基因芯片技术在分枝杆菌菌种鉴定和结核耐药性检测中的应用及评价
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同 一 份 痰 标 本 加 入 等 量 0.5%N-乙 酰 半 胱 氨 酸 和氢氧化钠 (NALC-NaOH)前处理液,漩涡 振 荡 液
化15-20 min,吸 取 1 m1 消 化 液 于 1.5 ml离 心 管
中 ,用 于 基 因 芯 片 检 测 ,剩 余 样 本 用 于 结 核 培 养 。 核
— 205 —
度得到较 好 的 控 制,但 近 年 来 伴 随 HIV 感 染 的 流 行、MTB 耐药菌株的出 现 以 及 人 口 流 动 的 增 加,全 球疫情又急剧恶 化。 我 国 是 全 球 22 个 结 核 病 高 负 担 国 家 之 一 ,结 核 病 人 数 位 居 世 界 第 二 位 ,仅 次 于 印 度 。 [2] 一直以来困 扰 结 核 病 防 治 的 难 点:一 是 不 能 有 效 地 检 出 结 核 菌 ,不 利 对 患 者 的 及 时 正 确 救 治 ;二 是对患者用药的耐 药 情 况 不 能 及 时 检 测,不 能 做 到 针对性的联合用药治疗。传统的检测手段已不能满 足临床需求。随着 90 年 代 以 来 生 物 芯 片 技 术 不 断 研究,基因芯片技术 也 开 始 应 用 到 分 枝 杆 菌 的 检 测 中 。 [3,4] 与传统方法 相 比,生 物 芯 片 技 术 具 有 快 速、 结果可靠、重复性 好、通 量 高、可 以 在 一 个 反 应 中 检 测成千基因表达的 特 点,为 分 枝 杆 菌 的 实 验 室 诊 断 开拓新途径。为探讨基因芯片技术在结核病快速诊 疗中的应用价值,笔 者 就 我 院 近 期 检 测 的 情 况 进 行 以下统计分析。 1 材 料 和 方 法 1.1 研 究 对 象
tection of the resistance to Rifampin and Isoniazi in Mycobacterium tuberculosis clinical isolates.
Key words:Gene chip;Mycobacterium;Tuberculosis;Detection;Coincidence rate;Rifampin;Isoniazid (Chin J Lab Diagn,2015,19:0204)
— 204 —
文 章 编 号 :1007-4287(2015)02-0204-04
Chin J Lab Diagn,February,2015,Vol 19,No.2
基因芯片技术在分枝杆菌菌种鉴定和 结核耐药性检测中的应用及评价
李 晓 非1,2 ,梁 桂 亮2 ,普 冬2 ,杨 冬 梅2 ,赵 旻1*
结 核 病 是 一 种 由 结 核 分 枝 杆 菌 (MTB)感 染 引
*通讯作者
起的严重危害人类 健 康 和 生 命 的 传 染 病,是 全 球 主 要的公共卫生问题 之 一,也 是 造 成 人 类 死 亡 最 多 的 疾病之一 。 [1] 结核疫情由于疫苗和药物的使用 曾 一
中 国 实 验 诊 断 学 2015 年 2 月 第 19 卷 第 2 期
选 择 2013 年 1 月 至 12 月 本 院 结 核 科 涂 阳 肺 结 核 住 院 患 者 656 例 纳 入 观 察 。 每 例 患 者 采 集 清 晨 第 一口痰2-5ml吐入无菌容器内及 时 送 检,同 时 进 行 培养和基因芯片检测。质控菌株购自美国国家菌种 保 存 中 心,共 18 株:结 核 分 枝 杆 菌 H37Rv (ATCC27294)、结 核 分 枝 杆 菌 (ATCC25177)、胞 内 分 枝 杆 菌 (ATCC13950 )、 鸟 分 枝 杆 菌 (ATCC25291)、龟 分 枝 杆 菌 (ATCC35752)、脓 肿 分 枝 杆 菌 (ATCC19977 )、 戈 登 分 枝 杆 菌 (ATCC14470)、偶 然 分 枝 杆 菌 (ATCC6841)、不 产 色 分 枝 杆 菌 (ATCC19530)、堪 萨 斯 分 枝 杆 菌 (ATCC12478)、浅 黄 分 枝 杆 菌 (ATCC43903)、金 色 分 枝 杆 菌 (ATCC19527)、 瘰 疬 分 枝 杆 菌 (ATCC19981)、土 地 分 枝 杆 菌 (ATCCl5755)、草 分 枝 杆 菌 (ATCC11758 )、 溃 疡 分 枝 杆 菌 (ATCC19423)、蟾 蜍 分 枝 杆 菌 (ATCC19250)、耻 垢 分 枝 杆 菌 (ATCC19420)。 1.2 仪 器 和 试 剂
BACTEC MGIT 960 结 核 培 养 仪 及 配 套 试 剂 由美国 BD 公 司 生 产;结 核 分 枝 杆 菌 抗 原 检 测 试 剂 (胶体金法)由杭州 创 新 生 物 检 验 技 术 公 司 生 产;基 因芯片检测平台及 配 套 试 剂:为 北 京 博 奥 生 物 有 限 公司研制开发。 1.3 方 法
Application evaluation of Gene chip technology in the identification of Mycobacterium species and determination of anti-tu- berculosis drug resistance LI Xiao-fei1,2,LIANG Gui-liang2,PU Dong2,et al.(1.Department of Biomedical Engi- neering,Basic Medical College of Wuhan University,Wuhan,Hubei 430071,China;2.Department of clinical labora- tory,The third people'sHospital of Kunming,Kunming,Yunnan 650000,China)
dence rate and the consistency of two methods of Gene chip technology in the identification of Mycobacterium species and drug resistance detection,Results 21non-tuberculosis Mycobacterium were detected by the two methods in 656 patients with the smear-positive tuberculosis,the coincidence rate was 100%.The sensitivity was 87.8% (86/98),the specificity was96.0%(410/427),the coincidence rate was 94.5%(496/525),Kappa value 0.84in the gene-chip detec- ting rifaman-resistance Mycobacterium tuberculosis.The sensitivity was 81.9% (96/116),the specificity was 91.7% (375/409),the coincidence rate was 89.5%(470/525),Kappa value 0.71in the gene-chip detecting isoniazid-resistance
fied by Gene chip technology and were cultured by BACTEC MGIT 960.Detection of tuberculosis?positive samples re-
sistance to rifampin and isoniazid using Gene chip technology and culture method with BACTEC MGIT 960.Culture method with BACTEC MGIT 960 was used as the referHale Waihona Puke Baidunce method,Evaluation of the sensitivity,specificity,coinci-
率为100%。耐药性检测发现,基因芯片对利福平的敏感度为87.8%(86/98),特 异 度 为 96.0% (410/427),符 合 率 为
94.5%(496/525),Kappa值为0.84,P>0.05;对异烟肼的敏感度为81.9% (96/116),特 异 度 为 91.7% (375/409),符
consistence in the two methods detecting rifaman-resistance and isoniazid-resistance Mycobacterium tuberculosis.Gene chip technology has wide application prospect in diagnosis and treatment of tuberculosis patients,as it allows fast and accuracy de-
合率为89.5%(470/525),Kappa值为0.71,P>0.05;两种 药 物 药 敏 结 果 总 符 合 率 为 92.0%(966/1 050)。 结 论 基
因芯片技术能够准确地筛选出非结核分枝杆菌;对利福平和异烟肼 耐 药 性 检 测 与 培 养 法 有 很 好 的 符 合 率 和 高 度 一 致
Abstract:Objective Study on the application value of rapid diagnosis and treatment of tuberculosis with Gene chip technology.Methods Mycobacterium species of sputum specimens of tuberculosis(positive acid fast stain)were identi-
性,而且能够快速、准确地检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼的 耐 药 性,在 结 核 病 的 快 速 诊 疗 领 域 具 有 广 阔 的 应 用
前景。
关 键 词 :基 因 芯 片 ;分 枝 杆 菌 ;结 核 ;检 测 ;符 合 率 ;利 福 平 ;异 烟 肼
中 图 分 类 号 :Q789
文 献 标 识 码 :A
(1.武汉大学基础医学院 生物医学工程系,湖北 武汉430071;2.昆明市第三人民医院 检验科,云南 昆明650000)
摘要:目的 探讨基因芯片技术在结核病快速诊疗中的应用价 值。 方 法 对 抗 酸 染 色 涂 片 阳 性 的 肺 结 核 患 者 痰
标本同时进行基因芯片菌种鉴定和 BACTEC MGIT 960培养,对结核阳性的样本分别用以上两种 方 法 检 测 利 福 平 和
Mycobacterium tuberculosis.Conclusion Gene chip technology is an effective method for accurate screening of non-tubercu-
losis Mycobacterium.Gene chip technology and culture method with BACTEC MGIT 960had a high coincidence rate and high
异烟肼的耐药性。以培 养 法 为 参 考 方 法 ,评 价 基 因 芯 片 法 菌 种 鉴 定 和 耐 药 检 测 的 敏 感 度 、特 异 度 和 符 合 率。 采 用
Kappa检验分析两种方法的一致性。结果 656例涂 片 阳 性 的 患 者 中,两 种 方 法 各 检 出 非 结 核 分 枝 杆 菌 21 例,符 合
化15-20 min,吸 取 1 m1 消 化 液 于 1.5 ml离 心 管
中 ,用 于 基 因 芯 片 检 测 ,剩 余 样 本 用 于 结 核 培 养 。 核
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度得到较 好 的 控 制,但 近 年 来 伴 随 HIV 感 染 的 流 行、MTB 耐药菌株的出 现 以 及 人 口 流 动 的 增 加,全 球疫情又急剧恶 化。 我 国 是 全 球 22 个 结 核 病 高 负 担 国 家 之 一 ,结 核 病 人 数 位 居 世 界 第 二 位 ,仅 次 于 印 度 。 [2] 一直以来困 扰 结 核 病 防 治 的 难 点:一 是 不 能 有 效 地 检 出 结 核 菌 ,不 利 对 患 者 的 及 时 正 确 救 治 ;二 是对患者用药的耐 药 情 况 不 能 及 时 检 测,不 能 做 到 针对性的联合用药治疗。传统的检测手段已不能满 足临床需求。随着 90 年 代 以 来 生 物 芯 片 技 术 不 断 研究,基因芯片技术 也 开 始 应 用 到 分 枝 杆 菌 的 检 测 中 。 [3,4] 与传统方法 相 比,生 物 芯 片 技 术 具 有 快 速、 结果可靠、重复性 好、通 量 高、可 以 在 一 个 反 应 中 检 测成千基因表达的 特 点,为 分 枝 杆 菌 的 实 验 室 诊 断 开拓新途径。为探讨基因芯片技术在结核病快速诊 疗中的应用价值,笔 者 就 我 院 近 期 检 测 的 情 况 进 行 以下统计分析。 1 材 料 和 方 法 1.1 研 究 对 象
tection of the resistance to Rifampin and Isoniazi in Mycobacterium tuberculosis clinical isolates.
Key words:Gene chip;Mycobacterium;Tuberculosis;Detection;Coincidence rate;Rifampin;Isoniazid (Chin J Lab Diagn,2015,19:0204)
— 204 —
文 章 编 号 :1007-4287(2015)02-0204-04
Chin J Lab Diagn,February,2015,Vol 19,No.2
基因芯片技术在分枝杆菌菌种鉴定和 结核耐药性检测中的应用及评价
李 晓 非1,2 ,梁 桂 亮2 ,普 冬2 ,杨 冬 梅2 ,赵 旻1*
结 核 病 是 一 种 由 结 核 分 枝 杆 菌 (MTB)感 染 引
*通讯作者
起的严重危害人类 健 康 和 生 命 的 传 染 病,是 全 球 主 要的公共卫生问题 之 一,也 是 造 成 人 类 死 亡 最 多 的 疾病之一 。 [1] 结核疫情由于疫苗和药物的使用 曾 一
中 国 实 验 诊 断 学 2015 年 2 月 第 19 卷 第 2 期
选 择 2013 年 1 月 至 12 月 本 院 结 核 科 涂 阳 肺 结 核 住 院 患 者 656 例 纳 入 观 察 。 每 例 患 者 采 集 清 晨 第 一口痰2-5ml吐入无菌容器内及 时 送 检,同 时 进 行 培养和基因芯片检测。质控菌株购自美国国家菌种 保 存 中 心,共 18 株:结 核 分 枝 杆 菌 H37Rv (ATCC27294)、结 核 分 枝 杆 菌 (ATCC25177)、胞 内 分 枝 杆 菌 (ATCC13950 )、 鸟 分 枝 杆 菌 (ATCC25291)、龟 分 枝 杆 菌 (ATCC35752)、脓 肿 分 枝 杆 菌 (ATCC19977 )、 戈 登 分 枝 杆 菌 (ATCC14470)、偶 然 分 枝 杆 菌 (ATCC6841)、不 产 色 分 枝 杆 菌 (ATCC19530)、堪 萨 斯 分 枝 杆 菌 (ATCC12478)、浅 黄 分 枝 杆 菌 (ATCC43903)、金 色 分 枝 杆 菌 (ATCC19527)、 瘰 疬 分 枝 杆 菌 (ATCC19981)、土 地 分 枝 杆 菌 (ATCCl5755)、草 分 枝 杆 菌 (ATCC11758 )、 溃 疡 分 枝 杆 菌 (ATCC19423)、蟾 蜍 分 枝 杆 菌 (ATCC19250)、耻 垢 分 枝 杆 菌 (ATCC19420)。 1.2 仪 器 和 试 剂
BACTEC MGIT 960 结 核 培 养 仪 及 配 套 试 剂 由美国 BD 公 司 生 产;结 核 分 枝 杆 菌 抗 原 检 测 试 剂 (胶体金法)由杭州 创 新 生 物 检 验 技 术 公 司 生 产;基 因芯片检测平台及 配 套 试 剂:为 北 京 博 奥 生 物 有 限 公司研制开发。 1.3 方 法
Application evaluation of Gene chip technology in the identification of Mycobacterium species and determination of anti-tu- berculosis drug resistance LI Xiao-fei1,2,LIANG Gui-liang2,PU Dong2,et al.(1.Department of Biomedical Engi- neering,Basic Medical College of Wuhan University,Wuhan,Hubei 430071,China;2.Department of clinical labora- tory,The third people'sHospital of Kunming,Kunming,Yunnan 650000,China)
dence rate and the consistency of two methods of Gene chip technology in the identification of Mycobacterium species and drug resistance detection,Results 21non-tuberculosis Mycobacterium were detected by the two methods in 656 patients with the smear-positive tuberculosis,the coincidence rate was 100%.The sensitivity was 87.8% (86/98),the specificity was96.0%(410/427),the coincidence rate was 94.5%(496/525),Kappa value 0.84in the gene-chip detec- ting rifaman-resistance Mycobacterium tuberculosis.The sensitivity was 81.9% (96/116),the specificity was 91.7% (375/409),the coincidence rate was 89.5%(470/525),Kappa value 0.71in the gene-chip detecting isoniazid-resistance
fied by Gene chip technology and were cultured by BACTEC MGIT 960.Detection of tuberculosis?positive samples re-
sistance to rifampin and isoniazid using Gene chip technology and culture method with BACTEC MGIT 960.Culture method with BACTEC MGIT 960 was used as the referHale Waihona Puke Baidunce method,Evaluation of the sensitivity,specificity,coinci-
率为100%。耐药性检测发现,基因芯片对利福平的敏感度为87.8%(86/98),特 异 度 为 96.0% (410/427),符 合 率 为
94.5%(496/525),Kappa值为0.84,P>0.05;对异烟肼的敏感度为81.9% (96/116),特 异 度 为 91.7% (375/409),符
consistence in the two methods detecting rifaman-resistance and isoniazid-resistance Mycobacterium tuberculosis.Gene chip technology has wide application prospect in diagnosis and treatment of tuberculosis patients,as it allows fast and accuracy de-
合率为89.5%(470/525),Kappa值为0.71,P>0.05;两种 药 物 药 敏 结 果 总 符 合 率 为 92.0%(966/1 050)。 结 论 基
因芯片技术能够准确地筛选出非结核分枝杆菌;对利福平和异烟肼 耐 药 性 检 测 与 培 养 法 有 很 好 的 符 合 率 和 高 度 一 致
Abstract:Objective Study on the application value of rapid diagnosis and treatment of tuberculosis with Gene chip technology.Methods Mycobacterium species of sputum specimens of tuberculosis(positive acid fast stain)were identi-
性,而且能够快速、准确地检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼的 耐 药 性,在 结 核 病 的 快 速 诊 疗 领 域 具 有 广 阔 的 应 用
前景。
关 键 词 :基 因 芯 片 ;分 枝 杆 菌 ;结 核 ;检 测 ;符 合 率 ;利 福 平 ;异 烟 肼
中 图 分 类 号 :Q789
文 献 标 识 码 :A
(1.武汉大学基础医学院 生物医学工程系,湖北 武汉430071;2.昆明市第三人民医院 检验科,云南 昆明650000)
摘要:目的 探讨基因芯片技术在结核病快速诊疗中的应用价 值。 方 法 对 抗 酸 染 色 涂 片 阳 性 的 肺 结 核 患 者 痰
标本同时进行基因芯片菌种鉴定和 BACTEC MGIT 960培养,对结核阳性的样本分别用以上两种 方 法 检 测 利 福 平 和
Mycobacterium tuberculosis.Conclusion Gene chip technology is an effective method for accurate screening of non-tubercu-
losis Mycobacterium.Gene chip technology and culture method with BACTEC MGIT 960had a high coincidence rate and high
异烟肼的耐药性。以培 养 法 为 参 考 方 法 ,评 价 基 因 芯 片 法 菌 种 鉴 定 和 耐 药 检 测 的 敏 感 度 、特 异 度 和 符 合 率。 采 用
Kappa检验分析两种方法的一致性。结果 656例涂 片 阳 性 的 患 者 中,两 种 方 法 各 检 出 非 结 核 分 枝 杆 菌 21 例,符 合