３ ３卷
第 １ 期
海
洋
学
报
ＶｏＩ ３， ＮＯ ．３ ．１
２ １ 年 １月 ０１
ห้องสมุดไป่ตู้
ＡＣＴＡ ＯＣＥＡ ＮＯＬＯＧＩ ＣＡ ＮＩ ＳＩ ＣＡ
Ｊ ｎ ａ ｙ２ １ ａ ｕｒ ０ １
凡 纳 滨对 虾 Ｅ Ｔ Ｓ Ｒ标 记 的筛 选及 遗传 多态 性检 测 Ｓ －Ｓ
张琼 李喜莲 薛淑 雯 ， ， ， 刘小林¨ ， 皓。相建 海。 黄 ，
依据。
关键 词 ： 纳滨 对虾 ； Ｓ Ｓ Ｒ； 传 多样 性 凡 Ｅ Ｔ—Ｓ 遗
中图分类号 ： ７．３ Ｑ１ ８ ５ 文献标 志码 ： Ａ 文 章 编 号 ： ２ ３ ４ ９ （ ０ １ ０ － １ １０ ０ ５ — １ ３ ２ １ ） １０ ２ － ６
ｌ 引 言
凡 纳 滨 对 虾 （ ｔｐ ｎ ｅ ｓｖ ｎ ａ ｉ ， 称 南 Ｌｉ ｅａ ｕ ａ ｎ ｍｅ ） 又 ｏ
摘 要 ：为 了研 究我 国海 南地 区某 凡 纳 滨 对 虾 （ ｔｐ ｎ ｅｓ ａ ｎ ｍｅ ） 育 群 体 的 种 质 资 源 多 样 Ｌｉ ｅａ ｕ ｎ ａ ｉ 繁 ｏ ｖ 性， 取 １ 选 ４个 比利 时野 生对 虾 的 Ｅ Ｔ 微 卫 星标 记 ， ２ ０个 中 国人 工选 育 的凡 纳 滨 对虾 个 体 为 Ｓ 以 ４
凡纳滨对虾三个亲本群体及其子代的遗传变异分析的开题报告
凡纳滨对虾三个亲本群体及其子代的遗传变异分析的开题
报告
1. 研究背景
凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）是世界上最重要的养殖品种之一，而其优良的养殖性状与其遗传育种密切相关。
三个不同来源的凡纳滨对虾亲本群体之间的遗
传变异成为育种研究的关键。
2. 研究目的
本研究旨在对不同来源的凡纳滨对虾三个亲本群体及其子代的遗传变异进行分析，以比较分析其遗传变异特征及潜在遗传育种价值。
3. 研究方法
选取来自不同区域的三个凡纳滨对虾亲本群体作为研究对象，分别为墨西哥、巴拿马和美国的常规养殖亲本。
收集其子代的样本，提取DNA，利用SNP芯片进行基因分型，采用基于SNP的多样性分析方法，比较分析三个亲本群体及其子代的遗传变异
特征，其中包括杂合度、聚类分析、主成分分析等。
4. 研究预期结果
本研究将重点关注凡纳滨对虾三个亲本群体及其子代的遗传变异差异及分布情况。
预期结果将分析其杂合度、遗传多样性和群体结构等特征，进一步研究凡纳滨对虾的
遗传育种潜力和适应性。
最终可为凡纳滨对虾的遗传育种提供科学依据。
5. 研究意义
本研究将有助于深入了解不同来源的凡纳滨对虾亲本群体之间的遗传变异差异，有利于优化育种策略，提高凡纳滨对虾的产量和质量，为凡纳滨对虾产业的可持续发
展提供支持。
同时，本研究还为其他重要水产类生物的遗传育种研究提供了新的思路
和参考。
凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)不同世代养殖群体的遗传多样性分析
４ ０７ ３０２
提 要
采 用微卫 星位 点对 凡纳滨 对虾 的海 南群体 （ 口亲虾 繁育 的第 １ 进 世代 ： ） 山东 和饶平群体 Ｇ１、
（ ２、湛江 ２和 湛江 ３群体（ ３、湛江 １ 上海群体（ ４共 ４个 世代 ７个养殖群 体 的遗传 多样 性进 Ｇ） Ｇ） 和 Ｇ）
行 了分析 。 ２ 对微卫 星 ｝物 中筛选 出 １ 从 ｌ Ｊ ２对有 效扩增 引物，对 ７个群体 共 ２ ０个个体进 行扩增，得 ８ 到ｌ ０个 多态位 点，共获 得等位基 因数 ６ ３个。 各位 点 的等位基 因数在 ２ ｌ 之 间，各群体 的平 均等 一 ５个
第４ ０卷 第 ２期
２ 年 ０９ ０ ３ 月
海
洋
与
湖
沼
ＶＯ１４ ＮＯ． ．０． ２ Ｍ ａ ．２ ９ ｒ， ００
ＯＣ ＥＡＮＯＬ ＯＧＩ Ａ Ｅ Ｌ ＭＮ０Ｌ０Ｇ Ａ Ｓ ＮＩ Ｔ Ｉ Ｉ Ｉ ＣＡ
凡纳滨对 虾（ｉ ｐ ｎ ｅ ｓ ａ ｎ ｍｅ Ｔ 世 代养殖 Ｌｔ ｅ ａ ｕ ｎ ａ ｉ ｆ ｏ ｖ ）￣ 群体 的遗传 多样 性分析水
｝广东省科技计划重点项 目，０ ４ ２ １ ５ ０ ２ ０ Ａ ０ ０ ０ ２号。童 馨，硕士， — ｉ ｗ ｓｉｈ ａ ＠ｙ ｈｏｔ ｍｃ Ｅ ｍａ ： ｅｈｇ ｗ ｙ ａｏ ． ． ｌ ｏ ｎ
① 通讯 作 者 ：喻 达 辉 ， 士 ，研 究 员 ， — ｉ ｐａｌｄ ＠ １３ ｏ 博 Ｅｍａｌ ｅｒ ｈ ６ ． ｍ ： ｙ ｃ 收稿 日期 ： ０ ８０ —９ ２０ ．３２ ，收修 改 稿 日期 ： ０ ８０ —７ ２０ —５２
关键词
中图分类号
凡 纳滨对 虾，微卫 星 Ｄ ，遗传分 化，杂合子 缺失 ＮＡ
凡纳滨对虾八个地理群体遗传多样性的微卫星分析
凡纳滨对虾八个地理群体遗传多样性的微卫星分析刘洪涛;杨明秋;何玉贵;唐贤明【期刊名称】《海南大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2018(036)002【摘要】选用15对多态性较高的微卫星引物,对8个地理群体的凡纳滨对虾的遗传多样性和亲缘关系进行了分析,结果显示:8个群体的平均有效等位基因数(Ne)为2.26～2.86;平均观测杂合度(Ho)为0.59～0.71;平均多态信息含量(Pic)为0.42～0.55.厄瓜多尔、新加坡、海南和泰国正大一群体的遗传变异度大,为高多态性群体.新加坡群体和海南本地群体的遗传距离最大(0.2154),海南本地群体和泰国正大一群体的遗传距离最小(0.0214),即海南本地群体与泰国正大一群体的亲缘关系最近,与新加坡群体的亲缘关系最远.【总页数】7页(P146-152)【作者】刘洪涛;杨明秋;何玉贵;唐贤明【作者单位】海南省海洋与渔业科学院,海南海口570206;海南省海洋与渔业科学院,海南海口570206;海南省海洋与渔业科学院,海南海口570206;海南省海洋与渔业科学院,海南海口570206【正文语种】中文【中图分类】S917.4【相关文献】1.基于微卫星的泥蚶5个地理群体遗传多样性分析 [J], 程雪艳;滕爽爽;肖国强;邵艳卿;张炯明;方军;柴雪良2.梭鱼(Liza haematocheila)4个野生地理群体遗传多样性的微卫星分析 [J], 毛守康;马爱军;丁福红;闫喜武;罗海忠;李伟业;徐宝荣;王怀忠;王宝义3.魁蚶4个地理群体遗传多样性微卫星分析 [J], 田吉腾;刘志鸿;杨爱国;吴彪;周丽青4.飘鱼微卫星位点的筛选及珠江流域5个地理群体的遗传多样性分析 [J], 阮惠婷; 徐姗楠; 李敏; 戴嘉格; 李振海; 邹柯姝; 刘丽5.许氏平鲉6个地理群体遗传多样性的微卫星分析 [J], 任建功;王青林;孙朝徽;于姗姗;王桂兴;于清海;刘霞;宋立民;司飞因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
基于微卫星分子标记信息对低温条件下凡纳滨对虾生长及出肉率性状的遗传参数估计
基于微卫星分子标记信息对低温条件下凡纳滨对虾生长及出肉率性状的遗传参数估计凡纳滨对虾(Pacific white shrimp,Litopenaeus vannamei),又名南美白对虾,自然分布于南美洲太平洋沿岸水域,是世界重要的对虾类养殖品种之一。
凡纳滨对虾具有适应性广泛、对不良环境抗逆性强、生长速度快等特点,其肉质鲜美,深受人们的喜爱,有着十分广阔的市场前景。
但是近年来由于气候异常,导致我国南方凡纳滨对虾主养殖区屡次遭遇寒灾,对凡纳滨对虾产业造成重大损失。
异常低温不仅导致凡纳滨对虾大量死亡,同时温度因素也制约着凡纳滨对虾的养殖季节和地域,影响养殖产量和效益。
为了加速培育出耐低温凡纳滨对虾新品种,提高养殖产量和经济效益,对凡纳滨对虾耐低温相关性状的遗传参数进行估计是十分必要的。
然而,在传统的BLUP遗传育种方法中,个体间亲缘关系的确定来源于人为记录的物理系谱,物理系谱的构建很容易由于标记脱落、误读和引入共同环境效应而导致信息错误或不准确,给性状遗传参数的准确估计造成困难。
本研究首次将微卫星分子标记引入凡纳滨对虾耐低温性状遗传参数的评估中,通过计算分子亲缘相关度构建分子系谱进而对性状遗传参数进行估计,并利用交叉验证跟物理系谱相比较,以佐证分子亲缘相关度在实际中估计性状遗传参数的可行性。
本实验主要结果如下:(1)本实验通过筛选凡纳滨对虾多态性微卫星位点,并不断优化位点组合、反应体系及反应程序,成功建立了一个五重、两个四重和一个三重PCR反应体系,并将其应用于11个凡纳滨对虾家系的亲权鉴定。
结果显示,4组多重PCR体系中的16个微卫星位点在11个凡纳滨对虾家系中的平均等位基因数(Na)为6,平均多态信息含量(PIC)为0.581,平均观测杂合度(Ho)为0.513,平均期望杂合度(He)为0.636。
利用Cervus3.0软件,对已知系谱关系的11个凡纳滨对虾家系进行亲权分析,其第一亲本累积排除率(CE-1P)、第二亲本累积排除率(CE-2P)和双亲累积排除率(CE-PP)分别为 0.99525487、0.99990862 和 0.99999986。
凡纳滨对虾抗WSSV选育家系的抗病与生长特性
家 系选 育 是 获 得 优 良品 种 （ 系 ） 品 的重 要 方 法
家 系对虾 存 活 率 呈 负 相 关 （ 一 ．５ 。 张 天 时 ｒ＝ ０４ ）。 ； （０７ 采用定 向交配建立 了 １１ 中国对 虾 （ ｅｎｒ ２０ ） ０个 Ｆｎｅ － ｏｅａｕ ｈｎｎｉ） 同胞 家 系和 ２ ｐｎｅｓｃｉｅｓ 全 ｓ ９个 中国对 虾半 同
纳 滨对虾 的选择 育种 研究 是 在对生 长 性能 和 Ｔ Ｖ抗 ｓ
１ 材料与方法
１ １ 家 系建立 ．
１ １１ 个 体 选 育 ．．
２０ ０ ２年 １ 从 当 年 引 进 的 无 １月
特定 病原 （ Ｐ ）凡 纳滨 对 虾 亲 虾 （ 国夏 威 夷 ） ＳＦ 美 生
性 等权 重 的综 合 选择 指 数 进行 的 ． ｓ １９ ） Ｍｏｓ（９９ 报
摘要 ： 引进 的无特 定病原 （ Ｐ ）凡 纳滨 对虾 （ ｉｐｎ ｅ ｓ ａ ｎ ｍ ｉ 亲虾 生产 的 子代 中挑 选 出 生长 从 ＳＦ Ｌｔ ｅ ａｕ ｎ ａ ｅ） ｏ ｖ
快、 体格 健 壮等 性状 良好 的 个体作 为 亲本 建 立 １ 第一代 选 育 家 系， 经 ２ ３ 养 和感 染 实验从 ６个 并 ２ ｄ饲
产 的子代 中挑 选 出 生 长快 、 格健 壮 等 性 状 良好 的 体
道 ５４ １ 个全同胞家系对虾的生产性能与 Ｔ Ｖ感染的 Ｓ
育 家系成 活率在 １．％ ～ ００ ４５ ７ ．％之 间 ， 平均成 活率为 ３ ．％ ±１．％ ， 第一代提 高 ２ ．％ ．１个 第 ７３ ５２ 比 ４３ ２ 二 代选 育 家系经 ２ ８ｄ的生长 实验 显示 ：１个选育 家 系体长特 定生长 率在 ００ １ ００４２之 间 ， 重 ２ ．０ ５～ ．１ 体
凡纳滨对虾遗传多样性的SSR分析
ｍ ｌＬＥ Ｔ ｐ ． ；％ Ｓ Ｓ２ ｇｍＬ胰 Ｒ Ａ酶 ） ｍｏ Ｄ Ａ，Ｈ ８ ０ １ ／ Ｄ ；０ ／ Ｎ ， 用剪刀剪碎 ；２ 加入 ２ ｇ Ｌ蛋白酶 Ｋ８ Ｌ 终 浓度 （） ０ｍ ／ｍ （ ４ ０Ｉ ／ ） 充分混匀后 ， ０ ｇｍＬ ， ｘ 放人 ５ ℃ 水浴锅 中温浴 ３ｈ； ５ （ ） ６ｍ ｌＬ Ｎ Ｃ ０ Ｌ 在旋 涡混 合器 上 高速混 合 ３ 加 ｏ ａ１ ０Ｉ ， ／ ３ ｘ
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第２ ８卷 第 １ 期
水
利 渔 业
２０ ０ ８年 １月
． １． ３
凡 纳 滨 对 虾 遗传 多样 性 的 Ｓ Ｒ分 析 Ｓ
曾地刚， 陈晓汉 ， 李咏梅 ， 敏 ， 彭 蒋伟明， 杨春玲
（ 广西水产研 究所 ， 西 南宁 广 ５０ ２ ） ３ ０ １
国南方主要养殖虾种 ， 受国内外市场 的青 睐。 深 微卫 星 （ ｉ ａａ ｌｔ） Ｍ ｃ ｓｔ ｌｅ 或简 单 重 复 序 列 （ ｉｐｅ ｓ— ｒ ｅｉ ｓ ｌ ｅ ｍ
人工养殖群体的 ４ ８个凡 纳滨对虾样 品活体运 回实验室 ，
一
８ ＆Ｃ保存 ， 别 提取 凡纳 滨对 虾个 体 的基 因组 Ｄ Ａ 分 Ｎ。
摘要：通过对 ５ Ｓ Ｒ位点的聚合酶链 式反应 （ Ｃ 扩增 、 个 Ｓ Ｐ Ｒ） 聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染 色检测 ， 究凡 探
纳滨对虾群体 的遗传多样性 。结果表 明 ， 供试的凡纳滨对虾群体在 ５个 Ｓ Ｒ位点上有 ２～ Ｓ ４个等位基 因， 平
均等位基因数 ３个 ， 平均杂合度 ０ ５５ ， ．７ ５ 平均多态信息量 ０ ４ ６ ， ． ８４ 平均 有效等位基 因数 ２５ ５ 。全群基 因纯 ．０３ 合度 ０— ． ， 均 ０ ３ １ 。显示该凡纳滨对虾群体 的遗传多样性水平处于 中度多态 。 ０ ８平 ．９７ 关键词 ： 凡纳滨对虾 ；Ｓ 遗传 多样性 Ｓ Ｒ；
凡纳滨对虾引进群体与养殖群体遗传多样性的AFLP分析
凡纳滨对虾引进群体与养殖群体遗传多样性的AFLP分析叶宁;包秀凤;刘建勇【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2017(041)003【摘要】The white shrimp,Litopenaeus vannamei,is one of the most important aquaculture species in China.The broodstocks used in China are mainly introduced from abroad.Recently,several new domestic white shrimp strains have been bred and used as broodstock.To further strengthen the genetic breeding of white shrimp,it is necessary to understand genetic diversity status of different strains.In the present study,the amplified fragment length polymorphism (AFLP) was employed to analyze the population genetic diversity and genetic difference between four introduced populations and three domestic breeding populations.A total of 105 fragments in length of 100～500 bp were identified from 210 individuals using seven AFLP primer combinations,of which 90 of 105 fragments were polymorphic,and the proportion of polymorphic loci was 85.71％.The polymorphic loci within populations varied from 54.17％ to 65.63％,with an average of 60.53％,and the mean heterozygosities ranged from 0.164 to 0.236,with an average of 0.202.AMOVA analysis revealed that 51.79％ of genetic variations derived from populations,the estimated ΦST value over all polymorphic loci across the seven populations was0.518,indicating significant genetic differences between populations andstrong population structure.Furthermore,these results could provide theoretical supports for germplasm improvement ofL.Vannamei..%为了解引进群体与国内养殖凡纳滨对虾群体遗传多样性水平,提高我国凡纳滨对虾种质改良效果,应用AFLP标记技术对国外引进群体和国内养殖凡纳滨对虾群体的遗传多样性进行分析.采用7对AFLP引物组合对7个群体(4个引进群体,3个养殖群体)210个个体进行扩增,结果发现,7个群体在100～500 bp共检测到105个位点,其中多态性位点为90个,多态位点比例为85.71％.4个引进群体(KONABA、SISMAN、OI、CHAI)的多态性位点百分率分别为62.5％,57.29％,61.21％,61.46％;3个国内养殖群体(ZX、ZK、GDOU)的多态性位点百分率分别为65.63％,61.46％,54.17％.7个群体的平均期望杂合度为0.202,表明所检测的7个群体均具有较高的遗传多样性.AMOVA分析显示,51.79％的变异来源于群体间,群体的平均ΦsT值为0.518,表明凡纳滨对虾群体内遗传多样性非常丰富,群体间相似性较大,且存在较强的基因交流.本研究可为我国凡纳滨对虾种质改良提供基础资料.【总页数】8页(P339-346)【作者】叶宁;包秀凤;刘建勇【作者单位】广东海洋大学水产学院,湛江市海洋生态与养殖环境重点实验室,广东湛江524088;广东海洋大学水产学院,湛江市海洋生态与养殖环境重点实验室,广东湛江524088;广东海洋大学水产学院,湛江市海洋生态与养殖环境重点实验室,广东湛江524088【正文语种】中文【中图分类】Q347;S917.4【相关文献】1.卵形鲳鲹养殖群体与野生群体遗传多样性的AFLP分析 [J], 彭敏;陈晓汉;陈秀荔;蒋伟明;杨春玲;李咏梅2.凡纳滨对虾引进群体和2个养殖群体遗传变异的微卫星分析 [J], 马春艳;马洪雨;马凌波;杨柯3.凡纳滨对虾引进群体和养殖群体的PCR-RFLP分析 [J], 杨柯;马春艳;马凌波;胡卫国;顾德平4.文蛤养殖群体和野生群体遗传多样性的AFLP分析 [J], 赫崇波;丛林林;葛陇利;刘卫东;周遵春;高祥刚5.不同凡纳滨对虾养殖群体的微卫星遗传多样性分析 [J], 唐芳;温贝妮;刘红因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
基于微卫星分子标记的凡纳滨对虾商业苗种遗传多样性分析
第41卷第5期渔业科学进展Vol.41, No.5 2020年10月Oct., 2020 DOI: 10.19663/j.issn2095-9869.20190527004 /方振朋, 孟宪红, 李旭鹏, 栾生, 曹家旺, 陈宝龙, 孔杰, 闫茂仓, 胡利华. 基于微卫星分子标记的凡纳滨对虾商业苗种遗传多样性分析. 渔业科学进展, 2020, 41(5): 101–109Fang ZP, Meng XH, Li XP, Luan S, Cao JW, Chen BL, Kong J, Yan MC, Hu LH. Genetic diversity analysis of domestic commercial brands seedlings of Litopenaeus vannamei based on microsatellite molecular markers. Progress in Fishery Sciences, 2020, 41(5): 101–109基于微卫星分子标记的凡纳滨对虾商业苗种遗传多样性分析*方振朋1,2孟宪红2①李旭鹏2栾生2曹家旺2陈宝龙2孔杰2闫茂仓3胡利华3(1. 上海海洋大学水产与生命学院上海201306；2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室青岛266071；3. 浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室温州325005)摘要为研究我国凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)商业苗种的遗传多样性特征，于河北、山东、广东、海南等地采集了6个有代表性的凡纳滨对虾品牌苗种，分别命名为黄骅R、东营M、广州P、广州Z、海南S和海南Z，以8个微卫星标记检测其遗传多样性。
结果显示，6个品牌的凡纳滨对虾在8个位点呈现不同程度的多态性，其平均等位基因数(N a)、期望杂合度(H e)、观测杂合度(H o)和多态信息含量(PIC)分别为4.5~9.5、0.516~0.733、0.346~0.550和0.472~0.700，各品牌遗传多样性丰富程度从高到低分别为黄骅R>广州Z>广州P>海南Z>东营M>海南S。
基于生长和抗逆功能基因SNP分子标记的凡纳滨对虾野生及选育群体遗传多样性分析
51卷收稿日期：2020-02-15基金项目：上海市虾类产业技术体系建设专项（沪农科攻字〔2014〕第7-1-11号）作者简介：*为通讯作者，戴习林（1969-），教授，主要从事水产养殖与海洋生物学研究工作，E-mail ：**************.cn 。
申淑慧（1995-），研究方向为罗氏沼虾遗传育种，E-mail ：189****************基于生长和抗逆功能基因SNP 分子标记的凡纳滨对虾野生及选育群体遗传多样性分析申淑慧1，2，3，戴习林1，2，3*（1水产科学国家级实验教学示范中心（上海海洋大学），上海201306；2农业农村部淡水水产种质资源重点实验室（上海海洋大学），上海201306；3水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心（上海海洋大学），上海201306）摘要：【目的】分析凡纳滨对虾野生群体与选育群体的遗传多样性及遗传差异，为进一步改良优化凡纳滨对虾种质提供参考依据。
【方法】通过凡纳滨对虾转录组测序数据挖掘候选SNP 位点，设计扩增引物，采用10尾野生凡纳滨对虾进行直接测序验证，筛选获得11对有效引物及24个位于生长和抗逆功能基因上的SNPs 位点，并用于分析2个野生群体（Y 1和Y 2）和2个选育群体（F 1和F 2）的遗传多样性。
【结果】凡纳滨对虾野生群体的观测杂合度（Ho ）、期望杂合度（He ）及多态信息含量（PIC ）等遗传参数平均值明显高于选育群体。
在2个野生群体中，Y 2的各项遗传参数平均值均高于Y 1；在2个选育群体中，F 2的各项遗传参数平均值均高于F 1，且在CATL 、ANT 、Tryptase 、Crustin-like 和Penaeidin4c 等功能基因的某些SNP 位点上，2个选育群体的各项遗传参数平均值为0。
4个凡纳滨对虾群体中均存在SNP 位点不同程度偏离Hardy-Weinberg 平衡现象。
野生群体Y 1与选育群体F 1间的近交系数（Fis ）最高（0.0875），且基因流（Nm ）也较高（4.2728）；野生群体Y 2与选育群体F 1间的遗传分化指数（Fst ）最高（0.0947），但Nm 最低（2.3886），表明二者间的遗传背景较远。
凡纳滨对虾2_个选育群体自交和杂交F1_的形质差异分析
凡纳滨对虾2个选育群体自交和杂交F 1的形质差异分析张哲1,杨章武1∗,郑雅友1,李正良1,葛辉1,杨志宏2,许智海3㊀(1.福建省水产研究所/福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室,福建厦门361013;2.福建省漳浦县佛昙鸿达水产育苗场,福建漳州363000;3.福建省漳浦县水产技术推广站,福建漳州363000)摘要㊀为研究凡纳滨对虾选育群体自交和杂交F 1的形态亲缘关系,采用方差分析和多元统计分析方法,通过12个测量性状比较F 1各组和普通苗组的外部形态特征㊂方差分析结果显示,F 1各组之间㊁与普通苗组之间在部分形态特征上表现出明显差异,主要体现在F 1各组的平均鲜出肉率比普通苗组提高了6.12%,普通苗组表现出较高的体长变异系数和较低的存活率等特征㊂通过主成分分析共构建了4个主成分,累计贡献率为92.33%㊂第一主成分主要反映头胸甲长(X 3)㊁头胸甲宽(X 4)㊁第一腹节长(X 5)㊁第二腹节长(X 6)㊁第六腹节长(X 7)的特征,方差贡献率为40.14%;第二主成分主要反映肥满度指数Ⅰ(X 9)㊁肥满度指数Ⅱ(X 10)㊁重长指数Ⅰ(X 11)㊁重长指数Ⅱ(X 12)的特征,方差贡献率为25.34%㊂逐步判别分析显示,所建Fisher 分类函数方程组可清晰区分普通苗组㊁BB (BɬˑB ȶ)㊁AB (AɬˑB ȶ)和BA (BɬˑA ȶ)各组对虾群体,其判别准确率分别为96%㊁75%㊁84%和97%,但AA 组(AɬˑAȶ)的判别准确率较低,仅为13%㊂聚类分析结果显示,普通苗组与选育群体F 1代明显分为2支,F 1代各组中自交组间亲缘关系最近,正交组与自交组间亲缘关系较近,反交组与各组亲缘关系较远㊂关键词㊀凡纳滨对虾;杂交选育;形质差异;多元统计分析中图分类号㊀S 968㊀㊀文献标识码㊀A㊀㊀文章编号㊀0517-6611(2023)13-0081-05doi :10.3969/j.issn.0517-6611.2023.13.019㊀㊀㊀㊀㊀开放科学(资源服务)标识码(OSID):Morphological Variation Analysis of Self-crossing and Hybrid F 1from Two Breeding Populations of Litopenaeus vannameiZHANG Zhe ,YANG Zhang-wu ,ZHENG Ya-you et al㊀(Key Laboratory of Cultivation and High-value Utilization of Marine Organisms in Fujian Province /Fisheries Research Institute of Fujian,Xiamen,Fujian 361013)Abstract ㊀In order to study the morphological relationship between self-crossing and hybrid F 1of Litopenaeus vannamei breeding population,the external morphological characteristics of F 1group and common seedling group were compared by 12measured traits by using variance anal-ysis and multivariate statistical analysis.The variance analysis results showed that there were significant differences in some morphological char-acteristics between F 1groups and ordinary seedling groups,which mainly reflected that the average fresh meat rate of F 1group was 6.12%higher than that of ordinary seedling group.And the ordinary seedling group showed higher variation coefficient of body length and lower surviv-al rate.Through the principal component analysis,four principal components were constructed,the cumulative contribution rate was 92.33%.The first principal component mainly reflected the characteristics of carapace length (X 3),carapace width (X 4),the length of the first pleon segment (X 5),the length of the second pleon segment (X 6),the length of the sixth pleon segment length (X 7),the variance contribution rate was 40.14%.The second principal component mainly reflected the characteristics of fatness index Ⅰ(X 9),fatness index Ⅱ(X 10),weight-length index I (X 11)and weight-length index Ⅱ(X 12),the variance contribution rate was 25.34%.Step discriminant analysis showed that the Fisher classification function equations could clearly distinguish the groups of common seedling group,BB (BɬˑBȶ),AB (AɬˑBȶ)and BA (BɬˑAȶ),with the discriminant accuracy of 96%,75%,84%and 97%,respectively.But the discriminant accuracy of AA (AɬˑAȶ)was lower,only 13%.The results of cluster analysis showed that the common seedling group and the breeding population F 1generation were di-vided into two branches.Among the F 1generation groups,the self-crossing group had the closest relationship,the relationship between the direct cross group and the reciprocal cross group was closer,the reciprocal cross had farther relationship with each group.Key words ㊀Litopenaeus vannamei ;Hybridization;Morphological variation;Multivariate statistical analysis基金项目㊀福建省种业工程项目(2017FJSCZY02);2021年福建省海洋与渔业结构调整专项(2021HYJG16)㊂作者简介㊀张哲(1985 ),男,安徽宣城人,助理研究员,硕士,从事对虾选育与增养殖研究㊂∗通信作者,研究员,从事海水养殖与水产育种研究㊂收稿日期㊀2022-06-12㊀㊀凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei )又名南美白对虾,俗称白虾,原产于南美洲太平洋沿岸的暖水水域,具有养殖产量高,适温㊁盐范围广,生长速度快等特点,是世界三大养殖对虾中单产量最高的虾种,也是我国对虾养殖最主要的种类㊂2020年我国凡纳滨对虾海水养殖119.8万t㊁淡水养殖66.5万t,凡纳滨对虾养殖产量占当年对虾养殖产量的86.5%㊂福建省也是对虾养殖的重要省份之一,2020年对虾养殖产量22.6万t,其中凡纳滨对虾20.3万t,占对虾养殖产量的89.8%㊂凡纳滨对虾虾苗数量4269亿尾,占全国对虾养殖数量的27.3%[1]㊂苗种是水产增养殖产业的源头,对虾种苗问题是对虾养殖业发展的核心问题㊂近年来,国内各大研究机构开展了凡纳滨对虾人工育种研究,已成功培育出9个凡纳滨对虾新品种[2-5]㊂其中,有关凡纳滨对虾的遗传多样性研究,国内外主要集中在SSR [6-8]㊁SNP 分子标记[9-10]等方面对选育群体或家系的遗传结构进行分析,但对传统的形态特征研究较少㊂目前利用多元统计分析方法对种群形态特征的分析已在鱼类[11]㊁蟹类[12]㊁贝类[13]和虾类[14]中广泛应用㊂然而,利用多元统计分析方法分析凡纳滨对虾不同选育群体形质差异的研究还较少㊂目前国家大力提倡种业创新,鼓励水产良种自主可控,因此不同选育世代遗传特性研究在对虾选育过程中至关重要,是实现良种创新的有效途径㊂笔者培育凡纳滨对虾选育后代,通过形态学测定,采用主成分分析㊁判别分析和聚类分析3种多元统计分析方法分析了2个凡纳滨对虾选育群体自交和杂交F 1的形态质量特征差异,旨在为后续良种本地化选育和亲缘关系研究提供理论依据和方法参考㊂1㊀材料与方法1.1㊀试验材料㊀A 组泰国选育系和B 组海南选育系2个凡纳滨对虾群体均通过商业渠道获得㊂特征性状均为速长型,安徽农业科学,J.Anhui Agric.Sci.2023,51(13):81-85㊀㊀㊀A 组抗逆性较强㊂每个群体经过2代以上选择并自繁纯化,于2年后进行亲本群体内自交和群体间杂交,亲本产卵孵化后进行苗种培育,获得4个不同交配组合的F 1㊂为消除不同环境对凡纳滨对虾生长的影响,对虾幼体在培育至体长2~3cm 后,转入同一水泥池,分不同网箱养成,对凡纳滨对虾形态性状进行对比测试㊂将大小相当的普通苗作为对照,普通苗为未经选育的本地苗,俗称 土苗 ,进行为期200d 的养殖,对12个形态和质量指标进行对比分析㊂试验用凡纳滨对虾的来源和样本信息见表1㊂表1㊀凡纳滨对虾不同群体样本信息统计Table 1㊀The information statistics of L.vannamei samples from different groups群体Groups体长Body length变化范围Variation rangeʊmmx ʃSDʊmm 变异系数Coefficient of variation(CV)ʊ%存活率Survival rateʊ%AA 组AA group(AɬˑA ȶ)73.40~119.20102.17ʃ6.12 5.9995.3BB 组BB group(BɬˑB ȶ)93.30~125.30102.84ʃ5.93 5.7775.4AB 组AB group(AɬˑB ȶ)91.30~115.80100.54ʃ5.59 5.5686.6BA 组BA group(BɬˑA ȶ)90.90~124.80104.92ʃ7.27 6.9370.7普通苗组Common seedlings group 92.80~126.50106.32ʃ10.509.8846.2㊀注:每组样本量均为100尾㊂㊀Note:The sample size in each group was 100.1.2㊀形质指标的测量㊀使用游标卡尺(精度为0.05mm)和电子秤(精度为0.01g)随机抽样,不同组合F 1和普通苗组均随机抽取100尾样本,测定各组形态性状和质量性状,包括体长(BL)㊁头胸甲高(CH)㊁头胸甲长(CL)㊁头胸甲宽(CW)㊁第一腹节长(FSL)㊁第二腹节长(SSL)㊁第六腹节长(SISL)以及体重(BW)㊁头重(HW)和腹重(AW),共10个形质指标㊂凡纳滨对虾形态测量示意图见图1㊂图1㊀凡纳滨对虾形态测量示意Fig.1㊀The morphological measurement of L.vannamei1.3㊀数据处理1.3.1㊀数据标准化㊂为消除凡纳滨对虾个体大小对形态学参数的影响,需要将每尾对虾的所有参数做如下处理,所测7个形态指标(BL㊁CH㊁CL㊁CW㊁FSL㊁SSL㊁SISL)通过以下公式进行转化[15-17],分别得出7个形态特征指标(以X 1~X 7表示)㊂M s =M o (L s /L o )b(1)b =log 10M o /log 10L o(2)式中,M s 为各性状标准化数据;M o 为各性状测量数据;L s 为头胸甲长测量值平均值;L o 为头胸甲长实际测量值㊂对3个质量性状参数通过公式计算进行转化,得出5个质量评价指标(以X 8~X 12表示),分别为X 8(鲜出肉率=腹重/体重ˑ100%)㊁X 9[肥满度指数Ⅰ=体重/(体长)3ˑ100%]㊁X 10[肥满度指数Ⅱ=肉重/(体长)3ˑ100%]㊁X 11(重长指数Ⅰ=体重/体长)㊁X 12(重长指数Ⅱ=肉重/体长)㊂1.3.2㊀数据统计分析㊂采用Excel 2013和SPSS 25.0软件统计凡纳滨对虾群体各形质评价指标的平均值和标准差,对12组标准化数据进行多元统计分析㊂其中,通过主成分分析计算出各主成分的得分㊁方差贡献率和累计方差贡献率,并根据贡献较大的主成分得分,绘制主成分散布图[18-19]㊂判别分析采用逐步判别分析方法,每步选择Willks 的λ统计量最小的变量进入判别函数[20-21]㊂聚类分析根据5个群体间的欧式距离进行聚类[22]㊂2㊀结果与分析2.1㊀方差分析㊀方差分析结果(表2~3)显示,普通苗组与AA 组除X 2㊁X 4㊁X 9外的其余9个性状均有显著差异(P <0.05);普通苗组与BB 组除X 9外的其余11个性状均有显著差异(P <0.05);普通苗组与AB 组除X 9外的其余11个性状均有显著差异(P <0.05);普通苗组与BA 组除X 7㊁X 9㊁X 11㊁X 12外的其余8个性状均有显著差异(P <0.05);AA 与BB 组除X 1㊁X 5㊁X 11㊁X 12外的其余8个性状均有显著差异(P <0.05);BB㊁AB㊁BA 组间除X 2㊁X 4㊁X 6㊁X 8~X 10的6个性状均有显著差异(P <0.05)㊂2.2㊀主成分分析㊀通过Bartlett 球形检验和KMO 适合度检验发现,形质评价指标相关系数矩阵与单位矩阵有显著差异(P <0.05)且适合度尚可(KMO =0.785>0.700),表明该研究所涉及形质评价指标适合进行主成分分析㊂对所有样本的12个形质评价指标进行主成分分析,共获得4个主成分,其方差贡献率分别为40.14%㊁25.34%㊁15.98%和10.87%,累计贡献率为92.33%㊂对于第一主成分,X 3㊁X 4㊁X 5㊁X 6㊁X 7的影响较大,其负荷值分别为0.678㊁0.607㊁0.968㊁0.925和0.907;对于第二主成分,X 9㊁X 10㊁X 11㊁X 12的影响较大,其负荷值分别为0.783㊁0.831㊁0.747和0.797;对于第三主成分,X 2㊁28㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀安徽农业科学㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀2023年X4㊁X8的影响较大,其负荷值分别为0.691㊁0.654㊁0.632;对于第四个主成分,X8㊁X9㊁X3的影响较大,其负荷值分别为-0.597㊁0.537和0.415(表4)㊂不同对虾群体第一㊁第二主成分散布图见图2㊂从图2可以看出,除了普通苗组和AA组可区分外,BB㊁AB和BA组主成分落点相互重叠,不能清晰区分开来㊂表2㊀凡纳滨对虾不同群体7个形态指标的比较Table2㊀Comparison of7morphological indicies among different groups of L.vannamei单位:mm群体Groups形态指标Morphological indiciesX1X2X3X4X5X6X7 AA组AA group102.17ʃ6.12c15.59ʃ0.87b25.62ʃ1.48d14.78ʃ0.85b8.95ʃ0.53c9.36ʃ0.62c15.19ʃ0.82b BB组BB group102.84ʃ5.93c15.91ʃ0.87a25.89ʃ1.61c15.08ʃ0.87a9.00ʃ0.52c9.51ʃ0.55b15.06ʃ0.87c AB组AB group100.54ʃ5.60d14.94ʃ0.92c25.52ʃ1.55e14.10ʃ0.92c8.80ʃ0.49d9.30ʃ0.52c14.71ʃ0.82d BA组BA group104.92ʃ7.27b16.07ʃ1.20a26.42ʃ2.14b15.23ʃ1.21a9.21ʃ0.64b9.51ʃ0.66b15.87ʃ1.10a 普通苗组Common seedlings group106.32ʃ10.50a15.67ʃ1.06b29.15ʃ1.98a14.86ʃ1.06b9.48ʃ0.57a10.01ʃ0.60a15.83ʃ0.95a ㊀注:同列不同小写字母表示差异显著(P<0.05)㊂㊀Note:Different lowercase letters in the same column indicated significant differences(P<0.05).表3㊀凡纳滨对虾不同群体5个质量指标的比较Table3㊀Comparison of5quality indicies among different groups of L.vannamei群体Groups质量指标Quality indiciesX8ʊ%X9ʊ%X10ʊ%X11ʊg/mm X12ʊg/mm AA组AA group61.15ʃ1.29b 1.16ʃ0.17a0.71ʃ0.10a 1.21ʃ0.16bc0.74ʃ0.10b BB组BB group61.88ʃ1.29a 1.12ʃ0.05b0.69ʃ0.03b 1.19ʃ0.16c0.74ʃ0.10b AB组AB group61.31ʃ1.32b 1.12ʃ0.06bc0.69ʃ0.04bc 1.13ʃ0.14d0.70ʃ0.09c BA组BA group61.51ʃ1.40ab 1.14ʃ0.05ab0.70ʃ0.04ab 1.27ʃ0.21ab0.78ʃ0.13a 普通苗组Common seedlings group57.92ʃ2.05c 1.14ʃ0.06abc0.66ʃ0.04d 1.34ʃ0.19a0.77ʃ0.11a ㊀注:同列不同小写字母表示差异显著(P<0.05)㊂㊀Note:Different lowercase letters in the same column indicated significant differences(P<0.05).表4㊀凡纳滨对虾12个性状对4个主成分的负荷值及贡献率Table4㊀The load values and the contribution rates of12traits of L.vannamei to four principal components性状Traits主成分Principal components1234X10.599-0.5770.2890.311 X20.5900.2440.6910.221 X30.678-0.096-0.4860.415 X40.6070.2990.6540.189 X50.9680.009-0.111-0.190 X60.925-0.028-0.195-0.186 X70.907-0.1300.137-0.045 X8-0.2530.1890.632-0.597 X9-0.2330.783-0.0740.537 X10-0.3280.8310.1890.268 X110.4990.747-0.370-0.204 X120.4390.797-0.217-0.349特征值Eigenvalue 4.817 3.040 1.918 1.305累计贡献率Cumulative con-tribution rateʊ%40.1465.4881.4692.332.3㊀判别分析㊀通过判别分析共获得4个典型判别函数,前3个典型判别函数的累积方差为99.3%(表5)㊂测量性状与判别函数的相关系数见表6,从12个特征性状中筛选出有显著贡献的7个变量,即X2㊁X4㊁X5㊁X7㊁X8㊁X11㊁X12㊂第一和第二判别函数散布图见图3㊂从图3可以看出,普通苗组与各F1组区分明显㊂在不同交配组合的F1各组中,BA组除了与AA组存在部分重叠外,与BB组㊁AB组区分明显,AA 组㊁BB组与AB组存在较多重叠㊂经过判别分析(表7)发现,普通苗组㊁BB㊁AB㊁BA各组的正确判别率较高,分别为96%㊁75%㊁84%和97%㊂AA组的错判率较高,其判别准确率仅13%㊂判别结果进一步表明,普通苗组与F1代各组在形质特征性状上存在显著差异,各选育群体自交和杂交F1代各组间也存在差异,其中杂交组差异较为明显㊂图2㊀凡纳滨对虾不同群体样本的第一、第二主成分散布图Fig.2㊀Scatter map of the first and second principal components of L.vannamei samples from different groups2.4㊀聚类分析㊀对所有样本的12个测量性状进行聚类分析,得出5个凡纳滨对虾群体的聚类图(图4)㊂从图4可以看出,普通苗组与F1代各组明显聚为2支,F1代各组中自交组AA和BB亲缘关系最近,杂交组中正交组(AB)与自交组亲缘关系较近,反交组(BA)与各组亲缘关系较远㊂这进一步验证了判别分析的结果,说明凡纳滨对虾通过杂交和自交选育的后代与普通苗产生了较大的形质特征差异,形成了具有单独特征的新种群㊂3851卷13期㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀张哲等㊀凡纳滨对虾2个选育群体自交和杂交F1的形质差异分析表5㊀不同群体凡纳滨对虾判别函数分析结果Table 5㊀The discriminant function analysis results of different groups of L.vannamei函数Function 特征值Eigenvalue 方差Varianceʊ%累积方差Cumulative varianceʊ%卡方Chi square自由度DFP 1 3.83753.453.41604.102400.0002 3.00941.995.3829.337270.00030.284 4.099.3146.879160.00040.0500.7100.024.06570.001表6㊀凡纳滨对虾形质性状与判别函数的相关系数Table 6㊀Correlation coefficients between morphological and qualitytraits and discriminant functions for L.vannamei性状Traits 函数Functions 1234X 10.0760.2900.2500.317∗X 2-0.1400.1880.939∗0.020X 4-0.1370.1960.948∗-0.065X 50.1150.479∗0.4070.442X 60.2540.3920.4200.461∗X 7-0.0910.581∗0.3810.419X 8-0.337-0.393∗0.2820.312X 9-0.0410.052-0.043-0.526∗X 10-0.147-0.0710.044-0.427∗X 110.0350.229∗0.149-0.018X 12-0.0310.1510.191∗0.036㊀注:∗表示性状与判别函数之间的相关系数绝对值最大㊂性状X 3未通过变量缺陷容差检验㊂㊀Note:∗indicated the maximum absolute correlation between the variablesand the discriminant function.X 3trait didn t pass the variable defect tolerancetest.图3㊀凡纳滨对虾不同群体样本的第一、第二判别函数散布图Fig.3㊀The Scatter map of the first and second discriminantfunctions for L.vannamei samples from different groups表7㊀不同凡纳滨对虾群体判别结果Table 7㊀The discriminant results of L.vannamei from different groups群体Groups判别结果Discriminant results普通苗组Common seedlings groupAA 组AA groupBB 组BB groupAB 组AB groupBA 组BA group判别率Discriminant rateʊ%普通苗组Common seedlings groupAA 组AA groupBB 组BB groupAB 组AB groupBA 组BA group普通苗Common seedlings group 960000960000AA 组AA group0132301323BB 组BB group3317516033175160AB 组AB group 1192384011923840BA 组BA group 03700970370097总计Total100100100100100100100100100100图4㊀5个凡纳滨对虾群体欧氏距离聚类分析Fig.4㊀The cluster analysis of five groups of L.vannamei basedon Euclidean distance3㊀讨论在研究对虾不同群体特征性状时,样本量是非常重要的前提条件㊂若样本量太少,则不能充分反映群体的变异特征,从而会错误判断不同群体间的差异㊂据文献显示,在进行主成分分析和判别分析时,样本量与所测量性状数的比值必须大于3[23]㊂该研究中不同对虾群体的样本量均为100尾,该比值均超过8,说明该研究结果具备统计学意义㊂3.1㊀不同群体凡纳滨对虾形质特征方差分析㊀方差分析表明,经过项目组选育的凡纳滨对虾自交和杂交F 1各群体与普通苗在12个指标性状上存在不同程度的显著差异,F 1各组的平均鲜出肉率比普通苗组提高了6.12%,普通苗组表现出头胸甲较细长的特征㊂F 1各组体长的变异系数均明显低于普通苗组,表现出选育后代更为整齐的特征㊂F 1各组存活率明显高于普通苗组,多代选育后具有对水泥池养殖环境更48㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀安徽农业科学㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀2023年好的适应性㊂3.2㊀不同群体凡纳滨对虾杂种优势分析㊀凡纳滨对虾属于外来虾种,我国海域没有天然资源㊂近年来,国内科研机构和企业已培育出多个凡纳滨对虾新品种,且培育方法多以杂交育种为主㊂2016年通过审定的 广泰1号 凡纳滨对虾新品种采用品系繁育结合正反交测试选育方法,在产业上得到较好应用㊂该研究结果进一步表明,杂交组合的子一代在各生长性状上表现出一定的杂种优势㊂杂交组合中正交和反交子一代的性状存在一定差异㊂反交BA组在各性状中除了X8㊁X9和X10与正交AB组没有显著差异外,其他各性状均显著高于正交AB组,这种正反交杂种优势存在差异的现象也普遍存在于其他水产动物中㊂陈炳霖等[24]对不同种群罗非鱼正反交子代奥尼罗非鱼的生长性状进行了对比分析,发现正交奥尼罗非鱼群体全长㊁体高和尾柄高对体质量的影响较大,而反交群体全长和体高对体质量的影响较大㊂李永等[25]对2个地理种群斑节对虾杂交子代的生长性能进行研究,结果表明正交组合的杂种优势均高于反交组合㊂张跃环等[26]对不同地理群体牡蛎开展种间杂交研究,结果表明正交组生长和存活性状表现出积极的单亲杂种优势,而反交组则表现出明显的远交衰退现象,变态率极低㊂该研究中正反交F1代在生长性状上均表现出一定的母系遗传效应[27]㊂3.3㊀不同群体凡纳滨对虾形质特征差异的原因分析㊀在判别分析中,AA组判别准确率较低,仅13%㊂该研究结果表明,AA组中有31%被判别为BB组㊁19%被判别为AB组㊁37%被判别为BA组,说明BB㊁AB㊁BA组均与AA组在形态上存在不同程度的相似性,难以正确区分AA组㊂根据A组和B组选育群体的来源,分析原因可能是因为来自海南的选育群体B组最初也来源于泰国的选育系,二者之间可能存在一定的基因交流或混杂现象㊂泰国与我国海南的地理位置相近,贸易往来频繁㊂海南地区常引进泰国的选育系作为对虾种虾,产出子一代销往全国,也就是俗称的 一代苗 ,因此这种基因交流的可能性较大[28-29]㊂判别结果中BA组和普通苗组的判别准确率较高,说明其与其他各组在形质特征上已存在明显差异㊂其中,普通苗组为未经选育但多代生长于本地的群体,已逐渐形成适应本地环境的新种群㊂从不同群体欧氏距离聚类图也可以看出,普通苗组与选育群体子代组的亲缘关系已较远㊂BA组通过选育群体杂交而获得,其在形质特征上与亲本存在一定差异,表现出一定的杂种优势,且亲缘关系较正交子代更远㊂凡纳滨对虾的生长周期一般为1~2年,商品虾通常养殖90~150d即可出塘㊂该研究过程中可能由于养殖网箱的限制,试验对虾生长普遍偏慢,生长数据低于正常养殖水平,因此项目组将最终测定时间延长至200d,但由于生长较慢,选育群体的生长优势未能充分体现出来,与普通苗的大小差异没有达到预期效果㊂今后将改进设施条件,开展进一步研究㊂参考文献[1]农业农村部渔业渔政管理局,全国水产技术推广总站,中国水产学会. 2021年中国渔业统计年鉴[M].北京:中国农业出版社,2021:26-34.[2]代平,孔杰,栾生.我国凡纳滨对虾种质资源引进与分析[J].科学养鱼,2018(1):3-5.[3]赵永贞.凡纳滨对虾 桂海1号 [J].海洋与渔业,2013(3):54.[4]孔杰,何建国,江谢武,等.凡纳滨对虾 海兴农2号 [J].中国水产, 2017(11):67-71.[5]叶宁.凡纳滨对虾新品种 兴海1号 的选育技术[J].海洋与渔业, 2018(7):70-71.[6]黄小帅,徐煜,胡晓娟,等.利用微卫星标记分析7个凡纳滨对虾引进群体子一代的遗传多样性[J].南方水产科学,2019,15(1):54-62. 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凡纳滨对虾遗传多样性研究中AFLP体系的建立
究 拟通 过优 化反应 体 系 的多个 因 子 ， 立 适 合 凡 纳 建
滨对 虾 的 Ａ Ｌ Ｆ Ｐ反 应 体 系 ， 之 后 凡 纳 滨 对 虾 的遗 为 传多样 性研 究奠 定基 础．
的主要养 殖 品种． 但是 近年 来 ， 由于凡 纳滨对 虾遗 传
育种 工作 滞后 ， 导致 亲本选 择不 严 ， 亲交 配现象 严 近
１ ３ １ 基 因组 Ｄ Ａ提 取 ． ．Ｍｇ “浓 度 （ ． ０、 ． ５ １ ５ 、 ． ５、 ． ０、 ． ５ １ Ｏ １ ２ 、 ． ０ １ ７ ２ Ｏ ２ ２
虾 背部肌 肉组 织剪碎 ， 入 １５ ｅ 离心 管 内 ， 入 放 ． ｍ 加 １ｅ Ｓ Ｅ ｍ Ｎ Ｔ缓 冲 液 ［ ０ ｍ ｌｄ Ｔｉ Ｈ １ ｐ ＝ ２ ｍｏ ｍ ｒ — Ｃ ， Ｈ ／ ｓ
（ １， 表 ）其余 试剂 皆 为分析纯 ．
基金项 目： 国家现代农 业产业技术体系建设专项资金 资助项 目（ Ｙ ＹＴ ４６ ＮＣ Ｘ ）
作者 简 介 ： 伟 毅 （９ ３一）， ， 究 实 习员 ； — ｉ： ｗ ｓｕ ｙｈｏ ｃ 王 １８ 男 研 Ｅｍａ ｗ ｙｊ ＠ ａ ｏ．ｎ ｌ ｔ
公 司 ） ＩＭｓＩＴ Ｎ ｇｓ （ Ｅ 、 、 ｅ 、４ Ｄ Ａ ｌ ａｅ Ｎ Ｂ公 司 ） Ｘ Ｎ ｉ 、Ｄ Ａ ／ ｉｄＩ（ ｉｎｅ Ｈ ｎ Ｉ Ｔａ ｇｎ公 司 ） １０ ｂ Ｎ ａ ｄ ｒ Ｆｒ Ｉ 、 ０ ｐ Ｄ Ａ ｌ ｅ （ ｅ— ｄ ｍｅｔｓ 司 ） Ｒ ａｅ（ ｅｍｅｔｓ公 司 ） 蛋 白酶 Ｋ ｎａ 公 、 Ｎ ｓ Ｆ ｒ ｎａ 、
王 伟 毅 徐 景 祥 ， 灵伟 ， 阮
（ ．国家海洋局第三海洋研究所 、 １ 国家海洋局海洋生物遗传 资源重点实验 室 ， 福建 厦 门 ３ １０ ； ６０ ５
凡纳滨对虾引进亲虾及其子一代的遗传多样性研究
凡纳滨对虾引进亲虾及其子一代的遗传多样性研究李锋;林继辉;刘楚吾【期刊名称】《海洋科学》【年(卷),期】2006(30)4【摘要】采用Operon公司的16个引物对两个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)引进亲本群体及其子一代对虾的基因组DNA多态性进行了检测.第一个亲虾群体对16个引物共获得78个位点,其中多态位点数为48个,占61.54%;其子代对虾共获得89个位点,其中多态位点数为50个,占56.18%.第二个亲虾群体对16个引物共获得97个位点,其中多态位点数为49个,占50.52%,其子代对虾共获得93个位点,多态位点数为28个,占30.11%.单个引物获得的标记数为1～8个.第一个亲本群体及其子代个体间的平均遗传距离分别是0.195 9±0.039 2和0.143 5±0.026 8;第二个亲本群体及其子代个体间的平均遗传距离分别为0.0922±0.018 9和0.062 1±0.014 8.两个亲本群体间的遗传距离为0.654 6±0.079 4,两个子代群体间的遗传距离为0.708 7±0.065 6.在OPF-09、OPZ-11两个引物的扩增结果中,发现两个亲本群体及其子代有差异标记.【总页数】5页(P64-68)【作者】李锋;林继辉;刘楚吾【作者单位】湛江海洋大学,水产学院,广东,湛江,524025;湛江海洋大学,水产学院,广东,湛江,524025;湛江海洋大学,水产学院,广东,湛江,524025【正文语种】中文【中图分类】S917【相关文献】1.漠斑牙鲆引进群体子一代遗传多样性的RAPD分析 [J], 李鹏飞;刘萍;柳学周2.凡纳滨对虾亲本和子一代群体的线粒体DNA遗传特征研究 [J], 陈薇;马凌波;马春燕3.凡纳滨对虾引进群体与养殖群体遗传多样性的AFLP分析 [J], 叶宁;包秀凤;刘建勇4.利用微卫星标记分析7个凡纳滨对虾引进群体子一代的遗传多样性 [J], 黄小帅;徐煜;胡晓娟;徐武杰;苏浩昌;文国樑;杨铿;曹煜成5.利用微卫星标记分析7个凡纳滨对虾引进群体子一代的遗传多样性 [J], 黄小帅;徐煜;胡晓娟;徐武杰;苏浩昌;文国樑;杨铿;曹煜成;因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
凡纳滨对虾(Litopenaeus vannmei)生长和耐低溶氧性状的遗传参数估计和遗传获得评估
凡纳滨对虾(Litopenaeus vannmei)生长和耐低溶氧性状的遗传参数估计和遗传获得评估张嘉晨;曹伏君;刘建勇;袁瑞鹏【期刊名称】《海洋与湖沼》【年(卷),期】2016(047)004【摘要】选择来自75个家系的6000尾凡纳滨对虾个体进行为期96h的耐低溶氧试验,测定其生长性状和耐低溶氧性状.利用线性动物模型估计了凡纳滨对虾收获时期生长和耐低溶氧性状的方差组分和遗传参数.结果显示,凡纳滨对虾收获体长和收获体质量的遗传力分别为0.35±0.11和0.48±0.15,表现为中高遗传力水平,且统计检验显著(P＜0.05).收获体长和收获体质量间的表型相关和遗传相关分别为0.89和0.95,表现为高度线性正相关(P＜0.05).凡纳滨对虾耐低溶氧性状的遗传力为0.07±0.03,表现为低遗传力水平.生长性状(收获体长和收获体质量)和耐低溶氧性状间的表型相关和遗传相关分别为0.14-0.18和0.11-0.13,表现为低度线性正相关,但统计检验不显著(P＞0.05).耐低溶氧性状的选择反应和遗传获得的估计值较低,分别为0.02±0.02和4.87％.体长的选择反应和遗传获得分别为0.65±0.18和7.22％;体质量的选择反应和遗传获得分别为1.13±0.31和11.07％,表明第一代对生长性状的选育达到了良好的效果.【总页数】7页(P869-875)【作者】张嘉晨;曹伏君;刘建勇;袁瑞鹏【作者单位】广东海洋大学水产学院湛江 524025;广东海洋大学水产学院湛江524025;广东海洋大学水产学院湛江 524025;广东海洋大学水产学院湛江524025【正文语种】中文【中图分类】S968.22【相关文献】1.凡纳滨对虾过氧化氢酶基因单核苷酸多态性及其与耐低溶氧性状的相关性 [J], 陈晓敏;刘建勇;张嘉晨;袁瑞鹏;钱佳慧2.日本囊对虾耐高氨氮与生长性状的遗传参数估计 [J], 蒋湘;郑静静;谢妙;刘永奎;曾凤仙;刘建勇3.零换水工厂化养殖模式下凡纳滨对虾生长和存活性状遗传参数估计 [J], 刘均辉;栾生;罗坤;曹宝祥;陈宝龙;孟宪红;刘宁;孔杰4.凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）体重、存活性状的遗传参数和基因型与环境互作效应* [J], 栾生; 罗坤; 阮晓红; 曹宝祥; 王浩; 杜学芳; 张凯; 孔杰5.凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）体重、存活性状的遗传参数和基因型与环境互作效应 [J], 栾生; 罗坤; 阮晓红; 曹宝祥; 王浩; 杜学芳; 张凯; 孔杰因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
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凡纳滨对虾选育系间杂交的生长性状及遗传多样性分析吴怡迪;骆轩;杨章武;黄永春;游伟伟【摘要】对2个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)选育系(A和B)的自繁与杂交后代的生长性状及遗传多样性进行了分析.养殖对比实验结果表明,杂交组合AB 生长性状优于其他各组,表现出较好的杂种优势.使用11对荧光标记的微卫星引物对4个凡纳滨对虾自繁与杂交群体以及1个从美国引进的初代亲本SIS群体的基因组DNA进行扩增,结果显示除AA群体外,其余4个群体均表现出较丰富的遗传多样性,观测到的平均等位基因数(Na)为4.273～5.636,平均期望杂合度(He)为0.586～0.629,平均多态信息含量(PIC)为0.512～0.556.遗传距离分析结果显示,SIS群体和AA群体的遗传距离最远(0.670 4),而与AB群体的最近(0.131 4).研究结果表明,引自美国的凡纳滨对虾群体经多代自繁后,其遗传多样性水平降低;而选育系间杂交则可使杂交后代的生长性状和遗传多样性水平得到改善.【期刊名称】《厦门大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2016(055)005【总页数】8页(P646-653)【关键词】凡纳滨对虾;生长性状;遗传多样性;微卫星;杂交【作者】吴怡迪;骆轩;杨章武;黄永春;游伟伟【作者单位】厦门大学海洋与地球学院,福建厦门361102;厦门大学海洋与地球学院,福建厦门361102;福建省水产研究所,福建厦门361013;集美大学水产学院,福建厦门361021;厦门大学海洋与地球学院,福建厦门361102【正文语种】中文【中图分类】S917.4凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)又名南美白对虾,原产自南太平洋和美洲沿海水域,自1988年引入我国以来,已成为我国水产养殖的主要品种[1]．作为水产经济虾类的重要养殖品种,我国每年的凡纳滨对虾种苗需求量高达4 000亿尾以上[2]．然而近年来由于各种虾类疾病相继入侵及养殖过程中频繁近交导致的种质退化等原因,我国凡纳滨对虾在养殖过程中出现了个体小型化、生长速度慢、抗病性差等问题．因此，从分子水平上了解现有凡纳滨对虾群体的遗传变异情况,并在此基础上培育适合福建海域养殖的凡纳滨对虾新品种显得十分迫切．微卫星标记技术作为第二代分子标记的代表,已被广泛应用于水产生物的遗传分析研究中[3]．Maggioni等[4]用10个微卫星标记对巴西9个凡纳滨对虾养殖场的亲虾群体进行评估,结果显示9个亲虾群体的遗传多样性程度与来自中美洲的野生群体一致,处于较高水平．Artiles等[5]用4个微卫星标记对古巴1个凡纳滨对虾引进群体的不同世代进行遗传多样性分析,结果表明各后代群体的遗传多样性水平近似,但后代群体与基础群体间存在明显的遗传差异．此外，还有研究用微卫星标记对凡纳滨对虾的遗传多样性进行了分析,发现随繁育世代增加,养殖群体后代的遗传多样性呈下降趋势,并建议在后续繁育工作中通过增加杂交来改善或避免近交衰退的现象[6]．2008年起,厦门市厦兴龙水产种苗有限公司与福建省水产研究所等单位合作开展凡纳滨对虾良种选育工作．本研究针对该育种项目中的4个群体和1个美国引进群体,采用微卫星标记对其遗传结构和遗传多样性进行分析,从而监测该育种项目中各对虾群体的遗传变异情况．1.1 实验材料实验所用的2个选育群体(A和B)以及它们的2个杂交群体取自厦门市厦兴龙水产种苗有限公司,初代亲虾群体则引自美国SIS公司(Shrimp Improvement System,USA),命名为SIS．选育系A来源于2008年由美国SIS公司引进亲虾的子一代,选育系B来源于2010年引自广东的另一个凡纳滨对虾繁育群体,随后针对生长与抗病性状对2个群体进行了连续多代的群体选育．2014年,用选育系A的F6代群体以及选育系B的F4代群体作为亲本,采用双列杂交获得了它们的自繁以及正、反杂交后代,并分别命名为AA(A♀×A♂)、BB(B♀×B♂)、AB(A♀×B♂,正交)和BA(B♀×A♂,反交)．5个凡纳滨对虾群体分别于2014年7—9月随机取样30尾,活体运回实验室后,用无菌手术剪和镊子取对虾的尾节肌肉,保存于95%(体积分数)乙醇中备用．1.2 实验方法1.2.1 4个群体生长指标的跟踪测量4个群体的养殖对比实验于2014年7—11月在厦兴龙水产种苗有限公司的晋江基地进行．2014年7月31日,将每个交配组合的仔虾分别养殖在室外水泥池,每池6 m2,投苗密度100尾/m2,每组设置2个对照池．养殖期间随对虾生长阶段进行定期投饵,并保持不间断充气．在养殖40,60,80和100 d时对各群体对虾进行取样测量,每池取30尾,用游标卡尺(精确度0.01 mm)和电子天平(精确度0.01 g)对其体长、头胸甲长和体质量3个指标进行测量并记录．1.2.2 微卫星分析基因组DNA的提取：实验所用凡纳滨对虾的基因组DNA采用北京天根生化科技有限公司的海洋动物组织基因组DNA提取试剂盒进行提取,并用1.2%(质量分数)琼脂糖凝胶电泳和NanoDrop2000分光光度计分别检测所提取基因组DNA的质量和浓度,之后于-20 ℃保存备用．微卫星引物的筛选及PCR扩增：实验所用微卫星引物参考文献[7],选取并合成了44对引物进行PCR扩增,从中挑选出11对特异性强、多态性较高且重复性好的微卫星引物(表1),并在每对引物的5′端设计添加不同类型的特异性荧光标记(FAM、HEX或ROX)用于后期混样检测目的条带,再交由上海生工生物工程股份有限公司合成．PCR反应体系(25 μL)：10×PCR Buffer (含Mg2+) 2.5 μL，dNTPs(2.5 mmol/L) 2 μL，正、反向引物(10 mmol/L)各1 μL，Taq DNA聚合酶(5 U/μL) 0.25 μL，模板DNA(80～100 ng/μL) 1 μL,加ddH2O补足至25 μL．PCR反应程序:94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s,相应退火温度退火30 s,72 ℃延伸30 s,35个循环;72 ℃延伸7 min．PCR产物经电泳检测和筛选后,委托上海生工生物工程股份有限公司进行短串联重复序列(STR)分型分析．1.2.3 数据统计与分析4个群体的生长数据用PASWStatistics18软件进行比较分析,群体间各指标的比较采用单因素方差分析进行,差异显著性水平为p<0.05．根据Falconer[8]的方法,对2个杂交组合AB和BA的中亲杂种优势率HMP及单亲杂种优势率HA、HB进行计算.微卫星数据用PopGene 3.2软件进行统计分析,计算5个群体各微卫星位点的等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He),用以评估各群体的遗传多样性;Hardy-Weinberg(H-W)平衡检验和固定指数(Fis)的计算则分别用以检测Ho和He之间的差异和评估杂合子缺失情况;计算两两群体间的Nei′s无偏遗传距离(Ds)用以评估群体间的遗传差异．根据Botstein等[9]的方法,采用PIC-CALC 0.6软件,依据等位基因频率计算各个位点的多态信息含量(PIC)．群体间遗传分化指数(FST)、群体内和群体间的分子变异分析(AMOVA)均采用Arlequin 3.5软件进行．2.1 自繁及杂交群体的生长及杂种优势分析各取样时期内4个选育群体的体长、头胸甲长和体质量数据如图1(a)、(b) 和(c)所示．由图中可见,4个群体的各指标都随生长天数的增加而增加．对群体间各指标进行单因素方差分析,结果显示：在养殖40 d时,AB和AA群体的各项指标均高于另外2个群体(BA和BB)，且AB群体与这2个群体差异显著;而至80 d后AB和BB群体的各指标显著高于BA和AA群体．图1(d)中体质量日增长量的统计分析结果表明：AA、BB和BA 3个群体的体质量日增长量随生长天数的增加而下降;自繁子代群体AA和BB的体质量日增长量在Ⅰ至Ⅱ阶段明显下降,其中BB群体的体质量日增长量下降了53.7%;杂交子代群体AB和BA的下降幅度较小,其中AB群体的体质量日增长量在Ⅰ至Ⅱ阶段基本保持不变．杂交群体杂种优势率的分析结果表明,40～80 d各生长指标的HMP都随生长天数的增加而呈先降低后上升的趋势(表2)．2个杂交群体在60 d时都表现出负向的中亲杂种优势,且整个过程中BA群体的HMP几乎全部为负值,即表现出杂种劣势．另外,2个杂交群体子代的HMP都介于HA和HB之间,且HA和HB之间存在明显差异．2.2 凡纳滨对虾群体的遗传多样性11对微卫星引物在5个凡纳滨对虾群体中均能扩增出目的条带．表3为5个群体在各微卫星位点上的遗传多样性信息,结果显示：11个微卫星位点上共检测到81个等位基因,在5个群体中，位点TUMXLv7.121、TUMXLv7.56、Pvan1815和TUMXLv10.312的PIC均高于0.5，位点TUMXLv10.207和TUMXLv9.178的PIC分别在AA和SIS群体中小于0.5，其余位点的PIC均介于0.25～0.5之间.5个群体的平均Fis均为正值,且在位点TUMXLv9.178的Fis也均为正值；5个群体在11个微卫星位点的平均Na为3.909～5.636,平均He为0.561～0.629,平均PIC为0.493～0.556；其中AB群体平均Na和Ho最高(Na=5.636,Ho=0.600),BB群体平均He和PIC最高(He=0.629,PIC为0.556),AA群体除平均Fis值外，各项遗传多样性指标最低,SIS群体各项遗传多样性指标都低于AB和BB群体并高于BA和AA群体；5个群体在11个微卫星位点上的H-W 平衡遗传偏离指数(HWD)显示,2个自繁子代群体AA和BB在多数微卫星位点上都显著偏离平衡(p<0.05)．2.3 群体遗传分化分析5个凡纳滨对虾群体两两对比的FST和基于等位基因频率计算得到的各群体间的Ds见表4：各群体间FST和Ds分别介于0.037 5～0.254 8和0.064 0～0.670 4之间．5个群体中FST且Ds最大的是AA与SIS群体(FST=0.254 8,Ds=0.670 4),AB与BA群体之间的遗传分化最小(FST=0.037 5)．AMOVA结果显示,81.62%的遗传变异源于群体内,18.38%来自群体间(表5)．3.1 4个交配组合群体的生长及杂种优势情况生长性状对比结果表明,整个生长过程中正交子代AB群体的生长相比其他3个群体具有明显的优势, 而AA群体和反交子代BA群体的各项生长指标都较低．不同亲本所获子代的性状表现有显著差异,这种正反交性状的不对称性现象在水产生物的育种中已有不少报道[10-11]．此外,在养殖的前2个阶段，2个自繁群体的体质量日增长量随日龄的增加呈明显的下降趋势,而2个杂交群体的下降值低于2个自繁群体,这在一定程度上说明杂交子代在养殖早期的生长较稳定．杂种优势分析结果表明,AB群体获得了较高的与生长性状相关的杂种优势,说明选育系间杂交是提高凡纳滨对虾养殖性能的一个有效途径,这与林红军等[12]的研究结果一致．2个杂交子代的HMP在40～80 d内呈现先降低后上升的趋势,可见杂种优势在早期并不稳定,而到了后期又逐渐恢复并保持稳定状态,这种早期不稳定的现象可能与杂种优势在早期被母性效应掩盖有关[13]．BA群体表现出杂种劣势的现象则进一步说明杂交过程中母本的选择以及杂交配对起着非常重要的作用．3.2 5个凡纳滨对虾群体的遗传多样性微卫星标记是分析生物遗传多样性和遗传差异的有效工具,衡量微卫星位点多态性的一个重要指标是PIC．本研究中的11个微卫星位点在5个凡纳滨对虾群体中均表现出多态性,根据Botstein等[9]的划分标准,位点TUMXLv7.121、TUMXLv7.56、Pvan1815和TUMXLv10.312表现出较高的多态性(PIC>0.5)，TUMXLv10.207和TUMXLv9.178分别在AA和SIS群体中表现出较低的多态性(PIC<0.25)，其余位点均为中度多态性.5个群体在这11个微卫星位点上的平均PIC介于0.512～0.556之间，具有较高的多态性.在遗传育种工作中,明确基础群体的遗传多样性情况,并采用遗传多样性水平较高的群体作为亲代选育,将增强后代对环境的适应性．Na和He是评价群体遗传多样性的重要指标,杂合度的评估中Ho易受样本大小的影响,而He更能反映群体的遗传多样性[14]．本研究中,平均Na最高的是杂交子代AB群体(Na=5.636,He=0.606),平均He最高的是BB群体(Na=4.454,He=0.629),这2个群体的遗传多样性参数水平略高于冯娜娜等[15]和Vela Avitúa等[16]所研究的国内及墨西哥的凡纳滨对虾养殖群体,而低于Lima等[17]研究的巴西养殖群体．对各群体H-W平衡检验结果表明,AA和BB群体在多数位点上都偏离了平衡．群体的Fis也代表其基因纯合度[18],5个凡纳滨对虾群体的平均Fis均为正值表明各群体均存在不同程度的近交及杂合子缺失现象，其中AB群体的近交程度最低(Fis=0.017),SIS群体次之(Fis=0.057),AA群体近交程度最高(Fis=0.151)，说明AA群体的基因型已经达到了相对较纯合的状态,这与Knibb等[19]的研究结果一致．另外,位点TUMXLv9.178的Fis在所有群体中均为正值,表明该位点存在部分纯合子过剩,这可能是由于无效等位基因的存在所致[20]．正交子代AB群体遗传多样性水平在各群体中最高,而反交子代BA群体相对较低,这可能与亲本对子代基因库的贡献率不同相关[21],而亲本遗传贡献率的差异则是受精率、成活率等多种因素综合影响的结果．2个选育系杂交子代与自繁子代遗传多样性水平上的差异表明,选育系间杂交可使后代的遗传多样性水平得到明显改良．另外,SIS群体的遗传多样性低于AB和BB群体的现象,从一定程度上证实了目前国内凡纳滨对虾亲虾市场上关于近年来SIS公司亲虾质量下降的报道[22]．3.3 5个凡纳滨对虾群体的遗传差异在水产生物育种过程中,亲本的选择除了要保证高的遗传多样性水平之外,还应考虑遗传距离及遗传分化程度的大小．选择遗传距离远且具有良好性状的凡纳滨对虾进行杂交试验,并评估最优组合,是培育优良新品种的有效途径[23]．本研究对5个凡纳滨对虾群体FST和Ds的分析显示,选育系A虽然也源自于美国,但经过多代的自繁选育后已与新引进的美国SIS亲代群体之间发生了明显的遗传分化(FST=0.254 8,Ds=0.670 4),这表明长期的自繁会导致同一地区来源的凡纳滨对虾后代之间发生明显的遗传分化,这种情况在罗氏沼虾(Macrob rachium rosenbergii)[24]中也有发现．另外,2个杂交子代群体(AB和BA)和2个自交子代群体(AA和BB)之间出现了高度遗传分化(FST>0.20,Ds>0.4),而2个杂交子代群体与SIS群体之间则为中度遗传分化(0.05<FST≤0.15,Ds<0.2)．综上可见,引进的亲虾群体经多代自繁后,其后代的遗传多样性有所下降,但基因型的纯合度得到提高．采用多代自繁的凡纳滨对虾纯合选育系进行选育系间杂交,其杂交后代能够表现出一定的杂种优势,同时遗传多样性水平也得到一定程度的提高,这有望成为培育凡纳滨对虾新品种(系)的一个有效途径．【相关文献】[1] 于洋.凡纳滨对虾分子标记的开发及其在遗传育种中的应用[D].青岛:中国科学院研究生院 (海洋研究所),2014:1-6.[2] 刘建勇.南美白对虾优质种苗培育技术(上)[J].当代水产,2014(1):1-3.[3] VASEEHARAN B,RAJAKAMARAN P,JAYASEELAN D,et al.Molecular markers and their application in genetic diversity of penaeid shrimp[J].AquacultureInternational,2013,21(2):219-241.[4] MAGGIONI R,COIMBRA M R M,COSTA R B,et al.Genetic variability of marine shrimp in the Brazilian industry[J].Pesquisa Agropecuria Brasileira,2013,48(8):968-974.[5] ARTILES A,COBO R,BENTEZ L,et al.Assessment of genetic variation and productive markers through four progenies of the first introduced stock of cultured shrimp Penaeus (Litopenaeus) vannamei in Cuba[J].International Journal of Aquaculture,2015,5(23)：1-12.[6] LUVESUTO 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