实验室常用的细菌作用及其选择

实验室常用的细菌作用及其选择
实验室常用的细菌作用及其选择

第一篇:JM109,DH5a,BL21这些感受态有何区别

1:DH5a菌株

DH5a是一种常用于质粒克隆的菌株。E.coli DH5a在使用pUC系列质粒载体转化时,可与载体编码的β-半乳糖苷酶氨基端实现α-互补。可用于蓝白斑筛选鉴别重组菌株。

基因型:F-,φ80dlacZΔM15,Δ(lacZYA-argF)U169,deoR,recA1,endA1,hsdR17(rk-,mk+),phoA,supE44,λ-,thi-1,gyrA96,relA1

2:BL21(DE3) 菌株

该菌株用于高效表达克隆于含有噬菌体T7启动子的表达载体(如pET系列)的基因。T7噬菌体RNA聚合酶位于λ噬菌体DE3区,该区整合于BL21的染色体上。该菌适合表达非毒性蛋白。

基因型:F-,ompT, hsdS(rBB-mB-),gal, dcm(DE3)

3:BL21(DE3) pLysS菌株

该菌株含有质粒pLysS,因此具有氯霉素抗性。PLysS含有表达T7溶菌酶的基因,能够降低目的基因的背景表达水平,但不干扰目的蛋白的表达。该菌适合表达毒性蛋白和非毒性蛋白。

基因型:F-,ompT hsdS(rBB-mB-),gal, dcm(DE3,pLysS ,Camr

4:JM109菌株

该菌株在使用pUC系列质粒载体进行DNA转化或用M13 phage载体进行转染时,由于载体DNA产生的LacZa多肽和JM09编码的LacZΔM15进行α-互补,从而显示β-半乳糖苷酶活性,由此很容易鉴别重组体菌株

基因型:recA1,endA1,gyrA96,thi-1,hsdR17,supE44,relA1,Δ(lac -proAB)/F’[traD36,proAB+,lacIq,lacZΔM15]

5:TOP10菌株

该菌株适用于高效的DNA克隆和质粒扩增,能保证高拷贝质粒的稳定遗传。

基因型:F- ,mcrAΔ(mrr-hsd RMS-mcrBC),φ80 ,lacZΔM15,△lac Ⅹ74, recA1 ,araΔ139Δ(ara-leu)7697, galU ,galK ,rps, (Strr) endA1,nupG

6:HB101菌株

该菌株遗传性能稳定,使用方便,适用于各种基因重组实验

基因型:supE44,hsdS20(rB-mB-),recA13,ara-14,proA2,lacY1,galK2,rpsL20,xyl-5,mtl-1,leuB6,thi-1

第二篇:JM110或 SCS110

大多数大肠杆菌菌株中含有Dam甲基化酶和Dcm甲基化酶,前者可以在GATC 序列中腺嘌呤N-6位上引入甲基,后者在CCA/TGC序列的第一个胞嘧啶 C-5位置上引入甲基。常用的菌株都会产生dam,dcm,从而受到甲基化的影响.

部分限制性内切酶对甲基化的DNA不能切割,如FbaI和MboI等,一般生物公司提供的内切酶说明中均有说明。

大多数酶切位点的甲基化不影响切割,而有些会影响,如XbaI, BclI等。而且甲基化只发生在特定序列,以XbaI为例,只有在位点序列旁出现GA或TC,该XbaI位才会被甲基化。

而要解除这种限制修饰作用通常有两种方法:

(1)选用上述酶的同功酶,如Sau3AI,DNA识别切割位点与MboI相同;但不受甲基化影响;

(2)利用甲基化酶缺失的受体细胞进行DNA的制备,如E.coli JM110和链霉菌等,前者Dam和Dcm甲基化酶已敲出,而后者细胞内本就没有甲基化酶,从这些细胞中抽提的 DNA就能被上述酶切割。

E.coli JM110

要排除dam,dcm甲基化的影响,需要用特定的dam-,dcm-的菌株,如JM110

如果由JM110或 SCS110等甲基化缺失的菌株产生的质粒,则不会被甲基化.

第三篇:各种感受态细胞的区别用途特征

Xl1-Blue菌株

基因型:endA1 gyrA96(nalR) thi-1 recA1 relA1 lac glnV44 F‘[Tn10 proAB+ lacIq Δ(lacZ)M15] hsdR17(rK- mK+)。

特点:具有卡那抗性、四环素抗性和氯霉素抗性。

用途:分子克隆和质粒提取。

BL21(DE3)菌株

基因型:F– ompT gal dcm lon hsdSB(rB- mB-) λ(DE3 [lacI lacUV5-T7 gene 1 ind1 sam7 nin5])。

特点:该菌株用于以T7 RNA聚合酶为表达系统的高效外源基因的蛋白表达宿主。T7噬菌体RNA聚合酶基因的表达受控于λ噬菌体DE3区的lacUV5启动子,

该区整合于BL21的染色体上。该菌适合于非毒性蛋白的表达。

用途:蛋白质表达。

BL21(DE3)ply菌株

基因型:F- ompT gal dcm lon hsdSB(rB- mB-) λ(DE3) pLysS(cmR)。

特点:该菌株带有pLysS,具有氯霉素抗性。此质粒还有表达T7溶菌酶的基因,T7溶菌酶能够降低目的基

因的背景表达水平,但不干扰IPTG诱导的表达。适合于毒性蛋白和非毒性蛋白的表达。

用途:蛋白质表达

DH5α菌株

基因型:F- endA1 glnV44 thi-1 recA1 relA1 gyrA96 deoR nupG Φ80dlacZ ΔM15 Δ(lacZYA-argF)U169, hsdR17(rK-, λ–

特点:一种常用于质粒克隆的菌株。其Φ80dlacZΔM15基因的表达产物与pUC载体编码的β-半乳糖苷酶氨基端实现α互补,可用于蓝白斑筛选。recA1和 endA1的突变有利于克隆DNA的稳定和高纯度质粒DNA的提取。

用途:分子克隆、质粒提取和蛋白质表达。

JM109菌株

基因型:endA1 glnV44 thi-1 relA1 gyrA96 recA1 mcrB+ Δ(lac-proA e14- [F‘ traD36 proAB+ lacIq lacZΔM15]hsdR17(rK-mK+)。

特点:部分抗性缺陷,适合重复基因表达, 可用于M13克隆序列测定和蓝白斑筛选。

用途:分子克隆、质粒提取和蛋白质表达。

第四篇:

E.coli Electro-Cells

E.coli Electro-Cell JM109

制品名 TaKaRa Code 包装量价格(人民币元)

E.coli Electro-Cell JM109 D9022 1 Set (50 μl×10支) 300

■ Genotype

E.coli JM109

recA1, endA1, gyrA96, thi-1, hsdR17, supE44, relA1,

Δ(lac-proA/F'[traD36, proAB+, lac Iq, lacZ ΔM15]

■细胞浓度

1~2×1010 Bacteria/ml

■保存

-80℃

■制品说明

用高电压脉冲电流瞬间击穿大肠杆菌,从而导致DNA转入大肠杆菌内的转化方法称为电穿孔法。电穿孔法是各种转化方法中效率最佳的方法之一,比Ca2+处理的感受态细胞的转化效率高,在转化少量DNA时,特别能发挥其特有的威力。

TaKaRa使用独自开发的菌体培养法,制作出了效果极佳的 E.coli Electro-Cell JM109。

■细胞种类

α-互补性选择宿主E.coli JM109

E.coli JM109在使用pUC系列质粒载体进行DNA转化或用M13 phage载体进行转染时, 由于载体DNA产生的LacZα多肽和JM109 F'编码的lacZΔM15的结合,显示β-半乳糖苷酶活性 (α-互补性)。利用这一特性,可以很容易鉴别重组体菌株。因为具有F'质粒,除可用于制作基因库、进行亚克隆等之外,也可作为M13载体DNA的宿主,调制单链DNA。

■质量标准

使用10 pg的质粒DNA进行转化时:

50 μl E.coli JM109 Electro-Cell/10 pg pUC19 plasmid转化时产生的菌落数

>1×109 transformants/1 μg pUC19 plasmid

F'质粒的稳定性检测

对E.coli JM109使用pUC19 DNA进行电穿孔法转化后,在含有100 μg/ml 的Ampicillin、0.2 mM的IPTG, 40 μg/ml的X-Gal的L-琼脂平板培养基上,产生的白色菌落在1%以下。

50 μl的E.coli JM109 Electro-Cell在含有100 μg/ml的Ampicillin L-琼脂平板培养基上不产生菌落。

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BL21(DE3)pLysS细菌菌株

BL21(DE3)pLysS细菌菌株可以表达T7控制并核糖体结合位点的高效蛋白表达。BL21(DE3)pLysS对λDE3(1)是溶源性的。λDE3含有T7噬菌体基因I,编码的T7 RNA聚合酶受lac UV5启动子的控制。BL21(DE3)pLysS含有pLysS 质粒,他携带编码T7溶菌酶基因。在T7启动子控制下,T7溶菌酶降低靶基因的背景表达但并不干扰由IPTG诱导的表达水平。

包装:

P9811 500μl

https://www.360docs.net/doc/8b15680238.html,/tbs/tb095/tb095.pdf

第五篇:JM109,DH5a,BL21感受态有何区别

1:DH5a菌株

DH5a是一种常用于质粒克隆的菌株。E.coli DH5a在使用pUC系列质粒载体转化时,可与载体编码的β-半乳糖苷酶氨基端实现α-互补。可用于蓝白斑筛选鉴别重组菌株。

基因型:F-,φ80dlacZΔM15,Δ(lacZYA-argF)U169,deoR,recA1,endA1,hsdR17(rk-,mk+),phoA,supE44,λ-,thi-1,gyrA96,relA1

2:BL21(DE3) 菌株

该菌株用于高效表达克隆于含有噬菌体T7启动子的表达载体(如pET系列)的基因。T7噬菌体RNA聚合酶位于λ噬菌体DE3区,该区整合于BL21的染色体上。该菌适合表达非毒性蛋白。

基因型:F-,ompT, hsdS(rBB-mB-),gal, dcm(DE3)

3:BL21(DE3) pLysS菌株

该菌株含有质粒pLysS,因此具有氯霉素抗性。PLysS含有表达T7溶菌酶的基因,能够降低目的基因的背景表达水平,但不干扰目的蛋白的表达。该菌适合表达毒性蛋白和非毒性蛋白。

基因型:F-,ompT hsdS(rBB-mB-),gal, dcm(DE3,pLysS ,Camr

4:JM109菌株

该菌株在使用pUC系列质粒载体进行DNA转化或用M13 phage载体进行转染时,由于载体DNA产生的LacZa多肽和JM09编码的LacZΔM15进行α-互补,从而显示β-半乳糖苷酶活性,由此很容易鉴别重组体菌株

基因型:recA1,endA1,gyrA96,thi-1,hsdR17,supE44,relA1,Δ(lac -proAB)/F’[traD36,proAB+,lacIq,lacZΔM15]

5:TOP10菌株

该菌株适用于高效的DNA克隆和质粒扩增,能保证高拷贝质粒的稳定遗传。

基因型:F- ,mcrAΔ(mrr-hsd RMS-mcrBC),φ80 ,lacZΔM15,△lac Ⅹ74, recA1 ,araΔ139Δ(ara-leu)7697, galU ,galK ,rps, (Strr) endA1,nupG

6:HB101菌株

该菌株遗传性能稳定,使用方便,适用于各种基因重组实验

基因型:supE44,hsdS20(rB-mB-),recA13,ara-14,proA2,lacY1,galK2,rpsL20,xyl-5,mtl-1,leuB6,thi-1

M110或 SCS110

大多数大肠杆菌菌株中含有Dam甲基化酶和Dcm甲基化酶,前者可以在GATC 序列中腺嘌呤N-6位上引入甲基,后者在CCA/TGC序列的第一个胞嘧啶 C-5位置上引入甲基。常用的菌株都会产生dam,dcm,从而受到甲基化的影响.

部分限制性内切酶对甲基化的DNA不能切割,如FbaI和MboI等,一般生物公司提供的内切酶说明中均有说明。

大多数酶切位点的甲基化不影响切割,而有些会影响,如XbaI, BclI等。而且甲基化只发生在特定序列,以XbaI为例,只有在位点序列旁出现GA或TC,该XbaI位才会被甲基化。

而要解除这种限制修饰作用通常有两种方法:

(1)选用上述酶的同功酶,如Sau3AI,DNA识别切割位点与MboI相同;但不受甲基化影响;

(2)利用甲基化酶缺失的受体细胞进行DNA的制备,如E.coli JM110和链霉菌等,前者Dam和Dcm甲基化酶已敲出,而后者细胞内本就没有甲基化酶,从这些细胞中抽提的 DNA就能被上述酶切割。

E.coli JM110

要排除dam,dcm甲基化的影响,需要用特定的dam-,dcm-的菌株,如JM110

如果由JM110或 SCS110等甲基化缺失的菌株产生的质粒,则不会被甲基化=============================

实验室的一般大肠杆菌拥有4288条基因,每条基因的长度约为950bp,基因间的平均间隔为118bp(基因Ⅷ)。E.coli基因组中还包含有许多插入序列,如λ-噬菌体片段和一些其他特殊组份的片段,这些插入的片段都是由基因的水平转移和基因重组而形成的,由此表明了基因组具有它的可塑造性。

利用大肠杆菌基因组的这种特性对其进行改造,使其中的某些基因发生突变或缺失,从而给大肠杆菌带来可以观察到的变化,这种能观察到的特征叫做大肠杆菌的表现型(Phenotype),把引起这种变化的基因构成叫做大肠杆菌的基因型(Genotype)。具有不同基因型的菌株表现出不同的特性。

分子克隆中常用的大肠杆菌及其遗传标记按Demerec等1966年提出的命名原则,采用的菌株所有的基因都假定处于野生型状态,除非在基因型上另外注明。

大肠杆菌基因型的表示方法(Demerec, et, al. 1966):

一、一般规则:

1、根据基因产物或其作用产物的英文名称的第一个字母缩写成 3个小写斜体字母来表示。例如:DNA Adenine Methylase→dam。

2、不同的基因座,其中任何一个突变所产生的表型变化可能相同,其表示方法是在 3个小写斜体字母后加上一个斜体大写字母来表示区别。例如:Recombination→recA、recB、recC。

3、突变位点应通过在突变基因符号后加不同数字表示。如 supE44(sup基因座E的44位突变)。如果不知道几个等位基因中哪一 /几个发生了功能性突变,则用连字符“ -”代替大写字母,如 trp-31。

4、细菌的基因型中应该包含关于其携带的质粒或附加体的的信息。这些符号包括菌株携带的质粒或附加体、质粒或附加体上的突变基因座和突变位点。其基因符号应与基因座的表示符号明显区别,符号的第一个字母大写、不斜体并位于括号内;质粒或附加体上的突变基因座和突变位点的基因符号的表示方法与染色体上突变基因座、突变位点的符号相同。

5、对于携带附加体的菌株的完整基因型描述应包括附加体的状态(游离或整合)。以 F因子为例,F-:F因子缺失; F+:自主性 F因子,不携带任何遗传可识别染色体片段; F':携带有遗传可识别细菌染色体片段的自主性 F因子;Hfr:整合到染色体上的 F因子( high frequency of recombination)。当这些质粒或噬菌体片段变异或缺失时,用()“或”/“等以区别。例如:/F' [traD3

6、proAB、lac I q、lacZ. M15]

6、某个基因或某个领域缺失时,在其基因型前面加上“”表示。例如:lac-proAB基因缺失时它的基因型表示为(lac-proAB)。

7、由于某种基因的变异导致大肠杆菌可以明显观察到特征变化,有时也用其表现型代替基因型进行表示。例如:某些抗药性的获得或丧失,用如下方式表示: Streptomycin抗性→Str +或 Str r,Ampicillin敏感性→ Amp-。(第一个字母要大写,“+”或“r”表示有抗性,“-”表示无抗性或敏感)。

8、根据某些特异性蛋白的变异及其导致的结果变化进行表示。例如:TH2菌株上有一种基因型表示如下:hsdS20 (rB-、mB-),其中 S20代表特异性识别蛋白发生变异,()中的 rB-、mB-表示由于 S20的变异而导致 B株来源的 hsdR 和 hsdM的功能缺失。

9、蛋白质的名称与对应的基因或等位基因相同,但不用斜体,且首字母大写,如, UvrA、 UvrB。

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