RefViz软件使用说明

前几天在园子里看到关于RefViz的介绍后很感兴趣，随即下载安装试用；用几天后，发现这是一个很有趣的软件，可以更好的帮助我们管理参考文献，并且发现文献之间的关联性；以下将我对一些主要功能的使用体会，与DXYers分享一下：

一、建立RefViz数据库（Create View）

RefViz可以实现与Endnote和RM的无缝连接，即我们可以将手头的Endnote数据库和RM数据库直接导入。RefViz的PDF Help中介绍了通过下载多种数据库文件后建库的方法，不再赘述，这里介绍一下与参考文献管理软件之间嵌入的方法：

在RM或Endnote的安装目录下，均有一个文件Configure DataViz.exe，运行此文件后，按照Wizard的提示，找到RefViz安装目录下的RefViz.exe文件，然后按照提示就可建立链接。（Fig1）

打开RM，可以看到工具栏中已经出现RefViz的链接工具（Fig2），点击该工具栏，RefViz 会开始自动建立相关数据库（注意此时新建的数据库自动保存在X:\RefViz\datasets文件夹中）；

此外，可以通过导出RM或Endnote数据库为RIS格式的文本文档，然后在RefViz中导入（Fig3）

Figure 3

二、工作视窗简介

A为文献关联信息区，显示文献按照主题词（最初建库时，这些主题词是由RefViz根据在文献数据库中某词的出现位置及频率自动生成的）的分类情况（在Galaxy视图中），以及主题词之间组和后的关联性（在Matrix视图中）；

B为关键词显示区：

b1为一级关键词区，显示与文章关联性最强Keywords（最初建库时，也是由RefViz自动生成的，这些关键词和Galaxy视图中的关键词完全相同，是文献分类的主要依据）

b2为次级关键词区，与一级关键词协助进行文献分类；

b3为描述性关键词，意义不是很大。

C为文献基本信息区（已经把Advisor视图关闭）

Figure 4

三、各视窗功能介绍：

在Galaxy视窗下，将鼠标放于某一类文献下，可以出现如图（Fig5）所示基本信息：

该图显示的是，第11类文献，总数为82条，Top Keywords 为plaque, PTCA ,atherectomy; Figure 5

点击此类文献，则C区和B区的信息随之变化（Fig6）Figure 6

此时，进入Matrix视窗，虽然关键词的排序以及关联性强弱没有发生变化，但是在第11类文献中出现的一级关键词均被着重显示为红色（Fig7）。

B区的Search功能比较简单，不再赘述。

Figure 7

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下面详细介绍一下Matrix视窗的功能：

如图（Fig8），在valve和endocarditis的交汇点，出现文献的相关信息：相关性0.586，文献计数18条。（此相关性是如何计算出的，很神奇啊？！心内膜炎的确和心脏瓣膜之间有重要的联系；我的个人理解，该相关性的计算依据，可能是统计各词的出现频率，然后计算出的两个关键词同时在决定文献属性的某一个特定部位（如文章题目）出现的概率；的确，通过这种关联，可以确立文献之间的内在联系）

下面，我们改变关键词的排列方式（由字母顺序排列改为相似性排列），如图（Fig9），可以发现横轴的关键词以其内在的相似性进行排列：ace (血管紧张素转化酶) acei （血管紧张素转化酶抑制剂）mi （心肌梗死）captopril （一种转化酶抑制剂）enalapril（另一种转化酶抑制剂），这几个具有内在相关性的词，竟然都出现在一起！！（电脑也会成为一个心血管专家！）。这种排列，无疑可以为用户提供重要的信息，可以揭示文献的研究热点和研究趋势（当然应该具备一定的专业判断能力）；比起单纯的文献检索系统，RefViz在这

一点上实在是聪明。

其它及类排列方式的组和，大家可以试一试，通过上面的介绍，可以触类旁通。Figure 8

Figure 9

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下面详细介绍一下Matrix视窗的功能：

如图（Fig8），在valve和endocarditis的交汇点，出现文献的相关信息：相关性0.586，文献计数18条。（此相关性是如何计算出的，很神奇啊？！心内膜炎的确和心脏瓣膜之间有重要的联系；我的个人理解，该相关性的计算依据，可能是统计各词的出现频率，然后计算出的两个关键词同时在决定文献属性的某一个特定部位（如文章题目）出现的概率；的确，通过这种关联，可以确立文献之间的内在联系）

下面，我们改变关键词的排列方式（由字母顺序排列改为相似性排列），如图（Fig9），可以发现横轴的关键词以其内在的相似性进行排列：ace (血管紧张素转化酶) acei （血管紧张素转化酶抑制剂）mi （心肌梗死）captopril （一种转化酶抑制剂）enalapril（另一种转化酶抑制剂），这几个具有内在相关性的词，竟然都出现在一起！！（电脑也会成为一个心血管专家！）。这种排列，无疑可以为用户提供重要的信息，可以揭示文献的研究热点和

研究趋势（当然应该具备一定的专业判断能力）；比起单纯的文献检索系统，RefViz在这一点上实在是聪明。

其它及类排列方式的组和，大家可以试一试，通过上面的介绍，可以触类旁通。

Figure 8

Figure 9

四、关键词工具（Keywords Tool）

关键词工具可以对三个级别的关键词进行级别更改，最终通过Reprocess功能，改变初始文献的分类状态。

首先选中全部文献（Fig10）

比如，我认为ef（射血分数的缩写）这个词不足以作为分类依据，或者认为这个词对研究的意义不大，可以通过demote键将它降格为二级、乃至描述性关键词（Fig11）；同理，我认为restenosis,这个词很重要，可以对其升级（Fig12）。通过这种修改，可以进一步按照自己的喜好或者专业需要限定和细分文献。按下Reprocess，文献分类就此改变（略）。Figure 10