泛素调节蛋白质降解途径
自噬与泛素化蛋白降解途径的分子机制及其功能
自噬与泛素化蛋白降解途径的分子机制及其功能一、本文概述自噬与泛素化蛋白降解途径是细胞内蛋白质降解的两种主要方式,它们在维持细胞稳态、调控细胞生命周期、促进细胞适应环境变化等方面发挥着至关重要的作用。
本文旨在深入探讨这两种降解途径的分子机制及其功能,以期更全面地理解细胞内蛋白质降解的过程及其生物学意义。
我们将对自噬的分子机制进行详细介绍。
自噬是一种通过形成自噬体,将细胞内受损、变性或多余的蛋白质及细胞器运输至溶酶体进行降解的过程。
我们将从自噬体的形成、自噬底物的识别与选择、自噬体与溶酶体的融合以及降解产物的利用等方面,全面阐述自噬的分子机制。
同时,我们还将讨论自噬在细胞自稳、免疫应答、疾病发生发展等方面的生理功能。
我们将对泛素化蛋白降解途径的分子机制进行阐述。
泛素化是一种蛋白质翻译后修饰方式,通过泛素分子与底物蛋白的共价连接,标记底物蛋白以进行降解。
我们将从泛素化过程、泛素化底物的识别与降解、泛素化在细胞周期调控、信号转导等方面的作用等方面,深入探讨泛素化蛋白降解途径的分子机制。
我们还将讨论泛素化蛋白降解途径在细胞生长、分化、凋亡等过程中的生理功能。
我们将对自噬与泛素化蛋白降解途径的交叉点进行探讨,分析它们在蛋白质降解过程中的相互作用与协同作用,以及它们在维持细胞稳态、调控细胞生命周期等方面的共同功能。
通过对这两种降解途径的深入研究,我们有望为理解细胞内蛋白质降解的复杂过程提供新的视角,并为相关疾病的治疗提供新的思路和方法。
二、自噬途径的分子机制自噬是一种细胞内自我消化的过程,通过降解和回收细胞内受损、变性或多余的蛋白质及细胞器,来维持细胞的稳态和生存。
自噬过程涉及多个分子机制的协同作用,主要包括自噬体的形成、自噬体与溶酶体的融合以及底物的降解等步骤。
自噬体的形成是自噬过程的关键步骤。
在饥饿、压力等自噬诱导信号的作用下,细胞内的自噬相关基因(ATG)被激活,启动自噬体的形成。
ATG基因编码的蛋白质参与自噬体膜的形成和延伸,其中,ATG5和ATG12形成的复合物以及ATG8(也称为LC3)的脂化修饰是自噬体形成的关键事件。
蛋白泛素化修饰
3分钟带您了解蛋白泛素化修饰人体细胞内蛋白质降解主要有两条途径:一种是在溶酶体内(一种具有“消化降解”功能的细胞器)通过ATP(体内直接供能分子)非依赖途径被降解,此途径主要降解外来的蛋白质,对蛋白质的选择性较差。
另一种是在蛋白酶体内,通过ATP依赖途径(需耗能),经过泛素化修饰后被降解。
此途径主要降解细胞内结构异常的蛋白质和短寿的蛋白质。
如果我告诉你真核生物80%~90%蛋白质的降解是由泛素-蛋白酶体降解途径(ubiquitin-pro-teasomepathway, UPP)介导的,而此途径是泛素化修饰蛋白最主要的去向,你是不是很好奇泛素化修饰到底是何方神圣?那小编就言简意赅、简明扼要的给大家介绍一下蛋白泛素化修饰。
泛素(Ub, ubiquitin)是一种普遍存在于真核细胞中的由76氨基酸残基组成的多肽。
一个或多个泛素分子能够在一系列酶的作用下共价连接至蛋白质底物上,形成泛素化修饰(ubiquitination)。
调控蛋白表达水平的重要机制,参与了几乎所有生命过程,是一种至关重要的翻译后修饰。
01在ATP供给能量的情况下,泛素激活酶E1将泛素分子活化。
02泛素激活酶E1将活化的泛素分子传递给泛素结合酶E2。
03泛素连接酶E3将结合E2的泛素连接到靶蛋白上。
图1. 泛素化修饰过程[1]泛素-蛋白酶体途径(UPP)20S催化核心与19S调节复合物结合形成26S蛋白酶体结构。
泛素标记的蛋白质与19S复合物结合,并在蛋白水解β亚基处降解。
19S亚单位与多泛素链结合,ATP展开蛋白质底物并将其转移到20S核心颗粒中。
蛋白质通过20S 中心,在那里被降解成25个氨基酸以下的小寡肽。
介导泛素非依赖性蛋白质降解。
图2. 蛋白酶体结构与蛋白质降解[1]泛素化修饰类型在泛素链中,泛素部分可通过其赖氨酸(Lys11、Lys27、Lys6、Lys29、Lys33、Lys63和Lys48)或N端蛋氨酸残基(Met1)结合。
蛋白质降解途径研究及其生物学功能
蛋白质降解途径研究及其生物学功能蛋白质是细胞中最重要的分子之一,是细胞结构、功能和代谢的基础。
在细胞内部,蛋白质的合成与降解是一个动态平衡的过程,其中蛋白质降解途径对于细胞的正常生理过程起着至关重要的作用。
蛋白质的降解途径主要包括两种:泛素-蛋白酶体途径和自噬途径。
泛素-蛋白酶体是真核细胞中最重要的蛋白质降解途径之一,其主要作用是分解细胞内部的蛋白质废物和异常蛋白质,维持细胞内部蛋白质的稳态。
而自噬是另一种主要的蛋白质降解途径,它主要由溶酶体分解和回收细胞内部蛋白质及其他细胞成分。
泛素-蛋白酶体途径和自噬途径同样重要的一个共同点就是它们的调节网络非常复杂。
泛素-蛋白酶体途径的关键结点是泛素加工酶,而自噬途径的关键结点则是相应的自噬基因ATG。
通过复杂的信号传递与调控网络,泛素-蛋白酶体和自噬途径共同保证了细胞内部蛋白质的处理和稳态维持。
值得注意的是,蛋白质降解途径对于生物学功能的影响也是非常重要的。
例如,泛素-蛋白酶体途径在一些细胞增殖和存活调控中扮演着重要角色。
通过影响蛋白质降解途径,可以有效调控细胞周期、减少蛋白聚集疾病的发生,促进代谢活动及细胞凋亡等生物学功能。
同时,蛋白质降解途径的研究也对疾病诊断和治疗具有重要意义。
泛素-蛋白酶体途径在肿瘤发展和免疫系统的调节中起到了重要作用,而自噬途径的故障又和多种人类疾病有关,如神经退行性疾病、癌症以及炎症等。
对于蛋白质降解途径研究来说,还有一项最基础也最重要的工作就是酶促反应机理的研究以及活性位点和底物选择性的研究。
这些工作的开展通常涉及到一系列生物化学手段,如酶学研究、晶体学解析、荧光探针与荧光共振能量转移技术等。
总之,对于蛋白质降解途径的研究具有广泛的生物学意义和临床实际应用价值。
随着人类对于细胞生物学、疾病发病机理的深入了解,蛋白质降解途径的研究将会进一步加强和深化。
蛋白质的泛素化降解途径.pptx
1980
✓ Ciechanover、Hershko和Rose等人证明:APF-1 与泛素是同一物质。
1983 1987
✓ Ciechanover、Hershko和Rose等人发现3种新酶: 泛素激活酶E1、泛素结合酶E2和泛素连接酶E3, 并提出“多步骤泛素标记假说”。
✓ Goldberg 分 离 出 依 赖 ATP 并 降 解 泛 素 化 底 物 的 26S蛋白水解酶,命名为Proteasome(蛋白酶体)
4 蛋白质的泛素化降解过程
sbustrate Ub
Ub Ub Ub
Ub
Ub Ub Ub Ub
sbustrate Ub
20S
Ub Ub
Ub Ub Ub
Ub Ub Ub Ub
Ub
15
5 总结
➢ 蛋白质的泛素降解途径的发现历程 ➢ 泛素降解途径中的重要物质 ➢ 蛋白质泛素降解的具体过程
6 思考题
如何判断蛋白质是通过溶酶体体系降解还 是通过泛素化途径降解?
1
1 知识回顾
食物蛋白质
胃蛋白酶
多肽/胨
多种蛋白水解酶
氨基酸C端多肽
多种肽酶
氨基酸/短肽
food
2
1 知识回顾
10-20%
膜蛋白 细胞外蛋白
80-90%
异常蛋白
短寿蛋白
内质网相 关蛋白 长周期蛋白
溶酶体途径
氨
基
酸
/
小
泛?素化?途?径
肽
3
2 发现历程 Discovery process
1975
✓ Goldstein从牛胸腺中分离出一种具有标记待降解 靶蛋白作用的多肽 。
16
9
泛素调节蛋白质降解途径
意义
了解了泛素为媒介的蛋白质裂解作用和 过程,使得科学家对细胞如何控制及分裂蛋 白质的研究有可能深入到分子层级。而当蛋 白质裂解作用发生异常时,人体就会产生不 适甚至疾病,如子宫颈癌症和囊肿纤维症等, 因此,从分子层面角度去了解泛素调节的蛋 白质降解的化学过程和机理,及对生命过程 进一步的探索,具有十分重要的应用意义。
第二阶段: 靶蛋白在26 s蛋白酶体的作用下,由泛素介导的蛋白水解过程。 经泛素活化的底物蛋白被展平后,通过两个狭孔,进入26 s蛋白酶体的催化 中心,蛋白降解在20 s蛋白酶体内部发生。进入26 s蛋白酶体的底物蛋白质 被多次切割,最后形成3~22个氨基酸残基的小肽。 整个流程分为以下六个步骤: 1、E1类酶激活泛素,该过程需要ATP(三磷酸腺苷)提供一定能量; 2、泛素转移至E2类酶; 3、E3类酶具有特异性,可以识别出需破坏的目标蛋白质,与目标蛋白质 接近的E2-泛素复合体将泛素转移至目标蛋白质; 4、E3类酶释放出被泛素标记的蛋白质; 5、被标记的蛋白质分子尾端形成一小段泛素分子链; 6、泛素分子链在蛋白酶体的端口被识别并脱离蛋白质,目标蛋白质进入 蛋白酶复合体的桶状通道最终降解为缩氨酸并由另一端口释放出去。
泛素—蛋白酶体途径( upp ) 一系列相关的酶
泛素活化酶(E1)是催化泛素与底物结合所需的第一个酶。 细胞内仅有单一的泛素活化酶基因。利用不同的转录起始点, 它可产生E1a 和E1b两种泛素活化酶,它们的生物功能可能有所 不同。 泛素偶连酶(E2)是泛素与蛋白底物结合所需的第二个酶。 细胞内有多种泛素偶连酶基因,大多数泛素偶连酶有一个14~ 16 KD的核心,含有活性所必需的半胱氨酸残基。在不同的泛素 偶连酶间有约35%的同源性,这一区域可能参与泛素偶连酶和蛋 白底物的结合。 泛素-蛋白连接酶是泛素与底物蛋白结合所需的第三个酶。 泛素-蛋白连接酶在决定泛素介导的底物降解方面有特殊的作 用。不同类型的泛素-蛋白连接酶间缺乏序列同源性,而且分子 量差异较大。
泛素依赖的蛋白质降解途径
泛素依赖的蛋白质降解途径概述泛素依赖的蛋白质降解途径是细胞内一种重要的蛋白质降解机制。
在这个途径中,泛素被连接到待降解的蛋白质上,然后通过泛素连接酶系统和蛋白酶体进行降解。
这一途径在维持细胞内蛋白质稳态、调控细胞周期和应激响应等方面起着重要的作用。
泛素连接酶系统泛素连接酶系统是泛素依赖的蛋白质降解途径的关键组成部分,它包括泛素激活酶(E1)、泛素结合酶(E2)和泛素连接酶(E3)。
泛素激活酶(E1)泛素激活酶是泛素连接酶系统的起始酶,它能够将游离的泛素与ATP结合形成泛素-AMP中间体,然后将泛素转移至泛素结合酶(E2)上。
泛素结合酶(E2)泛素结合酶是泛素连接酶系统中的中间酶,它能够与泛素激活酶(E1)和泛素连接酶(E3)相互作用,将泛素从泛素激活酶转移至泛素连接酶。
泛素连接酶(E3)泛素连接酶是泛素连接酶系统中的最后酶,它能够与泛素结合酶(E2)和待降解的蛋白质相互作用,将泛素连接到待降解的蛋白质上。
泛素连接酶的家族非常庞大,不同的泛素连接酶对不同的蛋白质具有特异性。
泛素化泛素化是将泛素连接到待降解的蛋白质上的过程。
泛素化是一个级联的反应过程,需要泛素激活酶、泛素结合酶和泛素连接酶的协同作用。
泛素连接酶的选择性不同的泛素连接酶对不同的蛋白质具有特异性,这种选择性是通过泛素连接酶与待降解蛋白质的相互作用来实现的。
泛素连接酶通过与待降解蛋白质的结构域或特定的氨基酸残基相互作用,选择性地将泛素连接到蛋白质上。
泛素连接点泛素可以连接到待降解蛋白质的不同位置,形成多种不同类型的泛素连接。
最常见的泛素连接方式是将泛素连接到蛋白质的赖氨酸残基上,形成K48链。
K48链是一个信号标记,会被蛋白酶体认识并降解。
此外,泛素还可以连接到蛋白质的其他氨基酸残基上,形成K63链或单一的泛素连接。
蛋白酶体蛋白酶体是细胞内的一种细胞器,主要负责泛素依赖的蛋白质降解。
蛋白酶体由核心颗粒和相关蛋白组成,核心颗粒是由多个蛋白酶组成的大复合物。
cullinringe3泛素连接酶化介导的降解途径
cullinringe3泛素连接酶化介导的降解途径
Cullin-RING泛素连接酶(CRLs)是细胞内一种重要的蛋白质降解途径,它们通过识别和标记需要降解的蛋白质,将其送往蛋白酶体进行降解。
其中,CRL3是一种较小的CRLs,由Cullin-3、RING手指蛋白和可能的其他调节因子组成。
CRL3的主要功能是介导某些蛋白质的泛素化降解,这些蛋白质
通常与细胞周期、DNA修复和信号转导等过程相关。
当细胞内这些蛋白质的浓度过高或过低时,CRL3能够快速响应并调节它们的水平,
从而维持细胞的稳态。
CRL3的工作机制相对复杂。
首先,它需要识别并结合需要降解
的蛋白质,这通常是通过蛋白质上的特定氨基酸序列实现的。
一旦结合,CRL3会招募一种名为E2的泛素结合酶,该酶将泛素分子转移到目标蛋白质上。
随后,CRL3将标记后的蛋白质送往蛋白酶体进行降解。
在Cullin-RING泛素连接酶的降解途径中,CRL3的作用至关重要。
它不仅能够快速响应细胞内的变化,还能够精确地调节蛋白质的水平,从而维持细胞的正常功能。
未来对CRL3降解途径的研究将有助于更
深入地理解细胞内蛋白质稳态的维持机制,并为相关疾病的治疗提供新的思路。
泛素化降解的名词解释
泛素化降解的名词解释泛素化降解是细胞内一种重要的降解通路,它在维持细胞内蛋白质稳态以及调节许多生物学过程中发挥着关键的作用。
本文将对泛素化降解进行名词解释,并探讨其机制、调节因子以及在相关疾病中的作用。
泛素化降解最初由以色列科学家阿伦·赫希科维茨发现,并因此获得了2014年诺贝尔化学奖。
这一过程通过泛素(ubiquitin)蛋白的共价结合来标记需要降解的蛋白质。
泛素是一种由76个氨基酸组成的小蛋白质,它通过与目标蛋白质形成酯或胺结合的方式发挥作用。
泛素化降解的过程涉及到三个主要步骤:泛素激活、泛素连接和降解。
首先,泛素会与泛素激活酶结合,形成一个泛素-酶复合物。
这个复合物会将泛素激活为泛素腺苷酸二聚体,并将其与泛素结合酶一起转移到目标蛋白质上。
接下来,泛素连接酶会将泛素从泛素激活酶转移至目标蛋白质上,形成泛素链。
泛素链的形成方式决定了目标蛋白质的降解方式。
最后,泛素化目标蛋白质会被送往蛋白骨架复合物,并经过蛋白骨架复合物介导的降解途径被降解。
泛素化降解的调节因子对于其正常运行起着重要的调控作用。
其中,泛素连接酶族(E3酶)是指导具体目标蛋白质与泛素连接的关键因子。
E3酶可分为两大类:一个是对特定目标蛋白质具有高度选择性的E3酶家族,另一个是对多种目标蛋白质起催化作用的RBR(RING-between-RING)超家族。
这些E3酶能识别目标蛋白质的特定结构域,并与之相互作用,导致泛素与目标蛋白质结合。
泛素化降解在许多生物学过程中发挥着重要的作用。
首先,它对于维持细胞内蛋白质稳态至关重要。
蛋白质的合成和降解存在着动态平衡。
泛素化降解通过及时清除运行异常或不再需要的蛋白质,确保细胞内蛋白质的适当水平。
其次,泛素化降解还参与了细胞生命周期的调节、DNA损伤修复、信号通路的调控以及细胞凋亡等许多生物学过程。
除了在正常生理过程中的作用外,泛素化降解还在一些疾病的发生和发展中扮演重要角色。
例如,糖尿病、神经退行性疾病、心血管疾病以及癌症等都与泛素化降解的异常调节有关。
蛋白降解如何测定的原理
蛋白降解如何测定的原理
蛋白质的降解主要通过两大途径实现:溶酶体降解途径和泛素蛋白酶体降解途径。
检测方法原理如下:
1. 溶酶体降解pathway:这是细胞内主要的蛋白质降解途径,可以通过检测溶酶
体酶活性变化来监测蛋白降解程度。
常用的酶活性分析主要有酸性磷酸酶、羧肽酶等。
2. 泛素蛋白酶体降解:该途径要求蛋白质首先被泛素标记。
可以检测被泛素化的蛋白质量变化。
也可以检测表达泛素化酶相关基因和蛋白的变化。
3. 还原性SDS 胶电泳:通过比较蛋白质组分子量变化,检测降解产物的变化。
4. 氨基酸分析:色谱分析细胞内氨基酸组成变化,计算蛋白质氨基酸释放量。
5. Western blot:通过抗体检测特定蛋白表达量的降低,判断蛋白质被降解的程度。
6. 同位素示踪:标记特定蛋白质,追踪标记物在降解过程中的流向变化。
通过上述多种方法可以从不同侧面检测蛋白质的降解情况。
但需要综合运用并重复验证,以保证结果的准确可靠。
泛素—蛋白酶途径降解蛋白质与疾病
泛素结合酶
目前有 50 种泛素结合酶( E2 )被发现, 其中酵母中13 种,哺乳动物中有20 多种,由 此推测E2 的多样性与靶蛋白泛素化特异性有 关; 多数E2为小分子量蛋白,其共性是有14- 16KD 核心区域,核心区域内含有维持其活性 所需的半胱氨酸残基;其主要功能是把泛素连 接到靶蛋白或E3上。
单泛素化
单泛素化是一个由多种酶( E1 、 E2 、 E3 )和ATP 参与的级联反应。与磷酸化相 似,泛素化是一个可逆的过程,通过泛素 化酶和去泛素化酶维持平衡。单泛素化不 能降解靶基因,只是起到调节作用。泛素 化过程如下图所示。
图1 泛素化的过程
多聚泛素化
多聚泛素化,即由数个泛素分子形成的泛素链 C端的甘氨酸与单泛素化底物特异性结合。Ub 与 靶蛋白的共价连接,至少需要4 - 5 个Ub 连接到 靶蛋白上,形成多聚泛素链。
2.1 UPP对p53蛋白的调控
• p53蛋白是细胞内重要的凋亡 调控因子,可通过激活一系列 靶基因实现凋亡调控功能。 MDM2是E3家族成员,促进 p53从核内向细胞质转运,使 之被泛素化后降解,从而发挥 抗凋亡作用。 多种肿瘤细胞中发现UPP活性 上调,p53蛋白降解增加,肿 瘤细胞增殖明显上升。
•
•
2.2 UPP对转录因子NF-κB的 调控
• 细胞转录因子NF-κB可以激活 抗凋亡基因如bcl-2等,发挥 抗凋亡作用 。 正常情况下, NF-κB 活性被 IκB抑制 。 肿瘤细胞中参与IκB 降解的蛋 白酶体活性增加,细胞内NFκB 水平升高,细胞增殖增加。
泛素调节的蛋白质降解
2000年代:发现新的泛素化修饰方式 如多泛素化、去多泛素化等进一步丰 富了泛素调节的蛋白质降解的机制
维持细胞内稳态:泛素调节的蛋白质降解有助于清除异常蛋白维持细胞内环境稳定。
参与信号转导:通过调节特定蛋白质的稳定性泛素调节的蛋白质降解参与多种信号转导过程。
细胞周期调控:泛素调节的蛋白质降解在细胞周期调控中发挥重要作用影响细胞增殖和分化。
疾病发生发展:泛素调节的蛋白质降解异常与多种疾病的发生和发展密切相关如癌症、神经 退行性疾病等。
泛素与泛素化
泛素是一个由76 个氨基酸组成的 小型蛋白
泛素分子包含三 个结构域:N-末 端锌指结构域、 中央α-螺旋结构 域和C-末端环状 结构域
泛素通过其C-末 端环状结构域与 靶蛋白结合形成 多聚泛素链
泛素化:将泛素分子通过酶促反应连接到靶蛋白上 蛋白酶体:泛素化蛋白的降解场所 泛素-蛋白酶体途径:泛素化蛋白在蛋白酶体中被降解的过程 降解过程:泛素化蛋白被26S蛋白酶体识别、降解并回收利用
泛素标记:蛋白质被泛素化标记标记后的蛋白质被运送到自噬小体 自噬小体形成:被标记的蛋白质与自噬小体结合形成自噬泡 自噬泡成熟:自噬泡逐渐成熟与溶酶体融合降解其中的蛋白质 降解产物释放:降解产物通过溶酶体的出泡作用释放到细胞质中供细胞再利用
泛素调节的蛋白质降解异常与代谢性疾病的关系 泛素调节的蛋白质降解在代谢性疾病中的作用 泛素调节的蛋白质降解异常导致代谢性疾病的机制 泛素调节的蛋白质降解异常对代谢性疾病的影响
泛素调节的蛋白质 降解的研究前景与 展望
泛素调节的蛋白质降解机制是细胞内蛋白质稳态的关键过程深入研究有助于揭示生命活 动的本质。
泛素化蛋白质的降解:泛素化蛋白质被蛋 白酶体识别并降解进而影响细胞内蛋白质 的稳定性。
泛素介导的蛋白质降解
此提取物可被分为两个部分,当两部 (6)泛素短链在蛋白酶体开口处被识别,泛素标记物被切除,蛋白质被切割成小片段。
MCL1是维持祖细胞和干细胞多能性的重要基因,并且在泛素化的过程中MCL1对BCL2(与细胞凋亡有关)前体存活也具有重要的意义。 1、《化学教育》2004 年第 11 期《泛素调节的蛋白质降解》 2004 年诺贝尔化学奖简介 李炎武 谭卫兵 邝雪英 张伟
• 一种:溶酶体,不需要能量,无选择性的 降解。主要是降解细胞通过胞吞作用摄取 的外源蛋白质。
• 另一种:需要能量,高效率、指向性很强 的降解过程。比如多数细胞内的蛋白质降 解。这个过程需要泛素调节蛋白质降解, 即泛素—蛋白酶体途径( UPP )介导的蛋白 水解过程
泛素调节的蛋白质降解概述
• 蛋白质的降解是一个精细控制的过程,首先有待 降解的蛋白质被一种多肽(称之为泛素)所标记 (蛋白质的泛素化),接着这些泛素化的蛋白质 进入细胞的蛋白酶复合体的活性位点,蛋白质被 降解成7~9个氨基酸长度的短肽片段后,从蛋白
• 蛋白质与泛素蛋白或泛素样蛋白(UBL)相结合,UBL 这个过程需要泛素调节蛋白质降解,即泛素—蛋白酶体途径( UPP )介导的蛋白水解过程
E1与ATP结合后,催化泛素羧基末端腺嘌呤化,同时释放无机焦磷酸(PPi)。 因此,蛋白酶体本身对蛋白质并没有选择性,具有选择性的是E3酶,它只对待降解的蛋白质进行泛素化标记。
,在细胞外,蛋白质在蛋白酶的催化下水
解释放能量,蛋白质在细胞内被降解却需
要能量,给科学家们造成了很大的困扰。
• 1977年开始Avram Hershko致力于研 究网状细胞提取物。在试图利用色谱 能够调节被修饰蛋白的稳定性、功能活性状态以
泛素化 溶酶体降解
泛素化溶酶体降解
泛素化和溶酶体降解都是细胞中常见的蛋白质降解途径。
泛素化是一种标志蛋白质降解的机制,它通过将蛋白质上的泛素分子与泛素连接酶(E1、E2、E3)一起作用,将泛素标签加入到待降解的蛋白质上,然后将其送入溶酶体进行降解。
溶酶体是一种膜包裹的细胞质器,其中含有大量的水解酶,可对其内部降解的物质进行水解、降解和重构。
每个溶酶体都包含有两种类型的酸性水解酶:水解蛋白酶和内肽酶。
这些水解酶负责将蛋白质分子降解为短肽段,并最终将其降解为氨基酸。
泛素化和溶酶体降解在破坏蛋白质结构和失去其功能方面起着重要作用。
它们参与许多细胞过程,例如代谢、调节、信号转导以及免疫反应。
细胞利用泛素化和溶酶体降解来维持其内部环境的稳定性,并保证各种蛋白质的正常生命周期。
此外,泛素化和溶酶体降解还将会启发一些诱导降解药物研究,这是一种针对特定疾病治疗的新兴方法。
例如,破坏蛋白质的降解是某些类型的癌症的重要机制,因此通过促进泛素化和溶酶体降解过程,可以消除癌细胞,开发出一种更好的治疗方法。
最后,在细胞学和药物研发上,泛素化和溶酶体降解是极其重要的蛋白质结构破坏的途径,研究这些过程将有助于深入了解细胞内部的调控机制,并帮助开发出新的治疗方法与药物。
泛素介导的蛋白质降解
方案1
①纯种有色饱满的玉米和纯种无色皱缩的玉米进 行杂交,获得F1代. ②取 F1 代植株 10 株,与无色皱缩的玉米植株进行 测交.
③收获测交后代种子并统计不同表现型的数量比 例.如四种表现型比例符合 1∶1∶1∶1 ,则符合 自由组合规律.若四种表现型比例不符合 1∶1∶1∶1,则不符合自由组合规律.
1981-1983年,进一步研究发现了三种酶与这
种活动有关。他们将其分别命名为E1、E2和E3。
泛素介导蛋白质降解的发现
E1负责激活泛素分子。泛素分子被激活后就被运送
到E2上,E2负责把泛素分子绑在需要降解的蛋白质上。
但E2并不认识指定的蛋白质,这就需要E3帮助。E3具 有辨认指定蛋白质的功能。当E2携带着泛素分子在E3 的指引下接近指定蛋白质时,E2就把泛素分子绑在指 定蛋白质上。这一过程不断重复,指定蛋白质上就被
控制果蝇眼色的基因位于 x染色体上,已知果蝇 的红眼( W )对白眼( w )是显性,现将一只 红眼雌果蝇和一只白眼雄果蝇交配, F1 代全是 红眼且雌雄各半,如果 F1 雌雄个体随机交配, 则推测F2代卵中具有W和w及精子中具有W和w 的比例是( ) A A. 卵细胞: 精子:W:w=1:1 W:w 3:1 B. 卵细胞: W:w 3:1 精子:W:w 3:1 C. 卵细胞: W:w 1:1 精子:W:w=1:1 D. 卵细胞:W:w 1:1 精子:W:w=3:1
( 2 )上述两对性状的遗传是否符合自由组合定律 ? 为什么? 不符合;因为玉米粒色和粒形的每一对相对性状 的分离比为3∶1,两对性状综合考虑,如果符合 自由组合规律,自交后代分离比应符合 9 ∶ 3∶ 3∶ 1. ___________________________________________
蛋白降解途径
蛋白降解途径蛋白质的降解途径主要有三种,溶酶体途径、泛素化途径和胱天蛋白酶(caspase)途径。
1、溶酶体途径:蛋白质在同酶体的酸性环境中被相应的酶降解,然后通过溶酶体膜的载体蛋白运送至细胞液,补充胞液代谢库。
胞内蛋白:胞液中有些蛋白质的N端含有KFERQ信号,可以被HSC70识别结合,HSC70帮助这些蛋白质进入溶酶体,被蛋白水解酶降解。
胞外蛋白:通过胞吞作用或胞饮作用进入细胞,在溶酶体中降解。
2、泛素-蛋白水解酶途径:一种特异性降解蛋白的重要途径,参与机体多种代谢活动,主要降解细胞周期蛋白Cyclin、纺锤体相关蛋白、细胞表面受体如表皮生长因子受体、转录因子如NF-KB、肿瘤抑制因子如P53、癌基因产物等;应激条件下胞内变性蛋白及异常蛋白也是通过该途径降解。
该通路依赖ATP,有两步构成,即靶蛋白的多聚泛素化?多聚泛素化的蛋白质被26S蛋白水解酶复合体水解。
(1)、物质基础:泛素(ubiquitin):一种76个氨基酸组成的蛋白质,广泛存在于真核生物中,又称遍在蛋白。
在一系列酶的作用下被转移到靶蛋白上,介导靶蛋白的降解。
蛋白水解酶(proteasome):识别、降解泛素化的蛋白质的复合物,由30多种蛋白质及酶组成,其沉降系数为26S,又称26S蛋白酶体,由20S的圆柱状催化颗粒和19S的盖状调节颗粒组成,是一个具有胰凝乳蛋白酶、胰蛋白酶、胱天蛋白酶等活性的多功能酶。
所有蛋白酶体的活性中心都含有Thr残基。
经泛素化的底物蛋白可以被26S蛋白酶体的盖状调节颗粒识别,并被运送到20S的圆柱状核心内,在多种酶的作用下水解为寡肽,最后从蛋白酶体中释放出来。
泛素则在去泛素化酶的作用下与底物解离后回到胞质重新利用。
(2)、具体过程:①靶蛋白的多聚泛素化:泛素激活酶E1利用ATP在泛素分子C端Gly残基与其自身的半胱氨酸的SH间形成高能硫脂键,活化的泛素再被转移到泛素结合酶E2上,在泛素连接酶E3的作用下,泛素分子从E2转移到靶蛋白,与靶蛋白的Lys的ε-NH2形成异肽键,接着下一个泛素分子的C-末端连接到前一个泛素的lys48上,完成多聚泛素化(一般多于4个)②多聚泛素化的蛋白质被26S蛋白水解酶复合体水解:经泛素化的底物蛋白可以被26S蛋白酶体的盖状调节颗粒识别,并被运送到20S的圆柱状核心内,在多种酶的作用下水解为寡肽,最后从蛋白酶体中释放出来。
泛素介导的蛋白质降解通用课件
THANKS.
蛋白质组学分析
利用蛋白质组学技术,对细胞或组织中蛋白质进行大规模分析, 了解泛素化蛋白质的种类和丰度。
相互作用研究
通过免疫共沉淀等方法,研究泛素化蛋白与其他蛋白质的相互作用 ,了解其在细胞内的功能和降解机制。
磷酸化与去磷酸化研究
分析磷酸化与去磷酸化对蛋白质稳定性和泛素化降解的影响,探讨 其在信号转导和细胞周期调控中的作用。
亨廷顿蛋白的降解障碍是重要原因。
癌症
泛素-蛋白酶体系统在癌症发生、发展 中起重要作用,如对细胞周期、细胞 凋亡和DNA修复等关键过程的调节。
抑制泛素-蛋白酶体系统的活性或功能 是癌症治疗的一种策略,已有多种靶 向泛素-蛋白酶体系统的药物进入临床 试验阶段。
肿瘤细胞常通过泛素化修饰来调控关 键蛋白的稳定性,进而影响肿瘤细胞 的增殖、分化和转移。
展望与未来研究方
05
向
深入研究泛素介导的蛋白质降解的机制
泛素化蛋白底物识别机制
研究泛素化蛋白底物的特异性识别过程,以及泛素化修饰对蛋白底物稳定性和功能的影响 。
泛素化酶的调控机制
探讨泛素化酶的活性调节,以及其在不同生理条件下的变化规律,以深入理解泛素化过程 。
泛素-蛋白酶体系统的进化与比较研究
通过比较不同物种中泛素-蛋白酶体系统的结构和功能,揭示其进化规律和适应性。
其他疾病
心血管疾病
泛素-蛋白酶体系统参与心肌肥厚、动脉粥样硬化等心血管疾病的 发生和发展。
糖尿病
泛素-蛋白酶体系统对胰岛素信号通路的调节在糖尿病发病过程中 发挥重要作用。
感染性疾病
一些病毒和细菌利用泛素-蛋白酶体系统来调控宿主的免疫反应和细 胞凋亡过程,影响感染性疾病的发病和病程。
蛋白泛素化的主要作用
蛋白泛素化的主要作用蛋白泛素化是一种重要的后翻译修饰方式,可以调节蛋白质的稳定性、活性和互作效应,对多种生物学过程有关键作用。
下面就从几个不同角度介绍蛋白泛素化的主要作用。
1. 调控蛋白质降解蛋白泛素化对蛋白质降解起到决定性作用。
蛋白质降解是生物细胞中的基本过程,通常通过泛素-蛋白酶体途径或泛素-蛋白酶解体途径实现。
后者主要参与被泛素化的细胞质蛋白质的降解,而前者则参与细胞内质网蛋白的降解。
蛋白质的泛素化可以增强蛋白质与泛素-蛋白酶解体途径和泛素-蛋白酶体途径的相互作用,从而促进蛋白质的降解。
2. 调节信号传导蛋白泛素化对信号传递也有很重要的调节作用。
例如,蛋白质的泛素化可能导致其结构或互作效应发生改变,从而干扰或促进信号转导通路。
蛋白泛素化还可以调节一些细胞生长因子、细胞凋亡调节因子或转录因子的活性,从而参与多种生物学过程的调控。
3. 干扰细胞因子信号通路蛋白泛素化还可以干扰多种细胞因子信号通路和其背后的生物学机制,从而影响细胞的生长和分化。
例如,泛素化因子Wnt信号通路在发育和成年时期发挥重要作用,其中泛素化对Dsh蛋白的调节是一个主要机制。
另外,蛋白的泛素化还可以调节多种细胞因子的受体与下游信号传导蛋白之间的互作关系。
4. 调节DNA修复蛋白泛素化还可以参与细胞DNA修复。
DNA修复的复杂过程涉及DNA参与的多种修复酶和调节因子,其中一些蛋白质被泛素化可以增强其与其它细胞因子的相互作用,从而促进DNA修复过程。
综上所述,蛋白泛素化是一种复杂的后翻译修饰方式,可以影响细胞生物学过程的多个环节。
它对调节蛋白质降解、信号传导、干扰细胞因子信号通路和DNA修复等具有决定性作用。
随着对蛋白泛素化生物学过程的不断解析,我们相信这种后翻译修饰方式的作用会得到更加深入的认识。
泛素化 降解 bim
泛素化降解是一种细胞内蛋白质调控的过程,它涉及到泛素蛋白的附着和去除,以及通过蛋白酶体将目标蛋白质降解为其组成部分的过程。
Bim(Bcl-2 相关的调控因子)是一个蛋白质,它在细胞凋亡(程序性细胞死亡)过程中发挥重要作用。
在泛素化降解中,Bim可以通过泛素蛋白连接到泛素酶,然后被送入蛋白酶体进行降解。
这种泛素化降解对于细胞调控非常重要,因为它可以调节细胞生存和死亡的平衡。
如果Bim被泛素化并降解,可能会减少细胞凋亡,从而有助于细胞的生存。
相反,如果Bim 不被泛素化,可能会导致细胞凋亡增加,这在某些情况下对细胞的生存非常重要,如在免疫细胞中。
总之,泛素化降解可以通过改变目标蛋白质的稳定性来调节其功能,Bim也是其中的一个例子,它在细胞凋亡调控中起到关键作用。
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泛素—蛋白酶体途径( upp ) 一系列相关的酶
泛素活化酶(E1)是催化泛素与底物结合所需的第一个酶。 细胞内仅有单一的泛素活化酶基因。利用不同的转录起始点, 它可产生E1a 和E1b两种泛素活化酶,它们的生物功能可能有所 不同。 泛素偶连酶(E2)是泛素与蛋白底物结合所需的第二个酶。 细胞内有多种泛素偶连酶基因,大多数泛素偶连酶有一个14~ 16 KD的核心,含有活性所必需的半胱氨酸残基。在不同的泛素 偶连酶间有约35%的同源性,这一区域可能参与泛素偶连酶和蛋 白底物的结合。 泛素-蛋白连接酶是泛素与底物蛋白结合所需的第三个酶。 泛素-蛋白连接酶在决定泛素介导的底物降解方面有特殊的作 用。不同类型的泛素-蛋白连接酶间缺乏序列同源性,而且分子 量差异较大。
意义
了解了泛素为媒介的蛋白质裂解作用和 过程,使得科学家对细胞如何控制及分裂蛋 白质的研究有可能深入到分子层级。而当蛋 白质裂解作用发生异常时,人体就会产生不 适甚至疾病,如子宫颈癌症和囊肿纤维症等, 因此,从分子层面角度去了解泛素调节的蛋 白质降解的化学过程和机理,及对生命过程 进一步的探索,具有十分重要的应用意义。
第二阶段: 靶蛋白在26 s蛋白酶体的作用下,由泛素介导的蛋白水解过程。 经泛素活化的底物蛋白被展平后,通过两个狭孔,进入26 s蛋白酶体的催化 中心,蛋白降解在20 s蛋白酶体内部发生。进入26 s蛋白酶体的底物蛋白质 被多次切割,最后形成3~22个氨基酸残基的小肽。 整个流程分为以下六个步骤: 1、E1类酶激活泛素,该过程需要ATP(三磷酸腺苷)提供一定能量; 2、泛素转移至E2类酶; 3、E3类酶具有特异性,可以识别出需破坏的目标蛋白质,与目标蛋白质 接近的E2-泛素复合体将泛素转移至目标蛋白质; 4、E3类酶释放出被泛素标记的蛋白质; 5、被标记的蛋白质分子尾端形成一小段泛素分子链; 6、泛素分子链在蛋白酶体的端口被识别并脱离蛋白质,目标蛋白质进入 蛋白酶复合体的桶状通道最终降解为缩氨酸并由另一端口释放出去。
③泛素可以直接从E2转移给底物蛋白形成Ub蛋白复合物,这时 的底物多是些碱性蛋白(如组蛋白) ,而在大多数情况下,底物蛋 白先与泛素连接酶( ubiquitin ligating enzyme, E3)特异性结合,E3 可使E2和底物蛋白相互接近,继而蛋白底物与E2酶连接的泛素 结合,这样就完成了底物蛋白质的泛素化。
UPP参与的生物学功能
1、抗原提呈:抗原分子泛素化后被26 s蛋白酶 体降解成多肽,然后由组织相容性复合体(MHC) I类分子提呈到细胞表面,再被细胞毒性T细胞 (CTL)识别。 2、调节细胞周期: UPP调节降解调节蛋白,如细 胞周期因子、信号传导蛋白等,在控制细胞周 , 期尤其是生殖细胞方面起重要作用。细胞周 期因子先被泛素化,然后由26 s蛋白酶体降解, 导致周期因子依赖的激酶失活,从而使细胞有 丝分裂期中止。细胞周期因子- 周期因子依赖 的激酶复合体可由它们特定的抑制因子使其 失活,这些抑制因子也由泛素- 蛋白酶体途径降 解。
Байду номын сангаас点表示活性区域,蛋白质降解的场所
泛素化和去泛素化
泛素通过E1和E2被激活的过程称为泛素的活化。 泛素的活化过程是一个依赖ATP的酶促反应:
①首先泛素活化酶( ubiquitin activatingenzyme E1 ) 催化泛 素C 末端的甘氨酸( Gly) 形成Ub-腺苷酸中间产物,然后激 活的泛素C末端被转移至E1酶内Cys残基的-SH键上,形成 高能硫酯键; ②含有高能硫酯键的泛素通过转酰基作用使其进一步转移 到泛素载体蛋白( ubiquitin conjugating enzyme, E2)特异的 Cys残基上,形成E2-Ub巯基酯;E2-Ub巯基酯提供泛素分 子,使泛素C端甘氨酸与底物蛋白的Lys残基的氨基形成共价 键,由第一个泛素单体与底物蛋白内部的Lys残基的ε氨基( 或β氨基)结合;
UPP与疾病
UPP与许多人类疾病有关。与泛素相关的疾 病可分为2种:一种是泛素体系酶的突变导致的功 能丧失或者是目标底物蛋白识别基序的改变,而 导致某种蛋白的稳定。另一种是目标蛋白功能 不正常或加速降解的结果。泛素蛋白酶体途径 是细胞内环境稳定的关键调节因素,细胞的许多 重要蛋白都在此通路的调控之下。 泛素蛋白酶体通路对细胞内信号转导及细 胞生长调控是一个很重要的调节因素,并与许多 生理及病理过程密切相关。
泛素及其调节蛋白质降解途径
学 :聂 红
2004年10月16日瑞典皇家科学院将本年度诺贝尔 化学奖授予以色列科学家阿龙·切哈诺沃、阿夫拉姆·赫 什科和美国科学家欧文·罗斯,以表彰他们在泛素调节 的 蛋 白 质 降 解 研 究 领 域 中 的 卓 越 成 就 。
泛素调节的蛋白质降解概述
蛋白质的降解是一个精细控制的过程,首先有待降 解的蛋白质被一种多肽(称之为泛素)所标记,接着这 些蛋白质进入细胞的蛋白酶复合体中,蛋白酶复合体是 一个上下有盖的圆桶状酵素,它们如同细胞的垃圾桶, 专门负责蛋白质的分解及再循环利用,泛素在这一过程 中释出讯号,让蛋白酶复合体分辨出有待降解的蛋白质。
肿瘤发病机制中的作用
泛素蛋白酶体通路在肿瘤的发病机制中起 重要作用。肿瘤可以起因于癌基因蛋白生长促 进因子的稳定或由于肿瘤抑癌基因的不稳定。 某些常规通过蛋白酶体降解的癌基因蛋白,如果 不能及时地从细胞中清除,就会诱导细胞恶变。
神经系统疾病发病机制中的作用
近年来发现泛素系统也与神经细胞变性有关。如引起 帕金森病的一个重要因子是Parkin,后者是泛素和蛋白的E3 连接酶,能与E2 UbcH7 和UbcH8 共同作用,而Parkin自身也 是经泛素化调节降解,一旦Parkin变性,影响某些蛋白降解, 就会引起多巴胺类神经元的毒性损伤而引起常染色体隐性 少 年 型 帕 金 森 病 ( autosomal recessive juvenile parkinsomism)。
蛋白酶体是催化泛素与底物蛋白偶联体降解的关键酶,包括 20 s蛋白酶体和26 s蛋白酶体。26 s是由20 s和19 s复合体共同结 合装配而成,此组装过程需要耗能。20 s蛋白酶体是主要起催化 作用的复合体,它由14个不同的蛋白组装成一个筒状结构,由内层 2个β环和外层2个α环组成, 每个环含有7个亚基,基本结构可书写 成α7β7β7α7。α亚基主要用于底物识别,β亚基主要参与底物降 解。19 s复合体由17或18个亚基组成,在特定条件下又可分成2个 次级复合物,一个叫盖子( lid) ,一个叫底座( base) 。底座由10个亚 基组成,其中6个有ATP酶活性,它们与底物泛素化有关,盖子由8个 没有ATP酶活性的亚基组成,其中一个亚基Rpn11 /Pda / s13在泛 素循环方面起重要作用。
泛素的结构与组成
泛素含有76个氨基酸残基,广泛存在于真核生物,目前尚 未发现泛素存在于原核生物中,泛素的氨基酸序列极其保 守。泛素基因主要编码两种泛素前体蛋白质:一种是多聚泛 素,另一种是泛素融合蛋白。
泛素—蛋白酶体途径 泛素 蛋白酶体途径( upp )的组成 蛋白酶体途径 的组成
泛素—蛋白酶体途径( upp )由泛素( ubiquitin, ub)以及一 系列相关的酶组成。除泛素以外还包括4 种酶家族:泛素活 化 酶 ( ubiquitin - activating enzyme, E1 ) 、 泛 素 偶 连 酶 ( ubiquitin - conjugating enzymes, E2s)也称泛素载体蛋白 ( ubiquitin -carrier protein) 、泛素-蛋白连接酶( ubiquitin ligating enzymes, E3s)和蛋白酶体(proteasome) 。蛋白的泛素 化和去泛素化都需要多种酶介导, upp既有高度底物多样性 又具有针对不同调控机制的多样性。
1和3:E1、E2催化的泛素激活反应,消耗ATP;2:E3催化的蛋 白质激活反应,消耗ATP;4:依赖于E3的蛋白质泛素化反应; 5:不依赖于E3的蛋白质泛素化反应;6:26S蛋白体催化蛋白 质水解;7和8:异肽酶催化的水解反应,使泛素游离出来。
去泛素化作用是泛素化过程的逆转。在真核细胞内已发现 多种去泛素化酶,它们能够水解泛素和底物蛋白之间的硫酯键, 还能把错误识别的底物从泛素化复合体中释放出来。它们又可 以分为两类:
小 结
泛素-蛋白酶体途径是调节细胞内蛋 白水平与功能的重要机制,涉及许多重要 的生理过程和许多疾病及肿瘤的发病机 制。尽管泛素蛋白酶体途径与人类疾病 机制的关系还有待于进一步的研究,但此 途径为人类克服许多难以治疗的疾病提 供了一个新思路。
26S蛋白酶体的结构
细胞内的废弃物处理装置 ——蛋白酶体
一个细胞大约含30000个细胞废弃物处理装置即蛋白 酶复合体——蛋白酶体,这些桶状结构可以几乎将所有蛋 白质分解为7-9个氨基酸长度的缩氨酸,蛋白酶体的活性 表面在桶状结构的内部。蛋白酶体能辨别出与泛素结合的 蛋白质,一旦作为标签的泛素脱离蛋白质,即可利用三磷 酸腺苷提供的能量改变蛋白质的性质使其从一端进入蛋白 酶复合体内发生降解,并最终以缩氨酸的形式从另一端释 放出来。这一过程如此复杂,需要消耗能量。然而蛋白酶 体并不能选择待降解的蛋白质,细胞内主要是通过E3类酶 的特异性选择并利用泛素加以标签,从而选择正确的待降 解蛋白质。
(1)泛素羧端水解酶( ubiquitin C - terminal hydrolases (UCHs) ):分子 量为20~30 KD,水解去除和泛素C末端连接的小肽,也参与泛素多聚体 产生泛素单体的过程,促进泛素再循环,对泛素系统的正常运行是很有 必要的。 (2)泛素特异性加工酶( ubiquitin - spicific prote2ases - UBPs/USPs): 分子量大约为100 KD,参与去除和解聚底物蛋白质上的多聚泛素键,从 而防止多聚泛素在底物蛋白的聚集。
泛素—蛋白酶体途径( upp ) 介导的蛋白水解过程
由泛素介导的蛋白水解过程,分为2个阶段。第一阶段: 多个泛素分子与靶蛋白共价结合。首先,泛素经泛素活化 酶E1 活化,泛素上76位的Gly与泛素活化酶上特殊的Cys残 基形成一个高能硫酯键,并伴有ATP水解; 然后,通过转酯作 用,泛素从泛素活化酶转移到泛素结合酶E2 的Cys上,形成泛 素结合酶- 泛素;最后,在泛素连接酶E3 参与下,泛素又从泛 素结合酶转移到受体蛋白(靶蛋白)的Lys残基上,形成泛素靶蛋白,使靶蛋白发生泛素化。多个遍泛素分子重复地附 加到靶蛋白上,则形成分枝的多Ub链。泛素共有7个Lys残基 ,在多聚泛素链结构中,其中一个泛素的C - 末端Gly与相邻的 泛素之间通过Lys48、Lys63或Lys29连接。