实验设计与数据处理-
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
实验设计与数据处理
功能性近红外光谱(fNIRS)评估运动负荷对脑血流动力学 响应的影响
目 录
课题背景
1
研究背景;意义
实验设计
2
实验方案;实验准备;数据采集
数据处理
3
数据预处理;数据处理;统计分析
总结
4
总结;反思
研究背景
Part.1
1.大脑血流动力学响应
上肢运动在神经学和神经康复中频繁用于评估受损的运动功能;上肢康复训练
可以改善脑卒中患者的上肢功能障碍,恢复其上肢运动功能。
背 景
神经-血管耦合:上肢运动引起相应神经的活性增强会导致局部毛细血管 增加氧气的消耗,从而引起局部血流量(CBF)增加。
本实验目的是探究运动负荷 对初级运动皮层(M1,同 侧和对侧)的激活作用
2.近红外光脑功能成像
NIRS 利用神经活动与血液动力学响应间的相关性来间接测量脑活动,
背 景
是一种无损伤的脑功能检测技术。 生物组织对近红外光(700-1000 nm)有低吸收 和高散射的特征,近红外光可以穿透一定深度的 组织,同时由于生物质组织内 HbO2、 HHb等 主要的吸收色团对近红外波段的光具有不同的吸 收光谱,可选择合适波长的近红外光,结合吸收 色团浓度的变化来反映脑功能活动。
2.近红外光脑功能成像
修正的Beer-Lambert 定律
背 景
fNIRS的独特优势 操作简便,便携性好 时间分辨率和空间分辨率较高 适用于自然情境、婴幼儿童和 特殊人群
实验设计
Part.2
1.实验方案
实验目的:探究运动负荷对大脑血流动力学响应的影响 实验设计: 不同重量的哑铃(0LB、5LB、10LB)以及不同的主动运动训练时间(10S、 20S),表示不同的运动负荷,如表1所示。
表1 实验具体参数
experiment 1 2 3 4 5 6 exercise load (LB) 0 0 5 5 10 10 stimulation priod (S) 10 20 10 20 10 20
实 验 设 计
1.实验方案
实验范式:六组实验,每组实验包括25s的静息期,以测得血氧的基线; 15次主动运动刺激期和休息期交替进行。如图1所示。 主动运动刺激期:手握哑铃进行主动肘屈至最大角度,并保持(10S或 20S),直至刺激时间结束。 休息期:25S血氧水平恢复基线。 实验1,3,5约585S;实验2、4、6
实 验 设 计
约735S。
每组实验完成后休息1小时,保证 被试从疲劳中恢复正常状态。
图1 实验任务时间轴
2.实验准备
被试招募:15名健康右利手志愿者(重庆大学和陆军军医大学附属西南医 院的机构审查委员会(IRB)批准),无上肢运动障碍和神经肌肉疾病;实 验前保证充足休息,并于实验前充分了解实验内容和流程,并签署知情同 意书。 实验环境:实验在陆军军医大学生物医学工程学院405实验室进行,房间保 持黑暗且安静。 实验设备:多通道fNIRS系统(NIRx Medical Technologies LLC, NY, USA) 采用E-Prime设计实验范式程序。
实 验 设 计
3.数据采集
检测初级运动皮层(M1)的激活:采用国际10-20系统导联,将16个光 极(包括8个光源和8个探测器)覆盖于被试者M1,共20个通道。
实 验 设 计
被试者端坐于椅子上,保持安静状 态、根据电脑屏幕完成实验,保存 每个被试的实验数据。
数据处理
Part.3
1.数据预处理
根据Beer-Lambert定律,将原始数据转化为血红蛋白浓度数据需要以 下步骤:
数 据 处 理
原始数据d
原始数据转光密度OD:
' ' OD logI1 / I0 - logI1 / I0 = logI 1 / I1
基于 MATLAB的 工具箱 nirsLAB
光密度数据 OD
去噪: 例如 0.01Hz~0.1Hz带通: 去除生理噪声与基线漂移;剔除异常数据等 去噪后光密度 OD 光密度转血红蛋白浓度: 血红蛋白浓度 数据dc
i i ODi ( HBO CHBO HBR CHBR )* r * DPF i
分析与统计结 果
时频波形分析: 例如:block平均;t-test等
2.数据处理
绘制每个被试的各实验下的HbO2,HHb,tHb的浓度变化图 (标记刺激点)
数 据 处 理
以 HbO2 为例
每个实验下,将所有被试的各个通道数据进行平均 任务块平均(单人、所有 被试)
每三个block叠加平均 每五个block叠加平均
十五个block叠加平均
3.统计分析
绘制通道激活图
数 据 处 理
如图所示(以HbO2 为例),对侧M1中 通道5-10有明显激活 ,同侧M1中也有激 活的通道。
统计有显著激活的通道数目
3.统计分析
统计任务块内的浓度幅值、浓度均值、到达幅值所需的时间
实 验 设 计
绘制带误差棒的柱状图(均数+ 标准差)
eg.所有被试在每个实验下的平均
HbO2浓度的改变
同种因素下组间数据比较——单因 素方差分析
评估两种条件下的O2Hb和HHb差异的统计 学显着性
两组间差异——配对t检验(P<0.05)
总结
Part.4
本实验为单纯的fNIRS脑功能成像,接下来的实验中还会加入
总 结
脑电检测。实验设计和数据处理方面还应改进。
在预实验的基础上设计的实验,还有需要完善的地方。还未全面 接触数据处理的各种方法,需要更深入学习,参考相关文献,并
应用于实践。
谢谢聆听
Thank you to listen.
功能性近红外光谱(fNIRS)评估运动负荷对脑血流动力学 响应的影响
目 录
课题背景
1
研究背景;意义
实验设计
2
实验方案;实验准备;数据采集
数据处理
3
数据预处理;数据处理;统计分析
总结
4
总结;反思
研究背景
Part.1
1.大脑血流动力学响应
上肢运动在神经学和神经康复中频繁用于评估受损的运动功能;上肢康复训练
可以改善脑卒中患者的上肢功能障碍,恢复其上肢运动功能。
背 景
神经-血管耦合:上肢运动引起相应神经的活性增强会导致局部毛细血管 增加氧气的消耗,从而引起局部血流量(CBF)增加。
本实验目的是探究运动负荷 对初级运动皮层(M1,同 侧和对侧)的激活作用
2.近红外光脑功能成像
NIRS 利用神经活动与血液动力学响应间的相关性来间接测量脑活动,
背 景
是一种无损伤的脑功能检测技术。 生物组织对近红外光(700-1000 nm)有低吸收 和高散射的特征,近红外光可以穿透一定深度的 组织,同时由于生物质组织内 HbO2、 HHb等 主要的吸收色团对近红外波段的光具有不同的吸 收光谱,可选择合适波长的近红外光,结合吸收 色团浓度的变化来反映脑功能活动。
2.近红外光脑功能成像
修正的Beer-Lambert 定律
背 景
fNIRS的独特优势 操作简便,便携性好 时间分辨率和空间分辨率较高 适用于自然情境、婴幼儿童和 特殊人群
实验设计
Part.2
1.实验方案
实验目的:探究运动负荷对大脑血流动力学响应的影响 实验设计: 不同重量的哑铃(0LB、5LB、10LB)以及不同的主动运动训练时间(10S、 20S),表示不同的运动负荷,如表1所示。
表1 实验具体参数
experiment 1 2 3 4 5 6 exercise load (LB) 0 0 5 5 10 10 stimulation priod (S) 10 20 10 20 10 20
实 验 设 计
1.实验方案
实验范式:六组实验,每组实验包括25s的静息期,以测得血氧的基线; 15次主动运动刺激期和休息期交替进行。如图1所示。 主动运动刺激期:手握哑铃进行主动肘屈至最大角度,并保持(10S或 20S),直至刺激时间结束。 休息期:25S血氧水平恢复基线。 实验1,3,5约585S;实验2、4、6
实 验 设 计
约735S。
每组实验完成后休息1小时,保证 被试从疲劳中恢复正常状态。
图1 实验任务时间轴
2.实验准备
被试招募:15名健康右利手志愿者(重庆大学和陆军军医大学附属西南医 院的机构审查委员会(IRB)批准),无上肢运动障碍和神经肌肉疾病;实 验前保证充足休息,并于实验前充分了解实验内容和流程,并签署知情同 意书。 实验环境:实验在陆军军医大学生物医学工程学院405实验室进行,房间保 持黑暗且安静。 实验设备:多通道fNIRS系统(NIRx Medical Technologies LLC, NY, USA) 采用E-Prime设计实验范式程序。
实 验 设 计
3.数据采集
检测初级运动皮层(M1)的激活:采用国际10-20系统导联,将16个光 极(包括8个光源和8个探测器)覆盖于被试者M1,共20个通道。
实 验 设 计
被试者端坐于椅子上,保持安静状 态、根据电脑屏幕完成实验,保存 每个被试的实验数据。
数据处理
Part.3
1.数据预处理
根据Beer-Lambert定律,将原始数据转化为血红蛋白浓度数据需要以 下步骤:
数 据 处 理
原始数据d
原始数据转光密度OD:
' ' OD logI1 / I0 - logI1 / I0 = logI 1 / I1
基于 MATLAB的 工具箱 nirsLAB
光密度数据 OD
去噪: 例如 0.01Hz~0.1Hz带通: 去除生理噪声与基线漂移;剔除异常数据等 去噪后光密度 OD 光密度转血红蛋白浓度: 血红蛋白浓度 数据dc
i i ODi ( HBO CHBO HBR CHBR )* r * DPF i
分析与统计结 果
时频波形分析: 例如:block平均;t-test等
2.数据处理
绘制每个被试的各实验下的HbO2,HHb,tHb的浓度变化图 (标记刺激点)
数 据 处 理
以 HbO2 为例
每个实验下,将所有被试的各个通道数据进行平均 任务块平均(单人、所有 被试)
每三个block叠加平均 每五个block叠加平均
十五个block叠加平均
3.统计分析
绘制通道激活图
数 据 处 理
如图所示(以HbO2 为例),对侧M1中 通道5-10有明显激活 ,同侧M1中也有激 活的通道。
统计有显著激活的通道数目
3.统计分析
统计任务块内的浓度幅值、浓度均值、到达幅值所需的时间
实 验 设 计
绘制带误差棒的柱状图(均数+ 标准差)
eg.所有被试在每个实验下的平均
HbO2浓度的改变
同种因素下组间数据比较——单因 素方差分析
评估两种条件下的O2Hb和HHb差异的统计 学显着性
两组间差异——配对t检验(P<0.05)
总结
Part.4
本实验为单纯的fNIRS脑功能成像,接下来的实验中还会加入
总 结
脑电检测。实验设计和数据处理方面还应改进。
在预实验的基础上设计的实验,还有需要完善的地方。还未全面 接触数据处理的各种方法,需要更深入学习,参考相关文献,并
应用于实践。
谢谢聆听
Thank you to listen.