分子生物学实验技术课程
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分子生物学实验技术讲义
1、质粒提取
质粒提取方法参考上海生工公司质粒小量提取试剂盒说明书进行,方法如下:(1) 在含氨苄青霉素抗生素的LB培养基中接种目标菌株,于37℃充分震荡培养12-16h。
(2) 取1.5-5ml菌液,于室温8000g离心2min收集菌体,到净或吸干培养基。
(3) 在菌体沉淀中加入250μL Buffer P1,吸打或震荡至彻底悬浮菌体。
(4) 加入250μL Buffer P2,立即温和颠倒离心管5-10次,室温静置2-4min。
(5) 加入350μL Buffer P3,立即温和颠倒离心管5-10次,混匀后室温静置2min,以彻底去除RNA。
(6) 12000g离心5-10min,将上清全部小心移入吸附柱,8000g离心30s。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。
(7) 在吸附柱中加入500μL去蛋白液Buffer DW1,8000g离心30s。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。
(8) 向吸附柱中加入500μL wash Solution,8000g离心30s。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。
(9) 重复步骤8。
(10) 将空吸附柱和收集管放入离心机,8000g离心1min。
(11) 在吸附膜中央加入50-100μL Elution Buffer,室温静置1-2min,8000g离心1min。将所得到的质粒DNA溶液置于-20℃保存或用于后续试验。
2、PCR扩增体系如下:
2×PCR MIX 5μl
上游引物(10μM)0.2μl
下游引物(10μM)0.2μl
质粒0.6μl
ddH2O 4μl
总体积10μl
混匀离心后,按照下列程序进行反应:
95℃5min
95℃30s
48℃30s 30cycles
72℃1min
72℃10min
10℃保存
在PCR产物中加入1μl 10×LoadingBuffer,1%(w/v)琼脂糖凝胶电泳检测。
3 、DNA纯化回收方法按照生工公司试剂盒说明书进行:
(1) 电泳介绍后在紫外线下将目的条带用锋利的小刀小心切下。
(2) 将切下的目的DNA条带放入干净的离心管中,称取重量。
(3) 向胶块中加入等体积溶胶液(如果凝胶重为0.1g,其体积可视为100μl,则加入100μl PC溶液),50℃水浴放置10min左右,期间不断温和上下翻转离心管,以确保胶块充分溶解。(若胶块体积过大,可事先将胶块切碎)。
(4) 将上一步所得溶液加入一个吸附柱CB2中,12000r/min离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放入收集管中。
(5) 向吸附柱中加入500μl漂洗液,12000r/min离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱放回收集管中。
(6) 重复步骤5。
(7) 将吸附柱放入收集管中,12000r/min离心2min,尽量去除漂洗液。将吸附柱置于室温数分钟,彻底晾干。
(8) 将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加适量的洗脱缓冲液EB,室温放置2min,12000r/min离心2min,收集DNA。-20℃保存。
4、连接克隆载体
参考pMD19-T Vector说明书加入以下组分进行连接:
T载体(pMD 19-T)0.5μl
Solution Ⅰ 4.5μl
PCR产物 5.0μl
总体积10μl
混匀离心后16℃连接过夜,产物用于转化实验。
5、感受态细胞制备
(1) 从-80℃冰箱取出保存的大肠杆菌DH5a菌种,用接种针蘸取少许菌液在LB 固体平板上划线,37℃培养12-17 小时;挑取大肠杆菌单菌落,接种于2 ml LB 液体培养基中,37℃摇培过夜;
(2)按1:100的比例取500 µl菌液接种到装有50 ml LB液体培养基的250 ml三角瓶中,37℃振荡培养2~3 小时,至OD600为0.3~0.5;
(3)在冰浴上放置10分钟,4℃下12000 g离心1分钟收集菌体,
(4)用预冷的0.1M CaCl2 500 µl悬浮菌体;12000 g,4℃离心1 分钟收集菌体,再用预冷的0.1 M CaCl2 100 µl重悬菌体,置于冰浴中备用(12~24 小时内转化效率最高);或者加入15%~20% (v/v)甘油,200 µl每份分装,-80℃保存备用。
6、连接产物采用热击法转化大肠杆菌感受态DH5α,方法如下:
(1) 将连接产物加入100μL感受态细胞中,充分混匀,冰上放置30min。
(2) 42℃热击1min30s,冰上放置2min后加入LB液体培养基1ml。
(3) 37℃低速震荡培养1h。
(4) 培养结束后,将一部分菌液均匀涂于含Amp的LB培养基平板上,37℃倒置培养过夜。
7、阳性克隆的鉴定
阳性克隆采用菌落PCR进行初步筛选,然后对重组质粒进行酶切的方法进行检测。
(1) 菌落PCR检测
用灭菌的牙签蘸取单克隆划线,过夜培养后,挑取少量菌落进行PCR扩增,PCR扩增体系如下:
2×Taq PCR MasterMix 5μl
上游引物(10μM)0.2μl
下游引物(10μM)0.2μl
ddH2O 4.6μl
总体积10μl
混匀后,按照下列程序进行反应:
95℃5min
95℃30s
48℃30s 35cycles
72℃1min
72℃10min
10℃保存
将PCR产物加入1μl 10×LoadingBuffer,1%(w/v)琼脂糖凝胶电泳检测。电泳条件:150V,20min。选取阳性克隆提取质粒,进行双酶切鉴定。
②质粒单酶切
酶切检测体系如下:
10×M buffer 1μl
HindⅢ质粒0.5μl 8.5μl
总体积10μl
37℃酶切3h,然后加入1μl 10×LoadingBuffer,1%(w/v)琼脂糖凝胶电泳检测。电泳条件:150V,20min。