基因工程简答题总结
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基因工程原理复习题思考题
5、简单叙述同尾酶和同裂酶的差别。
同尾酶:来源不同,识别的序列不同,但能切出相同的粘性末端,连接后不能被相关的酶同
时切割。
同裂酶:识别序列相同,切割位点有些相同,有些不同。分完全同裂酶和不完全同裂酶
(PS:完全同裂酶:识别位点和切点完全相同。
不完全同裂酶:识别位点相同,但切点不同。)
6、连接酶主要有哪些类型?有何异同点?影响连接酶连接效果的因素主要有哪些?类型:DNA连接酶和RNA连接酶
异同点:
相同点:都能以DNA为模板,从5'向3'进行核苷酸或脱氧核苷酸的聚合反应。
不同点:DNA聚合酶识别脱氧核糖核苷酸,在DNA复制中起作用;而RNA聚合酶聚合的是核
糖核苷酸,在转录中起作用。
7、试分析提高平端DNA连接效率的可能方法。(传说中的网上答案)
1、低温下长时间的连接效率比室温下短时间连接的好。
2、在体系中加一点切载体的酶,只要连接后原来的酶切位点消失。这样可避免载体自连,应该可以大大提高平端连接的效率。
3、足够多的载体和插入片段是最重要的。
4、平端的连接对于离子浓度很敏感
5、尽可能缩小连接反应的体积
6、建议放在四度冰箱连接两天效率更高比14度好
8、基因工程中常用的DNA聚合酶主要有哪些?
1) 大肠杆菌DNA聚合酶
2) Klenow fragment
3) T7 DNA聚合酶
4) T4 DNA聚合酶
5) 修饰过的T7 DNA聚合酶
6) 逆转录酶
7) Taq DNA聚合酶
第四章基因克隆的载体系统
1、作为基因工程载体,其应具备哪些条件?
具有针对受体细胞的亲缘性或亲和性(可转移性) ;
具有合适的筛选标记;
具有较高的外源DNA的载装能力;
具有多克隆位点(MCS ;具有与特定受体细胞相适应的复制位点或整合位点。
3、载体的类型主要有哪些?在基因工程操作中如何选择载体?
基因工程中常用的载体(vector)主要包括质粒(plasmid)、噬菌体(phage)和病毒(virus) 一大类。这些载体均需经人工构建,除去致病基因,并赋予一些新的功能,如有利于进行筛选
的标志基因、单一的限制酶切点等。
4、质粒转化原理,影响转化率的因素有哪些?
A化学法(CaCI2法)转化原理:是Ca2+与细菌外膜磷脂在低温下形成液晶结构,后者经热脉冲发生收缩作用,使细胞膜出现空隙,质粒或DNA重组分子便可进入细胞内(感受态细胞)。
B 电穿孔转化转化原理:将待转化的质粒或DNA重组连接液加在电穿孔转化仪的样品池
中,两极施加高压电场,在强大电场的作用下,细菌细胞壁和细胞膜产生缝隙,质粒或DNA 重组分子便可进入细胞内。
影响转化率的主要影响因素:
1)载体本身的性质及其空间构象:超螺旋构象转化率最高;
2)插入片段的大小:插入片段越大,转化效率越低;
3)受体细胞的类型及预处理;
4)转化方法:电击法高于化学法。
5、重组体分子的选择方法主要有哪些?并简单阐述其原理。
从总体上看,重组体分子的选择与鉴定方法基本上可以分为如下几个类型:
(1)基于载体遗传标记检测法
在构建基因工程载体系统时,载体DNA分子上通常携带了一定的选择性遗传标记基因,转化或转染宿主细胞后可以使后者呈现出特殊的表型或遗传学特性,据此可进行转化子或重组子
的初步筛选。
(2 )基于克隆DNA序列检测法
Southern印迹杂交:根据毛细管作用的原理,使在电泳凝胶中分离的DNA片段转移并结合
在适当的滤膜上,然后通过与已标记的单链DNA探针的杂交作用以检测这些被转移的DNA 片段。
(3)基于外源基因产物检测法
如果目的基因产物能降解某些药物使菌株呈现出抗性标记,或者基因产物与某些药物作用是
显颜色反应,则可根据抗性或颜色直接筛选含目的基因的克隆子。
第五章基因的克隆一般方法
1、基因的克隆方法主要有哪些?并阐述其克隆原理(至少3种,都是书上找的,自选哈,
建议必选DD RT-PCR和SSH原因请看下题)?
1)差减杂交(SH
通过DNA复性动力学原理富集目的基因序列,并以此构建减数文库的方式来进行目的基因分
离克隆的。
2)抑制性差减杂交(SSH
SSH的核心技术是抑制性PCR它是一种将检测子cDNA单链标准化步骤和消减杂交步骤结合为一体的技术。其中标准化步骤均等了检测子中的cDNA单链丰度,而消减杂交步骤去除了
检测子和驱赶子之间的共同序列,使检测子和驱赶子之间不同的序列得到扩增。
3)差异显示PCR( DD RT-PCR
利用真核生物mRNA吉尾处有POLY( A)结构,在其3'端设计象5'-T11GA样引物,该引物可与mRNA、数的十二分之一结合,从而使这部分基因得到逆转录,同时结合5'端的随机引物(20条10-mer),可以使不同长度的基因得到扩增。
4)DNA代表性差异分析(DNA RDA
代表性差别分析是通过突变型(驱赶DNA driver DNA与野生型(检测DNA tester DNA
基因组之间的差异来分离和鉴定突变基因的方法。
5)扩增限制性片段长度多样性(AFLP
基因组DNA经过限制性内切酶消化后,产生粘性末端。使用人工合成的短的双链接头,该接
头一端具有同样的内切酶识别粘性末端,互补连接后成为DNA莫板。接头和与接头相邻的酶
切片断的几个碱基序列作为引物的结合位点。
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2、简单阐述差异显示PCR克隆基因的原理及其优缺点,有何应用?
主要原理:利用真核生物mRNA吉尾处有POLYYA)结构,在其3'端设计象5'-T11GA样引物, 该引物可与mRNA总数的十二分之一结合,从而使这部分基因得到逆转录,同时结合5'端的
随机引物(20条10-mer),可以使不同长度的基因得到扩增。
优点:
简便、灵敏、高效、省时,能快速显示mRNA勺组成。
所需的mRNA量少。
各样本mRNA勺差异可同时进行比较。
扩出的cDNA可直接用于测序、文库筛选等。
缺点:
假阳性条带多,对低丰度的基因表达不容易检测。
工作量大。
无法定量研究。
扩出的条带往往是3'端比较短的UTR区的一段序列,提供的信息较少。
利用该技术,目前已有越来越多的差别表达基因得以分离和鉴定,在分子生物学和基因工程
研究领域发挥了极大的作用。(P221)
3、抑制性差减杂交的原理与应用。
原理:SSH的核心技术是抑制性PCR它是一种将检测子cDNA单链标准化步骤和消减杂交步骤结合为一体的技术。其中标准化步骤均等了检测子中的cDNA单链丰度,而消减杂交步骤
去除了检测子和驱赶子之间的共同序列,使检测子和驱赶子之间不同的序列得到扩增。
应用:
基因突变体的研究:如基因的表达与不表达;
基因时空表达的研究:如根、茎、叶;
不同处理条件下的基因表达差异:如施肥与不施肥、光照与不光照。
4、酵母双杂交技术、噬菌体表面展示技术的原理。
A. 酵母双杂交技术原理:大部分真核生物的位点特异转录激活因子通常具有两个可分隔开
的结构域,一个是DNA特异结合域(DNA-binging domain,BD ), 一个是转录激活域(transcriptional activation domain,AD)。这两个结构域各具功能,互不影响,但一个完
整的、具有激活特定基因表达的激活因子必须同时含有这两个结构域,否则无法完成其激活
功能。不同来源的激活因子的BD区与AD区结合后则能特异地激活BD结合基因的表达。
B. 噬菌体表面展示技术原理:当外源D NA片段插入丝状噬菌体基因组的一个外被蛋白基因
中时,如果两者读码框结构保持一致,这个外源DNA片段所编码的产物可与此外被蛋白一起
以融合蛋白的形式表达,并显示在噬菌体的表面。利用抗此外源基因编码产物(多肽或蛋白)的抗体,通过亲和纯化,就能从大量的噬菌体中富集、分离出含有所要的基因的融合噬菌体。
然后,通过基因扩增,得到大量所要的目的基因。