GSAS软件操作简介

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GSAS软件操作简介

GENERAL STRUCTURE ANALYSIS SYSTEM

目前常用的Rietveld结构精修软件有GSAS, Fullprof, Rietan, BGMN, DBWS, WinPLOTR等等,其实他们的核心算法都是一样的。DBWS是最早的精修软件,但由于其是DOS操作界面,目前用户越来越少。而GSAS由于操作方便、界面友好、更新迅速而得到广泛使用。

GSAS有两个版本的软件,一个叫PC-GSAS,另外一个叫EXPGUI。

PC-GSAS是Los Alamos National Laboratory的Allen C. Larson和Robert B. Von Dreele编写的,联系方式Bob von Dreele - *****************,文章引用应标明:A.C. Larson and R.B. Von Dreele, "General Structure Analysis System (GSAS)", Los Alamos National Laboratory Report LAUR 86-748 (1994).

PC-GSAS是基于人机对话的方式,操作起来稍显复杂。在这儿我们主要介绍EXPGUI。EXPGUI是B. H. Toby在GSAS的基础上编写的图形用户界面(Graphical User Interface)程序,可以说EXPGUI囊括了我们所经常用到的大部分GSAS的功能,但不是全部。文章引用应标明:B. H. Toby, EXPGUI, a graphical user interface for GSAS, J. Appl. Cryst. (2001). 34, 210-213.联系方式: Brian Toby - ******************

本文主要包括以下几个部分:

1.软件下载与安装

2.数据导入与模型建立

3.结构精修过程过程(背景函数,晶格参数,峰形参数,原子位置,温度因子,择优取向)

4.数据导出与处理

1.软件下载与安装

主页/solution/gsas/

下载地址:

ftp:///public/gsas/

/ccp/ccp14/ftp-mirror/gsas/public/gsas/

ftp:///ccp14/ftp-mirror/gsas/public/gsas/

http://ccp14.sims.nrc.ca/ccp/ccp14/ftp-mirror/gsas/public/gsas/

作者编写了非常详细的使用说明文件:GSASManual.pdf,可以从网上下载:

ftp:///public/gsas/manual/GSASManual.pdf.

/ccp/ccp14/ftp-mirror/gsas/public/gsas/manual/GS ASManual.pdf

EXPGUI可以运行在多种平台:Windows,Mac,UNIX,Linux,SGI。在Windows操作系统下面只要运行gsas+expgui.exe,按照提示就可以顺利完成安装。

2. 数据导入与模型建立

2.1 格式转换

GSAS可以处理中子衍射(飞行时间数据和固定波长数据)和X射线衍射。关于中子衍射可以参考GSASManual的实例,也可以随时随地按F1获得在线帮助。我们主要演示X射线粉末衍射数据的Rietveld拟合。

由于不同的衍射仪公司都有自己的数据格式,因此我们必要把不同公司的数据格式转换为GSAS的数据格式。Powder4程序可以完成数据转化。用Powder4打开衍射数据,然后保存为Gsas CW ESD 格式。

2.2 结构模型

下面以高温超导体YBa2Cu3O7-x为例讲述GSAS精修过程。YBCO的晶体结构如下所示,我们一步一步的建立这个结构模型。

运行EXPGUI.exe,选择文件存储路径和文件名,会跳出一个对话框,点Create,创建一个新的文件。出现如下所示的EXPGUI的主界面。

单击Phase按钮,建立结构模型,有几种不同的方法。

2.2.1 手动输入

点击Add Phase按钮,出现add new phase窗口,输入Phase title,空间群Pmmm,晶格常数a,b,c,α,β,γ。点Add按钮,没有错误的话添加完成,如果空间群输入有误则会提示。

接下来点add atoms按钮,出现add new atom对话框。输入每个原子的元素符号,名称,原子位置,占有几率,温度因子,最后点add atoms按钮完成输入。X U F

2.2.2用CIF文件建立结构模型

Crystallographic Information File (CIF) 文件包含了晶体结构的所有信息。因此如果有CIF文件的话可以从CIF文件直接导入建立结构模型。CIF文件可以从ICSD数据库(http://icsdweb.fiz-karlsruhe.de/index.php)下载。

点击Add Phase按钮,出现add new phase窗口,点击Import phase from: 出现下拉菜单,选择CIF文件,然后找到CIF文件存放的地址,打开CIF文件就可以完成晶格结构和原子信息的输入。如果以前做过GSAS精修,那么也可

以选择GSAS .EXP file,从以前的结果中导入晶体模型。另外也可以使用其他几个格式文件输入晶体模型。

2.3衍射数据和仪器参数

点击Histogram按钮,再点Add new Histogram按钮出现add new histogram对话框,在Data file中选择衍射数据文件YBCO.gsa,在Instrument Parameter file中选择仪器参数文件X:\GSAS\example\inst_xry.prm,此文件对应于Cu靶的X射线波长。点Add完成输入。

3.结构精修过程

完成以上步骤后就可以开始结构精修了。点击Genles就可以进行拟合,出现拟合结果窗口。

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