植物组织特异性启动子的研究进展

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植物应答逆境胁迫分子机制的研究进展

植物应答逆境胁迫分子机制的研究进展

植物应答逆境胁迫分子机制的研究进展作者:许存宾来源:《种子科技》 2018年第9期摘要:植物在生长过程中经常遭受各种胁迫因子的影响,随着分子生物学技术的发展,植物适应逆境的机制研究也从生理水平步入分子水平。

对植物应答逆境胁迫的转录组、蛋白组和调控分子机制3个方面的研究进行了概述。

关键词:植物;应答逆境胁迫;分子机制;研究进展植物经常遭受各种逆境胁迫,对生长发育造成不利影响,甚至引起死亡。

植物的逆境胁迫通常包括非生物胁迫和生物胁迫,前者主要由一定的物理或化学条件引发,如高温、干旱、冷害、高盐、重金属、机械损伤等,后者主要由各种生物因子引发,如真菌、细菌、病毒、线虫和菟丝子等引起的病虫害[1]。

植物为了适应逆境环境,会在分子、细胞、器官、生理生化等水平上作出及时调节[2~3]。

植物对逆境胁迫的响应是一个非常复杂的生命过程,其分子机制至今尚未完全阐明。

随着全球环境的日益恶化,各种逆境胁迫对植物生长发育带来的影响也日渐严重,成为制约现代农业发展的重要因素,各国学者对植物逆境应答机制的研究也投入了越来越多的力量[4]。

早期科学家们对植物在不利环境中的形态变化和生理指标变化研究较多,随着分子生物学技术的不断发展,对植物适应逆境机制的研究从生理水平进入分子水平,使得植物在逆境胁迫条件下的代谢机理研究取得了重要进展。

植物受到逆境刺激后,通过系列信号分子对相关抗逆基因和蛋白的表达进行调节,进而改变自身形态和生理生化水平来适应逆境[5]。

此研究不仅能探索生命现象的本质,而且能更好地进行分子育种和植物次生代谢产物合成研究。

本文就植物应答逆境胁迫的转录组学、蛋白组学和分子调控机制3个方面的研究进展进行了概述。

1植物应答逆境胁迫的转录组学研究进展转录组学(transcriptomics)是一门在RNA水平上研究生物体中基因转录的情况及转录调控规律的学科,即从RNA水平研究基因表达的情况。

转录组学可定量分析生物体不同组织、不同发育阶段和不同环境条件下的基因表达变化情况。

种子特异性启动子的研究进展

种子特异性启动子的研究进展
目 前发现的与种子中贮藏蛋白质有关的启动子主 要有球蛋 白(l u n 启 动子、 g bl ) o i 谷蛋 白(l en 启 动 g ti) ul 子、 醇溶 谷 蛋 白 ( rl i ) 动 子 、 S po mn 启 a e U P启 动子 和
npn 动 子等 。 ai启 2 1 球 蛋 白启 动 子 . 2 11 棉 花 一 蛋 白 B基 因启动 子 .. 球 球蛋 白是 棉花 ( ospu iuu Gsyim hr tm)种 子 中含 量 s
(r u — uds r yt s I,bs ) g nl b n a hsn a gs I 是在灌浆期 a eo tc he 表达的一种酶 , 负责直链淀粉的合成 。Ku Ih等 将小 t 麦 gs I b 基因上游 40 b的序列与 gs 因连接后导 s . k u基 人小麦中, 结果发现 , 在转基 因小麦中 gs u 基因的表达 时 间与 g s I的 表 达 时 间 一 致 。对 启 动子 的序 列 进 bs 行 部 分 缺 失 的 研 究 表 明, g s 在 bs I基 因上 游 的 19 b10 b . k 一 区域的序列控制基 因的特异表达 。 .k J
l 与淀粉合成 有关的种子特异启 动子
与淀 粉 合 成 有 关 的 种 子 特 异 启 动 子 主 要 有
gs I、 B A P小亚基 基 因启动 子 等。 b S E1和 G s
1 1 g s 1 子 特异启 动 子 . b 种 s
2 与蛋白质合成有关的种子特异启动子
P o r s fSu y OlS e p cf r moe r ge so td i e d S e i c P o tr i
M A a - e .W ANG n -e S nm i Yo g fi

高等植物启动子及其应用研究进展_路静

高等植物启动子及其应用研究进展_路静

自然科学进展第14卷 第8期 2004年8月高等植物启动子及其应用研究进展*路 静1,2 赵华燕1 何奕昆2 宋艳茹1**1.中国科学院植物研究所,光合作用和环境分子生理学重点实验室,北京100093;2.首都师范大学生物系,北京1000372003-11-06收稿,2003-12-30收修改稿*北京市自然科学基金(批准号:5012009)、国家自然科学基金(批准号:30170783)和/八六三0高科技(批准号:2004AA212121)资助项目**通讯作者,E -mail:songyr@摘要 高等植物基因的表达调控已成为分子生物学研究领域的热点和前沿,启动子是基因表达调控的重要元件.深入研究启动子的结构和功能,建立可用于植物转基因表达的时、空、量三维调控系统,可为功能基因组学研究及通过基因工程技术精确地调节植物代谢提供全新的思路.文中从高等植物启动子的类型、结构和功能入手,着重介绍了启动子研究及应用的最新进展.关键词 启动子 基因表达调控 时空表达特异性 启动子是RNA 聚合酶能够识别并与之结合,从而起始基因转录的一段DNA 序列,通常位于基因上游.一个典型的启动子包括CAAT -box 和TATA -box,它们分别是依赖DNA 的RNA 聚合酶的识别和结合位点,一般位于转录起始位点上游几十个碱基处.在核心启动子上游通常会有一些特殊的DNA 序列,即顺式作用元件,转录因子与之结合从而激活或抑制基因的转录.一旦RNA 聚合酶定位并结合在启动子上即可启动基因转录,因此启动子是基因表达调控的重要元件,它与RNA 聚合酶及其他蛋白辅助因子等反式作用因子的相互作用是启动子调控基因转录的实质.根据启动子的转录模式可将其分为3类:组成型启动子、组织或器官特异性启动子和诱导型启动子.1 组成型启动子在组成型启动子调控下,不同组织器官和发育阶段的基因表达没有明显差异,因而称之为组成型启动子.双子叶植物中最常使用的组成型启动子是花椰菜花叶病毒(CaMV )35S 启动子,它具多种顺式作用元件[1].其转录起始位点上游-343~-46bp 是转录增强区,-343~-208和-208~-90bp 是转录激活区,-90~-46bp 是进一步增强转录活性的区域.在了解CaMV 35S 启动子各种顺式作用元件的基础上,人们利用它的核心序列构建人工启动子,以得到转录活性更高的启动子.Mit -suhara 等[2]利用CaM V 35S 核心启动子与CaM V 35S 启动子的5.端不同区段和烟草花叶病毒的5.非转录区(omega 序列)相连,发现把两个CaM V 35S 启动子-419~-90(E12)序列与omega 序列串联,在转基因烟草中GU S 有最大的表达活性.把7个CaM V 35S 启动子的-290~-90(E7)序列与omeg a 序列串联,非常适合驱动外源基因在水稻中表达.用这两种结构驱动GUS 基因表达,在转基因烟草和水稻中GUS 活性比单用CaMV 35S 启动子高20~70倍.另一种高效的组成型启动子CsVMV 是从木薯叶脉花叶病毒(cassava vein mosaic virus )中分离的[3].该启动子-222~-173bp 负责驱动基因在植物绿色组织和根尖中表达,其中-219/-203是TGACG 重复基序,即as1(activating sequence 1),-183/-180为GATA(又称为as2),这两个元件的互作对控制基因在绿色组织中表达至关重要.该启动子-178~-63bp 包含负责调控基因在维管组织中表达的元件.CsVMV 启动子在转基因葡萄中驱856动外源基因的转录能力与使用两个串联的CaMV35S启动子相当,两个串联的CsVMV启动子转录活性更强[4].Rance等[5]利用CoYMV(com-melina yellow mosaic virus),CsVM V启动子区和CaMV35S启动子的激活序列(as1,as2)人工构建高效融合启动子,瞬时表达实验表明该启动子可驱动报告基因在双子叶植物烟草中高效表达,在单子叶植物玉米中其驱动能力比通常使用的C-玉米蛋白启动子高6倍.因此用这种人工构建的高效启动子驱动抗病基因或目的蛋白基因,在双子叶和单子叶植物中均可达到较理想的效果.人们高度重视从植物本身克隆组成型启动子,并初见成效,例如肌动蛋白(actin)[6]和泛素(ubiqu-i tin)[7]等基因的启动子已被克隆.用这些启动子代替CaMV35S启动子,可以更有效地在单子叶植物中驱动外源基因的转录.Naomi等[8]分别从拟南芥的色氨酸合酶B亚基基因和植物光敏色素基因中克隆了相应启动子,用其代替CaM V35S启动子,在转基因烟草中也取得了很好的表达效果.由于组成型启动子驱动的基因在植物各组织中均有不同程度表达,应用中逐渐暴露出一些问题.例如外源基因在整株植物中表达,产生大量异源蛋白质或代谢产物在植物体内积累,打破了植物原有的代谢平衡,有些产物对植物并非必需甚至有毒,因而阻碍了植物的正常生长,甚至导致死亡.另外,重复使用同一种启动子驱动两个或两个以上的外源基因可能引起基因沉默或共抑制现象[9].因此,人们寻找更为有效的组织、器官特异性启动子代替组成型启动子,以更好地调控植物基因表达.2组织或器官特异性启动子这类启动子调控下的基因转录一般只发生在某些特定器官或组织中,目前已发现这类启动子中一般同时存在几种控制组织特异性表达的元件,其表达特异性由这些元件的种类、数目及相对位置等共同决定.深入研究这些启动子不仅有助于阐明植物形态、发育、代谢途径等基础理论,而且具有广泛的应用价值.2.1根特异启动子根的发生和发育是植物发育过程中的重要问题,研究根中特异表达基因及其启动子无疑是重要的.拟南芥根中特异表达的黑芥子酶(my rosinase)是由Py k10基因编码的.Pyk10启动子中存在若干器官特异性表达和植物激素应答的特异元件,如ACGT-核心序列、CANNTG-motifs、GATA-motifs、诱导物(elicitor)应答元件W-box((T)TGAC(C))、植物激素应答元件(如as-1元件、生长素和脱落酸应答元件、Myb元件)和细胞特异表达元件等[10].其中ACGT,CANNTG,GATA等顺式作用元件是决定组织器官特异表达的转录因子结合位点,Myb 元件在控制植物次生代谢、调节细胞形态建成及信号传导通路中起作用.根特异表达系统可用于研究转基因植物的高渗胁迫耐受、植物修复和根际分泌等问题.Borisjuk 等[11]用根特异启动子mas2.,GFP和烟草钙网蛋白(calreticulin)基因构建融合表达载体,水培转基因烟草结果表明,根细胞不仅能够高效生产GFP,而且可将目的蛋白质分泌到液体培养基中.因此利用该启动子与其他有用的能编码蛋白质的基因融合,不仅可大量生产目的蛋白质,且更便于回收产物.2.2茎特异启动子Trindade等利用cDNA-AFLP技术从马铃薯中分离了一个与乙醇脱氢酶非常相似的TDF511(tran-script derived fragment),其基因Stg an可能参与植物体内影响赤霉素水平的复合物的合成[12].在NCBI数据库中,比较Stgan启动子与马铃薯的patatin I和I I、蛋白酶抑制子、nodulin22K和23K 等编码蛋白质基因的启动子,发现它们包含一些可能与蔗糖应答反应有关的共有序列;该启动子还包含植物中几个保守的转录因子(如Dof1,Dof2, Dof3和PBF)的结合位点.构建S tgan启动子-GUS 融合表达载体转化烟草,GUS组织化学染色显示该启动子驱动基因在茎结节处特异表达,可能参与块茎形成过程.研究在茎中特异表达基因的启动子,不仅可从分子水平了解茎的发生、分化过程,更重要的是利用这些启动子调节植物代谢可满足人类需求,如人们对木质素生物合成及其调控的研究.木质素是植物体内仅次于纤维素的一种含量丰富而重要的有机857自然科学进展第14卷第8期2004年8月大分子物质,它的存在对于增加植物机械强度、远距离水分运输和抵抗外界不良环境的侵袭都是非常有益的.然而,木质素的存在也有一定的负面作用[13].因此,人们希望通过调节木质素的合成以降低其含量.目前多使用CaMV35S启动子驱动目的基因,近年来已分离一些木质素生物合成途径中关键酶基因的启动子,如4CL,F5H等基因的启动子,人们正在尝试利用这些特异性启动子来调节木质素的生物合成.Bel-l Lelong等[14]已从拟南芥中分离了肉桂酸羟-4-基化酶(cinnamate-4-hydroxylase, C4H)基因的启动子,本实验室首次从毛白杨中分离了C4H启动子,并对该启动子的功能进行了初步鉴定.GUS组织化学染色和GUS荧光测定结果表明,C4H启动子驱动外源基因在烟草茎的维管组织中丰富表达(待发表),有望将来利用该启动子驱动功能基因调控木质素的生物合成过程.2.3叶特异启动子M arraccini等[15]从咖啡(coff ea arabica)中克隆了1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(rubisco)小亚基基因RBCS1,该基因在一年生植物咖啡的叶中特异表达.研究发现RBCS1启动子上游GTGGT-TAAT序列与豌豆RBCS3A启动子的Box II核心序列相同;在其启动子G-box(GCCACGTGGC)两侧分别有一个类I-box(核心序列为GATAAG),形成I-G-I结构,推测G-box十个碱基的回文结构可能结合某个转录因子;其AT-1box(AGAATTT T-TATT)与其他RBCS和CAB基因的AT-1box (AATATTTT TATT)相比只有两个碱基不同;类L-box(AAAAT TAACCAA)与马铃薯RBCS1和RBCS3A启动子的相同.由此可见,植物叶特异表达顺式元件具高度保守性.有趣的是Taniguchi等[16]在玉米中发现了一个双元启动子系统(dual promoter system).PPDK (pyruvate,orthophosphate dikinase)是C4植物光合反应中的一个叶绿体酶,该酶基因Pdk具有一个双元启动子系统(C4Pdk启动子和细胞质Pdk启动子).这两个启动子的区别在于起始密码子和拼接方式的差异,C4Pdk启动子驱动Pdk转录成较长的mRNA,基因产物定位在叶绿体中;细胞质Pdk启动子在Pdk基因的第一个内含子中,驱动Pdk转录成较短的mRNA,它所编码的蛋白质定位于细胞质中,又称为细胞质Pdk启动子.C4Pdk启动子是受光诱导的强启动子,驱动基因在玉米叶肉细胞中特异表达;而细胞质Pdk启动子是个弱启动子,且不具有组织特异性.大多数C4植物的光合作用相关基因的表达具有细胞特异性,且主要在转录水平调节基因表达活性,因此,可利用该启动子在C4植物叶肉细胞中高效表达外源基因.2.4花特异启动子高等植物发育过程中花器官的形成是一个十分复杂的过程,它包括一系列器官分化及严格控制的细胞及生化变化,同时伴随大量基因的协同表达.目前人们最为关注的是花药中特异表达的基因,抑制或破坏这些基因的表达可导致雄性不育,即可利用基因工程的方法创造雄性不育系.人们克隆了许多花药特异表达的基因,如在花药绒毡层特异表达的TA29[17],A9[18]、在花粉壁特异表达的Bp4A[19]等,但这些基因都是在花药营养细胞中表达,与生殖细胞的分化无关.Singh 等[20]从百合(L ilium longif lorum)中克隆了一个L GC1基因的启动子,该启动子驱动的基因只在雄配子细胞中表达.L GC1启动子-242~-183bp之间可能包含某种顺式作用元件,它的缺失会导致细胞特异性表达特性丧失,由此可知L GC1在生殖细胞中的表达特异性可能是由于其他细胞中存在某些转录因子抑制该基因表达的结果.这是迄今为止发现的第一个有关雄配子细胞特异性的启动子,在研究花药发生和受精作用中将会是一个有用的工具.2.5果实、种子特异性启动子利用果实或种子等器官特异性启动子调控基因表达,不仅可提高基因在这些部位的表达量,将生物能耗降到最低,利于表达产物的分离,而且可有目的地提高转基因植物果实或种子的营养或改善其品质.番茄E8启动子[21]是成熟果实中乙烯应答性基因的启动子,其-409~-263bp可控制E8基因在果实成熟过程中特异表达,-2181~-1088bp为乙烯应答激活域.Sandhu等[22]利用E8启动子驱动呼吸道合胞病毒F抗原基因成功转化番茄植株,用果实特异表达抗原喂饲小鼠,可诱导小鼠产生特异的858自然科学进展第14卷第8期2004年8月粘膜免疫反应、血清学抗体反应及TH1型细胞免疫反应.基因表达调控与免疫学的有效结合,使得转基因植物口服疫苗可在不久的将来问世.2A12是番茄中另一种果实特异性启动子,毛自朝等[23]利用该启动子驱动ipt调节果实内源激素的含量,不仅可获得无籽果实,还能改善果实的品质.种子特异性启动子中研究较多的是胚乳特异性谷蛋白基因启动子.谷蛋白占水稻种子储藏蛋白总量的70%~80%,早在1986年Takaiw a[24]等就克隆了第一个水稻谷蛋白基因的cDNA.该基因转录起始位点-261~-1bp之间有若干控制种子特异性表达的顺式作用元件,如AACA-box、种子凝集素-box、未成熟种子核因子结合位点等.此外,启动子更上游处还有若干增强子和调节元件,如-300 bp处的RY重复序列,它是核蛋白的结合位点[25]. Yoshihara等[26]研究发现水稻谷蛋白启动子上游-104~-60bp之间有两个顺式作用元件AACA和GCN4,GCN4能增强启动子的活性,而启动子的组织特异性则须两者协同作用.虽然植物食物中包含人类营养所需的绝大多数矿物质和有机养分,但日常摄入的食物往往不足以提供人体所需的营养.因此人们希望通过植物基因工程提高植物中所含的营养物质.水稻谷粒中含有铁蛋白,但多积累在糊粉层,在谷粒加工过程中会失去很多铁.Vasconcelos等[27]用水稻胚乳特异性谷蛋白基因启动子驱动大豆铁蛋白基因,使转基因水稻谷粒中铁和锌的含量都有所增加,而且铁蛋白主要积累在胚乳中,不会在食品加工过程中丢失.无独有偶,Datta等[28]利用水稻谷蛋白特异启动子驱动八氢番茄红素合酶基因PS Y,在水稻胚乳中成功合成维他命原A.以植物为生物反应器生产生物可降解塑料是本实验室研究目标之一.叶梁等使用大豆7S种子特异性启动子,构建二价和三价种子特异性表达载体转化油菜[29].这样将产物聚-3-羟基丁酸酯(PHB)定位与种子质体中,不仅增加了底物供应,也减少PH B对植物生长发育的影响.为优化已有表达框架,减小基因沉默发生几率,Zhang等[30]从油菜H165基因组DNA中分离到nap inB启动子的部分序列)nap300.序列分析表明,nap inB启动子包含一些在进化上保守性很高的序列,如AT-rich se-quence,TACACAT保守序列、RY重复序列、G-box等,这些顺式作用元件可能对种子特异性表达起重要的调控作用.将nap300与GUS基因融合转化烟草,GU S在胚和胚乳中均有表达;GUS荧光检测显示nap300启动子具有驱动基因在种子发育晚期表达的能力.3诱导型启动子与组织器官特异性启动子相比,诱导型启动子有着独特的优点:它可根据需要在植物特定的发育阶段、组织器官或生长环境下,快速诱导基因转录的/开0与/关0.根据来源,可将诱导型启动子分为天然存在的启动子和人工构建的启动子.3.1天然的诱导型启动子长期进化过程中,植物通过启动不同基因的表达可在一定范围内适应光、温、水等环境的变化.这些基因的启动子通常包含比较保守的顺式作用元件,利用这些保守元件可以推测新基因的可能功能,也可用这些环境应答基因的启动子与抗逆基因融合,从而使转基因植物更好地适应逆境.天然诱导型启动子包括光、温度、激素应答启动子等.光应答启动子中通常存在GT-1-motif, I-box,G-box和AT-rich sequence等顺式作用元件;温度应答启动子中多存在H SE-motif,CCAAT-box, CCGAC-motif等;激素应答启动子中则包含各种激素应答元件[31].G-box作为蛋白结合的一个高度保守的位点,是植物中通用的受信号诱导的顺式作用元件,在植物和动物中具高度保守的核心序列CACGT[32].G-box通常与另外一个顺式作用元件如I-box,H-box等协同作用,在细胞接受外界信号时调节转录起始的频率.这种机制可能是通过G-box及其结合蛋白相互作用产生一个内部环境,其他调节蛋白与启动子区域有效结合,使细胞准确而有选择地起始转录.有些诱导型启动子同时具有组织特异性,如RBCS1启动子,既包含叶特异表达元件,又带有几个光应答元件(LREs),受光的诱导调节[15].当转基因烟草由光照转入黑暗时,该启动子驱动的GU S活性比在光下低许多,Northern杂交几乎检测不到GUS的表达.859自然科学进展第14卷第8期2004年8月由于植物生长环境及基因表达的复杂性,从外界环境的刺激到启动应答基因的表达之间的信号通路往往是相互交叉的,这样启动子中包含的顺式作用元件通常也不止一种,如从葡萄中克隆的白藜芦醇合酶基因Vst1启动子,当病虫侵害、UV照射、臭氧环境或化学物质诱导时均可启动Vst1的表达. Riou等[33]发现该启动子上分别带有乙烯和臭氧的应答元件,可适应不同的外界刺激.拟南芥rd29A 基因[34]在干旱、高盐碱、低温或脱落酸诱导时表达,其启动子-174~-55区域包含干旱应答因子(DRE,TACCGACAT)和ABA应答因子(ABRE, ACGTGG/TC),且该基因在ABA诱导表达时, DRE和ABRE是相互独立的.当植物受病虫害侵犯时,受伤部位会立刻启动细胞程序性死亡,即发生所谓超敏反应(hypersens-i tive response,H R).HR通常会启动未受伤部位产生次级防御反应,从而对一般的病虫害产生普遍抗性,这种现象称为系统获得性抗性(systemic ac-quired resistance,SAR).烟草中SAR基因是一个至少包含十二个成员的家族,SAR也受一些诸如水杨酸(SA),INA(dichloroisonicotinic acid)和BTH(ben-zothiadiazole)等化学物诱导[35].烟草Sar8.2b基因启动子-205/-201是as-1元件(T GACG),-146/-141和-276/-271为两个GT-1结合序列(GGAAAT),-97/-94、-322/-318和-761/ -758分别是Dof结合基序(AAAG),前两者被认为可以与SA应答的转录因子结合而起关键作用.启动子缺失实验表明Sar8.2b启动子-927~-728和-351~-197bp分别包含有SAR高效诱导基因表达所需的顺式作用元件,缺少了这两个DNA片段,转基因烟草GUS表达活性明显降低.3.2人工构建的诱导型启动子在开发植物天然存在的诱导型启动子的基础上,人工构建可诱导表达系统以满足不同需求.目前研究最多、最深入的可诱导表达系统是化学诱导表达系统.自第一次用化学诱导表达系统TetR,通过CaMV35S启动子成功调节cat基因[36]的表达以来已有20多年的历史,现已发展成日臻完善的植物表达外源基因的可诱导表达系统.该系统包括两个转录单元:一是与化学诱导物结合的转录因子的表达,另一个转录单元包含一个应答元件,经诱导物处理后,通过它激活转录因子,从而激活或抑制目的基因的表达[37].一个理想的化学诱导表达系统应具备以下特点:首先,外源基因在植物体自身不表达或低水平表达,当添加诱导物后,高效诱导基因表达;其次,诱导物需要有较强的专一性;第三,诱导物可快速启动基因表达的/开0与/关0;而且诱导物对植物无毒或低毒[37,38].根据控制基因表达的方式,可将化学诱导系统分为两大类:阻遏型启动子系统和激活型启动子系统.3.2.1阻遏型启动子系统该系统建立在阻遏蛋白与转录因子在空间构型相互作用的基础之上.当诱导物不存在时,激活蛋白与阻遏蛋白结合,基因正常转录;添加诱导物后,诱导物与激活蛋白结合或阻止其与阻遏蛋白结合,阻遏蛋白则与启动子上的某些顺式作用元件结合,抑制基因转录,如以四环素抑制子为基础的四环素抑制系统(tTA).Love 等[39]用包含四环素抑制子的启动子Top10与报告基因GFP相连转化拟南芥,发现用100ng/m L的四环素即可抑制GFP的表达,而且改变培养基中四环素的浓度,可调节GFP的表达水平.3.2.2激活型启动子系统在抑制型启动子系统中,抑制基因转录所需诱导物的量往往超出植物适应的范围,而且在真核生物中激活基因比抑制基因转录更容易,近年发展了一些激活型启动子系统,如地塞米松诱导的GR系统[40]、雌二醇诱导的ER 系统[41]、杀虫剂诱导的EcR系统[42]等.激活型启动子系统的优点是只有当诱导物存在时才能启动基因表达,去除诱导物后,基因表达很快被关闭,这样就可以人为地精确、快速控制基因的表达.Bohner等[43]研究了一种可双向调控外源基因表达的系统,他们将改造的启动子Top10与报告基因GUS相连,使用转录激活子TGV作为基因开关.转基因烟草结果表明,用地塞米松处理3h后基因表达量达到高峰;用四环素处理6h即可关闭基因表达.该诱导系统最大的优点在于可迅速调节基因的表达与否,当外源基因可能对植物产生不良影响时这一点显得尤为重要.为了满足应用需要,人们开始研究便于在大田860自然科学进展第14卷第8期2004年8月使用的诱导表达系统,杀虫剂诱导的EcR系统就是一个很好的范例.U nger等[42]利用欧洲玉米螟(Os-trinia nubilalis)的蜕皮激素配基结合结构域(EcR LBD)、玉米C1激活域(AD)和GAL4DNA结合结构域(DBD)构建化学诱导激活子,把它与玉米ms45最小启动子相连,构建成可受杀虫剂诱导的人工启动子诱导系统.他们利用该系统在玉米雄性不育突变株ms45中成功地诱导了育性恢复基因MS45的表达.4问题与展望近20年人们在启动子研究方面展开了大量的工作,不仅克隆了数量丰富的启动子,而且对其结构和功能有了一定的认识.但从遗传信息到基因的表达是一个十分复杂的过程,还有许多问题有待解决.基因表达与否以及表达时间、表达部位需要启动子上的顺式作用元件与相应的转录因子的协同作用.从植物中已知的启动子分析,组织特异性及诱导型启动子的顺式作用元件有一定的保守性,如B-box是种子特异启动子的高度保守区[44],G-box通常受光敏色素A诱导,参与多种信号调节[45,46].而且,启动子驱动基因表达通常需要两种或两种以上的顺式元件,这些元件的种类、数量以及彼此之间的顺序与距离都可能影响基因的转录与否或转录程度.如果能发现其中的规律,将会对基因表达的调控取得突破性进展.另外,基因的特异性表达不仅包括在特定时期激活某些基因的表达,还涉及到在其他组织器官或发育时期抑制某些基因的表达,对抑制子的研究将使人们更好地理解基因表达的调控过程.根据需要选择或人工构建合适的启动子(组成型、组织器官特异性、诱导型或复合型启动子),不仅便于研究新基因的功能,阐明植物的生长、发育、分化及繁殖过程与机理,还可以在植物特定的部位或发育阶段生产有用蛋白质或其他代谢产物,以实现对外源基因表达的定时、定点、定量三维精确调控.人们已经尝试利用植物这个天然的生物反应器进行目标产物的商业化生产并初见成效[47].参考文献1Odell J T,et al.Identification of DNA sequences required for activ-ity of the cauliflower mosaic virus35S promoter.Nature,1985, 313:8102M itsuhara I,et al.Efficient promoter cassettes for enhanced ex pres-si on of foreign genes in di cotyledonous and monocotyledonous plants.Plant Cell Physiol,1996,37:493Verdaguer B,et al.Functional organization of the cassava vein mo-saic virus(CsVM V)promoter.Plant M ol Biol,1998,37:10554Li Z J,et al.Expression of a bifunctional green fluorescent protein (GFP)fusi on marker under the control of three constitutive promot-ers and enhanced derivatives in transgenic grape(Vitis6inif era).Plant Sci,2001,160:8775Ran ce I,et bination of viral promoter sequences to generate highly active promoters for heterologous therapeutic protein over-ex-pressi on in plants.Plant Sci,2002,162:8336M cElroy D,et al.Isolation of an efficient acti n promoter for use in rice transformati on.Plant Cell,1990,2:1637Christensen A H,et al.M aize polyubiquitin genes:structure,ther-mal perturbation of expression and transcript splici ng,and promoter activi ty follow i ng transfer to protoplasts by electroporation.Plant M ol Biol,1992,18:6758Naomi Shirasaw a-Seo,et al.Constitutive promoters available for transgene expression instead of CaM V35S RNA promoter:Ara-bidopsis promoters of tryptophan synthase protein subunit and phy-tochrome B.Plant Biotech,2002,19(1):199Kum patla S P,et al.Genom e intruder scanning and modulation sys-tems and transgene si lencing.T IBS,1998,3:9710Nitz I,et al.Pyk10,a seedling and root specific gene and promoter from A rabidopsis thaliana.Plant Sci,2001,161:33711Borisjuk N C,et al.Production of recombinant proterins in plant root exudates.Nature Biotech,1999,17:46612Trindade L M,et al.Is olation and fun ctional characterization of a stolon specific promoter from potato(Solanu m tuberosu m L.).Gene,2003,303:7713魏建华,等.木质素生物合成途径及调控的研究进展.植物学报,2001,43(8):77114Bel-l Lel ong D A,et al.Cinnamate-4-hydroxylase expression in ara-bidopsis.Plant Physiol,1997,113:72915M arraccini P,et al.Rubisco small subunit of Coff ea arabica:cD-NA sequence,gene cloning and promoter analysis in transgenic to-bacco plants.Plant Physiol Biochem,2003,41:1716Tan i guchi M,et al.T he promoter for the maize C4pyruvate,or-thophosphate dikinase gene directs cel-l and ti ssue-specific transcrip-tion in transgenic mai z e plants.Plant Cel l Physiol,2000,41(1):42 17Koltunow A N,et al.Different temporal and spatial gene expression patterns occur during anther development.Plant Cell,1990,2: 120118Paul W,et al.T he isolati on an d characterisation of the tapetum-spe-cific Arabidopsi s thaliana A9gene.Plant M ol Biol,1992,19(4):861自然科学进展第14卷第8期2004年8月。

植物分子生物学研究中的基因启动子分析

植物分子生物学研究中的基因启动子分析

植物分子生物学研究中的基因启动子分析随着基因组学技术的不断发展和应用,越来越多的生物信息学分析工具被应用于生物学研究领域。

在植物分子生物学研究中,基因启动子的分析是一个非常重要的研究内容。

基因启动子是指位于基因转录起始区域的DNA序列,是控制基因表达的关键因素之一。

通过对植物基因启动子的分析,可以深入了解植物基因调控机制的运作方式,从而更好地理解植物发育、适应和响应环境等生理过程。

本文将从基因启动子的含义、种类及其在植物研究中的作用三个方面,深入探讨基因启动子分析的重要性。

一、基因启动子的含义和种类基因启动子通常定位在基因转录起始区域的5'端,长度约为100-2000bp。

它被认为是基因调控的主要起点,控制着基因的转录和表达。

在植物基因组中,启动子类型主要包括:(1)核心启动子:位于编码区域的5'端,仅包括转录起始位点(TSS)及其周围几个碱基,长度通常小于50bp。

(2)组织特异性启动子:指仅在特定细胞或组织中启动转录的启动子,其控制基因的表达仅限于某些细胞或细胞群。

(3)响应性启动子:指在特定的内外环境因素刺激下,通过识别响应元件进行调控的启动子,包括各种环境因素的响应元件,如光响应元件、温度响应元件、激素响应元件等。

(4)增强子和沉默子:指在不同细胞类型间及不同环境因素下对启动子的转录调控进行分别增强或沉默的序列。

二、基因启动子在植物研究中的作用1.基因启动子在基因工程中的应用首先,在植物基因工程中,研究者经常需要通过改变启动子的序列来调整基因表达,从而改变植物表现型。

例如,在转基因作物的育种中,利用卫星病毒启动子来改变抗病性基因的表达,使作物获得更好的病毒抗性。

此外,一些促生长和耐旱基因的启动子也被广泛应用在转基因植物的生产和品种改良上。

2.基因启动子在基因调控机制研究中的应用基因启动子的功能不止于此,它在植物基因调控机制的研究中也具有很大的应用前景。

对基因启动子的分析可以揭示基因调控网络中的重要组成部分及其相互作用。

植物启动子结构分析及其应用

植物启动子结构分析及其应用

植物启动子结构分析及其应用随着生物技术的不断发展,越来越多的研究集中于转录调控机制研究。

而启动子作为基因调控的关键元件,自然成为了研究的重点。

植物启动子结构分析是现代分子生物学领域的一个热点话题。

本文将介绍植物启动子的概念,并重点分析其结构及应用。

一、植物启动子的概念在遗传学中,启动子是指控制DNA转录成RNA的区域,是基因转录的起始点。

启动子通常由多个调控元件组成,通过复杂的相互作用来控制基因在不同细胞和不同阶段的表达。

启动子的长度一般为100-1000个碱基对,是控制转录速率和转录起始位置的关键区域。

在植物领域,启动子是植物基因组中一个重要的研究对象。

植物启动子的结构复杂,包含多个基因调控元件,这些元件的组合形成了独特的转录调控网络。

研究植物启动子的结构及调控机制,对于揭示植物基因表达及调控机制具有重要意义。

二、植物启动子的结构分析及应用1. 启动子元件的定位及功能分析元件是指影响启动子转录活性的DNA序列,元件可以促进或抑制转录的发生。

植物启动子中常见的元件包括:基本转录因子结合元件、转录调控因子结合元件、甲基化区域等。

现代分子生物学技术可通过测序、序列识别和功能检测等手段对启动子元件进行定位和功能分析。

2. 启动子转录复合物的分离及功能分析启动子转录复合物是由基本转录因子和其他调控因子组成的,有关启动子复合物的机制可促进对基因表达的理解。

现代分子生物学技术通常用来分离纯化启动子转录复合物,并用质谱等方法鉴定复合物的成分,以揭示启动子复合物的组成和调控机制。

3. 启动子细胞特异性表达的分析启动子细胞特异性表达的研究可以用来探讨不同细胞类型的基因表达和分子调控,这些信息对于细胞命运及其功能的理解都有很大的帮助。

现代分子生物学技术通常利用高通量测序和组织特异性基因表达数据库等手段探索植物启动子的细胞特异性表达规律,为仔细剖析植物基因表达及调控机制提供线索。

4. 启动子逆向设计及应用启动子逆向设计是指以既有的多种植物启动子元件为模板,设计一组不同的启动子来实现特定的转录调控目标,是基因工程及其应用的关键技术。

植物启动子的研究进展

植物启动子的研究进展
4.几个杨树木质部特异启动子片段表达载体的构建与功能分析。张爽、武会、杜克久。2012年,《蚕业科学》。
5.大豆球蛋白G1启动子的克隆及表达活性分析。张庆林、赵艳、李晓薇、张艳、苏连泰、王英、李景文、王庆钰。2011年第9卷第4期,《分子植物育种》。
6.烟草PR1a基因启动子的克隆及其活性检测。王云鹏、韦正乙、邢少辰、林春晶。2011年5月第39卷第5期,《西北农林科技大学学报》。
植物启动子的研究已经有了较大的成就,随着分子生物学技术的不断发展与完善,多种可以在不同组织器官中表达的特异性启动子已经被分离,从而使外源基因在植物体内可以定点、定量、定时进行表达。最大限度地减少对植物其他代谢途径的影响。从文献中,有提到将拟南芥中的根特异启动子pyk10在烟草中表达[1],以明确拟南芥根特异表达基因pyk10启动子在烟草的根部特异表达。实验结果表明,克隆的根特异表达基因启动子与已报道的pyk10启动子的一致性为100%,表明该启动子为根部特异表达启动子,为揭示植物根的发生、分化和发育机制,以及培养抗根部病虫害和营养高效利用型转基因烟草奠定了基础。
关键词:组织特异启动子、诱导型启动子、载体构建、植物表达载体
到目前为止,专家学者们对于植物启动子的研究方法都是基本相同的,都参照了DNA重组技术的步骤。首先,将植物表达载体中的组成型启动子利用核酸内切酶或外切酶双酶切切除组成型启动子,并形成酶切位点,一般组成型启动子为CaMV35S。第二步,将作为研究对象的启动子酶接到质粒基因组中,形成重组载体。第三步,是验证启动子片段是否已经连接到表达载体上,这一步骤可以通过酶切和PCR技术来进行。第四步,是将重组的载体转化到宿主细胞中,即细菌当中,再用细菌去侵染植物组织以完成将目的基因转入到植物细胞中的目的。然后是进行植物组织的无菌培养,有些还设置对照组来比较不同启动子的表达对植物生长 of a plant defensin gene directs specific expression in nematode-induced syncytia in Arabidopsis roots。Shahid Siddique,Krzysztof Wieczorek,Dagmar Szakasits,David P. Kreil,Holger Bohlmann。2011,49期《Plant Physiolog y and Bioch emistry》。

水稻茎叶特异性启动子研究进展

水稻茎叶特异性启动子研究进展

农艺学现代农业科技2012年第17期茎在水稻生长发育过程中不仅能输导营养物质,而且还具有光合作用、贮藏营养物质的功能。

叶片是水稻进行光合作用的主要器官,在利用和固定能量方面发挥着重要的作用。

为了提高水稻产量和转基因水稻的生物安全性,寻找合适的茎叶特异性启动子使插入的目的基因能够定点、定时、定量表达,以此来驱动目的基因表达使其获得抗虫、抗病能力及对逆境的耐受性。

鉴于茎叶是水稻进行光合作用的场所,光合作用相关的蛋白主要可分为3类:一是捕光叶绿素a/b 结合蛋白(CAB ,chlorophyll a/b binding protein ),其可以通过与光合体系Ⅰ(PSⅠ)和光合体系Ⅱ(PSⅡ)结合接收太阳能从而同化二氧化碳[1];二是核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶(RuBPCase ,ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase ),其主要是在光合作用中对二氧化碳的固定起到催化作用,并且在光呼吸途径中产生2-磷酸乙醇酸[2];三是丙酮酸磷酸双激酶(PPDK ,pyruvate ,orthophosphatedikinase ),其作为光合反应中的一个叶绿体酶,同时催化二氧化碳初级受体生成磷酸烯醇式丙酮酸。

研究表明,编码光反应酶的基因是多基因家族,它们在茎叶中表达具有高度的组织特异性。

近年来,关于水稻茎叶特异性启动子的研究主要是与光合作用相关酶基因的方面,并且取得了一定的进展,现将其总结如下。

1水稻茎叶特异性启动子的种类1.1捕光叶绿素a/b 结合蛋白基因启动子植物捕光叶绿素a/b 结合蛋白是一类比较典型的光诱导型基因。

目前,研究者已经从小麦、水稻和梨等植物中分离并得到了cab 基因[3-8]。

Leutwiler L S et al [9]的研究结果表明,植物中的cab 启动子同时具有2种特性,即光诱导性及茎叶组织特异性。

cab 基因的表达调控是在转录水平上,调控元件位于基因的5′非翻译区,而且cab 基因的表达水平与不同的光受体有关[10]。

植物组织特异性启动子的研究进展

植物组织特异性启动子的研究进展

征, 并通过介绍花、 果实 、 种子及 叶特异性启动子 , 概述植物组织特异性启 动子 的功能和研 究进展 , 讨论植 物组织 特异性启动 子研
究 中问 题 和 展望 。
关键词
组织特异性启动子
结构特征
植物基因工程
组织特异性启 动子也称器 官特异性启动子 ( r n og a seicpo o r , pc r t ) 可调控基 因只在某些特 定的部位 或 i f m e
还有增强子和沉 默子 的一般特 性 , 其表 达特异 性 由这
些元件 的种类 、 目及 相对位 置等 共 同决 定。启 动子 数 中控制基 因组织特异性表达 的序列一般位于 A A盒 rT ( 基本转 录 因子 T I FI D结 合位 点 , 有 序 列是 T ・ 共 Ar A A A, T T A 由 A A盒及 转 录起始 点 即可构成 最简 单 的启

组 织特异性启动子 的特异性通 常以特 定的组织细 胞结构和化 学 、 物理信 号 为基础 因此 ,作 为转 录调 控序列的组织特异性启 动子与诱 导型启 动子有一定 的 共性。经序列分析研究 发现 , 在这些 组织 特异性 启 动 子 中都有与组织特 异性 相关 的特异序 列 , 而这 些特异 序列也正是基 因特异表达所 必须的 l 3。 2 , J
i hl n ) n a oe 。类黄酮类物质 是广 泛存 在 于高等植 物 中 c c
的次生代谢物 , 与植物 的花色形成密切相关 , , 防止 紫外损伤 、 如 抗
病 、 响豆科植物 的根瘤形成等 。 影
2 2 果 实、 . 种子特异启动子
利用果实 或种子等器 官
器官中表达 , 往往表 现 出发育调 节的特 性。外 源基 并

植物启动子的结构和功能研究

植物启动子的结构和功能研究

植物启动子的结构和功能研究植物启动子是基因表达的关键因素,对于研究植物的生长发育以及作物生产具有重要的意义。

植物启动子的结构和功能一直是植物学家们研究的焦点问题,在过去的几十年里,随着生物技术的发展和基因组学的突破,人们对植物启动子的研究取得了长足的进展。

一、植物启动子的概念和特点植物启动子是位于基因上游的DNA序列,参与了基因的转录调控。

它包括了一些关键元件,例如启动子序列、转录因子结合位点、增强子、沉默子等等。

植物启动子通常是由一些共同序列组成,例如TATA盒、CCAAT盒和GC盒等等。

这些序列与转录因子结合,共同控制基因的转录。

与动物启动子不同的是,植物启动子通常比较长,包含了大量的可变区域和重复序列。

二、植物启动子的结构和功能植物启动子通常由两个部分组成:核心启动子和增强子。

核心启动子通常是一个短序列,约20个碱基长,包含了TATA盒和转录起始位点(TSS)。

它是转录因子的主要结合位点,控制基因的转录起始。

增强子是与核心启动子相邻的DNA 序列,其中包含了许多转录因子结合位点。

增强子的作用是增加转录的效率和特异性。

植物启动子的功能主要包括:1.控制基因的启动转录和终止转录。

2.调节基因的表达水平和时间。

3.控制基因的组织特异性和发育特异性。

4.响应内外环境的诱导因子和胁迫。

三、植物启动子在作物遗传育种中的应用植物启动子的结构和功能研究不仅有助于深入了解植物的基因表达调控机制,而且在作物遗传育种中也具有重要的应用价值。

例如,可以通过改变植物启动子的组成和结构,调控目标基因的表达水平和时间。

此外,植物启动子还可以用于设计特定的基因表达载体,实现转基因作物的创建和改良。

四、植物启动子的未来研究方向和挑战目前,对于植物启动子的研究还面临着许多挑战和问题。

例如,如何准确鉴定和解析植物启动子的结构和组成、如何准确模拟和预测植物启动子的功能和调控机制等等。

因此,未来的研究方向主要包括:1.基因组学和生物信息学的集成,完成全基因组的启动子鉴定和分析。

植物诱导型启动子的研究进展

植物诱导型启动子的研究进展
基 因表 达 ,从 而 使 植 物 能 够 适 应 复 杂 多 变 的生 长 环 境 。对 植 物 启 动 子 的研 究 有 助 于 了解 基 因转 录
效表达 ,其诱导 型是 由其上存 在 的正 负调控元 件相互作 用
而 决 定 的 。 综 述 了诱 导 型 启 动 子 的种 类 、 启 动 子 序 列 内部 调 控 元 件 的 类 型 以及 适 用 于诱 导 型 启 动 子 的研 究 方 法 , 并 对 其 在 植 物 基 因 工程 中 的 应 用前 景进 行 了展 望 。 关 键 词 :启 动 子 ;诱 导 型 ;调 控 元 件

中 图分 类 号 : 一 Q3
文献标志码 : A
● 农业生产
文 章 编 号 :6 4 34 (0 0 — 0 5 0 17 — 5 72 1 )3 0 0 — 5 1
植 物 诱 导 型 启 动 子 的研 究 进展 米
王志新 ,赵 琳 ,李文滨”
10 3 ) 5 00 ( 东北农业大学大豆生物学教 育部 重点实验 室,哈 尔滨
导 ; ( ) 有 增 强 序 列 、沉 默 序 列 或 类 似 功 能 ; 2具
mi e y t e i tr c in o o i v n e ai e r g l tr l — n d b h n e a t fp st e a d n g t e u ao y e e o i v
的 保 守 性 。 有 些 生 长 素 诱 导 启 动 子 中 含 有
5- G C C 3 序 列 和 与 它 相 似 的 5-GT ' T T 一’ T ' /1 [
G bx 植 物通 用信 号诱 导元 件 .最 早从 编码 — o是
R c 基 因 的上 游 区鉴 定 出来 。 它 高度 保 守 ,通 常 bS

两种植物组织特异性基因表达方法分析

两种植物组织特异性基因表达方法分析

两种植物组织特异性基因表达方法分析目前研究人员已经在不同植物中分离并证实了多种具有组织表达特异性的启动子,以下是搜集整理的一篇相关,欢迎阅读参考。

ﻭ多细胞生物体内存在不同类型的器、组织、细胞,它们有各自的特性,担负着不同的功能。

例如,植物根表皮中的根毛细胞,主要负责从周围土壤中吸收水分与矿质营养。

与这一功能相适应,它们在发育过程中向外突起管状结构以增加其表面积和吸收水分、养分的能力(Grier-son和Schiefelbein2002);植物根里的内皮层细胞在发育过程中通过特殊的细胞壁加厚和特定部位胼胝质的沉积凯氏带,阻止矿质养分向维管束和地上部分渗透,控制皮层和维管柱之间的物质运输;在茎和叶片中,保卫细胞可以调节内部叶肉细胞与外部环境之间的气体交换,这一过程需要依赖周围细胞通过K离子交换来创造一个调节气孔关闭与打开的膨压(Raschke和Fellows1971)。

这些不同类型器、组织、细胞的,以及它们之间功能的差异,在很大程度上取决于特异性表达的基因。

因此,研究不同器、组织、细胞中呈特异性表达的基因,对了解植物生长发育调控机理,细胞类型与功能之间的关系都有重要意义。

此外,研究组织特异性表达的基因的调控机理,可帮助我们构建植物组织特异性表达体系,有目的地在特定器、组织、细胞中表达特定靶基因,以便进行靶基因功能分析。

组织特异性表达技术在植物基因工程中具有一定的应用前景,如利用植物的特定组织细胞合成所需要的代谢产物,还可以用于作物改良的基因工程等.组织特异性表达技术是近年来植物学研究中的一个重要领域(Ubeda-Tomas等2008;Plett等2010;Duan等2013)。

ﻭ本文主要介绍目前被广泛使用的两种植物组织特异性基因表达方法,即特定启动子驱动法和GAL4/UAS激活标签法.ﻭ1组织特异性启动子驱动法ﻭ1.1植物组织特异性启动子启动子是一段位于功能基因5 端上游的DNA序列,包含特定的保守序列,长度因基因而异。

高等植物启动子及其应用研究进展

高等植物启动子及其应用研究进展

第quot卷第期quot年月高等植物启动子及其应用研究进展路静quot赵华燕何奕昆quot宋艳茹quotquot中国科学院植物研究所光合作用和环境分子生理学重点实验室北京ampquot首都师范大学生物系北京amp’quotamp收稿quotampquotamp收修改稿quot北京市自然科学基金批准号quot、国家自然科学基金批准号amp’’amp和“八六三”高科技批准号quot--quotquotquot资助项目quotquot通讯作者./0123456789531:0305摘要高等植物基因的表达调控已成为分子生物学研究领域的热点和前沿启动子是基因表达调控的重要元件深入研究启动子的结构和功能建立可用于植物转基因表达的时、空、量三维调控系统可为功能基因组学研究及通过基因工程技术精确地调节植物代谢提供全新的思路文中从高等植物启动子的类型、结构和功能入手着重介绍了启动子研究及应用的最新进展关键词启动子基因表达调控时空表达特异性启动子是lt-聚合酶能够识别并与之结合从而起始基因转录的一段gt-序列通常位于基因上游一个典型的启动子包括--:4A和--:4A它们分别是依赖gt-的lt-聚合酶的识别和结合位点一般位于转录起始位点上游几十个碱基处在核心启动子上游通常会有一些特殊的gt-序列即顺式作用元件转录因子与之结合从而激活或抑制基因的转录一旦lt-聚合酶定位并结合在启动子上即可启动基因转录因此启动子是基因表达调控的重要元件它与lt-聚合酶及其他蛋白辅助因子等反式作用因子的相互作用是启动子调控基因转录的实质根据启动子的转录模式可将其分为amp类组成型启动子、组织或器官特异性启动子和诱导型启动子组成型启动子在组成型启动子调控下不同组织器官和发育阶段的基因表达没有明显差异因而称之为组成型启动子双子叶植物中最常使用的组成型启动子是花椰菜花叶病毒0BCampD启动子它具多种顺式作用元件其转录起始位点上游EampampFE:G是转录增强区EampampFEquot和EquotFE:G是转录激活区EFE:G是进一步增强转录活性的区域在了解0BCampD启动子各种顺式作用元件的基础上人们利用它的核心序列构建人工启动子以得到转录活性更高的启动子B1H3IJ080等quot利用0BCampD核心启动子与0BCampD启动子的’端不同区段和烟草花叶病毒的’非转录区4/K60序列相连发现把两个0BCampD启动子EFE.quot序列与4/K60序列串联在转基因烟草中LMD有最大的表达活性把’个0BCampD启动子的EquotFE.’序列与4/K60序列串联非常适合驱动外源基因在水稻中表达用这两种结构驱动LMD基因表达在转基因烟草和水稻中LMD活性比单用0BCampD启动子高quotF’倍另一种高效的组成型启动子3CBC是从木薯叶脉花叶病毒0330N0NK15/4301N18I3中分离的amp该启动子EquotquotquotFE’amp:G负责驱动基因在植物绿色组织和根尖中表达其中EquotOEquotamp是L-L重复基序即030H1N0H1563KPIK5KEampOE为L--又称为03quot这两个元件的互作对控制基因在绿色组织中表达至关重要该启动子E’FEamp:G包含负责调控基因在维管组织中表达的元件3CBC启动子在转基因葡萄中驱动外源基因的转录能力与使用两个串联的0BCampD启动子相当两个串联的quot启动子转录活性更强amp’等利用-.-//01200-3/-quot14156quotquot启动子区和78启动子的激活序列quot9quot:人工构建高效融合启动子瞬时表达实验表明该启动子可驱动报告基因在双子叶植物烟草中高效表达在单子叶植物玉米中其驱动能力比通常使用的玉米蛋白启动子高lt倍amp因此用这种人工构建的高效启动子驱动抗病基因或目的蛋白基因在双子叶和单子叶植物中均可达到较理想的效果amp人们高度重视从植物本身克隆组成型启动子并初见成效例如肌动蛋白1lt和泛素6gt1611等基因的启动子已被克隆amp用这些启动子代替78启动子可以更有效地在单子叶植物中驱动外源基因的转录ampA-/1等B分别从拟南芥的色氨酸合酶quot亚基基因和植物光敏色素基因中克隆了相应启动子用其代替78启动子在转基因烟草中也取得了很好的表达效果amp由于组成型启动子驱动的基因在植物各组织中均有不同程度表达应用中逐渐暴露出一些问题amp例如外源基因在整株植物中表达产生大量异源蛋白质或代谢产物在植物体内积累打破了植物原有的代谢平衡有些产物对植物并非必需甚至有毒因而阻碍了植物的正常生长甚至导致死亡amp另外重复使用同一种启动子驱动两个或两个以上的外源基因可能引起基因沉默或共抑制现象Camp因此人们寻找更为有效的组织、器官特异性启动子代替组成型启动子以更好地调控植物基因表达amp组织或器官特异性启动子这类启动子调控下的基因转录一般只发生在某些特定器官或组织中目前已发现这类启动子中一般同时存在几种控制组织特异性表达的元件其表达特异性由这些元件的种类、数目及相对位置等共同决定amp深入研究这些启动子不仅有助于阐明植物形态、发育、代谢途径等基础理论而且具有广泛的应用价值ampquot根特异启动子根的发生和发育是植物发育过程中的重要问题研究根中特异表达基因及其启动子无疑是重要的amp 拟南芥根中特异表达的黑芥子酶/25-quot1quot是由quot基因编码的ampquot启动子中存在若干器官特异性表达和植物激素应答的特异元件如DEF核心序列、DAAFE/-1Gquot、EDFD/-1Gquot、诱导物011-5应答元件Hgt-IFFED、植物激素应答元件如quot9元件、生长素和脱落酸应答元件、2gt元件和细胞特异表达元件等9Jamp 其中DEFDAAFEEDFD等顺式作用元件是决定组织器官特异表达的转录因子结合位点2gt元件在控制植物次生代谢、调节细胞形态建成及信号传导通路中起作用amp根特异表达系统可用于研究转基因植物的高渗胁迫耐受、植物修复和根际分泌等问题ampK-51quotL6M等99用根特异启动子/quot:’E NO和烟草钙网蛋白051601基因构建融合表达载体水培转基因烟草结果表明根细胞不仅能够高效生产ENO而且可将目的蛋白质分泌到液体培养基中amp因此利用该启动子与其他有用的能编码蛋白质的基因融合不仅可大量生产目的蛋白质且更便于回收产物ampquot茎特异启动子F51PP等利用QADDNRO技术从马铃薯中分离了一个与乙醇脱氢酶非常相似的FQN995quot51SP514PG5T/其基因8T可能参与植物体内影响赤霉素水平的复合物的合成9:amp在AKU数据库中比较8T启动子与马铃薯的S1U和UU、蛋白酶抑制子、-P601::V和:7V等编码蛋白质基因的启动子发现它们包含一些可能与蔗糖应答反应有关的共有序列该启动子还包含植物中几个保守的转录因子如Q-G9Q-G:Q-G7和OKN的结合位点amp构建’启动子EW8融合表达载体转化烟草EW8组织化学染色显示该启动子驱动基因在茎结节处特异表达可能参与块茎形成过程amp研究在茎中特异表达基因的启动子不仅可从分子水平了解茎的发生、分化过程更重要的是利用这些启动子调节植物代谢可满足人类需求如人们对木质素生物合成及其调控的研究amp木质素是植物体内仅次于纤维素的一种含量丰富而重要的有机大分子物质它的存在对于增加植物机械强度、远距离水分运输和抵抗外界不良环境的侵袭都是非常有益的amp然而木质素的存在也有一定的负面作B第quot卷第期quot年月用quot因此人们希望通过调节木质素的合成以降低其含量目前多使用amp’quot启动子驱动目的基因近年来已分离一些木质素生物合成途径中关键酶基因的启动子如quotamp等基因的启动子人们正在尝试利用这些特异性启动子来调节木质素的生物合成-./01等2已从拟南芥中分离了肉桂酸羟-2-基化酶’-.2./01234056-quotamp基因的启动子本实验室首次从毛白杨中分离了quotamp启动子并对该启动子的功能进行了初步鉴定34组织化学染色和34荧光测定结果表明quotamp启动子驱动外源基因在烟草茎的维管组织中丰富表达待发表有望将来利用该启动子驱动功能基因调控木质素的生物合成过程quot叶特异启动子amp5566707等从咖啡’377-28’中克隆了-二磷酸核酮糖羧化酶8加氧酶59:76/小亚基基因9:quotlt该基因在一年生植物咖啡的叶中特异表达研究发现9:quotlt启动子上游3lt33ltltlt序列与豌豆gtquot启动子的/核心序列相同在其启动子3-:/33lt33两侧分别有一个类-:/核心序列为3lt3形成-3-结构推测3-:/十个碱基的回文结构可能结合某个转录因子其lt-:/3ltltltltltltlt与其他9:quot和quot:基因的lt-:/ltltltltltltltlt 相比只有两个碱基不同类.-:/ltlt与马铃薯gt和gtquot启动子的相同由此可见植物叶特异表达顺式元件具高度保守性有趣的是lt07196A7等B在玉米中发现了一个双元启动子系统C9D5/E/F5GFEHHIJDG59-KF/5FA/DA/DAFC7L70是2植物光合反应中的一个叶绿体酶该酶基因gt1具有一个双元启动子系统quotgt1启动子和细胞质gt1启动子这两个启动子的区别在于起始密码子和拼接方式的差异quotgt1启动子驱动gt1转录成较长的EgtM基因产物定位在叶绿体中细胞质gt1启动子在gt1基因的第一个内含子中驱动gt1转录成较短的Egt-M它所编码的蛋白质定位于细胞质中又称为细胞质gt1启动子quotgt1启动子是受光诱导的强启动子驱动基因在玉米叶肉细胞中特异表达而细胞质gt1启动子是个弱启动子且不具有组织特异性大多数2植物的光合作用相关基因的表达具有细胞特异性且主要在转录水平调节基因表达活性因此可利用该启动子在2植物叶肉细胞中高效表达外源基因quot花特异启动子高等植物发育过程中花器官的形成是一个十分复杂的过程它包括一系列器官分化及严格控制的细胞及生化变化同时伴随大量基因的协同表达目前人们最为关注的是花药中特异表达的基因抑制或破坏这些基因的表达可导致雄性不育即可利用基因工程的方法创造雄性不育系人们克隆了许多花药特异表达的基因如在花药绒毡层特异表达的ABNBO、在花粉壁特异表达的:CP等但这些基因都是在花药营养细胞中表达与生殖细胞的分化无关701A等QR从百合5D53E7532D中克隆了一个Fquotlt基因的启动子该启动子驱动的基因只在雄配子细胞中表达Fquotlt启动子SQ2QTSOquot:D之间可能包含某种顺式作用元件它的缺失会导致细胞特异性表达特性丧失由此可知Fquotlt在生殖细胞中的表达特异性可能是由于其他细胞中存在某些转录因子抑制该基因表达的结果这是迄今为止发现的第一个有关雄配子细胞特异性的启动子在研究花药发生和受精作用中将会是一个有用的工具quot果实、种子特异性启动子利用果实或种子等器官特异性启动子调控基因表达不仅可提高基因在这些部位的表达量将生物能耗降到最低利于表达产物的分离而且可有目的地提高转基因植物果实或种子的营养或改善其品质番茄GH启动子Q是成熟果实中乙烯应答性基因的启动子其S2RPTSQBquot:D可控制GH基因在果实成熟过程中特异表达SQOTSROO:D为乙烯应答激活域0CA9等QQ利用GH启动子驱动呼吸道合胞病毒U抗原基因成功转化番茄植株用果实特异表达抗原喂饲小鼠可诱导小鼠产生特异的粘膜免疫反应、血清学抗体反应及ltV型细胞免疫反应基因表达调控与免疫学的有效结合使得转基因植物口服疫苗可在不久的将来问世QQ是番茄中另一种果实特异性启动子毛自朝等Qquot利用该OO第quot卷第期quot 年月启动子驱动quot调节果实内源激素的含量不仅可获得无籽果实还能改善果实的品质种子特异性启动子中研究较多的是胚乳特异性谷蛋白基因启动子谷蛋白占水稻种子储藏蛋白总量的amp’amp’早在年-./.0.12等就克隆了第一个水稻谷蛋白基因的3456该基因转录起始位点7178quot之间有若干控制种子特异性表达的顺式作用元件如6696:8lt、种子凝集素:8lt、未成熟种子核因子结合位点等此外启动子更上游处还有若干增强子和调节元件如7ampamp8quot处的gt重复序列它是核蛋白的结合位点1ABB.C.等1研究发现水稻谷蛋白启动子上游7amp27amp8quot之间有两个顺式作用元件6696和D952D952能增强启动子的活性而启动子的组织特异性则须两者协同作用虽然植物食物中包含人类营养所需的绝大多数矿物质和有机养分但日常摄入的食物往往不足以提供人体所需的营养因此人们希望通过植物基因工程提高植物中所含的营养物质水稻谷粒中含有铁蛋白但多积累在糊粉层在谷粒加工过程中会失去很多铁E.A3F3GHA等1用水稻胚乳特异性谷蛋白基因启动子驱动大豆铁蛋白基因使转基因水稻谷粒中铁和锌的含量都有所增加而且铁蛋白主要积累在胚乳中不会在食品加工过程中丢失无独有偶4..等1利用水稻谷蛋白特异启动子驱动八氢番茄红素合酶基因quot在水稻胚乳中成功合成维他命原6以植物为生物反应器生产生物可降解塑料是本实验室研究目标之一叶梁等使用大豆I种子特异性启动子构建二价和三价种子特异性表达载体转化油菜1这样将产物聚::羟基丁酸酯JKL定位与种子质体中不仅增加了底物供应也减少JKL对植物生长发育的影响为优化已有表达框架减小基因沉默发生几率MB.FN等amp从油菜K基因组456中分离到a mp’启动子的部分序列—amp序列分析表明amp’启动子包含一些在进化上保守性很高的序列如6-:C3BAGOPGF3G-69696-保守序列、gt重复序列、D:8lt等这些顺式作用元件可能对种子特异性表达起重要的调控作用将amp与DQI基因融合转化烟草DQI在胚和胚乳中均有表达DQI荧光检测显示amp启动子具有驱动基因在种子发育晚期表达的能力诱导型启动子与组织器官特异性启动子相比诱导型启动子有着独特的优点它可根据需要在植物特定的发育阶段、组织器官或生长环境下快速诱导基因转录的“开”与“关”根据来源可将诱导型启动子分为天然存在的启动子和人工构建的启动子quot天然的诱导型启动子长期进化过程中植物通过启动不同基因的表达可在一定范围内适应光、温、水等环境的变化这些基因的启动子通常包含比较保守的顺式作用元件利用这些保守元件可以推测新基因的可能功能也可用这些环境应答基因的启动子与抗逆基因融合从而使转基因植物更好地适应逆境天然诱导型启动子包括光、温度、激素应答启动子等光应答启动子中通常存在D-::RST:8ltD:8lt和6-:C3BAGOPGF3G等顺式作用元件温度应答启动子中多存在KIU:RS9966-:8lt99:D69:RS等激素应答启动子中则包含各种激素应答元件D:8lt作为蛋白结合的一个高度保守的位点是植物中通用的受信号诱导的顺式作用元件在植物和动物中具高度保守的核心序列969D-1D:8lt通常与另外一个顺式作用元件如T:8ltK:8lt等协同作用在细胞接受外界信号时调节转录起始的频率这种机制可能是通过D:8lt及其结合蛋白相互作用产生一个内部环境其他调节蛋白与启动子区域有效结合使细胞准确而有选择地起始转录有些诱导型启动子同时具有组织特异性如quot-启动子既包含叶特异表达元件又带有几个光应答元件VgtUA受光的诱导调节当转基因烟草由光照转入黑暗时该启动子驱动的DQI活性比在光下低许多5CBGCF杂交几乎检测不到DQI的表达由于植物生长环境及基因表达的复杂性从外界环境的刺激到启动应答基因的表达之间的信号通路往往是相互交叉的这样启动子中包含的顺式作用元件通常也不止一种如从葡萄中克隆的白藜芦醇合酶基因./0-启动子当病虫侵害、QE照射、第quot卷第期quot年月臭氧环境或化学物质诱导时均可启动quot的表达quot等ampamp发现该启动子上分别带有乙烯和臭氧的应答元件可适应不同的外界刺激拟南芥’基因amp在干旱、高盐碱、低温或脱落酸诱导时表达其启动子-./0-11区域包含干旱应答因子2quot3455654和7应答因子7quot356466845且该基因在7诱导表达时2quot3和7quot3是相互独立的当植物受病虫害侵犯时受伤部位会立刻启动细胞程序性死亡即发生所谓超敏反应9:lt’ltgtAlt’ltgtltBquotBquot通常会启动未受伤部位产生次级防御反应从而对一般的病虫害产生普遍抗性这种现象称为系统获得性抗性:ltCDEDF’lt’ltEgtDltGquot烟草中Gquot基因是一个至少包含十二个成员的家族Gquot也受一些诸如水杨酸GHID9J’gtDgtDED和74BKltgtL9EELJlt等化学物诱导amp1烟草amp’基因启动子-M18-M.是E-.元件4656-.N8-..和-/N8-/.为两个64-.结合序列664-/8-、-amp8-amp.O和-/N.8-/1O分别是2P结合基序6前两者被认为可以与G应答的转录因子结合而起关键作用启动子缺失实验表明GE’OK启动子-/0-/O和-amp1.0-./K分别包含有Gquot高效诱导基因表达所需的顺式作用元件缺少了这两个2I片段转基因烟草6QG表达活性明显降低quot人工构建的诱导型启动子在开发植物天然存在的诱导型启动子的基础上人工构建可诱导表达系统以满足不同需求目前研究最多、最深入的可诱导表达系统是化学诱导表达系统自第一次用化学诱导表达系统4ltquot通过5ERSamp1G启动子成功调节amp基因ampN的表达以来已有M多年的历史现已发展成日臻完善的植物表达外源基因的可诱导表达系统该系统包括两个转录单元一是与化学诱导物结合的转录因子的表达另一个转录单元包含一个应答元件经诱导物处理后通过它激活转录因子从而激活或抑制目的基因的表达amp/一个理想的化学诱导表达系统应具备以下特点首先外源基因在植物体自身不表达或低水平表达当添加诱导物后高效诱导基因表达其次诱导物需要有较强的专一性第三诱导物可快速启动基因表达的“开”与“关”而且诱导物对植物无毒或低毒amp/ampO根据控制基因表达的方式可将化学诱导系统分为两大类阻遏型启动子系统和激活型启动子系统quotquot阻遏型启动子系统该系统建立在阻遏蛋白与转录因子在空间构型相互作用的基础之上当诱导物不存在时激活蛋白与阻遏蛋白结合基因正常转录添加诱导物后诱导物与激活蛋白结合或阻止其与阻遏蛋白结合阻遏蛋白则与启动子上的某些顺式作用元件结合抑制基因转录如以四环素抑制子为基础的四环素抑制系统4TAlt等amp用包含四环素抑制子的启动子4.M与报告基因6UV相连转化拟南芥发现用.MMgtW8CT的四环素即可抑制6UV的表达而且改变培养基中四环素的浓度可调节6UV的表达水平quotquot激活型启动子系统在抑制型启动子系统中抑制基因转录所需诱导物的量往往超出植物适应的范围而且在真核生物中激活基因比抑制基因转录更容易近年发展了一些激活型启动子系统如地塞米松诱导的6quot系统M、雌二醇诱导的3quot系统.、杀虫剂诱导的3Dquot 系统等激活型启动子系统的优点是只有当诱导物存在时才能启动基因表达去除诱导物后基因表达很快被关闭这样就可以人为地精确、快速控制基因的表达79gtlt’等amp 研究了一种可双向调控外源基因表达的系统他们将改造的启动子4.M与报告基因6QG相连使用转录激活子46S作为基因开关转基因烟草结果表明用地塞米松处理amp9后基因表达量达到高峰用四环素处理N9即可关闭基因表达该诱导系统最大的优点在于可迅速调节基因的表达与否当外源基因可能对植物产生不良影响时这一点显得尤为重要为了满足应用需要人们开始研究便于在大田使用的诱导表达系统杀虫剂诱导的3Dquot系统就是一个很好的范例QgtWlt’等利用欧洲玉米螟-quot.’/0/amp01/2amp2/quot的蜕皮激素配基结合结构域3DquotT72、玉米5.激活域2和6T2I结合结构域272构建化学诱导激活子把它与玉米C1最MNO第quot卷第期quot 年月小启动子相连构建成可受杀虫剂诱导的人工启动子诱导系统他们利用该系统在玉米雄性不育突变株quot中成功地诱导了育性恢复基因amp’的表达问题与展望近年人们在启动子研究方面展开了大量的工作不仅克隆了数量丰富的启动子而且对其结构和功能有了一定的认识但从遗传信息到基因的表达是一个十分复杂的过程还有许多问题有待解决基因表达与否以及表达时间、表达部位需要启动子上的顺式作用元件与相应的转录因子的协同作用从植物中已知的启动子分析组织特异性及诱导型启动子的顺式作用元件有一定的保守性如-.是种子特异启动子的高度保守区/-.通常受光敏色素0诱导参与多种信号调节.。

植物诱导型启动子研究进展_孙芳芳

植物诱导型启动子研究进展_孙芳芳

收稿日期:2014-01-13基金项目:重庆市自然科学基金资助项目(No.CSTC2011jjA80014),中央高校基本科研业务费资助项目(No.XDJK2009B024)作者简介:孙芳芳(1986-),女,汉族,西南大学,硕士研究生,蔬菜遗传育种与生物技术,E-mail:723352260@qq.com通讯作者:宋洪元,男,汉族,西南大学,研究员,硕士生导师,E-mail:707671194@qq.com植物诱导型启动子研究进展孙芳芳宋洪元(西南大学园艺园林学院,重庆北碚400715)摘要:启动子是控制目的基因表达的关键元件,而诱导型启动子的出现为精确、灵活调控外源基因在植物中的表达提供了可能,目前已经成为植物基因工程研究和开发的热点之一。

该文主要就环境胁迫诱导型、光诱导型、激素诱导型等各种常见的诱导启动子的特点进行了综述,并对诱导型启动子的未来研究和应用方向进行了展望。

关键词:诱导型启动子;作用元件;基因表达调控外源基因在植物受体细胞中的表达是植物基因工程研究的关键问题之一。

基因的表达由顺式作用元件和反式作用因子共同调控。

启动子是位于基因上游区域调控基因转录的一段DNA序列,是一种重要的顺式调控因子,决定基因转录的时空精确性和转录效率,从而调控下游基因的表达。

因此,植物启动子的研究有助于了解控制基因转录的模式及其调控机制,并有利于提高和改进外源目的基因的表达。

植物基因的启动子按表达方式可分为组成型启动子(基因的表达不受时空限制和外源因素的控制)、诱导型启动子(基因的表达受外源物理、化学因素的诱导,没有诱导物存在,基因表达水平很低甚至没有)和组织特异性启动子(基因的表达分布在植物的某个组织或器官中)。

组织特异性启动子的特异表达不具有绝对性,如绝大部分果实特异性启动子同时存在乙烯应答元件,故也可看作是乙烯诱导型启动子。

因此,不同的研究方法和分析角度会导致同一启动子的分类产生差异,一种类型的启动子也往往会具有其他类型启动子的特性。

高等植物启动子功能和结构研究进展

高等植物启动子功能和结构研究进展

高等植物启动子功能和结构研究进展
夏江东;程在全;吴渝生;季鹏章
【期刊名称】《云南农业大学学报》
【年(卷),期】2006(021)001
【摘要】启动子是控制植物基因表达的重要DNA序列结构,文章简述了启动子的定义、分类和启动子的研究策略.并着重从组成型启动子、组织特异型启动子和诱导型启动子3个方面介绍了它们的功能和结构的研究现状.提出了植物基因工程中启动子研究存在的问题与展望.
【总页数】8页(P7-14)
【作者】夏江东;程在全;吴渝生;季鹏章
【作者单位】云南农业大学农学与生物技术学院,云南,昆明,650201;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南,昆明,650223;云南农业大学农学与生物技术学院,云南,昆明,650201;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南,昆明,650223
【正文语种】中文
【中图分类】Q943.2
【相关文献】
1.高等植物ACC氧化酶基因启动子研究进展 [J], 吴健;侯和胜
2.高等植物启动子功能和结构研究进展 [J], 夏江东;夏平
3.高等植物启动子克隆方法的研究进展 [J], 王莹;韩烈保;曾会明
4.高等植物胁迫诱导型启动子的研究进展 [J], 文添龙;刘雪梅;冀亚萍;俞嘉宁
5.高等植物绿色组织特异表达启动子研究进展 [J], 王淼;王旭静;唐巧玲;王志兴;王育青
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植物基因启动子的克隆及其功能研究进展

植物基因启动子的克隆及其功能研究进展

植物遗传资源学报2008,9(3):3852391Journal of Plant Genetic Res ources植物基因启动子的克隆及其功能研究进展聂丽娜1,2,夏兰琴1,徐兆师1,高东尧1,李 琳1,2,于 卓2,陈 明1,李连城1,马有志1(1中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部作物遗传育种重点开放实验室,北京 100081;2内蒙古农业大学农学院,呼和浩特 010019) 摘要:启动子在植物基因表达调控过程中起着重要作用。

对于植物基因启动子的克隆及其功能研究有助于了解信号传递途径和基因表达调控模式,为植物转基因工程研究提供理论依据。

本文综述了植物基因启动子的基本结构、类型、克隆方法及功能研究进展,着重介绍了广泛应用于转基因工程的诱导型启动子及启动子功能分析,展望了今后植物启动子的研究方向。

关键词:植物基因启动子;诱导型启动子;克隆;功能分析Progress on Clon i n g and Functi onal Study of Pl ant Gene Pro motersN I E L i 2na 1,2,X IA Lan 2qin 1,XU Zhao 2shi 1,G AO Dong 2yao 1,L IL in1,2,Y U Zhuo 2,CHE N M ing 1,L IL ian 2cheng 1,MA You 2zhi1(1N ational Key Facility for C rop Gene Resources and Genetic I m prove m ent/Key L aboratory of C rop Genetics and B reeding,M inistry of A griculture /Institute of C rop Sciences,Chinese A cade m y of A gricultural Sciences,B eijing 100081;2College of A grono m y,InnerM ongolia A gricultural U niversity,Huhhot 010019) Abstract:Pr omoters p lay an i m portant r ole in the p r ocess of p lant gene exp ressi on and regulati on .The studyon the p r o moter cl oning and its functi onal investigati on contributes t o understand the signal transducti on pathways and gene exp ressi on regulati on model,and offers theoretical basis f or transgenic engineering .This paper revie ws the basic structure,types,cl oning methods and the functi on of p lant gene p r omoters,es pecially inducible p r omoters and their functi on analysis app lied widely t o transgenic engineering .I n the end,this paper deals with the future re 2search and devel opment p r os pects of p lant p r omoters .Key words:Plant gene p r o moter;I nducible p r omoter;Cl oning;Functi on analysis收稿日期:2008204220 修回日期:2008206216基金项目:国家高技术研究发展计划(“863”计划)项目(2006AA10Z115,2007AA10Z130);国家自然科学基金项目(30700504)作者简介:聂丽娜,硕士,研究方向为分子生物学通讯作者:徐兆师,助理研究员,博士,研究方向为分子生物学。

几个拟南芥器官特异性启动子的克隆和功能验证

几个拟南芥器官特异性启动子的克隆和功能验证
②方向性。启动子是一种有方向性的顺式调控元件,有单向启动子和双向启动子两 类。

③位置特异性。启动子一般位于所启动转录基因的上游或基因内的前端。处于基因 的下游或在基因的上游但离所要启动的基因太远的启动子,~般都不会起作用。
④种属特异性。原核生物的不同种、属,真核生物的不同组织都具有不同类型的启 动子,但一般来说,亲缘关系越近的两种物种,其启动子通用的可能性越大llJ。
植物启动子的顺式元件除了上述共有的保守碱基序列外,不同来源的启动子还通常 具有种属特异的或者仅局限于某种基因家族特有的调节基序。如高度保守的G框:其共 通序列为5 CACGTG 3,它需要与另一个顺式作用元件结合,在细胞接受外界信号时对 转录起始的频度起调节作用。醇溶谷蛋白框:保守序列为5 ACATGTGTAAAGGTGAAT 3位于.300区,但醇溶谷蛋白基因只有在内胚乳表达【51。豆球蛋白框:其保守序列为5 TCCATAGCCATGCATGCTGAAGAATATC 3,该序列指导成熟种子的特异表达,具有 一种数量调节的特性16J。
genes,play a crucial role in flowering transition and activation of flower organ identity genes. In this study,three different 5’一lfy’S promoter deletion fragments are cloned from arabidopsis,
论文作者签名: 豸p易勿
日期:
08年5月 30日
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种子特异性启动子的研究进展

种子特异性启动子的研究进展
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1 植物 基因核心启动子结构及功 能
T P ( AA.o.id g ren B TT bxbni p t )的 结 合 能 力 与 一 般 n oi 5. A 3的启 动 子 的 结 合 能 力 相 似 。这 种 反 向 的 A. J T T 框能与 T P结合 并指 导下 游 的转 录表明 , 真核生 物 AA B 在
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马铃薯块茎组织特异性启动子GBSS的克隆及序列分析

马铃薯块茎组织特异性启动子GBSS的克隆及序列分析

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2 结 果 与分 析
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畏 赢 粜 ( 术 学 版)

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植物组织特异性启动子的研究进展摘要:组织特异性启动子也称器官特异性启动子(organ specific promoter),可调控基因只在某些特定的部位或器官中表达,并往往表现出发育调节的特性。

本文介绍了植物组织特异性启动子中的花、果实、种子及叶特异性启动子,并对植物组织特异性启动子研究中问题进行了讨论和展望。

关键词:植物组织特异性启动子,研究进展启动子(promoter)是RNA聚合酶能够识别并与之结合从而起始基因转录的DNA序列,是重要的顺式作用元件,位于结构基因5’端上游区的DNA序列,能指导全酶与模版的正确结合,活化RNA聚合酶,并使之具有起始特异性转录的形式,决定转录的方向和效率以及所使用的RNA聚合酶类型,是转录调控的中心。

目前,植物基因工程中常用的启动子为组成型表达启动子(Constitutive promoter)。

组织特异性启动子也称器官特异性启动子(organ specific promoter),可调控基因只在某些特定的部位或器官中表达,并往往表现出发育调节的特性。

外源基因在细胞中表达是基因工程研究的关键,而组织特异性启动子不仅能使目的基因的表达产物在一定器官或组织部位积累,增加区域表达量,同时也可以避免植物营养的不必要浪费。

因此,组织特异性启动子一直都是植物基因工程中研究的重点和难点,研究者在植物的分生组织、维管束组织、薄壁组织、花粉、种子和胚乳等几乎各种组织中都发现有组织特异性驱动基因表达的启动子[1],尤其在根、维管束和韧皮部特异表达启动子研究中取得了很大进展。

1 植物生殖器官表达的组织特异性启动子1.1 花特异启动子高等植物发育过程中花器官的形成是一个十分复杂的过程,它包括一系列器官分化及严格控制的细胞及生化变化,同时伴随大量基因的协同表达。

植物花特异表达启动子只在植物开花的时期启动基因的表达,它的分离克隆为花卉的品质改良提供了重要的顺式调控元件。

人们克隆了许多花药特异表达的基因,如在花药绒毡层特异表达的TA29[2]和A9[3]以及在花粉壁特异表达的Bp4A[4]基因等,这些基因都是在花药营养细胞中表达,与生殖细胞的分化无关。

Mariani等将烟草花药绒毡层特异表达基因启动子TA29分别与核酸酶Bamase和RnaseTl基因融合后转化植物,这两种核酸酶基因在花药中特异表达,破坏绒毡层,获得雄性不育烟草和油菜[5,6],开创了基因工程创造雄性不育系的先河,至今已在烟草[7]、油菜[8]等植物上获得成功。

还有在花药中特异表达的基因,如拟南芥和油菜的APG 基因等。

在花粉中特异表达的基因如:玉米的Zm13 (蛋白酶抑制剂)、CDPK (钙依赖型蛋白激酶)、番茄的LAT52、LAT 59及油菜Bp4 、I3 、E2和F2s等。

近年来人们相继分离和鉴定了许多花特异表达基因的启动子,如矮牵牛和金鱼草的类黄酮合成相关的一些基因(CHSA、CHSJ、CHIB、CHIA2)的启动子。

其中对查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)基因家族的查尔酮合酶基因启动子的研究较为深入,CHs是类黄酮类物质生物合成途径中的关键酶,它催化3个分子的丙酚辅酶A(malonyl CoA)与1个分子的香豆酰辅酶A(eoumaryl CoA)生成4,5,7-三羟基黄烷酮(narigen-inchalcone)。

类黄酮类物质是广泛存在于高等植物中的次生代谢物,与植物的花色形成密切相关,并在植物与环境的相互作用中起重要作用,如防止紫外损伤、抗病、影响豆科植物的根瘤形成等[9]。

1.2 果实和种子特异启动子特异性启动子调控基因表达,不仅可提高基因在这些部位的表达量,而且可有目的地提高转基因植物果实或种子的品质。

目前已获得的果实特异型启动子主要有E8、2A11、2A12、PG、MCP I、B33和ACC氧化酶启动子等。

毛自朝等用PCR方法获得了番茄果实专一性启动子2A12和农杆菌C58 Ti质粒上的ipt基因,经农杆菌介导转入番茄品种“中蔬4号”的基因组中。

Beta-glucuronidase(GUS,β-葡糖苷酸酶)组织化学活性分析表明:2A12启动子具有严格的果实表达专一性;转基因果实中细胞分裂素的含量增加,最终导致果实中种子发育的停滞和胎座组织的增厚,并形成无籽番茄果实;果实采后的储藏保鲜时间延长1-2周[10]。

如Krasnyanski 等[11]将E8启动子与报道基因uidA相连,导入番茄中,在T0、T1代植株果实和叶子中分析β-葡糖醛酸糖苷酶,发现E8控制的uidA基因只在番茄果实里表达。

Obiadalla-Ali等采用反义RNA技术,将B33启动子控制的马铃薯果糖-1,6-磷酸酶基因转入番茄中,使其在果实中特异性表达。

结果表明,番茄叶绿体中果糖-1,6-磷酸酶活性被抑制,完全成熟的果实的平均重量减少20%,而其他碳水化合物,如葡萄糖、蔗糖等变化很小。

说明可以利用果糖-1,6-磷酸酶的反义RNA技术获得迷你型番茄。

另外一个问题是,果实特异启动子控制外源基因表达的效果有时并不理想。

例如Krasnyanski等[11]将花椰菜花叶病毒(cauliflower mosaic virus, CaMV) 35S启动子与苜蓿(Madicago sativa)花叶病毒的5’ 不翻译前导序列连接, 构成组成型启动子CaMV 35S/AMV,将其与E8启动子分别转入番茄中中,GUS活性分析显示:CaMV 35S/AMV控制报道基因的表达远远高于E8启动子。

种子特异性启动子分为与淀粉合成有关的种子特异启动子和与蛋白质合成有关的种子特异启动子。

与淀粉合成有关的种子特异启动子主要有gbssⅠ、SBE 1和AGP小亚基基因启动子等。

目前发现的与种子中贮藏蛋白质有关的启动子主要有球蛋(globulin)启动子、谷蛋白(glutelin)启动子、醇溶谷蛋白(prolamine)启动子、USP启动子和napin启动子等。

研究较多的是胚乳特异性谷蛋白基因启动子。

人们希望通过植物基因工程提高植物中所含的营养物质。

水稻谷粒中含有铁蛋白,但多积累在糊粉层,在谷粒加工过程中会失去很多铁。

Vasconcelos等[12]用水稻胚乳特异性谷蛋白基因启动子驱动大豆铁蛋白基因,使转基因水稻谷粒中铁和锌的含量都有所增加,而且铁蛋白主要积累在胚乳中,不会在食品加工过程中丢失。

因为种子特异性启动子可以控制外源基因在种子中的特异表达,有些外源基因的产物在种子中的大量积累,有可能会影响到种子的萌发等特性。

在有些情况下,利用种子特异启动子控制外源基因表达的效果并不比组成型启动子好。

Lee 等[13] 2001年分别将35S启动子和水稻谷蛋白GluB-1启动子控制下的赖氨酸反馈迟钝玉米的二氢吡啶合成酶基因分别导入水稻中,结果发现,35S 启动子控制的转基因水稻中dhps的转录本和种子中DHPS的活性比GluB-1启动子控制的转基因水稻中的高。

两种转基因植物中未成熟种子中自由赖氨酸的含量均比野生型的高。

35S启动子控制的转基因水稻的成熟种子中自由赖氨酸的含量比野生型高,GluB-1启动子控制的转基因水稻的成熟种子中自由赖氨酸的含量和野生型的相同。

比较DHPS和赖氨酸酮戊二酸还原酶的表达水平,可以看出外源dhps 基因的表达导致LKR活性增加,使赖氨酸水平上升,但是35S启动子控制下dhps 的过量表达可以提高种子中赖氨酸的含量。

这就表明,如要增加水稻籽粒中赖氨酸的含量,利用35S启动子的效果比GluB-1启动子更好。

2 植物营养器官表达的组织特异性启动子2.1 根、茎特异表达启动子根、茎是植物体吸收、运输水分和营养物质的重要器官。

根特异表达系统可用于研究植物的高渗胁迫耐受、植物修复和根际分泌等。

应奇才等克隆乔松的根特异性启动子PmPgPR10驱动胆碱单氧化物酶基因(CMO)和甜菜碱醛脱氢酶基因(BADH)并转入水稻,对转基因植株根和叶的CMO酶、BADH酶活性及其他生理生化指标进行了测定。

结果表明:CMO/BADH双价基因可在根部特异性表达[14]。

茎特异表达系统一般包括:韧皮部特异表达启动子、维管束特异表达启动子、块茎特异表达启动子[15]。

对这类启动子结构与功能的研究将为植物基因工程的研究提供启动元件。

蒋浩等首次证明笋瓜PP2基因启动子可驱动外源基因在异源植物韧皮部及分生组织中特异性表达。

研究比较深入的维管束特异表达启动子主要有:菜豆富甘氨酸细胞壁结构蛋白(GRPll8)基因、拟南芥维管束特异表达profilin2基因和菜豆苯丙氨酸氨裂合酶(PAL)基因的启动子。

马铃薯颗粒结合淀粉合成酶(granule-bound starch synthase, GBSS)基因在各器官中均有表达,但在块茎与匍匐茎中最高。

经研究表明马铃薯GBSS基因启动子驱动的GUS基因在匍匐茎和块茎中的表达比叶片高125~350倍,且高浓度蔗糖等因素可诱导GBSS基因高水平表达[15 ]。

2.2 叶特异表达启动子植物叶特异表达顺式元件具高度保守性,Taniguchi等[16]在玉米中发现了一个双元启动子系统(dual promoter system)。

PPDK(pyruvate orthophosphate dikinase)是C4植物光合反应中的一个叶绿体酶,该酶基因Pdk具有一个双元启动子系统(C4Pdk启动子和细胞质Pdk启动子)。

这两个启动子的区别在于起始密码子和拼接方式的差异,C4Pdk启动子驱动Pdk转录成较长的mRNA,基因产物定位在叶绿体中;细胞质Pdk启动子在Pdk基因的第一个内含子中,驱动Pdk转录成较短的mRNA,它所编码的蛋白质定位于细胞质中,又称为细胞质Pdk启动子。

C4Pdk启动子是受光诱导的强启动子,驱动基因在玉米叶肉细胞中特异表达,而细胞质Pdk启动子是个弱启动子,且不具有组织特异性。

大多数C4植物的光合作用相关基因的表达具有细胞特异性,且主要在转录水平调节基因表达活性。

因此,可利用该启动子在植物叶肉细胞中高效表达外源基因。

3 植物组织特异性启动子的问题及研究展望启动子是精确调控外源基因在植物体内表达的“开关”。

随着转基因技术的广泛应用,快速分离和鉴定植物体内各种特异启动子已经成为植物基因工程研究的热点和难点。

近年来,植物种子特异性启动子的研究和应用有了很大的提高,但是在应用过程中也出现了一些新的问题。

一些种子特异启动子除了使外源基因在种子中表达,还可以使外源基因在植物的其他部分异位表达[17,18]。

另外,种子特异性启动子由多个元件控制,调控机制复杂。

种子特异性启动子能否驱动外源基因在转基因植物中正确表达,表达时间和空间严格遵循种子特异性,启动子的哪些序列参与了表达与调控,顺式作用元件与反式作用因子如何协调,能否跨越种属间隔进行调控,采用何种方法保证转基因植物种子的顺利萌发,或避开由种子萌发获得实生苗的途径而通过组织培养等方式使外源基因在子代中顺利表达等,这些问题有待于进一步研究和解决。

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