安捷伦化学工作站(新的化学工作站流程入门)
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数据采集
单个采集方法 ACQ.M 用于保留采集参数,因此建议您在以后的数据审核操作中 不要更改此方法。 可在数据分析视图中查看和打印此方法的采集参数。
如果序列文件夹中保存了这些文件,则可以在不改变主方法或序列模板的情况下 执行数据审核和数据再处理操作。 如果需要,也可以将方法更改再次保存到主方 法中。
9
2 数据采集
数据采集
数据采集
从化学工作站 B.02.01 开始,您可以利用单次运行和序列的灵活数据存储来指定 不同的保存位置,而无需重新配置。使用 “ 视图 ” 菜单的首选项对话框中的路径 选项卡,可以添加除默认路径 C:\chem32\x\DATA (其中 x 是仪器编号)之外 的多个路径。 用添加和删除按钮可以方便地删除现有路径,您也可以导航选定位 置并将新位置的路径添加到首选项中。 不能从列表中删除默认路径,但可以在配 置编辑器中更改它。
品。 序列采集期间发生仪器故障时,可能会出现这种情况。 • 采集已有行后,向序列模板添加了其他的行。其他的运行将添加到已有数据
中。 因此,当用户从序列菜单中选择部分序列时,将出现对话框,其中提供了从列表 选择现有序列容器还是创建新序列容器的选项。
化学工作站工作流程
13
2 数据采集
数据采集
数据的存储模式取决于采集的是单次运行数据还是序列数据: 1 执行序列时,将在指定子目录中用唯一名称自动创建新文件夹 (序列容器)。
运行单个样品时,数据文件 (*.d) 将写入指定子目录。
化学工作站工作流程
7
1 化学工作站数据结构
化学工作站 B.02.01 及更高版本
2 对于序列数据,执行的序列模板 (*.s) 和所有涉及的方法 (*.m) 都会复制到序 列容器中。 方法的副本叫做序列方法,以区别于原始主方法。
版本
2/2009 Germany 印刷 Agilent Technologies Hewlett-Packard-Strasse 8 76337 Waldbronn
仅供研究之用。
禁止在诊断过程中使用。
软件版本
本指南对 B.04.xx 版的安捷伦化学工作 站软件有效,其中 xx 表示该软件的次 要版本,并不影响本指南的技术准确 性。
图2
“ 首选项 ” 对话框 /“ 路径 ” 选项卡
然后,在执行运行时,就可以在样品信息 / 序列参数对话框中对所有新指定的数 据路径进行选择。
10
化学工作站工作流程
数据采集 2
数据采集
图3
数据路径选择
序列中的数据采集
为了运行序列,必须有适当的预定义方法。 这些方法就是以上所述的主方法。 通 常,主方法和序列模板用在化学工作站的方法和运行控制视图中。 因此,在方法 和运行控制视图中,可通过化学工作站资源管理器访问主方法和序列模板。
部分序列采集
在部分序列采集的情况下,用户可在两个选项之间选择: • 将部分序列采集到新的序列容器中 或 • 在已有序列容器中采集部分序列。 从部分序列执行中将数据文件采集到已有序列容器中,这在以下情况下可能有 用: • 必须覆盖单个数据文件 (或若干数据文件),例如因为第一个位置使用了错误
的样品瓶。 • 第一个位置只执行了序列的第一部分,必须通过执行部分序列来添加缺少的样
声明
本书内容如有改变,恕不另行通 知。安捷伦科技公司对本材料,及 由此引出的任何商务和特种用途不 承担责任。安捷伦科技公司对本手 册中可能有的错误或与装置、性能 及材料使用有关内容而带来的意外 伤害和问题不负任何责任。如果安 捷伦与用户对本书中的警告术语有 不同的书面协议,这些术语与本书 中的警告术语冲突,则以协议中的 警告术语为准。
1 化学工作站数据结构
本章概述了 B.02.01 版之前的化学工作站中使用的数据结构与 B.02.01 版及其后 续版本中的新数据结构之间的差别。
2 数据采集
本章将说明对序列和单次运行,新的数据结构如何影响数据采集的工作流程。
3 数据分析
本章将概述可用的数据分析和审核选项,并说明数据结构情况对选择选项有何影 响。
两个方法都包含完整的方法参数,包括采集和数据分析参数。 ACQ.M 的设计意图是确保保留了每个特定数据文件的原始方法参数。采集 参数可以在 “ 数据分析 ” 视图中查看和打印。 DA.M 可在数据分析过程中修改,以便存储那些不适用于序列的所有运行而 仅供某个数据文件专用的数据分析参数,例如定时积分事件。
技术许可
本书对硬件和 / 或软件的介绍已获得特 许,未经许可,不得使用或复制。
权力限制说明
如果软件用于某一美国政府基本合同或 次级合同,软件的使用将作为下列情况 之一被许可:按照法案 DFAR 252.227-7014 (1995 年 6 月)确定的 “ 商业计算机软件 ” ;或者按照法案 FAR 2.101 (a) 确定的 “ 商业条款 ” ;或者按 照法案 FAR 52.227-19 (1987 年 6 月)确定的 “ 限制计算机软件 ” ;或者 任何相当机构法规或合同条款。软件的 使用,复制或解密受安捷伦科技标准商 业许可条款的管理,美国政府的非 DOD 部门和机构将获得不比法案 FAR 52.227-19 (c) (1-2) (1987 年 6 月)大 的权利。美国政府的用户将获得不比法 案 FAR 52.227-14 (c) (1-2) (1987 年 6 月)或 DFAR 252.227-7015 (b) (2) (1995 年 11 月)确定的限制权利大的 权利,这一原则适用于任何技术数据。
图4
“ 首选项 ” 对话框 /“ 序列 ” 选项卡
采集序列开始时,将从主方法文件夹把序列表中指定的方法复制到序列容器中。 此外将创建该序列的一个副本,和序列日志、批处理 (*.b) 文件一起放在序列容 器中。所有方法更新 (例如,校正表的更新)都将写入容器中的该序列方法。此 时,所有必需文件都已可用于将来数据审核和数据再处理,而不受其他序列运行 时对主方法或序列模板所作更改的影响。
安捷伦化学工作站
新的化学工作站工 作流程入门
化学工作站工作流程
Agilent Technologies
注意
© 安捷伦科技有限公司,2006, 2007-2009 根据美国和国际版权法,未经安捷伦公 司书面许可,本书内容不得以任何形式 复制 (包括电子存储修改或翻译)。
手册部件号
G2170-97043
序列模板会在序列表中引用这些方法。
化学工作站工作流程
11
2 数据采集
数据采集
就像前面解释过的,用序列模板 <sequence_name>.S 运行序列,并且使用主方 法 <method_name>.M 时,将创建一个新文件夹 (“ 序列容器 ”),其中包含序列 运行所生成的所有文件。
该文件夹的位置由序列参数对话框中的设置确定;该文件夹的命名由首选项对话 框的序列选项卡确定。默认情况下,名称为 <sequence_name> <acquisition_date> <acquisition_time>,但可以用标记操作者、仪器、计数器和 PC 名称来配置,也可以手动输入任何名称。如果名称模式没有产生专有的序列 容器名称,化学工作站将附加上一个计数,以确保唯一性。
6
化学工作站工作流程
化学工作站 B.02.01 及更高版本
化学工作站数据结构 1
化学工作站 B.02.01 及更高版本
为了加强数据文件和方法之间的相关性,化学工作站 B.02.01 及更高版本实现了 以下新的数据组织模式。和化学工作站一起使用时,安捷伦 OpenLAB 企业内容 管理器 (ECM) 也会利用新的数据概念,因为现在可以把整个数据集 (序列 / 方 法 / 数据文件)作为一个实体传输 (归档)到 ECM。
图1
Sequence Acquisition B.02.01 及更高版本
文件夹 Chem32\1\methods 中的方法用作主方法,也就是说在采集和数据分析 期间,它们保持不变。
类似地,文件夹 Chem32\1\sequence 中的序列用作序列模板,可用于多次重新 运行序列 (但不进行数据再处理)。
5
1 化学工作站数据结构
B.02.01 之前的化学工作站
B.02.01 之前的化学工作站
在 B.02.01 版之前的化学工作站中,序列、方法和生成的数据文件及结果都存储 在固定的、彼此分开的指定位置中。 例如,在序列中方法通过名称来引用,用户 需负责维护方法、序列和数据文件的完整性。 因此,数据的长期归档和结果的复 制就成了艰巨的任务。 用户必须记录色谱图、结果和相关方法;不仅常规实验室 是这种情况,有些领域的非常规实验室 (例如环境实验室)也是如此。在 B.02.01 之前的化学工作站中,只能通过把所有内容打印在报告中来实现。
以下章节将详细说明这一结构对典型工作流程的影响。 同时还将介绍化学工作站 对话框中的相应设置。
8
化学工作站工作流程
源自文库
化学工作站工作流程
2 数据采集
数据采集 10 序列中的数据采集 11 部分序列采集 13 单次运行的数据采集 14
本章将说明对序列和单次运行,新的数据结构如何影响数据采集的工作流程。
Agilent Technologies
安全警告
警告
警告提示表示危险。提醒您 在操作过程中注意,如果执 行不当,将导致人身伤害或 死亡。不要忽视警告提示。
小心
小心提示表示危险。提醒您 在操作过程中注意,如果执 行不当,将影响产品或丢失 重要数据。不要忽视小心提 示。
化学工作站工作流程
内容提要 …
内容提要 …
在分析实验室中,需要在短时间内高效地采集色谱数据。 澄清含糊的结果会很费 时,而且会增加管理成本。自化学工作站 B.02.01 版以来,数据存储和数据浏览 功能已得到改进,能更快地对结果数据进行审核和数据再处理。 在本手册中,将说明如何高效地使用化学工作站 B.04.01 中的新数据存储和检索 功能来提高您实验室的效率。
采集期间,数据文件将存储到序列容器中。在每个数据文件 (*.D) 内,会为这次 特定运行保存另两个方法 (ACQ.M 和 DA.M)。这两个方法是序列方法的副本, 保存了采集特定数据文件时方法的状态。在某些情况下 (例如校正表更新),每 次运行时 DA.M 方法均不同。
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化学工作站工作流程
数据采集 2
4
化学工作站工作流程
化学工作站工作流程
1 化学工作站数据结构
B.02.01 之前的化学工作站 6 化学工作站 B.02.01 及更高版本 7 本章概述了 B.02.01 版之前的化学工作站中使用的数据结构与 B.02.01 版及其后 续版本中的新数据结构之间的差别。
Agilent Technologies
所有和序列相关的任务 (例如采集和数据分析)都在序列和方法的副本上执 行。 因此,序列模板和主方法会保持不变,以便将来进行其他序列操作。
序列采集过程中对序列所作的任何更改 (例如向序列表添加行)都将在序列 容器内的序列文件副本上执行。 序列模板将保留不变。
类似地,方法中的任何更改 (即运行校正时校正表中的更新)都会反映在序 列方法中,而不是主方法中。 执行序列时,生成的所有数据文件 (*.d) 和对应的批处理文件 (*.b) 及序列日志 文件 (*.log) 都会存储到序列数据文件夹中。 3 每个数据文件都包含两个用于创建运行的方法副本。 • 第一个副本叫做 ACQ.M,完成方法的采集部分之后直接保存。 • 第二个副本叫做 DA.M,在完成数据分析部分之后保存。
4 “ 专有文件夹创建 ” 关闭时的工作流程
本章将介绍 “ 专有文件夹创建 ” 关闭时的工作流程,此时您可以如同在化学工作 站 B.01.03 或更早版本中那样保存数据。该模式不能充分利用化学工作站中最新 的数据审核和数据再处理功能的优点。
化学工作站工作流程
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目录
目录
1 化学工作站数据结构 5 B.02.01 之前的化学工作站 6 化学工作站 B.02.01 及更高版本 7
2 数据采集 9 数据采集 10
3 数据分析 15 数据分析 16 数据分析:数据审核 18 数据审核期间的化学工作站用户界面 23 数据分析:数据再处理 25
4 “ 专有文件夹创建 ” 关闭时的工作流程 29 “ 专有文件夹创建 ” 打开还是关闭? 30 “ 专有文件夹创建 ” 关闭时的工作流程 31 序列容器迁移 34
单个采集方法 ACQ.M 用于保留采集参数,因此建议您在以后的数据审核操作中 不要更改此方法。 可在数据分析视图中查看和打印此方法的采集参数。
如果序列文件夹中保存了这些文件,则可以在不改变主方法或序列模板的情况下 执行数据审核和数据再处理操作。 如果需要,也可以将方法更改再次保存到主方 法中。
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2 数据采集
数据采集
数据采集
从化学工作站 B.02.01 开始,您可以利用单次运行和序列的灵活数据存储来指定 不同的保存位置,而无需重新配置。使用 “ 视图 ” 菜单的首选项对话框中的路径 选项卡,可以添加除默认路径 C:\chem32\x\DATA (其中 x 是仪器编号)之外 的多个路径。 用添加和删除按钮可以方便地删除现有路径,您也可以导航选定位 置并将新位置的路径添加到首选项中。 不能从列表中删除默认路径,但可以在配 置编辑器中更改它。
品。 序列采集期间发生仪器故障时,可能会出现这种情况。 • 采集已有行后,向序列模板添加了其他的行。其他的运行将添加到已有数据
中。 因此,当用户从序列菜单中选择部分序列时,将出现对话框,其中提供了从列表 选择现有序列容器还是创建新序列容器的选项。
化学工作站工作流程
13
2 数据采集
数据采集
数据的存储模式取决于采集的是单次运行数据还是序列数据: 1 执行序列时,将在指定子目录中用唯一名称自动创建新文件夹 (序列容器)。
运行单个样品时,数据文件 (*.d) 将写入指定子目录。
化学工作站工作流程
7
1 化学工作站数据结构
化学工作站 B.02.01 及更高版本
2 对于序列数据,执行的序列模板 (*.s) 和所有涉及的方法 (*.m) 都会复制到序 列容器中。 方法的副本叫做序列方法,以区别于原始主方法。
版本
2/2009 Germany 印刷 Agilent Technologies Hewlett-Packard-Strasse 8 76337 Waldbronn
仅供研究之用。
禁止在诊断过程中使用。
软件版本
本指南对 B.04.xx 版的安捷伦化学工作 站软件有效,其中 xx 表示该软件的次 要版本,并不影响本指南的技术准确 性。
图2
“ 首选项 ” 对话框 /“ 路径 ” 选项卡
然后,在执行运行时,就可以在样品信息 / 序列参数对话框中对所有新指定的数 据路径进行选择。
10
化学工作站工作流程
数据采集 2
数据采集
图3
数据路径选择
序列中的数据采集
为了运行序列,必须有适当的预定义方法。 这些方法就是以上所述的主方法。 通 常,主方法和序列模板用在化学工作站的方法和运行控制视图中。 因此,在方法 和运行控制视图中,可通过化学工作站资源管理器访问主方法和序列模板。
部分序列采集
在部分序列采集的情况下,用户可在两个选项之间选择: • 将部分序列采集到新的序列容器中 或 • 在已有序列容器中采集部分序列。 从部分序列执行中将数据文件采集到已有序列容器中,这在以下情况下可能有 用: • 必须覆盖单个数据文件 (或若干数据文件),例如因为第一个位置使用了错误
的样品瓶。 • 第一个位置只执行了序列的第一部分,必须通过执行部分序列来添加缺少的样
声明
本书内容如有改变,恕不另行通 知。安捷伦科技公司对本材料,及 由此引出的任何商务和特种用途不 承担责任。安捷伦科技公司对本手 册中可能有的错误或与装置、性能 及材料使用有关内容而带来的意外 伤害和问题不负任何责任。如果安 捷伦与用户对本书中的警告术语有 不同的书面协议,这些术语与本书 中的警告术语冲突,则以协议中的 警告术语为准。
1 化学工作站数据结构
本章概述了 B.02.01 版之前的化学工作站中使用的数据结构与 B.02.01 版及其后 续版本中的新数据结构之间的差别。
2 数据采集
本章将说明对序列和单次运行,新的数据结构如何影响数据采集的工作流程。
3 数据分析
本章将概述可用的数据分析和审核选项,并说明数据结构情况对选择选项有何影 响。
两个方法都包含完整的方法参数,包括采集和数据分析参数。 ACQ.M 的设计意图是确保保留了每个特定数据文件的原始方法参数。采集 参数可以在 “ 数据分析 ” 视图中查看和打印。 DA.M 可在数据分析过程中修改,以便存储那些不适用于序列的所有运行而 仅供某个数据文件专用的数据分析参数,例如定时积分事件。
技术许可
本书对硬件和 / 或软件的介绍已获得特 许,未经许可,不得使用或复制。
权力限制说明
如果软件用于某一美国政府基本合同或 次级合同,软件的使用将作为下列情况 之一被许可:按照法案 DFAR 252.227-7014 (1995 年 6 月)确定的 “ 商业计算机软件 ” ;或者按照法案 FAR 2.101 (a) 确定的 “ 商业条款 ” ;或者按 照法案 FAR 52.227-19 (1987 年 6 月)确定的 “ 限制计算机软件 ” ;或者 任何相当机构法规或合同条款。软件的 使用,复制或解密受安捷伦科技标准商 业许可条款的管理,美国政府的非 DOD 部门和机构将获得不比法案 FAR 52.227-19 (c) (1-2) (1987 年 6 月)大 的权利。美国政府的用户将获得不比法 案 FAR 52.227-14 (c) (1-2) (1987 年 6 月)或 DFAR 252.227-7015 (b) (2) (1995 年 11 月)确定的限制权利大的 权利,这一原则适用于任何技术数据。
图4
“ 首选项 ” 对话框 /“ 序列 ” 选项卡
采集序列开始时,将从主方法文件夹把序列表中指定的方法复制到序列容器中。 此外将创建该序列的一个副本,和序列日志、批处理 (*.b) 文件一起放在序列容 器中。所有方法更新 (例如,校正表的更新)都将写入容器中的该序列方法。此 时,所有必需文件都已可用于将来数据审核和数据再处理,而不受其他序列运行 时对主方法或序列模板所作更改的影响。
安捷伦化学工作站
新的化学工作站工 作流程入门
化学工作站工作流程
Agilent Technologies
注意
© 安捷伦科技有限公司,2006, 2007-2009 根据美国和国际版权法,未经安捷伦公 司书面许可,本书内容不得以任何形式 复制 (包括电子存储修改或翻译)。
手册部件号
G2170-97043
序列模板会在序列表中引用这些方法。
化学工作站工作流程
11
2 数据采集
数据采集
就像前面解释过的,用序列模板 <sequence_name>.S 运行序列,并且使用主方 法 <method_name>.M 时,将创建一个新文件夹 (“ 序列容器 ”),其中包含序列 运行所生成的所有文件。
该文件夹的位置由序列参数对话框中的设置确定;该文件夹的命名由首选项对话 框的序列选项卡确定。默认情况下,名称为 <sequence_name> <acquisition_date> <acquisition_time>,但可以用标记操作者、仪器、计数器和 PC 名称来配置,也可以手动输入任何名称。如果名称模式没有产生专有的序列 容器名称,化学工作站将附加上一个计数,以确保唯一性。
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化学工作站工作流程
化学工作站 B.02.01 及更高版本
化学工作站数据结构 1
化学工作站 B.02.01 及更高版本
为了加强数据文件和方法之间的相关性,化学工作站 B.02.01 及更高版本实现了 以下新的数据组织模式。和化学工作站一起使用时,安捷伦 OpenLAB 企业内容 管理器 (ECM) 也会利用新的数据概念,因为现在可以把整个数据集 (序列 / 方 法 / 数据文件)作为一个实体传输 (归档)到 ECM。
图1
Sequence Acquisition B.02.01 及更高版本
文件夹 Chem32\1\methods 中的方法用作主方法,也就是说在采集和数据分析 期间,它们保持不变。
类似地,文件夹 Chem32\1\sequence 中的序列用作序列模板,可用于多次重新 运行序列 (但不进行数据再处理)。
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1 化学工作站数据结构
B.02.01 之前的化学工作站
B.02.01 之前的化学工作站
在 B.02.01 版之前的化学工作站中,序列、方法和生成的数据文件及结果都存储 在固定的、彼此分开的指定位置中。 例如,在序列中方法通过名称来引用,用户 需负责维护方法、序列和数据文件的完整性。 因此,数据的长期归档和结果的复 制就成了艰巨的任务。 用户必须记录色谱图、结果和相关方法;不仅常规实验室 是这种情况,有些领域的非常规实验室 (例如环境实验室)也是如此。在 B.02.01 之前的化学工作站中,只能通过把所有内容打印在报告中来实现。
以下章节将详细说明这一结构对典型工作流程的影响。 同时还将介绍化学工作站 对话框中的相应设置。
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化学工作站工作流程
源自文库
化学工作站工作流程
2 数据采集
数据采集 10 序列中的数据采集 11 部分序列采集 13 单次运行的数据采集 14
本章将说明对序列和单次运行,新的数据结构如何影响数据采集的工作流程。
Agilent Technologies
安全警告
警告
警告提示表示危险。提醒您 在操作过程中注意,如果执 行不当,将导致人身伤害或 死亡。不要忽视警告提示。
小心
小心提示表示危险。提醒您 在操作过程中注意,如果执 行不当,将影响产品或丢失 重要数据。不要忽视小心提 示。
化学工作站工作流程
内容提要 …
内容提要 …
在分析实验室中,需要在短时间内高效地采集色谱数据。 澄清含糊的结果会很费 时,而且会增加管理成本。自化学工作站 B.02.01 版以来,数据存储和数据浏览 功能已得到改进,能更快地对结果数据进行审核和数据再处理。 在本手册中,将说明如何高效地使用化学工作站 B.04.01 中的新数据存储和检索 功能来提高您实验室的效率。
采集期间,数据文件将存储到序列容器中。在每个数据文件 (*.D) 内,会为这次 特定运行保存另两个方法 (ACQ.M 和 DA.M)。这两个方法是序列方法的副本, 保存了采集特定数据文件时方法的状态。在某些情况下 (例如校正表更新),每 次运行时 DA.M 方法均不同。
12
化学工作站工作流程
数据采集 2
4
化学工作站工作流程
化学工作站工作流程
1 化学工作站数据结构
B.02.01 之前的化学工作站 6 化学工作站 B.02.01 及更高版本 7 本章概述了 B.02.01 版之前的化学工作站中使用的数据结构与 B.02.01 版及其后 续版本中的新数据结构之间的差别。
Agilent Technologies
所有和序列相关的任务 (例如采集和数据分析)都在序列和方法的副本上执 行。 因此,序列模板和主方法会保持不变,以便将来进行其他序列操作。
序列采集过程中对序列所作的任何更改 (例如向序列表添加行)都将在序列 容器内的序列文件副本上执行。 序列模板将保留不变。
类似地,方法中的任何更改 (即运行校正时校正表中的更新)都会反映在序 列方法中,而不是主方法中。 执行序列时,生成的所有数据文件 (*.d) 和对应的批处理文件 (*.b) 及序列日志 文件 (*.log) 都会存储到序列数据文件夹中。 3 每个数据文件都包含两个用于创建运行的方法副本。 • 第一个副本叫做 ACQ.M,完成方法的采集部分之后直接保存。 • 第二个副本叫做 DA.M,在完成数据分析部分之后保存。
4 “ 专有文件夹创建 ” 关闭时的工作流程
本章将介绍 “ 专有文件夹创建 ” 关闭时的工作流程,此时您可以如同在化学工作 站 B.01.03 或更早版本中那样保存数据。该模式不能充分利用化学工作站中最新 的数据审核和数据再处理功能的优点。
化学工作站工作流程
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目录
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1 化学工作站数据结构 5 B.02.01 之前的化学工作站 6 化学工作站 B.02.01 及更高版本 7
2 数据采集 9 数据采集 10
3 数据分析 15 数据分析 16 数据分析:数据审核 18 数据审核期间的化学工作站用户界面 23 数据分析:数据再处理 25
4 “ 专有文件夹创建 ” 关闭时的工作流程 29 “ 专有文件夹创建 ” 打开还是关闭? 30 “ 专有文件夹创建 ” 关闭时的工作流程 31 序列容器迁移 34