基因组学复习参考
基因组学整理试题
基因组学整理试题填空题：1.位置效应的两种类型：稳定型，花斑型2.细胞器基因组：线粒体基因组，叶绿体基因组3.基因组进化的分子基础：突变，重组，转座4.RNA聚合酶的三种类型：pol1(RNA聚合酶1),pol2（RNA聚合酶2）,pol3（RNA聚合酶3）5.转座子分类：DNA转座子，逆转录转座子6.克隆载体的几种类型：YAC,BAC,HAC,MAC7.重叠群组建的方法：步移法，指纹法名词解释：1.C值：是指一个单倍体基因组中DNA的总量，一个特定的种属具有特征的C值。
2.C值悖理：生物种属所具有的基因数目与其生物结构的复杂性不成比例的现象.3.N值悖理：基因数目与进化程度或生物复杂性的不对应性，称之为N值悖理（N所表示的是基因数目）。
4.基因家族:来自一个共同的祖先, 因基因加倍和趋异产生许多在DNA序列上基本一致而略有不同的成员。
1）大部分担负类似的生物学功能.2）比较各个成员间的序列差异，可追踪基因的演变轨迹。
5.假基因：来源于功能基因但已失去原来功能的DNA序列.包括重复假基因、加工假基因、残缺假基因。
6. DNA标记->限制性片段长度多态性（ RFLP）同一物种的亚种、品系或个体间基因组DNA 受到同一种限制性内切酶作用而形成不同的酶切图谱的现象->简单序列长度多态性（SSLP）可变排列的简单重复序列, 即重复次数不一,在染色体的同一座位重复序列拷贝数不同;包括俩种类型：小卫星序列（VNTR）、微卫星序列(SSR）->单核苷酸多态性（SNP）SNP是指同一物种不同个体基因组DNA的等位序列上单个核苷酸存在差异的现象。
其中最少一种在群体中的频率不小于1％；如果出现频率低于1％，则视作点突变。
7.序列间隙：因覆盖率的原因而留下的未能测序的序列，仍存在于克隆文库中, 这类间隙称为序列间隙。
物理间隙：因克隆载体自身的限制或DNA顺序特殊的组成等原因造成某些序列丢失或未能克隆, 这类间隙称为物理间隙。
基因组学期末复习课后习题
基因组学期末复习课后习题1.为什么RNA不能成为主要的遗传信息载体？RNA分子在细胞自然生理状态条件下很容易断裂，因此长度有限，不能储存大量遗传信息。
此外，RNA复制酶缺少校读机制，不能及时消除复制时产生的错配碱基，很容易积累突变。
RNA分子的胞嘧啶残基脱氨基可生成尿嘧啶，这种自发突变产生的尿嘧啶很难与RNA分子中正常的尿嘧啶加以区分。
此外，现存生物细胞中缺少RNA分子突变修复机制。
2.什么是序列复杂性？如何计算序列复杂性？序列复杂性是指基因组中单拷贝的DNA序列为单一序列，多拷贝的DNA序列为重复序列，不同序列的DNA总长为复杂性。
在DNA浓度确定时，c0t1/2值表示不同序列的总长，即复杂性的程度，一般以碱基对bp表示。
通常以大肠杆菌基因组的单一序列为标准，在相同的复性条件下计算其他基因组的复杂性。
3.假基因能否表达？为什么？假基因相对于原来的功能基因而言失去正常功能，但是它可能产生了新的功能。
随着基因组数据的积累，现在已知有不少假基因仍然保持转录活性，特别是起源于重复基因的假基因和获得启动子的加工的假基因。
假基因的表达产物已失去原有功能，如产生残缺蛋白质。
有些假基因在进化过程中产生了新的功能。
4.低等生物与高等生物基因组组成有何差别？为什么会产生这些差别？低等生物与高等生物基因组组成的差别可以从生物进化的角度来解释。
随着生物进化的发展，核膜的出现和细胞器的复杂程度的增高等因素，导致了低等生物与高等生物基因组组成的差别。
5.有哪些异常结构基因？举例说明。
重叠基因是指编码序列彼此重叠的基因，含有不同蛋白质的编码序列。
例如，人类核基因组INK4a/ARF座位有2个蛋白质产物p16和p19，它们利用同一座位的不同启动子，第一个外显子不同，但共享第二和第三个外显子，产生两个不同读框的mRNA。
巢式基因（基因内基因）是指一个完整的基因包含在另一个基因的内部。
例如，线虫基因组中一个编码甘氨酸合成酶的基因FGAM有21个内含子，内含子9中含有一个独立的基因，内含子11中含有4个独立的基因。
基因组学复习资料整理
基因组学1. 简述基因组的概念和其对生命科学的影响。
基因组：指一个物种的全套染色体和基因。
广义的基因组：核基因组，线粒体基因组，叶绿体基因组等。
基因组计划对生命科学的影响：①研究策略的高通量，彻底认识生命规律：基因组研究高通量，研究手段和研究策略的更新，加强了生命科学研究的分工与协作，从不同层次深入研究生命现象。
②促进了相关学科的发展：分子生物学遗传学生物信息学生物化学细胞生物学生理学表观遗传学等③物种的起源与进化：Ⅰ.重要基因的发掘、分离和利用：遗传疾病相关基因，控制衰老的基因，工业价值的细菌基因，重要农艺性状基因等。
Ⅱ.充分认识生命现象：基因的表达、调控，基因间的相互作用，不同物种基因组的比较研究，揭示基因组序列的共性，探讨物种的起源和进化。
④伦理学法律问题：伦理问题，知识产权问题，法律问题，社会保险问题。
2. Ac/Ds转座因子Ac因子有4563bp，它的大部分序列编码了一个由5个外显子组成的转座酶基因，成熟的mRNA有3500bp。
该因子本身的两边为11bp的反向重复末端（IR），发生错位酶切的靶序列长度8bp。
Ds因子较Ac因子短，它是由Ac因子转座酶基因发生缺失而形成的。
不同的Ds因子的长度差异由Ac因子发生不同缺失所致。
Ac/Ds因子转座引起的插入突变方式：玉米Bz基因是使糊粉层表现古铜色的基因，当Ac/Ds转座插入到Bz基因座后，糊粉层无色。
当Ac/Ds因子在籽粒发育过程，部分细胞发生转座，使Bz靶基因发生回复突变，从而形成斑点。
Ac/Ds两因子系统遗传特点：1）Ac具有活化周期效应，有活性的Ac+因子被甲基化修饰后会形成无活性的ac-因子，反之无活性的ac-因子去甲基化成有活性的Ac+因子。
2）Ac与Ds因子有时表现连锁遗传但更多表现独立遗传。
3）Ac对Ds的控制具有负剂量效应。
4）Ac/Ds可引发靶基因表现为插入钝化、活性改变、表达水平改变和缺失突变等。
5）Ds的结构不同，插入同一靶基因的位点可能不同，形成的易变基因的表型也不同。
基因组学考点复习
基因组学考点复习第一章绪论1.基因组学的发展历史和现状（人类基因组计划HGP）答:人类基因组计划与20世纪80年代中期开始酝酿，1989年美国正式资助，2000年6月宣布完成人类基因草图。
人类基因组计划是一项世界范围的科研项目，有六个国家16个单位参加，中国是其中之一。
人类基因组测序计划原定于2003年结束，由于采取一些新的技术提前3年完成。
国际人类基因组测序联合体公布的人类基因组草图覆盖了整个基因组的86.8%，包括常染色质区域的97%。
截止2012.1.31，国际上已完成的和正在进行的基因组测序计划共12251个，包括真核生物，真细菌和古细菌。
2.基因组学的研究内容答:Genomics: The studies of the structure and function of genomes.Structure and sequence of genomes;Function of genomics;Applied genomics.3.什么是基因组Genome、转录组和蛋白质组答：Genome：The entirety of an organism's hereditary information. It is encoded either in DNA or, for many types of virus, in RNA. 转录组：RNA copies of the active protein-coding genes。
蛋白质组：The cell’s repertoire of proteins第二章遗传作图1.遗传作图的分子标记类型（RFLP、STR/VNTR/Microsatellite、SNP）、分布特征和作图方法答：RFLP：Restriction fragment length polymorphisms, 限制性片段长度多态性；VNTR：小卫星序列STR:微卫星序列SNP：单核苷酸多态性single nucleotide polymorphisms 2.卫星、小卫星、微卫星的区别答：卫星的组成单位是短碱基序列，卫星序列位于染色体的异染色质区；小卫星在染色体上分布于常染色质区；微卫星重复单位仅2-5bp，也位于常染色质区。
基因组学期末复习资料
第一章基因组概论1、基本概念隔裂基因：大多数真核生物蛋白质基因的编码顺序(Exon)都被或长或短的非编码顺序(Intron)隔开。
重叠基因/嵌套基因：指调控具有独立性但部分使用共同基因序列的基因/同一段DNA 能携带两种不同蛋白的信息.假基因：一般由先前的功能基因积累突变形成，称为假基因，用符号Ψ表示。
基因家族：真核基因组中有许多来源相同、结构相似、功能相关的基因，这组基因称为基因家族。
基因组：一个物种的一套完整遗传物质的总和，包括核基因组和细胞质基因组。
基因组学：研究生物体基因组的组成、结构与功能的学科。
结构基因组学：着重研究基因组的结构并构建高分辨的遗传图、物理图、序列图和转录图以及研究蛋白质组成与结构的学科。
功能基因组学：主要是利用结构基因组学研究所得到的各种信息在基因组水平上研究编码序列及非编码序列生物学功能的学科。
人类元基因组：指人体内共生的菌群基因组的总和，包括肠道、口腔、呼吸道、生殖道等处菌群。
Alu序列：灵长类动物细胞的主要散在的重复DNA序列。
含有限制性内切酶Alu的切点（AG↓CT）。
2、原核与真核生物基因组与顺反子的等价关系在简单基因组中基因与顺反子等价原核和低等真核细胞：基因与产物之间的关系比较简单。
通常是一基因一相应产物，而且基因往往与产物共线性。
基因和顺反子等价：基因是遗传的功能单位；也是可表达的遗传信息的单位。
在细菌中：基因是编码区(开放阅读框)。
细菌基因常常组合成一个操纵子，这样几种产物均由一条多顺反子mRNA翻译而成。
在真核细胞中：基因是转录的单位。
大多数基因以单顺反子mRNA的形式转录。
3、基因组C值与C值矛盾基因组C值是一个物种的基因组固有的DNA含量，一般是恒定的。
C值矛盾或C值悖论:C值大小与生物进化不协调的现象。
C值矛盾原因: 基因内(内含子)、基因间的间隔序列、重复序列和假基因序列4、基因组序列复杂性与基因组大小的关系①序列复杂性：不同序列的DNA总长。
基因组学,复习
“基因组学”精要第1章 基因组学概论基因组学：研究基因组的组成与功能的生物学分支学科结构基因组学：以全基因组测序为目标的基因结构研究，通过基因组作图、可算序列分析来确定基因组成、基因定位的科学。
功能基因组学：利用结构基因组学提供的信息，以高通量大规模实验方法，及统计与计算机分析为特征，全面系统地分析全部基因功能学科1、简述基因组学研究的意义？a)基因组学已经成为现代生命科学的核心领域，催生了许多新兴的生命科学的分支学科与交叉学科，如功能基因组学、进化基因组学等；b)基因组结构域功能的解读可为医学、健康、农业、林业、畜牧业与医药工业的发展和技术创新提供理论依据。
c)基因组学的研究涉及众多领域，尤其是在人类疾病基因的研究，发挥了十分重要的作用。
d)疾病的遗传学基础；e)对于致病基因及相关基因的克隆在基因组学研究中占据着核心的位置；f)对疾病的预防、诊断、治疗都有重要意义。
第2章 遗传图绘制遗传作图：采用遗传学分析方法，将基因或其他DNA分子标记标定在染色体上构建遗传连锁图的作图方法。
物理作图：采用分子生物学技术，直接将DNA分子标记、基因或克隆标定在基因组的实际位置所构建位置图的作图方法。
1、简述构建遗传图谱的基本原理？2、为何要绘制遗传图与物理图？1)基因组太大,必需分散测序,然后将分散的顺序按原来位置组装,需要图谱进行指导。
2)基因组存在大量重复顺序,会干扰排序,因此要高密度基因组图。
3)遗传图和物理图各有优缺点,必须相互整合校正。
3、简述DNA标记的类型及其特点？①限制性片段长度多态性标记（RFLP）：a.处于染色体上的位置相对固定；b.同一亲本及其子代相同位点上的多态性片段特征不变；c.同一凝胶电泳可显示同一位点的不同多态性片段，具有共显性特点。
②简单序列长度多态性（SSLP）：多等位性，每个SSLP都有多个长度不一的变异体。
包括可变串联重复（VNTR）也叫小卫星序列，和简单串联重复序列（SSR）也叫微卫星序列。
基因组学复习资料
基因组学复习资料基因组学复习资料名词解释1.蛋白质基序：由2或3个二级结构如α-螺旋，β-折叠和转环构成的组合，它们有特征性的序列，具有特定的功能，称为基序或模体。
2.C 值(C value)：是指一个单倍体基因组中DNA的总量，一个特定的种属具有特征的C值。
3. C值悖理(paradox) 生物的复杂性与基因组的大小并不完全成比例增加的现象.4.遗传作图（genetic mapping）：采用遗传学分析方法将基因或其他DNA顺序标定在染色体上构建连锁图。
这一方法包括杂交实验和家系分析。
基因或DNA标志在染色体上的相对位置与遗传距离。
遗传距离用重组率来衡量。
即通过计算两个连锁的遗传标记在每次减数分裂中的重组概率，确定两者的相对距离遗传图距单位为 cM，每单位厘摩定义为1%交换值5.物理作图（physical mapping）:采用分子生物学技术直接将DNA分子标记、基因或克隆标定在基因组实际位置。
物理图的距离依作图方法而异，辐射杂种作图的计算单位为厘镭（cR），限制性片段作图与克隆作图的图距单位为DNA的分子长度，即碱基对。
6.重组热点（recombination hot spot）：染色体的某些位点之间比其他位点之间有更高的交换频率，被称为重组热点。
7.基因组测序覆盖面（coverage）:随机测序获得的序列总长与单倍体基因组序列总长之比，覆盖面越大，遗漏的序列越少。
8.密码子偏爱(codon bias)：生物有时更加偏爱地使用一个或者一组密码子的现象。
这是在进化过程中基因复制的差异所产生的结果。
（仅供参考）9.开放读框（open reading frame ORF）它们由一系列指令氨基酸的密码子组成，有一个起始点和一个终止点。
10.功能域或外显子洗牌（domain shuffling or exon shuffling）由不同基因中编码不同结构域的片段彼此连接形成的全新编码序列称为功能域或外显子洗牌。
基因组学复习资料整理(word文档良心出品)
基因组学1. 简述基因组的概念和其对生命科学的影响。
基因组：指一个物种的全套染色体和基因。
广义的基因组：核基因组，线粒体基因组，叶绿体基因组等。
基因组计划对生命科学的影响：①研究策略的高通量，彻底认识生命规律：基因组研究高通量，研究手段和研究策略的更新，加强了生命科学研究的分工与协作，从不同层次深入研究生命现象。
②促进了相关学科的发展：分子生物学遗传学生物信息学生物化学细胞生物学生理学表观遗传学等③物种的起源与进化：Ⅰ.重要基因的发掘、分离和利用：遗传疾病相关基因，控制衰老的基因，工业价值的细菌基因，重要农艺性状基因等。
Ⅱ.充分认识生命现象：基因的表达、调控，基因间的相互作用，不同物种基因组的比较研究，揭示基因组序列的共性，探讨物种的起源和进化。
④伦理学法律问题：伦理问题，知识产权问题，法律问题，社会保险问题。
2. Ac/Ds转座因子Ac因子有4563bp，它的大部分序列编码了一个由5个外显子组成的转座酶基因，成熟的mRNA有3500bp。
该因子本身的两边为11bp的反向重复末端（IR），发生错位酶切的靶序列长度8bp。
Ds因子较Ac因子短，它是由Ac因子转座酶基因发生缺失而形成的。
不同的Ds因子的长度差异由Ac因子发生不同缺失所致。
Ac/Ds因子转座引起的插入突变方式：玉米Bz基因是使糊粉层表现古铜色的基因，当Ac/Ds转座插入到Bz基因座后，糊粉层无色。
当Ac/Ds因子在籽粒发育过程，部分细胞发生转座，使Bz靶基因发生回复突变，从而形成斑点。
Ac/Ds两因子系统遗传特点：1）Ac具有活化周期效应，有活性的Ac+因子被甲基化修饰后会形成无活性的ac-因子，反之无活性的ac-因子去甲基化成有活性的Ac+因子。
2）Ac与Ds因子有时表现连锁遗传但更多表现独立遗传。
3）Ac对Ds的控制具有负剂量效应。
4）Ac/Ds可引发靶基因表现为插入钝化、活性改变、表达水平改变和缺失突变等。
5）Ds的结构不同，插入同一靶基因的位点可能不同，形成的易变基因的表型也不同。
基因组学-Genomics-知识考点汇总
基因组学-Genomics-知识考点汇总•基因组（Genome：Gene＋chromosome）细胞或生物体中一套完整的单倍体遗传物质•基因组学（Genomics）最早Thomas Roderick在1986年提出，包括基因组作图、测序和分析。
可分为结构基因组学和功能基因组学。
一、结构基因组学1.遗传图(Genetic Mapping Genomes) : Based on the calculation of recombination frequencyby linkage analysis .通过亲本的杂交，分析后代的基因间重组率，并用重组率来表示两个基因之间距离的线形连锁图谱每条染色体组成一个连锁群，所有染色体的连锁群组成的图谱即构成基因组遗传图。
重组率代表基因位点之间的相对距离。
在遗传作图中，人们把一个作图单位定义为1厘摩（cM），1cM等于1%的重组率。
提高遗传作图的分辨率：选用不同的杂交群体；增加杂交群体的数目；增加分子标记的数目；扩大分子标记的来源分子标记：绘制基因组遗传图需要的坐标点。
分子标记的主要来源是染色体上存在的大量等位基因。
在DNA水平上，两个基因间一个碱基的差异就足以形成等位基因。
2.物理图（physical map）：指DNA序列上两点的实际距离，它是以DNA的限制酶片段或克隆的大片段的基因组DNA分子为基本单位，以连续的重叠群为基本框架，通过遗传标记将重叠群或基因组DNA分子有序排列于染色体上。
物理图的绘制: Based on molecular hybridization analysis and PCR techniques杂交法；指纹法；荧光原位杂交技术。
3.基因组序列测定: Sequencing methods: the chain termination procedure;Map-based clone by clone strategy;Whole genome shotgun (WGS) strategy;Sequence assembly;•传统基因组测序的方法：克隆步移法（BAC-by-BAC Strategy）和全基因组鸟抢法（Whole Genome Shotgun Strategy）。
基因组学复习资料
为什么说基因组学是生命科学的前沿学科？基因组学已成为生命科学的前沿学科，已渗透到各个科学领域，出现了结构基因组学，功能基因组学，蛋白组学，功能蛋白组学，功能酶学，生物信息学，生物计算机，药物基因组学，疾病基因组学等基因研究方向。
1、启动子：细菌中RNA聚合酶结合并启动转录的DNA序列。
2、转录因子：是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。
3、RNA聚合酶：是能够特异性地与启动子结合并启动转录的蛋白质。
4、转录因子（transcription factor，TF）：是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。
按功能可分为两类： 1.普遍性转录因子（general transcription factor）是转录起始复合物的组成成员，将RNA聚合酶定位在核心启动子上。
2.激活转录因子：对转录起始复合物的组装及转录速率施加影响，决定某一基因是否表达。
5、RNA编辑（RNA editing）:改变原有mRNA碱基序列组成的修饰。
有两种方式：①将mRNA分子中某些碱基进行代换，使原有mRNA密码子的含义发生改变②在mRNA分子内部插入某些核苷酸，使mRNA原有的读码框发生大范围的改变6、转录物组（transcriptome）:基因组在整个生命过程中所表达的全部转录物的总和。
7、翻译（translation）:按照mRNA密码子的排列顺序在核糖体上依次连接对应氨基酸合成多肽链的过程。
8、密码子摆动性（wobble）:密码子的第3个碱基选择不同碱基配对的现象。
出现的原因：反密码子位于环化的tRNA序列内，是反密码子的第一个核苷酸与密码子第三个核苷酸不能形成标准的碱基配对。
9、密码子（codon）:mRNA分子中每相邻的三个核苷酸编成一组，在蛋白质合成时，代表一种氨基酸。
61个氨基酸密码子，3个终止密码子。
10、移码（frame shift）：如果翻译时出现反密码子与正密码子的配对间断或重叠，将改变后续的编码信息，这一现象称为移码。
福建农林大学基因组学复习材料
第一章1．什么是基因组？基因组是一种生物所拥有的整套遗传物质，它包含该生物的全部遗传信息。
2．基因组学研究内容、分支、特点基因组学研究内容：疾病基因组学研究、药物基因组学、环境基因组学、蛋白质组学、模式生物和病原生物基因组学、基因开发研究分支：结构基因组学，比较基因组学，功能基因组学基因组研究的特点：基因组学是一门关于基因组图、测序和基因组分析的学科。
与传统的遗传学比较，基因组学具有全局性、高效性、综合性和先进性的特点。
1 全局性（Overall, genome-wide）：以整个基因组为研究对象，而非具体到单个特定的基因。
2 高效性（High-throughput）：研究方法是平行的、高通量的，一次试验可产生大量的数据。
1 综合性：需要多学科的合作，包括生物学、化学、统计学、机械技术、电子技术、信息技术等。
2 先进性：将现有各种最先进的技术应用到极至，同时也推动了各种技术的高速发展。
3．人类基因组计划诺贝尔奖获得者Dulbecco：“人类DNA序列是人类的真谛，这个世界发生的一切，均与DNA序列息息相关”（1986）；90年启动的国际性研究计划；利用大规模测序技术，完成全部人类数万个基因，30亿对碱基的序列分析4. 人类基因组进化的意义人类基因组计划对生命科学的研究和生物产业的发展具有非常重要的意义，它为人类社会带来的巨大影响是不可估量的。
首先，获得人类全部基因序列将有助于人类认识许多遗传疾病以及癌症等疾病的致病机理，为分子诊断、基因治疗等新方法提供理论依据。
第二，破译生命密码的人类基因组计划有助于人们对基因的表达调控有更深入的了解。
最后，人类基因组图谱对揭示人类发展、进化的历史具有重要意义。
第二章1．遗传作图、物理作图概念、意义遗传作图(genetic mapping)：采用遗传学分析方法将基因或其他DNA 分子标记标定在染色体相对位置上构建连锁图。
物理作图（physical mapping）:采用分子生物学技术直接将DNA分子标记、基因或克隆标定在基因组的实际位置所构建的位置图。
基因组学复习题精编版
基因组学复习题文件编码（008-TTIG-UTITD-GKBTT-PUUTI-WYTUI-8256）第1章1)什么是C-值悖理什么是N-值悖理C-值悖理：生物基因组的大小同生物进化所处地位的高低无关的现象。
N-值悖理：基因数目与进化程度或生物复杂性的不对应性，称之为N值悖理2)什么是序列复杂性基因组中不同序列的DNA总长，用bp 表示。
3)RNA分子有哪些种类mRNA tRNA rRNA scRNA snRNA snoRNA 小分子干扰RNA4)不编码蛋白质的RNA包括哪些类型tRNA rRNA scRNA snRNA snoRNA 小分子干扰RNA5)什么是假基因假基因是如何形成的来源于功能基因但已失去活性的DNA序列，有沉默的假基因，也有可转录的假基因。
产生假基因的原因有很多，如编码序列出现终止密码子突变，或者插入和缺失某些核苷酸使mRNA移码，造成翻译中途停止或者异常延伸，合成无活性的蛋白质。
6)假基因能否表达为什么能，假基因相对于原来的基因已经失去功能但是可能产生新的功能。
最初人们认为, 假基因是不能转录的基因, 随着基因组数据的积累, 现在已知有不少假基因仍然保持转录的活性, 特别是起源于重复基因的假基因和获得启动子加工的假基因，但假基因的转录产物已失去原有的功能, 如产生残缺蛋白质。
7)如何划分基因家族什么是超基因家族基因家族：将来自共同的祖先，因基因加倍或变异产生了许多在DNA序列组成上基本一致而略有不同的成员划分为一个基因家族。
超基因家族：起源于共同祖先，由相似DNA序列组成的许多基因亚家族或相似的基因成员构成的群体，它们具有相似的功能。
8)低等生物与高等生物基因组组成有何差别为什么会产生这些差别低等生物：1)结构紧凑，一般不存在内含子（古细菌除外）；2)大小在5 Mb以下；3)缺少重复序列；4)很少非编码序列。
高等生物：1)结构松弛，含有大量重复序列；2）基因大多为断裂基因，由内含子和外显子构成；3)由线性DNA与蛋白质组成染色体结构； 4)含有细胞器基因组。
基因组学复习资料
基因组学复习资料基因组学复习资料为什么说基因组学是生命科学的前沿学科？基因组学已成为生命科学的前沿学科，已渗透到各个科学领域，出现了结构基因组学，功能基因组学，蛋白组学，功能蛋白组学，功能酶学，生物信息学，生物计算机，药物基因组学，疾病基因组学等基因研究方向。
基因组学形成和发展的科学技术基础？基因组学有哪些特点?1).可能性；2）整体性；3）大科学性（复杂性）；4）原创性；5）前沿性；6）竞争性；7）自动化，程序化（标准化），规模化，快速化，产业化。
为什么基因组DNA测序能发现许多新基因？基因组研究已取得那些重要进展？基因组：所有生命都具有指令其生长与发育，维持其结构与功能所必需的遗传信息，生物所具有的携带遗传信息的遗传物质总和称为基因组。
基因组学：是研究生命体全部遗传信息的一门学科。
模式生物：反向遗传学：为什么要在基因组水平上研究生命现象/为什么线粒体基因组大小在不同生物中变化大，而叶绿体基因组大小相对稳定？有什么证据支持细胞器起源的的内共生假说？人类基因组顺序已经完成，但编码蛋白质基因的准确数仍存在不同的看法，为什么？染色体组：不同真核生物核基因组均由一定数目的染色体组成，单倍体细胞所含有的全套染色体。
C值：指一个单倍体基因组中DNA的总量，一个特定的种属具有特征的C值。
CpG岛：基因组中富含GC（60%—70%）的DNA区段，一般长度为1—2kb。
支架附着区（SAR）：从致密的蛋白质骨架向外伸展的DNA环与染色体骨架附着区结合的DNA顺序成为SAR。
基质附着区（MAR）：从致密的蛋白质骨架向外伸展的DNA环与核基质结合的DNA顺序称为MAR。
核型：将中期染色体按照大小与着丝粒的位置依次排列，可组成每种生物特有的染色体组图像，称为核型。
转座子：转座子是基因组中一段可移动的DNA顺序，可以通过切割、重新整合等一系列过程从基因组的一个位置“跳跃”到另一个位置。
人类基因组计划中为什么要构建遗传图？人类基因组中有30亿个碱基对，含有大量重复序列，要在这样大的序列中确定某一基因的位置，如同大海捞针。
基因组学考试资料 整理版
第一章一、基因组1、基因组（genome）：生物所具有的携带遗传信息的遗传物质的总和,是指生物细胞中所有的DNA，包括所有的基因和基因间区域。
2、基因组学：指以分子生物学技术、计算机技术和信息网络技术为研究手段，以生物体内全部基因为研究对象，在全基因背景下和整体水平上探索生命活动的内在规律及其内外环境影响机制的科学。
基因组学包括3个不同的亚领域结构基因组学(structural genomics) ：以全基因组测序为目标功能基因组学(functional genomics)：以基因功能鉴定为目标比较基因组学(comparative genomics)二、基因组序列复杂性1、C值是指一个单倍体基因组中DNA的总量，以基因组的碱基对来表示。
每个细胞中以皮克(pg，10-12g)水平表示。
C 值悖理（矛盾）（C-value paradox)：在结构、功能很相似的同一类生物中，甚至在亲缘关系十分接近的物种之间，它们的C值可以相差数10倍乃至上百倍。
C值反映了总体趋势上，随着生物结构和功能的复杂性的增加，各分类单元中最小基因组的大小随分类地位的提高而递增。
2、序列复杂性单一顺序：基因组中单拷贝的DNA序列重复顺序：基因组中多拷贝的基因序列真核生物基因组DNA组分为非均一性，可分为3种类型：快速复性组分、居间复性组分、缓慢复兴组分三、基因与基因家族1、基因家族：是真核基因组的共同特征，他们来自一个共同的祖先，因基因加倍和趋异，产生了许多在DNA序列上基本一致而略有不同的成员。
包括编码RNA的基因和编码蛋白质的基因2、隔裂基因（split gene）：指基因内部被一个或更多不翻译的编码顺序即内含子所隔裂。
3、异常结构基因分类重叠基因：编码序列彼此重叠的基因，含有不同蛋白质的编码序列。
基因内基因:一个基因的内含子中包含其他基因。
反义基因: 与已知基因编码序列互补的的负链编码基因，参与基因的表达调控，可以干扰靶基因mRNA转录与翻译。
基因组学复习题终极版.doc
基因组学复习题终极版。
1 .根据您的理解,我们在未来将面临基因组学方面的主要挑战是什么？1.1表征人类基因组的结构和功能1.2更好地理解人类基因组中可遗传的遗传变异的知识1.3应用基因和代谢途径的新知识来开发人类疾病治疗的新有效方法1.4解释不同物种间进化和变异的机制1.5克隆和表征作物中的关键功能基因1.6使用基因组学工具来提高作物产量和解决世界粮食危机2 .脱氧核糖核酸作为遗传物质的优势是什么？2.1。
脱氧核糖核酸包含大量信息2.2 .互补碱基对确保精确复制2.3 .在水中的高稳定性3 .脱氧核糖核酸的功能如何优于核糖核酸？两者都可以作为遗传物质；许多病毒使用核糖核酸作为它们的遗传物质。
脱氧核糖核酸可能是作为细胞的遗传物质进化而来的,因此核糖核酸可以作为信使核糖核酸,把蛋白质合成的信息传递给核糖体。
这种基因在代谢上是不稳定的,因为它会被核糖核酸酶迅速分解。
脱氧核糖核酸必须是稳定的,核糖核酸必须进化才能完成这一功能。
脱氧核糖核酸和核糖核酸有相同的编码能力。
它们都是具有相似潜在长度的聚合物。
普遍存在于所有生物体内的脱氧核糖核酸,但与核糖核酸并不相同。
有些病毒是异常的,因为-省略部分-e特异性表达,使用转基因技术改变其原始表达组织。
因此,该基因将显示异位表达现象。
外切表达可以使某些性状在新的组织中出现。
因此,可以在此基础上推断基因的功能。
使用组成型启动子可以同时引起过表达和外切表达31 .请简单描述微阵列方案。
机器人将探针脱氧核糖核酸的微小斑点印在阵列上。
将两个样品（测试和参考)的mRNA转化为cDNA，用两种不同的荧光染料（例如cy3和cy5)标记,并允许与阵列杂交。
杂交后,在两种染料独立激发后,用共聚焦激光装置扫描微阵列,以获得两种波长的荧光发射。
测试样品与参考样品中每个基因的相对丰度由相应阵列元件发射的荧光所测量的绿/红比率来反映。
图像分析软件用于确定荧光强度,以便对阵列上所有基因的测试样本和参考样本进行定量比较32 .什么是蛋白质组及其目的？蛋白质组指细胞中所有蛋白质的总和。
基因组学与蛋白质组学复习要点(答案)
一、名词：Gene遗传学概念：基因是世代相传的，基因决定了遗传性状的表达，基因的颗粒性主要表现在世代相传的行为和功能表达上具有相对的独立性，基因呈直线排列在染色体上。
分子生物学概念：合成有功能的蛋白质或RNA所必需的全部DNA（部分RNA病毒除外），即一个基因不仅包括编码蛋白质或RNA的核酸序列，还应包括为保证转录所必需的调控序列。
genome细胞或生物体中，一套完整单体的遗传物质的总和，即某物种单倍体的总DNA。
对于二倍体高等生物来说，其配子的DNA总和即一组基因组，二倍体有两份同源基因组。
Protein生物体中广泛存在的一类生物大分子，由核酸编码的α氨基酸之间通过α氨基和α羧基形成的肽键连接而成的肽链，经翻译后加工而生成的具有特定立体结构的、有活性的大分子。
Proteome(1)由一个基因组所表达的全部相应的蛋白质。
(2)在一定条件下，存在于一个体系（包括细胞、亚细胞器、体液等）中的所有蛋白质。
exon外显子(expressed region)是真核生物基因的一部分，它在剪接(Splicing)后仍会被保存下来，并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质古细菌定义1：常生活于热泉水、缺氧湖底、盐水湖等极端环境中的原核生物。
具有一些独特的生化性质，如膜脂由醚键而不是酯键连接。
在能量产生与新陈代谢方面与真细菌有许多相同之处，而复制、转录和翻译则更接近真核生物。
古核生物与真核生物可能共有一个由真细菌的祖先歧化而来的共同祖先。
所属学科：生物化学与分子生物学（一级学科）；总论（二级学科）定义2：现今最古老的生物群，为地球原始大气缺氧时代生存下来的活化石。
为单细胞生物，无真正的核，染色体含有组蛋白，RNA聚合酶组成比细菌的复杂，翻译时以甲硫氨酸为蛋白质合成的起始氨基酸，细胞壁中无肽聚糖，不同于真细菌，核糖体蛋白与真核细胞的类似。
许多种类生活在极端严酷的环境中。
与真核生物、原核生物并列构成现今生物三大进化谱系。
基因组学复习参考
基因组学复习参考（个人见解）1、原核与真核生物基因组在结构与进化上的异同（古细菌也要留意）2、遗传图、物理图的绘制方法3、什么是重复序列？重复序列的种类有哪些（包括原核与真核生物）？4、DNA测序的基本方法有酶法（桑格法）、化学法两种，描述其原理，解释两种方法的化学反应原理。
（可绘图）5、全基因组序列的测定方法有两种：散弹法和逐个克隆测定法。
以细菌基因组（水稻基因组等）为例，解释测定全基因组DNA序列的基本过程和基本原理。
6、近年来蛋白质组学有哪些主要研究方法？它们的基本原理是什么？7、表观遗传学的定义、包括哪些内容、研究方法8、转录组的定义、研究的基本方法和实验原理9、列举第二代测序仪的种类及基本测序原理？10、全基因组关联性研究和研究的基本方法？（GW AS）这些是基因组学中比较重要的十大问题。
其余还有1、列举几种已经测定序列的生物基因组（如人类、小鼠、鸡、水稻、家蚕和果蝇等）2、SNP、EST、LGT、VGT、RNA-Seq、酵母双杂交、SAGE、RT-PCR\GC含量、宏基因组、泛基因组等概念3、分子生物学相关问题：RNA的剪切的几种形式，生物获得新基因的基本途径，非编码RNA的种类与功能，DNA的修复，组蛋白修饰等4、细胞生物学相关问题：肿瘤细胞特征及肿瘤发生关键因素，线粒体、叶绿体特点及起源5、生物信息学相关问题：常用的生物信息学数据库及序列比对常用的软件和其特点，基因识别的常用软件和原理6、基因工程相关问题：基因组文库构建与常见载体等下面是咱们所基因组学的考试大纲还有历年基因组学试题，大家可以参考一下，希望对大家复习有所帮助。
中国科学院北京基因组研究所研究生入学考试《基因组学》考试大纲一、考试内容1.基因组导论考试内容●基因组学的研究对象和发展历程●基因在DNA水平、RNA和蛋白质水平的定义●基因组的定义和基因组的分类●基因学研究的基本内容●基因组学研究的基本技术与方法考试要求●了解基因组研究的基本对象、内涵和最新进展●了解基因的结构单元、功能单元和表型单元●了解基因组研究的基本方法：物理图谱的制作、DNA测序和注释●理解基因组组分变化的基本参数：GC含量、GC-skew、嘌呤含量●掌握基因组重复序列的分类（包括原核生物和真核生物）2．遗传密码与基因组的进化考试内容●遗传密码的发现●遗传密码的排列和内容导向的排列●RNA世界假说●遗传密码的进化●GC含量变化与密码子的动态关系考试要求●记忆密码子表的密码子和氨基酸的排列●简述遗传密码中密码子排列的规律和基本关系●解释什么是RNA世界和了解细胞器的起源●举例解释密码子进化的假说●解释密码子或氨基酸变化与DNA组分动态变化的关系（原核生物基因组）3．微生物基因组学考试内容●真细菌基因组●古细菌基因组●极端环境微生物基因组●单细胞真核基因组●宏基因组考试要求●全面了解真细菌基因组的结构和复制起始位点●全面了解古细菌基因组的结构和复制起始位点●了解细菌基因组的重复序列和极端环境微生物基因组的特点●全面了解横向转移的发生和对细菌基因组进化的意义●了解酵母基因组的大小和染色体的数量4. 脊椎动物基因组学考试内容●目前已经测定的脊椎动物基因组有哪些●灵长类基因组间的差异●哺乳动物Y染色体的进化●脊椎动物2R假说的内容和根据●脊椎动物基因数量的增加和基因大小的增加考试要求●了解脊椎动物基因组中基因结构的特点●了解基因结构与重复序列的关系●列举种群特异的重复序列分类●了解脊椎动物基因组进化的基本动力●理解脊椎动物基因数量的概念4. 节肢动物基因组考试内容●昆虫基因组大小的变化范围和结构的特点●昆虫基因组重复序列与进化●节肢动物基因组结构与脊椎动物基因组的差异●昆虫基因组研究为模式生物研究提供了基本生物学基础●昆虫基因组研究与经典遗传学研究的关系考试要求●了解昆虫基因组重复序列的种类●了解昆虫基因组大小的变化●节肢动物基因组研究的进展有哪些●以昆虫为模式的生物学研究内容有哪些●了解利用昆虫为模式的遗传学研究5. 其他多细胞动物基因组和转录组研究考试内容●线虫基因组●转录组研究●非编码RNA●小RNA的种类和定义●表观遗传学和甲基化考试要求●了解线虫基因组和基因的结构特点●了解转录组研究的基本技术和方法●了解近年来非编码RNA和小RNA研究的进展●解释DNA甲基化和组蛋白修饰研究的方法6. 植物基因组考试内容●已经测序的植物基因组和植物基因组结构的特点●植物基因进化的原动力是基因组的重复（加倍）●植物基因组的共线性●杂交优势研究的理论●植物基因组研究的特点考试要求●了解植物基因组结构的特点●熟悉植物基因组中的重复序列●植物基因组多倍体与基因组进化的关系●了解植物家养化过程中基因的变化●了解植物杂交优势的分子机理研究●了解植物基因组研究的最新进展（有哪些基因组的全序列是已知的）7．人类基因能组研究考试内容●人类基因组计划（理由、计划与实施）●人类基因组计划的后续工作●癌症和常见疾病的研究方法●全基因组关联性（Whole Genome Association）研究●人类基因组与灵长类基因组的基本差异考试要求●了解人类基因组计划的历史●不同定义下人类基因组基因的数量●什么是SNP和HapMap计划●什么是全基因关联性研究和研究的基本方法●了解人类基因组研究的进展8. 基因组研究技术与方法考试内容●下一代基因组测序技术●基因测序技术的发展历史●发现和鉴定基因功能的方法●蛋白质组研究的基本方法和原理（如双向电泳和质谱）●蛋白质的功能域考试要求●市场上有哪些“下一代”测序仪？●解释“下一代”测序仪的基本技术原理●了解基因标签的研究方法和数据分析原理●简述鉴定蛋白的基本方法●分析蛋白质功能域的方法9. 基因组信息分析考试内容●基因组信息研究与数据库●基因表达数据分析与数据库●基因的组装和重复序列识别●基因识别●DNA序列的进化分析考试要求●了解国际主要数据库（如Genbank）和常用工具（如blast）●了解EST、序列标签（尤其是新一代测序仪产生的数据）和芯片数据等数据库的基本内容●了解基因组序列组装的基本原理●了解基因识别软件和原理（包括真核与原核生物基因组）●掌握DNA序列进化研究的基本方法和常用软件主要参考书目：序号/书名/作者/出版社/备注1）基因组III；T.A.布朗；袁建刚（译）；科学出版社。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
基因组学复习参考（个人见解）1、原核与真核生物基因组在结构与进化上的异同（古细菌也要留意）2、遗传图、物理图的绘制方法3、什么是重复序列？重复序列的种类有哪些（包括原核与真核生物）？4、DNA测序的基本方法有酶法（桑格法）、化学法两种，描述其原理，解释两种方法的化学反应原理。
（可绘图）5、全基因组序列的测定方法有两种：散弹法和逐个克隆测定法。
以细菌基因组（水稻基因组等）为例，解释测定全基因组DNA序列的基本过程和基本原理。
6、近年来蛋白质组学有哪些主要研究方法？它们的基本原理是什么？7、表观遗传学的定义、包括哪些内容、研究方法8、转录组的定义、研究的基本方法和实验原理9、列举第二代测序仪的种类及基本测序原理？10、全基因组关联性研究和研究的基本方法？（GW AS）这些是基因组学中比较重要的十大问题。
其余还有1、列举几种已经测定序列的生物基因组（如人类、小鼠、鸡、水稻、家蚕和果蝇等）2、SNP、EST、LGT、VGT、RNA-Seq、酵母双杂交、SAGE、RT-PCR\GC含量、宏基因组、泛基因组等概念3、分子生物学相关问题：RNA的剪切的几种形式，生物获得新基因的基本途径，非编码RNA的种类与功能，DNA的修复，组蛋白修饰等4、细胞生物学相关问题：肿瘤细胞特征及肿瘤发生关键因素，线粒体、叶绿体特点及起源5、生物信息学相关问题：常用的生物信息学数据库及序列比对常用的软件和其特点，基因识别的常用软件和原理6、基因工程相关问题：基因组文库构建与常见载体等下面是咱们所基因组学的考试大纲还有历年基因组学试题，大家可以参考一下，希望对大家复习有所帮助。
中国科学院北京基因组研究所研究生入学考试《基因组学》考试大纲一、考试内容1.基因组导论考试内容●基因组学的研究对象和发展历程●基因在DNA水平、RNA和蛋白质水平的定义●基因组的定义和基因组的分类●基因学研究的基本内容●基因组学研究的基本技术与方法考试要求●了解基因组研究的基本对象、内涵和最新进展●了解基因的结构单元、功能单元和表型单元●了解基因组研究的基本方法：物理图谱的制作、DNA测序和注释●理解基因组组分变化的基本参数：GC含量、GC-skew、嘌呤含量●掌握基因组重复序列的分类（包括原核生物和真核生物）2．遗传密码与基因组的进化考试内容●遗传密码的发现●遗传密码的排列和内容导向的排列●RNA世界假说●遗传密码的进化●GC含量变化与密码子的动态关系考试要求●记忆密码子表的密码子和氨基酸的排列●简述遗传密码中密码子排列的规律和基本关系●解释什么是RNA世界和了解细胞器的起源●举例解释密码子进化的假说●解释密码子或氨基酸变化与DNA组分动态变化的关系（原核生物基因组）3．微生物基因组学考试内容●真细菌基因组●古细菌基因组●极端环境微生物基因组●单细胞真核基因组●宏基因组考试要求●全面了解真细菌基因组的结构和复制起始位点●全面了解古细菌基因组的结构和复制起始位点●了解细菌基因组的重复序列和极端环境微生物基因组的特点●全面了解横向转移的发生和对细菌基因组进化的意义●了解酵母基因组的大小和染色体的数量4. 脊椎动物基因组学考试内容●目前已经测定的脊椎动物基因组有哪些●灵长类基因组间的差异●哺乳动物Y染色体的进化●脊椎动物2R假说的内容和根据●脊椎动物基因数量的增加和基因大小的增加考试要求●了解脊椎动物基因组中基因结构的特点●了解基因结构与重复序列的关系●列举种群特异的重复序列分类●了解脊椎动物基因组进化的基本动力●理解脊椎动物基因数量的概念4. 节肢动物基因组考试内容●昆虫基因组大小的变化范围和结构的特点●昆虫基因组重复序列与进化●节肢动物基因组结构与脊椎动物基因组的差异●昆虫基因组研究为模式生物研究提供了基本生物学基础●昆虫基因组研究与经典遗传学研究的关系考试要求●了解昆虫基因组重复序列的种类●了解昆虫基因组大小的变化●节肢动物基因组研究的进展有哪些●以昆虫为模式的生物学研究内容有哪些●了解利用昆虫为模式的遗传学研究5. 其他多细胞动物基因组和转录组研究考试内容●线虫基因组●转录组研究●非编码RNA●小RNA的种类和定义●表观遗传学和甲基化考试要求●了解线虫基因组和基因的结构特点●了解转录组研究的基本技术和方法●了解近年来非编码RNA和小RNA研究的进展●解释DNA甲基化和组蛋白修饰研究的方法6. 植物基因组考试内容●已经测序的植物基因组和植物基因组结构的特点●植物基因进化的原动力是基因组的重复（加倍）●植物基因组的共线性●杂交优势研究的理论●植物基因组研究的特点考试要求●了解植物基因组结构的特点●熟悉植物基因组中的重复序列●植物基因组多倍体与基因组进化的关系●了解植物家养化过程中基因的变化●了解植物杂交优势的分子机理研究●了解植物基因组研究的最新进展（有哪些基因组的全序列是已知的）7．人类基因能组研究考试内容●人类基因组计划（理由、计划与实施）●人类基因组计划的后续工作●癌症和常见疾病的研究方法●全基因组关联性（Whole Genome Association）研究●人类基因组与灵长类基因组的基本差异考试要求●了解人类基因组计划的历史●不同定义下人类基因组基因的数量●什么是SNP和HapMap计划●什么是全基因关联性研究和研究的基本方法●了解人类基因组研究的进展8. 基因组研究技术与方法考试内容●下一代基因组测序技术●基因测序技术的发展历史●发现和鉴定基因功能的方法●蛋白质组研究的基本方法和原理（如双向电泳和质谱）●蛋白质的功能域考试要求●市场上有哪些“下一代”测序仪？●解释“下一代”测序仪的基本技术原理●了解基因标签的研究方法和数据分析原理●简述鉴定蛋白的基本方法●分析蛋白质功能域的方法9. 基因组信息分析考试内容●基因组信息研究与数据库●基因表达数据分析与数据库●基因的组装和重复序列识别●基因识别●DNA序列的进化分析考试要求●了解国际主要数据库（如Genbank）和常用工具（如blast）●了解EST、序列标签（尤其是新一代测序仪产生的数据）和芯片数据等数据库的基本内容●了解基因组序列组装的基本原理●了解基因识别软件和原理（包括真核与原核生物基因组）●掌握DNA序列进化研究的基本方法和常用软件主要参考书目：序号/书名/作者/出版社/备注1）基因组III；T.A.布朗；袁建刚（译）；科学出版社。
2) 基因Ⅷ；本杰明·卢因；余龙、江松敏、赵寿元（译）；科学出版社。
中国科学院北京基因组研究所2006年招收攻读硕士学位研究生入学考试专业试题科目名称：基因组学科目代码：344考试时间：2006年1月15日上午8：30-11：30一、基本概念（50分）1．列举原核与真核生物基因在基本结构上的异同。
（5分）2．解释RT-PCR的基本原理与应用。
（5分）3．列举真细菌（eubacteria）DNA聚合酶的亚基和它们的基本功能。
（5分）4．列举十种已经测定序列的大型真核生物基因组（大于100Mb）。
（5分）5．解释什么是SNP及其应用。
（5分）6．人类、小鼠、鸡、水稻、家蚕和果蝇基因组的大小（用Mb表示）是多少？（5分）7．什么是DNA文库？制作DNA文库的载体有几种（根据插入片段的大小，至少列出三种以上）。
（5分）8．什么是重复序列？重复序列的种类有哪些（包括原核与真核生物）？（10分）9．举例说明什么是RNA选择剪切。
（5分）二、问答题（共100分）1．DNA测序的基本方法有酶法与化学法两种，请绘图解释两种方法的化学反应原理。
（10分）2．除mRNA和rRNA外，还有哪些有功能的RNA？它们在细胞里的基本功能如何？（20分）3．全基因组序列的测定方法有两种：散弹法和逐个克隆测定法。
以细菌基因组为例，解释测定全基因组DNA序列的基本过程和基本原理。
（10分）4．虚拟5个DNA序列，并用这些序列构建基因进化树。
你需要什么信息才能用这些序列算出进化的大致时间？（20分）5．简述在RNA水平上研究基因表达的基本方法（至少五种）和原理。
（20分）6．近年来蛋白质组学有哪些主要研究方法？它们的基本原理是什么？（10分）7．绘图解释基因组物理图谱的基本制作方法和过程（至少两种方法）（10分）科目名称：基因组学第1页共1页中国科学院北京基因组研究所2007年招收攻读硕士学位研究生入学统一考试专业试题科目名称：基因组学科目代码：714 考试时间：2007年1月21日上午8：30-11：30一、基本概念（共8题，共50分）1．解释PCR，RT-PCR，和定量PCR的基本原理与应用。
（10分）2．解释什么是EST，并简述其应用。
（5分）3．人类、鸡、拟南芥、水稻、家蚕和果蝇基因组的大小（用Mb表示）大约是多少？（5分）4．列出三种以上用于制作大片段DNA文库的载体（大于30Kb）。
（5分）5．细菌基因组有哪些种类的重复序列？举例说明。
（5分）6．人类基因组有哪些种类的重复序列？举例说明。
（10分）7．基因组的功能单元是基因，原核生物基因组获得新基因的重要途径是什么？（5分）8．真核生物获得基因的最基本途径是什么？（5分）二、问答题（共6题，共100分）1．DNA测序的基本方法有酶法（桑格法）、化学法和合成法（Sequence-by-synthesis）三种，请绘图解释三种方法的化学反应原理。
（15分）2．多细胞生物有几种非编码RNA，列举它们的种类和在细胞里的基本功能。
（25分）3．测定全基因组序列的方法有两种：散弹法和逐个克隆测定法。
以细菌基因组为例，解释测定全基因组DNA序列的基本过程和基本原理。
（10分）4．绘图解释用限制性内切酶制作基因组物理图谱的基本方法和过程。
（10分）5．基因组的大小是如何测定的？列举至少三种方法并说明原理。
（20分）6．列举可能的基因重复（Gene Duplication）种类。
重复发生后，两个功能相同的基因中会有一个自由变化，或在选择的压力下固定。
假如有一个RNA水解酶，在pH7时活性最高，那么在重复后（一个基因组里有两个拷贝）它会发生哪些可能的变化呢？（20分）科目名称：基因组学科目代码：714 第1页共1页中国科学院北京基因组研究所2008年招收攻读硕士学位研究生入学统一考试专业试题科目名称：基因组学科目代码：724 考试时间：2008年1月20日上午8：30-11：30一、基本概念（50分）1．列举你所知道的DNA序列比对分析工具。
（5分）2．原核生物基因组GC Skew的计算公式和基本意义是什么？（5分）3．人类基因组大约有多少基因？（5分）4．用YAC (Yeast Artificial Chromosomes) 系统制作DNA文库时，一般插入片段的长度是多少（范围即可，用Kb表示）？（5分）5．解释用DNA序列推断物种进化关系的原理。