细菌的分类和鉴定

（一）生理学与生化学分类法
主要以细菌的形态、染色以及细菌的特 殊结条件等等。 主要有两种方法 1、传统分类法
2、数值分类法
1、传统分类法
主要以细菌的形态、生理特征为分类基 础，选择一些较稳定的生物学性状如细菌的 形态结构、染色性、培养特性、生化反应、 抗原性等作为依据，然后按主次顺序逐级区 分。
（二）生理生化特征
包括营养类型、与氧的关系、对温度的适应 性、碳水化合物的代谢试验、蛋白质和氨基酸的 代谢试验及的碳源和氮源利用试验、各种酶类试 验、抑菌试验等等。 生理生化特征特点： 对微生物生理生化特征的比较也是对微生物 基因组的间接比较； 测定生理生化特征比直接分析基因组要容易；
六、微生物分类鉴定的依据
根据微生物分类学中使用的技术和方法，可 把它们分成四个不同的水平：
①细胞形态和行为水平； ②细胞组分水平； ③蛋白质水平； ④基因组水平。
在微生物分类学发展的早期，主要的分类鉴 定指标是以在细胞形态和习性为主，可称为经典 的分类鉴定法
七、细菌的分类方法
生物分类的传统指标
1、DNA G+C mol%测定
DNA分子两条链上4种碱基的总分子量 为100，测定其中G+C或A+T摩尔百分比， 能反应出细菌间DNA分子的同源程度，习惯 上以G+C 作为细菌的分类标记。 不同菌属间的G+C mol%范围很大，在 25%~75%之间，但同一种细菌G+C mol% 相当稳定，不受菌龄、培养条件和其它外界 因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们G+C mol%越接近（但并非G+C mol%越接近， 亲缘关系就越近？？？）。
细菌的命名依据“国际细菌命名法规” 的规 定，学名用拉丁文，遵循“双名法”。即每一种 细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分构成，属
名第一个字母必须大写，其余均应小写（即使种
名以人名或地名命名）。整个属名及种名在出版 物中应排成斜体。 如：Escherichia coli 属名+种名
五、细菌的命名（二）
2、数值分类法
对细菌各种生物学性状按“等重要原则” 进行分类，选用多项生理、生化指标逐一进 行比较，通过查表或计算机分析各菌间相似 度，完成细菌分类。
（二）遗传学分类法
以细菌的核酸、蛋白质等在组成的同源 性程度分类。 主要有三种方法 1、DNA G+C mol%测定 2、核酸同源值测定 3、核蛋白体RNA碱基序列测定
（三）两类分类法的优点和意义
方 法 优 点 意 义
生理学与生化学 方便、简单、廉 主要用于鉴定 分类法 价 准确、可靠； 遗传学分类法 有利于了解细菌 主要用于分类 的进化和原始亲 缘关系
三、原核微生物（广义细菌）分类系统
《伯杰鉴定细菌手册》
(Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology)
伯杰氏手册:是目前进行细菌分类、鉴定的 最重要参考书，其特点是描述非常详细，包括 对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实 验的具体方法。
四、细菌的分类等级
界 （Kingdom）
门 （Phylum）
纲（Class）
目（Order） 科（Family） 属（Genus） 种（Species）
五、细菌的命名（一）
形态学特征指标特点：
易于观察和比较，尤其是真核微生物和具有特
殊形态结构的细菌；
许多形态学特征依赖于多基因的表达，具有相
对的稳定性；
（二）生理生化特征
包括营养类型、与氧的关系、对温度的适应 性、碳水化合物的代谢试验、蛋白质和氨基酸的 代谢试验及的碳源和氮源利用试验、各种酶类试 验、抑菌试验等等。 生理生化特征特点： 对微生物生理生化特征的比较也是对微生物 基因组的间接比较； 测定生理生化特征比直接分析基因组要容易；
几种不同的书写情况
属名重复出现，可缩写
如：E.coli （大肠杆菌）； 只确定属名，未确定种名的某一株细菌 Salmonella sp. （沙门菌属）； 只确定属名，未确定种名的若干菌 Salmonella spp. 亚种用subsp.（正体）表示 Pasteurella multocida subsp. septica
一、微生物的分类
根据微生物的大小、结构、组成等分三类
原核细胞 如：细菌、放线菌、螺旋体、支原体、 型 衣原体、立克次体。（也称广义的细菌）
真核细胞 如：真菌、原虫 型 非细胞型 如：病毒、亚病毒、朊粒
二、细菌的分类方法
根据每种细菌各自特征，并按照它们的 亲缘关系分类，分类方法有两类 1.生理学与生化学分类法（传统方法） 2.遗传学分类法
2、核酸同源值测定
为什么不能说G+C mol%越接近，亲缘 关系就越近？ 因为G+C mol%只能反映细菌的碱基总 数而不能反映碱基序列！！！ 而利用DNA分子杂交的技术就可以精确 测定DNA分子的碱基序列。这就是核酸同源 值测定。
3、核蛋白体RNA碱基序列测定
核蛋白体RNA碱基序列测定属于核酸范 畴。 由于核蛋白体RNA（rRNA）序列比较保 守，其变化十分缓慢。其中，16s rRNA具 有高度的保守性和特异性以及该基因序列足 够长，因此，被作为细菌鉴定的快速、准确 方法，素有“细菌化石之称”。
分子生物学指标
微型、简便、快速或自动化鉴定技术
细菌的数值分类
八、生物分类的传统指标
形态学特征 生理、生化学特征
从不同层次，用不同学科的技术方法来研究和比较 不同微生物的细胞、细胞组分或代谢产物，从中发现反 映微生物类群特征的资料。
（一）形态学特征
包括培养特征、细胞形态及其染色特性、 特殊的细胞结构、运动性等等。