丝状真菌异源蛋白表达系统研究进展_姜天一
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
通过基因融合表达融合蛋白的方法虽然得到了广泛的应 用, 但是其背景知识仍然不是很清楚, 也有一些试图通过融合基 因提高表达量但不成功的例子[26]。尽管如此, 基因融合仍然是提 高曲霉中异源基因表达量的首选办法。
3 抑制丝状真菌自身的蛋白酶系统
为了能在丝状真菌中过量表达异源蛋白, 可采用融合表达 技术、使用真菌特异的强启动子, 有时甚 至 还 用 高 拷 贝 数 的 强 启 动子, 但有时仍然不能获得高的异源蛋白产量。有研究显示, 在 很多情况下, 异源蛋白基因的转录水平并未受到影响, 问题仅仅 在 于 分 泌 途 径 和 分 泌 后 [27]。应 该 对 丝 状 真 菌 分 泌 途 径 进 行 深 入 探
1 选择丝状真菌自身的强启动子
为使异源蛋白能够过量表达, 往往选用一些宿主自身的强 启动子来进行调控。
报 道 最 多 的 是 cbh1 启 动 子 。 cbh1 启 动 子 启 动 木 霉 菌 属 ( Trichoderma) 的 T.reesei 外切葡 聚 糖 纤 维 二 糖 水 解 酶Ⅰ基 因 的 转录。曾有研究表明, 用 T.reesei 发酵生产以外切葡聚 糖 纤 维 二 糖 水 解 酶Ⅰ为 主 的 纤 维 素 酶 , 产 量 能 达 到 40 g /L, 是 T.reesei 胞 外分泌性蛋白总量的 50%, 比一般细菌高出好几百倍[10]。cbh1 启 动子在 T.reesei 中最大有效个数为 3 个, 即超过 3 个启 动 子 拷 贝 不会继续增加目的蛋白产率, 其原因可能是特异性识别启动子 的反式作用因子有限, 只能保证一定量的启动子被识别[11]。但研 究 表 明 , 这 个 启 动 子 在 黑 曲 霉 ( Aspergillus niger) 中 则 表 现 为 拷 贝数越多增强效果越明显[12]。最近对 T.reesei 中木聚糖酶表达调 控机制的研究表明, 其中的调控机制非常复杂[13, 14]。因此, 意图通 过 过 量 表 达 转 录 调 节 蛋 白 来 无 限 地 增 加 cbh1 启 动 子 启 动 效 率 的方法是不现实的[15]。但在黑曲霉中情况却相对简单。glaA 启动 子 是 黑 曲 霉 作 为 异 源 表 达 宿 主 时 普 遍 使 用 的 强 启 动 子[16, 17], 它 是 黑曲霉的葡萄糖淀粉酶启动子, 能够得到产量非常高的葡糖淀 粉酶[6]。现已阐明, AmyR 和 CreA 分别是这个启动子的正向和反 向调节蛋白 [18], 通过改变这些反式因子的表达水平 , 即可影响
1051
讨, 以便于寻找适合用作表达宿主的真菌株系。 在这些研究中, 具有突破性进展的是 Dunn- Coleman 等 发 现
丝状真菌自身表达的蛋白酶能够明显影响异源蛋白的产量[28], 而 不同的丝状真菌和同种真菌不同株系表达的蛋白酶谱有很大不 同。可以根据此特点, 选择不同的种株系用于表达不同的目的蛋 白 [29]。解 决 这 个 问 题 的 另 一 种 方 法 是 通 过 诱 变 或 基 因 敲 除 等 技 术 筛 选 出 特 异 的 蛋 白 酶 缺 陷 的 丝 状 真 菌 突 变 株 [30]。中 国 科 学 院 微 生 物研究所的刘丽等利用自外诱变技术成功筛选出一株酸性蛋白 酶活性缺陷的黑曲霉菌株, 其生长特性和糖化能力与一般菌株 无异, 但其胞外酸性蛋白酶活性只有正常菌株的 0.76%。他们还 利 用 vhb 报 告 基 因 比 较 这 株 黑 曲 霉 在 转 录 和 分 泌 水 平 上 的 差 异, 结果显示, VHB 的分泌量与酸性蛋白酶活性成明显的负相关 性[31], 蛋白酶缺陷型菌株表达量比出发菌株量增加了约 500%。由 此可见, 在某些时候宿主分泌的蛋白酶系是决定异源表达成败 的关键因素。
为了使丝状真菌表达分泌异源蛋白的量与表达同源蛋白达 到相当的水平, 研究者进行了多方面的努力, 分别通过不同的途 径提高异源蛋白的表达量和分泌量。这些途径主要包括: ①选择 以丝状真菌自身的强启动子构建的表达盒 来 表 达 外 源 基 因[8]; ② 通过构建融合蛋白提高异源蛋白的分泌水平; ③抑制丝状真菌 自 身 的 蛋 白 酶 系 统 , 以 降 低 对 异 源 蛋 白 的 水 解[9]; ④优 化 发 酵 条 件和改变发酵方式。
[ 摘要] 丝状真菌, 俗称霉菌, 在食品工业中被用于生产多种生物酶和有机酸。近年来, 人们发现丝状真菌具有分泌量大、
表达的蛋白有天然活性等特点, 非常适合作为同源和异源重组蛋白的表达宿主, 因此被广泛研究和探讨。简要综述了以黑
曲霉为代表的几种常被用作蛋白表达宿主的丝状真菌的特点、应用中的主要问题和基本解决方案 , 以及近年关于丝够分泌到细胞外, 不仅便于分离 纯化, 也有利于蛋白的累积。丝状真菌表达的很多自身的蛋白能 够高效分泌到胞外[23]。利用这个特性 , 可用异源基因取代某个分 泌性良好的同源蛋白基因的 3' 端, 表达出融合蛋白, 用这个丝状 真菌自身的蛋白作为载体将目的蛋白“运 出 ”细 胞 。 这 种 方 法 能 使异源蛋白的 分 泌 量 提 高 5~100 倍[4]。Ward 等 最 先 报 道 了 使 用 基因融合技术提高蛋白产量的方法。他们通过将黑曲霉编码葡 糖淀粉酶的基因和牛凝乳酶的基因相融合, 发现通过融合基因 表 达 的 凝 乳 酶 产 量 大 大 超 过 单 纯 异 源 表 达 的 未 融 合 的 凝 乳 酶 [24], 并且融合蛋白在分泌到胞外后会自动水解, 产生凝乳酶。随着研 究的深入和基因融合技术的成熟, 现在大多数融合蛋白表达操 作只使用葡糖淀粉酶的催化结构域融合目的蛋白, 表达的融和 蛋白可用蛋白水解酶特异性水解 N 端氨基酸序列, 得到目的蛋 白 产 物[25]。
表达系统的最佳培养条件和发酵条件的研究进展。
[ 关键词] 丝状真菌; 黑曲霉; 异源表达
[ 中图分类号] Q78C Q949.327.1
[ 文献标识码] A
Advances in Resear ch of Heter ologous Expr ession in Filamentous Fungi
JIANG Tian- yi, ZHU Ping
长久以来, 丝状真菌不仅在饮料、奶 酪 等 食 品 工 业 和 酶 的 商 业 化 生 产 中 被 广 泛 使 用[1, 2], 同 时 也 由 于 其 在 商 业 领 域 的 重 要 地 位而得到长期深入的研究。丝状真菌的一些重要特性已逐渐被 人 们 所 认 识 , 这 些 特 性 包 括 表 达 量 大 、胞 外 分 泌 率 高 、蛋 白 质 分 子折叠和修饰系统接近高等真核细胞、生产的外源蛋白具有天 然活性等[3]。因此, 丝状真菌很快成了颇具 吸 引 力 的 可 用 于 生 产 异源重组蛋白的表达宿主系统[4, 5]。
1050
文章编号:1009- 0002(2007)06- 1050- 03
生物技术通讯 LETTERS IN BIOTECHNOLOGY Vol.18 No.6 Nov., 2007
综述
丝状真菌异源蛋白表达系统研究进展
姜天一, 朱平 中国医学科学院, 协和医科大学 药物研究所生物合成室, 北京 100051
[ 收稿日期] 2007- 04- 03 [ 作者简介] 姜天一( 1981- ) , 男, 硕士研究生 [ 通讯作者] 朱平, ( E- mail) zhuping@imm.ac.cn
姜天一等: 丝状真菌异源蛋白表达系统研究进展
glaA 的启动转录效率。还有一些 常 用 的 启 动 子 , 如 构 巢 曲 霉 ( A. nidulans) 的 持 家 基 因 gpdA 启 动 子 、受 乙 醇 、乙 胺 和 酮 类 物 质 诱 导的 alcA /alcR 启动子, 都已被成功地用作异源蛋白在丝状真菌 表达系统的有效启动子[19, 20]。阿根廷科学家研究发现[21], 用来自粗 糙链孢霉的 cfp 基因启动子在丝状真菌中表达异源蛋白时, 其表 达量受到碳源的控制, 可以通过改变碳源来阻遏或诱导异源蛋 白的产生。Andrie[22]等使用来自 Pyrenophora tritici repentis( 属于 半知菌亚门) 的 ToxA 和 ToxB 启动子异源表达了多种报告基因, 并详细阐述了 ToxA 和 ToxB 作为丝状真菌异源表达启动子的 潜 力, 为今后使用这 2 种启动子提供了基础。
5 内质网因素
大多数蛋白需要在内质网中经过正确折叠后才具有生物活 性, 没有正确折叠的蛋白会滞留在内质网中或者被降解清除。细 胞自身具有蛋白质折叠的质量控制机制, 这使得未能正确折叠 的蛋白不能分泌到胞外[35]。内质网的这种“校读( proofreading) ”功
丝状真菌卓越的表达和分泌能力一直是吸引人们的最大特 点。丝状真菌中的曲霉属和赤霉属的一些种, 在理想的培养条件 下发酵分泌葡糖淀粉酶的产率可 达 20 g /L 发 酵 液 , 分 泌 纤 维 素 酶可达到 40 g /L 发酵液[6], 并具有真核 分 泌 机 制 , 很 可 能 还 具 有 与哺乳动物系统相似的蛋白修饰性 能 , 如 高 甘 露 糖 型 和 N- 糖 基 化等[7]。相比较而言, 细菌表达的蛋白质往往以无活性的、难溶的 包涵体形式存在[3]。因此可以认为, 丝状真 菌 具 有 成 为 理 想 的 表 达宿主的潜力。但是在使用丝状真菌作为宿主表达外源蛋白, 尤 其是非丝状真菌蛋白时, 其分泌效率往往不尽如人意, 产率一般 比表达同源蛋白低 2 到 3 个数量级[4]。
4 形态学因素
不同的培养方法产生的丝状真菌具有不同的形态, 其分泌 效 率 也 不 同 。其 中 一 个 原 因 是 菌 体 生 长 改 变 了 培 养 液 的 流 动 性 , 造成营养物质和氧气在发酵罐中梯度分布; 另一个原因是不同 生长形态往往导致不同的生物量。几种常见的丝状真菌与其相 应的发酵形态见表 1。有人在研究了产黄青霉药瓶培养产生的菌 球后发现, 小于 400 μm 的菌球全部由具有代谢活性的活细胞组 成; 而直径更大一些的菌球则分成 4 个区域, 最外层是具生长活 性的菌丝, 接下来是 2 层代谢活性依次减弱的细胞, 最里面是空 心层[32]。还有人研究了黑曲霉 AB4.1 菌株在不同培养系统中、不 同菌体形态时蛋白质分泌产量的变化, 比较了几种发酵系统, 发 现 其 目 的 蛋 白 葡 糖 淀 粉 酶- GFP 的 产 量 在 固 定 化 细 胞 培 养 系 统 中得率最高, 而在传统的药瓶培养系统中得率最低, 两者相差 10 倍; 并因此推测, 异源蛋白的合成和分泌主要发生在菌丝尖端生 长 的 过 程 中[32, 33]。
Institute of Materia Medica, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Beijing 100051, China
[ Abstr act] The characteristic of producing the homologous and heterologous proteins in some convention spaces of fila- mentous fungi was reviewed. And the basic expression strategies, the putative problems and the putative solutions were in- troduced. In the end, the author reviewed recent progress in study of the effect of filamentous fungal morphology on het- erologous protein secretion. [ Key wor ds] filamentous fungiC Aspergillus nigerC heterologous expression
3 抑制丝状真菌自身的蛋白酶系统
为了能在丝状真菌中过量表达异源蛋白, 可采用融合表达 技术、使用真菌特异的强启动子, 有时甚 至 还 用 高 拷 贝 数 的 强 启 动子, 但有时仍然不能获得高的异源蛋白产量。有研究显示, 在 很多情况下, 异源蛋白基因的转录水平并未受到影响, 问题仅仅 在 于 分 泌 途 径 和 分 泌 后 [27]。应 该 对 丝 状 真 菌 分 泌 途 径 进 行 深 入 探
1 选择丝状真菌自身的强启动子
为使异源蛋白能够过量表达, 往往选用一些宿主自身的强 启动子来进行调控。
报 道 最 多 的 是 cbh1 启 动 子 。 cbh1 启 动 子 启 动 木 霉 菌 属 ( Trichoderma) 的 T.reesei 外切葡 聚 糖 纤 维 二 糖 水 解 酶Ⅰ基 因 的 转录。曾有研究表明, 用 T.reesei 发酵生产以外切葡聚 糖 纤 维 二 糖 水 解 酶Ⅰ为 主 的 纤 维 素 酶 , 产 量 能 达 到 40 g /L, 是 T.reesei 胞 外分泌性蛋白总量的 50%, 比一般细菌高出好几百倍[10]。cbh1 启 动子在 T.reesei 中最大有效个数为 3 个, 即超过 3 个启 动 子 拷 贝 不会继续增加目的蛋白产率, 其原因可能是特异性识别启动子 的反式作用因子有限, 只能保证一定量的启动子被识别[11]。但研 究 表 明 , 这 个 启 动 子 在 黑 曲 霉 ( Aspergillus niger) 中 则 表 现 为 拷 贝数越多增强效果越明显[12]。最近对 T.reesei 中木聚糖酶表达调 控机制的研究表明, 其中的调控机制非常复杂[13, 14]。因此, 意图通 过 过 量 表 达 转 录 调 节 蛋 白 来 无 限 地 增 加 cbh1 启 动 子 启 动 效 率 的方法是不现实的[15]。但在黑曲霉中情况却相对简单。glaA 启动 子 是 黑 曲 霉 作 为 异 源 表 达 宿 主 时 普 遍 使 用 的 强 启 动 子[16, 17], 它 是 黑曲霉的葡萄糖淀粉酶启动子, 能够得到产量非常高的葡糖淀 粉酶[6]。现已阐明, AmyR 和 CreA 分别是这个启动子的正向和反 向调节蛋白 [18], 通过改变这些反式因子的表达水平 , 即可影响
1051
讨, 以便于寻找适合用作表达宿主的真菌株系。 在这些研究中, 具有突破性进展的是 Dunn- Coleman 等 发 现
丝状真菌自身表达的蛋白酶能够明显影响异源蛋白的产量[28], 而 不同的丝状真菌和同种真菌不同株系表达的蛋白酶谱有很大不 同。可以根据此特点, 选择不同的种株系用于表达不同的目的蛋 白 [29]。解 决 这 个 问 题 的 另 一 种 方 法 是 通 过 诱 变 或 基 因 敲 除 等 技 术 筛 选 出 特 异 的 蛋 白 酶 缺 陷 的 丝 状 真 菌 突 变 株 [30]。中 国 科 学 院 微 生 物研究所的刘丽等利用自外诱变技术成功筛选出一株酸性蛋白 酶活性缺陷的黑曲霉菌株, 其生长特性和糖化能力与一般菌株 无异, 但其胞外酸性蛋白酶活性只有正常菌株的 0.76%。他们还 利 用 vhb 报 告 基 因 比 较 这 株 黑 曲 霉 在 转 录 和 分 泌 水 平 上 的 差 异, 结果显示, VHB 的分泌量与酸性蛋白酶活性成明显的负相关 性[31], 蛋白酶缺陷型菌株表达量比出发菌株量增加了约 500%。由 此可见, 在某些时候宿主分泌的蛋白酶系是决定异源表达成败 的关键因素。
为了使丝状真菌表达分泌异源蛋白的量与表达同源蛋白达 到相当的水平, 研究者进行了多方面的努力, 分别通过不同的途 径提高异源蛋白的表达量和分泌量。这些途径主要包括: ①选择 以丝状真菌自身的强启动子构建的表达盒 来 表 达 外 源 基 因[8]; ② 通过构建融合蛋白提高异源蛋白的分泌水平; ③抑制丝状真菌 自 身 的 蛋 白 酶 系 统 , 以 降 低 对 异 源 蛋 白 的 水 解[9]; ④优 化 发 酵 条 件和改变发酵方式。
[ 摘要] 丝状真菌, 俗称霉菌, 在食品工业中被用于生产多种生物酶和有机酸。近年来, 人们发现丝状真菌具有分泌量大、
表达的蛋白有天然活性等特点, 非常适合作为同源和异源重组蛋白的表达宿主, 因此被广泛研究和探讨。简要综述了以黑
曲霉为代表的几种常被用作蛋白表达宿主的丝状真菌的特点、应用中的主要问题和基本解决方案 , 以及近年关于丝够分泌到细胞外, 不仅便于分离 纯化, 也有利于蛋白的累积。丝状真菌表达的很多自身的蛋白能 够高效分泌到胞外[23]。利用这个特性 , 可用异源基因取代某个分 泌性良好的同源蛋白基因的 3' 端, 表达出融合蛋白, 用这个丝状 真菌自身的蛋白作为载体将目的蛋白“运 出 ”细 胞 。 这 种 方 法 能 使异源蛋白的 分 泌 量 提 高 5~100 倍[4]。Ward 等 最 先 报 道 了 使 用 基因融合技术提高蛋白产量的方法。他们通过将黑曲霉编码葡 糖淀粉酶的基因和牛凝乳酶的基因相融合, 发现通过融合基因 表 达 的 凝 乳 酶 产 量 大 大 超 过 单 纯 异 源 表 达 的 未 融 合 的 凝 乳 酶 [24], 并且融合蛋白在分泌到胞外后会自动水解, 产生凝乳酶。随着研 究的深入和基因融合技术的成熟, 现在大多数融合蛋白表达操 作只使用葡糖淀粉酶的催化结构域融合目的蛋白, 表达的融和 蛋白可用蛋白水解酶特异性水解 N 端氨基酸序列, 得到目的蛋 白 产 物[25]。
表达系统的最佳培养条件和发酵条件的研究进展。
[ 关键词] 丝状真菌; 黑曲霉; 异源表达
[ 中图分类号] Q78C Q949.327.1
[ 文献标识码] A
Advances in Resear ch of Heter ologous Expr ession in Filamentous Fungi
JIANG Tian- yi, ZHU Ping
长久以来, 丝状真菌不仅在饮料、奶 酪 等 食 品 工 业 和 酶 的 商 业 化 生 产 中 被 广 泛 使 用[1, 2], 同 时 也 由 于 其 在 商 业 领 域 的 重 要 地 位而得到长期深入的研究。丝状真菌的一些重要特性已逐渐被 人 们 所 认 识 , 这 些 特 性 包 括 表 达 量 大 、胞 外 分 泌 率 高 、蛋 白 质 分 子折叠和修饰系统接近高等真核细胞、生产的外源蛋白具有天 然活性等[3]。因此, 丝状真菌很快成了颇具 吸 引 力 的 可 用 于 生 产 异源重组蛋白的表达宿主系统[4, 5]。
1050
文章编号:1009- 0002(2007)06- 1050- 03
生物技术通讯 LETTERS IN BIOTECHNOLOGY Vol.18 No.6 Nov., 2007
综述
丝状真菌异源蛋白表达系统研究进展
姜天一, 朱平 中国医学科学院, 协和医科大学 药物研究所生物合成室, 北京 100051
[ 收稿日期] 2007- 04- 03 [ 作者简介] 姜天一( 1981- ) , 男, 硕士研究生 [ 通讯作者] 朱平, ( E- mail) zhuping@imm.ac.cn
姜天一等: 丝状真菌异源蛋白表达系统研究进展
glaA 的启动转录效率。还有一些 常 用 的 启 动 子 , 如 构 巢 曲 霉 ( A. nidulans) 的 持 家 基 因 gpdA 启 动 子 、受 乙 醇 、乙 胺 和 酮 类 物 质 诱 导的 alcA /alcR 启动子, 都已被成功地用作异源蛋白在丝状真菌 表达系统的有效启动子[19, 20]。阿根廷科学家研究发现[21], 用来自粗 糙链孢霉的 cfp 基因启动子在丝状真菌中表达异源蛋白时, 其表 达量受到碳源的控制, 可以通过改变碳源来阻遏或诱导异源蛋 白的产生。Andrie[22]等使用来自 Pyrenophora tritici repentis( 属于 半知菌亚门) 的 ToxA 和 ToxB 启动子异源表达了多种报告基因, 并详细阐述了 ToxA 和 ToxB 作为丝状真菌异源表达启动子的 潜 力, 为今后使用这 2 种启动子提供了基础。
5 内质网因素
大多数蛋白需要在内质网中经过正确折叠后才具有生物活 性, 没有正确折叠的蛋白会滞留在内质网中或者被降解清除。细 胞自身具有蛋白质折叠的质量控制机制, 这使得未能正确折叠 的蛋白不能分泌到胞外[35]。内质网的这种“校读( proofreading) ”功
丝状真菌卓越的表达和分泌能力一直是吸引人们的最大特 点。丝状真菌中的曲霉属和赤霉属的一些种, 在理想的培养条件 下发酵分泌葡糖淀粉酶的产率可 达 20 g /L 发 酵 液 , 分 泌 纤 维 素 酶可达到 40 g /L 发酵液[6], 并具有真核 分 泌 机 制 , 很 可 能 还 具 有 与哺乳动物系统相似的蛋白修饰性 能 , 如 高 甘 露 糖 型 和 N- 糖 基 化等[7]。相比较而言, 细菌表达的蛋白质往往以无活性的、难溶的 包涵体形式存在[3]。因此可以认为, 丝状真 菌 具 有 成 为 理 想 的 表 达宿主的潜力。但是在使用丝状真菌作为宿主表达外源蛋白, 尤 其是非丝状真菌蛋白时, 其分泌效率往往不尽如人意, 产率一般 比表达同源蛋白低 2 到 3 个数量级[4]。
4 形态学因素
不同的培养方法产生的丝状真菌具有不同的形态, 其分泌 效 率 也 不 同 。其 中 一 个 原 因 是 菌 体 生 长 改 变 了 培 养 液 的 流 动 性 , 造成营养物质和氧气在发酵罐中梯度分布; 另一个原因是不同 生长形态往往导致不同的生物量。几种常见的丝状真菌与其相 应的发酵形态见表 1。有人在研究了产黄青霉药瓶培养产生的菌 球后发现, 小于 400 μm 的菌球全部由具有代谢活性的活细胞组 成; 而直径更大一些的菌球则分成 4 个区域, 最外层是具生长活 性的菌丝, 接下来是 2 层代谢活性依次减弱的细胞, 最里面是空 心层[32]。还有人研究了黑曲霉 AB4.1 菌株在不同培养系统中、不 同菌体形态时蛋白质分泌产量的变化, 比较了几种发酵系统, 发 现 其 目 的 蛋 白 葡 糖 淀 粉 酶- GFP 的 产 量 在 固 定 化 细 胞 培 养 系 统 中得率最高, 而在传统的药瓶培养系统中得率最低, 两者相差 10 倍; 并因此推测, 异源蛋白的合成和分泌主要发生在菌丝尖端生 长 的 过 程 中[32, 33]。
Institute of Materia Medica, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Beijing 100051, China
[ Abstr act] The characteristic of producing the homologous and heterologous proteins in some convention spaces of fila- mentous fungi was reviewed. And the basic expression strategies, the putative problems and the putative solutions were in- troduced. In the end, the author reviewed recent progress in study of the effect of filamentous fungal morphology on het- erologous protein secretion. [ Key wor ds] filamentous fungiC Aspergillus nigerC heterologous expression