外文医学文献检索工具Pubmed、SCI模板

1.1 什么是PubMed？
❖ 创建机构：美国国立医学图书馆（NLM）下设的美国生物技 术信息中心（NCBI）
❖ 摘要型(Abstract)的数据库, 提供文献的线索 ❖ 特色：免费、收录广、内容全、检索途径多、检索体系完备
、文摘库、部分文献可以免费获得全文 ❖ 整合在NCBI的统一检索平台Entrez上，与该平台其他数据库
• 用户利用一个MeSH词能找出所有有关该主题的文献 – 不同拼写：leukemia(s), leukaemia(s)→leukemia – 同义词： cancer(s), tumor(s), tumour(s), neoplasm(s) →neoplasms
3.3 MESH主题词检索
➢ 一篇文章可有多个MeSH词 ➢ 主题词可以组配相应的副主题词 ➢ 主题词的树状结构表：系统默认对含有下位概念的主题词进
• 逻辑运算符号的顺序为从左至右，可以 用全括号来改变其运算顺序。
2.7 限定检索
• 限定检索功能是对上一次检索操作结果进行限定。 • 限定检索将限定在MEDLINE数据库中进行。限定检索结
束后，需要将限定取消，点击“Clear all”。 • 选择条件就是点击选中限定选项。 • PubMed可限定内容包括：字段、文献类型、语种、日期
2.2 著者检索
❖ 二.通过字段限定检索及组合检索也可实现更精确的著者检 索 例如，输入Smith SR[1AU]可检索出第一著者为Smith SR的 文献
❖ 三.通过“Advanced”中的“Author”限定，可以检索该作 者的文献
2.3 期刊检索
四种方法：
一.利用PubMed自动词语匹配功能，其输入规则是：期刊 全名、MEDLINE期刊缩写名、ISSN号（例如1671-3982）三 种形式中的任何一种形式均可。 例如：Cancer RES。 如果期刊刊名正好与MeSH词相同， 例如cell、science 等，PubMed将这些词作为MeSH词检索。
2.3 期刊检索
二是利用期刊字段限定检索，其输入规则是：在刊名之后 加上刊名字段符。 例如：Cancer RES[TA]。
三是通过“Advanced”中的“Journal”，可以检索该刊 发表的文献。
四是通过“Journals in NCBI Databases”，查找到该刊 后，再选定该刊，发送到检索框进行期刊检索。
➢ 如果单词数量大于600，则PubMed自动提示延长词干。 ➢ 截词功能只限于单词，对词组无效。
2.6 布尔逻辑检索
逻辑运算符号主要有“AND”、“OR”、“NOT” ，分别表示“逻辑与”，“逻辑或”，“逻辑非” 。
A AND B
A OR B
A NOT B
2.6 布尔逻辑检索
• 直接输入几个检索词，系统默认词之间 是AND的逻辑组配关系
1.4 PubMed的记录来源
❖ MEDLINE Inprocess
由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未标引的数据 只有简单的书目及文摘信息，无MeSH字段 标引后，获得MeSH词后，再加入MEDLINE Indexed 标记：[PubMed-in process]
1.4 PubMed的记录来源
• 日期字段有三个[DP]、[EDAT]、[MHDA]
3、PUBMED高级检索功能
3.1 检索史 3.2 组合检索 3.3 主题词检索 3.4 期刊数据库检索 3.5 其他检索服务
3.1 检索史
➢Search History检索史，包括检索式序号、检索提问式、 检索时间及检索结果数 ➢单击检索式序号，显示Options选项，可执行AND、OR、 NOT、Delete（删除检索式）、Save in my NCBI（把检索 式保存在My NCBI）等不同操作 ➢检索史最多保留8小时
2.1 自动词语匹配检索
❖ 输入有实际意义的检索词，点击“Search”，系统按照自 动词语匹配的原理进行检索
❖ Pubmed最具特色的检索功能之一 智能化的检索过程 基本原理：对输入的检索词，首先在多个索引词表进行 搜索、比对，并自动转换为相应的MeSH主题词、著者或 刊名，再将检索词在all fields（所有字段）中检索， 并执行“OR”逻辑运算。如有多个检索词或短语词组， 则继续将其拆分为单词后分别在all fields中检索，单 词之间的逻辑关系为“AND”
2.4 短语精确检索
2.4 短语精确检索
结果对比
Traditional chinese medicine
“Traditional chinese medicine”
2.5 截词检索
➢ 在检索词后加“*”可实现截词检索，以提高查全率，对 词根或词尾略有变化的词进行检索时需要应用截词检索。
➢ 截词检索时，Pubmed关闭自动词语匹配功能，PubMed允许 使用“*”进行右边截词检索。 如： “viru*”，检索以viru开头的单词， immun*， 可以检出immune、immunologic等词。
、子集（Subsets）限定等。
2.8 日期或日期范围检索
• 可以在检索框中键入日期或日期范围，系统会按 日期段检索，并将符合条件的记录予以显示。
• 日期的录入格式为YYYY/MM/DD[DP],可以只写年 如：1999/09/08[DP]:出版日期为1999年9月08
• 日期范围用冒号链接 如： 2004/01:2004/06[DP]
外文生物医学文献检索工具的使用技巧与策略
——Pubmed与SCI
主要内容
一.PUBMED 二.SCI
一.PUBMED
1、PUBMED简介 2、PUBMED的基本检索功能 3、PUBMED的高级检索功能 4、PUBMED的结果的处理
1、PUBMED简介
1.1 什么是Pubmed？ 1.2 Pubmed的发展过程 1.3 Pubmed的收录范围 1.4 Pubmed的记录来源 1.5 Pubmed的常用字段 1.6 Pubmed检索的特点 1.7 Pubmed界面
3.2 组合检索
•组合检索可实现多个字段的逻辑组配检索 •在之前的检索基础上可以序号形式参与运算。
如：#1 AND #2、#3 OR #4等。
3.3 MESH主题词检索
• PubMed记录中的医学主题词(MeSH, Medical Subject Headings)是由标引员为PubMed中的Medline文献所人工指 定的词，主题词对同一概念的不同表达方式进行了规范。 PubMed能自动地为输入的检索词寻找相应的MeSH词
作为文献主题的人名
Publication Type
文献类型，包括期刊论文、综述、临床试验 、随机对照试验、病例报告、来信等
MeSH Subheadings MeSH副主题词
Source
文献出处
Journal Title Abbreviation
刊名缩写
Title
篇名
Title/Abstract
不用于显示。用于对篇名和摘要字段进行检 索
2.1 自动词语匹配ห้องสมุดไป่ตู้索
❖ Search Details框详细显示自动词语匹配的 实际检索
❖ 有较好的查全率，同时保证一定的查准率 ❖ 例如，查找阿司匹林防治心肌梗死的文献，
最简单的方法是在检索框中直接输入Heart attack aspirin三个词
转换后的检索式 可进行修改
2.2 著者检索
1.3 PubMed的收录范围
❖ 部分文献可直接获取全文，包括
Pubmed Central（PMC，收录期刊780余种）；NLM开发 的免费生物医学数字化期刊全文数据库
开放获取（Open Acess，OA）期刊 部分出版商提供的免费文献
1.4 PubMed的记录来源
❖ MEDLINE Indexed
1966年以来的MEDLINE已标引数据， 有MeSH字段和摘要， 标记：[PubMed-indexed for MEDLINE]
1.4 PubMed的记录来源
❖ OLDMEDLINE
1948-1965年间发表的200万篇生物医学文献 未标引，无MeSH字段， 标记：[PubMed-OLDMEDLINE]
2.4 短语精确检索
❖对检索词加上双引号（英文状态）进行强制检索 ❖短语精确精确检索时，Pubmed关闭自动词语匹配功能 ❖例如：检索框中输入“traditional Chinese medicine”， PubMed将“traditional Chinese medicine”作为一个不可 分割的短语在数据库的所有可检索字段中进行检索。
Text Words
不用于显示。用于以下字段的检索：TI、AB 、MH、SH、NM、PS、OT等字段
Volume
期刊卷号
1.6 PubMed的检索特点
• 系统特点： 主题加工规范 检索方式灵活多样 免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取） 提供检索词自动转换匹配
1.7 PubMed界面
English 4806 （约占85%)
Chinese 69 French
期刊论文发表时所 用的语言
Japanese……
❖ 绝大部分可回溯至1948年，最早回溯至1865年
❖ 内容涉及基础医学、临床医学、护理学、口腔医学、兽医 学、环境医学、营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保 健、微生物、药学、社会医学等领域
字段名称 Abstract Affiliation Author Name
Comment in
Corporate Author Comment on
Publication Date Grant Number Issue ISSN Language
MeSH Major Topic MeSH Terms
检索词输入框
使用帮助
常用工具
更多服务
PubMed题录
题名 TI
来源 PubMed SO 记录类型 （状态）
作者 AU
2、PUBMED基本检索功能
2.1 自动词语匹配检索 2.2 著者检索 2.3 期刊检索 2.4 短语精确检索 2.5 截词检索 2.6 布尔逻辑检索 2.7 限定检索 2.8 日期或日期范围检索
❖ Publisher-Supplied
出版商提供的电子文献题录 包括MEDLINE未收录的部分记录 标记：[PubMed-as supplied by publisher]
1.5 PubMed的常用字段
• PubMed中供显示和限定检索用的字段共有60多个
字段标识 AB AD AU
CIU
CN CON DP GR IP IS LA MAJR MH NM OT
Substance Name Other Term
说明 摘要 第一著者的单位和地址（包括E-mail地址） 著者
该字段中的文献评论了本文献
合著者或团体著者 该字段中的文献是本文献的评论对象 出版日期 经费资助项目号、合同号 期刊的期号 国际标准连续出版物编号 语种 主要MeSH词，即有*的主题词 MeSH词（主题词） 化学物质名称 非MeSH词，NLM之外的机构赋予的关键词
1.5 PubMed的常用字段
字段标识 PG
PMID
PL
PS
PT SH SO TA TI TIAB
TW VI
字段名称
说明
Pagination 文章所在期刊的页码
PubMed Unique Identifier
PubMed记录识别号
Place of Publication
期刊出版地
Personal Name as Subject
三种方法：
❖ 一.在检索框中输入著者姓名，Pubmed自动执行著者检索 一般姓在前名在后，姓用全称，名用首字母 例如，输入Smith SR可检索出姓为Smith，名的首字母 为SR的所有著者的文献 2002年以后的文献，Pubmed可实现对姓名全称的检索， 而且姓名排列顺序不限 例如，输入Smith SR的姓名全称Steven R Smith，可 检索出2002年以来该著者被Pubmed收录的文献。
建立无缝链接，可实现跨库检索
1.2 PubMed的发展历程
1997198319711879-
PubMed网络数据库 Medline光盘数据库 Medline联机检索系统 Index Medlcus（IM）检索期刊
1.3 PubMed的收录范围
❖ 收录全世界80多个国家5200多种生物医学期刊的文摘及题 录数据，涉及40多个语种