生物信息学：第五讲BLAST序列比对
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第五讲：BLAST 序列比对
1. Basic Local Alignment Search Tool
2. Compare a query sequence to all the sequences in a specified database
Fra Baidu bibliotek
BLAST的常用种类（详细见教材）： 1、blastn 2、blastp 3、tblastn 4、blastx 5、tblastx
例1：对给定的opsin蛋白进行blastp,目标数据库为 nt,物种为Eukaryota
例2：对给定的olfactory receptor基因进行blastn,目 标数据库为nt,物种为Eukaryota
作业：对给定的2个基因(test1,test2)分别进行 blastn, blastp, tblastn, tblastx, blastx
1. Basic Local Alignment Search Tool
2. Compare a query sequence to all the sequences in a specified database
Fra Baidu bibliotek
BLAST的常用种类（详细见教材）： 1、blastn 2、blastp 3、tblastn 4、blastx 5、tblastx
例1：对给定的opsin蛋白进行blastp,目标数据库为 nt,物种为Eukaryota
例2：对给定的olfactory receptor基因进行blastn,目 标数据库为nt,物种为Eukaryota
作业：对给定的2个基因(test1,test2)分别进行 blastn, blastp, tblastn, tblastx, blastx