RNA提取方法汇总-2017年度
RNA提取心得(组织RNA提取和培养细胞的RNA提取)
一.组织RNA提取1.最好新鲜组织,这样RNA提取的效果比较好,这是肯定的。
2. 如果不是新鲜的(最好在半年之内,-80℃或者液氮中冻存的)组织,注意不要反复冻融,从冰冻状态拿到0-4℃,注意不要拿到常温,待组织解冻后,用 DEPC泡过的剪刀剪一小块组织,称重后,放到预冷的匀浆器中,然后加入一定量的TRIZOL试剂,然后匀浆。
注意:速度不要太快,要匀一会挺一会,否则由于摩擦产热,RNA遇热会加速降解。
如果一次做多个标本的RNA提取,也要这样做,更不能急。
后面的步骤和细胞RNA提取一样。
二.培养细胞的RNA提取1.贴壁细胞,需要先用胰酶消化后,然后收集到离心管中,离心,去上清,然后用PBS多洗2-3次,以去除多余的胰酶。
悬浮细胞,直接用吸管或者加样枪吹打评壁,以使细胞基本可以被吹下来。
然后离心去上清,不需要用PBS洗。
2.然后将少量细胞悬液转移到预冷的DEPC泡过的1.5毫升EP管中,然后加入一定量的TRIZOL(细胞多的话加1毫升,细胞少的话加0.5毫升就可以),然后用枪头吹打混匀5-10分钟。
(如果有时间就继续往下做,如果没有时间,可以把加了TRIZOL后的细胞裂解液冻存到-80℃,用的时候提取和新的提取的效果一样。
)在冰上操作。
3.上面的混匀5-10 分钟,基本可以使细胞裂解,然后可以进行下面的步骤,详细的步骤我就不介绍了。
我只介绍一些需要注意的地方。
1.一定要注意冰上操作,低温离心。
2.戴口罩和勤换手套,去任何东西都要带着手套去取。
3.每次去器材的时候都要用镊子去夹,镊子要在酒精灯上烧一下。
4.所有的器材都要经过DEPC浸泡后高压后才可以使用,所需要的氯仿,酒精,异丙醇等都保证没有被RNA 酶污染,不能用没有泡过DEPC的枪头去提取液体,一定要用DEPC浸泡过的枪头去吸,如果发现试剂有可能被污染了,要立即更换。
5. 吸取上清一定不要吸到中间层的蛋白,如果吸到蛋白一定要重新用氯仿抽提,因为,吸到的蛋白很可能会对RNA产生降解作用。
rna的提取方法
rna的提取方法
1.细胞或组织的采集:采集样品时应尽量避免RNA的降解或污染,可使用RNase-free工具和试剂,避免手套和工作表面受到RNase污染。
2. 细胞或组织的破碎:可使用机械方法、化学方法或冻融法等
方法将细胞或组织破碎,释放RNA。
3. RNA的纯化:RNA的纯化可使用酚/氯仿法、商用RNA纯化试
剂盒等方法。
其中,酚/氯仿法是最常用的RNA纯化方法。
该方法利
用酚将RNA从DNA和蛋白质中分离,然后通过氯仿的密度梯度离心分离出RNA。
4. RNA的质量检测:RNA的纯化后,需要进行质量检测,以确保RNA的完整性和纯度。
可使用紫外线吸收法、琼脂糖凝胶电泳等方法进行检测。
5. RNA的保存:RNA的保存应避免RNA降解,需使用RNase-free 的保存液,如RNAlater等,或在零下80℃的冷冻库中保存。
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RNA提取方法总结
RNA提取方法总结这篇文章主要讲的是几种常用的RNA提取方法。
1、异硫氰酸胍氯化铯超速离心法原理:使用蛋白质变性剂异硫氰酸胍有效抑制RNA酶的活性,经过起始密度为 1.78g/ml的氯化铯介质,进行密度梯度超速离心,RNA 沉淀于管底,而DNA与蛋白质在上清中。
使用这种方法,不但能得到高质量的RNA,而且能同时分离出细胞染色体DNA.本法对于冷冻时间长、细胞质和细胞核不易分离的组织标本以及富含RNA酶的组织细胞(如胰腺)的RNA提取尤其适合。
此法提取的RNA 的质量好和成功率高,已成为提取哺乳动物细胞RNA的常规方法。
其缺点是操作复杂、流程长,一次提取的样品数量有限。
2、盐酸胍-有机溶剂法本法有MacDonald 1987年在Strohman报道的方法基础上改进而成的,适用于没有超速离心及设备的情况下提取细胞总RNA。
它利用盐酸胍抑制RNA酶,匀浆裂解细胞,有机溶剂抽提去除蛋白质,通过选择性沉淀RNA分子而去除DNA,提取的RNA质量较好,但整个操作过程繁杂费时。
3、氯化锂-尿素法本法首先由Auffray报道,利用高浓度尿素变性蛋白质同时抑制RNA 酶,3mol/L LiCl选择性沉淀RNA。
其缺点是有时会存在DNA污染,LiCl 沉淀RNA会丢失一些小分子量的RNA,如5S RNA等。
优点是快速简捷,尤其适用于大量样品少量组织细胞的RNA提取,其质量可以满足Northern分析,Oligo(dT)提取mRNA,SI核酸酶或RNase保护实验等。
本法每提取107个细胞能提取总RNA约10 g。
4、热酚法本法主要用于少量细胞样品RNA提取,其产量不高,但简单易行。
5、快速提取法本法主要用于培养细胞,通过0.5%SDS裂解细胞,酚抽提去除蛋白质和DNA沉淀,快速纯化RNA。
6、细胞质RNA提取法本法主要适用于培养细胞,首先去除细胞核,然后用蛋白酶K消化蛋白质,酚/氯仿抽提去除蛋白质。
操作简单,同时能进行多个样品操作,多数步骤在室温下进行,提取的RNA质量较高,可满足体外无细胞翻译系统、cDNA合成、引物延伸以及核酸酶SI保护实验。
rna提取方法
rna提取方法RNA提取方法。
RNA提取是分子生物学研究中的重要步骤,其质量和纯度直接影响后续实验结果的准确性和可靠性。
在进行RNA提取时,我们需要选择合适的提取方法,并严格按照操作规程进行操作,以确保提取到高质量的RNA样品。
本文将介绍常用的RNA提取方法及其操作步骤,希望能对您的实验工作有所帮助。
1. 常用的RNA提取方法。
(1)酚/氯仿法,这是最常用的RNA提取方法之一,通过酚和氯仿的相分离,将RNA从细胞裂解液中提取出来。
该方法操作简单,适用于大多数样品类型,但需要注意的是酚/氯仿对操作者和环境有一定的危害性,需要在安全通风下进行操作。
(2)硅基柱法,该方法利用硅基柱上的硅胶膜吸附RNA,通过洗脱的方式提取RNA。
该方法操作简便,提取效率高,且对DNA和蛋白质有较好的去除效果,适用于高质量RNA的提取。
(3)磁珠法,磁珠法利用磁珠载体对RNA进行特异性结合,通过磁场的作用实现RNA的分离和提取。
该方法操作简单,易于自动化,且对样品量要求较低,适用于高通量样品的提取。
2. RNA提取操作步骤。
(1)样品裂解,将待提取RNA的样品进行裂解,一般使用细胞裂解液或组织裂解液进行细胞破碎,释放RNA。
(2)酚/氯仿提取,将裂解液与酚/氯仿按比例混合,离心分离出上清液中的RNA。
(3)酒精沉淀,向上清液中加入等体积的异丙醇或乙醇,使RNA沉淀出来,再经过洗涤和干燥步骤得到RNA沉淀物。
(4)溶解RNA,用无DEPC的水或TE缓冲液溶解RNA沉淀物,得到可用于后续实验的RNA样品。
3. 注意事项。
(1)操作环境,在进行RNA提取时,需要在RNase-free的环境下进行操作,避免RNA受到RNase的污染。
(2)样品保存,裂解后的样品需要在-80℃的环境下保存,以避免RNA的降解。
(3)避免污染,在操作过程中需要避免外源RNA的污染,使用RNase-free的试剂和耗材,并注意操作规范。
(4)质量检测,提取得到的RNA样品需要进行质量检测,包括浓度、纯度和完整性的检测,以确保提取到高质量的RNA。
RNA提取方法汇总情况-20171222
CTAB+Licl过夜
植物
三七
根
药用植物提取法
植物
桑树
根、茎、叶、花芽
Trizol、天根试剂盒(花
芽)
植物
桑树
花芽
天根kit
植物
沙冬青
花
CTAB
植物
沙棘
根、茎、叶、果实
Planteasy
植物
沙枣
根
天根试剂盒
植物
山核桃
果仁
CTAB+LiCl
植物
山核桃
种仁
Easyspin kit
植物
山核桃
胚乳
CTAB法+过柱(柱上消
动物
豚鼠
视网膜
TRIzol
动物
耗牛
耳软骨
Trizol+过住
动物
摇蚊
整虫
Trizol
动物
叶蝉
Trizol
动物
夜蛾
Trizol
动物
云南切梢小蠹
虫蛹、幼虫、成虫
TRIzol
动物
肿瘤细胞
Trizol
动物
猪
干细胞、十二指肠、眼
肌、肝脏、心
肌、大脑、巨噬细胞、
肺、肌肉
Trizol
原核和真菌
变色菌
Trizol
原核和真菌
TRIzol
植物
谷子
谷籽、种子
Trizol
植物
桂花
叶
TRIzol
植物
海带
藻体
天根试剂盒
植物
海棠
果实和叶子
天根试剂盒/planteasy
植物
核桃
叶片
planteasy/CTAB/天根试剂
rna的提取方法
rna的提取方法RNA的提取是从生物样品中获取RNA的过程,这个过程通常包括以下几个步骤:1. 样品收集:根据需求选择生物样品,如细胞、组织、血液等,并采用合适的方法收集。
2. 细胞破碎:通过细胞破碎,将细胞内的RNA释放到溶液中。
破碎方法包括机械破碎、超声波破碎、化学破碎等。
3. RNA分离:分离RNA和其他分子,如DNA、蛋白质等。
4. RNA纯化:将RNA纯化,去除杂质,获得高质量RNA。
纯化方法包括硅胶柱层析、离心管基质层析等。
下面详细介绍三种常用的RNA提取方法:1. 酚-氯仿法这种方法可用于组织和细胞的RNA提取。
首先使用酚将细胞或组织破碎,然后加入等体积的氯仿,混匀,使DNA和蛋白质沉淀于底部,RNA在上层水相中得到富集。
再通过异丙醇沉淀,将RNA分离出来。
最后,通过洗涤和纯化过程,得到高质量RNA。
酚-氯仿法是一种经济、简单和高收率的提取RNA的方法。
2. 硅胶柱纯化法该方法是一种高效、快速且高纯度的RNA提取方法,适用于多样品处理。
该方法使用硅胶柱将RNA分离,并消除DNA和酶的污染。
该方法能够从各种样本中提取高品质RNA,可用于测序、杂交和原位杂交等分子生物学应用。
3. 针头粘贴法这种方法是一种快速简单的RNA提取法,特别适用于某些免疫细胞和细胞样品。
利用针头从样品中取出细胞,将其粘贴在聚丙烯酰胺凝胶上,通过离心将RNA分配到凝胶上。
该方法提取RNA量小,但可以高度升质和纯化的RNA,是一种快速且相对简单的RNA提取方法。
总之,根据不同的实验目的,可选择适用于不同的RNA提取方法。
rna提取方法
rna提取方法RNA提取方法。
RNA提取是分子生物学研究中的重要步骤,它能够从细胞或组织中分离出RNA,并为后续的实验和分析提供可靠的样本。
在实验室中,有多种方法可以用来提取RNA,每种方法都有其特点和适用范围。
本文将针对常用的RNA提取方法进行介绍和比较,希望能为科研工作者提供一些参考和帮助。
一、酚/氯仿提取法。
酚/氯仿提取法是一种经典的RNA提取方法,它通过酚和氯仿的相分离特性来分离RNA。
首先,细胞或组织样本被加入到酚中,然后加入氯仿和异丙醇,最后进行离心分离。
这种方法简单易行,适用于大多数样本类型,但对RNA的纯度要求较高,且操作过程中需要注意避免RNA的降解。
二、硅基柱法。
硅基柱法是一种基于硅基质的RNA提取方法,它通过硅基柱的亲和吸附作用来富集RNA。
样本经过细胞裂解后,加入硅基柱柱子进行离心,然后通过洗脱步骤得到纯净的RNA。
这种方法操作简便,适用于高通量提取,但对样本量和纯度要求较高。
三、磁珠法。
磁珠法是一种利用磁珠颗粒来富集RNA的提取方法,它具有操作简便、高效快速的特点。
样本经过裂解后,加入磁珠颗粒进行混合,然后通过磁场分离得到RNA。
这种方法适用于多样本处理和自动化操作,但对磁珠颗粒的选择和配比要求较高。
四、酶法。
酶法是一种利用酶来选择性降解DNA而保留RNA的提取方法,它适用于需要高纯度RNA的实验。
通过加入DNA酶和蛋白酶K来去除DNA和蛋白质,最终得到纯净的RNA。
这种方法操作简便,适用于小样本和特定实验要求,但需要注意酶的活性和浓度控制。
五、TRIzol法。
TRIzol法是一种利用TRIzol试剂来提取RNA的方法,它通过酚-醇混合物和氯仿的相分离特性来富集RNA。
样本经过混合后,加入氯仿进行离心分离,最后得到RNA。
这种方法适用于多种样本类型,但需要注意操作过程中的酚和氯仿的使用安全。
综上所述,不同的RNA提取方法各有特点,科研工作者可以根据实验需求和样本特性选择合适的方法。
RNA的提取总结
一、总的RNA的提取基础知识:(1)DEPC:中文名为焦碳酸二乙酯。
分子式为C6H10O5,分子量为162.14。
是一种强烈的RNA酶抑制剂。
它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。
DEPC水一般是指千分之一浓度的DEPC,在搅拌器上搅拌至完全溶解,即看不到“油珠”为止,DEPC气味芳香浓烈,强挥发性,有毒,需在通风橱中操作。
(2)RNA分子:哺乳动物细胞有3种rRNA:28S、18S和5S。
一个典型的哺乳动物细胞含有10-5μg RNA,其中80~85%为rRNA,其余15~20%主要由各种类型的低分子量RNA组成(tRNA、核内小分子RNA等),这些高丰度的RNA分子具有确定的大小和核苷酸序列、并能用电泳、密度梯度离心、阴离子交换或高效液相层析等技术分离纯化。
mRNA与上述RNA不同,其含量为细胞总RNA的1~5%,大小和核苷酸序列各不相同,从数百至数千碱基不等。
..多数真核细胞mRNA在其3端均有一poly(A)尾,使得mRNA可以通过挂有oligo(dT)-纤维素的亲和层析柱分离纯化,获得的异源性分子集群的总体,可编码细胞内所有的多肽。
RNA酶变性剂RNA酶:水解RNA。
•含有链内二硫键,使其能抵抗长时间的煮沸和温和变性剂。
另外,变性后可迅速折叠,目前,尚无RNA酶失活的简易办法。
•该酶不需要二价阳离子激活,难以被金属离子鳌和剂(EDTA)失活。
——只好避免污染!用强烈变性剂,如盐酸胍或硫氰酸胍溶液能迅速溶解蛋白质,导致细胞结构破碎,核蛋白由于其二级结构的破坏而从核酸上解离下来。
..RNA酶可耐受多种处理(例如煮沸)而不失活,但却会被4 mo1/L硫氰酸胍和β-疏基乙醇等还原剂所灭活。
因此可联用上述试剂,从组织中提取完整无损的RNA实验准备工作:器具和试剂的消毒..(1)尽可能使用无菌、一次性塑料制品,已标明RNase-Free且未开封过的塑料制品,不必再进行其他处理,对于国产塑料制品,应按下列方法进行处理:在一玻璃烧杯中注入含终浓度为0.1%DEPC的去离子水,将要处理的塑料制品浸泡其中12小时以上,弃DEPC水溶液,适温烘烤干燥已处理过的塑料制品,再经103.4kPa,121℃高压灭菌15分钟,70-80℃烘烤干燥即可使用..(2)所用的玻璃器皿,置于干燥烘箱中200℃烘烤2小时以上。
rna提取方法
rna提取方法RNA提取方法。
RNA提取是分子生物学研究中的重要步骤,它能够从细胞或组织中提取出RNA,为后续的实验分析和研究奠定基础。
本文将介绍几种常用的RNA提取方法,希望能够为实验工作者提供一些参考和帮助。
1. Trizol法。
Trizol法是一种常用的RNA提取方法,它利用Trizol试剂将细胞或组织中的RNA溶解,然后通过酚-氯仿提取的方式分离RNA。
该方法操作简单,提取效果好,适用于各种类型的样品。
但需要注意的是,在操作过程中要避免RNA的降解,尽量减少搅拌和离心的时间,以保证提取的RNA质量。
2. 氯仿-异丙醇法。
氯仿-异丙醇法是另一种常用的RNA提取方法,它通过氯仿和异丙醇的相分离作用,将RNA从其他细胞成分中提取出来。
该方法提取的RNA纯度高,适用于大规模的样品处理。
但需要注意的是,在操作过程中要避免氯仿的挥发和异丙醇的残留,以免对后续实验造成影响。
3. 磁珠法。
磁珠法是近年来发展起来的一种RNA提取方法,它利用表面修饰的磁珠与RNA特异性结合,通过磁场的作用将RNA分离出来。
该方法操作简便,提取效果稳定,适用于高通量的样品处理。
但需要注意的是,在操作过程中要避免磁珠的污染和RNA的降解,以保证提取的RNA质量。
4. 硅胶柱法。
硅胶柱法是一种经典的RNA提取方法,它利用硅胶柱的吸附作用将RNA从细胞或组织中提取出来。
该方法提取的RNA质量好,适用于对RNA纯度要求较高的实验。
但需要注意的是,在操作过程中要避免硅胶柱的交叉污染和RNA的降解,以保证提取的RNA质量。
总结。
以上介绍了几种常用的RNA提取方法,每种方法都有其特点和适用范围。
在选择合适的RNA提取方法时,需要根据样品的特性和实验的要求进行综合考虑。
同时,在操作过程中要严格控制各项操作条件,以保证提取的RNA质量。
希望本文能够对实验工作者有所帮助,谢谢阅读!。
mRNA提取注意事项
合成cDNA第一链合成的引 合成cDNA第一链合成的引 确定退火温度适合所用的引物 cDNA 物退火失败 RNA模板存在较多二级结 RNA模板存在较多二级结 构 反转录成功,PCR失败 反转录成功,PCR失败
将RNA和引物在不含盐及缓冲液条件下变性/ RNA和引物在不含盐及缓冲液条件下变性/ 和引物在不含盐及缓冲液条件下变性 退火, 退火,提高逆转录反应温度 PCR步骤中使用超过1/5的逆转录反应产物 PCR步骤中使用超过1/5的逆转录反应产物 步骤中使用超过1/5
RNA提取的通用方法 RNA提取的通用方法
异硫氰酸胍/ 异硫氰酸胍/苯酚法
步骤: 步骤: • • • • •
材料准备:尽量新鲜。 材料准备:尽量新鲜。 裂解变性:异硫氰酸胍(亚硫氢胍,巯基乙醇, 月桂肌氨酸等)。 裂解变性 异硫氰酸胍(亚硫氢胍,巯基乙醇,N-月桂肌氨酸等)。 异硫氰酸胍 使细胞及核蛋白复合物变性,释放RNA,有效抑制核酸酶。 使细胞及核蛋白复合物变性,释放RNA,有效抑制核酸酶。 RNA 纯化分离:苯酚,氯仿,异戊醇。苯酚/氯仿可抽提去除杂物。 纯化分离:苯酚,氯仿,异戊醇。苯酚/氯仿可抽提去除杂物。 洗涤:70%乙醇。 洗涤:70%乙醇。 沉淀:异丙醇、无水乙醇。 沉淀:异丙醇、无水乙醇。 乙酸钠(pH4.0):维持变性的细胞裂解液的pH值 沉淀RNA。 乙酸钠(pH4.0):维持变性的细胞裂解液的pH值,沉淀RNA。 ):维持变性的细胞裂解液的pH RNA 此外还常用氯化锂选择沉淀RNA。 此外还常用氯化锂选择沉淀RNA。 RNA
影响RNA提取的因素 影响RNA提取的因素
材料: 材料:
新鲜, 新鲜,切忌使用反复冻融的材料 如若材料来源困难,且实验需要一定的时间间隔。 如若材料来源困难,且实验需要一定的时间间隔。可以先将材料 贮存在TRIzol或样品贮存液中, 贮存在TRIzol或样品贮存液中,于-70℃或-20℃保存 TRIzol或样品贮存液中 70℃或 20℃保存 如要多次提取, 如要多次提取,请分成多份保存 液氮长期保存,-70℃短期保存 液氮长期保存,-70℃短期保存 ,-70℃
RNA提取方法范文
RNA提取方法范文一、酚酸法酚酸法是最常用的RNA提取方法之一,它可以从多种生物样本中提取RNA。
这个方法的基本步骤如下:1.新鲜采集生物样本,并迅速将其转移到离心管中。
2.加入三倍体积的酸性酚:酚氯仿(5:1)溶液,对细胞进行破碎和溶解。
破碎细胞过程也可以用高压破碎机或超声波破碎器进行。
3.加入等体积的氯仿,并混匀离心。
4.收集上清液,使用等体积的异丙醇沉淀RNA。
5. 用70%乙醇洗涤RNA沉淀物,离心沉淀后空干,最后用RNase-free水重溶。
二、硅胶柱法硅胶柱法是一种基于硅胶材料的RNA提取方法,可以高效地纯化RNA。
它的基本步骤如下:1.用碱性裂解液将细胞或组织破碎,破坏蛋白质酶和其他核酸酶的活性。
2.加入等体积的酚氯仿提取混合物中的细胞碎片和其他凝固物。
3.加入等体积的异丙醇沉淀RNA。
4.将RNA沉淀物洗涤并去除DNA污染物。
5.将RNA反复吸附到硅胶柱上,去除杂质。
6.用低盐溶液洗涤硅胶柱,去除剩余的杂质。
7.用高盐洗脱RNA,收集纯化的RNA。
三、磁珠法磁珠法是一种通过磁珠将RNA与其他核酸或杂质分离的方法,它的基本步骤如下:1.用碱性裂解液将细胞或组织破碎,破坏蛋白质酶和其他核酸酶的活性。
2.加入等体积的异丙醇沉淀RNA。
3.将沉淀物沉淀,并洗涤去除DNA和其他杂质。
4.加入磁性磁珠,使其结合RNA。
5.使用磁性架将磁珠捕获,并洗涤去除杂质。
6.重新悬浮磁珠,将RNA从磁珠上洗脱。
7. 收集洗脱的RNA,用RNase-free水重溶。
需要注意的是,在RNA提取过程中应该尽量避免RNA降解和污染。
为了保证RNA的完整性和纯度,可以在提取过程中使用RNase酶抑制剂、做好境外灭菌的操作以及选择合适的材料和试剂。
综上所述,RNA提取方法有多种选择,每种方法都有其特点和适用范围。
选择适合的RNA提取方法对于分子生物学研究和基因表达分析的准确性至关重要。
RNA的提取方法
RNA的提取方法RNA提取是一项关键的实验技术,用于从生物样本中分离和纯化RNA分子。
RNA的提取方法通常包括细胞破碎、RNA的溶解和纯化。
以下是几种常见的RNA提取方法:1.酚/氯仿提取法这是一种常见且经典的RNA提取方法。
首先将样品中的细胞进行破碎,然后将细胞裂解液与等体积的酚混合,并进行振荡离心。
酚可与蛋白质结合形成上清和有机相,而RNA会在有机相中沉淀。
接下来,用氯仿去除DNA等杂质,然后将上清转移到新离心管并加入异丙醇,以沉淀RNA。
最后,通过离心将RNA沉淀物收集并洗涤,最终得到纯化的RNA。
2.硅基膜或硅树脂提取法这是一种使用硅基膜或硅树脂来纯化RNA的高效方法。
在这种方法中,首先通过物理或化学方法破坏细胞膜,然后在硅基膜或硅树脂的表面上固定RNA。
接下来,通过对固定RNA进行洗涤和去除杂质的步骤,最终得到纯化的RNA。
3.列柱纯化法这是一种使用RNA捕获柱或硅膜柱等纯化RNA的方法。
在这种方法中,首先将裂解的细胞滤液加入到柱上,并经过多次洗涤,以去除杂质。
然后,通过改变柱的条件,如pH、盐浓度等,使RNA释放出来并收集。
这种方法具有高纯度、高通量和可自动化的优点。
4.磁珠提取法磁珠提取法是一种快速、高效的RNA提取方法。
在这种方法中,首先将裂解的细胞滤液与具有亲和性RNA结合能力的磁珠混合,并经过洗涤步骤去除杂质。
然后,通过改变磁场的条件,使磁珠内的RNA释放并收集。
这种方法适用于高通量的RNA提取,具有高产率和高纯度。
5.TRIZOL法TRIZOL法是一种常用的综合性RNA提取方法。
在这种方法中,样品中的细胞先与TRIZOL试剂混合,然后加入氯仿使得细胞的核酸沉淀。
接下来,将上清转移至新的离心管中,并加入异丙醇使得RNA沉淀。
最后,通过洗涤和离心将RNA沉淀物收集并纯化。
需要注意的是,不同的RNA提取方法适用于不同类型的样本和实验需求。
选择合适的RNA提取方法对于后续实验的成功与结果的准确性至关重要。
RNA提取
RNA提取1、动物组织从负80拿出之后要放在冰中,提前准备好枪头、镊子、匀浆器、无核酶管子(标记好)、transzol、氯仿、异丙醇、无水乙醇、无核酶水、滤纸等。
2、①组织:切组织50~100mg(多一些也可以),可以切数个小的,有利于研磨,放在管口然后用研磨棒粘着下去,然后加入1ml transzol在冰上充分碾磨,至肉眼看不到颗粒状物质。
②细胞:六孔板,用PBS洗两遍,每孔加入1ml transzol,在冰上吹打20次。
3、室温静置5-10分钟。
4、每使用1ml transzol,加0.2ml氯仿,剧烈震荡15s(这个一定要用力震荡,可以延长时间,有利用充分混合),室温孵育5~10min。
5、15000rpm,4度离心15分钟,分成三层,无色的上层,中间层,粉红色有机层下层,RNA主要存在于水相,一般可以吸出来400-500微升。
6、转移无色的水相于新的离心管,每使用1ml transzol加入0.5ml异丙醇,颠倒混匀,室温孵育10~15min。
7、15000rpm ,4度离心10分钟,去上清,在管底可以看到胶状物。
8、加入1ml 80%乙醇(无核酶水配制),剧烈震荡。
9、12000rpm ,4度离心8分钟。
10、重复8、9。
11、弃上清,倒扣EP管于滤纸之上,不能剧烈摇动,让乙醇自然流出,室温晾干沉淀10~20分钟(不宜过长因为RNA越干燥下一步用无核酶水溶解越难溶),此时可以完全看到管底有胶状物质,此时管壁可能存在一些流不出来的乙醇,将滤纸卷成圈然后吸一下,不要碰到RNA沉淀。
12、然后加入30微升溶解RNA沉淀,一般溶解5~10分钟,一般比较难容的可以轻微弹一下管壁,然后用离心机离一下。
13、然后进行定量,逆转录。
RNA提取方法
RNA提取⽅法总RNA的提取(Trizol法提取)在收集到⽣物材料之后,最好能即刻进⾏RNA制备⼯作。
若需暂时储存,则应以液氮将⽣物材料急速冷冻后,储存于-80℃冷冻柜。
在制备RNA时,将储存于冷冻柜的材料取出,⽴即以加⼊液氮研磨的⽅式打破细胞,不可以先⾏解冻,以避免RNase 的作⽤。
1.提取组织RNA时,每50~100mg组织⽤1ml Trizol试剂对组织进⾏裂解;提取细胞RNA时,先离⼼沉淀细胞,每5-10 ╳106个细胞加1ml Trizol后,反复⽤枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞;2.将上述组织或细胞的Trizol裂解液转⼊EP管中,在室温15~30C下放臵5分钟;3.在上述EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.2ml氯仿的量加⼊氯仿,盖上EP管盖⼦,在⼿中⽤⼒震荡15秒,在室温下(15℃~30℃)放臵2~3分钟后,12000g(2℃~8℃)离⼼15分钟;4.取上层⽔相臵于新EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.5ml异丙醇的量加⼊异丙醇,在室温下(15℃~30℃)放臵10分钟,12000g(2℃~8℃)离⼼10分钟;5.弃上清,按照每1ml TRIZOL加1ml 75%⼄醇进⾏洗涤,涡旋混合,7500g(2℃~8℃)离⼼5分钟,弃上清;6.让沉淀的RNA在室温下⾃然⼲燥;7.⽤Rnase-free water 溶解RNA沉淀。
PCR实验室常⽤DNA聚合酶有三种:TaKaRa Taq TM,TaKaRa E X Taq TM和Pyrobest TM DNA Polymerase。
TaKaRa Taq TM 是⼀般的DNA聚合酶,保真性较差,但价钱便宜,⼀般⽤于基因表达的检测等。
TaKaRa E X Taq TM是具有Proof reading 活性的耐热性DNA聚合酶,具有⼀定的保真性,⽽且其扩增得到的PCR产物3’端附有⼀个“A”碱基,如果希望直接将产物克隆到T-vector可以⽤此酶。
RNA的提取方法
RNA的提取方法RNA提取是生物学中一项非常重要的实验技术,它可以用于研究RNA在生物体内的表达以及功能调控。
RNA提取的方法有多种,下面将介绍一些常用的RNA提取方法。
1.总RNA提取:总RNA提取是最常用的RNA提取方法之一,它可以提取细胞或组织中的所有RNA种类,包括mRNA、rRNA和tRNA等。
总RNA提取的步骤包括细胞或组织的裂解、蛋白酶处理、RNA溶液的提取和纯化等。
提取时可以使用商业化的总RNA提取试剂盒,也可以自制试剂进行提取。
2.mRNA提取:mRNA是总RNA中占比相对较小的一部分,它包含了大部分的转录信息。
mRNA的提取主要是通过使用寡聚dT寡核苷酸的亲和浸润材料,富集含有poly(A)尾的RNA分子。
提取步骤包括细胞裂解、磁珠富集和纯化等。
3. miRNA提取:miRNA是一类长度较短的非编码RNA,具有多种生物学功能。
miRNA的提取相对较为复杂,步骤包括细胞裂解、蛋白酶处理、有机溶剂萃取、硅胶膜纯化和乙酸乙酯沉淀等。
商业化的miRNA提取试剂盒则简化了这一过程。
4.胚胎RNA提取:胚胎RNA提取主要适用于研究早期胚胎发育过程中的基因表达变化。
提取步骤包括选择合适的胚胎发育阶段、胚胎裂解、RNA的提取和纯化等。
在这个过程中,需要注意减少RNA的降解,因为胚胎RNA含有RNA酶。
5.组织RNA提取:组织RNA提取是为了研究不同组织中特定基因的表达差异。
提取组织RNA的步骤包括组织的裂解、蛋白酶处理、RNA的提取和纯化等。
组织RNA的含量通常较少,需要采取额外的措施来提高RNA的得率。
6.体液RNA提取:体液RNA的提取用于研究循环系统或分泌系统中的RNA信息。
体液RNA的提取步骤包括样本的离心、细胞裂解、RNA的提取和纯化等。
一般情况下,体液RNA的浓度较低,因此需要使用高敏感的RNA提取方法。
总的来说,RNA提取是RNA研究的基础,根据不同的研究目的和样本类型选择合适的RNA提取方法非常重要。
RNA提取方法
总RNA的提取方法(Trizol)
1、取1g植物材料,倒入液氮剧烈研磨,成粉(研磨成粉称重,无液氮时继续添加),转入离心管中,加入1ml Trizol混匀(除DNA)。
2、室温放置5min。
3、加200ul氯仿(1ml Trizol+0.2ml氯仿目的:除酚)剧烈震荡15s,室温放置3min(时间的控制)。
4、12000rpm,4℃,15min,取上层水相,大约600ul,下层有机相弃去。
5、加异丙醇(-20℃)混匀,室温放置10min(1ml Trizol+500ul异丙醇,目的:除盐,若盐少,可用无水乙醇)
6、12000rmp,4℃,10min,弃上清,RNA在管底和管壁形成胶状沉淀。
7、加1ml75﹪乙醇洗涤沉淀(用枪头吹打)低速离心5min,弃上清,4℃,,7500rmp,一般为7000rmp。
8、室温放置,晾干5至10min(不要过干,否则RNA难溶,另外,乙醇残留时会对RNA逆转录酶抑制)。
9、加25-30ulDEPC水,可用枪头吹打帮助溶解。
①看到沉淀时加30-50ulDEPC 水;②看不到沉淀时加20-25ulDEPC水。
注意事项:
1、DNA制备所需的水、溶液,都必须用DEPC 37℃预处理。
2、操作过程中要用到的Eppenolorf管,枪头必须经DEPC处理
3、玻璃器皿需高温干热(200℃)灭菌2-3h。
4、塑料制品和电泳槽等需要0.5mol/L的NaoH处理1-2h,然后用无菌水漂洗干净。
5、操作台和枪先用氯仿擦一遍。
6、操作中常换一次性手套,手是主要的污染源。
7、戴口罩,避免口中的RNA酶污染。
提取RNA及用DEPC去除RNase的个人总结精华
提取RNA及用DEPC去除RNase的个人总结精华RNA(核糖核酸)是一种重要的生物大分子,在生物学和分子生物学研究中起着至关重要的作用。
为了能够从生物样本中有效地提取RNA,并且保留其完整性和纯度,科学家们经过不断的探索和实践,发展出了各种提取RNA的方法。
本文将对提取RNA的常用方法进行介绍,并重点讲解如何使用DEPC来去除RNase的干扰。
1. RNA的提取方法在提取RNA之前,首先要选择合适的样本来源,常见的包括细胞、组织和体液等。
接下来,选择不同的提取方法根据样本的性质和研究目的来决定。
1.1 酚/氯仿法酚/氯仿法是一种经典的RNA提取方法。
它通过酚与细胞溶解膜的相容性,使RNA与DNA、蛋白质和其他杂质分离开来。
细胞或组织经过离心后,上清液中含有RNA,而DNA、蛋白质和其他杂质则被酚溶液中。
接着,氯仿会与酚中的DNA结合而形成沉淀,在离心过程中分离出来。
这样,我们可以获得相对较纯的RNA。
1.2 硅胶柱法硅胶柱法是一种基于RNA与硅胶的亲和性吸附原理的提取方法。
首先,样本经过蛋白酶、混悬液和酚/氯仿处理后,去除了DNA和蛋白质。
然后,将清洗后的样本溶液通过硅胶柱,RNA会在硅胶表面结合,其他杂质则被洗脱。
最后,将纯化后的RNA从硅胶上洗脱下来,即可得到较纯的RNA。
2. DEPC的使用及去除RNaseDEPC(二乙氧基甲基叔丁基苯胺)是一种常见的RNase抑制剂,可以有效地抑制RNase的活性,保护RNA的完整性。
2.1 DEPC的制备DEPC可以通过在无水环境下将其加入去离子水中进行制备。
在加入过程中要慢慢搅拌以确保彻底溶解,并进行蒸馏纯化,最终得到含有DEPC的去离子水。
需要注意的是,DEPC具有较强的致癌性和刺激性,使用时应佩戴个人防护用品,确保安全操作。
2.2 DEPC对RNase的抑制作用DEPC可以与RNase中的组氨酸残基反应,形成氨基甲酸甲酯,从而使RNase失活。
提取rna有哪些方法
提取rna有哪些方法
提取RNA的方法有以下几种:
1. 酚/氯仿提取法:加入酚溶液和氯仿,使细胞裂解,并使RNA萃取至有机相中。
然后使用异丙醇和盐沉淀RNA,最后用乙醇洗涤和脱水。
2. 链霉亲和纯化法:利用链霉素结合特定序列(例如poly A序列)的能力,通过链霉素磁珠或石蜡树脂来纯化多聚A尾的mRNA。
3. 柱层析法:使用离子交换柱、凝胶层析柱或亲和层析柱(例如,根据RNA与硅胶柱或根据RNA酶的抗体选择性地结合)来分离和纯化RNA。
4. 总RNA提取法:将细胞或组织裂解,使用一种提取试剂(如TRIzol试剂)来提取总RNA。
总RNA中包含mRNA、rRNA和tRNA等各种类型的RNA。
5. 过滤提取法:通过使用尺寸排除膜或滤波器来去除细胞碎片和DNA,然后使用过滤盘或纤维膜纯化RNA。
需要根据实验需求和样品性质选择适合的RNA提取方法。
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