数量性状遗传参数估测
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第三节 重复力
• 重复力的概念 • 遗传参数（Genetic Paramenters）是反映数量
性状遗传规律的参考常数。主要有重复力、 遗传力和遗传相关。
• 重复力（Repeatability）是数量性状多次度 量值之间的重复程度。从统计学来看，是性 状各次度量值间
的组内相关系数（Intraclass correlation coefficient）。其取值在0~1之间。
• • •
rPi P =
COVPiP Pi P
= 2Pi = Pi = Pi P P
Vpi = VP（n）
1-（n-1）ri n
• • •
rPjP =
1-（n-1）rj n
Q = rPi P rPjP
= 1-（n-1）ri 1-（n-1）rj
•
Q..>1时,用 第I次度量值估测准确。
•
Q<1 时，用第j次度量值估测准确
• •
AX
=
(
Pi
-
P
) 1+（n-1）re
+
P
重复力的用途
• 5 根据早期的记录估测后期的产量 重复力的大小反映不同度量值间的重复程度，对于重复力高的性 状，早期产量高的个体，其后期的产量也高，早期产量低，后期 产量也低。
• 根据不同次记录与所有记录平均数的相关系数，确定用那一次记
录来估测后期产量最可靠。
• 3 已实现的遗传力（realized heritability）子代选择
•
反应占亲代选择差的比例。
遗传力的表达方式
• 1遗传力是育种值对表型值的决定系数。 h2 = dPA = A2 / P 2 • 2 表型各组分间无相关时，遗传力是育种值对表型值的回归系数。
• A = h2 P
即 h2 = bAP
h2 = VA/ VP
• re > H2 > h2 重复力是遗传力的上限。
• 4. 综合评定畜禽育种值
• •
h2(n) =
VA VP(n)
=
n 1+（n-1）re·
VA VP
=
n h2 1+（n-1）re
• 根据n 次度量记录,评定个体育种值:
•
AX= ( Pi - P )h2(n) + P
n h2
• 个体没有测定记录, 群体的平均表型值就是个体生产性能的最
•
佳估值。
•
•
当n 很大时， n re / 〔1+（n-1） re〕≈ 1
PX = P(n) 多次记录的平均数就是个体的 可能生产力 。
重复力的用途
• 3. 判断遗传力估计是否正确
• re = （VG+VEg）/ VP
H2 = VG/ VP
第四节 遗传力
• 遗传力的概念：
• 1 广义遗传力（heritability in the broad sense）数量性 状基因型方差占表型方差的比率。H2=VG/VP。
• 2 狭义遗传力（ heritability in the narrow sense）数量性
•
状育种值方差占表型方差的比率。h2=VA/VP。
∵ ∑SPAR = 0
• h2 = 2A/ 2P=SSA/ SSP =（SSA+SPAR）/ SSP = SPAP / SSP = bAP
• 3 遗传力是育种值与表型值的相关系数的平方，是用表型值估计
育种值准确性的度量。
• • •
rAP = COVAP/ AP =
SPAP SSP
P ·
A
=
bAP
P ·=
A
h2
·
1 h
=
h
•
•
h2 = r2AP
遗传力的估计原理
• 只有通过亲属关系才能估计遗传力. rA
• 亲属间没有环境相关,
R1 A1 A2 R2
• SSB =n∑k（Xj-X）2
SSW
k
=∑
∑n（Xji-Xj）2
i = n j= k
•
dfB = K-1 dfW = K（n-1） K是个体数 n 是度量次数
•
SSP =∑kn（Xji-X）2
dfP = nK-1
•
当个体间度量次数不等时，用加权平均数
• •
度量n0
n0 =
源自文库
1（ k-1
∑nj-
∑n2j ） ∑nj
重复力的用途
• 1 确定性状度量次数
• 每次度量值中VG+VEg不变，只有VES改变，度量次数越多，VES越
小。
VP（n）=VG+VEg+VE s/ n
• ∵ VP=VG+VEg+VE s
re=（ VG+VEg）/ VP
• ∴ VP= re VP +VE s
VE s = （1-re ）VP
•
VP（n）= re VP + （1-re ）VP/ n = VP〔1+（n-1） re〕/ n
重复力概念
• 某一性状在多个家畜中进行多次度量，同一个 体多次 度量值间 的差异称为个体内（组内） 方差 （inter-individual variance），
• 不同个体间多次度量值的差 异称为个体间（组
间）方差（intra- individual variance）。
•
VP= 2B+ 2W
•
环境方差的剖分
• 一般环境方差（General environmental variance）:
• 在时间上持久 或空间上非局部的条件所造成的环境方 差，是个体间方差的 一部分。
•
VE = VEg+ VEs
2B = VG+ Veg
• 特殊环境方差（Special environmental variance）
• re（n） = （VG+VEg ）/ VP（n）= (VG+VEg )/ VP〔1+（n-1） re〕/ n
• •re •
•∴ •
= n re / 〔1+（n-1） re〕
PX
n re =
（
1+（n-1）re
P(n)-
P ）+
P
• 当n =0 时 n re / 〔1+（n-1） re〕= 0 PX = P
•
是暂时的或局部的条件造成的环境方差，
•
是个体内方差。 2W = VEs
重复力估测
• •
re =
VG+VEg VP
= VG+VEg
=
2B
VG+VEg+Ves
2B+ 2W
• = MSB-MSW
（ MSB估计的是 2W+n2B）
•
MSB+（n-1）MSW
（ MSW估计的是 2W）
• MSB=SSB/dfB MSW =SSB/dfW SSP=SSB+SSW dfP=dfB+dfW
• n 次度量的方差与一次度量方差之比为：
•
VP（n） / VP = 〔1+（n-1） re〕/ n
•
增加度量的精确性，就需降低度量的方差，对于高重复力，
•
需 度量次数少；低重复力，需要度量多次
•
度量，才能降低度量 方差。
重复力的用途
• 2 估计个体的可能生产力：
•
PX = re（n）（P(n) - P ） + P
• 重复力的概念 • 遗传参数（Genetic Paramenters）是反映数量
性状遗传规律的参考常数。主要有重复力、 遗传力和遗传相关。
• 重复力（Repeatability）是数量性状多次度 量值之间的重复程度。从统计学来看，是性 状各次度量值间
的组内相关系数（Intraclass correlation coefficient）。其取值在0~1之间。
• • •
rPi P =
COVPiP Pi P
= 2Pi = Pi = Pi P P
Vpi = VP（n）
1-（n-1）ri n
• • •
rPjP =
1-（n-1）rj n
Q = rPi P rPjP
= 1-（n-1）ri 1-（n-1）rj
•
Q..>1时,用 第I次度量值估测准确。
•
Q<1 时，用第j次度量值估测准确
• •
AX
=
(
Pi
-
P
) 1+（n-1）re
+
P
重复力的用途
• 5 根据早期的记录估测后期的产量 重复力的大小反映不同度量值间的重复程度，对于重复力高的性 状，早期产量高的个体，其后期的产量也高，早期产量低，后期 产量也低。
• 根据不同次记录与所有记录平均数的相关系数，确定用那一次记
录来估测后期产量最可靠。
• 3 已实现的遗传力（realized heritability）子代选择
•
反应占亲代选择差的比例。
遗传力的表达方式
• 1遗传力是育种值对表型值的决定系数。 h2 = dPA = A2 / P 2 • 2 表型各组分间无相关时，遗传力是育种值对表型值的回归系数。
• A = h2 P
即 h2 = bAP
h2 = VA/ VP
• re > H2 > h2 重复力是遗传力的上限。
• 4. 综合评定畜禽育种值
• •
h2(n) =
VA VP(n)
=
n 1+（n-1）re·
VA VP
=
n h2 1+（n-1）re
• 根据n 次度量记录,评定个体育种值:
•
AX= ( Pi - P )h2(n) + P
n h2
• 个体没有测定记录, 群体的平均表型值就是个体生产性能的最
•
佳估值。
•
•
当n 很大时， n re / 〔1+（n-1） re〕≈ 1
PX = P(n) 多次记录的平均数就是个体的 可能生产力 。
重复力的用途
• 3. 判断遗传力估计是否正确
• re = （VG+VEg）/ VP
H2 = VG/ VP
第四节 遗传力
• 遗传力的概念：
• 1 广义遗传力（heritability in the broad sense）数量性 状基因型方差占表型方差的比率。H2=VG/VP。
• 2 狭义遗传力（ heritability in the narrow sense）数量性
•
状育种值方差占表型方差的比率。h2=VA/VP。
∵ ∑SPAR = 0
• h2 = 2A/ 2P=SSA/ SSP =（SSA+SPAR）/ SSP = SPAP / SSP = bAP
• 3 遗传力是育种值与表型值的相关系数的平方，是用表型值估计
育种值准确性的度量。
• • •
rAP = COVAP/ AP =
SPAP SSP
P ·
A
=
bAP
P ·=
A
h2
·
1 h
=
h
•
•
h2 = r2AP
遗传力的估计原理
• 只有通过亲属关系才能估计遗传力. rA
• 亲属间没有环境相关,
R1 A1 A2 R2
• SSB =n∑k（Xj-X）2
SSW
k
=∑
∑n（Xji-Xj）2
i = n j= k
•
dfB = K-1 dfW = K（n-1） K是个体数 n 是度量次数
•
SSP =∑kn（Xji-X）2
dfP = nK-1
•
当个体间度量次数不等时，用加权平均数
• •
度量n0
n0 =
源自文库
1（ k-1
∑nj-
∑n2j ） ∑nj
重复力的用途
• 1 确定性状度量次数
• 每次度量值中VG+VEg不变，只有VES改变，度量次数越多，VES越
小。
VP（n）=VG+VEg+VE s/ n
• ∵ VP=VG+VEg+VE s
re=（ VG+VEg）/ VP
• ∴ VP= re VP +VE s
VE s = （1-re ）VP
•
VP（n）= re VP + （1-re ）VP/ n = VP〔1+（n-1） re〕/ n
重复力概念
• 某一性状在多个家畜中进行多次度量，同一个 体多次 度量值间 的差异称为个体内（组内） 方差 （inter-individual variance），
• 不同个体间多次度量值的差 异称为个体间（组
间）方差（intra- individual variance）。
•
VP= 2B+ 2W
•
环境方差的剖分
• 一般环境方差（General environmental variance）:
• 在时间上持久 或空间上非局部的条件所造成的环境方 差，是个体间方差的 一部分。
•
VE = VEg+ VEs
2B = VG+ Veg
• 特殊环境方差（Special environmental variance）
• re（n） = （VG+VEg ）/ VP（n）= (VG+VEg )/ VP〔1+（n-1） re〕/ n
• •re •
•∴ •
= n re / 〔1+（n-1） re〕
PX
n re =
（
1+（n-1）re
P(n)-
P ）+
P
• 当n =0 时 n re / 〔1+（n-1） re〕= 0 PX = P
•
是暂时的或局部的条件造成的环境方差，
•
是个体内方差。 2W = VEs
重复力估测
• •
re =
VG+VEg VP
= VG+VEg
=
2B
VG+VEg+Ves
2B+ 2W
• = MSB-MSW
（ MSB估计的是 2W+n2B）
•
MSB+（n-1）MSW
（ MSW估计的是 2W）
• MSB=SSB/dfB MSW =SSB/dfW SSP=SSB+SSW dfP=dfB+dfW
• n 次度量的方差与一次度量方差之比为：
•
VP（n） / VP = 〔1+（n-1） re〕/ n
•
增加度量的精确性，就需降低度量的方差，对于高重复力，
•
需 度量次数少；低重复力，需要度量多次
•
度量，才能降低度量 方差。
重复力的用途
• 2 估计个体的可能生产力：
•
PX = re（n）（P(n) - P ） + P