1-生物标志物1
生物标志物的概念和定义
⽣物标志物的概念和定义
⽣物标记物:⽣物标记物(biomarker):⽣物标记是⼀种可以客观地测量和评价正常的⽣物学过程、致病的过程,或对治疗⽣物标记物:
⼲预的药理学反应的指标[2]。
⽣物标志物可以是⼀种⽣理、病理、解剖特征,或者是与正常或异常的⽣物学功能或过程相关的某⼀⽅⾯的测量。
典型的⽣物标记物通过实验(如通过化学分析,如⾎脂中的低密度脂蛋⽩等)或者仪器(如⾎压计)来测量取得的。
A biomarker is a characteristic that is objectively measured and evaluated as an indicator of normal biologic processes, pathogenic processes, or responses to a therapeutic intervention. A biomarker can be a physiologic, pathologic, or anatomic characteristic or measurement that relates to an aspect of normal or abnormal biologic function or process. Typically, a biomarker is measured using a test (e.g., by chemical analysis) or instrument (e.g., by sphygmomanometry)。
生物标志物
生物学有效剂量标志物
与重要的亚细胞靶结构相互作用的暴露 物质剂量即生物学有效剂量。
生物学有效剂量标志物举例 标志物 暴露 生物学介质 DNA加合物 苯并芘 组织、白细胞 蛋白质加合物 环氧乙烷,TNT 红细胞
易感性标志物
可测得的遗传或获得性因素的指示物。易感 性本身不引起疾病,但可影响暴露引发疾病 的概率。
第三节 研究方法
研究实例 1
研究题目 波兰某工业区环境中芳香族化合物暴露人群的DNA加合物研究
测量指标 DNA加合物/淋巴细胞DNA(介质)
测量方法
荧光检测竞争ELISA法、DNA加合物32P后标记技术
研究设计 横断面分析研究
暴露组 对照组 煤焦油作业工人 当地城市居民、近郊农民
排除年龄、吸烟、其他职业暴露等因素影响 比较3组DNA加合物水平
内部剂量标志物举例 标志物 暴露 生物学介质 Cotinine 香烟中的尼古丁 体液 铅 环境中的铅 体液及组织(如头发、指甲、牙齿) 4-A* TNT 体液(血液、尿液) DDE DDT 脂肪组织 黄曲霉毒素 食物中的黄曲毒 体液 霉素 致突变实验 化学性致突变物 体液 * 4-氨基-2,6-二硝基甲苯
生物标志物的选择
• 关联性:所选用的生物学标志物应与所 研究的暴露-疾病关系有关联 • 真实性:所选用的暴露标志物应能反映 暴露有无及其剂量 • 可靠性:即可重复性 • 稳定性:所选用的标志物应相对稳定
应用生物学标志物应注意的问题
• 个体间变异:不同个体同一组织器官中 标志物的出现频率和量有可能相差很大 • 组织间变异:同一个体不同组织器官之 间标志物出现的频率和量可能差别较大 • 测定方法;不同测定方法的灵敏度不同 • 样本含量:由于测定方法的复杂性或费 用问题,样本含量一般较小,因此统计 把握度较低
6-第四章生物标志物1
目前是将原油、 目前是将原油、氯仿沥青等混合物 分离成单个化合物从而进行鉴定的主要 技术。 技术。
(1)色谱技术原理 利用流动的稳定流体带着待分离样品 在装有吸附剂的细管中流动, 在装有吸附剂的细管中流动,使混合物在 流动过程中不断吸附-解吸, 流动过程中不断吸附-解吸,最终分子结 构简单、 构简单、分子量小的组分先从色谱柱出口 流出,分子结构复杂、 流出,分子结构复杂、分子量大的组分后 从色谱柱口流出, 从色谱柱口流出,达到对混合样品的分离 作用。再利用检测仪器进行检测。 作用。再利用检测仪器进行检测。
生物标志化合物
第一节 基本概念
一、生物标志化合物的概念及形成 二、生物标志化合物的研究意义 三、生物标志化合物的分析
三、生物标志化合物的分析
原油及烃源岩样品分析流程
1.岩石中可溶有机质抽提 1.岩石中可溶有机质抽提
可溶有机质:沉积物(岩)中可以被有机溶剂淬取 可溶有机质:沉积物( 抽提)出来的吸附或残留在岩石中的有机质。 (抽提)出来的吸附或残留在岩石中的有机质。
生物标志化合物
第一节 基本概念
一、生物标志化合物的概念及形成 二、生物标志化合物的研究意义 三、生物标志化合物的分析
生物标志化合物
第一节 基本概念
一、生物标志化合物的概念及形成 生物标志化合物:是沉积物( )、原油、 生物标志化合物:是沉积物(岩)、原油、 原油 油页岩和煤中那些来源于生物体,在有机质 油页岩和煤中那些来源于生物体, 演化过程中具有一定稳定性, 演化过程中具有一定稳定性,没有或很少发 生变化,基本保存了原始生化组分的碳骨架, 生变化,基本保存了原始生化组分的碳骨架, 记载了原始生物母质特殊分子结构信息的有 机化合物。 机化合物。 生物标志化合物从何而来? 生物标志化合物从何而来?
生物标志化合物
15
希 腊 中 新 世
10 5 0
原 油
0
15
20
25
30
15
20
25
正 构 15 烷 烃 质 10 量 分 数
(%)
30
5
西 非 下 白 垩 统 915m
正 构 烷 烃 质 量 分 数
(%)
C27
15 10 5 0 15 15 20 25 30
西 德 ( 莱 因 地 堑 ) 渐 新 世 925 m 岩 石 抽 提 物
四环萜烷也较广泛分布于原油和岩石抽 提物中。目前认为这个系列的化合物由五 环三萜烷类烃热降解或生物降解而成 (Aquino Neto等,1983) 。目前发现的 该系列化合物分布于C24~C27,有可能分布 到C35(Peters等,1993),常以C24丰度最 高。
(3) 长链三环萜烷
长链三环萜的结构特征是环上带有-个异戊二烯 结构单元的长链。这类化合物在油和沉积物中广泛 分布,并且其碳数一般以C19~C30为主,但在一些 原油中也检测出了C19~C45的三环萜,甚至碳数更 高,可达C54 。
0
15
20
25
30
15 10
5 0
西 非 下 白 垩 统 2425 m
10 5 0 15
突 尼 斯 古 新 始 2074m
岩 石 抽 提 物
20 25 30
15
20
25
30
分 子 的 碳 原 子 数
分 子 的 碳 原 子 数
图7-4 尤因塔盆地始新统沉积物和西非 下白垩统中的正构烷烃分布曲线线
图7-5 突尼斯和莱茵河谷下第三系岩石 抽提物中以及希腊中新世原油中分布曲
生物标志物
生物标志物科技名词定义中文名称:生物标志物英文名称:biomarker定义:用于监测和评价能够导致生物有机体的生物化学和生理学改变的化学污染物。
所属学科:海洋科技(一级学科);海洋科学(二级学科);环境海洋学(三级学科)本内容由全国科学技术名词审定委员会审定公布生物标志物:在亚个体和个体水平上既可以测定污染物暴露水平,也可以测定污染物效应的生理和生化指标。
对于疾病研究,生物标志物一般是指可供客观测定和评价的一个普通生理或病理或治疗过程中的某种特征性的生化指标,通过对它的测定可以获知机体当前所处的生物学过程中的进程。
检查一种疾病特异性的生物标志物,对于疾病的鉴定、早期诊断及预防、治疗过程中的监控可能起到帮助作用。
寻找和发现有价值的生物标志物已经成为目前研究的一个重要热点。
自1994年蛋白质组概念提出,定量蛋白质组学已经成为蛋白质组学研究的热点和中心。
定量蛋白质组学便是检测正常与疾病状态下组织全部表达蛋白质在量上的差别。
定量蛋白质组学中的蛋白质定量技术也成为发现生物标志物的重要途径。
生物标志物是生物体受到严重损害之前,在不同生物学水平(分子、细胞、个体等)上因受环境污染物影响而异常化的信号指标。
它可以对严重毒性伤害提供早期警报。
这种信号指标可以是细胞分子结构和功能的变化、可以是某一生化代谢过程的变化或生成异常的代谢产物或其含量,可以是某一生理活动或某一生理活性物质的异常表现,可以是个体表现出的异常现象,可以是种群或群落的异常变化,可以是生态系统的异常变化。
生物标志物分类从功能上一般分为:接触(暴露)生物标志物(biomarker of exposure);效应生物标志物(biomarker of effect);敏感性生物标志物(biomarker of susceptibility)选择生物标志物的原则1.所选择的生物标志物必须具有一定的特异性。
2.所选择的生物标志物必须具有足够的灵敏度,即所选标志物的水平与外接触水平要有剂量一反应关系,在无害效应接触水平下仍能维持这种关系。
生物科技的生物标志物
动态生物标志物
定义:随时间变化而变化的生物标志物 类型:生理性指标、生化指标、细胞学指标等 作用:监测疾病发展过程、评估治疗效果、预测疾病预后等 应用领域:医学、生物医学研究、药物研发等
生物标志物的应用领 域
医学领域
药物监测:监 测药物在体内 的分布、代谢 和排泄情况, 指导临床用药。
案例分析:某地区 空气污染对人群健 康的影响评估
THANK YOU
汇报人:
疾病诊断:利 用生物标志物 检测疾病的发 生、发展过程, 有助于早期诊 断和预后判断。
疗效评估:评 估药物治疗效 果,为调整治 疗方案提供依
据。
预测风险:通 过对生物标志 物的检测和分 析,预测个体 患某种疾病的
风险。
环境科学领域
监测环境污染
评估生态系统健康
预测环境风险
监测生态系统的变化
生物安全领域
常见的生物标志物包括血压、 血糖、血脂等。
生物标志物的作用
评估疾病风险和预后 监测疾病的发展和进程 指导临床用药和治疗方案 预测疾病复发和转移风险
生物标志物的分类
传统生物标志物
定义:指那些 在生物体内天 然存在、与疾 病或生理状态 相关的生物分
子
类型:蛋白质、 基因、代谢物
等
检测方法:实 验室检测、临
生物科技的生物标志物
汇报人:
目录
生物标志物的定义 和作用
生物标志物的分类
生物标志物的应用 领域
生物标志物的研究 现状和发展趋势
生物标志物的挑战 与问题
案例分析与应用实 例展示
生物标志物的定义和 作用
生物标志物的定义
生物标志物是体内发生变化的 指标
可以反映生物体的生理、生化 过程及其变化
生物标志物分类
生物标志物分类生物标志物是指在生物体内或外部环境中存在的一种物质,可以用来诊断、预测或监测疾病的发生和发展。
生物标志物的种类繁多,可以根据其来源、性质和应用领域等方面进行分类。
一、来源分类1.内源性生物标志物内源性生物标志物是指生物体内自身产生的物质,包括蛋白质、核酸、多肽、代谢产物等。
例如,血液中的血糖、胆固醇、尿素等,以及癌细胞产生的肿瘤标志物如CA125、PSA等。
2.外源性生物标志物外源性生物标志物是指生物体外部环境中存在的物质,包括细菌、病毒、毒素、化学物质等。
例如,空气中的PM2.5、水中的重金属、食品中的农药残留等。
二、性质分类1.蛋白质类生物标志物蛋白质类生物标志物是指生物体内或外部环境中存在的蛋白质,包括酶、激素、抗体、细胞因子等。
例如,血液中的C反应蛋白、肝功能指标如ALT、AST等,以及癌细胞产生的肿瘤标志物如CEA、AFP等。
2.核酸类生物标志物核酸类生物标志物是指生物体内或外部环境中存在的核酸,包括DNA、RNA等。
例如,血液中的病毒核酸如HIV、HBV、HCV等,以及癌细胞产生的肿瘤标志物如BRCA1、BRCA2等。
3.代谢产物类生物标志物代谢产物类生物标志物是指生物体内代谢过程中产生的物质,包括糖类、脂类、氨基酸、有机酸等。
例如,血液中的血糖、胆固醇、尿素等,以及癌细胞产生的肿瘤标志物如5-HIAA、NMP22等。
三、应用领域分类1.临床诊断生物标志物临床诊断生物标志物是指用于诊断疾病的生物标志物,包括肿瘤标志物、心肌酶、肝功能指标等。
例如,血液中的CA125、PSA等用于癌症的诊断,以及心肌酶如CK-MB、肝功能指标如ALT、AST 等用于心肌梗死和肝病的诊断。
2.疾病预测生物标志物疾病预测生物标志物是指用于预测疾病发生和发展的生物标志物,包括遗传标志物、代谢标志物等。
例如,BRCA1、BRCA2等遗传标志物用于预测乳腺癌和卵巢癌的发生风险,以及血液中的血糖、胆固醇等代谢标志物用于预测糖尿病和心血管疾病的发生风险。
生物标志物的检测方法及应用
生物标志物的检测方法及应用随着生物医学科学的发展,人们对疾病的认识越来越深刻,对于疾病的预防与诊治也变得越来越细致。
生物标志物是指生物体内的某种化学物质,可用于诊断疾病、监测治疗、评估患者复发和预后等方面。
生物标志物的检测方法也多种多样,如何选择最合适的检测方法,对于准确地使用生物标志物具有关键性意义。
一、生物标志物的分类生物标志物可按其检测原理来分类:(1)基于分子生物学方法,如PCR、RT-PCR、蛋白质组学等;(2)基于免疫学方法,如ELISA、荧光免疫法、放射免疫法等;(3)基于物理化学方法,如电化学法、质谱法、光学传感器等。
生物标志物还可按其生物特性分类:(1)生化标志物,包括血清蛋白、血清酶、神经肽等;(2)细胞标志物,包括肿瘤标志物等;(3)遗传标志物,包括染色体变异、基因突变等。
二、生物标志物的检测方法1.基于分子生物学方法PCR是最常见的一种基于分子生物学的生物标志物检测方法,可以快速高效地检测多种病原体。
PCR法适用于检测DNA、RNA等生物大分子,通常是将生物样本经过简单的提取处理,将其所需的核酸分离出来,再进行PCR扩增。
PCR方法的优势在于可以快速、敏感、特异地检测生物标志物,并且可以在样本中快速筛选出病原体。
不过PCR有一定的局限性,其较大的问题在于对于某些生物体内的标志物不易检测或不适用,比如RNA标志物就需要依靠转录酶反应(RT-PCR)进行扩增检测。
同时PCR需要许多精细、复杂的试剂和设备,具有一定成本,而且还容易出现阳性假阳性等问题,可能会影响检测结果的准确性。
蛋白质组学是一种通过质谱技术鉴定生物物种样本中蛋白质的方法,蛋白质组学可以检测到某些特定的蛋白质标志物,能够提供更全面的疾病信息,但其检测方法有较高的成本、复杂性和技术门槛。
2.基于免疫学方法免疫检测法就是利用抗体与抗原间的免疫偶联反应来检测生物标志物的方法。
免疫学方法通常是将所需的抗体与标准生物标志物做免疫反应,通过抗体与生物标志物的特异性结合从而完成标志物的检测。
生物标志物
生物标志物(biomarker)思路总结:第一部分:Biomarkers Introduction1.什么是生物标志物?生物标志物是生物体内对于单个或多个环境压力(污染物)和非化学的。
生物标志物反应,因此能够提供不良反应的早期预警。
生物标志物反应通常在亚致命毒性范围内观察到,作为对生长、繁殖和生存影响的前兆。
它们包括正常生理功能的细微变化,如生殖行为、疾病复原力和捕食能力,这些能力会对生物体的长期生存和生殖输出产生深远影响;最终,这些会影响生态系统健康(生物体受到严重损害之前,在不同生物学水平(分子、细胞、个体等)上因受环境污染物影响而异常化的信号指标。
它可以对严重毒性伤害提供早期警报。
这种信号指标可以是细胞分子结构和功能的变化、的变化或生成异常的代谢产物或其含量,可以是某一生理可以是个体表现出的异常现象,可以是种群或群落的异常变化,可以是系统的异常变化。
)2. 生物标志物的选择原则:1) 生物标志物必须能够表明暴露于污染物。
2) 生物标记物的反应必须能够与对个体和生态系统的影响联系起来 3) 必须具有足够的灵敏度,即所选标志物的水平与外接触水平要有剂量-反应关系,在无害效应接触水平下仍能维持这种关系。
3. 生物标志物的具体应用:种群或群体-- 但在这一水平上的影响通常是由于许多个体适应度的变化而产生的。
对于一个个体的有机体来说,接触污染物是有害的,因为它们改变了个体的正常生理,而这些变化通常可以在分子或亚细胞水平上测量。
在分子或亚细胞水平上的损伤是由酶过程、蛋白质表达和功能的变化、突变或Pollutant Exposure MolecularSub-cellular (organelle)CellularTissueSystematic (organ)OrganismPopulationCommunityEcosystem ‘Early’ biomarker signals ( rapid ) ‘Later’ effects ( slow )细胞膜降解导致细胞死亡引起的。
生物标志物
DOCS SMART CREATE
生物标志物:基础与应用
DOCS
01
生物标志物的定义与分类
生物标志物的概念及发展历程
生物标志物是一种具有生物学特征的指标
• 可以反映生物体内的生理过程和病理状态
• 可以作为疾病诊断、治疗和预防的依据
生物标志物的发展历程
• 20世纪初,生物标志物的研究开始兴起
• 用于心血管疾病筛查:如hs-CRP、NT-proBNP等
• 用于心血管疾病分期:如cTnI、TNT等
• 用于心血管疾病预后评估:如LDL-C、HDL-C等
⌛️
心血管疾病标志物在心血管疾病诊断中的挑战
• 如何提高心血管疾病标志物的灵敏度和特异性
• 如何实现心血管疾病标志物的定量分析和动态监测
生物标志物在其他疾病诊断中的应用
• 用于疗效评估:如监测肿瘤标志物的变化
03
生物标志物在靶向治疗中的挑战
• 如何实现生物标志物的精准检测和定量分析
• 如何提高靶向治疗的疗效和安全性
生物标志物在药物疗效评估中的应用
药物疗效评估的基本概念
• 是一种评价药物治疗效果的方法
• 可以为药物研究和临床应用提供依据
生物标志物在药物疗效评估中的应用
生物标志物研究的新技术
生物标志物研究的新方法
• 基因测序技术:如NGS、PCR等
• 生物信息学方法:如生物标志物筛选、生物标志物验证
• 蛋白质组学技术:如双向电泳、质谱等
等
• 代谢组学技术:如LC-MS、GC-MS等
• 系统生物学方法:如网络分析、模型构建等
• 临床流行病学方法:如队列研究、病例对照研究等
生物标志物分类及其在临床医学中的应用
生物标志物分类及其在临床医学中的应用【摘要】随着科学的不断进步,生物标志物在临床中的使用越来越多。
其是一种能够对疾病发生过程中进行判断的指示物,从标志物的特质上可以分成小分子、大分子、复合生物以及生物种群等几种。
这种标志物主要是用于医学中对疾病进行梳理和判断,并且能够对疾病发生过程中的发展方向及轻重程度进行检测。
尤其是对高危人群进行药物的临床治疗具体效果和预测其发病风险有着非常重要的意?x。
本文简述了生物标志物的种类以及其在临床医学中的应用。
【关键词】生物标志物;分类;临床医学;应用生物标志物是一种对生理状态、病理过程以及利用药物后的集体反应进行客观判断的指示物。
其可以对生物集体和环境之间发生作用时的特征性改变进行反应和检测。
其作为一种临床医学中的辅助手段,可以有效的判断疾病的发生原因,并对其发展方向和后续的治疗手段应用有着非常关键的作用。
但是生物标志物的选择需要进行研究和详细的临床医学验证,并要对其在特殊情况下的可行性进行充分考虑。
随着目前对生物标志物的深入研究,通过将生物标志物与临床医学上的检测手段进行共同运用,可以使疾病病情更准确更快速的诊断和判断。
随着生命科学的发展推动了对其的研究进展,并使生物标志物在医学中的应用更加的广泛。
1生物标志物的分类1.1小分子生物标志物小分子的生物物种非常多,其能够使人体进行生命活动和代谢的基础。
但是一些小分子的化合物也对人体有着一定的危害。
其在人体内所发生的变化可以当做对疾病判断和检测的具体指标。
如临床上对糖尿病的判断可以利用人体中的血糖或尿糖浓度作为依据。
肾功能疾病的判断可以根据肌酐浓度作为依据,冠心病的判断可以通过胆固醇的水平以及动脉硬化程度作为依据等[1]。
1.2大分子生物标志物大分子生物标志物可以分为核酸类、蛋白质类以及糖类和脂类等。
首先,核酸类主要说的是体内核糖核酸的水平。
核糖核酸(缩写为RNA),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。
生物学标志物
生物学标志物生物学标志物是指可以在体液、细胞或组织中检测到的特定分子,用于诊断、预测疾病、评估治疗效果和监测疾病进展等方面。
目前,生物学标志物已成为许多临床诊断和治疗的关键指标,为医学研究和临床实践带来了巨大的变革。
本文将介绍生物学标志物的基本概念、分类、应用和研究进展。
一、基本概念生物学标志物(biomarker)是指生物体内的某种可量化或可观测的物质或现象,可以作为药物治疗、预防、诊断、筛查、监测疾病等过程中的指标。
它们可以是蛋白质、核酸、代谢产物、激素、细胞因子、小分子等,也可以是影像学检查、检测技术等。
生物学标志物可以通过不同的检测技术进行检测,如实时荧光定量PCR(qPCR)、质谱法(MS)、免疫测定法(ELISA)等。
二、分类生物学标志物的分类可以从不同的角度进行划分。
1.从来源分:可分为内源性和外源性生物学标志物。
内源性生物学标志物来自于生物体内,包括蛋白质、代谢产物、细胞因子等;外源性生物学标志物来自环境和外界因素,包括有机化合物、人工化学物质等。
2.从诊断应用分:可分为临床生物学标志物和诊断生物学标志物。
临床生物学标志物在临床上广泛应用,如肿瘤标志物CA125、PSA等;诊断生物学标志物则用于诊断特定疾病,如糖尿病的血糖和糖化血红蛋白等。
3.从生物学特征分:可分为分子标志物、细胞标志物和影像学标志物。
分子标志物是指体内可检测的蛋白质、DNA、RNA等分子;细胞标志物是指在细胞水平发现的变化,如单克隆B细胞增生、白细胞计数等;影像学标志物则是指通过影像学技术获得的信息,如X光检查和核磁共振成像等。
4.从疾病阶段分:可分为早期诊断和治疗监控生物学标志物。
早期诊断生物学标志物用于早期发现疾病,如肿瘤标志物;治疗监控生物学标志物用于评估治疗效果和预测疾病进展,如心血管疾病的肌钙蛋白等。
三、应用生物学标志物在医学领域中具有广泛的应用,以下是常见的应用场景。
1. 诊断生物学标志物在疾病的诊断和筛查中具有重要作用。
生物标志物
泥炭沉积的类脂化合物(正构烷烃、脂肪醇、脂肪酸、甾酮、三萜类化合物和类异戊二烯、直链酯类等)、纤维素中C,H,O 同位素,以及泥炭腐殖化度和孢粉、生物化石等都是恢复古环境的良好指标。
虽然泥炭的这些气候代用指标能够反演古环境的相对干湿、冷暖,但并不能定量地给出温度值的大小。
1、GDGTs(甘油二烷基甘油四醚脂)研究较多的GDGTs化合物主要包括类异戊二烯类(GDGT-0~GDGT-4)和支链类(I~III)两大类,类异戊二烯GDGTs被认为是古菌细胞质膜中所特有,是古菌存在的生物标志化合物。
与该指标的相关内容:(1)CBT:环化指数(the Cyclisation ratio of Branched Tetraethers)(2)MBT:甲基化指数(the Methylation index of Branched Tetraethers(3)研究发现支链GDGTs 结构中甲基个数(MBT指数)主要受当地年平均大气温度(MAAT)影响,其次受环境pH影响;支链GDGTs结构中环戊烷个数(CBT指数)主要受环境pH控制。
(4)环化指数(CBT)/甲基化指数(MBT)是近年来根据支链四醚膜类脂(GDGTs)提出的定量化重建土壤pH和陆地年平均大气温度(MAAT)的生物标志物指标。
(5)Weijers等人提出的MBT/CBT 指标在近海、湖泊沉积中都得到了较好应用,并依此将MBT/CBT 指标应用到泥炭沉积中,讨论了指标在泥炭沉积中的适用性和应用潜力。
文章发表在2007年的《Geochimica et Cosmochimica Acta》上。
(6)许云平等利用GDGTs来重建全新世渤海湾有机碳的来源及沉积能量(2010年国家自然科学基金项目)。
由GDGTS衍生出的指标BIT比值可用作湖相、河口、滨浅海环境沉积物中判识有机质来源的重要指标。
(7)高效液相色谱-质谱仪(HPLC-MS)进行GDGTs分析(当前存在的主要问题)。
生物标志物
生物标志物生物标志物是指在生物体内特定的分子、细胞或基因,其存在或表达水平可以反映生物体的生理状态、疾病状态或对环境刺激的响应。
目前,生物标志物在医学诊断、疾病监测和药物研发等领域中起着重要作用。
通过检测生物标志物的改变,可以及早发现疾病、评估疗效,并指导个体化治疗的选择。
生物标志物的分类生物标志物可以根据其来源和性质分为不同类型。
根据来源可分为体液标志物、组织标志物和细胞标志物。
体液标志物是指在血清、尿液、唾液等体液中检测的标志物,常用于疾病的筛查和监测。
组织标志物则是指从组织样本中检测的标志物,例如肿瘤组织中的特定蛋白。
细胞标志物是指从细胞中检测的标志物,常用于癌症诊断和监测。
根据性质,生物标志物可分为蛋白标志物、核酸标志物和代谢产物等。
蛋白标志物是最常见的一类生物标志物,可以通过免疫学方法检测。
核酸标志物主要是指DNA和RNA的变异或表达水平,在癌症分子诊断中有重要作用。
代谢产物标志物则反映了细胞代谢的状态,可以帮助了解机体的代谢特征和健康状况。
生物标志物在临床应用中的意义生物标志物在临床应用中发挥着关键作用,可以帮助医生进行早期诊断、评估疾病进展和疗效监测。
以肿瘤疾病为例,许多肿瘤具有特异性的标志物,如癌胚抗原(CEA)、前列腺特异抗原(PSA)等。
通过检测这些标志物的水平,可以实现肿瘤的早期筛查和诊断,指导治疗方案的选择。
另外,生物标志物还可以用于监测慢性疾病的进展情况,例如糖尿病患者的血糖、血脂等生物标志物的测定可帮助医生调整治疗方案,预防并发症的发生。
在药物研发领域,生物标志物的应用也十分重要。
通过研究药物对特定生物标志物的影响,可以评价药物的疗效和安全性,实现个体化治疗的目标。
生物标志物的前景和挑战随着生物技术的不断发展,越来越多的新型生物标志物被发现并应用于临床实践。
例如循环肿瘤细胞、微生物组等新兴生物标志物的研究正在迅速发展,为疾病诊断和治疗带来新的机会。
然而,生物标志物的研究和应用仍面临一些挑战,如标准化、灵敏度和特异性等问题,需要不断完善和改进。
生物标志物种类范文
生物标志物种类范文生物标志物是指生物体内能够反映生物体健康状况、生理状态或患病程度的可测量物质。
它们通常可通过体液或组织中的化学物质进行检测,对于疾病的诊断、预测和监测起着重要的作用。
下面将介绍一些常见的生物标志物种类:1.血液标志物:-血糖:用于糖尿病的诊断和监测。
-血脂:如胆固醇和甘油三酯,用于心血管疾病的风险评估。
-血清肌酐:用于评估肾功能。
-血清尿酸:用于痛风的诊断和监测。
2.尿液标志物:-尿蛋白:用于肾疾病的评估。
-尿胆原:用于肝疾病的评估。
-尿液pH:用于酸中毒和碱中毒的诊断。
3.呼吸系统标志物:-肺功能测试:如肺活量和肺泡通气量,用于呼吸系统的评估。
-血氧饱和度:用于评估呼吸功能和缺氧程度。
4.消化系统标志物:-食管酸反流:用于胃食管反流病的诊断。
-幽门螺杆菌抗体:用于幽门螺杆菌感染的评估。
-胃蛋白酶原:用于胃癌和胃溃疡的早期筛查。
5.免疫系统标志物:-白细胞计数:用于判断炎症和感染程度。
-C反应蛋白:用于炎症和感染的监测。
-免疫球蛋白:用于免疫功能评估。
6.肿瘤标志物:-癌胚抗原:用于结直肠癌和其他消化道肿瘤的监测。
-髓系抗原:用于白血病和骨髓异常的诊断。
-前列腺特异抗原:用于前列腺癌的筛查和监测。
7.神经系统标志物:-脑钠肽:用于心脏和肾脏功能的评估。
-神经元特异性烯醇化酶:用于神经系统退行性疾病的诊断。
-神经元特异性肌钙蛋白:用于神经系统创伤的诊断和监测。
总结起来,生物标志物种类繁多,涉及到人体的各个器官和生理系统。
这些标志物在医学诊断和治疗中起着重要的作用,有助于及早发现疾病和评估治疗效果。
然而,需要注意的是,生物标志物的水平受多种因素的影响,因此在使用生物标志物进行诊断或监测时,还需要综合其他临床指标和病史资料进行综合分析和判断。
生物标志物定义
生物标志物定义
生物标志物(Biomarker)是指在生物体内,包括人类和其他生物,可用于指示生理状态、疾病过程或药物反应的一种可测量的指标。
它可以是分子、物质、细胞、组织或生理参数等,能够反映生物体内某种生物学过程的存在、程度或变化。
生物标志物在医学领域具有重要意义,可以用于疾病的诊断、预测、治疗监测和药物研发等方面。
通过分析生物标志物的变化,可以获取关于健康状况、疾病风险、疾病进程、治疗效果等方面的信息,从而指导临床决策和个体化治疗。
常见的生物标志物包括:
1. 生化标志物:如血液中的葡萄糖、胆固醇、酶活性等,可以用于糖尿病、心血管疾病等的诊断和监测。
2. 分子标志物:如基因、蛋白质、核酸等,可以通过检测基因突变、蛋白质表达水平或特定基因的表达量来预测肿瘤的发生和发展。
3. 影像学标志物:如X射线、CT、MRI等影像学检查中的特定结构、肿瘤大小等指标,可以用于疾病的早期筛查和治疗效果评估。
4. 组织学标志物:如肿瘤活检中的组织形态学特征、细胞核分裂指数等,可用于肿瘤的分期和预后评估。
生物标志物的选择应考虑其在特定疾病或生理状态下的特异性、敏感性、可重复性和可操作性等因素,并需要经过严格的验证和验证过程,以确保其在临床实践中的可靠性和准确性。
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生物标志物种类范文
生物标志物种类范文生物标志物(Biomarkers)是指可以反映生物体内部状态或作为特定生物过程的指标或指示物质。
它们可以是物质、分子、细胞或特定基因的组合,可以用于疾病的诊断、预测和监测,以及治疗效果的评估。
生物标志物的种类非常多样,下面将介绍一些常见的生物标志物。
1.蛋白质标志物:蛋白质是生物体内大量存在的一类分子,具有广泛的生物功能。
许多蛋白质可以作为疾病的标志物,如肿瘤标志物CA125、胰岛素抵抗标志物HOMA-IR等。
2.核酸标志物:核酸是构成生物体遗传信息的基本单位,包括DNA和RNA。
许多疾病的发生和发展与基因突变有关,因此基因突变或基因表达的变化可以作为疾病的标志物。
例如,乳腺癌基因BRCA1和BRCA2的突变是乳腺癌遗传易感因素。
3.代谢产物:代谢产物是生物体物质和能量代谢的产物,可以反映机体的代谢状态。
例如,尿酸是痛风的标志物,脂肪酸是脂肪代谢异常的标志物。
4.组织标志物:组织标志物是体内不同组织或器官特异性表达的蛋白质或其他分子。
它们可以用于疾病的诊断和预测,如前列腺特异抗原(PSA)用于前列腺癌的诊断。
5.微生物标志物:微生物标志物是病原微生物在机体内活动产生的物质。
例如,在尿液中检测到细菌或菌落计数可以作为尿路感染的标志物。
6.血液标志物:血液是具有重要生理功能的体液,许多疾病都能够通过检测血液中的特定分子来进行诊断。
例如,高密度脂蛋白(HDL-C)和低密度脂蛋白(LDL-C)是心血管疾病的标志物。
7.神经标志物:神经标志物是反映神经系统功能状态的物质。
例如,神经特异性烯醇化酶(NSE)是用于评估脑损伤严重程度的标志物。
8.生物标志物图谱:生物标志物图谱是一种综合分析多个生物标志物以提高诊断准确性和疾病监测的方法。
通过对多个生物标志物的定量分析,可以得到一个全面的生物标志物图谱,提高对疾病的敏感性和特异性。
总之,生物标志物种类繁多,可以作为疾病的指标来发现、监测和治疗疾病。
生物标志物 国自然基金
生物标志物是一种可以反映生物体内生理和病理状态的分子或细胞。
它们在医学、环境科学等领域有着广泛的应用,如疾病的早期诊断、疾病风险评估、治疗效果监测等。
近年来,随着科学技术的发展,生物标志物的研究越来越受到重视,国家自然科学基金也为此设立了专门的资助项目。
国家自然科学基金是我国科研领域最重要的资助机构之一,它为我国的科研人员提供了强大的资金支持。
在生物标志物领域,国家自然科学基金主要资助那些具有前瞻性、创新性和实用性的研究项目。
这些项目旨在发现新的生物标志物,研究其生物学功能和作用机制,以及开发新的检测技术和方法。
通过国家自然科学基金的资助,我国的生物标志物研究取得了一系列重要成果。
例如,研究人员发现了一些新的肿瘤标志物,这对于肿瘤的早期诊断和治疗具有重要意义。
此外,还有一些研究揭示了生物标志物与环境因素的关系,为我们理解和预防某些环境相关疾病提供了新的思路。
生物标志物的定义
生物标志物的定义
通常,生物标志物或生物标记物是指生物体在受到严重损害之前,由于生物体和环境因子相互作用而引起的任何可以测定的变化,包括生化、生理、免疫和遗传等多方面[3]。
早在1987年,美国国家科学院就首先将生物标志物定义为由生物体或样本测出的外来化合物所导致的细胞学或生物化学组分过程,以及结构或功能的变化[4]。
接着,在1992年,Benson和Di Giulio认为生物标志物是在生物个体所测得的生物化学、生理学或病理学反应,而这些生物学反应正好能给出环境污染物的暴露,或由暴露所引起的亚致死效应资料[5]。
而英国生物学家Walker C H等人在1996年发表专著中提到:生物标志物是机体对某种或某种化学物质的生物学反应,也可以用以衡量化学物质暴露,又是也用以衡量毒性效应[6]。
简言之,生物标志物是指能够反映致病因素或毒物从暴露到效应过程中,各个环节性质的特异性生物分子,如DNA、蛋白质、酶、脂质、糖类等;也指在各种效应过程中反映某种外来物质引发的生物化学反应以及各种数据指标。
生物标志物
香草醛、香草酮和香草酸
香豆酸和阿魏酸
参数
定义 S 系列单体总量与 V 系列单 体总量之比 C 系列单体总量与 V 系列单 体总量之比 100mg 有机碳中 V、S 和 C 系列单体的总量 10g 干样中 V 体、S 和 C 系 列单体的的总量 V 或 S 系列中酸类单体与醛 类单体的含量比
指征意义 区分木质素来源于被子植物或裸子植物(被子 植物 S/V=1~4,而裸子植物 S/V≈0) 区分木质素来源于草本组织或木本组织(草本 组织 C/V=0.1~0.8,而木本组织C/V<0.05 ) 反映总有机碳中木质素总量
S/V
C/V
Λ8
Σ8 (Ad/Al)V (Ad/Al)S P/(V+S)
反映样品中木质素总量 反映木质素降解程度(经过降解的木质素 Ad/Al>0.4,未降解的木质素 Ad/Al较小。)
P 系列单体总量与 V 和 S 系
列单体总量之和的比值 P 系列单体中酮的量和 P 系 列总量的比值
评估去甲基/去甲氧基降解程度,比值随着降解
木质素在碱性条件下经 CuO 氧化分解后生成 11 种单体
类型 对羟基酚类 (P类) 紫丁香基酚 类(S类) 香草基酚类 (V类) 肉桂基酚类 (C类) 单体 对羟基苯甲醛、对羟基苯乙酮和 对羟基苯甲酸 丁香醛、丁香酮和丁香酸 来源 非陆源植物特有
被子植物木质素 所有维管植物木质素,裸子植 物几乎只含V 木本植物的叶或草本植物的 木质素
木质素的检测
木质素是一种以苯丙基为单体"通过碳 碳键和醚键连结的天然大分子聚合物
现有的分析技术很难对其进行直接的定 量分析,利用化学分解的方法将其结构 单元转化成易于检测的小分子化合物
降解方法
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石油大学:任拥军
二00七年四月
主要内容
一、 油藏地球化学简介
二、油藏地球化学描述现状、发展趋势
三、生物标志化合物
四、同位素地球化学 五、烃源岩研究和油源对比
六、包裹体地球化学 七、石油的地球化学成因、类型 和影响因素 八、油藏地球化学的基本原理和 基础研究 九、油藏地化在油气田勘探开发 中的具体应用
原油及烃源岩样品分析流程
1.岩石中可溶有机质抽提
可溶有机质:沉积物(岩)中可以被有机溶剂淬取 (抽提)出来的吸附或残留在岩石中的有机质。
研究原油生物降解程度:成藏以后油藏进入 细菌活动带,细菌会选择性地破坏一些生物 标志物,通过检测生物标志物被细菌降解的 情况,可以确定油藏形成以后演化的历史。
生物标志化合物
第一节 基本概念
一、生物标志化合物的概念及形成 二、生物标志化合物的研究意义 三、生物标志化合物的分析
三、生物标志化合物的分析
之后许多学者根据原பைடு நூலகம்组成非均质 性(Hillebrand和Leytheauser, 1992)、地层测试(Saigal等,1992) 和高压物性资料(England和Mackenzie, 1989;England和Mackenzie,1995)、 生物标志物成熟度参数(Horstad等, 1990)研究了油藏的充注系统。这些技 术和方法大大地促进了地球化学研究向 油藏评价和油田开发领域的延伸。
Bjorфy(1985,1992,1993)把热 蒸发(即热脱附)—气相色谱—火焰离 子检测(FID)或质谱(MS)技术引进地 球化学研究领域,为油藏地球化学研究 所需要的大量样品的扫描分析创造了条 件。CHEVRON公司Kaufman等(1990)利 用原油中大量化合物的“气相色谱指 纹”,研究多薄层油藏的连通性和产量 贡献取得成效。
第一节 基本概念
一、生物标志化合物的概念及形成 二、生物标志化合物的研究意义 三、生物标志化合物的分析
一、生物标志化合物的概念及形成
生物标志化合物:是沉积物(岩)、原油、 油页岩和煤中那些来源于活的生物体,在有 机质演化过程中具有一定稳定性,没有或很 少发生变化,基本保存了原始生化组分的碳 骨架,记载了原始生物母质特殊分子结构信 息的有机化合物。
2001年侯读杰等出版了“油藏及开发地 球化学导轮”。
第二部分:研究历程、现状
长期以来,石油地球化学的主要目标是面向 油气勘探,石油地球化学家的主要研究任务是鉴 别与评价含油气盆地的烃源岩、进行油源对比、 确定区域性的有机质成熟度和热演化史、计算生 油量(乃至资源量),为区域勘探决策提供依据。 对油气藏形成规律与油气藏中流体特征的研 究则较为薄弱,因此在区域勘探阶段之后,进入 油藏评价乃至滚动勘探开发和油藏开发阶段,有 机地球化学所发挥的作用是非常有限的。
促进油藏地球化学发展的驱动力:
许多石油公司朝着更为专事采油生产企业方向 发展的结果。 80年代中期以来,由于全球范围内未经石油勘 探开发的沉积盆地日趋缩小,海洋与荒漠地区勘探 费用日益高昂,加之世界石油市场油价下跌,导致 国际石油勘探市场渐趋萎缩。世界石油工业面临着 在勘探成熟盆地如何增储上产,确保下一世纪能源 需求的问题。一些石油公司把重点从区域性油气勘 探,转向专事油田开发生产,同时又面临现有油田 如何提高采收率的问题。
1993年王培荣主要采用Rock-eval岩石热解 和薄层色谱—火焰离子检测技术,对塔里木塔中 4号构造的3口井石炭系油藏进行有机地球化学描 述的初步尝试,研究了三个油藏的油源与主要充 注方向,检测出3个“沥青质或稠油富集层”, 标志3个不同深度的古、今油水界面,从而对油 藏演化与保存史有所认识。
1994—1995年王延栋和廖永胜等,引进全 烃地球化学分析技术,进行储层烃地球化学研 究,重点进行油源和油气运聚带的研究。 1995年,梅博文、张敏等对塔里木盆地哈 2—3构造作了油藏地球化学描述,并讨论了库 车油气系统油气藏聚集史。 1996年廖永胜、王庭栋等以渤海湾盆地埕 岛油田、曲堤地垒和四川盆地磨溪气田为例开 展了“油藏地球化学”专题研究。
主要参考文献
1.钟宁宁、张枝焕,石油地球化学进展,石油工 业出版社,1998,5 2.K.E.Peters、J.M.Moldowan著,姜乃煌等译, 生物标记化合物指南,石油工业出版社,1995,11 3.王大锐,油气稳定同位素地球化学,石油工业 出版社,2000.7 4.侯读杰、张 敏等,油藏及开发地球化学导论, 石油工业出版社,2001.6
80年代初、中期,国内外石油行业中兴起油藏
描述(或油藏表征)与“储层地球化学”研究热潮,
但这两项研究的重心仍强调储层物性空间变化规律 的研究。 自1985年以来,石油地球化学家的研究焦点也
日益明显地从勘探转向采油和与油藏有关的问题。
1984年B.Durand在一篇运移研究的综述性文
章中提出了“油气藏有机地球化学”(Organic
国外学者九十年代初开始关注“烃类流体侵 位与储层成岩作用”领域的研究。 一是由于早期烃类流体侵位有利于优质储层 形成。
二是储层成岩记录有助于重构油气成藏过程。
我国的研究标志: 1996年林壬子教授等人编译了“油藏地 球化学进展” ; 1997年王铁冠教授等人编译了“油藏地 球化学”; 1997年蔡春芳等人出版了“塔里木盆地 流体—岩石相互作用研究”, 1998年林壬子教授等人主编了“油气勘 探与油藏地球化学” 。
在这个背景下,油藏地球化学应运而生。
八十年代以来,首先是西北欧的地球化学 家从北海的勘探开发过程中存在的问题入手, 结合勘探卫星油藏和服务于油田开发,率先开 展地球化学描述,研究油藏注入聚集成藏历史, 揭示油气混合成藏模式,以至进行油藏开采过 程的生产监测,改进采油工艺,从而奠定了油 藏地球化学的基础。
无机地球化学的研究重点则总是与沉积学相结合, 其焦点则总是瞄准油层质量,并且大部分无机地球化学 研究专一地涉及岩石基质,这在描述和定量评价岩石性 质方面发挥着重要的作用。
忽略了油藏流体中包含的地质学和地球化学信息,
从而忽略了对油气藏中流体的研究,这也就不可避免地 限制了无机地球化学的在油气田勘探、开发中的作用。
如果说70年代和80年代石油地球化学的热门 话题是干酪根学说和生物标志化合物理论的话,那 么,90年代是油气成藏的地球化学机制以及油气田 开发的地球化学技术。因此这次战略转移必然带来 几个变化:
首先,主要的研究对象已经不是烃源岩而 是储集岩; 其次,不再局限于有机地球化学问题,而 是广泛地涉及到许多无机地球化学的问题; 第三,是必须采用一系列新的分析技术和 新的指标体系。
油藏地球化学是80年代中后期国际上新兴的一门 地球化学分支,也是地学与石油工程学之间的边缘 交叉学科。实际上它是传统的有机和无机地球化学 与与油藏工程、石油工程密切结合的产物。
油藏地球化学采用现代地化分析技术,结合各项 工程作业资料直接研究油藏流体(油气水)的非均 质性形成机理和分布规律及其与岩石矿物的相互作 用,探索油气充注、聚集历史与定位成藏化学机制。 在理论上它与含油气系统、油源灶和油气运移研 究接轨,在实践中,与油田勘探、油藏描述与评价、 油田开发与采油工艺等领域关系密切。
我国:“七五”中期,梅博文、殷凤祥、陈丽 华等最先开展油田水有机酸分析,研究“生油层— 储层的有机—无机相互作用”对储层物性的影响, 这也应当是油藏地球化学的研究范畴。
1992年洪志华等采用热解分析、荧光光谱、族 组成、碳同位素、元素、红外光谱、气相气谱等常 规地球化学分析技术,对塔里木盆地东河11井石炭 系储层原油进行地球化学研究,在识别油层与认识 其含油性方面取得进展。
在上述油藏地球化学的探索性研究进展 的基础上,一个主要由英国纽卡斯尔大学和 挪威奥斯陆大学的地球化学家和沉积学家等 参与的国际合作研究项目,将油藏流体地球 化学描述与成岩作用研究相结合,成功地剖 析了北海Ula油田的油藏聚集史,将油藏地球 化学研究提高到一个新的水平(Larter等, 1991)。
Geochemistry in Reservoir on Migration)。 Dahl和Speer(1986)最早注意并检测到北 海Osberg油田石蜡基原油油藏的古、今油水界面
处的焦油席,并探讨了其形成机理及其对注水采
油的影响。
England等(1987)通过Fortiers油田的地球化学 研究,首次将人们早已认识到的油藏流体非均质性现象 与成藏研究结合起来,提出了油藏充注与原油混合模式, 并首次阐明了油藏地球化学的概念,从而奠定了油藏地 球化学的理论基础。 England1990年并进一步论述了石油注入油藏后的 混合作用机理,在一篇讨论油气运聚和混合作用的文章 中除了用“油藏有机地球化学”(Organic Geochemistry of Petroleum Reservior)标题外, 在关键词中还用了“油藏地球化学”(Reservoir Geochemistry)这一术语。
油源对比:为原油及其油源岩的成因联系、油-油、 气-油、气-岩成因联系提供一系列参数 和指标。 是含油气系统、油气成藏机理研究的重要内容. 恢复沉积环境:不同环境有不同的生物组合、不 同的生物标志物,利用原油或烃 源岩中生物标志物组成特征,可 以查明烃源岩及其盆地沉积环境 特征。
油气运移提供证据:烃源岩和疏导层对油气运 移起到色层效应,利用这种效应可以追溯油 气运移路径和方向.
生 物 标 志 物 的 类 别
正构烷烃 无环类异戊二烯烷烃 二环-四环异戊二烯烷烃 藿烷系列 甾烷 芳香烃 含氮化合物、卟啉
第一节 基本概念
一、生物标志化合物的概念及形成 二、生物标志化合物的研究意义 三、生物标志化合物的分析
二、生物标志化合物的研究意义
生物标志化合物在有机质热演化过程中: 一方面在各种作用下,发生一定的结构变化, 以达到热力学上的稳定性。这些变化包括失去不 稳定的官能团,不饱和的链加氢变为饱和的结构, 发生芳构化以及异构化和分子的重排等。 结构上的“变异性”使其能够用于追溯有 机质的演化历程。 另一方面仍然保留其母体基本碳骨架 正是这种结构上的继承性使其具有标志 有机质来源及沉积环境的作用。