分子生物学实验技术课程

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分子生物学实验技术讲义

1、质粒提取

质粒提取方法参考上海生工公司质粒小量提取试剂盒说明书进行,方法如下:(1) 在含氨苄青霉素抗生素的LB培养基中接种目标菌株,于37℃充分震荡培养12-16h。

(2) 取1.5-5ml菌液,于室温8000g离心2min收集菌体,到净或吸干培养基。

(3) 在菌体沉淀中加入250μL Buffer P1,吸打或震荡至彻底悬浮菌体。

(4) 加入250μL Buffer P2,立即温和颠倒离心管5-10次,室温静置2-4min。

(5) 加入350μL Buffer P3,立即温和颠倒离心管5-10次,混匀后室温静置2min,以彻底去除RNA。

(6) 12000g离心5-10min,将上清全部小心移入吸附柱,8000g离心30s。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。

(7) 在吸附柱中加入500μL去蛋白液Buffer DW1,8000g离心30s。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。

(8) 向吸附柱中加入500μL wash Solution,8000g离心30s。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。

(9) 重复步骤8。

(10) 将空吸附柱和收集管放入离心机,8000g离心1min。

(11) 在吸附膜中央加入50-100μL Elution Buffer,室温静置1-2min,8000g离心1min。将所得到的质粒DNA溶液置于-20℃保存或用于后续试验。

2、PCR扩增体系如下:

2×PCR MIX 5μl

上游引物(10μM)0.2μl

下游引物(10μM)0.2μl

质粒0.6μl

ddH2O 4μl

总体积10μl

混匀离心后,按照下列程序进行反应:

95℃5min

95℃30s

48℃30s 30cycles

72℃1min

72℃10min

10℃保存

在PCR产物中加入1μl 10×LoadingBuffer,1%(w/v)琼脂糖凝胶电泳检测。

3 、DNA纯化回收方法按照生工公司试剂盒说明书进行:

(1) 电泳介绍后在紫外线下将目的条带用锋利的小刀小心切下。

(2) 将切下的目的DNA条带放入干净的离心管中,称取重量。

(3) 向胶块中加入等体积溶胶液(如果凝胶重为0.1g,其体积可视为100μl,则加入100μl PC溶液),50℃水浴放置10min左右,期间不断温和上下翻转离心管,以确保胶块充分溶解。(若胶块体积过大,可事先将胶块切碎)。

(4) 将上一步所得溶液加入一个吸附柱CB2中,12000r/min离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放入收集管中。

(5) 向吸附柱中加入500μl漂洗液,12000r/min离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。

(6) 重复步骤5。

(7) 将吸附柱放入收集管中,12000r/min离心2min,尽量去除漂洗液。将吸附柱置于室温数分钟,彻底晾干。

(8) 将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加适量的洗脱缓冲液EB,室温放置2min,12000r/min离心2min,收集DNA。-20℃保存。

4、连接克隆载体

参考pMD19-T Vector说明书加入以下组分进行连接:

T载体(pMD 19-T)0.5μl

Solution Ⅰ 4.5μl

PCR产物 5.0μl

总体积10μl

混匀离心后16℃连接过夜,产物用于转化实验。

5、感受态细胞制备

(1) 从-80℃冰箱取出保存的大肠杆菌DH5a菌种,用接种针蘸取少许菌液在LB 固体平板上划线,37℃培养12-17 小时;挑取大肠杆菌单菌落,接种于2 ml LB 液体培养基中,37℃摇培过夜;

(2)按1:100的比例取500 µl菌液接种到装有50 ml LB液体培养基的250 ml三角瓶中,37℃振荡培养2~3 小时,至OD600为0.3~0.5;

(3)在冰浴上放置10分钟,4℃下12000 g离心1分钟收集菌体,

(4)用预冷的0.1M CaCl2 500 µl悬浮菌体;12000 g,4℃离心1 分钟收集菌体,再用预冷的0.1 M CaCl2 100 µl重悬菌体,置于冰浴中备用(12~24 小时内转化效率最高);或者加入15%~20% (v/v)甘油,200 µl每份分装,-80℃保存备用。

6、连接产物采用热击法转化大肠杆菌感受态DH5α,方法如下:

(1) 将连接产物加入100μL感受态细胞中,充分混匀,冰上放置30min。

(2) 42℃热击1min30s,冰上放置2min后加入LB液体培养基1ml。

(3) 37℃低速震荡培养1h。

(4) 培养结束后,将一部分菌液均匀涂于含Amp的LB培养基平板上,37℃倒置培养过夜。

7、阳性克隆的鉴定

阳性克隆采用菌落PCR进行初步筛选,然后对重组质粒进行酶切的方法进行检测。

(1) 菌落PCR检测

用灭菌的牙签蘸取单克隆划线,过夜培养后,挑取少量菌落进行PCR扩增,PCR扩增体系如下:

2×Taq PCR MasterMix 5μl

上游引物(10μM)0.2μl

下游引物(10μM)0.2μl

ddH2O 4.6μl

总体积10μl

混匀后,按照下列程序进行反应:

95℃5min

95℃30s

48℃30s 35cycles

72℃1min

72℃10min

10℃保存

将PCR产物加入1μl 10×LoadingBuffer,1%(w/v)琼脂糖凝胶电泳检测。电泳条件:150V,20min。选取阳性克隆提取质粒,进行双酶切鉴定。

②质粒单酶切

酶切检测体系如下:

10×M buffer 1μl

HindⅢ质粒0.5μl 8.5μl

总体积10μl

37℃酶切3h,然后加入1μl 10×LoadingBuffer,1%(w/v)琼脂糖凝胶电泳检测。电泳条件:150V,20min。

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