rtpcr原理
RT-PCR详细图文解析
一、实时荧光定量PCR原理（一）定义：在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号累积实时监测整个PCR 进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
（二）实时原理1、常规PCR技术：对PCR扩增反应的终点产物进行定量和定性分析无法对起始模板准确定量，无法对扩增反应实时检测。
2、实时定量PCR技术：利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化，通过Ct 值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析3、如何对起始模板定量？通过Ct值和标准曲线对起始模板进行定量分析.4、几个概念：（1）扩增曲线：（2）荧光阈值：（3）Ct值：CT值的重现性：5、定量原理：理想的PCR反应：X=X0*2n非理想的PCR反应：X=X0 (1+Ex)n n：扩增反应的循环次数X：第n次循环后的产物量X0：初始模板量Ex：扩增效率5、标准曲线6、绝对定量1）确定未知样品的C(t)值2）通过标准曲线由未知样品的C(t)值推算出其初始量7、DNA的荧光标记：二、实时荧光定量PCR的几种方法介绍方法一：SYBR Green法（一）工作原理1、SYBR Green 能结合到双链DNA的小沟部位2、SYBR Green 只有和双链DNA结合后才发荧光3、变性时，DNA双链分开，无荧光4、复性和延伸时，形成双链DNA，SYBR Green 发荧光，在此阶段采集荧光信号。
PCR反应体系的建立及优化:1、SYBR Green 使用浓度:太高抑制Taq酶活性，太低，荧光信号太弱，不易检测2、Primer：引物的特异性高，否则扩增有杂带，定量不准3、MgCl2的浓度:可以降低到1.5mM,以减少非特异性产物4、反应Buffer 体系的优化5、反应温度和时间参数:由酶和引物决定6、其他与常规PCR相同（二）应用范围1、起始模板的测定；2、基因型的分析；3、融解曲线分析：可以优化PCR反应的条件，对常规PCR有指导意义，如对primer 的评价；可以区分单一引物、引物二聚体、变异产物、多种产物。
RT-PCR百度百科
概念RT-PCR 为反转录RCR（reverse transcription PCR）和实时PCR（real time PCR）共同的缩写。
逆转录PCR，或者称反转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR)，是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。
在RT-PCR中，一条RNA链被逆转录成为互补DNA，再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。
由一条RNA单链转录为互补DNA(cDNA)称作“逆转录”，由依赖RNA的DNA聚合酶（逆转录酶）来完成。
随后，DNA的另一条链通过脱氧核苷酸引物和依赖RNA 的DNA聚合酶完成，随每个循环倍增，即通常的PCR。
原先的RNA模板被RNA酶H降解，留下互补DNA。
RT-PCR的指数扩增是一种很灵敏的技术，可以检测很低拷贝数的RNA。
RT-P CR广泛应用于遗传病的诊断，并且可以用于定量监测某种RNA的含量。
（检测基因表达的方法，参见Northern Blot法。
）RT-PCR有时候也会指代实时PCR(real-time PCR)。
为了与逆转录PCR相区别，通常被写作“定量PCR”(quantitative PCR)或者RTQ-PCR(real-time quantitative P CR)。
实时PCR(real-time PCR)，属于定量PCR（Q-PCR）的一种，以一定时间内D NA的增幅量为基础进行DNA的定量分析。
real time PCR 的定量使用萤光色素，目前有二种方法。
一种是在ds DNA中插入特异的萤光色素；另一种使用一种能与增幅DNA序列中特定寡核酸序列相结合的一种萤光探针（probe）。
real time PCR 与reverse transcription PCR 相结合，能用微量的RNA来找出特定时间、细胞、组织内的特别表达的遗传基因。
这两种RT PCR的组合又被称之为“定量RT-PCR（quantitative RT-PCR）”[编辑本段]PCR技术相关试剂A液：变性液B液：醋酸钠溶液C液：酚／氯仿／异戊醇混合液（50：49：1）D液：异丙醇E液：75％乙醇F液：DEPC处理的灭菌去离子水G液：RNA酶抑制剂H液：反转录反应液I液：反转录酶J液：PCR反应液K液：Taq DNA聚合酶(0.5u／µl)L液：矿物油M液：50倍TAE电泳缓冲液N液：溴化乙锭溶液0液：上样缓冲液[编辑本段]PCR各步骤的目的（一）预变性：破坏DNA中可能存在的较难破坏的二级结构。
RT-PCR技术原理
RT-PCR原理
掌握PCR技术。 学会操作RT-PCR简介PCR仪。 熟悉琼脂糖凝胶电泳技术。
首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA，再 以cDNA为模板，扩增合成目的片段。
RT-PCR两种方法
RT-PCR反应体系
RT引物的选择
RT逆转录酶的选择
RT-PCR操作流程
1.从细胞或特定组织中提取总RNA； 2.逆转录实验； 3.扩增内参和目的基因并比较基因表达差异。
RT-PCR技术原理简介
张晓涛
RT-PCR简介
RT- PCR（Reverse TranscriptionPolymerase Chain Reaction）即逆转录PCR
RT-PCR是将RNA的反转录（RT）和cDNA的聚 合酶链式扩增（PCR）相结合的技术。
RT-PCR技术灵敏而且用途广泛，可用于检测 细胞中基因表达水平，细胞中RNA病毒的含 量和直接克隆特定基因的cDNA序列。
实验流程（两步法）
实验流程（一步法）
RT实验要素—决定特异性和灵敏度
问题（一）RT-PCR没有产物
原因
对策
பைடு நூலகம்
问题（二）非特异性扩增
原因
对策
RT-PCR_原理介绍
Real-time PCR(RT-PCR) 原理介绍实时荧光定量PCR技术于1996年由美国Applied Biosystems公司推出，由于该技术不仅实现了PCR从定性到定量的飞跃，而且与常规PCR相比，它具有特异性更强、有效解决PCR污染问题、自动化程度高等特点，目前已得到广泛应用。
本文试就其定量原理、方法及参照问题作一介绍。
一.实时荧光定量PCR原理所谓实时荧光定量PCR技术，是指在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
1.Ct 值的定义在荧光定量PCR技术中，有一个很重要的概念—— Ct值。
C代表Cycle，t代表threshold，Ct值的含义是：每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数（如图1所示）。
图1. Ct值的确定2.荧光域值（threshold）的设定PCR反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号，荧光域值的缺省设置是3-15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍，即：threshold = 10 ´SDcycle 6-153.Ct值与起始模板的关系研究表明，每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系〔1〕，起始拷贝数越多，Ct值越小。
利用已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线，其中横坐标代表起始拷贝数的对数，纵坐标代Ct值（如图2所示）。
因此，只要获得未知样品的Ct值，即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数。
图2. 荧光定量标准曲线4.荧光化学荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种：荧光探针和荧光染料〔2〕。
现将其原理简述如下：1）TaqMan荧光探针：PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针，该探针为一寡核苷酸，两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。
探针完整时，报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收；PCR扩增时，Taq酶的5’－3’外切酶活性将探针酶切降解，使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离，从而荧光监测系统可接收到荧光信号，即每扩增一条DNA链，就有一个荧光分子形成，实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。
rtpcr的作用
rtpcr的作用什么是rtpcrrtpcr（全称为逆转录聚合酶链反应，Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction），是一种基因检测技术，可以用于检测RNA分子在样本中的存在并量化。
rtpcr的原理rtpcr技术基于聚合酶链反应（PCR）的原理，通过逆转录将RNA转化为反义DNA （cDNA），然后使用一对特定的引物（primers）扩增目标基因的DNA片段。
逆转录过程中，逆转录酶将RNA模板反向转录合成cDNA，在PCR反应中，DNA聚合酶通过引物将cDNA扩增成大量的DNA。
这个过程可以使我们检测到RNA分子的存在，并量化RNA的数量。
rtpcr的应用rtpcr技术在生物医学研究和临床诊断中有着广泛的应用，特别是在疾病的诊断和治疗中起着重要作用。
1.病原体检测：rtpcr可以检测感染性疾病的病原体，如病毒和细菌。
通过扩增病原体酸核酸的特定片段，可以快速准确地诊断出病原体感染。
2.基因表达分析：rtpcr可以评估基因在不同组织或细胞中的表达水平。
通过对比不同样本中目标基因的表达差异，可以研究基因在生理和病理过程中的调控机制。
3.肿瘤检测：rtpcr可以检测肿瘤标志物，通过扩增患者体液或组织中的肿瘤相关基因，可以及早诊断出肿瘤，进行早期治疗。
4.遗传疾病诊断：rtpcr可以检测遗传疾病的突变基因，帮助医生确定患者是否携带致病基因，并进行遗传咨询和干预。
5.药物研发：rtpcr可以评估药物对特定基因的调控作用，在新药研发中有着重要的应用价值。
rtpcr的优势和局限性rtpcr技术相比传统的基因检测方法具有以下优势：•高灵敏度：可以检测到非常低浓度的目标RNA，并能够量化RNA的表达水平。
•高特异性：通过引物的设计，可以选择性地扩增目标基因，减少误报率。
•高准确性：可以重复多次扩增同一样本，并获得可重复的结果。
然而，rtpcr技术也存在一些局限性：•需要引物设计：需要针对目标基因设计特异引物，这对于一些未知基因或变异较多的基因可能存在困难。
RT-PCR技术原理
RT-PCR原理与实验操作一、知识背景：1、基因表达：DNA RNA Protein单拷贝基因表达存在逐步放大机制，如一个蚕丝心蛋白基因104个丝心蛋白mRNA（每个mRNA存活4d，可以合成105个丝心蛋白）共合成109个丝心蛋白。
因此单拷贝基因的mRNA表达水平对于其功能水平的调控是非常重要的。
2、PCR技术(polymerase chain reaction)：即聚合酶链式反应。
在模板、引物和四种脱氧核苷酸存在的条件下依赖于DNA聚合酶的酶促反应，其特异性由两个人工合成的引物序列决定。
反应分三步：A、变性：通过加热使DNA双螺旋的氢键断裂，形成单链DNA；B、退火：将反应混合液冷却至某一温度，使引物与模板结合。
C、延伸：在DNA聚合酶和dNTPs及Mg2＋存在下，退火引物沿5‘ 3’方向延伸。
以上三步为一个循环，如此反复。
3、逆转录酶和RT-PCR逆转录酶（reverse transcriptase）是存在于RNA病毒体内的依赖RNA的DNA聚合酶，至少具有以下三种活性：1、依赖RNA的DNA聚合酶活性：以RNA为模板合成cDNA第一条链；2、Rnase水解活性：水解RNANA杂合体中的RNA；3、依赖DNA的DNA聚合酶活性：以第一条DNA链为模板合成互补的双链cDNA.二、RT-PCR的准备：1、引物的设计及其原则：1）引物的特异性决定PCR反应特异性。
因此引物设计是否合理对于整个实验有着至关重要的影响。
在引物设计时要充分考虑到可能存在的同源序列，同种蛋白的不同亚型，不同的mRNA剪切方式以及可能存在的hnRNA对引物的特异性的影响。
尽量选择覆盖相连两个内含子的引物，或者在目的蛋白表达过程中特异存在而在其他亚型中不存在的内含子。
2）引物设计原则的把握：引物设计原则包括a、引物长度:一般为15～30bp ，引物太短会影响PCR的特异性，引物太长PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最适温度，也影响反应的特异性。
rt-pcr 探针原理 -回复
rt-pcr 探针原理-回复RTPCR 探针原理引言：在生物学研究领域，分子生物学技术的发展为我们揭示了许多生物过程的奥秘。
其中一项重要的技术是逆转录聚合酶链反应（RT-PCR），它是确定RNA中特定基因表达水平的强大工具。
RT-PCR技术的成功离不开探针的应用，通过探针的设计和合成，可以实现高度特异性的基因表达检测。
本文将详细探讨RT-PCR探针的原理，包括探针的设计、合成和应用方法。
一、RT-PCR的概述逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）是一种将RNA转化为DNA的方法，然后通过后续的PCR扩增反应来检测目标基因的表达水平。
RT-PCR技术的发明使得我们可以准确地测量RNA水平，并分析基因在不同组织或生理状态下的表达差异。
二、RT-PCR探针的基本原理RT-PCR探针是一种特殊的引物，用于在RT-PCR反应中选择性地扩增目标基因的特定序列。
与PCR引物不同，探针通常带有额外的物质，如荧光染料或报告分子，以便在扩增过程中检测目标序列的存在与否。
1. 探针的设计探针的设计是RT-PCR技术中极其重要的一步。
为了保证高度特异性和敏感性，需要根据目标基因的序列设计探针。
首先，需要选择一个足够长的片段作为探针的目标区域。
这个片段应在目标基因的独特区域，不能与其他基因序列混淆。
通常情况下，选择150-200个碱基对的片段是比较合适的。
其次，探针的设计需要满足一定的物理和化学特性。
例如，探针的GC含量应在40-60范围内，以确保适当的熔解温度。
此外，探针的末端应避免存在碱基序列间的重复，以免产生不特异的扩增产物。
最后，为了在PCR反应中检测探针的存在，需要将一个报告分子连接到探针上，比如荧光染料。
这种报告分子可以发出特定的信号，用于检测PCR 扩增的过程中特定序列的存在。
2. 探针的合成探针的合成可以通过合成化学方法来实现。
常见的方法是采用固相法合成，使用4个碱基的硫酰胺磺酰（or phosphoramidite）合成前体进行合成。
RT-PCR反转录原理及方法
准备包括 DNA 模板、引物、酶等必备物
质的 PCR 反应体系。
3
扩增过程
通过 PCR 仪对 DNA 进行多轮循环扩增， 以放大目标基因片段。
PCR 的条件优化及设计
1 温度
2 引物设计
优化反应温度，包括退火 温度和扩增温度，以提高 PCR 反应的特异性和效率。
设计合适的引物，包括引 物序列的选择和引物之间 的匹配程度。
不同之处
qPCR 可以实时监测 PCR 反应过程中产生的 DNA 数量， 而 RT-PCR 只能得到最终结果。
RT-PCR在研究领域的应用
1
免疫学研究
检测细胞因子、免疫相关基因的表达水
疾病诊断
2
平。
检测病原体、肿瘤标志物等与疾病相关
的基因。
3
基因表达研究
研究基因在各个发育阶段和组织类型中
生物学研究
PCR 检测方法
凝胶电泳
将扩增产物通过电泳分离，根 据大小和电荷差异进行检测。
实时荧光定量 PCR
利用荧光探针在 PCR 反应过程 中实时监测产物的累积量。
测序
通过 Sanger 测序或二代测序技 术对 PCR 产物进行基因序列的 确定。
RT-PCR 与 qPCR 的区别与联系
相同之处
都是通过增加 DNA 拷贝数来检测特定基因序列。
3 核酸模板浓度
优化核酸模板的浓度以获 得最佳的 PCR 反应结果。
PCR 模板的种类
基因组 DNA
从细胞中提取的全基因组 DNA，用于检测基因组上特 定的基因。
cDNA
通过 RT-PCR 将 RNA 反转录 而成的 DNA，用于检测特定 的 RNA 序列。
合成 DNA
《RTPCR技术原理》课件
缺点
对操作人员要求较高
RTPCR技术的操作较为复杂，需要经过专 业培训的操作人员才能保证结果的准确性
。
成本较高
RTPCR技术需要昂贵的仪器和试剂 ，导致检测成本较高，可能限制其
在资源有限地区的普及。
A
B
C
D
可能出现交叉污染
在操作过程中，如果样品或试剂受到污染 ，可能会导致交叉污染，影响检测结果的 准确性。
《rtpcr技术原理》ppt课 件
目录 CONTENT
• RTPCR技术概述 • RTPCR技术原理 • RTPCR实验操作流程 • RTPCR技术的优缺点 • RTPCR技术的应用实例
01
RTPCR技术概述
RTPCR技术定义
实时荧光定量PCR（Real-Time PCR）是一种在PCR反应过程中，通过荧光信号 检测DNA片段的扩增情况，并实时监测其变化的技术。
2000年
ABI公司推出高分辨率熔解曲线分析 技术，提高了SNP分型和突变检测的 准确性。
2004年
基于焦磷酸测序原理的实时荧光定量 PCR技术问世，提高了检测通量和灵 敏度。
RTPCR技术的应用领域
基因表达分析
突变检测
通过比较不同组织或不同处理条件下基因 的表达水平，研究基因的表达调控机制。
用于检测DNA序列中的点突变、插入和缺 失等变异，用于遗传病、肿瘤等疾病的诊 断和监测。
基因突变检测
总结词
RTPCR技术能够高效地检测基因突变，为遗传性疾病的诊断和治疗提供依据。
详细描述
基因突变是许多遗传性疾病的诱因，RTPCR技术通过对特定基因的扩增和荧光 检测，能够快速、准确地检测出基因突变位点及类型。这有助于遗传性疾病的 早期诊断和针对性治疗，为患者提供更好的医疗方案。
逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)
每个实验视频内容包括详细的实验操作流程，原理讲解，结果分析及疑难解答，并配有相应 的详实的文字文档和参考文献！
① 在 0.5ml 微量离心管中，加入总 RNA 1-5μg，补充适量的 DEPC H2O 使总体积达 11μl。 在管中加 10μM Oligo（dT）12-18 1μl，轻轻混匀、离心。 ② 70℃加热 10min，立即将微量离心管揑入冰浴中至少 1min。 然后加入下列试剂的混合物：10×PCR buffer 2μl；25mM MgCl2 2μl；10mM dNTPmix 1μl；0.1M DTT 2μl 轻轻混匀，离心。42℃孵育 2-5min。 ③ 加入 SuperscriptⅡ1μl ，在 42℃水浴中孵育 50min。 ④ 于 70℃加热 15min 以终止反应。 ⑤ 将管揑入冰中，加入 RNase H 1μl ，37℃孵育 20min，降解残留的 RNA。-20℃保存 备用。 3．PCR： ① 取 0.5ml PCR 管，依次加入下列试剂：第一链 cDNA 2μl；上游引物（10pM） 2μl； 下游引物（10pM） 2μl；dNTP(2mM) 4μl；10×PCR buffer 5μl；Taq 酶（2u/μl） 1μl。 ② 加入适量的 ddH2O，使总体积达 50μl。轻轻混匀，离心。 ③ 设定 PCR 程序。在适当的温度参数下扩增 28-32 个循环。为了保证实验结果的可靠不 准确，可在 PCR 扩增目的基因时，加入一对内参（如 G3PD）的特异性引物，同时扩增内 参 DNA，作为对照。 ④ 电泳鉴定：行琼脂糖凝胶电泳，紫外灯下观察结果。 ⑤ 密度扫描、结果分析：采用凝胶图像分析系统，对电泳条带进行密度扫描。 五、注意事项 1．在实验过程中要防止 RNA 的降解，保持 RNA 的完整性。在总 RNA 的提取过程中，注 意避免 mRNA 的断裂。
rt pcr原理
Real-time PCR（实时荧光定量PCR）原理解析1. 什么是PCR？PCR（Polymerase Chain Reaction，聚合酶链反应）是一种在体外扩增DNA片段的技术。
PCR的发明者是美国生物化学家基里尔·米隆尼斯（Kary Mullis），于1983年提出了这一方法。
PCR通过不断重复三个步骤来扩增目标DNA片段：变性（Denaturation）、退火（Annealing）和延伸（Elongation）。
这些步骤在PCR仪中由多个温度循环来控制，因此PCR也被称为“温度循环扩增”。
PCR技术为科学家提供了一种快速、敏感、特异性极高的扩增目标DNA的方法。
然而，传统的PCR只能在反应结束后进行结果的检测，无法实时监测反应的过程。
为了解决这个问题，Real-time PCR技术应运而生。
2. 实时PCR概述实时PCR是在PCR扩增过程中，使用荧光信号实时监测反应的进行。
与传统PCR相比，实时PCR能够提供实时的、连续的照片剖析PCR的进展。
实时PCR有两种常用的检测方法：荧光染料法和探针法。
其中，探针法又分为TaqMan探针法和Molecular Beacon探针法。
这些探针和染料能够与PCR反应中的产物结合，并产生荧光信号，根据信号的增长情况可以推断目标DNA的含量。
实时PCR广泛应用于分子生物学、医学诊断、检测病原体等领域。
接下来，我们将重点介绍实时PCR的基本原理以及常用的探针法和荧光染料法。
3. 实时PCR基本原理实时PCR的基本原理和传统PCR类似，也是通过变性、退火和延伸三个步骤来扩增DNA片段。
然而，在实时PCR中，PCR反应是在热循环PCR仪中进行，并且扩增过程中的结果可以实时检测。
实时PCR一般需要使用一种独特的仪器，称为实时荧光PCR仪或荧光定量PCR仪。
这种仪器能够在不破坏试管密封的情况下，通过荧光信号实时检测PCR反应体系中的增长程度。
在实时PCR中，荧光信号通过专门的探测器（Detector）收集，并且荧光信号的强度会随着PCR反应进行的次数递增。
rt—qpcr实验原理及步骤
rt-qpcr是一种结合了逆转录和实时荧光定量PCR技术的方法，用于对RNA分子进行定量检测。
其原理主要包括三个方面：逆转录、PCR 扩增和实时荧光定量检测。
1. 逆转录rt-qpcr实验首先需要将RNA转录为cDNA，这是通过逆转录酶（Reverse Transcriptase）催化的反应来实现的。
逆转录酶可以将RNA模板转录成相应的cDNA，为后续的PCR扩增提供模板。
2. PCR扩增在cDNA合成完成后，接下来是PCR扩增反应。
PCR扩增需要引物（primers）来选择性地扩增目标基因的片段。
在PCR过程中，引物与模板结合，逐渐扩增出大量目标片段，这些片段即为实验所关注的RNA分子的转录产物。
3. 实时荧光定量检测在PCR扩增过程中，可以加入SYBR Green等实时荧光染料，以实现实时监测PCR反应过程中产生的DNA片段数量。
这种实时荧光检测技术可以实现对PCR反应的动态观察，并能够定量分析反应体系中的DNA含量。
rt-qpcr实验步骤主要包括样品准备、逆转录、PCR扩增和荧光定量检测，以下为详细步骤：1. 样品准备首先需要准备待检测的RNA样品，其中包括目标RNA分子的提取、纯化和定量等工作。
样品的处理质量将直接影响后续实验结果的准确性和可靠性。
2. 逆转录将RNA样品与逆转录酶、随机引物和dNTPs等混合物一起进行逆转录反应。
逆转录过程一般包括以下步骤：首先将RNA与随机引物混合，然后加入dNTPs和逆转录酶，进行逆转录反应。
3. PCR扩增在逆转录完成后，将逆转录得到的cDNA作为模板，与特定引物和PCR Master Mix（包括酶、缓冲液和dNTPs等）进行PCR扩增反应。
PCR扩增条件需要根据引物的特性和目标片段的长度进行优化，以保证扩增反应的特异性和准确性。
4. 荧光定量检测在PCR扩增过程中，引入实时荧光染料（如SYBR Green）或探针（如TaqMan探针）来进行荧光定量检测。
RT-PCR原理及载体选择
— 试 验 总 结 —
15
绝对定量分析法
根据起始浓度与循环数呈线性关系，通过已知起始拷贝数的标准品可 做出标准曲线，再根据样品的 CT值就可以计算出样品所含的模板量。
16
R T-P C R 与 表 达 载 体 的 选 择
1
表达载体
表达载体（Expression vectors）就是在 克隆载体基本骨架的基础上增加表达 元件（如启动子、RBS、终止子等）， 是目的基因能够表达的载体。 表达载体是基因表达的核心元件。
— 试 验 总 结 —
2
实时荧光定量PCR
实时荧光定量PCR技术(RT-PCR) 是一种在PCR 反应体系中加入荧光基团利用荧光信号的积累实 时监测整个PCR反应的进程，最后通过标准曲线 对未知模板进行定量分析的方法。
— 试 验 总 结 —
12
两种方法的比较
— 试 验 总 结 —
13
荧光定量的解析方法
14
PCR 反应体系
10×PCR Buffer(含Mg2+ ) 2 uL dNTPs(各2.5mmol/L) 2 uL 引物(10umol/L) 各1 uL 模板 20～40 ng rTaq DNA聚合酶 0.5 U± 加双或三蒸水至 20 uL
5
— 扩 增 曲 线 —
RT-PCR的数学原理
6
CT
7
PCR 反应的对照
8
PCR 反应条件
— 试 验 总 结 —
9
TaqMan 探针法
— 试 验 总 结 —
10
SYBR Green I荧光染料法
SYBR Green I是一种只与dsDNA小沟 结合的具有绿色激发波长荧光染料。
11
实时定量RTPCR的原理及方法
实时定量RTPCR的原理及方法一、本文概述实时定量反转录聚合酶链式反应（Real-Time Quantitative Reverse Transcription Polymerase Chn Reaction，简称实时定量RT-PCR）是一种在分子生物学领域中广泛应用的实验技术，用于检测和分析RNA样本中特定基因的表达水平。
该技术结合了反转录和聚合酶链式反应（PCR）的基本原理，通过实时监测PCR过程中产生的荧光信号，实现对基因表达量的高精度定量。
本文将对实时定量RT-PCR 的原理、实验方法以及应用进行详细的阐述，旨在为读者提供全面且深入的了解，从而能够在实际研究中灵活应用该技术，提高实验效率和准确性。
二、实时定量RT-PCR的基本原理实时定量反转录聚合酶链式反应（Real-Time Quantitative Reverse Transcription Polymerase Chn Reaction，简称实时定量RT-PCR）是一种在DNA扩增过程中，通过荧光信号实时监测反应产物量的变化，从而得到起始模板量的分析方法。
这种技术结合了反转录（RT）和聚合酶链式反应（PCR）两个过程，使得RNA模板也能进行定量分析。
实时定量RT-PCR的基本原理可以分为三个步骤：反转录，PCR 扩增，以及实时荧光信号检测。
反转录步骤中，RNA模板在反转录酶的作用下，被转换成互补的DNA（cDNA）。
这个过程中，RNA的特异性序列被保留下来，为后续的PCR扩增提供了模板。
然后，PCR扩增步骤中，特定的DNA片段在DNA聚合酶的作用下，通过引物的引导，进行指数级的扩增。
在这个过程中，DNA的数量以2的n次方（n为循环次数）增长，从而大大提高了检测的灵敏度。
实时荧光信号检测步骤中，通过在PCR反应体系中加入荧光染料或荧光标记的特异性探针，使得在DNA扩增的每一个循环中，都能实时监测到荧光信号的变化。
这种荧光信号的变化与DNA产物的量成正比，因此可以通过实时监测荧光信号，来推算出起始模板的量。
深入理解rt pcr原理及应用
深入理解rt pcr原理及应用标题：深入理解RT-PCR原理及应用引言：RT-PCR（Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction）是一项重要的实验技术，广泛应用于分子生物学和医学研究领域。
本文将深入探讨RT-PCR的原理、操作步骤以及其在基因表达分析、传染病诊断和生物医学研究中的应用。
通过本文的阐述，读者将能够更好地理解RT-PCR的工作原理，并对其潜在应用有更全面的了解。
一、RT-PCR的基本原理1.1 反转录过程反转录过程是RT-PCR的核心步骤之一，其将RNA模板转录为相应的互补DNA（cDNA）。
该步骤涉及到逆转录酶的使用，它能够将RNA 模板上的核酸序列转录为互补的DNA序列。
1.2 PCR扩增过程PCR扩增是RT-PCR的另一个重要步骤，其能够使得少量的目标DNA 序列在体外迅速扩增至丰富、可检测的数量。
PCR扩增通过反复进行热循环，包括三个主要步骤：变性、退火和延伸。
在合适的条件下，DNA模板将被不断复制，生成指数级增加的扩增产物。
二、RT-PCR的操作步骤2.1 样本和试剂的准备在开始RT-PCR实验之前，首先需要准备好待分析的样本和所需的试剂，包括RNA提取试剂、RT反应试剂盒和PCR扩增试剂盒等。
2.2 反转录反应反转录反应是RT-PCR的第一步，其将RNA转录为cDNA。
该步骤中需要逆转录酶和引物，逆转录酶能够合成互补的DNA链，引物用于定向引导逆转录酶合成。
2.3 PCR扩增反应在完成反转录反应后，接下来是PCR扩增反应。
PCR扩增反应需要合适的引物以及热稳定的DNA聚合酶。
通过合理设计引物和优化反应条件，可以实现特定基因序列的选择性扩增。
三、RT-PCR应用领域3.1 基因表达分析RT-PCR被广泛用于基因表达分析，可以检测和定量目标基因在不同组织和细胞类型中的表达水平。
这项技术能够揭示基因在生物体中的表达模式，并为研究基因功能、生物发育和疾病机制提供重要依据。
RT-PCR详细图文解析
一、实时荧光定量PCR原理（一）定义：在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号累积实时监测整个PCR 进程，最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
（二）实时原理1、常规PCR技术：对PCR扩增反应的终点产物进行定量和定性分析无法对起始模板准确定量，无法对扩增反应实时检测。
2、实时定量PCR技术：利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化，通过Ct 值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析3、如何对起始模板定量？通过Ct值和标准曲线对起始模板进行定量分析.4、几个概念：（1）扩增曲线：（2）荧光阈值：（3）Ct值：CT值的重现性：5、定量原理：理想的PCR反应：X=X0*2n非理想的PCR反应：X=X0 (1+Ex)n n：扩增反应的循环次数X：第n次循环后的产物量X0：初始模板量Ex：扩增效率5、标准曲线6、绝对定量1）确定未知样品的C(t)值2）通过标准曲线由未知样品的C(t)值推算出其初始量7、DNA的荧光标记：二、实时荧光定量PCR的几种方法介绍方法一：SYBR Green法（一）工作原理1、SYBR Green 能结合到双链DNA的小沟部位2、SYBR Green 只有和双链DNA结合后才发荧光3、变性时，DNA双链分开，无荧光4、复性和延伸时，形成双链DNA，SYBR Green 发荧光，在此阶段采集荧光信号。
PCR反应体系的建立及优化:1、SYBR Green 使用浓度:太高抑制Taq酶活性，太低，荧光信号太弱，不易检测2、Primer：引物的特异性高，否则扩增有杂带，定量不准3、MgCl2的浓度:可以降低到1.5mM,以减少非特异性产物4、反应Buffer 体系的优化5、反应温度和时间参数:由酶和引物决定6、其他与常规PCR相同（二）应用范围1、起始模板的测定；2、基因型的分析；3、融解曲线分析：可以优化PCR反应的条件，对常规PCR有指导意义，如对primer 的评价；可以区分单一引物、引物二聚体、变异产物、多种产物。
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RT-PCR是将RNA的反转录（RT）和cDNA的聚合酶链式扩增（PCR）相结合的技术。
首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA，再以cDNA为模板，扩增合成目的片段。
RT-PCR技术灵敏而且用途广泛，可用于检测细胞中基因表达水平，细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。
作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。
RT-PCR用于对表达信息进行检测或定量。
另外，这项技术还可以用来检测基因表达差异或不必构建cDNA文库克隆cDNA。
RT-PCR比其他包括Northern印迹、RNase保护分析、原位杂交及S1核酸酶分析在内的RNA分析技术，更灵敏，更易于操作。
逆转录反应可以使用逆转录酶，以随机引物、oligo(dT)或基因特异性的引物（GSP）起始。
RT-PCR可以一步法或两步法的形式进行。
在两步法RT-PCR中，每一步都在最佳条件下进行。
cDNA的合成首先在逆转录缓冲液中进行，然后取出1/10的反应产物进行PCR。
在一步法RT-PCR中，逆转录和PCR在同时为逆转录和PCR优化的条件下，在一只管中顺次进行。
逆转录酶（reverse transcriptase）是存在于RNA病毒体内的依赖RNA的DNA聚合酶，至少具有以下三种活性：
1、依赖RNA的DNA聚合酶活性：以RNA为模板合成cDNA第一条链
2、 Rnase水解活性：水解RNA杂合体中的RNA；
3、依赖DNA的DNA聚合酶活性：以第一条DNA链为模板合成互补的双链cDNA.
用于反转录的引物可视实验的具体情况选择随机引物、Oligo dT 及基因特异性引物中的一种。
对于短的不具有发卡结构的真核细胞mRNA，三种都可。
RT-PCR实验有三步：抽提RNA，RT，PCR。
试验前注意：
1. 做RT前必需测RNA浓度，逆转录体系对RNA量还是有一些要求，常用500ng或1ug
2. RT按要求做，一般不会出太大问题。
3. PCR如需扩长片段，则对前两步要求较高，需要有完整的cDNA存在，不是单改变Mg2+浓度、退火温度能解决的。
引物合成
1、内参照：
GAPDH正义：5′—ACCACAGTCCATGCCATCAC—3′
反义：5′—TCCACCACCCTGTTGCTGTA—3′
β-actin
正义：5′—CACGATGGAGGGGCCGGACTCATC—3′
反义：5′—TAAAGACCTCTATGCCAACACAGT—3′
2、 par-4:
正义：5′—GGGACCTCGGAACTCAAC—3′
反义：5′—TGTATCTGCCTGGGACTG—3′
、退火温度计算
（A+T）+4（G+C）
正反义平均数，再上下波动度（±4℃，或±5℃）
4、引物各合成5 OD，每OD一瓶分装好
5、引物稀释：
加DEPC水量为（μl）= ? nmol / OD × 管上所标OD数×100 稀释为10p mol / μl 浓度的引物溶液
注意事项：
1、逆转录的关键步骤是立即冰水浴。
2、Rt时，先打开PCR预热30分钟。
3、RNA抽提前，打开离心机预冷。
4、在所有RNA实验中，最关键的因素是分离得到全长的RNA。
而实验失败的主要原因是核糖核酸酶（RNA酶）的污染。
在实验中，一方面要严格控制外源性RNA酶的污染；另一方面要最大限度地抑制内源性的RNA酶。
RNA酶可耐受多种处理而不被灭活，如煮沸、高压灭菌等。
、做RT前必需测RNA浓度，逆转录体系对RNA量还是有一些要求，常用500ng或1ug。
6、RT按要求做，一般不会出太大问题。
?
7、PCR，按常规。
但如需扩长片段，则对前两步要求较高，需要有完整的cDNA存在，
不是单改变Mg2+浓度、退火温度能解决的。
8、注意避免有毒、有害试剂伤害自己和他人：氯仿、溴化乙锭（EB）、酚、异硫氰酸胍、紫外线等。