回文结构和反向重复序列

回文结构和反向重复序列

回文结构：

回文结构广泛存在于各种生物体基因组中。它可以在质粒、病毒和细菌基因组DNA以及真核染色体和细胞器中找到，并且广泛分布于人类癌细胞中。基因组某一DNA由于自身单链DNA上有反向重复序列而自已配对，形成发夹结构或茎环结构。

回文结构是顺读和反读都一样的序列。如：

5'-gaattc-3'

3'-cttaag-5'

下面一行反着读和上面一行一样。是限制性内切酶识别DNA位点的核苷酸序列，呈二元旋转对称。

回文结构的意义：

1）是限制性内切酶的识别位点。

2）具有调节基因的表达作用，如色氨酸操纵子的前的弱化子。

3）转录终止时的识别结构。

4）这种结构不尽在DNA中存在,在RNA中也常因碱基的互补而常出现类似的结构,有利于稳定RNA的结构和行使功能。

5）基因工程中DNA序列的方便操作，限制性内切酶如同外科医生的"手术刀"，它在基因的切割部位就在DNA序列的回文序列中，并且他们之间是相对应的,

回文序列在基因序列的存在使基因的操作成为可能。

反向重复序列（inverted repeat sequence）：在同一多核苷酸链内的相反方向上存在的一段重复的核苷酸序列。在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的形成。如：

tatagcGCTATA

ATTACGcgatat

小写部分就是反向重复。

形成RNA时容易形成发夹结构。