细菌的分类及命名PPT
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❖ 学名用拉丁文，遵循“双名法”。 ❖ 每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分
组成如：产气荚膜梭菌（Clostridium
perfringens） ▪ 属名在前，字首字母要大写，其余小写
▪ 整个属名及种名在出版物中应排成斜体
▪ 中文译名，种名在前，属名在后
2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属 名和种名之后，往往还要加上首次定 名人（加括号）、现名定名人和现名 定名年份，这些均用正体排字。 ▪ 一般兽医学及医学微生物学文献中， 属名和种名之后的部分均予省略。 ▪ 如：Escherichia coli
门 Phylum (拉：Phylum))
纲 Class (拉：Classis)
目 Order (拉：Ordo)
科 Family (拉：Familia)
属 Genus（拉：Genus）
种 Species（拉：Species）
科及科以上的划分在细菌不太完善，且随 着研究的深入科属的划分会发生变动
1、属（genus）性状相近、关系密切的 若干菌种组成一个菌属，与其他属有明 显差异。
6、如果是新种，在新种的拉丁文学名 之后还要加上“sp.nov。”，nov是 novel的缩写。 ▪ 例如Lawsonia intracellularis gen．Nov. sp . Nov.，译为：胞内劳 森菌，新属新种。
7、亚种用subsp.(正体字)表示，这是 subspecies的缩写， ▪ 例如Pasteurella multocida subsp．septica，中译名为多杀性巴 氏杆菌败血亚种。
3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音 规则读念
4、属名重复出现时，拉丁文可缩写， 用第一个字母，为避免混肴，也可用 2个字母。大肠杆菌(E.coli)
5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌， 其拉丁文学名可在属名之后加sp．(正体字)； 如果同属未定种名的若干菌株，则用 spp． (species 的缩写， sp. 表示单数，spp. 表示复数 ) ， ▪ 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， ▪ Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。
细菌的分类及命名
一、 细菌的分类地位 二、 细菌的命名 三、 细菌分类鉴定的标准 四、 细菌的分类体系 五、 细菌的鉴定
一、细菌分类学——对细菌进行分类， 命名Leabharlann Baidu鉴定的 一门学科。
任务：
•在全面了解细菌生物学特征的基础上， 研究它们的种类，探索其起源，演化以 及与其他类群之间的亲缘关系，进而提 出能反映自然发展的分类系统，并将细 菌加以分门别类。
❖ 研究细菌的种系发生关系主要采用三种 方法： ▪ 1）测定DNA碱基(G+C)mol％ ▪ 2）核酸分子杂交 ▪ 3）16SrRNA寡核苷酸编目
1）DNA碱基G+C%比例的测定
简称GC比 （G+C）%=—G—+C———×100%
A+T+G+C
亲缘关系相近的种ＧＣ比也相近， ＧＣ比差别大亲缘关系必然远 种内差距2.5~4.0％, 种间>5%, 属间 差距>10%
细菌分类学包括分类，命名和鉴定
1、细菌分类：根据细菌各自的特征，并 按照亲缘关系分类，以不同等级编排系 统。分类有两种：
①细菌的生理生化分类法，包括有传 统分类法和数值分类法。
②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度 进行分类法，称种系分类或自然分类。
2、细菌命名：在分类基础上，给每种 细菌一个科学名称，便于交流并保证所 有的科研工作者给予同样名称。 3、细菌鉴定：将未知细菌按分类原则， 确定细菌的分类地位。
二、细菌的分类地位
1、过去属于植物界，
古菌
现在划为：原核生物
细菌
❖ 在兽医微生物中，古细菌不占重 要地位
2、细菌还包括
▪ 衣原体、立克次氏体、霉形体、 螺旋体、放线菌等→对动物和人 具有致病作用
▪ 蓝细菌、紫色光合细菌等
3、细菌的分类单元
细菌的分类单元与动植物一样，依次为
界 Kingdom (拉：Regnum)
2）核酸分子杂交法
DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA
方法: 待测菌株dsDNA------ssDNA 参照菌株，同位素标记的ssDNA 检测杂合DNA的放射性强度，参照菌株自 身为DNA复性的放射性强度100%
DNA-DNA杂交同源性性 >60%为同种 >70%同一亚种 20~60%为同一属
金黄色葡萄球菌的学名为 命名年份
Staphylococcus aureus Rosenbach
1884 属名葡萄球菌 种名金黄色 命名人的姓
恶臭消化链球菌的学名
改名者
Peptostreptococcus foetidus （ Veillon ）Smith
属名消化链球菌 种名恶臭 原命名者
恶臭消化链球菌是由 Veillon 首先发现和定名的 ，后 Smith 重新定为现名。
3）rRNA寡核苷酸编目分析
2、种（species）是细菌学分类的最基本 单元，生物学性状基本相同的细菌群体 归成一个菌种。
3 、 菌 株 （ strain ） 是 不 同 来 源 的 某 一 种 细菌的纯培养物。
三、细菌的命名
1、细菌的命名依据“国际细菌命名法规”(The
International Code of Nomenclature of Bacteria)
四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的 作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有 应用价值。
2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。
❖ 例如 ▪ 大肠埃希菌的学名全名是：
Escherichia coli(Migula) Castellani et Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。
▪ 金黄色葡萄球菌的学名为：
组成如：产气荚膜梭菌（Clostridium
perfringens） ▪ 属名在前，字首字母要大写，其余小写
▪ 整个属名及种名在出版物中应排成斜体
▪ 中文译名，种名在前，属名在后
2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属 名和种名之后，往往还要加上首次定 名人（加括号）、现名定名人和现名 定名年份，这些均用正体排字。 ▪ 一般兽医学及医学微生物学文献中， 属名和种名之后的部分均予省略。 ▪ 如：Escherichia coli
门 Phylum (拉：Phylum))
纲 Class (拉：Classis)
目 Order (拉：Ordo)
科 Family (拉：Familia)
属 Genus（拉：Genus）
种 Species（拉：Species）
科及科以上的划分在细菌不太完善，且随 着研究的深入科属的划分会发生变动
1、属（genus）性状相近、关系密切的 若干菌种组成一个菌属，与其他属有明 显差异。
6、如果是新种，在新种的拉丁文学名 之后还要加上“sp.nov。”，nov是 novel的缩写。 ▪ 例如Lawsonia intracellularis gen．Nov. sp . Nov.，译为：胞内劳 森菌，新属新种。
7、亚种用subsp.(正体字)表示，这是 subspecies的缩写， ▪ 例如Pasteurella multocida subsp．septica，中译名为多杀性巴 氏杆菌败血亚种。
3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音 规则读念
4、属名重复出现时，拉丁文可缩写， 用第一个字母，为避免混肴，也可用 2个字母。大肠杆菌(E.coli)
5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌， 其拉丁文学名可在属名之后加sp．(正体字)； 如果同属未定种名的若干菌株，则用 spp． (species 的缩写， sp. 表示单数，spp. 表示复数 ) ， ▪ 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， ▪ Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。
细菌的分类及命名
一、 细菌的分类地位 二、 细菌的命名 三、 细菌分类鉴定的标准 四、 细菌的分类体系 五、 细菌的鉴定
一、细菌分类学——对细菌进行分类， 命名Leabharlann Baidu鉴定的 一门学科。
任务：
•在全面了解细菌生物学特征的基础上， 研究它们的种类，探索其起源，演化以 及与其他类群之间的亲缘关系，进而提 出能反映自然发展的分类系统，并将细 菌加以分门别类。
❖ 研究细菌的种系发生关系主要采用三种 方法： ▪ 1）测定DNA碱基(G+C)mol％ ▪ 2）核酸分子杂交 ▪ 3）16SrRNA寡核苷酸编目
1）DNA碱基G+C%比例的测定
简称GC比 （G+C）%=—G—+C———×100%
A+T+G+C
亲缘关系相近的种ＧＣ比也相近， ＧＣ比差别大亲缘关系必然远 种内差距2.5~4.0％, 种间>5%, 属间 差距>10%
细菌分类学包括分类，命名和鉴定
1、细菌分类：根据细菌各自的特征，并 按照亲缘关系分类，以不同等级编排系 统。分类有两种：
①细菌的生理生化分类法，包括有传 统分类法和数值分类法。
②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度 进行分类法，称种系分类或自然分类。
2、细菌命名：在分类基础上，给每种 细菌一个科学名称，便于交流并保证所 有的科研工作者给予同样名称。 3、细菌鉴定：将未知细菌按分类原则， 确定细菌的分类地位。
二、细菌的分类地位
1、过去属于植物界，
古菌
现在划为：原核生物
细菌
❖ 在兽医微生物中，古细菌不占重 要地位
2、细菌还包括
▪ 衣原体、立克次氏体、霉形体、 螺旋体、放线菌等→对动物和人 具有致病作用
▪ 蓝细菌、紫色光合细菌等
3、细菌的分类单元
细菌的分类单元与动植物一样，依次为
界 Kingdom (拉：Regnum)
2）核酸分子杂交法
DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA
方法: 待测菌株dsDNA------ssDNA 参照菌株，同位素标记的ssDNA 检测杂合DNA的放射性强度，参照菌株自 身为DNA复性的放射性强度100%
DNA-DNA杂交同源性性 >60%为同种 >70%同一亚种 20~60%为同一属
金黄色葡萄球菌的学名为 命名年份
Staphylococcus aureus Rosenbach
1884 属名葡萄球菌 种名金黄色 命名人的姓
恶臭消化链球菌的学名
改名者
Peptostreptococcus foetidus （ Veillon ）Smith
属名消化链球菌 种名恶臭 原命名者
恶臭消化链球菌是由 Veillon 首先发现和定名的 ，后 Smith 重新定为现名。
3）rRNA寡核苷酸编目分析
2、种（species）是细菌学分类的最基本 单元，生物学性状基本相同的细菌群体 归成一个菌种。
3 、 菌 株 （ strain ） 是 不 同 来 源 的 某 一 种 细菌的纯培养物。
三、细菌的命名
1、细菌的命名依据“国际细菌命名法规”(The
International Code of Nomenclature of Bacteria)
四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的 作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有 应用价值。
2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。
❖ 例如 ▪ 大肠埃希菌的学名全名是：
Escherichia coli(Migula) Castellani et Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。
▪ 金黄色葡萄球菌的学名为：