全国细菌耐药监测网信息系统—附件
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全国细菌耐药监测网信息系统
数据上报标准(试用)
全国细菌耐药监测网通过“全国细菌耐药监测网信息系统”收集所有成员单位的耐药监测数据,系统具备完善的数据筛选和容错处理功能。
一、科室代码设置
监测网成员单位首次登录时须先在本院科室维护栏内登记注册医院临床科室并将其映射至系统所要求的标准科室分类上,科室代码为上报数据中DEPARTMENT字段中保存的代码,也可以设置成系统内置的标准科室代码,此代码可为数字代码、英文代码或中文名,最多允许15个字符(不区分中英文),设置后可随时增加和修改。上传的数据文件格式为Whonet 5.6的通用文件格式,后缀必需为“.dbf”(系统未来可能会支持Excel表格与Csv平面文本文件)。
二、数据文件各字段要求
1、来源ORIGIN
非必填字段,最长1个字符。若填写,则其必须为“h”,若不填写,数据上传后系统会自动补充,若填写值不为“h”,系统将自动替换成“h”。
2、国家COUNTRY_A
非必填字段,最长3个字符。若填写,则其必须为“CHN”,若未填写,数据上传后系统会自动补充。
3、医院INSTITUT
非必填字段,为卫生部统一分配的标准代码,标准6字符,前两位
为国家标准省级代码(如北京为11,云南为53等),后4位为各省编码(从0001开始),如昆明医科大学第一附属医院可能为(530001),若未填写,数据上传后系统自动补充已注册的医院标准代码,若填写则必须与本院的代码一致,否则系统会自动替换为正确代码,在数据上传时此字段不建议填值。
4、实验室LABORATORY
非必填字段,最长3个字符。系统不再将此作为医院标识,无具体格式要求,在数据上传时此字段不建议填值。
5、病历号PATIENT_ID
必填字段,要求至少填写总数据量的90%(住院病人要求全部填写,其余10%对应门诊无病历号的数据),最长16字符。
6、姓氏LAST_NAME和名字FIRST_NAME
以上两项只需有一项且必需有其中一项正确填写,最长12各个字符(即6个中文字符),此两项任意一项须100%填写。
7、性别SEX
此字段要求100%必填,最长1个字,WHONET要求只能填写“f”或者“m”,系统提供了相关的容错处理机制,允许填写“男”和“女”,系统会自动将“男”替换成“m”,将“女”替换成“f”。
8、年龄字段AGE
此字段要求100%必填字段,最长3个字符。
(1)不带任何后缀的1~3位整数或者2位数字+"y"后缀,代表年龄是按岁计算。
(2)2位数字+ "d" 即代表年龄按天计算。
(3)2位数字+ "w" 即代表年龄按周计算。
(4)2位数字+ "m" 即代表年龄按月计算。
(5)空值或其它字符,系统会认为是非法值,需补充修改后才能上报。
9、年龄类别PAT_TYPE
非必填字段,系统会根据年龄AGE自动生成该字段,即使是数据中已经填写了该值系统也会强制替换,若要填写,则该字段长度必须为3位字符,具体的计算规则如下:
1)当AGE后缀为“d”代表“天”时:
A.<=28,生成“new”代表“新生儿”;
B.>28,生成“ped”代表“儿童”;
2)当AGE后缀为“w”代表“周”时:
A.<=4,生成“new”代表“新生儿”;
B.>4,生成“ped”代表“儿童”;
3)当AGE后缀为“m”代表“月”时:
A.0,生成“new”代表“新生儿”;
B.>=1,生成“ped”代表“儿童”;
4)当AGE为纯数字,代表“岁”时:
A.0,生成“unk”代表“不明”,需修正后才能上报;
B.>=1并且<=14,生成“ped”代表“儿童”;
C.>=15并且<=65,生成“adu”代表“成人”;
D.>65,生成“ger”代表“老年”。
10、科室(送检科室)WARD
为非必填项,最大长度为15字,中英文不限。
11、科室类别WARD_TYPE
为100%必填项,最大长度为3个字,必须与WHONET内置的代码要求一致,见附表(1)。
12、专业类别DEPARTMENT
为100%必填项,最大长度为6个字,中英文不限(WHONET默认长度为3),此字段所填写的值,必须在用户系统设置的本院科室代码字典库中(科室代码设置见第一条)。未在字典库中的科室代码为非法值,无法通过系统校验,当数据上传成功后,系统会自动将此字段中的本院科室代码替换为系统内置的标准科室分类代码,系统内置的标准科室分类代码见附表(2)。
13、标本类型数字代码SPEC_TYPE和英文代码SPEC_CODE
不要求两者都完整,只要有其中一项即可,系统会根据其中一项自动补齐另一项。英文代码必须是2字符,数字代码最大3字符,两个字段都分别有自己的标准代码库(同样源自WHONET数据库,见附表3)。如果两者都有,但不匹配的例如痰标本的英文代码为“sp”,数字代码应该为“3”,如果填写了其它数字代码,系统会给出提示,要求修正不匹配的数据后再次上传。超出附表内的标本类型系统视为非法值,需修正后才能上报数据。另外,当标本类型为质控标本(即SPEC_TYPE为qc或者ex,并且SPEC_CODE为75或99)时,系统会给出提示并自动忽
略该条数据。
14、标本编号SPEC_NUM字段
100%必填字段,最大长度12字。
15、检验结果(细菌)ORGANISM
100%必填字段,标准3位英文字符代码,此代码为WHONET 5.6标准细菌代码;系统仅接受附表(4)所列出的细菌,不接受真菌,支原体,厌氧菌和分枝杆菌等。附表(4)所规定的标准代码外的数据,系统会给出提示并自动忽略该条数据。
16、细菌类别ORG_TYPE
系统仅接受革兰阳性菌“+”和革兰阴性菌代码“-”,最大允许1字符,此字段可不填写。当系统发现未填写时会自动根据ORGANISM字段的值推导出来,当系统发现本字段中填写的值与系统所推导的合法值不匹配的时候,会自动将其替换成合法值。
17、β-内酰胺酶BETA_LACT
非必填字段,1字符,且值仅能为“+”或“-”,若填写为“n”、“ne”、“neg”、“negative”或者中文全角“+”,系统会自动将其修正为半角英文“+”,若填写为“p”、“po”、“pos”、“positive”或者中文全角“-”,系统会自动将其修正为半角英文“-”。
18、超广谱β-内酰胺酶ESBL
规则同上。
19、耐甲氧西林葡萄球菌检测试验MRSA_SCRN
规则同上。