第九章 酶促反应动力学

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c.Km值表示酶与底物之间的亲和程度:Km值大表示亲 和程度小,酶的催化活性低; Km值小表示亲和程度大,
酶的催化活性高。 (同一种酶有几种底物就有几个Km值,其中Km值最小
的底物一般称为该酶的最适底物或天然底物) 2006-1-7一大般小情,况1下/K,m愈1/大Km,可表以明上近海亲大似学和生地命力表科愈学示学大院酶。对底物的亲和力
★乒乓机制的动力学曲线是两组平行直线 ★表观米氏常数KmA′(KmB′)随[B]( [A])浓度的增 大而增大 ★表观最大反应速度Vmax′随[B]([A])的增大而增大
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(2)序列机制的底物动力学方程
V KmA[B]
Vmax[ A][ B] KmB[ A] [ A][B]
合米氏方程,为Km 。
f.Km和米氏方程的实际应用
若已知某个酶的Km值,可以计算在某一个底物浓度 时,反应速度相当于最大反应速度的百分率。 g.Km可以帮助推断某一反应的方向和途径
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(2)Vmax和k3(kcat)的意义 在一定的酶浓度下,Vmax是一个常数,它只与底物的 种类及反应条件有关。
Rate of Reaction(v)
100 1903年,Henri用蔗 糖酶水解蔗糖的实验
80
60
40
20
0 0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 Concentration of Substrate(umol/L)
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酶与底物的中间络合物学说(Henri和Wurtz)
v~v/[S]作图法 v = Vmax - Km·[—Sv]—
v
Vmax
-Km
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v
[S]
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(3) Hanes-Woolf 作图法

1 Km
1
1
— = —— . — + ——
两边均乘以[S]:
v
Vmax [S] Vmax
—[S—] =—[S—] +—Km—
[S]
v
Vmax Vmax
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(一)抑制程度的两种表示方法
1、相对活力
★相对活力分数 (残余活力)
★相对活力百分数*100%
2、抑制率
a Vi V0
★抑制分数 (被抑制活力) ★抑制百分数
i 1 a 1 Vi V0 Vi
V0
V0
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(二)抑制作用的类型
经整理得: ES
Et S Km S
(1)
由于酶促反应速度由[ES]决定,即 v k2 ES
,所以 ES v (2)
k2
将(2)代入(1)得:
v k2
Et S Km S
v
k2Et S Km S
(3)
当[Et]=[ES]时, v Vm
将(4)代入(3),则:
所以 Vm k2 Et
1、不可逆的抑制作用
2.双底物反应的动力学方程
(1)乒乓机制的动力学方程
V
K
A m
[B]
Vmax [ A] [B] KmB [ A]
[ A] [B]
1 KmA 1 V Vmax [ A]
KmB 1 1
Vmax [B]
Vm a x
KmA: [B]达到饱和浓度时A的米氏常数 KmA′: A的表观米氏常数 Vmax:[A][B]都达到饱和浓度时的最大反应速度
基本原则:将米氏方程变化成相当于y=ax+b的直线方 程,再用作图法求出Km。
(1) Lineweaver-Burk 双倒数作图法
米氏方程的双倒数形式:
1 Km
1
1
— = —— . — + ——
v
Vmax [S] Vmax
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(2) Eadie-Hofstee 作图法
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三、酶的抑制作用
变性作用(denaturation): 抑制作用(inhibiton):使酶活力下降或丧失但并不引起 酶蛋白变性
变性剂没有选择性 抑制剂有不同程度的选择性
研究抑制剂对酶的作用有重大的意义: (1)药物作用机理和抑制剂型药物的设计与开发 (2)了解生物体的代谢途径,进行人为调控或代谢控制 发酵 (3)通过抑制剂试验研究酶活性中心的构象及其化学功 能基团,不仅可以设计药物,而且也是酶工程和化学修 饰酶、酶工业的基础
[ES]生成速度:v1 k1Et ES S ,[ES]分解速度: v2 k2ES k3ES

当酶反应体系处于恒态时: v1 v2
氏 方 程 的 推 导
即: k1Et ES S k2ES k3ES
Et
S ES ES
S
k2
k1
k3
令: k2 k3 Km k1
则:KmES ESS Et S
KsAKmB
1 KmA 1 KmB 1
1
K s
A
KmB
1
V
Vmax [ A]
Vmax [B]
Vm a x
Vmax [ A] [B]
★序列机制的动力学曲线是两组相交直线(交于X轴负侧) ★交点在X轴:表观KmA′(KmB′)不随[[B]([A])浓度变化 而变化( KmA′= KmA 、 KmB′= KmB) ★交点在X轴上:表观KmA′(KmB′)随[[B]([A])浓度的增 加而减小 ★交点在X轴下:表观KmA′(KmB′)随[[B]([A])浓度的增 加而增大 ★表观最大反应速度Vmax′随[B]([A])的增大而增大
S+E ES P+E
中间产物假说证据: (1)ES复合物已被电子显微镜和X射线晶体结构分析直 接观察到。 (2)酶和底物的光谱特性在形成ES后发生变化。 (3)酶的物理性质经常在形成ES后发生变化。 (4)已分离得到ES复合物。 (5)平衡透析时,底物浓度在半透膜内外不等。
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(二)酶促反应的动力学方程式
E1.米S氏 方 程式k1 的推导ES k3 k2
米氏方程:
v
Vm ax S Km S
PE
米氏常数:
Km
k2 k3 k1
推导原则:从酶被底物饱和的现象出发,按照
“稳态平衡”假说的设想进行推导。
S E
S Et ES
k1 k2
ES k3 P E
ES
★在缺少A时,B不能与E结合
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A
B
P
Q
E → AE → AEB → QEP → QE → E
A
B
AE
AEB
E
QE
Q
QEP
P
A与其产物Q相互竞争地结合E,但A和B互不竟争 反应的总方向决定于A、Q的浓度和反应的平衡常数
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NAD+ 与NADH相互竞争E上的NAD+结合部位
第九章 酶促反应动力学
一、化学动力学基础 二、底物浓度对酶反应速率的影响 三、酶的抑制作用 四、温度对酶反应速度的影响 五、pH对酶反应的影响 六、激活剂对酶反应的影响
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一、化学动力学基础
化学反应的两个基本问题:(1)反应进行的方向、可 能性和限度;(2)反应进行的速率和反应机制。
当[S]很大时,Vmax=K3 [E]
K3代表酶被底物饱和时每秒钟每个酶分子转换底物的分 子数,称为转换数(或催化常数,Kcat), 表明酶的最 大催化效率。
转换数的倒数即为催化周期:一个酶分子每催化一个底 物分子所需的时间。 乳糖脱氢酶转换数为1000/秒,则它的催化周期为10-3 秒
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种反应就称为一级反应。 速率常数与半衰期成反比,半衰期与反应物的初浓度无
关。 2. 二级反应 凡是反应速率与反应物浓度二次方(或两种物质浓度的
乘积)成正比的,这种反应就称为二级反应。 半衰期与初浓度成反比。 3. 零级反应 凡是反应速率与反应物浓度无关而受它种因素影响而改
变的反应。 半衰期与初始浓度成正比。
Kcat k3 k1 Km k2 k3
k1
Kcat/Km的上限是K1,即生成ES复合物的速度(酶促反应的速 度不会超过ES的形成速度K1,在水相中不会超过108~109)
只有Kcat/Km可以客观地比较不同的酶或同一种酶催 化不同底物的催化效率
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3.利用作图法测定Km和Vmax值
Log[S]
(三)多底物的酶促反应
1.多底物酶促反应按动力学机制分类
(1)序列反应 ①有序反应
E+A+B→AEB→PEQ→E+P+Q 只有Leading substrate (领先底物A)首先与酶结合,然 后 B 才 能 与 酶 结 合 , 形 成 的 三 元 复 合 物 EAB ( ternar y complex)转变为EPQ,B 的产物P先释放,A的产物Q 后释放。
所以1/Km表示形成ES的趋势大小
特例: Km=K2/K1=Ks(在K3K1,K2时)
d. Km与Ks Km不等于Ks。在K3<<K1、K2时, Km看作Ks, 也只有此时1/Km 才可以近似表示酶与底物结合的难易程
度。
e. Km与Km 无抑制剂时,ES的分解速度与形成速度的比
值符合米氏方程,为Km; 而有抑制剂时发生变化,则不符
定酶活力
V V max[S] V max Km [S] 2
Km的物理意义
2.动力学参数的意义
(1)米氏常数的意义
a.不同的酶具有不同Km值,它是酶的一个重要的特征物
理常数,只与酶的性质有关,而与其浓度无关。
b.Km值只是在固定的底物,一定的温度和pH条件下,
一定的缓冲体系中测定的,不同条件下具有不同的 Km值。
反应机制,即反应过程中各个单元反应是如何进行的。
2. 反应级数:根据实验结果,整个化学反应的速率服从 哪种分子反应速率方程式,则这个反应即为几级反应。 一级反应,二级反应,……,零级反应。
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(三)各级反应的特征
1. 一级反应 凡是反应速率只与反应物的浓度的一次方成正比的,这
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衡量酶催化效率的参数:即其大
(3)
Kcat/Km
的意义
小可以比较不同酶或同一种酶催 化不同底物的催化效率
在生理条件下, [S]/Km=0.01~1.0
v V max [S] Kcat [E] [S] Km [S] Km [S]
[S]<<Km 时:v Kcat [E] [S] Km
(一)反应速率及其测定
反应速率是以单位时间内反应物或生成物浓度的改变来 表示。用瞬时速率表示反应速率:
v =dc/dt 反应速率的测定实际上就是测定不同时间的反应物或生 成物的浓度。
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(二)反应分子数和反应级数
1. 反应分子数:在反应中真正相互作用的分子的数目。 单分子反应,双分子反应,…… 判断一个反应是单分子反应还是双分子反应,应先了解
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二、底物浓度对酶反应速率的影响
(一)中间络合物学说
在低底物浓度时, 反应速度与 底物浓度成正比,表现为一级 反应特征。 随着底物浓度的增加, 反应速 度不再按正比升高,反应表现 为混合级反应。 当底物浓度达到一定值,反应 速度达到最大值(Vmax),此 时再增加底物浓度,反应速度 不再增加,表现为零级反应。
(4)
v
Vm ax S Km S
当[S] <<Km时
V V max[S ] V max[S ] K’[S ]
Km [S ]
Km
酶反应速度与底物 浓度的关系曲线
当[S]>>Km时 当[S]=Km时
V V max[S ] V max[S ] V max 本条件可准确测
Km [S ] [S ]
v
1
以 [S]~[S]作图
v
-Km
Vmax
[S]
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(4)Eisenthal 作图法
(5)Hill 作图法
V Log
Vmax V
n Log[S] LogKm
Y
Log 1Y
n
Log[S] LogKm
(寡聚酶)
Log Y (Log V )
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
1Y
Vmax V
-LogKm
②随机反应
底物A、B与酶结合的顺序是随机的,形成的三元复合 物AEB → QEP,产物P、Q的释放顺序也是随机的。 限速步骤是AEB → QEP A与Q相互竞争E上的底物结合部位A,B 与P相互竞争E上 的底物结合部位B 反应的总方向决定于A、B、Q、P的浓度和反应的平衡常 数
(2)乒乓反应
底物A先与E结合成AE二元复合物,AE → PF(修饰酶形 式 ) , 释 放 第 一 个 产 物 P , 接 着 底 物 B 与 F 形 成 FB , FB →EQ,释放第二个产物Q。 A与Q 竞争自由酶形式E ,B与P竞争修饰酶形式F。 整个反应历程中只有二元复合物形式,没有三元复合物形 式。
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