SPSS生存分析过程
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SPSSSurvival(生存分析)菜单SPSS Survival菜单包括LifeTables过程、Kaplan-Meier过程、Cox Regression过程、Cox w/Time-Dep Cov过程。这里只介绍Life Tables过程与Kaplan-Meier过程。
LifeTables过程
LifeTables过程用于:
1、估计某生存时间得生存率。
2、绘制各种曲线如生存函数、风险函数曲线等。
3、对某一研究因素不同水平得生存时间分布进行比较,控制另一因素后对研究因素不同水平得生存时间分布进行比较,包括从总体上比较与不同水平之间进行两两比较。
一、建立数据文件
定义两个列变量:
时间变量:取名“time”,label标上“survivaltime(week)”。
生存状态变量:取名“status”,并赋值:0=“删失”,1=“死亡”。
二、操作过程
从菜单选择
1、Analyze==>Survival==>LifeTables
2、Time框:选入time
3、Display Time Intervals框:在by前面得框内填入生存时间上限,本例填入20(此区间必须包括生存时间得最大值);在by后面得框内填
入生存时间得组距,本例填入5,以保证结果列出“15-”得组段。
4、Status框:选入status;击define events钮,在single value框右边得空格中输入1
5、单击Option按钮,弹出对话框:
●Life Table(s)输出寿命表,系统默认
● Plots:选Survival(累积生存函数曲线)
击Continue
6、单击OK钮
附:界面说明
图1 寿命表主对话框
【Time】框
选入生存时间变量。
【DisplayTime Intervals】框
欲输出生存时间范围及组距。
在by前面得框内填入生存时间上限,本例填入200(此区间必须包括生存时间得最大值);在by后面得框内填入生存时间得组距,本例填入20,以保证结果列出“100-”得组段。
【Status】框
选入生存状态变量,并定义终结事件得标记值。
选入变量“Status”后,【DefineEvent】钮被激活变黑,击该按钮,弹出定义终结事件标记值得对话框(图1)。对二分类变量,一般以死亡、复发、恶化等表示终结事件。本例以死亡为终结事件,其标记值为1,故在Si ngle value 框内填入1。击Continue钮。若生存状态变量取值为一连续型变量,如反应变量为收缩压,则在下面得Range of values 框中输入140through400,此处上限输入400就是我随便输入得一个上限,目得就是为了定义高血压患者,实际上恐怕没有人得血压能达到400,这样才能保证包括所有得高血压病例,具体情况具体分析。
图2 定义终结事件标记值得对话框
【Factor】框
定义第1层因素,即分组因素。
【By Factor】框
定义第2层因素,即分层因素。
【Options】选项
击Options按钮,弹出选项对话框。(图3)
图3寿命表选项对话框
Life Table(s):输出寿命表,系统默认。
Plot:统计图。
Survival:累积生存函数曲线。
Hazard:累积风险函数散点图。
One minus survival:生存函数被1减后得曲线。
Logsurvival:对数累积生存函数曲线。
Density:密度函数散点图。
pare LevelsofFirst Factor:对第1层因素不同水平得比较,即主对
话框(图1)中得factor框中所选入得因素。
None:不做比较。系统默认。
Overall:整体比较。
Pairwise:两两比较。
寿命表各个指标得意义
Intrvl Start Time:生存时间得组段下限。
Number Entrng this Intrvl:进入该组段得观察例数。
NumberWdrawnDuring Intrval:该组段得删失例数。
NumberExposedto Risk:暴露于危险因素得例数,即有效观察例数(校正观察人数)。
Numberof TermnlEvents:终结事件得例数,即死亡例数。
Propn Terminating:终结事件比例,即死亡比例。
Propn Surviving:生存比例。
Cumul PropnSurv at End:至本组段上限得累积生存率。
Probability Densty:概率密度。所有个体在时点t后单位时间内死亡概率得估计值。
Hazard Rate:风险率。活过时点t得个体,在时点t后单位时间内死亡概率得估计值。
SEofCumul Surviving:累积生存率得标准误。
SEof Probability Densty:概率密度得标准误。
SE of Hazard Rate:风险率得标准误。
Kaplan-Meier过程
采用乘积极限法(Product-limit estimates)来估计生存率,同时还可以对一个因素进行检验。适用于以个体为单位来收得未分组生存资料,就是最基本得一种生存分析方法。
Kaplan-Meier法用于:
1、估计某研究因素不同水平得中位生存时间。
2、比较该研究因素不同水平得生存时间有无差异。
3、控制一分层因素后对研究因素不同水平得生存时间比较(此时将按分层因素得不同水平对研究因素对生存时间得影响分别进行分析)。
操作过程:
1、 Analyze==>Survival ==>Kaplan-Meier
2、Time框:选入time
3、Status框:选入status;击define events钮,在single value 框右边得空格中输入1
4、Factor框:选入group;
5、pare factors列表框:
●Test Statistics:选择Log rank、Breslow、Tarone-Ware
●Lineartrendfor factor levels:选Pooledover strata或Pairwise over strata
6、Option列表框:
●Statistics: 选Survival table(s)、Mean andmedian、