第七章 基因传感器
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第七章 基因传感器 Genosensor
一、基因传感器概述 1. 基因传感器及原理
以DNA为敏感元件,通过信号转换器将
DNA与DNA、DNA与RNA、DNA与其它有机
无机离子之间的作用的生物学信号转变为可检 测的光、电等物理信号。
2.基本结构 DNA探针 信号转换器
3. 基因传感器的制备步骤
● ● ● ●
电化学活性的小分子物质能与DNA分子
发生可逆性相互作用,其中一些物质能够专
一性地嵌入dsDNA 分子双螺旋结构的碱基对
之间,这一类物质称为杂交指示剂。
电化学活性杂交指示剂的电活性可使检
测电流增大,提高检测灵敏度。
●
寡聚核苷酸上修饰电化学活性的官能团 合成带有电化学活性基团的寡聚核苷酸,
与电极表面固定的ssDNA选择性地进行杂交反
肌酸酐水解酶 肌酸酐 H 2O 肌酸 脒基肌酸水解酶 肌酸 H 2O 肌氨酸 脲
肌氨酸 H 2O O2 甘氨酸+HCHO H 2O2
肌氨酸氧化酶
2. 请设计一种免疫传感器测定甲胎蛋白。
封闭
将目标DNA均匀分布在电极表面, 杂交形成ds-DNA
置于杂交指示剂溶液中,取出 洗去表面未被吸附的指示剂
选择DNA探针遵循的原则:
●
探针的长度 GC碱基的组成 探针分子内不能存在互补区
●
●
二、基因传感器的类型
● ● ●
电化学DNA传感器
光纤DNA传感器
压电型DNA传感器
1. 电化学DNA传感器
(2)检测原理
检测时,将ssDNA探针固定在电极表面,加入
具有电活性的物质作为标识物,浸入含有被测目标 DNA分子的溶液中,通过检测电极在待测溶液中 电化学信号的变化,确定靶基因的序列。 或者将待测基因片段固定在电极表面,然后与
溶液中已标定杂交指示剂的DNA探针进行杂交,
达到识别和测定靶基因的目的。
技术。
具有操作简便快速、成本低、体积小、 易于携带等特点,在分子生物学、疾病诊 断和治疗、新药开发、司法鉴定等领域具 有很大潜力。
压电晶体DNA传感器原理
小结:
25
习题:
1. 请分别设计测定肌酸酐的电流型酶传感器、光纤 酶传感器和电流型微生物传感器(节杆菌中含 有肌酸酐氧化酶)。如何对你设计的传感器的 性能进行评价?
电化学DNA传感器检测原理
(3)应用
电化学DNA传感器在基因分析、医学 分析、环境污染监测等方面都有应用。
●
基因分析
杂交时完全配对 A+B
1个碱基错配 A+C 2个碱基错配 A+D 碱基完全错配 A+E
靶序列与Ss-DNA探针完全配对或错配时的浓度-电流曲线
A: ss-DNA probe [HS(CH2)6-5-d(TAAGGG AAT GGT TAG GAA GGC)-3], B:fully matched oligonucleotide [5-d(GCC TTC CTA ACC ATT CCC TTA)-3], C:single-basemismatchedoligonucleotide [5-d(GCC TTC CTA ACT ATT CCCTTA)-3], D:double-base-mismatched oligonucleotide [5-d(GCC TTC CTA ACT C TT CCC TTA)-3], E: fully mismatched oligonucleotide [5-d(CTT GAT ACG GAT CAG AGT CAT)-3]
●
环境检测
Hg2+的检测
●
医学分析
细菌及病毒感染类疾病的诊断 基因诊断 DNA损伤研究
2. 光纤DNA传感器
以光纤作为转换元件,将杂交过程中产
生的特征光学信号(荧光、发光、颜色变化
等),通过光纤探头传递至光检测器,经光 电转换进而测定出目标基因。
3.压电晶体DNA传感器
压电晶体DNA传感器是新型的基因检测
DNA探针的固定 杂交过程 杂交的指示 信号的检测
设计DNA传感器涉及两个关键技术:
●
有效地将DNA探针固定在固体基质表面的技术 在传感器/液相界面对于靶基因的检测技术
●
4. DNA探针的固定化方法
●
吸附法
●
共价键结合法
自组装膜法
●
Au电极抛光、清洗
用被HS(CH2)6-标记的寡聚核苷酸 探针修饰电极表面
电化学DNA传感器由已知序列的单链DNA 分子与电化学电极组成。
●
电极表面固定的ssDNA探针
●活性标识物
制作电化学DNA传感器的关键是必须引入 电化学活性标识物。
常用的标识物有三种类型:
● ● ●
电化学活性的杂交指示剂 寡聚核苷酸上修饰电化学活性的官能团 标记酶
●
电化学活性的杂交指示剂
应,在电极表面形成带有电活性官能团的杂交
分子,通过测定其电信号可以识别和测定DNA
分子。
在寡聚核苷酸的5-端磷酸基上标记具有
电化学活性的羧酸二茂铁,制成二茂铁寡聚
核苷酸。合成的二茂铁寡聚核苷酸选择性地
与互补单链DNA形成复合物,检测其电流的变
化。该电流信号与复合物的量相关。
●
标记酶
利用酶的化学放大功能,在DNA分子上 标记酶作为识别物,当被酶标记的ssDNA与电 极表面的互补ssDNA发生杂交反应后,相当于 在电极表面修饰了一层酶,酶具有很强的催化 功能,通过测定反应生成物的变化量可以间接 测定DNA。
一、基因传感器概述 1. 基因传感器及原理
以DNA为敏感元件,通过信号转换器将
DNA与DNA、DNA与RNA、DNA与其它有机
无机离子之间的作用的生物学信号转变为可检 测的光、电等物理信号。
2.基本结构 DNA探针 信号转换器
3. 基因传感器的制备步骤
● ● ● ●
电化学活性的小分子物质能与DNA分子
发生可逆性相互作用,其中一些物质能够专
一性地嵌入dsDNA 分子双螺旋结构的碱基对
之间,这一类物质称为杂交指示剂。
电化学活性杂交指示剂的电活性可使检
测电流增大,提高检测灵敏度。
●
寡聚核苷酸上修饰电化学活性的官能团 合成带有电化学活性基团的寡聚核苷酸,
与电极表面固定的ssDNA选择性地进行杂交反
肌酸酐水解酶 肌酸酐 H 2O 肌酸 脒基肌酸水解酶 肌酸 H 2O 肌氨酸 脲
肌氨酸 H 2O O2 甘氨酸+HCHO H 2O2
肌氨酸氧化酶
2. 请设计一种免疫传感器测定甲胎蛋白。
封闭
将目标DNA均匀分布在电极表面, 杂交形成ds-DNA
置于杂交指示剂溶液中,取出 洗去表面未被吸附的指示剂
选择DNA探针遵循的原则:
●
探针的长度 GC碱基的组成 探针分子内不能存在互补区
●
●
二、基因传感器的类型
● ● ●
电化学DNA传感器
光纤DNA传感器
压电型DNA传感器
1. 电化学DNA传感器
(2)检测原理
检测时,将ssDNA探针固定在电极表面,加入
具有电活性的物质作为标识物,浸入含有被测目标 DNA分子的溶液中,通过检测电极在待测溶液中 电化学信号的变化,确定靶基因的序列。 或者将待测基因片段固定在电极表面,然后与
溶液中已标定杂交指示剂的DNA探针进行杂交,
达到识别和测定靶基因的目的。
技术。
具有操作简便快速、成本低、体积小、 易于携带等特点,在分子生物学、疾病诊 断和治疗、新药开发、司法鉴定等领域具 有很大潜力。
压电晶体DNA传感器原理
小结:
25
习题:
1. 请分别设计测定肌酸酐的电流型酶传感器、光纤 酶传感器和电流型微生物传感器(节杆菌中含 有肌酸酐氧化酶)。如何对你设计的传感器的 性能进行评价?
电化学DNA传感器检测原理
(3)应用
电化学DNA传感器在基因分析、医学 分析、环境污染监测等方面都有应用。
●
基因分析
杂交时完全配对 A+B
1个碱基错配 A+C 2个碱基错配 A+D 碱基完全错配 A+E
靶序列与Ss-DNA探针完全配对或错配时的浓度-电流曲线
A: ss-DNA probe [HS(CH2)6-5-d(TAAGGG AAT GGT TAG GAA GGC)-3], B:fully matched oligonucleotide [5-d(GCC TTC CTA ACC ATT CCC TTA)-3], C:single-basemismatchedoligonucleotide [5-d(GCC TTC CTA ACT ATT CCCTTA)-3], D:double-base-mismatched oligonucleotide [5-d(GCC TTC CTA ACT C TT CCC TTA)-3], E: fully mismatched oligonucleotide [5-d(CTT GAT ACG GAT CAG AGT CAT)-3]
●
环境检测
Hg2+的检测
●
医学分析
细菌及病毒感染类疾病的诊断 基因诊断 DNA损伤研究
2. 光纤DNA传感器
以光纤作为转换元件,将杂交过程中产
生的特征光学信号(荧光、发光、颜色变化
等),通过光纤探头传递至光检测器,经光 电转换进而测定出目标基因。
3.压电晶体DNA传感器
压电晶体DNA传感器是新型的基因检测
DNA探针的固定 杂交过程 杂交的指示 信号的检测
设计DNA传感器涉及两个关键技术:
●
有效地将DNA探针固定在固体基质表面的技术 在传感器/液相界面对于靶基因的检测技术
●
4. DNA探针的固定化方法
●
吸附法
●
共价键结合法
自组装膜法
●
Au电极抛光、清洗
用被HS(CH2)6-标记的寡聚核苷酸 探针修饰电极表面
电化学DNA传感器由已知序列的单链DNA 分子与电化学电极组成。
●
电极表面固定的ssDNA探针
●活性标识物
制作电化学DNA传感器的关键是必须引入 电化学活性标识物。
常用的标识物有三种类型:
● ● ●
电化学活性的杂交指示剂 寡聚核苷酸上修饰电化学活性的官能团 标记酶
●
电化学活性的杂交指示剂
应,在电极表面形成带有电活性官能团的杂交
分子,通过测定其电信号可以识别和测定DNA
分子。
在寡聚核苷酸的5-端磷酸基上标记具有
电化学活性的羧酸二茂铁,制成二茂铁寡聚
核苷酸。合成的二茂铁寡聚核苷酸选择性地
与互补单链DNA形成复合物,检测其电流的变
化。该电流信号与复合物的量相关。
●
标记酶
利用酶的化学放大功能,在DNA分子上 标记酶作为识别物,当被酶标记的ssDNA与电 极表面的互补ssDNA发生杂交反应后,相当于 在电极表面修饰了一层酶,酶具有很强的催化 功能,通过测定反应生成物的变化量可以间接 测定DNA。