宏基因组学技术

处理原理
3.15 厌氧生物 处理工艺
3.16 厌-好氧 处理技术
3.17 宏基因组学技术 3.19 DNA指纹技术 3.21 高通量测序技术 3.18 DNA提取实验操作 3.20 分子杂交技术
为了认识和利用微生物，微生物学上把各种微生物彼此分开得到一种微生物 的技术称为纯培养技术，又称Байду номын сангаас可培养技术(culture-dependent technology)。
3.1 何谓微生物 3.4 微生物结构与营养 3.7 微生物酶与催化
3.2 微生物学发展 3.5 无菌操作技术
3.8 微生物遗传与变异
3.3 微生物的分类 3.6 纯培养实验操作 3.9 纯培养技术案例
3.10 活性污泥法
3.13 生物膜法
工艺类型
3.11 改进活性污泥法 3.14 厌氧生物
3.12 生物膜法
增多。
石油污染修复： Ø 墨西哥湾石油污染的海水微生物，厌氧烃降解多种代谢相关的基因丰
度增加, 且与微生物有关的碳、氮、磷、硫和铁循环、金属抗性以及 与噬菌体复制相关的功能基因丰度也都增加。
3.1 何谓微生物 3.4 微生物结构与营养 3.7 微生物酶与催化
3.2 微生物学发展 3.5 无菌操作技术
反复稀释和选择 培养过程
恒温培养
1%
总微生物数
可筛选微生物
筛选策略 纯培养技术
优点 ▪ 获取目的基因较容易 ▪ 目的基因容易异源表达
▪ 基因信息量大 ▪ 获得的基因新颖性高 宏基因组技术 ▪ 可获得未培养微生物信息 ▪ 文库可重复利用
缺点 ▪ 菌种单一，筛选重复率高 ▪ 难获得未培养微生物的信息
尽量去除腐殖酸类物质、多糖和多酚等 物质，以免它们影响后续分子克隆操作
GeoChip
碳循环、氮循环、甲烷氧化、金属抗性、污染 物降解、抗生素抗性、应激反应、毒力、次级代谢 过程等
气候变化： Ø 土壤微生物群落结构在增温条件下会发生显著改变。 Ø CO2浓度升高，碳固定基因、易降解碳基因以及氮循环基因的数量明显
▪ 工作量大，耗时，成本高 ▪ 筛选效率低下 ▪ 目的基因异源表达困难
土壤
海洋
肠道
环境样品 细胞裂解 蛋白的去除 沉淀分离 DNA的纯化 常规的DNA提取流程
样品收集后应尽量快速提取DNA，以免 大分子DNA片段发生降解
尽可能完全地提出样品中所有微生物的DNA， 以反映微生物的真实多样性
保持较大的DNA片段以获得完整的目的基因 或基因簇
3.8 微生物遗传与变异
3.3 微生物的分类 3.6 纯培养实验操作 3.9 纯培养技术案例
3.10 活性污泥法
3.13 生物膜法
工艺类型
3.11 改进活性污泥法 3.14 厌氧生物
3.12 生物膜法
处理原理
3.15 厌氧生物 处理工艺
3.16 厌-好氧 处理技术
3.17 宏基因组学技术 3.19 DNA指纹技术 3.21 高通量测序技术 3.18 DNA提取实验操作 3.20 分子杂交技术