生物化学-讲义-第四章酶
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② 含不同亚基的寡聚酶: 琥珀酸脱氢酶(牛心),αβ2个亚基
多酶复合体:多种酶靠非共价键相互嵌合催化连续 反应的体系。
大肠杆菌丙酮酸脱氢酶复合体由三种酶组成:
①丙酮酸脱氢酶(E1) 以二聚体存在 2×9600 ②二氢硫辛酸转乙酰基酶(E2) 70000 ③二氢硫辛酸脱氢酶(E3)以二聚体存在 2×56000
A
B
如:6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。
CH2OH O OH
OH OH
OH
CH2OH
CH2OH
O OH
OH
OH
6. 合成酶类 Synthetase 能够催化C-C、C-O、C-N 以及C-S 键的形成反 应。这类反应必须与ATP分解反应相互偶联。
A+B+ATP A-B+ADP+Pi
如: 丙酮酸羧化酶催化Leabharlann Baidu反应。 丙酮酸 + CO2 草酰乙酸
4. 裂合酶类 Lyase
裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或原 子形成双键的反应及其逆反应。
A-B
A+B
如:延胡索酸水合酶催化的反应。
H O O C C H = C H C O O H H 2 OH O O C C H 2 C H C O O H O H
5. 异构酶类 Isomerase
异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即 底物分子内基团或原子的重排过程。
全酶(holoenzyme) = 酶蛋白+ 辅因子
酶的辅因子主要有金属离子和有机化合物。 金属离子:Fe2+、Fe3+ 、 Zn2+、 Cu+、Cu2+、
Mn2+、、Mn3+、Mg2+ 、K+、 Na+ 等。 有机化合物:NAD+、NADP+、FAD、生物素等。
辅酶(coenzyme):与酶蛋白结合较松,可透析除去。 辅基(prosthetic group):与酶蛋白结合较紧。
每一大类又分为若干亚类
乳酸脱氢酶 EC1.1.1.27
二、酶的命名
(1) 国际系统命名法(systematic name)
是以酶所催化的整体反应为基础,规定每一种酶的名 称应当明确标明酶的底物及催化反应的性质。
(2)习惯命名法(recommended name)
根据酶的作用底物及其所催化的反应类型来命名。
如:谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。
CH3CHCOOH HOOCCH2CH2CCOOH
NH2
O
CH3CCOOH HOOCCH2CH2CHCOOH
O
NH2
3. 水解酶类 Hydrolase
水解酶催化底物的加水分解反应。
AB+H2O
A-H+B-OH
如:脂肪酶(Lipase)催化的脂的水解反应:
R C O O C H 2 C H 3H 2 O R C O O HC H 3 C H 2 O H
必需基团:直接参与对底物分子结合和催化的基 团以及参与维持酶分子构象的基团。
二、酶的专一性 分为结构专一性和立体异构专一性。
1. 结构专一性(structure specificity)
AH2+B
A+BH2
如: 乳酸脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。
C H 3 C H C O O H N A D + C H 3 C C O O H N A D HH +
O H
O
2. 转移酶类 Transferase
转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子的
基团或原子转移到另一个底物的分子上。
A-R+C
A+C-R
如: 谷氨酸 + 丙酮酸 -酮戊二酸 + 丙氨酸 丙氨酸: -酮戊二酸氨基转移酶 谷丙转氨酶
第四节 酶的活性中心及专一性
一、酶的活性中心
酶的活性中心(active center):酶分子中能 直接与底物分子结合,并催化底物化学反应的部 位。
结合基团( Binding group ) 催化基团( catalytic group )
精品
生物化学--第四章酶
第一节 酶的一般性质
一、酶是生物催化剂
酶是由活细胞产生的,具有催化活性和高度专 一性的特殊生物大分子。包括蛋白质和核酸。
二、酶的催化特性
一般特性
1. 加快反应速度,而本身在反应前后没结构和性质的 改变。
2. 只缩短反应达到平衡所需要的时间而不改变反应平 衡点。
特殊性 1. 酶催化效率高
结合部位:酶分子中 与底物结合的部位。 决定酶的专一性。
催化部位:催化底物 敏感键发生化学变化 的基团,决定酶的催 化能力。
组成活性中心的氨基酸残基的侧链在一级结 构上可能相距很远,但在空间结构上相互靠近, 形成活性区域。
酶活性中心的基团属于必需基团,必需基团还包 括对酶表现活力所必需的基团,如Ser的羟基、Cys 的巯基、His的咪唑基等,它们起维持酶分子空间 构象的作用。
比非催化高108~1020倍,比非生物催化剂高107~1013倍。
2. 酶具有高度专一性
酶对反应的底物和产物都有极高的专一性,几乎没有 副反应发生。
3. 酶易失活
常温、常压,中性pH 环境下反应。
4. 酶的催化活性可被调节控制
酶抑制剂调节、反馈调节、酶原激活、共价修饰、激素 控制等。
三、酶的化学本质
根据酶蛋白质分子的特点,将酶分为:
单体酶:仅有一个活性中心,由一条或多条共价 相连的肽链组成的酶分子。
牛胰RNase 鸡卵清溶菌酶 胰凝乳蛋白酶
124 aa 单链 129 aa 单链 三条肽链
寡聚酶:由两个或多个相同或不同亚基组成的酶。 单独的亚基一般无活性。
① 含相同亚基的寡聚酶: 苹果酸脱氢酶(鼠肝),2个相同的亚基
12个E1 二聚体 24×96000 24个E2 单体 24×70000 6个E3 二聚体 12×56000 总分子量:560万
第三节 酶的分类和命名
一、酶的分类
1. 氧化还原酶 Oxido-reductase
氧化-还原酶催化氧化-还原反应。主要包括脱氢酶 (dehydrogenase)和氧化酶(Oxidase)。
绝大多数酶是蛋白质 证据:1. 酸水解的产物是氨基酸,能被蛋白酶水解 失活;2. 具有蛋白质的一切共性,凡是能使蛋白质 变性的因素都能使酶变性;3. 1969年,人工合成牛 胰核糖核酸酶。
少数酶是RNA(核酶,ribozyme)
第二节 酶的组成和结构特点
一、酶的组成
单纯酶类:仅由蛋白质组成 结合酶类:包括酶蛋白(apoenzyme)和辅因子 (cofactor),酶蛋白与辅因子组成完整的全酶, 单纯的酶蛋白无催化功能。
多酶复合体:多种酶靠非共价键相互嵌合催化连续 反应的体系。
大肠杆菌丙酮酸脱氢酶复合体由三种酶组成:
①丙酮酸脱氢酶(E1) 以二聚体存在 2×9600 ②二氢硫辛酸转乙酰基酶(E2) 70000 ③二氢硫辛酸脱氢酶(E3)以二聚体存在 2×56000
A
B
如:6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。
CH2OH O OH
OH OH
OH
CH2OH
CH2OH
O OH
OH
OH
6. 合成酶类 Synthetase 能够催化C-C、C-O、C-N 以及C-S 键的形成反 应。这类反应必须与ATP分解反应相互偶联。
A+B+ATP A-B+ADP+Pi
如: 丙酮酸羧化酶催化Leabharlann Baidu反应。 丙酮酸 + CO2 草酰乙酸
4. 裂合酶类 Lyase
裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或原 子形成双键的反应及其逆反应。
A-B
A+B
如:延胡索酸水合酶催化的反应。
H O O C C H = C H C O O H H 2 OH O O C C H 2 C H C O O H O H
5. 异构酶类 Isomerase
异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即 底物分子内基团或原子的重排过程。
全酶(holoenzyme) = 酶蛋白+ 辅因子
酶的辅因子主要有金属离子和有机化合物。 金属离子:Fe2+、Fe3+ 、 Zn2+、 Cu+、Cu2+、
Mn2+、、Mn3+、Mg2+ 、K+、 Na+ 等。 有机化合物:NAD+、NADP+、FAD、生物素等。
辅酶(coenzyme):与酶蛋白结合较松,可透析除去。 辅基(prosthetic group):与酶蛋白结合较紧。
每一大类又分为若干亚类
乳酸脱氢酶 EC1.1.1.27
二、酶的命名
(1) 国际系统命名法(systematic name)
是以酶所催化的整体反应为基础,规定每一种酶的名 称应当明确标明酶的底物及催化反应的性质。
(2)习惯命名法(recommended name)
根据酶的作用底物及其所催化的反应类型来命名。
如:谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。
CH3CHCOOH HOOCCH2CH2CCOOH
NH2
O
CH3CCOOH HOOCCH2CH2CHCOOH
O
NH2
3. 水解酶类 Hydrolase
水解酶催化底物的加水分解反应。
AB+H2O
A-H+B-OH
如:脂肪酶(Lipase)催化的脂的水解反应:
R C O O C H 2 C H 3H 2 O R C O O HC H 3 C H 2 O H
必需基团:直接参与对底物分子结合和催化的基 团以及参与维持酶分子构象的基团。
二、酶的专一性 分为结构专一性和立体异构专一性。
1. 结构专一性(structure specificity)
AH2+B
A+BH2
如: 乳酸脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。
C H 3 C H C O O H N A D + C H 3 C C O O H N A D HH +
O H
O
2. 转移酶类 Transferase
转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子的
基团或原子转移到另一个底物的分子上。
A-R+C
A+C-R
如: 谷氨酸 + 丙酮酸 -酮戊二酸 + 丙氨酸 丙氨酸: -酮戊二酸氨基转移酶 谷丙转氨酶
第四节 酶的活性中心及专一性
一、酶的活性中心
酶的活性中心(active center):酶分子中能 直接与底物分子结合,并催化底物化学反应的部 位。
结合基团( Binding group ) 催化基团( catalytic group )
精品
生物化学--第四章酶
第一节 酶的一般性质
一、酶是生物催化剂
酶是由活细胞产生的,具有催化活性和高度专 一性的特殊生物大分子。包括蛋白质和核酸。
二、酶的催化特性
一般特性
1. 加快反应速度,而本身在反应前后没结构和性质的 改变。
2. 只缩短反应达到平衡所需要的时间而不改变反应平 衡点。
特殊性 1. 酶催化效率高
结合部位:酶分子中 与底物结合的部位。 决定酶的专一性。
催化部位:催化底物 敏感键发生化学变化 的基团,决定酶的催 化能力。
组成活性中心的氨基酸残基的侧链在一级结 构上可能相距很远,但在空间结构上相互靠近, 形成活性区域。
酶活性中心的基团属于必需基团,必需基团还包 括对酶表现活力所必需的基团,如Ser的羟基、Cys 的巯基、His的咪唑基等,它们起维持酶分子空间 构象的作用。
比非催化高108~1020倍,比非生物催化剂高107~1013倍。
2. 酶具有高度专一性
酶对反应的底物和产物都有极高的专一性,几乎没有 副反应发生。
3. 酶易失活
常温、常压,中性pH 环境下反应。
4. 酶的催化活性可被调节控制
酶抑制剂调节、反馈调节、酶原激活、共价修饰、激素 控制等。
三、酶的化学本质
根据酶蛋白质分子的特点,将酶分为:
单体酶:仅有一个活性中心,由一条或多条共价 相连的肽链组成的酶分子。
牛胰RNase 鸡卵清溶菌酶 胰凝乳蛋白酶
124 aa 单链 129 aa 单链 三条肽链
寡聚酶:由两个或多个相同或不同亚基组成的酶。 单独的亚基一般无活性。
① 含相同亚基的寡聚酶: 苹果酸脱氢酶(鼠肝),2个相同的亚基
12个E1 二聚体 24×96000 24个E2 单体 24×70000 6个E3 二聚体 12×56000 总分子量:560万
第三节 酶的分类和命名
一、酶的分类
1. 氧化还原酶 Oxido-reductase
氧化-还原酶催化氧化-还原反应。主要包括脱氢酶 (dehydrogenase)和氧化酶(Oxidase)。
绝大多数酶是蛋白质 证据:1. 酸水解的产物是氨基酸,能被蛋白酶水解 失活;2. 具有蛋白质的一切共性,凡是能使蛋白质 变性的因素都能使酶变性;3. 1969年,人工合成牛 胰核糖核酸酶。
少数酶是RNA(核酶,ribozyme)
第二节 酶的组成和结构特点
一、酶的组成
单纯酶类:仅由蛋白质组成 结合酶类:包括酶蛋白(apoenzyme)和辅因子 (cofactor),酶蛋白与辅因子组成完整的全酶, 单纯的酶蛋白无催化功能。