动物育种学近交系数和亲缘系数的计算
(整理)家畜育种学试题集.
物种指具有不同的生态特点，彼此之间存在着生殖隔离，二倍体染色体数目和基本形态互不相同的生物集团, 是生物分类系统的基本单位。
品种指具有一定的经济价值，主要性状的遗传性比较一致的一种栽培植物或家养动物群体，能适应一定的自然环境以及栽培或饲养条件，在产量和品质上比较符合人类的要求，是人类的农业生产资料。
品系是品种的一种结构形式，它是起源于共同祖先的一个群体。
物种与品种的区别：①物种是动物分类学上的单位，是自然选择的产物。
②品种是畜牧学的基本单位，是人工选择的产物。
从遗传角度来看，品种是具有特殊的基因频率和基因配套体系的类群。
品种应具备的条件：①血统来源相同，具有更为接近的亲缘关系②性状及适应性相似－体型外貌、生理机能、经济性状、适应性相似③遗传性能稳定－能将典型的特征遗传给后代－纯种与杂种的根本区别④具有一致的生产性能－一个品种内可分为若干个品系－每个品系（或类群）各具特点－自然隔离形成，或育种者有意识培育，构成品种内的遗传异质性⑤具有足够的数量⑥必须通过政府部门的审定和认定1、品种形成的原因：各地自然环境和社会条件不同交通不便造成地理隔离各地的小群体在体型外貌及适应性等方面出现差异出现家畜品种的雏形原始品种被继续选育，形成特定生产方向的培育品种2、影响品种变化的因素-社会经济条件ω形成不同用途培育品种的主要因素工业革命之前: 农业、军事→马业工业革命之后: 城市→乳肉蛋绒裘革等用途畜禽ω影响品种形成和发展的首要因素-自然环境条件ω光照、海拔、温度、湿度、空气、水质、土质和食物结构等①专门化品种：在某一方面具有生产性能特长的品种，从而出现了专门的生产力。
②兼用品种：具有两个以上方面生产性能特长的品种。
生长（growth)：同类细胞数目增加或体积增大，使个体由小到大，体重逐渐增加的这种现象称为生长。
发育（development)：由受精卵分化出不同的组织器官,从而产生不同的体态结构与机能的过程。
它是个体生育机能逐步实现和完善的一个过程。
2012动物育种学复习题a
2012动物育种学复习题a《动物育种学》复习题)⼀、名词解释（选择强度选择差育种值配合⼒家系选择家系内选择品种品系近交系数亲缘系数同质选配异质选配轮回杂交级进杂交MOET育种阈性状杂交育种BLUP QTL 杂种优势⼆、填空题1. ⼈类把野⽣动物驯化成为家畜，⼤体经历了和两个阶段。
2. DNA⽔平上的影响数量性状的单个基因或染⾊体⽚段称为数量性状基因座，简称。
3．品系培育的⽅法有、近交建系法和。
4.在制定育种⽅案时，应考虑家畜多个重要的经济性状，实施多性状选择，其⽅法有3种，分别是、和。
5.品种培育的⽅法有、、和。
6.⼀个品种不是固定不变的，导致品种发⽣体型、外貌和⽣产性能变化的因素主要有和。
7. 按照作⽤于选择的外界因素，可将选择分为两类：和。
8．根据杂交的⽬的不同，杂交可⼤致上分为和。
9．在⽣产实践中，保持群体遗传多样性的关键是避免上升。
10．1948年，美国学者Henderson提出了BLUP育种值估计⽅法，即。
11．标准化的选择差称为。
12．个体选配分为和。
13．品种培育的⽅法有、、和。
14．在畜牧业中，按改良程度将家畜品种分为和。
15. MOET育种是将与等繁殖技术与核⼼群合作育种体系结合起来的⼀种选种⽅法。
16．在畜牧业中，按改良程度将家畜品种分为和。
17．家畜育种规划的⽅法主要包括4个⽅⾯：①确定；②估计育种群可能实现的遗传进展；③预测可望获得的；④确定遗传进展的。
18.家畜育种⼯作的特点是、和。
19．被选留种⽤个体的数量占被测定个体数量的⽐值称为；被选留个体均数与群体均数之差称为。
20．单性状选择⽅法包括、、和4种⽅法。
21.种⽤价值的⾼低通常⽤衡量。
三、单项选择题（每题1分，共10分）1.选择差除以该性状的标准差称为（）。
A 留种率B 选择反应C 世代间隔D 选择强度2.选择指数法是针对（）性状的选择⽅法。
A 单⼀B 质量C 抗病D 多个3.发源于⼀头优秀种公畜的畜群称为（）A 单系B 品族C 近交系D 群系4.在下列品系中，采⽤近交的⽅法建⽴的品系是（）。
动物育种学
BY一鸣动物育种学名词解释驯养：人类为了某种目的，把从自然界猎捕回来的野生动物加以驯服而成为驯养动物的过程。
绝对生长：指在一定时间内体重的增加量。
相对生长系数：局部器官的生长系数与整体器官生长系数的比值。
家畜的生产力：在一定的条件下一定的时间内，提供合乎标准的一定数量的产品的能力。
系谱：一头家畜的父母及其各代祖先的畜名、畜号、生产成绩及鉴定结果的记录文件。
复合育种值：把不同资料来源所估计的单项资料育种值，根据其遗传力的大小给以适当的偏回归系数并求和所得的数值。
相对生长：某一段时间内的增重与始重的比值。
同胞测定：根据某一个个体同胞的成绩，来对个体作出种用价值的评定。
异质选配：是一种以不同表型为基础的选配。
近交衰退：由于近交造成家畜繁殖力减退、死亡和畸形增多、生产力适应性下降、生长缓慢、生产力降低的现象。
亲缘系数：两个个体因为共同祖先而造成亲缘关系的大小。
个体选配：考虑到交配双方的品质异同和亲缘关系远近的一种交配形式。
引种：为了改良当地的品种，常常需要从外地引入优良品种来改良当地品种的过程。
专门化品系：各具特点，而且专门用以与另一种品系杂交，获取杂种优势的品系称为专门化品系。
配合力：不同种群通过杂交能获得的杂种优势的程度。
初生窝重：仔猪初生时全窝总重量。
品质选配：就是考虑交配双方品质对比情况的一种选配。
选择差：中选个体的平均表型值与群平均表型值的差。
后裔测定：根据某个个体后代的成绩，来对这个个体本身作出种用价值的评定。
家畜育种：就是提高种畜的品质，增加良种的数量以及改进畜产品的质量和数量，不断扩大和改良现有家畜品种、创造新品种、品系以及利用杂种优势的工作。
累积生长：任何一个时期所测得的体重或体尺，都代表该家畜被测定以前生长发育的累积结果，因此称为～性能测定：根据个体本身成绩的优劣来判断种用价值的高低。
野祖：各种家畜所来自的野生动物。
杂种优势现象：不同种群的家畜杂交所产生的杂种往往在生活力、生长势和生产性能等方面，表现出一定程度上优于亲本的现象。
实验五近交系数与亲缘系数计算
实验五近交系数与亲缘系数计算亲缘系数和近交系数是两个重要的概念，用于描述个体之间的亲缘关系和亲缘程度。
亲缘系数是指两个个体之间的亲缘关系的程度，而近交系数则是指同一亲源个体之间繁殖的程度。
亲缘系数一般由亲缘关系的近似概率确定，例如兄弟姐妹之间的亲缘系数为0.5，叔侄之间的亲缘系数为0.25、亲缘系数的范围通常在0到1之间，越接近1表示亲缘程度越高。
近交系数则是指同一亲源个体之间进行繁殖产生后代的程度。
近交系数的范围通常在0到1之间，越高表示近交程度越高。
近交系数是通过遗传多态性来计算的，具体的计算方法会根据遗传标记和分析方法的不同而有所差异。
亲缘系数和近交系数的计算方法都是基于基因频率和遗传距离的概念。
基因频率是指在一个群体或种群中一些基因型的频率，而遗传距离是指在基因座的遗传变异中测量的差异。
计算亲缘系数的一种常见方法是通过等位基因共享来估计。
等位基因是指在同一位点上可能存在的不同的基因型。
通过检测和比较个体在多个基因座上的等位基因，可以估计亲缘系数。
一种经典的计算亲缘系数的方法是使用明斯基方程（Mendelian equation），该方程是基于古典遗传学原理推导出的。
计算近交系数的方法则是根据亲缘系数和遗传距离的关系来确定的。
通常情况下，近交系数通过亲缘系数的平方根计算得到。
这是因为近交系数既受到亲缘系数的影响，又受到遗传变异的影响。
近交系数的计算可以帮助我们评估和预测种群的遗传多样性和遗传健康状况。
繁殖时的适当近交程度可以促进优质基因的聚集，提高遗传质量，但过高的近交程度会导致基因缺陷和遗传疾病的增加。
亲缘系数和近交系数的计算对于生物学、动物学和植物学等领域来说具有重要意义。
在实践中，我们可以通过DNA分析和遗传标记来估计亲缘系数和近交系数。
这些方法可以为种群的保护和繁殖计划提供重要的参考依据。
总之，亲缘系数和近交系数是两个重要的概念，在遗传学研究和实践中具有重要意义。
它们可以帮助我们评估和预测个体之间的亲缘关系和繁殖的程度，为种群的保护和繁殖计划提供重要的参考依据。
动物选配技术—近交程度分析(动物遗传育种课件)
式中，RxA 为个体到其祖先A个体间的亲缘系数； N为由个体X到其祖先A的世代数； Fx为个体的近交系数； FA为A个体的近交系数。
如果祖先A和个体x都不是近交个体，FA、Fx均为零，则公式可简化为：
R xA
(1)N 2
计算时，应首先把原系谱改编成结构式系谱；然后找通路，即从祖先（A）到后 代（x）的路径，查出每条路径上的n值；最后代入公式计算。若个体x或A是近交 所生的，就应该先计算出Fx或FA，代入公式6-6计算；若个体x或A不是近交所生 的，就应该代入公式计算。
Fn=1－(1－ΔF)n；
其中：n为世代数；
Fn为第t世代的近交系数
畜群中的母畜数量大于12头时，公式简化为：
1 F
8NS
有一闭锁畜群连续8个世代没有引入外来公畜，并且群内公畜始终保持3头，而 且实行随机留种，试问该畜群的近交系数是多少？
该畜群每个世代近交系数的增量为： 经过8个世代后畜群的近交系数为：
3
(½)3
S←B→D
0
3
(½)3
FX
(1)3 (1)3 22
1 4
求下图中个体X的近交系数?
A
B
C
DE
F
S
D
X
FX ?
FX 0
1 S
2 x
1 D
3
横 式 系 谱
Fx = （1/2）n1+n2+1 =（1/2）1+1+1 = 0.125
C
A
S
E
C
B
E
x
A
S
B
D G
A
C
S
X
B
E
D
通径图
第五章 近交系数与亲缘相关系数
□ ½ rpo 〇 □ rGO ½ □
〇 ½
〇 〇 ½ O
所以， rGO = 1 / 4 。 （3）全同胞相关 □ 〇
〇 〇 rFS
rFS = (1 / 2) 2 + (1 / 2) 2 = 1/ 4 + 1/ 4 = 1/ 2
（4）半同胞相关 〇
□ 〇 rHS 〇
〇
rHS = (1 / 2) 2 = 1 / 4
第一节 个体的近交系数
父母代与子代之间是明显的因果关系， 前面已经证明了一个亲本到子女的通径系数是 1/2。 一个近交个体的父母，可以看成是两个结果，而它们的共同祖先则可看成是共同原因。于是， 两个结果间的相关系数就等于连接两个结果的各个通径系数的乘积，父亲到共同祖先的代数 用 n1 表示，母亲到共同祖先的代数用 n2 表示，则两个结果之间通径系数的乘积为（½）n1+n2。 当有两个以上共同原因时，则父母之间的相关系数，等于连接两者的通径系数的乘积之和， 即
如果共同祖先也无近交系数时，上式便可简化为：
R xy = ∑ 1 2
n
如果 x 与 y 到共同祖先的代数分别为 n1 和 n2， 则以上各式中的 n 可写成 n1+n2， 即 n= n1+n2。 3、亲缘相关系数的算法举例。 例 1：计算右图中的 RSD，RXA，FX。 解：已知 S 为近交个体，故应先求 FS。
3 4
S
Fx = (1 / 2) 0+1+1 (1 + 0.1875) + (1 / 2)1+1+1 + (1 / 2) 2+ 2+1 + (1 / 2) 3+ 2+1 = (1 / 2) 2 × 1.1875 + (1 / 2) 3 + (1 / 2) 5 + (1 / 2) 6 = 0.296875 + 0.125 + 0.3125 + 0.015625 = 0.46875
育种复习题及答案
《动物育种学》复习题一、名词解释选择强度:不同性状间由于度量单位和标准差不同，为统一标准，都除以各自的标准差，使之标准化，这种标准化的选择差选择差:被选留个体的平均表型值与侯选群平均表型值之差。
选择反应:通过人工选择，在一定时间内，使得性状向着育种目标方向改进的程度。
它是选择差稳定遗传给后代的部分。
间接选择反应:利用性状间的遗传相关，通过对另一个性状的选择来间接选择所要改良的某个性状的选择方法。
育种值:各种基因型的加性效应值,个体加性效应的高低反映了它在育种上贡献的大小，因而称之为育种值个体育种值:个体育种值的简称育种值，指的是种用个体某一性状上能稳定遗传给下一代的基因的加性效应值。
配合力: 通过杂交能够获得的杂种优势程度，也即种群通过杂交能够获得的杂种优势程度，也即杂交效果的好坏和大小。
一般配合力:一个种群和其它各种群杂交能获得的平均效果，遗传基础是基因的加性效应，主要依靠纯繁选育提高。
特殊配合力:两个特定种群间杂交所能获得超过一般配合力的杂种优势，遗传基础是基因的非加性效应，其提高主要依靠杂交组合的选择。
家系选择:比较全群若干家系的均值，根据家系平均值的高低选留名次在前的家系的全体。
该法只考虑家系均值，而不考虑家系内偏差，个体的表型值除对家系均值起作用外，对选择并不起独立的作用。
物种:是具有一定形态、生理特征和自然分布区域的生物类群，是生物分类系统的基本单位品种:畜牧学的单位，指具有特定生物学特性、经济特性和种用价值、能适应一定自然和经济条件、能满足人类一定需求、具有一定数量的某种家畜类群。
品系:指来源于同一头卓越的系祖，且有与系祖类似的体质和生产力的种用高产畜群；这些畜群都符合该品种的基本方向。
广义：指一群具有突出优点，并能将这些突出优点相对稳定地遗传下去的具有较高种用价值的种畜群。
表型选择:基因型选择:个体选择:对两部分同等重视，即把超出群体均值最多的个体留种。
家系内选择:完全忽略Pf只根据Pw选择，在家系内选择超出家系均值最多的个体留种。
实习九 近交系数与亲缘系数的计算
（2）
∑
1 ( 2
n1 + n 2 + 1
)
（3）
为父亲到祖先的代数， 为母亲到祖先的代数 为母亲到祖先的代数， 为祖先的近接系数 为祖先的近接系数）。 （n1为父亲到祖先的代数，n2为母亲到祖先的代数，FA为祖先的近接系数）。 为父亲到祖先的代数
上列（1）式和（2）式，算法结果完全相 同，均可运用。（1）式中的n1+n2，也就等 1 n1+n2 于（2）式中的N；（1）式括号左上方的1， 也就等（2）式括号前的。计算时，首先通过 系谱，把所给系谱划为箭头式系谱，然后通过 此系谱找出父、母到祖先的代数，然后代入公 式，即可计算。
289
示例：仍用上例系谱，计算289号公与 其祖先16号之间的亲缘系数。 从上例系谱可看出，289号与16号之间的亲 289 16 缘关系，有两条通径路线，每条通径的代数 都是3，即： 289←135←90←16 135 90 108 16 289←181←49←16
181 49
另外， 号公羊还是近交后代， 另外，289号公羊还是近交后代，其近交系 号公羊还是近交后代 数是15.63%，代入公式后则得： 数是 ，代入公式后则得：
13 13 1+ 0 1 1 R(289)(16) = [( ) + ( ) ] = = 23.25% 2 2 1+ 0.156 4 1.156
号公羊与祖先16号公羊之间的亲缘系 即289号公羊与祖先 号公羊之间的亲缘系 号公羊与祖先 数是23.25%。 数是 。
育种学实验考试 选择指数的制订
181
49
135 289 181
108 90 16 108 49 16
华中农业大学《动物繁殖学》第十章 近交
结 论： 不改变群体基因频率
当近交程度达到最大即F=1时，群体将全部为纯合子， 其中AA的频率为p，aa的频率为q；
当近交程度最低（F=0）时，基因频率与基因型频率为 通常的Hardy-Weinberg频率。
第三节 近交衰退
▪ 近交衰退（inbreeding depression）表现 • 生活力降低； • 繁殖力下降； • 遗传缺陷发生率增高； • 生长受阻； • 与生活力有关联的某些数量性状如泌乳量、剪毛量、 产蛋数的均值有所下降。
非亲缘交配 狭义：同品种内无亲缘关系的个体间交配 广义：品种内杂交、品种间杂交及种间杂交
设有两个群体P1、P2 ，其基因频率、基因型 频率以及基因型值如表所示:
令p2=p1+y , q2=q1–y,则子一代杂合子的频率为 HF1= p1q2+q1p2 =p1(q1-y)+q1(p1+y) =2p1q1+y(q1-p1)
亲缘系数是平均概率 － 0 或 ½ 或 ¼
直系亲属亲缘系数：祖先与后代的亲缘关系 旁系亲属亲缘系数：旁系亲属间的亲缘关系
▪ 亲缘系数的计算
实习五
例：有两个在5个位点上不同的完全纯合的近交系小鼠。根据 下列条件填表： a.每个显性等位基因对6周龄体重的效应为+3mg； b.每个隐性等位基因对6周龄体重的效应为-3mg； c.部分显性存在，每个杂合位点的显性效应值为+2mg（即杂 合子比该位点纯合子育种值增加+2mg）； d.纯合位点的基因型值等于育种值； e.环境效应见下表； f.无上位效应存在。
基因型
育种值 非加性效应值 基因型值 环境效应值 表型值
(1)AAbbCCddEE
0mg
(2)aaBBccDDee
家畜育种学重点
家畜育种学重点名词解释：1、选择反应与选择强度:选择反应是指选留种畜群所生后代某性状均值与同期畜群统一性状均值之差，公式为R=H2S；选择强度即标准化的选择差，也就是以标准差为单位的选择差，公式为i=S/δ。
2、个体育种值与估计育种值：个体育种值的简称育种值，指的是种用个体某一性状上能稳定遗传给下一代的基因的加性效应值。
利用统计学原理和方法，通过表型值和个体间的亲缘关系进行估计，由此得到的估计值称为估计育种值，即EBV。
3、近交系数与亲缘系数：近交系数是指根据近亲交配的世代数，将基因的纯化程度用百分数来表示，即为近交系数。
亲缘系数：将群体中个体之间基因组成的相似程度用数值来表示，即为亲缘系数。
4、一般配合力与特殊配合力：一般配合力指一个种群和其它各种群杂交能获得的平均效果，遗传基础是基因的加性效应，主要依靠纯繁选育提高。
特殊配合力指两个特定种群间杂交所能获得超过一般配合力的杂种优势，遗传基础是基因的非加性效应，其提高主要依靠杂交组合的选择。
5、异质选配与间接选择：两个个体品质不同或者不相似，其间的交配称为异质选配。
根据性状之间的相关关系，通过对一个性状的选择来达到改良另一个性状的目的选择方法，称为间接选择。
大题：1、后裔测定：根据后裔的遗传信息估测个体育种值，以评定其种用价值。
其缺点是延长了世代间隔，缩短了种畜使用期限，增加了费用。
适用于：①低遗传力性状的选择，如猪的产仔数和鸡的产蛋量等；②限性性状的选择，如根据奶牛和奶山羊种公畜的产奶性能对其女儿的性状表现作出估价。
用于种公畜的注意点：①消除与配母畜效应的影响；②控制后裔间的系统环境；③保证一定的测定数量。
2、标记辅助选择：为提高选择的效率，利用与影响目标性状的基因相连锁的遗传标记进行的辅助选择。
㈠原理：通过测定QTL或主效基因的基因型，选出具有理想基因型的个体。
㈡基本策略：①Marker-BULP；②两阶段选择；③早期选择。
㈢影响标记辅助选择相对效率的因素：①QTL效应的大小；②标记与QTL的连锁程度；③选择的世代数；④常规选择的效率。
第八章 选配
—近交的用途 揭露有害基因；固定优良性状；结合选择 提高群体的同质性。 **近交只限于品种或品系培育时使用，一
般生产场和专业户，应尽可能避免(尤其是全同
胞、亲子之间或半同胞交配)，防止近交衰退。
2.2 远交（outbreeding）
— 概念 无亲缘关系的个体间的交配，称为远交。
— 遗传效应（与近交正好相反）
Fx CSD
（2）个体的 2Cxx 1
3.3 加性遗传相关（回忆）
—概念 两个个体的基因组中具有同源相同基因的比例。 或者说从个体x的基因组中随机抽取的一个基因在个 体y的基因组中也存在的概率。
如，在不存在近交的情况下，一个亲本和它的一 个后代间的加性遗传相关为1/2，即0.5，因为该亲 本传递了一半基因给它的后代。相应的，祖孙间的 加性遗传相关为1/4，全同胞之间为1/2，半同胞之 间为1/4。
P （有角母牛） 1 R R
交配概率不同，对下一代的基因型频率， 甚至基因频率就会有影响，从而产生不同于随 机交配的独特作用。
1． 品质选配
品质选配：也称为选型交配（assorsative mating，AM），是考虑与配双方品质对比情况的一 种选配方式。 **品质：可以是质量性状，也可以是数量性状； 既可以是表型上的，也可以是遗传上的；既可以是 单一性状，也可以是综合性状。
FA ：共同祖先A的近交系数.
3.2 Malé cot的共亲系数(Coefficient of kinship)
—概念
两个个体产生的配子携带同源相同基因的概率,
用C表示.
（1） 两个个体的共亲系数：等于这两个个体各自
父母的共亲系数的平均值；也等于一个个体与另一个 个体亲本的公亲系数的平均:
畜禽群系的亲缘系数与近交系数
畜禽群系的亲缘系数与近交系数
丛培元
【期刊名称】《辽宁畜牧兽医》
【年(卷),期】1990(000)003
【摘要】品系繁育是畜禽育种的重要手段,是提高畜禽生产水平行之有效的方法。
由于建系方法不同,品系也各种各样,群系是品系之一种,是采用闭锁群体继代选育方法形成具有不同于其他群体特征的亲缘类群,也就是由相互间有亲缘关系的个体组成的群体。
当前国内外养猪养禽业中,广泛而大量地繁育猪、禽的群系。
如。
【总页数】3页(P25-27)
【作者】丛培元
【作者单位】无
【正文语种】中文
【中图分类】S813
【相关文献】
1.基于Web的肉羊信息管理系统中亲缘系数及近交系数的程序设计与实现 [J], 涂远璐;邹建香;白云峰;冯国兴
2.亲缘系数与近交系数的数理分析 [J], 杨利丽;刘红英;刘顺梅;张金宝
3.亲缘系数与近交系数的计算 [J], 何颖;李霞
4.亲缘系数与近交系数的区别与联系 [J], 刘红英;杨利丽;王培承;张金宝;于文静
5.动物亲缘系数及近交系数的亲缘协方差算法 [J], 简承松
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家畜育种学讲义
FX (12)(21)(1FF)3(12)(41)(1FD) 1 3 7 0.218
8 32 32
❖ 例5. 亲子交配（B为A的子代） A
X B
A为共祖，通径链为： A→B N=1
FX(1 2)(11)(1FA)1 40.25 家畜育种学讲义
例6. 连续两代亲子交配 A
2. 选种为选配，选配验证选种效果：选种时要考虑下一 步的选配，选配所得后代是否优良，可以证明选种选 配是否合宜。
3. 选配巩固选种成果，选种加强选配：没有合理的选配， 选种成果就无法巩固。因为要使所选种畜的优良品质 能在后代中得到保持和加强，就必须选择具有相应优 良品质的配偶才能达到目的。通过选种，有了品质优 良的后代，又为进一步的选配提供了素材。
A←D←E→C→B N=4
当共祖为F时， A←C←F→D→B N=4
A←D←家F畜→育种C学讲→义B N=4
第三步：计算
Fx(12)(21)(1FC)(12)(21)(1FD)(12)(41)(1FE)2(12)(41)(1FF)2 1111
8 8 1616 30.375
8
家畜育种学讲义
例3. 一代半同胞交配的后代近交系数
家畜育种学讲义
作用： 后代综合双亲的优良性状，表现间于双亲之间，
属中间型遗传。丰富后代的遗传基础，创造新的类型， 提高后代的适应性和生活力。 缺点：
对连锁和负相关的性状选配效果不好。 应用：
主要应用于新品种培育的初期。
家畜育种学讲义
注意： ① 异质选配与弥补选配的区别；
弥补选配是指有相反缺陷的公母畜交配。 如：弓背配凹背；过度细致与过度粗糙；以损配损。 正确方法：用理想类型纠正损征。相反缺陷的交配可 能会加重缺陷。 ② 异质选配的主要目的是产生杂合子，因此要准确判 断基因型。 ③ 在考虑多个性状选配时，在单个性状时个体间可能 是异质交配，但在整体上可能因综合选择指数相同而 可视为同质交配。 ④ 同质选配多用于育种群，异质选配多用于繁殖群
家畜育种学2
（三）世代间隔（gencration interval ）即：子代（第一代）出生时父母的平均年龄，对于一个群体来说，其平均世代间隔为：∑∑===mi i m i i i n T n d 11/n i ：第I 个全同胞家系的有效后代数T i ：第I 个全同胞家系后代出生时父母的平均年龄 m ：群体中家系数如何缩短世代间隔，获得大遗传进展呢？1/尽可能缩短种畜的使用年限。
因为使用种畜（尤其是公畜），主要目的是为了获得比他还好的后代，所以要加快种畜的周转，如殴美国家种公猪每3个月更新一批。
2/在确保准选的前提下，尽量选择早选方案，避免“后裔测定”。
四、遗传力由R=Sh 2可知 h 2↑→R ↑但遗传力的高低除与性状本身的生物特性有关以外，还受h 2估计值的准确性的影响。
即受环境与育种值两方面的影响。
五、被选性状的数目多个性状同时选择是单个性状选择反应n1倍，如同时选择4个性状，则每个性状所得到的选择反应仅为单性状选择反应的21倍。
六、性状的相关性状之间的相关一为遗传相关；二为环境相关所造成的，x 、y 性状为正相关，x 、y 为负相关……第四节 选择的方法 一、选择方法的分类在育种工作中，依据不同的信息来源和不同的着眼点，选择方法多种多样，其选择（一）外形选择与性能选择1、外形选择：用外形鉴定的方法对种畜个体加以选择。
2、成绩鉴定：依据个体各次生产性能的优劣加以选择。
（二）表型选择与育种值选择1、表型选择：以个体直测生产成绩的表型值为依据选择，又分为：个体选择、系谱选择、后裔选择、同胞选择。
2、育种值选择：以性状估计育种值进行选择。
（三）单个性状选择与多性状选择1、在某个时间内重点选择某一个性状2、在育种过程中同时选择多个性状分为：综合评定法、顺序选择法、独立淘汰法、选择指数法（四）个体选择与家系选择法（五）直接选择与间接选择法二、单一性状选择的基本方法 （一）个体表型值剖分家系：在大群体（原群）中由全同胞（或半同胞）个体所组成小集团叫家系，个体表型值可剖分为：家系均值P 5和个体表型值与家系均值之差（P i -P f ），即家系内偏差：P w ，P i =P f +（P i -P f ）=P f +P w（二）单一性状的选择方法将上述个体表型值组分别给予不同程度的重视，合并为一个指数，即：I=b f P f +b w P w ，即有四种选择。
第5讲 近交系数与亲缘系数 群体与数量遗传学 教学课件
8 0.2500 0 0.1250 0.1250 0.5000 0.0625 0.0625 0 0.5000 0.0581 0.2633
二、亲缘系数
• 任何两个个体的亲缘系数
即它们间的遗传相关（亲
缘相关）。
合子X’到合子X(合子世代)
g’1
F’
g’2
的通径系数ba:
a’
a’
a 1
b 1 F'
2(1 F)
2
ab 1 1 F' 1 1 F' 2(1 F) 2 2 1 F
X’
b
g1
F
a
a
x
二、亲缘系数
Fn
an
1 1 F' PX.A' ba 2 1 F
1.G 1 0.5 0.5
2.F
1
0.25
3.E
1
4.H
5.E
6.B
7.A
Cov ij
Cov iSj
Cov iD j 2
4
4
6
2
3
5
45
6
7
0 0.25 0.25 0.25
0 0.5 0.125 0.3125
0 0.125 0.5 0.3125
1 0.5 0.5 0.5
1
0.3125 0.65625
rij
Covij Covii Cov jj
•
if(i==j) pedigree(i,i)=cov(i,i)-1; end
•
if(j>i) pedigree(i,j)=cov(i,j)/sqrt(cov(i,i)*cov(j,j)); end
•
pedigree(j,i)=pedigree(i,j);
动物遗传育种学资料整理
第二章 通径系数1、父子之间的相关为（0.5）；母女之间的相关为（0.5）；叔侄之间的相关为（0.25）；祖孙间的相关为（0.25）2、全同胞之间的相关为（0.5）；半同胞之间的相关为（0.25）3、表示通径线相对重要性的数值称（通径系数）；表示相关线相对重要性的数值称为（相关系数）4、自然界两个或多个事物的关系不外乎两种情况，一种是平行关系，另一种是（因果关系）5、简述通径链的追溯原则。
（1）先退后进；（2）在一条连接的通径链内最多只能改变一次方向；（3）邻近的通径必须以尾端才能与相关线相连接、一条通径链最多只能含有一条相关线、不同的通经链可以重复通过一条相关线； （4）追溯两个结果的所有通径时应避免重复。
6、老李（X ）有个亲侄子（Y ），侄子又有了个儿子（Z ），根据三者关系画出一个谱系，并求X 与Z 的相关。
解：Z125.0)2/1()2/1(44)(=+=XZ R第三章 群体的遗传组成1、解释下列名词孟德尔群体、基因库、基因频率、基因型频率、随机交配孟德尔群体：个体间能相互繁殖的群体，它们享有共同的基因库，群体遗传学所研究的群体均为孟德尔群体。
基因库：指群体全部遗传基因的总和。
基因频率：指群体中某一基因对其等位基因的相对比例。
基因型频率：指一个群体中某一性状的各种基因型的比例。
随机交配：指在一个有性繁殖的生物群体中，任何一个雌性或雄性的个体与任何一个相反的性别的个体交配的 概率相等 。
2、一个性状的遗传性不仅决定于基因，更直接的决定于（基因型）。
3、群体遗传学的交配系统包括（随机交配、选型交配、近交）而没有杂交。
4、在一个随机交配的平衡群体中，杂合子的比例其值永不超过（0.5）。
5、在一个平衡群体中，对于一个稀少的等位基因而言，稀少基因的频率下降10倍，则杂合子频率与稀少基因纯合子频率的比值（增加10倍）。
6、一个孟德尔群体是个体间能相互繁殖的群体，它们享有共同的（基因库）。
7、就畜禽个体而言，完全不加任何选配而绝对随机的交配（比较少）。
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•区别与联系
近交系数：一个个体的两个配子同源相同（identical by descent, IBD ）的概率。
亲缘系数(relationship coefficient)：两个有亲缘关系的个体间的加性基因效应间的相关。
近交系数和亲缘系数的计算
d
s
A
A d s SD
A A Cov r σσ),(=
)(b a P =Y
X A n n XY
F F F r +++=
∑+11)
1()2/1(2
1∑+=++)
1()2/1(121A n n X F F d s sd X F F r F ++=
112
1
D
S X
SD F F F r ++=
112根据此公式，
进行计算
两个个体间的加性遗传相关(additive
genetic relationship):是指在它们的基因组中具有同源相同基因的比例，或者说从个体x 的基因组中随机抽取的一个基因在个体y 的基因组中也存在的概率。
用a XY 表示 []
)()()()(21d b P c b P d a P c a P =+=+=+=Y
X A n n XY
F F F r +++=
∑+11)
1()2/1(2
1a XY 即亲缘
系数的分子
D
S X X X a F 21=
4
（1）近交系数的计算公式：
F X 为个体X 的近交系数；
n 1为由该个体的父亲到共同祖先A 的世代数； n 2为由其母亲到A 的世代数； F A 是共同祖先A 的近交系数；
Σ则表示当个体的父亲和母亲有多个途径造成亲缘相关时, 则要对由所有途径所造成的近交求和。
∑
+=++)1()2/1(121A n n X F F 通径法
2014/11/21 5
（2）近交系数的计算
C
X
B
A
D
E H
G
I
首先，找出A 、B 的共同祖先：
I 、G 、E
2014/11/21
6
（2）近交系数的计算
C
X
B A
D
E H
G
I
确定共同祖先的近交系数： 显然I 、G 的近交系数为0， 而
F E =0.53=0.125。
2014/11/21
7
（2）近交系数的计算
C
X
B
A
D
E H
G
I
确定连接A 和B 的通径链:
B←E→C→A
B←E→D→A B←E←G→D→A
B←E←H←I→G→D→A
通径链 共同祖先的近交系数
n 1+n 2+1
通径链的系数 B←E→C→A 4 B←E→D→A 4 B←E←G→D→A F G =0 5 B←E←H←I→G→
D→A
F I =0
7
F X = 23/128
8
•最后，将各通径链的系数累加即得X 的近交
系数。
)
1()(81421+81=E F
521)
(721)
(8
1=
E F )
1()(81421+X
XX F a +=1)
a +(a 2
1
= a = a d s xy xy yx xy 1
-=XX X a F 实际中用以下公式计算
个体的近交系数及个体间的亲缘系数
一、列表计算个体的近交系数
C
X
B
A
D
E H
G
I
步骤：
1.将系谱中的个体按世代分别从左至右、从上到下排列起来（世代高者在前，同一世代，先出生者在前）；
2.将各个体的父母标在各个体的上方；
3.依据下列公式依次计算两两间的加性遗传相关。
4.最后根据下列公式分别计算各个个体的近交系数；和两两间的亲缘系数。
YY
XX XY
XY a a a r =
X XX +F =a 1)a +(a 21= a = a d s xy xy yx xy 1
-=XX X a F d s X X X a F 2
1=I I H G E G E E C D A B I H G E D C B A X I 1 1/2 1/2 1/2 1/2 1/4 1/4 3/8 5/16 H 1 1/4 5/8 7/16 5/16 5/16 3/8 11/32 G 1 5/8 13/16 5/16 5/16 9/16 7/16 E 9/8 7/8 9/16 9/16 23/32 41/64 D 21/16 7/16 7/16 7/8 21/32 C 1 9/32 23/32 1/2 B 1 23/64 87/128 A 39/32 101/128
X
151/128
个体间的加性遗传相关（a ） 128
23=1128151=1=12823=6423×21=21=
XX X AB X a F a F 或
二、群体的近交系数
1. 规则近交
计算每个个体的近交系数，求算数平均数。
2. 小群体
3. 大群体
随机抽取一定的样本，然后逐个计算近交系数，取平均值；
对有完整系谱记录的群体—计算机计算所有个体的近交系数
3. 闭锁群
长期不引进种畜的随机交配的群体
81+8121F d
s E N N N ==
∆F t =1 - (1-ΔF )t
ΔF 为近交系数每代增量
N S 为每代参加配种的公畜数； N D 为每代参加配种的母畜数；
t 为世代数；F t 为第t 代的近交系数。