DNA提取(苯酚-氯仿小体法)
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苯酚-氯仿法小提DNA
试剂配制:
1:细胞裂解液:0.32 M 的蔗糖;5 mM 的MgCl2
2:DNA稀释缓冲液:0.375 M的NaCl;12 mM的Tris-HCl [PH 7.5]
3:10%的SDS [PH 7.2]
4:5 M的NaCl
5:苯酚-氯仿混合液V/V = 1:1
6:无水乙醇和70%的乙醇
DNA 抽提:
1、收集白细胞:500 μl新鲜/冻存全血(EDTA-2Na抗凝),加入1 ml的细胞裂解液
充分混匀后孵育10分钟,,13000 rpm离心15 sec/3min;
2、洗涤白细胞:离心后弃去上清液,加入1ml双蒸水重悬沉淀,将沉淀充分吹打使
起完全溶解后, 13000 rpm离心1 /5min;
3、稀释DNA,去除蛋白:弃离心后上清液,加入80 μl DNA 稀释缓冲液,重悬
沉淀,完全溶解后,加入10 μl 10% SDS 和5 M NaCl 100μl,用手摇匀,再加双蒸水240 μl稀释DNA;
4、加入300 μl苯酚-氯仿-异戊醇溶液(V/V=25:24:1,PH=7.5).盖紧试管,彻底混合
均匀后, 13000 rpm离心12 min;
5、取上清相转至另一1.5 ml EP管中,加入上清液体积比的1.5-2倍体积的预冷
无水乙醇。
反复颠倒数次后,可见有絮状DNA沉淀析出;
6、13000 rpm离心5 min,去上清水相。
加入和无水乙醇等量的70%预冷乙醇洗去DNA中的盐后,离心5 min。
用100 μl ddH2O或50 μl TE保存DNA备用。
为什么用酚与氯仿抽提DNA时,还要加少量的异戊酵?在抽提DNA时,为了混合均匀,必须剧烈振荡容器数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。
加入异戊醇能降低分子表面张力,所以能减少抽提过程中的泡沫产生。
一般采用氯仿与异戊酵为24:1之比。
也可采用酚、氯仿与异戊醇之比为25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成),同时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳定。